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GrainGenes Sequence Report: AE046217

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Sequence
AE046217
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE046217
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCACTTCCCCACTACCACCCATCCACGCAAGCAAAGACAGCGGTTCGGC
TCTAGAAGAAGAGATGCTGGTCACGTGCACCCACAGAACCGCGCCCCCAC
TCCTCGCCTGGCACTTCCGCTCCCACTCCCACTCCCACCGGCGTGAGTTA
CGAGGCAGCCCGCTGCCCTCTTGTCTCCCTCCTCTCAGGTGCGTCTGCTC
GATCGATCCTTCTTCCGGAGCCGATCTGCGATCTCGTGCAGGATTACTCA
CCGCGCGGAGGTCGTTGCTTGCCTTCGCAGGTGTTTCCGCGGGAGCCATC
CGCCTGAGGCGGTGGCGACGATGGCTGCCGCGGCTGTCGGGGAGATGGTC
TGGGTGCCGATACTGGAGGAGGGCGTGTTCCGGTTCGACGCGTCGGAGGA
CGCGCGCGTCGCGGCAGGGCCCAGCCTGTCATTCGCCGAGCCGGGGCGGC
GGGAGGTGCAGCGTGCGGGAGGGGATTGCCCCTCAGTCTTACCGGCGTGC
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TGCTTCTTTAACAAATATTTACCTGTCGTGGTCTCTCCTGGTATCTTCCC
GTCAGGTTTTCACTTGGAACACAGATGCATGGGGTTATGGGCCCGGAACC
ACATCACTGTATCAATCACACCCTTGGGTGTTGGCTGTACTCCCTGATGG
AAGGGCATTCGGTGTCCTTGCTGACACCACACGACGCTGTGAGGTATGTT
CCCTGCATTTCTCTATAGCTTATATGTGAATCAACTAATCCGTACCTCTT
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CTCATAACCAATCTCTTCCTGTACTAACATCCATACTACATACACTTTGC
TATTATAAACGTTTGCCAGATGTTCTCATGTTCAGTGCTTTCATGAATTT
AATTTTCATATTGTATATAAACTTGGAGGTTGTATATCTTATCTCTAATG
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TGTATACCAGTATGATGTTATAGTGCTGGTGACAATTTTATACAACCAAT
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AGTGTTTTTTATTTTTAAATGCATTGTTTCTCCGAAGGTAATACTAGGGG
CAACAATTCATACCCTTTAGTTATGAGAAATAGAAGTGTATAGTTATTAT
TGATAGTGTTCAGTTTAGTATCTTGCATGTCAGTCCATAGTTCGAATATC
AATGTTAGAACCTGATAGCGTGAACTAAAAAGTGGGGCGGATGGGAACTA
CCGGAAGAGAGTTCAGTGTGTTATGCGTTAAGCCTCTCATTGTCAATATA
TATGTATACATGAATAGAATTTTGCCCACATGTTCTACCCTTACTATCCT
GTTTCCATCGCTTGTAAACCCCATTCACCCGTTGACCCTTGATAGTGAAA
CCATTGTTTCTCTCAGGAGGGGTAAACATAACCTGTATCAAAGCCAGGTT
ATTCAAAACTCACAGTTTTTTCTCGAGAATACGCAAAGCTTGTGTCTTGA
AGCATTGATAGAAAGATTTTACAAGCCTAAGAATAGGCAATTACAACCAA
ACACCGAAGACAAACGGCCCATGGTCACTAGACGAGCATTACAGAGGACG
TAGCCCATACAACCACTGGCCTGAATGCTATCCAGTTAACCAATCACCTT
GACCCTACTCGAGCTGCTCATGCTGCTGCATGCCATCACTTATTGGCGAT
CTTCAGCAGCAGCTGCTCTGCTTAGTAAGTGCACTGCATTCATAAGAAAT
GTTCCGCTAACCGTACTCCTACCACAATAATACATATGTCTACACTAAAG
ATCACAAGAGAAGTTAGAGTTGTAGAATAAAATAGCGGTGGTGGATGCCA
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TGTTTAAACAATCGTTATAATCTCCCCATGCAAACAAAAATGGAATGAAT
TATTCTTACTGATGACTCTTTTCCTATAGCTGTTTGTATTGTTGGAGAGT
AGATCATAATAGTGAAAATTGAAAAAAATATTTTCGAATTTGCTTGGTTT
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TGCTTGGATAGTTGGTCCAGCTGCCACTAGCATATATAAATGTCTCCTGA
TTCGTGAGTCACTGCTGGGCTTAAAATTTTCATACTGTCTCCACAGGTTG
TCAGGACATTTAGGGAGAAAGGCATTCCTTGTGATGTTGTTTGGATGGAT
ATTGACTATATGGATGGTTTTAGATGCTTCACATTTGATAGTGTAAGTAT
TTTTTGTTGGTATCCTAATTACTCCATGAAAGTAGTAATGTCAAACATCT
GGATTAGATTCCTATGCATGCTTGAATGTATATTTCTTAAAAATGCCAAA
TATCCTGTAATTTGTTCTAACTATTGCTGTCAGAATGGCTATGGTATAAA
CTTGTCACAATGTGAACCAGATAATGTTATTCTGAGTGCATTTTGACAAG
TTACTTTTATTCTGGTTGCACTGGTTGCAAGCTTGAAAAGCTTGTTCCAT
GGCCATTGATTGCTTTTGCGAGACATGGCCATCGATTTTGTTTGAGTAAG
TTGGCATCTTATCATATTTTACAGAACCGTTTCCCTGATCCGAAATCTAT
GGTCAATGATCTCCATTCCATCGGTTGCAAGTCAATCTGGATGCTTGACC
CAGGGATCAAGAAAGAGAACGGTTACTTTGTATATGACAGTGGTTCTAAA
AATGATGTTTGGATTAAAAAGGAAGATGACAGCCCATTCATTGGTATGTT
TTGCTGACTTCAGTGAGATCCTTTGTCTTCTTGATGACTTATTAGTAAAT
GATGCCTCATGTACTCTATTCCAGGGGAGGTATGGCCTGGTGATTGTGTT
TTTCCTGATTTTACCTGTGAAAGAACACGCACCTGGTGGGCTAGTTTGGT
AAAGGATTTTGTCTCCAATGGCGTCGATGGAATATGGAATGATATGAATG
AGCCCGCTGTCTTCAAAGTATACGCTCTATCATAATTTATTTATTATGTT
GTATATGTATTGATTATGCATCATAATTCTTTATTTTATACCATATTATT
TTATTTTCCCGCGTGTAATAAATTGTAATGGTGTCAACTTGCAGACCACT
ACAAAAACAATGCCTGAAAGCAATATACATAGAGGAGATGAAGATATTGG
TGGTGTCCAGAATCATTCTTACTATCATAATGTAAATTTGTGTCCCTTTG
TCAGTAAAAAGTGTTGGAGCGCAATCACATAGCTTTGCTACTTTACATGC
TTGTGTTGATCTTTATAATTTCCAGGCCTATGGAATGCTAATGGCAAGAT
CTACATATGAAGGAATGGCGATGTCTAATACAGATAAACGGCCATTTGTT
CTTACACGAGCTGGTTTTATAGGAAGCCAGCGCTATGCTGCAACCTGGAC
TGGTGATAATCTATCAAATTGGGACCATATGCACATGAGTCTACCAATGG
TTCTTCAGTTGGTATGTGAAGAATTTATGCAAGTGAAATACTTTCCATCT
AAAATAATTACCCAAACACTAGTCCTTCCTAATTTTTGACAATATCATCC
CAAGTCACTTTAGGAAAATAATTTTCCACTTAATTTATAAGCAAATGAAC
AATCCATCAGTATCCAAATTAACTGTACCGTGAGTGCAATCTTGTGATTT
GAAAGCAACGTATATTGCTTCCTGTATTAGTTTACTGCCTTGGTTGTTCT
CTAAGTTGCAATTTCATTACACGTGTTACTTATAAGCATGTTGTTCTTAA
AATGTTGCATAAGTAATCGCAGCTTTATAGGAATCTAATGGTGTGGTTAT
CTGATCAGGGTCTCAGTGGTCAGCCATTGTCAGGTCCTGATATTGGTGGG
TTTGCTGGAAATGCTACTCCAAAACTTTTTGGAAGGTGGATGGGAGTGGG
TGCATTGTTTCCATTTTCACGAGGCCATTCTGAAACTGGAAGTATTGACC
ATGAACCATGGTCCTTTGGTGAAGAGGTACTGTTTCACCCCCCACCCCCC
CCCCCCCCTACCCATGCACACAACCAAGAAGCCTAGATCTCTTTGCATGA
TGCCTTCATTTAAAATTTTCCATATGATTCATTACATGTCAGATCTATAT
AAGTGAGCCCTCTTTATTTTGAGATAACTAGCTAAATACTCATGCATTTC
CCTAGAAGTTTTCGATTGTGTGAGTTGCTTGAACACTTGTTCATCATAGC
CCCTTTGTCCAGATAAAAAAGAATCTGAAAATAAAAATAATCAAAAGAGT
GCGATACATCTGTCTACTACATAGAATGTATGATAATTGCTGCAATTAAT
TTTATGGTAACTTCAAGAGGTAATCTCTGAGTTGAACGGACGGCTACCAA
CTCAAATCTTTATAAGAATAAAGATAAAGATATACATTTTGTTCAACAAA
TCCACTAGGTCAGTCATTTAGCAACATGTGACATCCTGACCCAGGGATTA
ATAGGATTGATAGAATACTCATATCAACAAGGTATACCTTTTTTTTCCGG
AAGCTCATCTCTAAAGAACTCCGGTGTTAAGTTGTTCCCGGGTGTGGACA
AGTGAGGGCAAAATGCGCAGAAAAGACTAGAGTTGATCTGTGGGGTCAGT
CTAGAGATTCTAGAGAGCTGCCAGGGGTAACAGCCGATGTCCTGGGGTGC
CCGTGGTGTTGCACGACCCCATCATGATTTTTATTTGTTTTGATAAACAG
TAATTGGACTAGCTTTTTTTTCCCACACAAAGGCGAAAAGCTTTGCATTT
CGATGCATTGATAGAAAAGAAGTAGCCACATTACAAGTCCAGAGAGGACC
AACACCCACACCATACAACTCGACCCATCTAGGCTAAGCCAAGGCTAGTC
TAAGGGAGTATCTGGCGTACCCCTCGTGCTCCCGCCTCAGCCCACTACTT
AGCTTCCGCTTTGATCATGTCGACTAGGGAGGCTACCGAGGGGGATTCGT
TGTTGAAGACGATAGCGTTCCTATGCTTCCAGATCCATCATGTCGTGAGC
ATGATCATAGACGAGGTTCCTTTGCGCATGGGATGTGGGTTGGAGCGCAC
CACCAGCTCCCACCACTCCGCGAAGGGGCCTTCAGCAACCGGGGGTCCCG
CGGTAGATCAGATCCAATACAAGACCTCATGCAAGATAGTCCGTGCAAAC
GGGCATCCAGTGAGGATGTGCGACATTGTCTCCGCAGACTGGTTGCAGAA
CACGCAGCGCGGCCGGTGAGGCAGCCGTCGGCATTCCAGCCTTTCACCCG
TCCGACATCTGTCCTGGCAGGCAAGCCAGACGAAGAATTTCACCCTTGGT
AGCGCCCAGGATTTCCAGGTCAGCCTCCATGAACTTGAGATCACGAACCC
CTGAAAGAGGGCATAGTAGCAGGATTTGGAGGAGTACTGGCCGTCCGTCG
ACCACCGCCAGATAAGCTTGTCTGGCTCATCCCCTAGGTGTATGGCCTGC
AGCCTGCTCCACAGCTGCATGTACTGCCACAGCACGAGGGGGTCGATAGC
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TCCGCACCTTTCTGAGGCGTCGCGGGATTAGCGCTAGGAGGTCCGGTGTT
ATCTCCCCGATCGACTTCCCGTCCACCCATCTGTCCATCCAGAACAGCGC
AGACGTTCCCTCGCCCACCACCATTGTGGTGGAGGCAAAGAAGATCTCTC
GCTCATCCTTGGTGAATTGCATATCAAGCCCGCGCCAAGGTCGCAAGGGG
TCTGTATGCAGTCTCCACATCCAGCGGGTCCGGAGGCTAGTGGCCGTGCA
GGCAAGGTTTGGAATCCCAAGACCGCCGTAGCAGATCGGCCTGCACACCT
CCGCCTACTTAACGTGGAAGTGCCCACCCTCCGCCTCCTTCTTCCCCACC
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GGAGAGCACTATAAGCTGGTGAAGTGGGATCGCAGCGAGCACCGTGCGAA
TGAGGGTAAGTCGTCCCGCTTTAGGCATCATGGATGCTTTCCACGTGGGC
AGTTTATCTGCAATTCGGTCGATGACCAGTTGGAAGGCTTTGGATGGCGA
GGGGTATGCCAAGGTACTTGACGGGGAAGGGTGCCAATTGGCACTCCATC
ATGGCCGCCGCGCCTTTGGCCACCTCCTCCGAACAAGCAATCGGGGAAAC
ATCTTTTTTCTTCATAAGAGTTTATTACGTATTACTGTAACAGGGTTTTT
CTCTCTCTCATTGTCTACAATACATATAATCATGGGTGCTTGGCCTTGTG
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ATATTGTTTCCAACAAGTATCATTATAGATCACATACAGTTCTTAATGAG
ATTATTAAATTATTACTCATAAGCCCTATCTTATGTGTTTAGCAAATCCC
ATGCATGCACACATACCCTAGACCATCAATTTTCATTATTTACACCCTCC
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TTCCAATGATTCTTTCCCTTGGTGTTATAGAAGTACTCCCTCTGACCCAT
ATGGCGACAATTAATATGGATCAGAGGGAGTAACATTTTTGGTTATTACG
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CTTTCCAGATTCTTAAATTCTAACAGTTCATTTATATTTTAGTGTGAGGA
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TTACACCTCAAAACTATAAACTTCTAACTAATGGAACACGGAGCTGTTAC
ATGAATTTAGCAGGAAAATAGCATTTTATAAATGGGAAATTTGTGAAATT
CCTTCTGAAGTGGAGCCTAAGAGAATGCTAGCTATTGATATTTATGATGC
AAAACTTCACGCTGAAAATATTTCTTCCCTTTGGCTCTTCCTTACTGGGA
TTATCTCATTGGTGGGCTGATAGAAGATAGTTTTTTTGGTGTAATACTAA
ATCATATCCCTTGTTTTCTTATAGACTCGCAAGACCCAGAATTGAGGAAA
ATAGAGACTTCATTTCTCCTGGGACCGCTTTTAATCTGTGCAAGGTAATG
GTTTCACATCATTGCGCCTACAGAATATCTTATTTTTTTGCCTTTTTATC
TTGGAAGACCAGATGTCTGTTCCTGATCTTCTTCTCTATATGGGCTTGAA
TGTTCTGGTGTGTCAGTAGGCTTGTCTGGAATCTGATTTTGAACCATTGA
CTGTAAATGTTTAACTCTCAGTCATGTGGTTCTTATACATAGAAAAATAT
ATAGTGAACTAATGAAATATATTATAATTTTGTCTGTGCTTTGGTGTGAC
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AGGATCTGCCGGTGATGTATTTACAAGGTGGAGCAATACTTCCTGTAGGC
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CTTACATAGCCCCAGCCAAGTTACTTACAGTAATTTGCAAGTACTTCTAG
ATATATTTTCTATAAAAATGAGAGAATCTGCAGTCCATCTAATTAATCTG
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TCAACAACAGCAACAACAACAAATCCTTATTTGTCCCAAGCAAGTTGATG
TAGGCTAGATATGAAACCCAACAGAAACTATGGAACCAAAAAGTGAATGA
GGGAAAAAAGTAAACAAAGTACGAATAAACCAAGGTAAAGCTGGGGTGTC
CTATTTGAATGATAAATTATGTTTTACACCACGATGACTTGTTTTACAGG
TAAAGCTGAAGGTGTCCTTTTTGAAGATGCTGGGGATGGATACGGGTTCA
CACAGGGGAACTATCTCTTGACATATTATGTTGCCGAAGTCCACTCATCA
GTGGTTTCTGTGGAAGTTCTGAAAACTGAAGGATCCTGGAAAAGACCCAA
ACGCAACTTAAACATAAGTATATTACTTGGTGGAGGTGCTATGGTATGTC
TATTGGTTTATTTCTTGTTTACCACACCAGAAAATAAACAAATGTTGGCT
CCAGGGTTTTAATGTTTTTTGTTAACTCAGATAAGTTCACATGGTGTCGA
TGGTGAAGAAGTACATCTTACAATGCCTTCCCAATCTGAAGTATCCAGCT
TAGTTGCAACAAGTGAACTTGAGCTCAGGAGACGTTTGGGTATTGATCCT
ACAACTTTTGATGGATCTAATGTTTTATATCTTAAAGAGCTTACTATTAC
TGTAGTGTAAATTCTCTGAAGTTGGCTTGCATTGCTATCTTGTGATGGTT
GTACAGAGATGATTCGGCCAATACCTGATATCGATGAACCATCGGGACAG
GAAGGTGCTGAGCTCTCAAAAATACCTGTTGATTTGAAGAGTGGAGACTG
GTTGCTTAAGGTTGTACCATGGATTGGCGGTCGTATTATCTCTATGACAC
ATCTTCCTACTGGTATGGTTCACCTGTGTTATATGATTAATGGACTCCTG
CCAGTCCTACAATCTAATTCCACTGATAGGATATTCTATCAAATAGACAT
TGCCTTGAATTGTTCTTGATCTTCCAGTACATCTGCTGCAAAGGGATAAA
TCTGAGTTATTCTCGATACTTTAACTTCAGTCCTTGTAGGCCATTGATTA
TTGCCTATGGATTTCAAATAGAGACAACTTTATTTGTTACCTTAAGTGTC
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ATCAATGGCTATGAAGAATATAGCGGGACTGAATACAGGTCTGCTGGCTG
CACAGAAGAGTACAAAGTCGTTAAGTAAGATCACCATTGAGGCTGTTTCG
TCTTTCATTTGGGTGAATAGTTTGTTGTGTAGTTCCAGTTTTGGCAAGAA
AATAACTATTACAAAAATTATAGGAGGTATGCTGAGCAATCAGGAGAGGA
GGAATCTATTTGTTTGGAAGGAGATATTGGGGGTGGTCTGGTTCTTCAGC
GCCACATATCCATTTTGCAAGACAATGCAAAGATTGTTCAGATTGATTCT
AGCATTCAAGCAAGAAGTGTTGGTGCTGGCTCTGGTGGGTTCTCAAGGTG
AGTGTGCTACATTTAATAAAAAAATCATGTTTGTAAATCTTTAATCAGGA
ATTGTGCAGCTCATGACATATGTAGTTACAATAAAAGCAGTCAGGTGAAT
GCTCCCATGGACATGCACTGGTGCAATAAAAGAAAATGTTCTCAGATACT
GTTATATCTTAGATTGCCCGTTTTGTACTTTTCTCCTAGCAATTTTAAAA
AGAGAAATTGATATTTGTTTCGATCAAATTTCCAATTTATTTACCATAGT
TAGTGATTATTGATTATACAAAGTTTCAGTCATATACATCTTTGATCATT
CAAAGTGAAATAATATCACGGCACATTGAAACTTGTTTTTCTTTGAAGGT
TGGTATGTTTGCGAGTGCATCCTACTTTCACTCTTCTCCACCCTACCGAG
GTGGTTGTTGCCTTCACAGCCATTAATGGTTCTAAGCAAGAGATCTCCCC
TGAATCTGGAGAAGTAACATTTGAGGGAGACCTCCGGCCAAATGGTAAAT
TAATCTGTTCAACGTTCTGAGATTTTTTTTTGGGGCCTGATCAGCATTTT
TGACATAAAACTGTTACTTTTGTATTGATTTTGGGCTTCATTTTTCATCT
CGGAAACTACCAGGGGAATGGATGCTGGTGGACAAATGTGCAGGGCTCAG
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GGGGAACAGGTGATTTGAACATGGAGCTTTGGTCGGAGGAAAGGCCAGTT
TCTGAGGCTACACCATTGAGGATTTGCCACCACTATGAGCTGAGACAAAC
AAGCTAAGGCATGTTTGTTTGAGCTGCAGCTGAATGACAAGTCAGAGACG
TTACCGTGTTGCATTTTATGGTTTTTTTACCACCGTATCATGAAATGTTT
TCTGCAAGTTTGATGTTTCCATCATGTCAATGAGCTAAGACATGTTTGTT
TGAGCTGCAGCTGAATGACAAGTCGGAGACGTTACCATGTTCCATTTTAT
GGTTTTTTTTACCACCGTATCATGAATTGTTTTCTGCAAGTTTGATGTTT
CCATCATGTCAATGAGTAGTTGCAGACTGTTGCTTTTTCAAGCGTGTTCA
TTTGTAGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.