Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE026042

[Submit comment/correction]

Sequence	AE026042
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE026042
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCATCACTACACCTCCCCCTTCTCCGACGAAGTCCCGAACTCGCCCAGCC ACCGCCATTGCCGCGGCTTCGCACGAGATCCCCAAACACGACCATAACCT CCCCTCTGGGACGCCAAACCCGGCCGCAAGCCGGCGAAGAACATGAACGC GATTCGAAGCAAAGCACCATAAGACCACGCGCGCACTCCCACTCCTCCTC TAATCCCCGCCGATTTGGATCACGCGATAAGAACAGATCCACCTGTGTGC GCTGCGCAGGTCTATCAGACCAGTGCGCGTTGTGTTGAACAGACTCTGAC TCGAGGACCGGATCACTGATTTGTCTCGGATTCGGTCCGTGTGATCTGCT TCTGTTGGTGATTAGACATGATCAAAGCGGTGGTGTATTTTGGGCACATC TCCATTGGGGAGGTGGAGCTGTGGCCCAAGGGGGAGATGAACCTGGCAGG GGCGCCGCCGTGGGTGCGGGAGATCCGGGTGGACCGCCTCTCCCCGCCCA GCGAGCGGTGCCCGCCGCTCGCTATCCTGCAAACCGTGTCCTCGAGTGGC CGCTGCCTCGTGATGGAGTCGAGGCCGACGGCCACAGCGGACGAGCCCCC ATCGCCGCTTGTCTCCATGCACACCGCTTGCCTCAGAGACAACAAGGTAT ATATGAATCATTTCCCAACAGTTGGAGAACACAGATCAATCTGAATAAAT GGAACCCAAGCAAGGAATATTAGTTTAGCGCATGAAGCTGCCTAGTAGAA AACCTCCCTGAAACATCTACTGCATTAATGAGTAACGTAACTCAGCAATG ACACTTCTAGAGATGCTTAGCTACTGACTAATGTGATACCCACTGGAACG TAGATGAGAATCAGTTTTGTTGTTTTATGGATTGTGGACTTGGCTTATAC TTAATTGAATTGAATCGATAGACATGTATTGCTCAATCGATAGGCTTGTT TTAAGGACCAGCGTTTCATATTTCTCAAACAGATCAGTCATACTTTCCGA CTCTGCAATACAAAATATTGTTTGTTTAGGCATACTAGAGGTGATGAAGG GTTTTATTTTCTTCAACTGCTATGGATTTTGGACTCAACGATATTTTTTT CTCAGCAGTTCATCATTGCAATTGAATGTGAACTCTGAACCGCTGAACTC CATATACCAACAAATATTTGAATGTTGCTCGACTACTTTTGAGTTTGAAC ACATTAATGTGCATGGAATTCATCTGCTAGTTAGTTAATGCACCGCTTGA ATCCGCTAGGAGTTTTTTGTGAGGAGCATGGCTATATTAAGTACTTGATG TGCCTTTGTAGTTAACCATATTCTAAGTTTATCTGTAGTAACTATGATCA TGACTTTGCTGTGAATATTCCTGTTTCAACATTTCAATATTTGCATAATT TTCGGCCAATCTGTGCCACAAAATTTGGAACAAAATGCCCAGTCCTTTGC CTTTTATTTCTTTCTCCTCTTTTTGTTTGACCTCTGTAAAGAGATGTGCT AAGGAAAATGAAATTCCCAAGGCAAAGGAAGTTTAGCACATCTTGTTACA CTTTGCCAAATTCCTTGCCTTCCGTGCATTTTGCATTTCTATTCTCCCTG TTACACTTTATTTCCTAATTAAAATCCGTTCTGTTTGTCTTAATCTCCTT CTGATTAACTCTTTGTGTTTGTTCTGTTTGGCTCAATCTCCTTCCGATTA ACTCTTTGTGCTTGCAGACAGCAGTTTTTCCACTTGGAGCAGAAGAGATC CATTTAGTGGCAATGAAACCCAAGAGTAACTTGCCGAACCATGCATGCTT TTGGGGCTACAAAGTACCTTTAGGCTTGTATACTTCTTGCTTGAGTATGT TGAATCTTCGATGCCTAGGTATTGTGTTTGACCTTGATGAAACACTAATT GTTGCCAATACCACACGGTCATTTGAAGACAGAATTGATGCAATCCAGAG AAAATTGACTAATGAGTCTGACCCGCAGCGTATTAGTGGTATGTTGGCAG AGATCAAGAGGTACCAAGATGACAGATCTATGCTAAAGCAGTATATAGAA AGCGATCAAGTAACTGATTGTGGCAAAGTGTATAAAGCACAATCTGAGGT TGTCCCACCTTTAGCTGGTAATCATCAGCCTTTGATACGTCCTATCATAA GGCTACAAGAGAAAAGTATTATATTGACACGTATAAATCCATCGGTACGT TCATCATTCTATTCAGTCATTTTTTTGGCATGTGTGATAGCCAAAACAGC CTGTTGTCTCTTTGTATTTCTTTATCCAGTCATTTTTGCATGCATAAACA CCACCATAATTTGGATTATTTCGTATGTTGTGATCGATTTTACCTCTGTA ATTCAATTCAATCTATCTTGTAGTATTCTCAAATTAGCTGTTTCTTTTTA TCTAAAAAAGAATATGGCGACCTATTTGGTTATGGTACTGCCAGTTGTTC ATGCATCACACAGCTGCTTGCGGAGCTTGAATCAAATTAAATAACGTCTT ATCCATAGTATTCACGGGAAGTTGCACGCACTAGATGATATGGACAACCA ACTTTTTTTCTCGGGCCTGCTGATCTTTAACCATGTTTGCTTATTGCTAG ACTGTATAGTTTATTTTCCGTTCCTTTTTTCTGTTAGATAAAAGACACCA GTGTTCTGGTACGGTTAAGGCCTGCTTGGGATGATCTTCGGAGCTACCTG ATTGCAAGAGGTCGGAAACGTTTTGAGGTGTATGTGTGCACAATGGCTGA GAGGGACTATGCCTTGGAAATATGGAGGTTGCTTGATCCTGATTCAAGAC TGATAAACTCTGTCCAACTTCCTCACAGGCTTGTCTGTGTCAAATCTGGT ACATATTTATCTTGCTTCCAACCACCACAACTACAAATGGGCATAGTTCC TTTATATAATTTTTTCAATCAATTGTTGCCAATGATTTTACCTCCTTACA GTGAATTTCCATGTCCATGCATATTATATGATGTGATTGTCCATCCTTTT GAGGTTAATGCTAAATGTACTCATCTAGGTTCTAAAAAGTCTTTGCTAAA TGTATTCCATGATGGATCTTGCCACCCTGGAATGGCCCTAGTGATTGATG ATCGTTTGAAAGTTTGGGATGAGAAGGATCAGTGTCGAGTTCATGTTGTT CCTGCCTTCTCTCCATATTATGCTCCACAGGCAGAGGTAACATTTATTTT GTATCTTATTCCAGCATAAGATTATCTTACTTTATTGTTTACAGATGTCT TTAACTTACACAGGCAAACTTCCCTATTCCAGTTCTCTGTGTTGCCAGAA ATGTTGCATGCAATGTTAGGGGTGGCTTCTTTAAGTAAGAACCATCATCT TGGCTATATGCTACCGCAGAAATTGATTTCCTGTTACATACACATAACAA TGTTGAATGATTTGTCAACAAAGCAATTTATGATTTAATTGACAGGGAAT TTGATGAGGGCCTCCTACCATGGATTAGTGAGGTTCATTTCGATGATGAA TTAAATAATGTTCCTTCCGCTCCTGATGTTGGGAATTATTTGATTTCAGA GGTAAACTTTGTGAAGGTGGTTGTCTGGATGCTTCAAATTGACTCCCTGT AATTACCAACACTGATTTTTTTCTTGTTAGGATGAGAATGCTGCAACTTT GAATGTGAACAAAGATCCTCTGGCTTTTGATGGTATGCCAGATGCAGAGG TTAAGAGGAGAATGAAGGTTTGCACTTCTATTCCTTGTTCTATATGCTTG GTTATAAAAAGATGAGTTTGAAAACGGAAATGAGTTGATATCCAAGGATT AGGGTTGTGTTGTGTGTAATTAAATGGAGTGTGAGGTAGCATTGCCTAAA TTTATTGATGCTTAATAAGTGTTGGCCATTTTTTATTACGGTCAAGCAAT ATGCTTGAGAAACCCAAAGCCATCGTGTAAACATTTTATGTGTTTTGTTC ATGTATGTCGGGTTATGCCTGACAAGTTTAACAAACAAAAGTTCTATACC TTAGGGTAGAGTGCATAACTTGGAACTCAACGTGGTGGTTCATTTGTTGC TGAGCACAATAAGAGTCTCATTACCAACACTGCCGTAAACATTATTCGGA AATGCGGTTGTAGTAGATGATATTGGGCCATTGGATCAATGTTGCATTTG ACCCAATACTAAAAATATACACTCTTCATGAATATATATGAACGTTTTGG ACATGGATACAGTCCCCAACATGCAACTTTGACCATCATTTTCAGATGAA CGACAATAACTTCAAAGCCTATTGTCCCAAGCAAGTTAGGGTAGGCTATT ATTTTCATATGAACATGCGAGTAAAAAGTTCACAAATCTATGTTATGAAA ATATTTACATGGACTCCGAGTCAAAGTTAGAGAAGTTGGACTGCATGCTT TCTTGGAAGTCATTTCTCTAGGAATGGAGATAGTAGTTTACCATTTGTCA TGGCATTTTTCTGATCATTATCTGGCTAATTTATATTCAGTATATCTCCA TGCTCCATCTCTAGTAAACCCTAATTAACTAAATGCAACTTAACTGAATG AGAAAGGTGTTAGTTGTTTATTAGCTTCACTTTTTTTTGTGTTGAAACAA CTAATCGGCACTGCTCAACCTATGTCTGGGCCGTATGGTGTTGTTCCAAT GGGTCAACAAAAATGTTGATGTGAACAGAGGCGTATGTCTTCACATTTCT TAGCAACTGTTACTGTTTTTAATTTAATAATCATTTCTCCTAGTTATGTG TATTTGAACTATTTTTCAGGAAGCAGTTAGCAGTGTTCAAGCTGCGGATC CAATGACAACAAATGTTGATGTGATGTCAGTAGCTGCTAGACAGCAGATT GCTACATCTTCATCTACTCCGTTAGCACCACCACTGGGGATGGTGCCTTT GAATAACGATCAAGATCCCCAGCCTTCTTCAATCAGCTGGCCAGTTGCTC AATCTAGTTTTGGGGATTCCTCACATGGTTCTCCTGCTAGGGAAGAGGGT GAGGTTCCTGAGTCTGAGTTAGATCCTGACACGAGGAGAAGGCTTCTGAT ATTACAGCATGGCCAAGACACAAGAGATCCTACACCACCCTTTCCTGCAG AACCTTCTGTACAAGTCTCAGTTCCTCAAGTGCAATCTCAGGGTGAATTA TTTCCTGTAGAGGAGGAGATGGACCCAAGAAACCTAAATAGGACCTCAAT GGGGTTCCATTCAGAATTTGATGCTGTACATGGTGATAAAAATCAACCAC CACATCAATCGTACCTCCCTGCTGGGGATAATCCTATATCTTCCGATAGA CTTAACTATCAGAACGAGAGATATCCTTCTCAGGTGAGTGATCATCTATT TTGAGTAAATTGTAATTAATATTGTCCATTAATGAGGTGATTCTAGATGA TTTGGTGACAAATGCTTGATTTTACTCAGCCGCCTCACAGTGAGGATCAT CATATGCTTGAGAACCAGGCACCTACAACCTACAGATCCTTTTCCGGTAT GTTTTGCTTTACCTTTGATGTTTCTGATTTTCATACTGGATTTCAGGTTA GCAGCTGCATAGGATAATGCATGGTCCGCGATTTCCTTCTTGGCCTATTG AATATAGAAGCTTAAGCTATTTAGGATATCCTGTTATAATATAATGACCT ATATATCCCTTAACTGTGTTTACTGTCACCTCCTTAACAGTGAAAAGTAC AATGTTAGTATGTTTGCTAGTTAGGCATCACAGTTTGGTTGAGTTTGGAA AATGACCAGACATTATGGCTTGGACATAAGTATGTACTTTGTTATTACGT ATGTTAGTTAGGCATTTTATTTCGTTGCTGGTAGAGAGATATTATGGCTC ACACACAAGTTTGGATCTACATCTTTTCAGTTAGTTTTCCTTGGTTGTTA CTCCCTCTGTCTCAAAATGTGTTGGATATAAGTTCTGGTCAAAGTCAAAC TTTGTATGTATGCAATAGATTTTGGGAAGGAGCGTTAGATATTTTCCTTA TATTGATTTGTTAATATGGCTGATGTTATTATGTAACACCTTTTACCGAG AATCTTGCCTATTGTGAATTATTTCCCTAACTGTACTGTAGCTGCATAAG TAATTAATTGCATGCATATTTAGCTCTTGAAGTTCAGTGTTCCATTTGAA ACTCACAGCCAGCGCATGAGTCCAACTAGTATAACATTTCTAACTGCGTT TCTCATGTCTTAATTTCCCATTGTTCATTTCCTGTGGTTAGATGATTTAA GATGTTATTTTATACCAAGTAATTAAATGTATGCGCACCTTTTCATGGTC CATTACAGTATATGTAAACCCTGTGTTTCTTACCACTTAACACGTAAAAT AATATGATTGCCTTTTGCCCATAGTGAGCCTGTATAGATTGTCTGTTGGA TGCTAATGCTGGGGCATATCATGGAGATGATTAAAAAAACTATAAATGAT TTGCTCCTTTTTCTTCAGATAGGTTCACCTTTGATCCAAAATTCATTCTT GTTTACTGCTTTGCTCAGTGGTGCCCCTGTTATCATGAAAGGCTTGCAAT TTCATGAATGCCCCTCGTAAACTATTTGATTTTACTTATCTAGAGTATCT GAAACTGTGTCTGCAATGTGAAGGAGAGGACATGTCAAACCTTCATTTAG GTCACAGAAGCAGCCAAATGGAGTCAGGACGTCAATTTGTACAATATACA GAGACATCTGGTGTTGTTTTGGAGGAGATTGCGGCAAAGTGTGGATTTAA GGTAATTTTGATGTTACTAATCAGATATCATTATCTTCTACTTATTAGCT TAATGTTTCTGCCTATCTGGTGTTTCTTCACTTGTTTCTAGGTGGAGTAC CAGTCAACTCTATGTGATACTGCGGACTTGCGATTCTCCATTCAGGTAGA TTGCAACTTCTACTGATTGAAAGTGTCAATAATGATATTTTATTAATAAA CATCTTGTCAATGGATTACAATATTTCTTTTTTATTGAAAATTTTGTAAA CCTGAGGTAGATGTCAGTATGTGATCTTTATAACAGGTGTTACAGGATAG CCACTATTTAACATATATTAACATTTCACCAACTCTTTAAGTATGCTGCT GCATGTAAATTATTCAAATCCACTTTCAGTTTTCACACTACTGCGTCATG GTTCTCCATTCTCTATTTTCTGTGTGGATCTTTCAGGTTTGGATTGTTGG AGAAAAAGTTGGGGAAGGAATGGGAAGAACCAGGAAAGAAGCGCAACAGC GGGCAGCTAACATAACTTTGAGAAATTTGGCAGGTGATTTTTATGTTGTA CTCCCTAGTTTGTGACTCCAGATGAAAATTGACAAATATGCAACTGAGCT ATAGGTGGTTGACAATCTGTTGTTTGGGGTCATATTTTAGTAATTGACTT CTTACATATCATCAAACTCTCTGTATCTTGCAACTGCTTGTTGTTCAAAT TTCTCGCAGTCGTGGCACTTCAGTTACTAATCATCTGATGTCACTGAAAT GATTCTCCATATGTTTTTGGTGGTTTGAATCAATGGGCTTAGTTTTTTCT ATCCATAGTACTGTAATAAATGCAGTTTTCTCATAAAAACTGTATATACT AACTCTCTTTTGTTTTTAATATAATGCTAGATTTTGACAGATGAAGTTTA CTTGCAGATAAATTTCTGTCATTTGATCCAGATAAGTCGACAGTTCCAAA GGATAATGGCTTTAGTAGCAATCCAACCTCGTTCAAATATACAGGAAGTA GTAGAGATGACATATTACCAGTTTCAAGCACTTCAGATGAGTCTAGATAT ATGCATGAGAGAGTTTATAACTCAACCAAATCCTCTAGTTCTGTTGCTGC TCTCAAGGAGCTTGTAAGTAGCTGCTTTAATTGCCAGATTTTAATTAATT GTGCCGTTTTAACCCAGATATGTGTTGCAGTGTACAGCTGAGGGGTATAA CTTAGTTTTCCAAGCTCAGCCATCTCCATCCGATAATTCGACAGGGAACG AAGTTCATGCTCAGGTAAGTACTTCATTTCCGTGAATGCTCATTAAAAAA AATTCTGATACATCAGGGCTCACTTTATGTATTTTTTCAAAGCTCATGCT TTTAGTGTATTTCTTACTGCGTACTTGTGATTGGCTTTTCAGATCGAGAT AAATGGGCAAATCCTGGGGAAAGGGTTTGGAGCAACATGGGAGGAAGCTA AGCTACAGGTTGTAAGCTGATATAAGTGAATTATTTGTTTTATTTCTTCA CTTCGTTCTTCTTGGAGTTTTGAAATCAACAAATAAACTCAGTGGTGTGG GCGTGGGTGTTTTATTTCTTCACTTCGTTCTTGTATTGCTTTTATTAAGT CTCTAAAACTATTATTTTTATTTTCAAGAGTACTGAGGTTGTCTTCTTTT GATACAATAATAAACTAAAAAAATTGAATGAATATTGTTTGAATATAAAG AGGTTTTTTTGTGGATTATGTGCAGTTAATTTGCAGTCTTCTCTAACCCA TTTTTTTTCATAATATCCTATTGTAGGCTGCTGATGGGGCTCTGAGAACG TTGAAATACATGCTTGGTCACCTTGCACAGAAACGGCCTGCATCTCCAAG GTGAGGGTTTCCTAGTCTGCTGTTGTAGATCTGTTAGATTTTTAGCACTC AAGTATTGCTGAAGATCCGGGAAAGCTATTTTGAAATGTGTGGTATTTTG GGCCTTTTACTGGGGCACTAGGTTTATATCCGAAAACAGGATACCATCCC TTATTTTCATAGAAGCATAACACTATACCAGCTTTCACGCAATATAGGAC TCTCCTGTTGCTTATAACATGGAAGCACAGCTTACAGAATGAGGCTCACC TGTTTCCTTTTTTAAGTTAGAAATTAATGGAATAGAAGTGCCCATCCCTA TGAGTTTGGAACCGGATGCTTTATCAATGGCGTACTGCTGTAAACCCTTG ACGTGAAGTGTTGGGAAGAAGTTTTCATTACCTAGACTCCAGACTTGCAG AATGGTACTTGTTTGATTACATTTAGCCTGAATGAAGATGAGAAGAATTC AACTTATCCCCTCTACTGAGATATGCAACACATGCTGTACTGTTGTAGCA TTGTAATCAGTTTTATAGTTTTGTTGTTGCTAAGTTAAGAAGTGAATGAT GAAGTTAGCTGAGTTTTAGCCTAGCAATGATCACAATAGTTTTTACTCTT TTCACAGGTCATTTGTGTCCAATTATAGTAAACGCTTCAAGCCAGATTTC CAGCCGACTGTACACAGGATTCCTCCTGGCAGATATTCTAGGAGTGACAG TTACATCCCTTGATTGTTTTGTCTGAATTCTGCTGAGATGGTGCACCAGC AATTCTATGCAATCTGTGGCCCCAGAAGAACTTCCACAGTTGCAAGTTTG GCGAGATGGTTGCCGGAGGCAAGAAATAGTTGTACACGCCTGTACTTTCA TGTTCTTCATTTCGCTGTCCGCTTGTCTCACTGCCATTTCCAAGTCCAAG CTAAATCCAACAGATGTGGCTTGCAAGGAGTTGTCGTGATCTGCTTCCCG GGCAAGCCCACAACGCTGTAAATATGATTTGCCTCGGATCTGTTATCTGT GATGCCCCAGCTGAGAGTGGATCTTAGAGCAGGATGGCAGCTGGTTAGGA GACATTTTTTTAATTATATTATACATCAGGTTAGCACCTTCCGATGGAAC GGGTGGCTGCTAGTTGAGCTGATTTGGTCGCTTATATTCTATTGAGGCGG CTAGTGTTATTCTTTATTTATTTTTCAATACAGTTGACTTCAGGAAGGGG AGTAATTAGATTTTTTTTCCAATTCTGGAATGCAGTGTTAATTGGTCGAG CCACTTCTGTAACTTGTAAAGATTTGCTTTTACGGCTGGCTGCTGACTGA GACTGTCTAAATTAAATTGTAATAGTGTTCTGTTCTGTTCTGCCTGCCAG ATAAGCTATGCTGTGAGAGCTTACTACTTGTACAACCAGTGGACCTGATG T

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.