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GrainGenes Sequence Report: AE016756

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Sequence
AE016756
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE016756
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGGTATCTGATCAACCATAGGAGAAGGATCATGCGTCAGCACCAAGAACA
ACCTCCGTACCTGGGCCAATATCCTTGACCTCAACCTTAAGCAAAGGTAC
CTACCAGACTCATTCCTTCCTTTCGAATAATTTCATTTTATCTATGAATA
TAATCTTTCTAAAATTCCTTGTACTTTCATTCTGTAATATTTCTCTAAAT
GTCAGGTTTGTAGATTTTGCATAGCGGCTCAACAAGGAAACTACCGCCGA
TGAGGTTGTAAGGAGGGTAAAGACCTTCTGTTTGTCGCATAAAGATGTAT
TTCTTCTATTCAAATGTGCCAGGTTTGGACACGATGTTGGTGATTATGTG
GAGACCTTATATCCGTGACAATGTAACAACTCATCTGCTCCATTTATAAA
TAGTAATTTGCAAGGTTCCAGTTTCTTTAGCAAAGAATATTTGTTGCTTT
ACATTATTATTTTTCTGTTGGATTTGTTTGGTTGATATAAAAGTTATTAT
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AGATGGACTGTCGTCGATCCCGATCGTGGCCCTCATTGAGCGTCTGAGAC
TTCATTGAGAGTGGTTTTTATGCCACTCCGTTATATAAGATCCTTCGTAA
GCTTGTCAAACGAGTTGAAGCAAGAACATCGGTGAAGAATGCAAGGCTGA
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TAAACGACTTCCACTATTGTAATGCTTCATTTGGGTTATCTATAGCTAAA
ACATCTTTGAAACTCATGCCTTGTGAAACAACTTCCATTTTCATGCAAAG
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TTAGCAATCTGATGGGTGTCACTAACTAAATGTATGTATTAGGAAGGAAA
ATTGAGGGGTCGTGACAATAATTTAAGTTGTGGTACACATCCGCAAACCA
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CACCATTTGAATAGTACTCCTTATTGTGCATATCAAATTAATTCTTAGTA
CGCACATCAAATGGTGCATATTATACAATGTCTGATACTCCTTAAAATTG
TAGTACTAAGAATTAATTTGTTGTTATTTAGTGTGATTGTCGGTGTGGTA
ATTTCTCCAGATACGCTCATACAAGCTGCAACAAAGAACAATAGACAGTT
TTTAGAAATGGTAAGTCACAACCTTGGCTTTTCTTTATGTTGACCTTTGT
TTGATTACACTTTTAGTTGTCATCCTGTGCATAAGTTCTAAACTATAAGT
CTTTAAATTTATATGAATACATTAATGCATTTGACATTGGCCATTGTTAT
ATATTGTACCTTGATTCAGATGGTATTCTATCCTGATACCATATAGTGGT
GTGTTTTCCTTTGTGAATGCTCTGTGGTCGTGTTATATGCAAATGCTTTG
TTCTTTATTAAAAGAAGTACAACACTGTACAAAGAGCAAAGTTACATATA
CATATAAAGGGGAGGAGCTAAACTAGTAGAAAAAAACTAGAAGGTCTCAA
TTCATTGTGTCAAGCTCCCCTTATGTTTGGGTTTAACCCTATGGGCGACA
AGGGCCAGATCATGTTTGTAAACTGATTTCCAAGCTTGAAAAGAAGGTTT
TTGTTTCTTAAAGATAAATCCATTCCGCTGCTTCCAAATCCCCCACATAG
GACAAGTCGTTACCTCAAAAAAAACATGTCCTTCTAAAGGTTTGCTTTGC
TGTTGCAAATATATCAGAAAACCATTCCTAGAAGACCACTGAAAATCCAT
TCCCAGAAAACCCACTCATGAGAGAACTTTCCCTCTATATTTCACTTTCA
TCATCAGCATATCATGTATGATAAGCAAGTTTAAGTTCATCTAGTATCTA
ACTTTGGCAGCTCTTATTATCTCCTCTATTACATTTGGCTGAATCTGTGG
CATTTCCTTATGTTATAAGGCTCTTATGAGTAGTCAAATTACTGCCTTCA
TGAATCCTTGATTTTTTTCTAACCTGTTATTTTCTGCTATGTCTGAAGAT
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TGTTGACTTGATCTTAGCGCGTTGGGATTTGCATTATGCTAGTCTTAGAT
AATTATAGGTAGAATAATCTAAAACTAGCAGAGAATTATCAATTGATTTT
TGTTATATACATGTATATGATATAGAATTGAGGTCGTGAATATTTTCTCA
CCTGGTCGTACATGATAGTAGTAATTCTTTCCAACTTGATTGATTTTTTT
CACGTGTAAATTCGTGGCGTCATTTAAATAGATGACCAGAACAAAGATGT
ATTGATAGACTATATAACTGAAAATTACAATAATGCTGAAATAATTTATT
GCGAATGTTATGTTGGACTGATTAACTTGATCTAAATAATTTTTTCATTT
TTGATCGCAGGATTCAAATATTTAACTGGACTAGACATTCACTATGCTGC
ATGGATAGTTTAATCTTCGCACTTGATTAGGATAGCACATTCAGTACGTT
GAATGAATGCTGAATTATTTATAGATTTCGCTATGCAAAATATAATATTC
TATGAATCTATATCAGATGATATTCAATGAATCTTTATCAGATACATGTG
GTTCGAATCATGTAATTGATTGCCCGTATTATTTTATTTTTTTGGGTTGC
AATATTCTATTGCCATGAAATTAAGCGTTGTTGAAATAGTCCTTTCGCTA
CGAACATTGTCGCAATAGCTTCTCGCCATGCACATTTTGTCTGTTGTGAT
AATTGTATGTCACAACCAAAACTAGTATGTTGCAATTTTTTGTTACCACG
ATTTGGAGTTGTTGCCATAAATTAATGCCATAAACATAAGGCTTGTGGCA
AAAGATGTGTACCCACGAAAACAAGATTTGTTGCTATAGAGTTTAGGTTT
ATTGCAACAATTGGCTATTGCCATGGAAGGGTATGTGTCACGAAACAAGT
GTTGTTGGAATAGGCTATCTCCACAAATGGTTATCACCACAAAAGGCCAA
TCGCCATGATTTTGATCATTATTGCATTAAGCTATTCCCACTTACCAAAT
TGTGGTATTAAGCAAGTACTGCTACGAGATAGAGCATGGCAACTTGTCGC
ATCCGTGTTCCACTTCAAAGTGTGAGTCCAAAGGTATTAGTATTGACTAT
ACACGCTTTGGACTAAGTGTCATGTGTATGGCACCACTATTGATGTTGAT
AGATTCTTTTAAAAGAAAAGAAAATGCTGAAAGAGAATCTATAAAATATT
TTGCAGGATATAAAAGGCTGGAAATATCCAGCTTAGGTATATAGAAGATA
TACATGTTATGGTTGTATTCTTTGCTTATTAAACAATGTGGTTCTTGGGT
ATTGGATACCAAATTTGTCGGTGTGAAGTGTCATACAGAACAACGCAATT
CATGAACTACAATGGCCTAAGTAACTAGCAAAATAATATGTGATGATGTT
CATCAAAAACAACTAAAGTGTTGTTGTGTTTTTTGTTGAAATCAAAGCTT
GCCTTCAAGATTTGTTTTAATAATTGTTATTTTGTTCCGATATTATGAGA
ACAATTGTTTTTCAAATAATTACCGTATTCCATAAAAGATGGATGAACAC
TTGCACGTCTACTTGGAGAAATCATGTCCATAAACAATAATAATAAAATG
TCACAATACAAATGGTTGAAAGATCACTTACGAAGTGACATCGCCATTTA
AATTATATTAAAAAGAAAGCATGAAGAAACTCCATGTTGATGGAATTTTG
GAGTCTTTGATTTTGATCAATTGGCGCTTGTGAGACTTTCCTAGAGATAA
CCGAAACTCCGTTCATAGGCTAAAGAGGAATGGATGACTAACTTATTGGA
CATTGTGCGTGTTGATGTATATAGTCCATTATGTGTAGCCATGTGCAGTG
GATCTTTCAAGTTCATATACTTTCTCCAGAAATTTGAGTGAATATAAGTG
TATATTTACTTAATAAGGAAGAAGTATGAAACATTTGAAAATTGTTCAAA
GACTTCCAAGATGAATTAGAAAATCATTGTAACGAGAAAATAAAGAATTT
ATGATTTAATCATAAAAGAAGACATTTGAGTTGTAGTTTTAGCAAAACAC
CTAAGATTTAAGGAATCGTTTCATGGATTTGTGTTTCTCGATAAATCATA
TGAGTATGGAATGTTCAAGAGATGAAATCAAACCTTGTTTGACATGGTAC
GATCAAAGGTGTCATTTATAAAACTGCCATTATGTTTTAAGGATTAAAGA
TTTAGAGACTACCACTTTTACACGGAAAAGAGCACCAATGTGATCCGTTG
AAATGACACCATATGAGTTATTACTTGGGATAAAACCCAAGTTGTCTTTT
CTTAAAAATTTGGTATGCTAGGCATAAGTAAAATGTTTACAACCAAAGTC
GGATAAACATGTCTTTGTAGGTTATCCCATAGCAACGTTTAGGTATTCCT
CCATAACACCGAAGACAAAGGAGTTTGTCGCTTATAACGTCAAGTTTCTT
AAGAAGAAATTTTGATTAGGTTGATGAACTTTGATTAGGTTGATGAACCT
AAGCAACATGTGCTAAGTAGAGCATCACCGGAAAGTGTCCCAGAGGCGGG
CATAATGCTCATGTCTCACGTGATTACAAAGGTTGTGATCTCGGATATTA
GAGTTCCTATTTGAACCATATGGGTCGGGTAGGAATGAAATAGTGAGATT
TGATAAACAAGTCATTATTGTTTTGACAGTGATGAACCGACTACATGCAA
AGAAGCGGTGATGGGCCCTGACTCCATAAAATGACTAGAAGTCATAAAAT
CCATGATAGTTTCGATACATGAGAAATCAAGTTTTTGAACATGGAAGACC
CTCCGGAAAGGAATAAATCCTATTTGTCGTCCTTGGATCTATAAAGAAAT
ACACATGGATGTTTCACATCTATGAAATAGTTGACATGTCGCAAAAGAGT
TTATGACAATGTTCAAGGAGTTGACTACGACAAGATTTGATCTTTTGTAG
TGATATTTAGTCTGGACGGATTAATGTAGCAACCACTACATATGTCAATT
TTGGTATATGGTAGTTGAACAAACAAAACAAAGTTCTTCTAATAGAATGG
TTACCTAGGACATGAACATGACACAGTCTGAAGGGTTTTGTTAATTCAAA
GGATGCTAAAAGGGCATGCAAACTTCAATGGTTGAAGTAAGCACATGGGA
GTTGAAATCTTCACCATGATGAAACTATTAAAAGGTTTAATTTCATCGAA
GATGATGAAAATGCTTGCATTTGCAAGAAATTAAGTGGGAGCGCTGAGAT
ATATTTATAATACATTAGTTAGGGTACATGTTGTTGATTGGAAATGATGT
ATCTTTTATTGAAACGGGTTAAGAAATTTCATTGAAATTGGATTTCGATA
AAAGACTTGGGAAAAACCAGAATATTAGGCATCAATGTCTATATGAATAG
ATTGAGGCGCTAATATGGTTATGCTTGGCGTACGTACATATATGAGATAT
TGAATAAGTTTAATATGAAAATGACAAGAAAGGTTCTTGCCACATGGAAA
GGATTGAATCAATATTCATGTGTATCGACACTTGGTAAGTAAAAACAAGA
TTCAAGTGTTTTGACACTTGGTGAGTGAAATCACATGAATACTTTGATCA
ATCATACATATTGTGATATGTACAAATCTATATCTATCCTATGCTCTAAA
TGTTATGAGCATATACCAGGATGACGCATAAGATGATCATTGGAGGATAA
TAAGAATATTCTTATGCTCTTTGCAAGAACTAAGGAAATATTAATGTAGA
GGTGACAAATAGTTCATTGTAAAGTATTACATTGTTACTAGTTTTTTCAC
AAGGAACAAATTAAATTTATCTCAATTTAAACTTTGGGTGGCACAATGTA
ATGGAAAGGAGGTTACATGATGGATTTGGATGAGTTCCAAAGTTAAGACA
TTGTGATGGATACTACAACAAAAGGCTAAGTATATGAATGCTATAGTTCA
AGCAAAGGAGGGCATTTGTGTTAAGTATGGATGTTTTTAATAACGAGGTC
ACAACATTGATGAATGATGTGATGAACATTCATCCGAAGTACAGCATTAT
AATCAAAGTCATTATGTTTACATTGCTATAACATCATGTGAAGTAACTTT
AATCCTTAGACCATGAGATCATGTTAATTGCTAACACCGCAAGAGTACTT
TGATAACATCAAACATCACAGCTTAACAGGGTGACTATAAAGGTGGGTTT
GGGTACTATGAAAGTGTTATGTTGAGGCTCATGTATAAAGAGTGGAATTT
GTCCATCCTGATGATGGAGATATAAACTCTGGGCCCTCTCGGTGATATCA
CATTGATAACAGCTTGCAAGCAGGTGATTTGATCACAAGGAATGTTATAT
CATGGGAACAAGAAAAATGTACTTGTCGGTAACAAGATCAAACTAGGTAT
GGAGATAACGATGATCGAATCTCGAAAATGTAATATATCATGAGACCAAG
GGATTTTGTTATGACATTAAAGGTTCAGACGATCACTAGAGTCATCGTTG
AATTGAATGTGTGGGAGTTAGTACGGATCTCCACCTCCCGCTGTTGATTA
TTGATTGGAGAGGGGTCTTGATCATGTCTGTACTATTTGCAAACCATAGG
GTGACACACTTAAGGGATACCGACACCATTTGGAGAAAACATGATACCAG
AGAAATATTATGAAAACATTGGAATTATTTTGATGGACACAGAATTGTTT
TAGGTCAAATTGCTGAAATTGGTTTTGCCTATGATATCGAAGTATTGCAA
GGGGTTTATGCAAATGTTTGTTAGTTAAAGTAATTAACAAAATTATGAAT
AAAATAAATAAAAGATTTTTATTAAATGAGAGGTGCATTAATTTTGGTGG
AAAGTTAATGCAACATTGAGTGGAGATGGAATTGATGTGGGAATGCTTAG
TGGAAGCTCCAGTAATATGAATGAGGGAGAGGTGTGGGCACCCACCATGG
ACGCCGGCCATGGCATGGGGGCTACCCCCTCCCCTACGAAAGGAGGCCTC
CACCTCCTCTCCTCTCACACCTCCTCGTGAAGGATCTCTCTCCCCCTCTA
GAATATTCTCCATGGTTTCAGATTTGTGAAGTACATGTTCCCGGTGGCTC
TTTTTCTAGAAGGATTTGATAATTCCTATGATTTGATGGAGCAAGGACTC
AGAGGTGCTCAGGGTACCGGACGTGTGTGATCACGAATGCACTGTTGCTT
TGTGGTGCTGGACTTCATCATGATCCTGAGATCGGCAAGTGAATGACTAT
ATCATCCACGAAATTAGATTTCGTTAACAAAGCTTTTCGGTCTTCGAGGG
TAAGATCTCTATGGATGTATATCCACCCGCTGATTGTATCGAGGTAGATA
GATATTGGTGCTTAGTTGTTCATATCATAGGAATTTTTGTTTTCTATGCT
ACGAACCCAACACAAAGTTGTGATGGCTTCCTGACACAAGGCACGGGGTA
TAGTTAACCAGTAGGTAGTACAATTCGGGACCTTTACTGTATGTGCATGC
AAAACAAATTGTGTTTTCTTTCCTTCGCTGCCTCATCACCATCCACACCC
TGGTCGGCTGATCTCTCCCTAGTCCACAACGTAGCGTTGTGAAGGCGTGT
TGACCTGCCTTGATTGTGTCGGTGGCTCCGTGTCAGTATCTGGCGTGTTT
GCCAGCTGTGTTGGTGTGCATAAGAAGGAACCATTTTTGGTCTTGGCGGA
AAAAAGCATGTAGAGTAGAAATTCAAACTTTTCCGATTTCAAAATTTTCA
TTTCCTTTCCAAACATCCGGATTGAAGGATATTCAAAAGATCGCCGTTCG
TAGGAGTACTTAAGTGGTGGACAACTGATTGTTGATATACGTCCCATCGC
ATTAGATGCACACCATTATGATCTGGGCAGCTTTCCTACTCCATACTACT
CGTAATCCATTCTCGTTCAATTTCACACCATGTGAAGAGGAAGCACCAAC
CACACCTGCAGCACATACGCTAGTTTGAAAGTGAAGAGCGTTTTTTCTTT
CTTTTCTTTGTGAAACAAGTACATTAGTATGAAGAGTGTGGCTCAGCTGC
TCGCTGGAGAAGGAGTCGGAACCTTGCTTAATTTTATAGCCCTTTGTGCT
AAATTTATGGACTTCTATGTAATTTTCTCTTTTTTAGGCCTTCGATGTAA
ACTGTACTCCCACCGACCGTGTAAAATTTTGTGGCCAGCAACCTTGTCAA
TTTTTAACTACAAGTAAGCATGATAGATTGCTCTTAAAATTTTCCACAAA
TCTTTTGAAGCTAACCAGGAATCCATTACACCAAAAACCACCACGGGTTC
TTAAAAATTCAAGCTCTTGCTATGCATCCGCATCCCGATAAAATTGAAAC
CGTTTTGGAAACATTCAAACAAAGAATAAAAAGTATAATATTTTTTGTAT
GGCATCCTGCTACATGTATCGAGAAACATGTGTTTTGACAACTTTTGAAA
AAAATCCTTATTGGATGCTTCCCAATATTGGATACTAAGTTCCATGCATG
AATATTATTAATTATTCTTTGGTTTCAACTCAAACGAGGAAGGTCGTGCC
CTTATCGACATCATATGTTTATTTATGATATAGTTCCTACTTCTTGTAGA
TGGGTGCATCTTGTTGTACTAATCCATTTTGCTAGGGAGAGTTTCCAACA
ATCAACAAAAAGTTTATGATAATTTTTCGTGTGACATGACTATTTTTTCT
ATAAAAAATATACGAAAAGTATGACTCAAAATGCCACAACCCTAGTGTTT
CAGACAGAGTGGACCATGTTATACTTATGATTTCCAAGTTCAACGAGTTT
CCAAGCTTCTTAGCTGAACTCCGCCCACTAAAATTACTTTTTTCAATTTA
ATTATCAATATTAGGTAAAATTTGATATACAATCAACTAGTAGTGCTTTT
AAAGTTTACCAAAAACTTTTGGAGGTACCCGCCAGACCACCAAAATATTG
AAAACCAACAATAGTTCAGGGAGATTCAACTTATTTCTAAGACTTTTTGG
ATACAGACGAATTTGACCAAGTTTTATTAAATTGATATGAAAAAAGATAA
AAGCAGAAATACAAAAGATTTAAGTAAGAAGTCCTTTCATGTGTTCTACT
TGCAATAGTAGTAAGTTGCACTTGCCTTGCATATGAGACTCAGATAATAG
ACGTATGTCATATCATCAGTATATAAAATTATAATATGTAAAACTCAAAA
AATTATAAATTTGTTTGACATCTATAAAGTAGGGATGTATATTTGGTTCT
TCTACTTTGTCTCATGTAGAAGGCAACATTTATTTGCTCCCTAACACTTG
AAAATTTTGATACGATGGTCTAGAGAAACGATGGAGAAGATTCTAGAATG
ATGGAAAAGTGTGTTTTGAGGTTTGTGCATATATAACGTTCCTTGTGATA
AAGACTATCAATAAAATCTTCTAGATGCTAGAACAGAAAATAAGATCCAA
TGGTTGTAAATTTTGGGATTCGCGAGTCTTGATCCAACGGTCAATATTTA
GAGTTATCCGTACAGTATATAGTTGTAAGGAAAAATTATGAAAAAACAAC
TTCACATTATGGATTGCCATTTATGGATAAAGTTGGATTTCAAATCCATT
GACCAAGGTCATGGGCACATCCACATCATAGTTTATCATAAATTTTAGAT
ATTTTGTAGATGATCGCATCTTTTGGCTTGGTAAACAATGTTTACAGCGG
GAGTTTCCAACTTACGGCAACAAAAAACCATTTTCAATTTTCGAAGTGAC
ATGATTTTTTGGTGGAAAGCAATTACGAATTCTGTGGATTGGAATGCCAT
CACCCTATTTTATAGACATAACCATGTTTTCGATTCAGAAGTTTATGAGT
TTAATTTTCAAACTTTCTAGTTAACTTTGCACACTCAAGTAAGTGGTAGT
TTTATCTTAGAAAATTATAAAATGCTTTTGGGGGTACCTAATAGGTAGTC
CATATATCAAGAACGGTCGAGAGTTCTAAAAGATTCAACTTCGTGCTTAG
AATTTGCATGCTGACAAAGTTGATCCTATATTGGAAACAACCGAAGAAAT
AAATAAAAATTCAAAAACAAAGTTGAACTTACGCAAGGCATCCTTTTGTG
TGTATAACCTACCATGCAAATTTATGGACCTATTTCGTAAATGCACACAA
ATCAAACTTGTGTTTTCTCTCCTTTGTTGCCTCTCTCCATTTAAACTCCC
TCTCTACTCTTAGCCCTAGCTTAAATGACTTTATGTTGATTAACCCGAAT
TAGGTCAAAATTGACCACAAGTAAGTGTTGGATTGCTCTAAAATTATGCA
CAGAATCGTTTAAGGTACCCAGTAGTCATAGATCGAAAACGATAGAGAGT
TCTGAAAGGTTCAACTTCTTGCTATGAATTAATGGCAATGCCAACAATTT
TGACCCATTTTGAAAACATGTGAGAAAAACTAGAGCATCGCGTCCCTTAT
TTTGAGTGGGCATTGAGTCCTCCTACATGTACTAGTGTAGTTTCCATGAA
AAATATGGTTCCGACTACGACCAATCCAATTTCCCTCCTCTAAAACATTG
TGCTGCAAATATCTGTAGATTTAGTCCAAAATCCGTACAACACATTCTCA
AGTTTCAGTACAATATAATATTAGTGTGGTACCAATGCAACATGGATGTT
AGAATATAGTTCGCCCGGTATTCTACTGACTAAACTAGTACTGGTACAAT
ACTATTATACTCCAGTACGAGACTACGAAGGGGTCGTCGATGGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.