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GrainGenes Sequence Report: AE038516

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Sequence
AE038516
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE038516
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACAAGTTCTCAAAGCAACGCAAAGCAGCTACCGAAGGTCATTAGTGAA
TTCGAGAGAGGGAGGGAGCAATGGCGACTCAGGCACAAACCATAGAGGTT
CCCACGGACGTTGAGCTGCTGCAGGTCCAGGCTGACCTGTGGCGCCACAG
CCTCTCGAGCTTGAGATCCCGACGACCATCCACCGCCTCGGCGGGGTGGC
CTCCCTGCCCGACCTTATGTCCGCGTTGTCGCTTCCCTCGATTAAGATGC
CATTCCTCGGCCGCCTCATGCGCGTGCTGGTCACGTCGGGCATCTTCGCC
ATCGACGCCGACGCCGACGCCGAGTCCAGCGTAGAGCTGTACCGCCTCAC
CCCGCTGTCCCGCGTGCTGGTGCACGGCGTCGTCGCGGACGAGCACCACA
GCCAAAAGTACTTTGTGCTGGGTGTCACCTCGCCGCACTACACCGAGGCT
GCCCTTGGGCTGGCTGGTTGGTTCAAGAAGGACCACGAGGCACCAGTGCC
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CACGGGGCTAGAGTCTCTTACCGACTGCGGTGGTGGCGATGGTACGACGG
CGAGAGCTATCCTCAAGGCCTACCCGCACATTAATTAAGTGCACTGTGTT
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CATGAAAGCAGGCTTCACAGACTACAAAATTGTGAAGAAATTGGGCGCTC
GGAGCGTCAGTGAGGTTTACCCGTAAAGGTGTTGTGCCCTAAGAGTATAA
ATAAAATATGTACTTATTTTATTTCCTTAAAGTTAGTTGCATGGATTGTT
AACTAGTTCAATCTTACGTGTCAAAGTTGTAAAATCTTCGTTTCAGGGAG
TACTGAAGCACATAGTATGTAGCTATGTATCATGTTGTTGTGCTGCCACA
ACGTAAGGTTTTCTTGTTGGTGCTAGTGCCTATTATATTAAACATTACAA
TTGTATCTTGTATTCGTCAGTAACCTACTTGGTAGTTTCTCTATCCATGC
AGCACGGTCACATCAGCGATTCAACGTGCAAGCTAATTTCCGGCGTTCTC
AAGCATCCATGTCATCCAATGGCCTCCACACCATCGTCTCAATTAATCTA
ACCATGACATCATATTGACCAATAAACCATGGGCGTCAAGGCTTAGGTGA
GCGTCTAGGTGAGTGTGCCGCGGGCGTTGCCTCCTCGGCGACGGTGCTTC
CGTTCCACGATGGCCTCCTCCTCCTCACCTTCCGCTCCTTCCGGCCCGGT
CCTCTAGTCGCTCGGCTCATGCTTCCTTCCGGGAGGCATTGATGGCGCCT
GCTCAGGATGTGCTTTCTTCCGAGGATTCGCGTCCACACCTGAGGCTAGC
CCCAATGGGGATATCATAGGTACTATCATGTATGCCATGTTGGTAAAATT
CTGACGTGATATACTAATTAATGATGAAAGAGATTGTGTTGGTATCATAG
GTAGATACGGTATCATGGCACGTAGAACTAGAAAAACTATTCTCAAATGA
ATCTTGTACACAATTTTACATTAAGATTCTATACAAAATAATAAATATAC
TAAGACTATGATACTAGTACATGATACTATGCATTATGGAGATGGTATCA
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TTCGTGCTCGCGCTGTCGCGACACAAAAAGTTAGAGATAACTACGTCGGG
AAAAGAAAATAGGCGGCTCTTTTTTGCTCAGCCCATCGTTATCCGTTGTT
CTTGTTCTAGCATGGCAGGTGCACGATTACGCCACGGCCCATTGTAGCCC
AACGTGGGCTAGGTGCCGTGACAGTTGTACTTGTCCAACATAACTCGGTG
TCATCCTAATATCCTATATACCCACGCACGGCATAATTTTTAGTGCCCGC
TAAGATATTTTTCGACACATCGTTTTAGTCTGCAGTTTCTATATTTAGGG
TTATCTTAATTATCGGAGTCACAGATAATCATAATATAAATCACACATGA
TATTTAAAATATGATCACAAGTCAACACGTACAAATATGACATAGTTAGC
TATCAGTTTCACAGTACTGCATAAAGCTAAATAGAATAGAACATATCATT
TAAGCTATAACTTAACAAACGTCATCTTCAGAAGAGATCCCAAATTCTTC
CCATATCAAAGTAGCATGATCGCGCTTGTAAGGGTTGTTCTTGTCTTCAT
AATCGTATAGATCAAGGTCAGAGTTATCTTCTGCAAGATCAGACTTGTAT
GAGCATGCGTGAGCAAGCATGACGATCTTGAATTTTAGTAAGATTTTCAT
TTGCTTGGAAAGCCAACTGCAGAAGTTCTCCGGCTTGTGCATCCATCTGT
GACAACGTCACGTTGTCTCCCTTCCATCTACAACAGCTGCATCTAGGATA
AGTGCCCACAAACTTGGAGTTCACCATCAGCATCAAAGGCGACTGGAATT
GTTCTATTACATTTTGTAGTCAACTAATGAATACCAACTAATGAATACGC
ATATTGGATGTGGCCACTTTCTTTAGTTGTCCAATCTTTCCCTCTTGACG
TTTGAGTGTGTGCCGAAGATTTCTAATATTCCTATACTGAGATTTCTCTT
TGCCTTGGAGCTACATACTGCAGCGAACATGACTAGTAAGACGCCTCTTA
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AGTTATTTGTCAAGCATAGTTTAGCAAACAACACATATAACTATAAAATT
CAGTTGCATACATCAGAGAAAATGTTGAGCAAATGGGATAATTCATGAGC
ATTCTCAAACTTTGTAAGTGTGGACTGGTTGAGATGGATACTGCAAATGC
AATGCAACACATTAAATAGGTAAGAATATCCTAGAAAGTAGCACAACAAA
AATAAACATAAATTTAGCTATGTACATCATTCAAGATTTCAACTCATTGG
ATGACTCTTCAGATATGATCATATCATGCTGATAAATGAAAATGTAGCAA
AATCAGCTTATCTTTGAACATACCACACCTTCAGTTTCAACGATGCAACA
AATTTGCTAACTTAAATGCGTCAAATCACCTATGCATTATTCATCTATAA
AGGAACAGCCGATCGGATAAGGAAACAATTCCCAAACCCCATATTAGTGA
GAATTTTATTGTCCCTAGCAATTCTAGCTTGATACTTGAAAGGGCATTCC
CATTCTAAATGTGTTTTTGTGTTTGTTGACAAAATACCAGTAAGTTTTAA
CCGTGTGCTAACTATCTTTCAAATCTCATGGTGAAAAAAGCACGAGATGA
TGTTTAACCTCTCAAAAGTGAAAAGATCGGAGAAGTATGAAGAGGGGTTG
TTGTTTGTACAACTTTAAGGTGATCTCTAATGAAGAAATGTTGAAGGTGT
CTTGAGTCCGGAGACTCCAGGGTCCAACCCCAAAGACTTCGGTCTGACCG
CCCTGAACTTCGGACTAGTCTCTGGCCCTGTCTCTGGCTCGTTGCCCAGA
AGATTACAATATACACCTCGAAGACCGGTCTAGAGTCTTGGCTCCACCCT
AGAGACTACAATGTTGTTTCCCGGAAACTCCGGCCAATTCTCCAGCCTAG
TCTCCGGCCAGTGTCTAGAGGCTCCCAGTACACCCTCCAGAGACTAGCCC
ACAGAGGAGGAAACGGAGGTGGCAATGGCCGCAACCGGCGTTGTTGCCAC
AATGGGGGCATGAGGCGCTTGACTGTCACAAGATCTACGACTATGACTCC
CTTGCCAGCAACTCCGCCTCTACATCGTCACACGAGCCTTGTCACTAGAT
CATGCATTCTAGTGCTACCGATCACTTTACTAGTGATCTCGAGTATCTCC
ATGTCCACAGCGCTACAATGGGCAGGATCAAGTGTAAGTGGCCAACGGTG
CAGGTTATTCTATTTTACATATTGATCACTTGAATTTACCTGGTTCATCC
CTTGACTTGAAGAACATTCTTCAATATTAGCAAGAATTTTCTATCTATTT
ATCGTCTTGTGTTCGATAATGATGTCCTTATTGAATTTCATCATTTATTT
TTCCTTGTTCAGGATAAGGCCACGCAAAAAATGCTTCTTCAATGTAGAAT
TCATGGTTGGCTGTACCCCATCCCGTTTAGTCGTGCATCGTACAACCCTC
CTCGCCAGGCGTCCTCTGGCGTCAAGACCACCTCGTCCCAATGTGATCAT
CGTCTTGGTCACCCCACCAATAACGCTCAAACTATTACCAAGAAAAAATG
ATTCAGTGTGTTCTTCCAGTAATCAGATCTCGATCTTTGTGATGCTTTTC
AGCGTGCTAGGAGTCGGCAATTATCTTTTAATGCTTATCATCGTGTTTCT
ACCCTGTCTCTTGAGTTAATTCATTCGGATGTTTGTGGTTTTATTTCTAT
TGCATCTTTGAGAGGGTATAAGTATTATGTTAGCTTTATCAATAATTACT
CGACGGGTGCTAGACCGATTTAAGACCAATTTGAACCTTGTTCATAGTAG
AAGTTCAGTTTGAGGAGGAGTATTAAATAAGTACTAAATAGATCTAGTAT
AGTATACCTGTCATGTATGTGTACATGTGCATACGTATGTATGTGTACAT
ATAAGTATATATAGAAGATATGCGAGGAGGCTTTGTCCACATGGAAAACC
CTAAATGAAACTCAAATATCCTGTTGTGGGTCTTGCGGTCTACTGTTTTC
CCACACAAGTCATGCGCCAGGGGCGGTAGAGTGTGAGCAGATCAAAGAGT
GCAGCATGGAGACACTGCTCAAAGAGTTTACGGGTTCGCAATCTTAGTTT
AACGTCATTTCTTCCACATGGCTAATTCTCTTACAGTTGATGAGATGTGG
AATGTTTTCCTCGAGGGAGTTGTCATGAGGCTACTGGCTTCTACCCGTGG
CTGGCAGTGCTACCCCTGGTGGTTCCCCTACCCTTCGTCGGCCGCTACGA
TGACTAGAAGGTGGAGGAATCTCAGGCGGGATGGCCGTAGCATTTTTTAG
TTCTTTGTCTGATGAAGGCCACATCCGCGGCGACGAGAATGAAGTTCCCT
CAACCCGCCCTAGATTAGTGTTCTTCCTCCAAGGAACCTTAATGGGCTAG
AGTTGGAAGTCGATTGTCGGGCATTAGGCCAAGCGTGATAGTGTTTGTGT
ACAGCAGCGACAACGTTCAAGGAAGGGGATGATGTCACATTGTATTGGTG
TGCTCAAGTTCCTCCTCTACCCGATGAAGCTCAAACCAGATGTGTCTTCC
TACATTTATCTAGATATATAGTTTCAGTCTCATTTAAATAGTACGTGCAT
GCATTATATCTTTTGTTCGTCTATCCTGAAATGTTAGTAAGAGCAGGCCA
ATCATTGATGGTTAAGAACAGCAACGCTTGTAGATCAAATTCCTGCTGTT
TGTGCTCATCCACACACGTACACCTGGTTTGGCCCACAAATGTAAAAGTT
CAGCAACTAATGGGTTTAGTTACATATCAATGTCGTTGCCGGGTTTCTTC
GGGCCTTCGATAAGCACTGACATCATAATGAATTTTCGCTTCATTCACAA
CCAAGGAGGAAGGTTGTAGAATATAGAGTCACGGGATAGGTGTTGTGACT
GCAGCTCTGCTCCCCAAAAGAATTAATACCATATGTACTTAGACCAAATC
ATAAGTTTATTGCGTCACCAACAAAGTCCGGAAAGTCTACTCGATTTTTC
TCCACTGCCAACCATCAGCAGGGTGCCTCAACATCTCGCATTTCTTACGG
TCTTCCATGTACCATCGCAACAACTTGGCATGCTCTTTCTTTCTAAACAA
ACATTTCAACTGTGGTATTATAGGAGCATACCACATCACCTTGACAGGAA
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ATCTTATATCGCAATAATGCAGTGCATACCGGACATTTATCCATATTCTC
GTACTTCTCATCGCGGTAGAGGATGTAGTCATTAGGGCATGCATGTATCT
TCTGCACGTCTAATCCTAGAGGACAGACGAGCTTTTTTGTTTCGTACGTA
CTGGCGGACAATTCTTCTTTTTTGGAAGCATATTCTTCATTAGTACCAGC
AACTTTTTAAATCCCGAGTTAGTCACACCGGTCTCTGCCTTCAACTTCAG
CAATTCTAGTGTGCTACCCAGCTTCTTCTGGCCATCTTCATAAGTTGGGT
ACAACAATTTATTGTAGTCCTATAACATCTGCTCGAACTGTAAGCTCTTC
TTTTCTGTGTCGTAGTCTCCCTTTGCATCAGAAATGACCCGACCAAGATC
ATCAACGGGCTCATCTGGTGCCCGTTCTTCACCTCATTCTTTTTCATTGT
CTTCCATTGCGGTATCAGCGTATTCAGGGAACATAGATCGGTAGTTGCCA
TCATCGTTCTCTTCTTCATCGTCGTCTTCCATCATAACCCCTCTTTTTCC
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GGCTCTGAAGGACTCTTGAGGAAGTGTGAGTCTGCTCAATATTCAACACA
TGGAAAACACATAGAACCATCATGCCGCTTGTTTGCCTCGGCCAAAAGGC
GAAAATAACGCACGCCTTCTCTGTAAGCGCCAGAACGTCGGTCACCGTAT
ATCCATGGATGGCTCATCTACATCATACAACCATATATATCAAACACAAT
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ACCTTTTAGACACTTTAAAACAGAGAGGAGAAAGCTTAAGTGTGGCTCGG
GCACCTCATATCATGTTTGTGTTGTGTGAACTCTAGTGGCATCGCTCTCA
CAGACATTTCATCGAGCACCTCTAGTGCATATGAAGAGAAAAAAAAACCT
AGCACAAACTATGCCACCTTCCTCCATGAAAAAATAGAGGAAAGTTGTGC
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AAATGGTCGGGACTAATGGCCCAAACCAAAGGCATTTTTTCTACTAGTGG
GAACTTATGTGTTTGGTGTCCTCTATCTCTACCTGATCAGTGCTCTGATT
ATCTCTAGGACATTCTCTGTACTAGCTTCTCCGGGACGGAGATCTTTCAA
CATCGTGGTTGTCAGCAACTTCTAGTTTACGTCGACGACTTCGCAACCGC
TGCTTATAAAGCGTCTGGGTTTTTCAAGCTTTCTCCAACACGAGTTTTGC
TACACTGGAGACTCAGAGACGACACCGAGTTTGGTTCTCGGCGTGCCGTC
GAGGGATGCAGAAGGGAAATGCTTAATTTCTAACGACTTGGGTTTCATTT
TTATGTTTTAAGGATGTTTTTATGAGGGCATGGTTTCAGATAATATATGG
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AACAAGATCGATTTGATGCCACATTTGGCATTAAGAAAGTGAGCATGGCG
CCTTATAATGAGAGGGTGGGCTTCTATTGTACCGTCTCGTGCGTGACATG
TGGCAGACACGAGCTGACTATATCTGCAGTTGCATATCCATACCGTACTA
GTTTATAGGCTCGCGTGTAGCGTGTGTGACTCGCTTGAGCTGTCACCTTT
GGGTCCACGGCTAAACCCCGATCCTCAAAAGTAGCCGATCGAGCTATATA
AACACATGTAAGCATCGCACTACCACAGCAACGAGTCCTCAAAGCAACAC
ACAGCAACTGGTCAGAGAGGGAGACTGTAAGATAGGGAGCAATGTCGACT
CAGACCATCGAGGTTCCCACGGACGCTGAGCTGCTGCAGGCACAGGCTGA
CCTGTGGCGCCACAGCCTCTACTACCTCACGTCCATGGGGCTCCGGTGCG
CCGTGGAGCTCGAGATCCCGACGACCATCCACCACCTTGGCGGGGTGGCC
TCGCTGCCCGACCTGATGACCGCGCTTTCCCTCCCCTCGGTCAAGATGCC
GTTTCTCGGCCGTCTGATGCGCGTGCTCGTCACCTCGGGCGTCTTCGCGG
CCGACGACAGCGTCTCCGAGTCCGGCCAGGAGCTGTACCGCCTCACCCCG
CTGTCTCGGGTGCTGGTGCACGGTGTCGTAGCGGACGAGCACCACAGCCA
GAAGTACTTCGTGCTCGGTGTCACCTCGCCGCACTACACGGAGGCGTCCC
TCGGGCTGGCCGACTGGTTCAAGAAGGACACCGTGCCACCGGTGACGTCG
CCATTCGAGGACAGGTATGGCGTGCCGCTCTTGGACGAGAAAACTGCCCT
CCTTGACAAGGAGCTCGACGATGTTGTGAATAAAGGCTTGGCTGCCCACG
ACAACCTGGGGATCGCCACGATACTACGGGAGTGCGGCGACATCTTTAAT
GGGGTTGAGTCTCTGACCGACTGTGGCGGTGGTGACGGTACGACGGCGAG
GGCCCTCGTCAAGGCTTACCCGCATCTCAAATGCACCGTGCTAGACCTCC
CGAAGGTGATCGAAAAAGCCCCACCTCATGATGTCATCAACTATGTTGCC
GGTGACCTCTTCCACACCGTCCCATCATCTCAAGCTGTGATGCTCAAGGT
ATATATCTCTTGGGAGAATAGCAATATTTCAGTTTTACAGCTGCTAGCAT
ATATAAATAATAAAAATCCGTTTTTCTTAATATTACTCGTACGTACCCGT
TTTGTAGCTTGTGCTCCACTTTTGGAGCGACCAGGATTGTGTCAAAATCC
TAGCTCAGTGCAGGAAGGCAATTCCTTCGCGTGAGGAGGGAGGAAAGGTA
ATAATCATAGAAATTGTTGTTGGACATTCCTTGGGGCCAATAATGTTTGA
AGCCCAACTATTGATGGATATGCTCATGATGGTGAACACAAGAGGGGGTC
AACGTGATGAAAAGCACTGGCGTGAGCTGTTCATGCAAGCGGGGTTCACA
GACTACAAAATTGTGAAGAAACTGGGAGCTCGATCCGTCATCGAGGTCTA
CCCGTAAGATGGTGTTCTCTAAGGATATAAATAAAGGAAGTGCTTCTTAT
TCTACTTATTACAAGTTACATGGGTCTTTTTACAGATCAAGTGTTTGATT
AATTTCCTTAAGGTCCATGTAACTTTTATCTGTAGAACTCGATGTGTGTG
CGTGTGCGCCTGTCTTGTTTTGTTGTGTGCCAAGAACGCATGCTATTGTA
TTGGTTGTTGTGCTTATTATATATGTATATTTATGATTCTATTACTTTGT
ATAGCATTTTTTTACTTTGGGCTAAATTGCAAAAGTGACATTAAACTTGC
TGAGAAATGCACAACCGTGGATGTAGTAACTAGACTTGACTAACAACCTA
TGAATAAAAAATGCATCATACAAGAAATGAAGACATGTGTTGGGTATTGA
TCGATACAAGTGTATAAAGCTCTCATAGAAAGATCTATGCAACCCATAGT
TGATATCATAAACAAAATAGCAGATGTAAGTAAATCAACCAAATAGATGA
AACTACCTCAATCAAGGTTAAAGTTTTGACGATCTAACTATTGCAATGGG
TATAGTCGGTCCCTATATAAGGCCGATAATGTCTTTATTTCCGGTTGTTA
CTGGTTATTATGGTTGGTTGCAGTGTGGGTATATCTTCATAGGGGTTGTA
GAGATGAATATGTTATCATATGACACATATAGTGGTATATGTTGATTATT
GGTAACAAGTGCTTCTTCGCTTATGTTTTCCTTTAACACCACACACAATG
AACGGGTACACCCACCATATGACTGCACCTAGGACACACTTCAAGTTTCA
AAGAGTGGAGCTAAGTTAATCCATGAATCTCACAAGCTTCCCTAGAAGCT
GCACATATGTGTAAAGATGAGCATCAAGCTAGATTTAAAGCCTGAACAAA
ATTACCACTAGTATATGCTATGGCTTAGTGAAGTACACCATGCATTTGAT
GGTGTATACATAATCCCCAAAATGTACTACCTTGTTAAGGAATACAACAA
CCAAAATATATATTTGCATCAAATTATTTTTATGGGTCAGGTCTTTGTCC
AGTAGTAGACAAATATATCGATATTAAGTCCTAAGCTAGTTTAGTGTCAA
GGGTATGTATAGTTTGTGGCCAAAATATACCTTACCAAGGTTTACCCTAT
GACCTAAAACTTCGGTTCTTGTTTGCACGATTGTCAACTTATTAGAATGC
CAATGACTACAAAGTCTAGTCCATATTTAGACAAAGTTAGCAAACACATG
GACACACAAAGTCCCTGAAATCTGCGTCATGATTTTTCTTTACTTTTCCC
GTTTCATAATATACCTCAAAGCAACGTAAATACGGGATCAAACTTCTATG
TGGTGAGTCAGGAATGGACCATGTCATCCCATAGTGCATGGGGCAGTATG
AGAGAAGCGTATGGATTTGCCGATAGCGTTGGGCAAGAAGACTGATTCTA
CTTGCTTGCCTTGTCCTTGTGCTTCTATTTTACGGTGGGTACAATGTAGG
GCCGGTGTTTGTGTTTCTGGTGGTGTACTGGTGCTGTTTGCTGAGGACAA
AGCATGGAAGGTGGTGGGAGAGTATGGCATGTCGTCCTTGGCTGTGTGGC
CCTCCTTGGACATCATGAAAGAGCAGACGGCCTTAAAGGAGGAGCGTACA
TTGTCATGCCTCGTAATGGGTATGACGCGAAATATCAAATATATATATAA
GTAAATTTCACCTTGTCTCTATTAGTATTGATTTTATATTATAATTGTTT
ATATATTTATCTATATAACGGCTCAAACTTCGTGGAGTTTATCCTTGACC
GAAGCTAACGTGCGGAGTAATATGAAACGGAGAAAGTATATCCGAGTGTT
GTGTACGAGGTCGGTGCCATAGAGACCGGCTTGCTTACTTATTAATGCTC
ATAGATGCATGTAAATGCCTTAATCATGTATATATGTTAGTTGATGGACC
TATTGTGTACAATAGAAGAGACCTAAAGCTGAGGAGTGTAATCTAGAGAC
TTTCTGGTAGCAATCATAGAGGCCAATCACGCTCGCTAGACGCGACATTT
TGATATTTGGTTGGTACGCTTATTAAAGCAGCCCTCTGTGCCATGCTCAC
TGGGATGCTCGGTTCTACTCGCTCCGTCCAGAAATAACTGACTTGACTTT
ATCTATATTCAAATATATTCAAATGTATCTAGACGTATTTTAGTATATAG
ATATATTCGAATCTAGACAAAACTAAGTCAGCTATTTCTGAACGGAGGGA
GTATTATTTTTCAGCGAGCTAGCCCCGAGCGAGCGCTAAGAAACGCAGAC
TAGTGGTCCTTTGACTCTAACGATGCATATTTGCTATGTGACCATGCACC
ATTTGCATAGGATTATTTCCATTTTCCTTTCTTATATTCTCTCACGTTTT
GCTCTAATAATCTTTATACCAATGCTTCATTTCGTGATGTTCTGTACACG
AAAAATGTCTACATATGAGATGATTCCATTCATGCAATGGCTCTCGAGTT
TCGTGCTTTGCCTAGAGTTAACCGTGTTTAATCTCGTCAAATTGTCGTGC
ATGCTTGGTGTTTCCCAAATGACTTTGAGCGGTAGTTTCTAGTCGATGTT
ACGGACAATTTTGATATTGTAAGTTTAAGTTTCAGGCACAAGAACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.