Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE018196

[Submit comment/correction]

Sequence	AE018196
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE018196
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATAAGAATCTTCAATCTGATTGTTGGTTAGGTTTATCCTTTTTTGA ATACGGAGTAGTATAAATATGCAACAAAATGGATGCGGATATCCGAGCCC ATCTAATCTAGGTAGAAATTCGATTCAGAGACTTGCTTGTACGTTTTGCC TAAAATTGATTCTGAAAATACAATCCTCGTAGATACTGTAGGAGTAGTGT ACTACCCTAGGCAAAGTGTAGCTCAGATCACGGAATCCAAAGTTGATCAC AAAATTTGCAGGCGGAGACACAGAAGAAAAGCGGAGCAGGAAACGAGACA ACGAGAAGGGACAAGGCAAGGAAGCGTCGAGAGACGCACCACCATCCCCG GGCCCCTACCCGCCTCGTCCGTACCGCGCCGCACCGGTGGATAGGTTGGG GGATCTCCGATCTTGGCCCTCCTTGTCCTGTTCAACAATCAACACCTCCG CGCGACGAGTCCCTCGCGAGCCCGGCCTCTCGAGCGCCTCCACGCCCGCG CGACGAGTTCATCGCGAGCCCGCCCCGTCGGATCGCGTCTGTCCCAGAGC AAAGGAGGCGGAGGAGGGGCGTCGTGCGCCGAGCTCGGGAGTCGTGGCGC TGTTCCGAGGCTGCTTTTCGTTCGGGTCGGCGGGGCGGAGGCCCGTCGCA TCACCCTTGACCTCTCCGCCGCGCGCGACCGTAGCGGCGGCAGCGGACGA CGGCGCCAAGATGAAGGGCCTCTTCAAGTCGAAGCCGCGGACGCCGCCCG AGGTCGTGCGGCAGACGCGCGAGCTCCTCATCTACCTCGACCTCCACTCC GACTCACGCGGCGCCGACGCCAAGCGAGAGGAGAAGGTGAGATCGAATCC GTCCGGCCATCCTGTTCCGATCCCCTTCCATGCCCACGGATTTGGCTTGG ATCGCGCCATGAGAGTGGAAAATGTTTTATCCCTTCCTCGATTTGGCCTG ATTTGTGGCCCGTACTCTTATTTCCATGAAAGCCTCAGCGCACGCTCCTC CATTTGCAACTATTATTTAGCCCGTTCTAGCACCTATCTGGTTTACTTCT TCCTGATCCACGATGATGATAGGACCGTAGCAAATAGAAATGTTCCCGTT CATGGAGCTCCGAGTGATACGAATTTGGTATATGAGCACATATCAGCATT CTGATAATGTTGCAGATGCACGTGCGGTAGATGATTGGAAACTTACTTGT TGTCATAAGTTCATATAATGCCCGCTTTCCATTTTGGTATATGGGCATAA ATATGTTAATTATGATAATGTTGCAGATGGGCATGTAATAGATGATCGAC GGCTTACTTGTTATCATAAATTCATATTTGATAATACACTTCTTGTAACG GTACACTACACCCGACGTAGGAAACAGGCAGATTTGTGCAACAAGGGTGA ACTTCTAAATTATGGCTTGCGTGCTTGTCCCGCTACTTAGCAAGAGTGTC GCGAGCAGAGCAAAGGTCTACATGGGCAGCAGCGCCCCGCAGGATGCCAG GCATGGACCCCTGGACCTTGTTGGAGGCAAGGTTGTTCTGGACATCCCAT AGGCGCCACATGAGCATCAATGACATTCTCCCAACAGCAAAGGGGGAGCG ATGTACAAAATGTAGCGGTTCACCGCGATCATAGGGTAGTAACATGGGAT GGGAGGTAAGAAAGAATTCAGGAGACGGAGGCTACAAACGAATTCTATTT TGTTAACCGTCTCCATGCAACTGCCGTTTTATGCTGTTAGAGCTCATGTA CATGGGCCACAAGCTAGCTATTCGGCCTAATTGCTGCGAAACCATGCAGC CCAACGTACGTGCCCCCCTGCCGACTTCTCTAGTCAGCCAGTGGCTGTTG GCACATACCAAGGCAAAATATGAAACTGTTTATTTGTGATACTAAATTAT GTCAACTTAAGTGATGCTCCTTCAAGTCAGTGGTGCGGAATTACGAAAAT ATAACCGCCCTGAACTGTGTTAACTGCTTTATGCTCAGAACAAATTGGCC TGCAGGCCACAAGCGGTAACTACGTATACAGATCTTCATTTGAGCAGTAA ATGCCTTCCTGGAGTAATATTAGTGATAGCCTTCTCGGAATATGATCTCT TGCTCAGTTTGTTCTCAAAATAAATAATACTTCTCAATTCAAATTATATA TTTCTGTACACTAACTTTAGCTAAAATTGTTTATGCAGATGGCAGAATTG AGCAAGAATATAAGGGATTTGAAGTGTATTCTATATGGCAACGGCGAGCA CGAGCCTATAACTGAAGCTTGTGTGCAATTGACCCAAGAGTTCTTCAGAG AGAACACTCTACGATTATTAATTATCTGTATTCCGAAGTTAAACCTGGAG GTACGTAACTTGATTTTGTTTTGTGTAGATCGTAAGAAGATTACAAAAAT ATTTTATTCAGTGAATACTTCTGTCGTTTAGATGGCTAATCATTTCATAG ATAACATTTTCTTGCCCTTTGGATTGTTTCAGACCAGGAAAGATGCTACT CAAGTTGTTGCAAACTTGCAAAGACAGCAAGTCTCCTCACGGATAGTCGC GTCTGAGTACCTAGAGTCAAATAAGGATCTTTTGGACACCTTGATTTCTG GGTGAGTAGCAAGTAATAAAAGCCACATTGATCTTTTAAAAGAAATTTGA AAGTTTTTCATATCTTGTTTGTTTATCTCTCTATCTTTTTTTGTGAATTT TTCTCGGTTTTTATTCCATGCATGTTACTGTTACCTGAGCACTTGCATTG ACCTCCATCACTCCCCTGTGACTGATAAGCTGTGTGCTGCCGTGTTCTGC ACATCCCATTTAACTCTTGATTAGGCAACTAGCTACTTTTAAATCTGAAG TAAACCTAGATGATCATATGAGGACACATCATGCTTCCCTTTAAATTTTA ATTTATACCATTGGGTTCATGTGTTTCTCTCTTTATGCCTCTGAAATATA TCTTTGTTACTGATTCTATAATTTACAGATTCTGCAAGAAACATGCCCCT TTAGAGCATCTCTAATGATGCCTGTAAAAACGTGAACTGTAAAACGCGTT TACAGGTCATGGAAAACTGCTTTTACGGGTTGAAAACACGAGGCGCAGAA CGGAACCCATAAAATTGGACCTGTAAAACGTGTTTCCTTTTTTTTTCCCA AACTTCATTTCCTCATCGATTCAGGCCGTACCGCCTGTCCCCCACGCCTG TCCCCGTGCCTCGCCGGCCGCGCCGCCCTTGCCTACGGCCTGAACCAATC TAGCTAGCTAGCAATCGTGAGCTGCTGCTGCTTGCTTGCTAGCTTGCAAA GCGTCGCAGGAATCGAGGCGCAGAATTAACGTCGCACATGGACTGAACCA TTCTAGCTAGCTAGTAATCATGAGCTGCTGCTTCTGCTTGCCTGCTAGCT TGCAAAGCATCGCAGCAATCGATCAGCTTGCTTGCTCGTGCTGCTGCTGT CCCGCTGGCCCCTGACCTGGCCGCGCTGTGCCGCGCGCCCCCCCTGGCCT GGCTGCGCACTGAGCTCGCCGCACCTGTCCGGTCTGGCCGTGGCATGGCC GTGCCGCCGGAGACTGGCACGGACGGTCAATTTTTCCTAAGCAGTGCTAA TTTCATGGCTGGAGGGACAACATACGGACGGCCGCCGGCGGATGTGAGCG GCGGAGGAAGTAGCGTTTTGGCCTGTAAACGTCCCTCGGAGCGCTACATG TACCGGCCGCAGGGTCGGGGTTCTCGGGCCACTGTAAATCGATTTACAGG CCGGGCCGTTTTACAGGTTTCGCTAGATCAACCAGACGCTCGTGAAACTG TATGTCGCCGGAATTTTACAGTTTTTGGCTTGTTTACAGGCTTCGTTAGA GATGCTCTTGTGTGGCTTGTGTCACATGGTCTCCATCTTCCCGCAATAGT ACTAGGATGATTATTGAGTGTCTTCTATTTTAAAACTGATTTTAATTATG AAATCAACAGTTAGTACATAACTGGATTCGTGCTGGTTAGCTAGTTAGCT TTTATACATTTGATTTTTGCACCTCGTCTTTCCCATTCATCACTCTGTGA TTCTGGTCATCTCAAGCGACTTAAGTTACAACAAATGTTGCCAGTTTTGT GAAGTTGCACTAGCTATATGGTTATTGGGTCCAAGTATTGCTTCTGTTTT GTTTATAACTGTGTTATTGCTGTTTGATTTGTTTCTTTCTTCACCTCACA GGTATGAGAATATGGACATTGCTTTACACTATGGTGCCATGTTGAGGGAA TGTATACGCCATCAGAGTATTGCAAGGTGACATTACTGTATTGAACTCAG TTGTCACGTGAAGCTTAAAGAAATTCATCTCACAATTAAACCATCGCCCA TTTACCTATCAATCGAAGAACCATAGGATGAATGTTATTTTTGTATGGGA ACAAAACTACAGGGGCTAACACTAATATTAACAATTGGCAGATGAAAGGA GAAACATCCCATTCGATCCAAAAGAAAGCCAGACAAACACTAAAACAACC TTTTAAACTTGACCCAATCACTATGGCTTTCCTAACATATCTGTCAAGAG ATCGAATATGTATTCCACATTTTCCACAAGTATCACTTTTTGTTGGAAAG GGTCAGAGAACACACTAAAATTACAAGCCATGAATAGAAAATAGAAAATG TATGTTGCTGATCCTTGTAAAGTGCACCTGTGGTTGCAAACTTCAAACAG TATTATTCAGTGATATGTGTCTCTGCACCACTAGAATATATCACTAAATA TGTAACACCGGGGCCCTCTTGCATCAATGTTTCTTGTATGCATGTAAACG AAGTAGATCAGAAGTGACACGCTTTTGTAGTTTGATTTAGTTGATATTGG GAGTGGTCGTTTTAGCTCCATTCTTCTCCAGAATAGTATATGCTAGCAGA AGAAAACAATGCCATTAACAGATGGTCTATGCATAAACTAATCTATTTTA CATACACTCAAATGGTGTAAGAACTGTAAGTTACAGAAATGGTGTTTGAT TACCTTAGTTTTTTTCATCTACAGGTACGTTTTAGAGTCTGACCATATGA ATAAGTTCTTTGACTATATACAACTTCCAAATTTTGACATAGCATCAGAT GCTTCCGCAACCTTCAAGGTAAGCTGCCTTTTCTTTCCTGCTTTTGCTTT TGTTACGTTGACAGGTATGCAAGATATATACTCCCTCCCTTTCAAAATAT AAGATGTTTTAGCTTTGTGAAAGAAGTGTATCTAGACCCCTTTTAGTGTG TAGGTTCACTCCAAACATAGATGAATCTACACACTAAAAGAAGTCTAGAT ACACTCCATTCACAAAACTAAAATATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGT ATAACGTAGCACTGTTGCTTGCTTGATGTGGCACAGTTGGCAGTTCTTGC TGCTTCAAGAAACCAGACTTGTGGAAAAACTGTTAAGCTGACTTGCTTAT CCACTTAACTTGTATGCTTACGCCCTACTACAGTCATACAAAATGACACA ACTATATCTGCAAGCAGTTACTTCTTGAGTTCAATGTTAGTAAAAATGTG GGAATGTGCATGCTTGCTTGGGTAGCTCTATGATTTTATCACCACATTGC TGTTCGTTCTCACATAGTCACATATACTTATGTAAGTTCATTCTTTTCTA CCTTATAAACAGGAACTTCTGACAAGGCATAAAGCAACGGTGGCAGATTT TCTTTCCAAGAACTATGACTGGGTCAGTACTTCTGCATCATCATTAAACT ATGCCACTTACAAACATGGTTGTGTCCTAATTGTCCGTATGCCTTAGAGC CTCATGATCGCAGGTTTTTTGTCAGTTAGTGGTGAATTACTATTAAGAAA ACACAAGTCTTGGTCCCAATACATGCTCTATTGTGTTTCGAGTGCTTTAG TGTGGGGTGTGATATGTGTGTGCATCACATGAGCTTTTTTTGGGGTTGGG GGTGATTGACTTGGTGAGATGGCCAAATTGTAGATCACGTTATTTCAGTG TATTTGCGATTCTTATTCTCATATATGTTCACTGCATGGACAATTCTTGG ATTGTATTCAGATAAATTGCATTTCTTCCTGTTCCTAGCTTGGTTGGCAT CATAGCTTACTTTTTTGTTATGAACTTATGATGCGTTTAATGCCAAGTTT CTGTTACGTATATGTAACAAATGCTATCAGTGGCAGAGTTGTTGCCGTTC TTTCTGCATTCCGTTTTGCCTCGTCTGATTTCATCCCTTTTCCTCAGTTC TTTGCAGAATTCAACTCTAGGCTGCTATCATCGACCAACTACATAACAAA AAGGCAAGCAATCAAGGTATTACTATTATGTTCTCTGTATTCCATACTGA TTTTGTATGTAGTGGCTGTACTGTTTACCATCATATGTACAGATCTTTGT AGATTTGCTATATTTTGTGCTTTTCTGTAACTGGAATATGGTTTGTATTA TCATCATACTTGAATAATGTCATTAGAAAATTTGACCAAACAACCCTTTG TAGCTTGTATGCTTTGAACCTTCACGTGAAGCTTGTGAATTTTCATGAGC CGTTTTCTGTTATAATAGGACAACCAAGCATAAACGTATCATTTTTTTCG AGTTTAATGGTGCACACCTAACGCAACTGAAACATGAAAATTTTGGTCGA TTTTTTAATCCATTTTGAGTTCATATTTTAAGACGTTGGTAAAAGAATCC ACAGCAACATTAGTACCAACATATGCGCCTGGTGGGAAGATCCACATGCA CAATCAACTAAGCATATGCCAGATTCTGCCCCTAGTCAATGCAAGGCATG CTTGATCTTTGCTTTTTCTGGAGCTGCAATGGCAGAAAGCATTGTGTTGA TTAACTCTCCTATCTTTAATGTATTTGTTTCCTCAGCCATTTTGAGATAC AACACCTACCTAGTGTTAGGCTTTATTTTAGCAGTATTTGTTTTTTTATA TCATTATTAGTTTCTTCAGTATCTTGTATACATCTTCTATTTCTTAAGTT TCTTATCTTTCATGTTTTTGTTTTCTTCCAGCTGTTGGGAGACATGCTGC TTGATCGATCAAATTCTGCCGTCATGATGCGATATGTTGGTTCAAAAGAT AATCTTATGATTCTGATGAATCTCTTAAGGGTATGTTTACTGTATTTGAT ATGTAAAATTTAGCCTGCAACTTACTGGAAGATTTAGATCTACCAACTAG GGGTGGGGAAGGGGGGTAAGGAGATATCAAAATTAAAGGCTTTCACGCGA AGTGTACCTGCAATAGCTCAGTGTCTTACCCAAGTCTAAGGGGGTCAGGT CCTTTCTATAGGCTGCCACCAGAAAAGAGCCTTCATGGTCAAAGCTTCCT TCCTCGGTAGCACCGGCTTCAAACCGATTACACGGAGATTCAAACCAGTG ATCAGATTTCTGAAGCCACAAGAGGCACAGGCGGAAAAAGGCTTTTGATC AAGGTCGGTAGTTCCGCAAAGAGTACAGTCACATCGGGATTGATGATACT CCGCAGAGCTATGCCAGAACCATTTTCCCGGTGATGCTGGCCTGAGGCTT GGTGCCACCGAGATTCTAAAACACGGTGTATGCTGTTCCACAGAAACCAA ACTGTGTTACACTGGAAACAAACCGGCAACACACACGCTCAGGATGTGCG CAAGTCTAGAACAAATTCCCGGTACCACCGGGTAGCACTGAAAGCAAGAA ACCAGTACTTTGTTGACAACAACAGGAGCTATTCTTGGAAGCACTGGCTA CAAACTGGTTGCACCGAATTCTGAAGCACAACATGTAGGACAAGTGGTCA ACCCTAAAGAATAGGTTTCCCTAACTCCTAACACAATCGCCATTCTTGGT AGTACCGGTTTCAACACCACTCATACAACTATTGAAGCTCTATGAGGCTG AAGCAAATCAGGCTGCTAAGTTTCAGACCTCACAACGGAGCTCAATCTCG ATACATATGAAATAAAGCTGTGGTTCGCTCATATTTGAGTTTTATGCCGT CCGGTATCATTGAGAATCACAAAAGCCGTCTCTTGAAGAGATTTCAAAGC ATATATGCTGAAAAAGATTCAGCCCTAGCTGAGCATCATCAAGAAACATC CACCAGCTTAGATATCTTACCCCTCTTTATAGTATGATTTGTCCCATACT CCAAGTGATTCTTGGAACCACTAAACGGATTAGAAAACTATCTCTAATCT TCTTTAAGCCATCCTTCCACATCAACTTTATAGGGGTCGACAACCACTGG TTAGACCAATACATTTGGGACTAAACACCTCTTTTCACTCAGTAAACTAT TACTCCCTCGTCATAGATCATCAAAACCCATTTACAATGTTTTCTATGCC AGAAATAAGGAGGTTGCTCTTTTTGCACATCCTAGCCTGTACTGGATGAC ATAGATATATCCTTTGACCTGACCTTATTTATAGAAGCTATGCTGAAGCC CCCCTGAACATTTGCACTTTTATGTATAGAAAGTAATGTTCTAGAGGAAT GTTAAAGACTGCTGTCAGTTTTTCTGTTCTAAGGAATGTAGTGGAATCGG GTTTGATAACCCGATCTTGATCCTTTTTTACAACTTTGTTGATCTATTCT GTGAAGGGCTACTGGTACATGGAGTTTTGAACTTAAATTCTACATTGAGC TCAATCTTCATCTGGCTATGGCTAGTGTTTTTTTTTTTTACTTTGCAACA TCAGCAAAGCTATTGACATTTCTTTTGATGAAATAACGCGCTAACCCCTT TTCTTGAAATCATGACTCCAAAATAGCCAGAATAAGCTAGAATTGGGGTT ATAAGTTGGTATTGGTTACTTTCAGTATGATTCATCTCCCAATCGGGCAA TATAAATGGTCTCTGCTGGGAGAGGTGAGAACTCTAGCCCCCAAGATCTG TCATAGGATATTGGTTATGTTACTGCTGGTTGTGTGTGCTCTATGATTCC ACCACGAATGATAGTAAACTACTCCCTCTGACCCATATTAGTTGATTTAG ATTCATCTAGATACGAATGTATCTAGTCAAGTTTTAGGGCTAGATACATC CGTATCTAGACAAATTTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGATA CAATGATGTATTTTTTGTTACTGTGCACGAATCAAATATCATCACAACGG AGGACTCTTTGGTCATATGAAACTACATATCGGAAGTACCAGTGTTTACA CCTCGGTTCAAAGTCTGGTGTGACTTTCTGATTACTGTTCAGTTTTACAA ACTTCTTTCAGATGACCATACTTGAAATACTGAGCGTCGCCATAATGTAT TAGTTGCATGATTTTACAAACTTCTTTCAGACGATCATACTTGAAATACT GAGCGTCACCATAATGTGTTGGTTGCATGATTCCTGTCAACATTACCGTG TTTTCAATTTTCTTATTATTTCTAAAATTTCCAGGATTCAAGCAAGAATA TTCAAATAGAAGCATTCCATGTGTTTAAGGTGAGTACATATATCATAACA AATGTATGTACGTAAGAAAATGTATGGTCTGTCTAAGTTTACTCTCTGAT TATACTTCTGCCGCATTTCAGCTGTTTGCTGCAAATAAAAACAAACCAGC TGAGGTTGTAAACATATTGGTTACAAATAGAAGCAAGCTTCTTCGATTCT TTGCTGGATTCAAGACTGACAAAGGTAGTTGCCTACTTCAACAGCTGTTT GTACTTTACGTCTACACCTGCTTCCTATTGAGTTTTCCTCTAGTCGTTTC TTGCTCTAGGTTTTAATTTGTCATGGTAACTGTTCCATGTGAACTAATTG TGCTGGTACTTCCAAAAGAAGACCTAATAGTGCTTTTATGATTTTTTCAG AGGATGAGCAGTTCGAGGCAGACAAGGAGCAGGTGATAAAGGAGATATCA GCGCTGTAATGTCCCTGATGTAGCTTGCTGAGGCTTTAAGTTAGACATTG CTAAGTGGCCTCTTGTGAACTTACTGTATTTACCGCACCATGAGAGGCTC TTGGCTGGATCTGCCGTTATGTTTCTTAGCAAAGCTGCTCTTGTAATAAT AGACTTCTGCACATAATTATGTTGCGAGTCAAGCAACTGTATGAATCATA TAGCTGGATGCTGCTATGAAGATGCGATATTTATATAGTTTTGTTACCTT GGTTGGTTTAAAGTTGGGACAGGCTTTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.