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GrainGenes Sequence Report: AE000116

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Sequence
AE000116
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000116
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAAAACTAGACTTCATTGCATATATGGAGGAGGTATAGTCATGTCTTCT
TCCCTTCTTACCTGAGCGCTGGATCCATTGCTAACAGGTATGTGCAAGCT
AGCGTTGACTCACAACACAGGTCATTTCTCTGCTTATATATGTTCAAAGA
TGATCTGAAATCTTCTACCTCTGCTCAACCTTTCTAGCTCGCTTTCTGCA
CTGCGTGCTCTTCACATATATCCTCTTTAATTTGCTTTGCGTTCATTCCA
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GGTCAGACAACGCACACTTTTGCCTGATCTCTGTTGCTCGGTCCAGGGTT
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ACATTATCTGCACATGGAAAAGCGCATTCTTCACATGGACCTAAAGCCCG
CCAACATACTATTGGATAATGACATGAAGCCTAAAATTACAGATTTTGGT
CTATCACGACCCGCGGAAAACTCACAAACCATGAGCACAGGACATTTTGT
ATCACGGTGAGCTACAAATCAGCACAGCAAAGCTACCTATATCTCTCAGC
TATATGTATTGATGTCATAACTGTTTGAGATTTTTAAATTTGACACAGCG
GGTATTGCGCTCCAGAAAACCTCTTTGGTTCTGGTAGGATGTCTTTCCAG
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TCTCATGATTTTCCTAATTAATTCGTACTGAACATTTGAAGTCTTATGTA
GTTAAATTCTTCCAAAAGCCATTATATACAATTCTAGCTTCCTCTCCTTG
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TCGGTAAGGTTATAAAATTGTGACCATTAGGATAATCTCTGACCCGCTTT
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TCTGAAAATTTACTTCATTTGATTGAACTAGAGAGGGTCAGGGAGTACCC
TAATGGTCCACAATTTGCACCTCTAGTAGTTGGGCCACCAAACAATTTTT
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CTACATCAAAATTTGACTTGGCACACTATTTATTACTATAAATAAACTTG
AAGGACAATTGTGTCCTAGTTGATTTCATTTTGATATGAACATGAAAATT
TATTTGCGTAAATTAGTAAATAGCATATGACAAAATAAATTAGCGTGTGT
AGCAGTCTAAATAGGCATCGCCGCACTAAGTCCTCTCTTTAGCTTTATCT
AGCTGGCATATAACAACTGCAGATGTTTATTATTGCTAGTGATATGCTTT
ACTGGCTATTTCTTCATACAAAATAGTGTTTGCAAAATTTAGTTGTTTTG
TGCACTAATTGTTGTATAGATATGCAAACTATGTAAATGAAATAATTGGA
CGTCATACTTTAATCACTTGGTATTAATACAGATATTGAGAAGATGGAGG
CATAGATGGAATAAATCAACAAAGGAAATATCACTGGAATACCACGAACA
AGTAACTAAATGCATAGAGATAGGGTCACTTTGCCAAAAGGTTGACCCAT
ATGCACGTCCTTCTATCTCAGAAATAATGAGAAATTTTGAAGAATTGGAA
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TGTTGCCATGTAGGATATAAAAGCGTGAAATTTATTGCACTTGTGTGTAC
ATATGATGCGTGTACGCATGCATATGAATTAAGGTAATGCATCTTAGTTT
TCTTTTATACATGCAGATAAAACCACCTTACTGGGAGGATGACATGCTTG
GAGTAGAACCGCTGGAATTGCAATTTGCTAATTCCGGGAATGACAAACAG
CATACCTTATCATGTTCAGTCGAGCTGAGCAATGATACAAATAGTTTCAT
AGCCTTCAAGGTTCAAACGACAAGCCTGTTGCCATACTCCATAGAGCCAA
GCAAGGACATTTTGAAACCACGATCAAAATGCACTGTGGACATAACATTG
CCTGCAGCTAACTCACAAGATCATAACAAGCAATACACGAAAGAGTTTAT
CGTCCAGAGCATTAAAGTCAATGATGGTCTAGAGACTAATGATATAAATG
AAGACTTGTTTGATAAACATATAACGGGTCTCCATGTGGATGAGATTTAC
TTGTCAGTCATTTCTGAAAAAACCTTCAATAAAGAGGTATTCCATCCACT
TCTTTGTCTGCCGCACACCAATTTTTCGTTTTTCCTCTTTGTATTGCTTT
CTTAATTAGGGTGATTGCATTGTAGAACGTTTTACCGTATCTTATCTGCT
GCCACGTCACGTGAATACAAAAGATATTTTCACCATCACAATGCGTTGTA
TCTTATGGTGGGCCCAGCAATAAATGTTTAACCACCCCATGTTTTCTTTC
TTCTCTGACCTTCTCCGACGATTTCTTTTTTCCCACATATCGGAAATCCT
TGGAGCATATGCTCCCTTTACCCAAAACATAATTTTCAAAATGTAAAAAA
TAATAGAAAAATCTTTAGCCCATTGATCTCGATATATTATGTGCGCACAT
AAGGTTTTCGTGATGGAACAGATATTTTTGTGCCTTGTGTAAAAATAGAA
AAGAGTATTGCGTTTATTATTTTTAATTAAACTACCATGGTGGCCCTCGC
AAATGCGAGGGCAACAACTTTATTTTTCTTTGAAAGATGAGGATTGTCTT
TACTATGTCGAAATTAACCTAGAAATACATTTTATTGATTTTTGTTTGCA
CATTCACATTATTTGATGGAAAATAATACATGTATAACCGAATAAGTAAA
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CTTAGGTTTCTATATGCAATTTAATTTTTAGATTGCGAGCTAGTTGGTAA
GATTAACTGTTAGATTGTCAAATCATTAGGGGCTACATGAGCAATGACTA
ATTGATGTTTAGATTACTTGAGCAATGAGTGTATGATGTTTAGACCATTT
AGGTGGAAAATAGGAAATAATATTATTGCTTAAAGAAGTAAAGACTAATT
AATCCTAGATAGGCCACTAAATAGTAAGCACGTCTCGCTTTTATATTGTA
TTGTTCTTTTAGTGGATAATTTATAAATTTGGAGATCTATAGATTACGGT
GGATTAGTTACAATTTTCAGTTATTTTCTATAAGAATAATCGCCATGCTA
ACTACTGAGTATTAAGTATGTGACCTTATTGATAGTTGCTTGATACAAGA
TGAATACACTTAGAGAAATTTGTACTCTAATTGGATTTTGTAAGTATGCT
ATTTTTATAATGTTAGTGTGGAACTTCTAAGTCACCCCCCTCTCCACCCC
CTAAAACTAGACACATGGATCGAAGGATCATCAATGAAGGAGCCTAGTTG
CTTATTTGACTTTAGAATTCCCCTCGCATTGAACCTACTCTCCCAAAATA
GTTTAGCTATGTTAGGTTAGTGCGATATTCGCGGTAATCTCCTTGTGCCT
GAGATTGTGTAGTGCGTAATGAAGCTATATTCGCTATGTCTAGATCTCGA
TGCTCTTGTATGAATCACCGTTTATCATGCAGTAAGCTACGGAGCTAGTG
ATTCTCACAACTCATTGTTCTTACTCGCCAGATTGTTGAATTTGGAAATT
TTTGCAATGTCTTGTGAGGAGTCTGTCCCTCGCAACCTTTTGTCCGCGGA
TCATTATGTCCTACTATTCGAGTTCTACATCTTATATAATATTTCAAAAC
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GCCACGCGATGCGAATGAGGGAGTAATAAGTCTCAAAAAACAAAATACGT
TGTTTAAGTAGGTTACCAAGGCGCTAGGGAAGTAAGGCGCAGATGCATTG
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TTTTACATATGTAGGTCACGGATTCCCCAGGCAAGCAGGCCAAGCAGTAC
GCAAGTTCCGGTAAGTATGTATGCATATATATGTTAGCTAATTAGTGTTG
CATGGAAAATAAATTGACAGACTGATATGACACGAGATTAGTGTATACGA
TCATCTGTCAAGTTCTAGCTTGCCAAACCATGTTATATTTATGGACAGAC
GGGGTAGCTTTTATCCATCAACTAGTTTTTAATCACATAATTCACTCTAC
GTTTATAACACCAGATATATTTGGTCCATCATTGTATAGTTTTTACATGT
ATCAATGTATAGCTTTGCACTGTAGGTAAATTAGCAAAAAGAGTAGTCGT
CTCAAATACGGAAAATAGGAAGAGTAATAATAATCAGACTAGAATATTTC
TGGACAAACGGGGTAGCTTTATCCATCAACTAGTTTTTAATCACATAATT
CACTCCACGTTTATAACAGCGGATATATTTGGTCCATCATTTTATAGTTT
TTACATGTATCACTGTATAGCTTTGCACTGTAGGTAAATTAGCAAAGAGT
AGTCGTCTCAAATACGTAAAATAGGAAGAGTAATAATAATCGGACTAGAA
TGAACCATTCATACCACATTAGCATTGCATGTGTGTCCATTAATTCACAG
CAGAGCATGTGCTTAGGACCAATTTGGACTGCAGGAACGAAAGCCCACCT
ATATGCTCCCTTCTGTTCTCAAAAAAACATTAGGGCATAGTTGCTTTAAA
GTTTGCGGAGAGTAATAGTTCTCAAAATCAAAATACAGTATGTTGTTTAA
GTGGAAGTGACGTTTATTGTTAGATTCTGAGTTGGACGAGAGGTCCTTGC
AGACAAGAAGTTTATGTGTTTGTAAGTCATGGACTTCCCAAACAACAAGT
GCTTCTATCTATCTATATGTATAGAACAAAAGAGGCAAGTTTCTAGCTAG
TAATCGAGACGAGAAAAATAATAATGAACGAAGGATGAACCAACAAATTA
AGGAAAATTCTGAATTGACTGCTTTTATACTGCATTGGTGGCAAACAGAG
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TCACTGGCGGCGACTACACCAGTGACCGGCCGGGCCTGGACCTAGTTGTT
GTTGTGGAGGTAAGCAGCAGCATGCAGGGCAAGAAGATGGCGCAACTGAA
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CGGTCATCACATGTTCCGATGTCGTCGAGGAGCTCTGGCCGCTGCGGCAG
ATTAAACAGCGGGAGTTGCAGGACCTCATTTACGAGCTTGAGCCCAGTGA
CAGGGACGGCAATAACATGAGGGAAGGTCTTCAGGCCGGGCTCAATGTCC
TCGGTAACCGAGAGGTCTGGGTTGGCCGAGTCAATGCCATCATGCTAGTG
TCTTCCGGTTGCGAGTATTATGACTATGAGGCTGTTACTTCTGTCGATGT
CGGGGACGTGCCTGTCTACACGTTTTGTTTTGGCAGCACACAACTCAGAG
AGCATGTGGCACTCGCCGAGGTCGCGGCCAAGAGCATAGGGGGGACGTTC
TCCCATGTCGTGGACCACCAGGGCGGCCTAACCATGGCCTTCTCCCAGTG
CCTGGCTGGCCTGCTTACCGTGGCGGTTCAGAACCTGGAGCTGACGGTGT
CATCTGTCAGAGGCGAGTCGACGATAGTGAAGGTGACAGCAGGGAGCTAC
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CAACCTCTACAGCGCAGAAGTGCGCAAAGTGATTGTGGAACTCCTCCTCC
CTACAATCCACAGCGAGCGCAGAGCAGAGATCCTCGATGTCAGTTACTCG
CACAAACGGTATGTAGAACTTTCACATTCAGAGAATCATGTAATCAGCCA
TTGATTATGATGATCGATCAAGAGTTAATTAATTAATTTAATGCAGCTCG
GCGGGGAGGATGAAATTGGTTGGGCCTACTGAGACGCTAACCGTGTGGCG
CACCGGCGCAGCAGCAGAGGACGAGAAGCCGGCACGGTGGTTACTGTCAG
GGGAGGCCCATCTCCAGATGGCACAGATGATCAAGGAAGCCAGAACTATG
GCGGAGGGCTCCAACAGGATGAATGATGCGCAGAACAAGCTAGTGGAGGC
ACACAACATGCTGGTAGATGAGGAGCAGTCCAACTCCTTACTGCTGAGGA
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GCGTTTTGCGTGGAAGGGCGCCGACATTCAAGTCATGCCGCGGTTGTTCG
CGACGCCACGCATGGACATGTACCTGGAGCAGGCCAACAAGTTCCTCAAC
GAACCGAGAATGCCGCTGCCGTCCTCTGTGGACGACGATGTCAAGCAGGA
GGTCAGTGCTCTTACAGTTAATAATGTTGCCAGCAGGGAAGAGGAGATGC
GGAGGTTGGCCTTGGACGTCGTGCTAGTGAGGAAGGAGAGCAGCAACGGG
GATAATATACCTGGAGGCTACTTTATTGGACGGCCCGGTAGCAGCATGCC
TTCACCTCCGCATAAGACCTCACGAGGCCTTTTTGGTATATTTCGGAAAA
AAGGATCCGGAGGCCGTTAAAGATGTATATGCTCCGATTATTCTATCTCC
CTCTAATTTCATTCTACACAAAAACTAATTCTAGGATGTACCTTCTTTTC
ATTTACCCTCTCAAAGGCCTCATGAGGTATATGCATAGGGGTGGGAATAT
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ATAGGATCAACAAGACGATGACGCCAATAAGGGCCGATTTCATGTACGAC
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TGAGGTTGACAGAGGCTCGTAAGGTATGGAGCGGTGGTGGAGATTACAAA
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TTTACTGGATAATCATTGCACAGGGTTCAGACTCCTTCAGACAACCTAAA
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TTAGTTTGTGCAAATGTGTGGAACACAAGCGATAATACGGAGTACAAGAT
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TATTTCATCGATTGGATTGATTATTTTTCTTCACACAATCCAGATCACTG
GCAGAGTATTAGCTCTACTGTACACTATCATCAAGAGGAGCCGAGCATGA
CACTGCTGATCGCAGAAGAAGAACAAGGTCATAGGAGATATGGAAGCCGG
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TCTCAGTTCTAACAAGTTTAATGGCCCATTAGTTTGACTGACTTGGATCT
TAGTACAAATAATTTAGTTGCGCCAGTACCGTTAGACTTTGGAGCACCGA
CTCTAAGAAATACCTATTATGTTTGACAACTCCATTTCTGGCATCTTTCC
CTCTTCTTTGTGCAAACTGCAATCGCTAGTTCTGTTGGATATCTCCGACG
ATAAGCTAACTGGACAAATTCCTGATTGCTCTGCTAATACATCCATGATA
AACATGCCGAGTATGAACATTGTTAATAAAAACTTGAGAAACAACAACCT
CTCGGGTGAATTTCCTTCATTTCTCCAAGATTGTCGGCAACTCGTCTCTC
TTGATCTTGCACACAACCACTTCTTTGGGACTTTGCCAACATGGATTCGT
GAGAAATTGCCACATTTGGCTTTATTACGACTACGGTCAAATATGTTTTC
TGGTCAAATTTCAGTGGAATTTATGGAGTTAGCTAATTTTCAGTATTTGG
ACCTTGCCAACAATAACATAACAGGGAGCATACGAAGATGTACTGTGAAC
TACAAATGATGATGATAAACATGATTATGATGATGCAATTTTTGGTGCTA
GGGTCGTTTGGTACCCAGGTATTCATTTCATTTAGTAGAAATGAAATGAA
TACATGGATTCATTTCATTTATATTATGATTCCAAAAACACCCACATGTT
TGGTTGCCACTGGAATTTGCAATTGCAAATGATGGGTCTGAGATAGGAAT
CGGGTTTACACATGGGGATATTTCGATGGATTTGCTAAATGAAATGACAG
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TCCAGGATTTCAGGCCCAAATGATGGATACAAAACGACCTCAGGTCAATT
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GGTCAAGAGAGATTATATACATTATACAGGAGACAATCTATATGGTGAAT
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CTATCACACAATGAGTTGTCCTGGGAGATCCGTGCAAGCTTGTCGGCTCT
CACATCATTAAGTCGTCTTAACGATGTCCTGTAACAATCTGACAGGAGTG
TTACCACCATTAGCTTTGGTGGTATGTAAAGTTGATGCGATGAATAATGC
GAGGGCTAGCAATAGTGCCCTGTTCCTAGTGTGTGTGTCAATGCCTAAAT
TAAGCCTTGATATTGCTAGTACTGTTCCGAGATATATATACTTGAGGATT
ATGGCATAGACTAAGGTTTGGCTATGTCATATGTAAAAGTTGATGTGTAA
TGAATAATGCTAGGGGCTGCAGAGAGTGCCCTGTTCTTGTTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTCAATGTCTGAATTAACTGATGCCAAGACTTACA
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TGGGCACAGACGCAATTTCTTCACTAGAGATACATTGCACATGGTTCAGA
CTTGTTCGGGCAAACTAATTTGCCACGCTCTGAATTAAGTTCAGATAGGA
CTAGGATTAACAGCAGCAAGAATTTAGTCTGCGCAATTGATAAAGCAGGG
TAAGATTCTATTTCATCCATCGGATTTTACTTGATTCTTTGCACAAACCA
GATCACTGGCAGAGTACTGACTGCACAAGAGTCAAGAAGTACAGAGTACT
GACTGCACAAGAAGAAGAAAATGTAAAGCGTACTAGTTCGTTACTCCGGG
TCGTCGTAGGAGAGGTGGAAGCCTGTGGCGCAGCCGGCGGCGTCGGGATC
CTCGGCGCCGCAGCAGTCGTAGAACTTGGCGGCGTAGGGCGGGTCGCCGT
CCTTGAGCTCGTAGTACCTGCACCGGTCCGTCGCCGTGGTTAAGAATGAG
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GGAGGAGGTGCGCTACCTCTTCTGGTCGTCGTGGCGGCGGCAGACGAAGA
AGGATGGGTGGAACCTGCAGGACTGCGGCGTGTTGCCCGACGGGGAGTAC
TTCGCCTTGCACCGCCGGCACACCCTCGCCGCCGCCGCCGCCGAGTCTTT
CTCCATCGCGCGCGCCACCGCCCACCGGACACGGACTCTCCTCCCGATTC
CTCTCTTTTTTTTCTTTTCGACGGGTAAATGTTTTGTTTTTGGGACAAAA
CTTCGAGGAATAGATGACTTGCTGTTGCTGGGCTTTGGCTCTGTCTTCTT
TTCCTGTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.