Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE014276

[Submit comment/correction]

Sequence	AE014276
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE014276
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACCCCCCTTGCCCTCTCGGTCTGTCCACCAGAGTCCCACTCTCGCCCCC GCGCGCGACACGAGTCAACGAAGCACGGACGCGCCCAGTCCCCGGTCTCC GGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGCGATCGGCTCCCGGCATGGTCAGGACCGG GAGCATGCGGCGGTCCTCGCTGCCGGCCTCGCCCGCGGCCCCGGTGCCCG AGTTCACCGCCTCGCCGGACGACTACACGCTCATGGAGGAGATAGGCTTC GGCGCCAACGCCGTCGTCTACCGCGCCCTCTTCCTCCCCACCAACACCAC CATAGCCGTCAAGTGCCTCGATCTCGATCGGGTCAACAGCAACCTCGTGA GCTCCCTTCCCTTCCCTCTCTCTACTCTCCCGGCTCCGGCTCTGCTCTCC CACAATTCTCTGTTCCCACGATTCTCTGCTCTCGTTCGTACTAGGGTTGG GTCCGCGAGACCTGGTCATTTAGGGATGCATTGTGGATGCTGTCGACCTG AGACGATCGATCTAGTTATATTTGTTTACATGATAGTATTAGCTCTAGGA TCAGACTGTGGATTTCATTTTGTCCAAGTTTGGCTCTAGTCGAGGAGTTG GTGTACTCGATCCTGCAATTTCCGTTCGCATTTTTTTTTTAACTTTGATG GTCTTATTTCGTCATTTTGTGAGTCACCTGCATTGCCCTTGCCTCTGGAT TGGTGATACCCTAGTAGGACTCTTTATCTTTTACAATTTGGCCAGAGTTG GCCCTGGTCGAGGAGTTGATATATTGGATTCTGCAATTTCTGTTCACAAT TTTCTACTTTGGTCGTCTGATTTCGTCATTTTACCAGTGACTTGCATTAC CCTCTCCACTGGTTTGGAGATACCATACGACTCTTATCTGTATTTCTATT AGGCACAACTCTGGCAAGCTTTGGTTGCTATTTATGAATTTCACAAATCA ACATAGGCCACTCCCAATTCTACGCGACACTGCATTTGTGGCCCCTAGAT GGCATGTAGATGCAGCGAATTTAATGTAGGATGCAGTATTTTTCCTAGTA AATTGCGTTTTCTTTGCAACACACCGCAACTTCATATTCTTTAGCTGGCA TGAATCATGATCACCAGGAGTACTGCTTGCTCGCTTCTGAAGCGCCAAAC TGTACACCTACCTCTGAAAGTTACATCGCATAACGAATGGATTTCCATAT TTATTACTGCCTGCCTCTTGGTGTTCCCTTTCTCAAAGTTTTTATTACCT GGTGTATTTAGCATCTCACAATGGTATCTGATATCTGTATATCCTCTGCA GGATGATGTGCGCAAGGAGGCTCAGATAATGAGCCTGATAGATCACCCCA ATGTCATCAAGGCGTATTGCTCGTTCGTCGTCGATCATAACCTTTGGGTC ATAATGCCATTCATGGCAGAGGGTTCATGTTTACACCTAATGAAGGTTGG ATACCCTGATGGCCTCGAGGAGCCTGTTATCTGCTCCATTCTAAAAGAAA CACTAAAGGCCCTAGATTACCTCCATAGGCAAGGACATATCCATCGAGAT GTCAAGGTTAGCTTATTCTATTACTCCATAGGATTAATTTGCACTAATGT CATCAGAACTTTTGCTCAACATAACATTTTACAGGCGGGCAATATCCTTG TCGATAGCCCTGGTGTAGTAAAGCTTGGGGACTTTGGTGTATCTGCTTGC TTGTTTGACAGAGGTGATAGACAAAGATCTAGGAATACATTTGTGGGAAC ACCGTGCTGGTAACTATATTTTTCTAAATTTCTTCTTCTAGAGGCTCGAT AAGTATTTAACAATTTGAAAAGTGTTTGACATGCTATCTTATTTTGTTTG GTGTTCAGGATGGCTCCAGAAGTTCTCCAGCCTGGAACAGGTTATAATTT CAAGTATGTTTTGAATCTCATAGTCATGTCATGTTTGCTACTATAGTCTA GAATACATTGATGCATTAGTTTGGTTGTCCATGAGATGACTTGTCATTTT TTCACTTCAGAAAAAGCTATGTACATTGGCACCATAAGACATTAGTACAT CTGAGATCACTCAAGTATTGTCTTGGAATTTTATGTTTATATGAAATGTT GAAATGCTATCTCTAGTTTTTCTTTCCTTCAGATGTCCTTCTCATCTATC CACTCTATAATTATGATACTCTTTGTCTTATTTCTATATATATTTTTACA TGTCATTGTGTTTTGGCTGGTTTTTATATATATAATTATGATACTTGAGG TGTGCTCATGAGTTTTTTTGCCCCTGCACAGAGCTGATATTTGGTCATTT GGAATAACTGCATTGGAACTTGCACATGGCCATGCTCCCTTCTCTAAGTA TCCTCCTATGAAGGTAACAAGTGTTACTTTTGTGAATTAAAATACTTCTA TATTTTGCAGGCAAGTATTAATAAACAAGTGTCTGAGCTGCTTCAGAATT GTTTTTCTTCTTTAGCTTCTCTTATATTCAAATTTTCGCTGAGCTCTCCT GTTGGCAGTTTGCAGACATGATGTTTTCACCATTTTGCTGTATCATATTA CTGTTGTACCAAAAGGCACCAATAATACCATTTTGCTACATGTGCATACC TTCTTTGCCTGACAACATTATTGTAAAAGCACCCATTTCCAAAAAAAAAA ACATTATTGGAAAAGTTAACCATAAGCTTGGTGGTCTTGTTCATGAAGTT AGCAATTTACGTGTAGAAACTTTTCTGGGCAGTCAAGGGTATTGTCAAAG GTGACAATCCTCATATATACACTTTTTTTAAACTGCAGTTTATCATGTTT AATGCAGGTTCTTCTCATGACGCTTCAAAATGCACCACCAGGTCTTGACT ATGACCGCGACAGAAAATTTTCAAAGGTAGTACTGGTCCTTTCAGCCAAT TCTTGGCTAGTGTGTGTATTTTGGTTATATTTTTACAGAAATATCTATGT CTTAGGAAGCCATGTAGGTTATTTGGAGAGTACAGACATATTAGATTACA ATGTTTACCCTTCTAATGAAGGCTTTTCATCTTAAATCTTAAATCAGTCT TTCAAGGAAATGGTTGCCATGTGCTTGGTAAAGGATCAAACTAAGAGGCC AACAGCTGAAAAGTTACTAAAGCATTCGTTTTTCAAGAACACAAAGGCCC CACAGCTGACTGTTAAGAGTATTATTACTGATTTGCCCCCTCTATGGGAG CGTGTGAAGACACTCCAGGTTTGACTTTTGTGATATCCTATTTTCCTACT TGGCATTGTTATCATTATATCACACTAAATTACTGTGCTTTTCCAGCAAA AAGACGCAGCACACTTGGCTTCTTCTGAACAGGAAGCACTTTCTATGGTT TGTGATATCAGCACCTACATGTACACTTGTTTATTTACTCCACAAACTTG AATGGCATGATATGTAACCACACTGTATGTTATGAAAGCCCCCACCCGCT TTTTGGCAAACTTACCAGGTGTATGTCGATTGGTGATTTTAGGATCTATA AAAACAAAGTAAGACTCGTGGGCACCTAATTTTAGAAGTTGATCACTTGT GCAGTATATAATTTGACTCCTTTTCATATAACAAAGATGATAACCAAAAT ATGTTTGAGCCAAGACATTCGTTTGTATGACCAATTAATTTGACTGGAAC TCATTGAAAGATTCCCACATGACTACGACCTGTCTTGTTTTGTTTCACAT GCAAACAATTAAGTAGTAACATTTTATTCAACACCGACATATCATGGCTA CTTGCAAATTAAGGTGATTTTGCTCGCAGTAGAGTTTTTGCTGCAATTTG ATCTTGTACAGCACTGTGTTGTAAACTTTTGGGGTGAATTCAGCATGATA GTGTTGTAATTTTTGAAAACATTATATATATATATATATATATAATTCCA TATCAATTGGCTATTTAAGAAATGCATATATGCAGTTCTGTCTTTCAATC CACTTAGCTGATTTTCGTATGGTTTGATTCCTGCCCAACAGAGCGAGTAC CAACGAGGTGTCAGTGCATGGTACTTTGATATTGAGGATCTAAAGGCTCA GGCTTTACTGGTAAAGCAATAGCTAACCTTTTCCTCATTGCTACGTCACT TATACGTTCTTGAGATGAAAGCGATTATGATATAACCTTACAAATAAGCC CCAAACTTATGCAGATTCATGATGATGATCCACCTGAAATAAAGGAGAAT GATGATAATGTTCGAACAACTGAAGTTGATAAGGTTTGATCGATTTGATT CCATTTCAAATTAATGACCTTCAACCTGTCCTGTAGTGATGATAGAAACA GTCTATATATTTGCTTGTTGAAATTCTTTTTGGAGTGCATCAAGGACAGG GGATATGATATGCTCCTATCTTCATAGTAAAAACTGAAAAGCTACAGCGT TTGTCTACTTTGAAGAGCATGCTGGCAGTAAAACGCCACAGATGCTTCTG CTACTCTGCCTGAATCTGAAAAATATATTTATCCCCTGTGATGCTTGAAT TACTTTTGTACAGGACAAAGATCTGCAACTTATTTGTCATTGTCATGTAG TTTTTCACCAACTATTACAGTAATACCTTAATTTTTTTGGCATTCCCTGT TGGGTTATAACCTAATGTGTTCTTACATGCAAGAGAGAGTTGTACCAATA TGTCTTCCAATGCTCTATTGGCAGGATGCATCTTCTGAGAGTCATTTTGG AAAATCTACACTTCAGAATGGAAATAACCGCTGGCCGAATCAGTATGTAA CATTTAAGCGTTCATTCAACTCTATAGGATCAATGTTTGATTTATAACAA GAAGAGAATCAGTAAACCTTGATTCATATTGCTGTTTTACTTTCCTGCTT TAGTGTTAATACTTAATAGTATATTCATAGTATTTTTTTATATTTCAGTG AACGAACTTGTGCCACTGCAGTAAATCCAGGTGGAAATGACCCTGAAACA AGTGAGGAATTGGCTTCTGACCTTGGCAATGCTGATTCTGGAAGGAAGGT TGATGGATCAGATTATGACTCATTATCCTCTACACCTAAGCATGGTTCTG AAGCGGGAAATTGTAAAAGTGAAGTTAGACAAAAACAAATAAGAACTTTC TCCGGCTCAATTCTGTATTCTCCTACCGCTGATAGTTCCGTCAATGGAAG AGGTCCTATTATTGACAGGTATGCTTAACAATTTTCGCGAACTTGTTCCA TTCTTTTTTATCTATTTCATACGTTCCAAATAGAAAACAAAGTACACTTT AATCTGTTTATATTCTAGGAGACGGTTGTTTAGTTCTTCAGTTTCAGCTT TGGAGTTTTGATAGATCTTATTTATAGATCTTGACCAAATATTTTTCCGA AAGAATTTGGTTTTCAGATGATGAAATTTGCATATCCATGTACTCATGCA CTTAACACATTTTGGAGTTTCCTAACATGTTGATGGAGTATGAGCATGAT CTAACTGTATATCGTTAAAAGTCATTAGCTTAAAGTTCCATCCACCAGCA TACTAGATATTATGTGGGGCCACTATAAGTGTTTATATAGTTATACCCCC TAAGTAAATGCCACTTCCAATACTTGATGGAGCAGTACAAGCAAATCCGC ACTAATCTGATATGGTTGATTGAAAAGAGCAGACGGCCTGTTATATAATG GGTACTGTAAAAGAGCTCTTCCTTAATGTTCAAGTTCTTTTATATTATTA GTTTGTGTTAGCATACCGGTTTTAATTGCATTTGATTGGTCTTACTCATC ACAGGAATGCAGGAGGTCAATCAGTATCTTATAAACAAAAGAATGATGCA GGAAGAATCGATGATCTTAGTGGTCCTCTGTCACTTTCAACTCGTGCTTC TGCAAATAGCCTGTCTGCCCCTATTCGTTCTTCTGGAGGTACGATAAAGC GGCCTTTGTTCTAGCACAATCATGCACCATATCTGTCAATGTACAGGCAA AAACTGTTGTCATACTTTAAAATTAGCTTAACACAGCAGCACAGCACGTG ATGTGCTTCTGAAAATGCTCTCTCTGCTCATATTCAGTGTTCAAGAAGTA GGATAAACCCCATGGTTCTTGCATAAATTTTCAACACTTTTGTCAATGTA GTTGAAAAGACTTGGATTCTCGTCTTAACATCTAGTGTTACAGTATGCAT TGTGAACTACACCCTTAGAGAATATTCCTGTCAACTCTAGTTCCTAGTGA TTGCATTGAAAGGCATGCGATTTTCTGCTTTTTATATGCAGGATATGTGG GCTCCTTGGGAGATAAGCCTAGGGTGGAAATAAAAGGCCGATTTTCTGTG ACATCCGAAAATGTTGATCTGCCAAAGGTAGGTTACCTGTTAAGCAATGC ATACATGTCAGTAGATAGTGCTCCATAGCTGACCACTTCAAGGAAAAACT AAATAAAATCTGCTTGACAGGTTCAGGAAATTCCAGTGGTCAAAGTTTCA CCTAGACCACAGGAGGTAAGAAAATGGTTCAGAAAAGCTCTACTGCACTC TTGCACTACTTAAATATGCACCTCAAGATGAGTTACCACTGATACTGGGA GTTCTCAGGGATCTGCACTGAGAAAATCAGCCAGTGTTGGTGCTTGGCCA GTGAAGGCTAAGTCAGTGGTACGCTTTCTTGTTGTCTAAACTCTACTAAA CCTGTCATTTGTAGAAACATTTTTTTACTTATTACAGTTACGTATTATTG CACTAAATTGTTTGTTTTCCCTTGATGTAACACTATTGAATTTTCTTTCT GAGTTTTCAATTAAACCACACAAGTTTAGATTTAATGAGACGGTTTAAAG TTTGTGCAATTATATTTCTGAAAGAGTTAATTGGCATTGTCTCTTTTCTT TGATCATATTTACTGTCAAGGTGTGTATGTCTCATTATAGAATGACCTGT ATAAGATGATATCCAGTTAACAGTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGAC TTGGGTTTGTCTATATTCGGATGTATCTAGCATCCCTCCGACCCATATTA GTTGACTTGGGTTTGTCTATATTCGGATGTATCTAGCATTAAAGAACTCT AAAGCCTGCAGAAACTGCGTTGAAAATGGACAATTTTTCCATGTTCGAAT TATGTATATCAAAGCTAGTTCATATGCTTGATTTTCTGCATTTAATAGTA TGTTTTTAGACCATTATTATGTACTCCCTTATGCTGTTAACATGTCCGCT TATTAAGAATTTAGGCTCTTTAAATGATTGGTGAGGCATAGAAGGGTCGA GGGTCCCAGTTTTGGACCAGTAGTACTTTTGTAATTATTTTGGTTTTTGG TCACTCGCTACATTAATGGCTGTTGAACACAAAATATTTACCACCTTCGT ATGTATTTTCTCTCTTTTCTCTCAATTCTATTTTGTATGCCTGGATGCAT TTGGTTTTGCAGTCTAATAATCATCAACGGAAGGAATTATGTGACAGCTC AGTATCTGCATCAGTTTTGATTCCCCATCTTCAAAACCTTGTACAGCAGA CCACATTTCAGCAAGTATGGAAGTAACCCAATATAATACCCTTAATACAT GCGTGTTCAATTATTTGTCTTATGGTAAACCATGTGCCATTTTCTTTTCC CAGGATCTCATCACGAACCTAATGAGTAACTTGCAACAGAATGAGAATGC TGATGGTAATGATTTTCCACTGTATCTACTGAAAGTTACAATTTTCTCCT TCTATAGTTAAAATATTTTATTTTCTCCAGGGTTGCAGTCTAGATTTCAG ACTGTGGAGGGTGATACAAGGGTAAGCAGCTTCATTGGTTAATATATGGA GTATATATATAATCCACATGCAAAGTTCATAATATGTACCTTCTGCACAT AATAGCTTTATAAGATTGGTGTGTGTTTATGTCCATTGCAGTAAAATTAC TACTGTAAAAACATATCAACTCATAAGTCTGTGCGCCTTTTTTGGCAGGT TGAAACAAGTAGTGCTGAGGGAGAACGGACACTACTCAATAAAATATTCG AATTACAGTCTAGGTAGGTCAATTACTTGGCAATTGATATTGAAACGGGT AATCACATCCTCTCAAACTTGAAATTTGTATTTGGAAAAGTTCCCACTTC CAATTGCTAACAACAAAACACTAAAATTCCTGCATAAAACCTCTCTTTTA TATAGCTCAATACTGTTTGATTGGATGTCAGTGATCTGTTATGCTTATGC CAGGTTTTTTGCTTGTCATCACCCATATCAGGTTGCTATCTTGCGGTATT AGTACCTATAATGCTGCCTGATTCTGTGAGCTGCTTTTCCTGCTTAGACT GTGCCTGTGCTGTGTCAAGAGTTACAGCCCAAGCCAACTGCAACATTTAT CATCTTGCTTAATGTTACTGTGTTGCCACATTACAATCTTATGCACGCCT AGCTGTTGGAGTTTGGATACTGCCTGCTTGGTATCTACTTGTTTCACATT GCCCACGTACCTCTACTGCTTGCTTCCACTTACACCTCACAGCCTTCTCC ACTCCATGCTCCCCCAGCTGTTATGTTTTTTTCTAGCTACTTCTGCACAG TGTGCATAGCTATCTTCTCTTGCATCACTAAAGTCTTTTCCACAATGCTT GACTGCTTTGAGATGAGTGATGAGGCTGTCTGGGTTATAAGTGCTGTGGT TCAATTGTCAGCCTTGCAACTTGGTAGTGAGACGGGTTAATGTTTTATAA TTACAATGTAACGCGTCACCACTAAATTTGTCCAAGGAACAAATTTCATG ACATTTTGACTAATTGCTAGCTAAAAAATAGGCGACTTTCGGCTTTCTAC ATTTTTCCTCTGAAATTCATAGCTGTGATGTTGTGTTGATCGTTTTCTGA GGCTTAATGCATACTCCAATCGAGATTTTAACATGACTAGGATGCATTCC TTTGTCAGTAATTAAGCTTTTGCATTCGTTATTATTTAATTTACAATTGC CTCTTGCAGAATGATTTCTTTAACCGACGAGTTGATTGCATCAAAGCTCA AGCATGTTCAGGTCAGTATCAATCTATTTCTCATGAGCTTTCTCCACTGT TTGCACTCGGAATCATCTGGAACTTAGCACTCTATTGTTTAGTCTATAAC AAAGGGTAGGGGGAGGGTGGTAAATGGACCCCTACTCAACATACACATCA TGCCAAATATACCTTAAGTACATCGAATTAGATAATCGAACAAACGACAA ATAAGCGTGAAAATTTATACCATGTGTAAGATGATTATTGTGTATGATTT GTCTTCTGCATTACTTGCAGCTGCAAGATGAACTAAATGCACTCTACTTC CAAGAAGAAATAGTCGACAGGAGAGAGGACAACGAAGAAGCATGACATGG TAAGGCACCCTTTGGTACCCACAAGGAGTATTCCGGTGACCACCCGCGGA AAAAAGAGAGTATTCTGGTCGTCACTATTCATTGCCTGCCCTGGTTCGTG CATTGAGGCCTGGAAGTCCACAAAGAACTCACTCTTCAAGGTTTAGTAGG AGACTATTCTCGTGGATGATGAACTTCGACTTGTTGCTATCCGTCTGTAC ATATCTATCTAGTCAGTAGGGTTTGAGTTTAGTCTATTGTCCTGCGAGTA TCCATTTGTTTTGGCCGATCTTATCATTGAGATGGCTATTGATGCCAGCC AATTTATATAGTAGAGCCTATTTGGTCGCAGAAGACTACTAGAATAATTG GACACTGGAATGTATTATATTATATAACAATATGCCAAGCGATTTGGAAT AAATGAGAAATGGATTTGGAATAAAGGAGAAACGAGTTGAGTTTGTAGGG TTTGAATCCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.