Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE031634

[Submit comment/correction]

Sequence
AE031634
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031634
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAGGTTCTTCTCCCCACCCCTCAAAACCCCCAAATTCGCCGCCGCCTAT
TCGACTCTCCGCCATTTTACCTCCACCGTCCACCCCACTCCATCTCATCC
AGGCGAACTCCGTCGCAGCAGTAGGGACCCCCGATGGCGAGCAACACTGG
AGGCAGCGGGAGCGGTGGCGGCCGTCGTTCCCGGGAGCGGAGGCCAGCGG
TCGGCACCGTGGAGCAAGCGGATCAGCGCGGGGCGGTCAAGCGGGCTAGG
GTTTCGGCCGGTGCTTCGCGCTCGGGTGGTATGCCTTCGTGACATCCATG
TGCTTGCTTTCCCTCGGTTCCTACATGATTAGAATGCTTTTGTAATTGCT
GTGTAAATACGCGATCTATTTCGGATTTGTTTATATCCCCCAGATCCTAT
AACATGTCTGTGCATAAAGTGGATTAATAGTTCGTAAGCTCGATATTGAA
GTAGGTAGGTAGTGGATATGCGTATCGATGTTATGATGGGGTGGCTGAAT
CCGTTGTTGATTGGGCCTCTTACTAGTTACTACTTGTTCGTTAAAAAGAT
GTGAAGGATACAGCTATGTTAGAAATAAATAGTCCGAACCTACGAATTCT
GGAGATTAGTTTTATTTAGTTTTCCATGTCGAAGCCTTGAAGGTAGTGTA
CTCTAGGTGTCCTTGTCACTTTAGAAATAGAGTCTGAACTGTTGTAGAAT
AGCCTGTGCGTGTGCATATATAGTTATATACACATTGGGTTGTGTGTGAT
AGAGAAGAAAAAGGGTACGTGAGGTGCCTTTGCAACAAATTGTGATTTTT
CTTGTTCGCTATATTTTTATGTGATTGATCCTTGGGGGTAAAAGCCTACA
AGCTAGGGATGGTGACTCCGGAGGTTGAAGGGCCTTGATATACTGTTTGT
TTTGTTGAGGGATCTTCTGCTCGTGCTCACTTCATTTACTTTATACCATT
GTAGATTGTAGTATCTTCATTTAATCAAGTCAATAAAGTCACTTAGTTGC
TGAACAAGTGATTGGGAACAATGCCTTATGGAGTACGACAATGTGGTGCA
GTTACTGATTCACTTAGTACATGTTGAACTGTTTCTTTTTCCGTGTTGAA
TTGTTGATCCCTTCTGGAAACATAATTATATTTTGTAGCACCCAACTGAT
CTATCCAAATGAACGTGGGTCATTTAAGCATAACAATTAGCTTCTGATAG
TGCTAGAGTTTGAAGCGTTTCAAGGATGATACATCAATGTCCAGTGGGCA
TCAGGAAGATGGCAATATTGTTATACTTTTTGTGGTAGTTTTGTTGAATG
AGATAGCAGATTTGATAAAATGACCGGTTGCATTCACTTCATTGCTACTG
TTATAAAAAATCCTCTCACAGTCCATGACAAGCGCTGTATGGTATTGCTA
GTCATGAATTGTCGCTGCAGAGTTAGTGTTTTATGGACTAATCTTTTTGT
AAAATTAGGTAGTTGTGCCAAGCTAATGTACTGAGACTGTGTAGACATGC
TGATTGTGGCAAGATATTTCTCGTGTCTTGTAAAACAAACACATTATTTT
ATGAGGGTGAGTGACTGGAAAAAGCAGCAGTCACTTTTGGTAAACAGGCA
CTTAGTTGCCATTTGTCAAATGTGGATACCGCAGTGTATTAATAGCTATC
ATTCGTGGCATCGTGCATTCAATAAGTAACAAATTTGTTGTCATTCACTT
GTATGAAGATGAGATTTCTATAGAATTGCTTAGAGTGATGGTAAGAAAGA
GCATAATTGAAAGGAGAGATAGCATTATATAGTATACTCAATGTATCAAT
ACATTGTGCCTTCGCCCCTTAGCTAGATCAGCCTGTGTTTGTTTAGCATA
TACACTTATGGTATTGTGACACCCTGTCCGTTTACAAATTTCATGATTCG
AGAGGATAGGTTTTGTATGGCAAGAAAGAGCATAATTGAAAGGAGAGATA
GCATTATATAGTATACTCAATGTAACTGTTTATCCAGGTAGACTGCCTAA
ACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCAGGTAGACTGCCTGGGTCG
GTCATCGTGAATCTGTAACTGTTTTTCAGTACAAAATTAGTCTTGTCAAG
TATGGTTAAATCCACCTGACAGCTGGTCTGTTTTTTTCTGCAACAAGCAT
TGGAAGCTTGCATTGTGTGTTAGAAAAAGAACGCCAAGAAGCCGCAAGAT
ACAAACTACCAACGATAGCGACGACCAGACCAAAACCAAACAACTATGCT
ACAGGAACATCTACTATAAGCTACCAAAAAGAAGAGACAGTCATAAGGTC
TAGGCATCCCTCTCAAAGACCAGAACCTAAGTCAGGTGGCCTAGCATGCC
TTGACAGCTGGTCTGTTATGTGCTTGAATTAGTACCCTTACTTGCACTAT
ATCCTGTTTTGATTTTTTTCTTGCACATGTGAGGTTCGAGGAATATCCTG
ATGATACATTTCCTCCATATTTACTTGTTAATTAACTCATTTTACCTCTG
AGTTAGTTTTGCGTACTCTCCTGGAAGCAACGTAATCAGGACTAAGACTG
ACTGGTATTGATGCTGGCATGATTGCAACGTAGTACTACATTGGTTCTTG
AAACATCTTTTCAATGTTGAGAGCTGACCAACTGTGCTGGAAATTGACCT
AATGATATTCCATAGCCTGGACCTATGTAAGAGATTTAATTGCTTAGAAG
ATGGAAACAAAAATGCATAGGTAATAGGTTGATGCCAACATGGCCTCGCA
AATATTGGATATCTTTATATTGCATACCTATAACAATGTAAGTGGCACGG
ACATGGGATAGCCCGTCTCCTGTCTATTCCTTCTGTTGGGACTAAACAGG
ATTAGCGTGACTTTGGTAAGCGGGACCCCTCAAAATGACCTGTAGATACT
GCTTGGGCTGGCGTCCTAGAGTCTGTCAGCATTCATCCGCACGTCCTAGC
AGCCCCATCTCCAGGATTTGGGGGCCCTGGTGCGACTTACGAAATAAGGC
TCTAATTTTTTTTCAAACTCAATAACTAGAAAAACAAAATCATATGTTTA
CTTTAATTATATAACTTCAAAATGTACTATTCCATACAATATTCATAAAT
ATATCGAGTATTCATTCTAAAATTGTAAATATGGCACTAAAGAAATAAAC
GAACCTCAGGTTCTACCAAAACGCGTCATGCGTCTGGTATTTCAGCGGTG
GAAGTGTGATATTCAGAATTTATTTGAGACTCTTTCACGACAAATCTGTC
TAGAGCACCCTTTTGAGACCGAGCTGCTGCTTCTAATCTCTGTTTTCTCT
TCTTCTTTTCAGCACCCGATTGACATTTCGTTTTTCTCATGATACGTCCT
GTTTCATAAATTAATAAATTAACAAAATTATTGAAACAATTCAATATCAC
AAGATCACGAGTTGTCGAGTTGCAACGGTCATACCTTGACTCGTGAATGG
CTGAATGCTAATTGCCGGATCGGCAGTCTCGTCGGCGAGATGACGTCGGA
AAGGACAAGACAAGAATTCTAGGAACAATTTGTTTCAGACTTCAGAAGTC
CGGCCGTGAAGTCTGAAGTGACTTGATTTTAGAGCAAGGGCTGTTCAATC
CTTACTATGCATTAAAATGCAAGTATACGGTACTATGCTGACTGCTGCTC
CCTAAGTCCCAAGTACCGCACTATGCAATTGCGATCAATTTTTGAGCAGC
AAGACGTCTATCGATCTGACCAAAAACAACATCGGCGTGAGGTTAAAAAA
CAAAAGAGAATAAGGACCGCCGGGGGCGCGGCCGGCCGCCCGGCCCCATA
TGAGAACGCCGACGAGATGCGAGGGCATTACCAGCTTGGGTTGGGGCTGG
GCAATCTACTGATCTGATTGCTGATCGCTGGGCGAGGCCGACTTGGCGAG
CGGAACCAGCGCAGGTCGAGGAGTCGAACCGTCGAGGCATCAATCATGAG
AGAAAGGTGGCCTGCGTAGGCACGCGTAGCTAGACCGCACGAGAAATACT
ACTCCCTCCGTTCAGAAATAAATGACTTCGGTTTGAATAGATTCGAATGT
ATCTAGTCGTGTTTTAGTGTACAGATACATTTGGATCTAGACAAACCCAA
GTCAGTTATTTCTAGACGGAGGGATACTAGGTTGTATGTAATCGGGGGCC
CTTGGAATTTGGCGGCCTGGTTCGATCGCTCACATGGAACACGTCCATCG
ACGGGCCTGCGTCCTAGAGTACCTGTATGCTGGGGAGGGTACATGCAGGA
TTAGCCAGACGGTAGCGGTAATCCCACCCAACACAAAGTGGGATCCCACG
AACGGAAATAAACAGGCTTTGCTGGCGGACGGGAGGCAGGCTTGGCAGAA
GGCCCGTACCACTTACATCGTTATATACCTATTGATCAAACTGTTTTTGT
GTGTGATATCTCAATGTACCTGCGTAAAAACTTCCATATGTTTATTATTT
ATTATACTTTAGAATTTTAGGTATCTTATTTTTGTACAACCTTGCTCCAG
TGTGAACAGAATTATTGCTATTTCAAAGGAACTTGATGCTCTCCCCGATT
CATTATGATGTCCTTCTCTTCTTTTTTCCTTTCTGCACGAGCATTAGCTG
TCTATATTTGCGTACTCCAAGCTTCTAATCCTAGACTAGCACAACTATAT
GTATGCTCAACAGTGAGTTCAAGTCTATATGTATGCTCTCCCCGATTCAT
TATGATGTCCTTCTCTTCTCTTTTCCTTTCTGCATGAGCATTAGCTGTCT
ATATTTGCATACTCCAAGCTTCTAATCCTAGACTAACACAACTTATATGT
CTGCTCAACAGTGAGTTCAAGTGGAAATGATGGGGTGCGGACAATGTTCC
GTTCCGTGTTGACGAGATATTTGATGGGAATATCAATAGGTTATGTTGAA
CAGGAACTTCTGACTGAGGCTGTACGCAGTAAAATAGTGCACAAGGTAGT
TGAGAAGATTATTGGTCGTCACCAAGAGCAAATTCCAGAAACTGAAAATT
CGATGGAACAGTATATAAGTCAGAATCAACAGAAAATCAAGGAGTGTCTG
AAGGTACATATTTTACAACTTCTAGGTCACAGGCACGTGCAGAAAATAAC
CATTGCTATTGTATCTGCCTTCTGTTACAGGGATATGTGGAAATGTTTTG
GTAGGGTTCTTGGTGTTCAAGTCTTCCTGTCGATGGCTTGACGTGTTCGA
GTGCAACATTAAATGAATGTGCTTAATTCACAACATGGCATTGAAATGGT
AAGCTCATTGTGAGATGTAATGCCATGACTATGCTACAAGCAGGGATTAG
TAGATATTCATTTTTGGATATCTGCATGCTATCTGGATTTCTGTGGTTCT
GTGTTTATTTTTATTGATGAATTGTCTATGTTCGGTTGGATTTTTTTAAA
ATAAAGGCTGCGGACTGTGAATTGGTGATAATGTGGCAGAACCATGGAAT
AATCTTGCTCAAGCCGTCAGATTTGATTAATATTCTATTACAACATTATT
AGAAATTTCTTTGCAAAGTGTTTTTTTGTAAGCTCAAAGTATTCTTCTGT
GAGATGAAAATAGTTAACACCATAAGGTATGGCAACAATGTGATTATCAA
CAGACTAGATGTTTTGGATTTGCGATGGTGGCAATTGTATAGAATAATAA
GACGTGGAGTAGGAGTTGGAGTTTTCACATTCAATGTGAACACTTGGGTA
CCAAGACAGGACTAAAGCGAGGCAGGAGAAATCCCTGCTGAGGCCGAGTA
AGAATAGGTTGGAAACTGGGATCAAGGGGGTGGCAAATTAGGCAGGTCAA
GTCAGTTAGGAAAGTTAAAATAGGCTGGGTTTATTATGGAATTTGCCTCA
TGGTTCAGTTGGTTATGTTTGAGTACCCAGTGCTACGAAAGCATGTCGCA
TTGCATCCATGGTCCTCAACCTATAAGTAATCTCTTGCCAAGTTCTCTTT
CTGACCCCGTAGTTCTCTACCTTGTCCTATTTCCACCACTCGTAACAGTG
TCTGCTAGCAACCAGTGGCCTAGTCCACTTGTCATGTATTGTTCTCGTGG
CCTTTTTGCCGTGTGCACTTTCCCTAACGCCATTTCTTTTTCATGTTATT
GGTGTCTGTCCTTTCTATGGTGTGCTTAGCGAACACATTTCTGTATCGGC
ATCTACATTCCAATTTTTTTTTTTGATAGCACACAGGAGATTTGTGTGTT
TGAGGTAACAAAGCGTATGTCTCCTGAACAGCTCGTGCACGGCTCAGGAG
ATGCAATACTAGCTTCGCCGCCGCGGTGGGGCCCCTCCTCATTTCAAGGG
CTGTCAGCCTGTCACCCATTTCCTCTCATTCTCAGTGTCGGAGACAGCTG
CCGCCGCGGTGGGGCCCCTCCTCATTTGCCCTGTCTTGTTGGTTTCCCTT
CCTCTCGTTGCTCTTGTGCGATCTGTAGGGTCGGTAGGTGCAGCGTTGTT
GGAGGTGACGATGGGTTTGAGATGGAGTGGCATTCTCGATCATCGGGGCT
ACATGGCCGAGACCAGTTCCTAGTGTTCTTTTTGGTGGCACCCTAGGAAC
TTGGCATGTGGATACAATCTAGCCTTCATTTGTTGCTCTGGCGACGAGGA
TATTGTGGTGTTTTCAAGCACCAATTCATGCACTCCAGGTTGAACAACTC
TTGACCTAGCCTTCATTGGTTGAATCAGTCAACGATGATGTGTGTTCGTC
CTTCCCTTCCTGAAGGTGTTTTCTCCGGTGTTGCCAATGTGGTCTTCACT
GGTAGGATCTGGCAACAACGGTATGCCGGTATAGTCATGCGTGTGCAGTG
GTACCTCCTTTGTCGGGTGAAAACGCTTGATCTGGCCTTTACTGGTTGGA
ACCGGCTTCGATCCTCTCCATTGCTGGATCTGGCAACGTTGATTCGTGCA
TGCCATCTCCCCTTGAAGGCATTGTCTTGGAAGACGGTCATCTTCTCCAC
CGAGAAAATGCCCTATCTCTAGCCTTCACAGTTTGCTCCTGGCCTCAATC
CCTCGTAACACTGTTGGTGTTTGAACTTTCCATTCTCTGTGTTGTTATGG
TTGGTTCCACAGAATATGACCACATTTTGACAATATGTTCCATTTTTTCA
ATTGTAAACCTATTTGTTCAGCTTTGGTGCCAATAGCATTATTCGGAACA
AAATTTGAATGGTGTGTGCATCGATTTGATGTTTCTACTTTGTCTAAAAA
ACTTGTGTTAATACGTCGAGAAAAAGAAAAAATGTGAAATGTTCGATGAA
TTGCCTAGAACCAAAACAGGTTAAGCAAAGAGGAGGCTAGTGCAATAAGA
AATATGAGAAGATAACAAAAGTAAGACAACTAGACAATCTAAAGCAAAAC
AGGTTAAGCAAAGAGAAAAAGAAAAAATGTGAAATGTTCGATGAATTGCC
TAGAACCAAAACAGGTTAAGCAAAGAGGAGGCTAGTGCAATAAGAAATAT
GAGAAGATAACAAAAGTAAGACAACTAGACAATCTAAAGCATGGACAAAC
ACGCTAACTTTATGGGGGAAGTAAAGTGAATCCATTAGTCTTAGAAGCAT
TCCCTCAGCATATACCCAACAAAAAGCATACGATTTTTTACTTGTTAAAA
TTGATAATTTTCTAAATGGATGCTATGGAAAGTATATAGAAGCAGAAGAT
GCATGCAGATAAAACAAGGATTGAGTTAATGCTTTGTTTTTTTTATAAGC
CTGCCCTTATTGATTGTACATACAGCTAGCACCACTTCACATAAGAAATT
AATAGGGCATTTAATGAAAATATTCTGGAAAAGACAAAATTGGTAAGTAT
TTGTGACGAAAACCAATTCTTGACATGTATTAGCCTTATCTCTGCATATA
ACATGCTAGCACTGCCTGTCTTGGCCAGACCCATAGATTCGTCACTTTTT
GGCTAATAGCTGGGAGTTAAGTTGACTTTATCTTAAAAGAGGAAGCTTTG
TGGTATTTGCCAAATCAGTCTCAATTGTAGTACAATGCAAATATTGTTGG
AGAACCATTATCCTCGTTTCTTCTCTAGCCATTTCCTCCATGGGGTTTCT
TTCTTTGCACATGAAATGGTTCCTGTGATAAACACACAATATTGGCATTC
TTCACCTTTAGATCAGTCTATTTATATGCAGAATCGAAAGAATATCTTTA
TTGCTGTTAGCTTCTGGTGTGTGCTTTAATGGAAGCGATAAAACAAATTA
AAGGTTTACTCAAGCAGAGTAATGTTCAGATAGTTTTTTCTTTCATGCTA
CAAGATGAGTTGATTGAACTACACTAAGTAATCACACGGGGTATACCTGT
AAGATAAATGGTATAATATGAACTATAGGGTGTAGCATGAGTCTCGTCAC
TCTATCCTACCTGTAAATTGTGATGAAGTTATCATAAGAGATATGTTATT
TTGCATCGCTAATATAGCATCGTAATTATAAGATGTTAATTTCATTATAT
CTTTTCGGGTGCATAACATGGGTATAAGATATATTATGCTGTTTCTAAGC
TCTTAGATTGAATTCTTTCAGTAAACATAGATTCATTGGAATGATTAATG
TTGCTTCTGGTTCCACGTTGTAACCATCCTATTTCTTTTGCCGTGCAGTA
CCTGCTGACCAGGAGAATAATGACGTTCATTTTCACTTGATGAACATAAA
GTACCAGGTATTTACACCTCTCGTTTATTTATTATATTATTTGGATGATG
CACTGTATCTGCAGTACTGTAGAGGTGTACCAGTCCAACCATTTTATTCT
TCGGTCCTGCATTGGGAAAGTATTAATGAACGTTTGATTCTAATTAATAT
TGTAGCAACTAGTAATTCTTATTTTTACTATTCAAGAACGTCCATTGATT
TTTTGGTGAATAAAGAACATCCATAGGTTCTCCATTCATTTCAATGTTGG
TTCACATGTTTTGCAAAGGCTCAAGTCATTAGGTTTATACCTACTGAGCC
TGTGATGCTCCTCTCACCTGGTCCTTGACTGGATTGGATCCCCTTAAAAC
CAACAGACTGGGTAGGAATGAGTTGGTATTGATCCAGAGTTCTCTGACCT
GTCAAAATCAGCGAGAGTTTTATTACTCTTGATGTATAACATTACAAATT
AGTATGTAGAACAGCATTTCATGTTCATTCTTCTAGAATGCACAAACAAC
ATCTGCACATCTGAGCCTGTGATGCTCCTCTCACCCTGGTCCATGACTGG
ATTGGATCCCCTTAAAATCAACAGACTGGGTAGGAATGAGTTGGTATTGA
TCCAGAGTTCTCTCACCTGTCAAAATTAACGAAAGAGTTTTATTACTCTT
GATGTATAACATTACAAATTAGCATGTAGAACAGCATTTCATGTTCATTC
TTCTAGAAATGCACAAACAACATCTGCACATCTTTTCATAATAGATAGGT
GAAGCAAACATACTTACGAGCTCTGTGATCTAGGACAAGAACTTCTCATT
ATGACATTTTCTAGACAATGATATTTTGAAAATGATTTGTTACTTCAAAC
ATTTTTTTCCTTGTGTGGGATTGAGCATATTGTATGCACAACTTCTTTTT
TAAAATATCTATCTTATTTATCAATGTTTTCCTCTGGTTTGTGAAGTTAG
TCTGAACATAATAGTTAGTTAGTATACTGAGGTGAGAGATCATGTCTCTG
TTTCTTGTCAGCAGGCTTGTGTCCTATTTGAGTGTCTCTCCAGCTTGTGA
AGATACTTTTTCATATTCAGCAATTTTTATCCGTTGGCGGTGAATTATTA
GGTAATCATACTTACATCAAATAAGATCACCAGATCCTTGAAAGAAAAGC
TACCAATGAGGGCTTGACTAGCAATAGCCCTTCAGTGAAGGTGAATGAAC
TGGCAGCAGGTGCCACTAATTTCCTTTATATTTTGACTGAAACAAATGCA
TATCGTGGAAGTCATTTTTTGGCACATTACAGTGTGATCATACTTGCATG
GGCACATGAATTAGTCTACTCAGGTTTGAAGACCAGATGCTTCTTATGTA
TTGTTGCCAGCGGAATAATGATGGTGCTGTCAGTATGGTGGCCAGGAAAC
CTGGTTTTAACATTTTTCTAAGTTCTAAAAAGGTACTTTTTTCACTGGCA
TACTGGCGGTAGTATGAGGGCTTCCACACAAAAGAAGTACATTGGCTATT
TTAGACCTCAAACCACTAGGCTACCTGGCGGCAAGCAGTACCAGAGAATA
CCTAGTTACATTGATCATGTGCCTAAGCTGTATGATCATTGTCCTTTTTT
CATAAAGGAAAAAACCAGTATGATCATTGTCTGTCTCATTGTTTTCCTCC
ACCATCACCTATTAGTGACCTATTAGTATATGACTTGCATGGATGATTAC
TCTTGCACAATGTTTTTTTTGACACCTTTACCGTAGGGGAATCCCCTACG
GTGTAATTTTATATTAAAAGAAAGGAGTTACATAGGTCCTATGAAAGGTA
GAGTACATCCTCTTGCACAATGTTATTGCTGCCAACATGGTTTTTCCTTA
GTGTATAACTGCAAAATGTATAATGTGTCTGGTCTCTACACAGCATTTGG
AAATGCAAGGTAACTTTATCCGACTTTCACGTCTTGGTTGTCCAAGATAT
GGCTGCAGAAGTGAAGAGGTTGACATGGAATCTCTAGAACCGATGTATTA
TGTCCAGATATCACAAGAGATAGATGTGCACTTCTGTCTTGTATGTACAT
TTGCATCGGTGGTTTGGTTCATTTCGCTTATGGGTGCTTGTGCCTTCCTT
ATCTACTTGACTCCCCTCTGGCACATGTTCAAATCCAACCATACACATAC
TTTTGACTGCCTGCTCTCACAAATTGTATGCCACTTTTTCTTCAATATTC
TCGGGTTCTTTTGGAAGGGCGAGTAATGACCAAATGACCATAACTTACAA
GAAAGGATAGTAGTATATATTTTGTTCTGCAGATGCGTGGCATTGCAGGT
ACCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.