Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE028942

[Submit comment/correction]

Sequence	AE028942
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE028942
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACCCCAGCCCCGAGACAGAACCGGCGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAT GAGGAAGAAGGTGGACGAGCGCATCCGCACGCTGATCGAGAATGGCGTGC GGCAGCGGCAGCGCTCCATGTTCATCATCGTCGGCGACAAGTCGCGCGAC CAGATCGTCAACCTCAACTACATGCTCGCCAAGTCCCGCGTCAAGTCGCG CCCCTCCGTCCTATGGTGCTACCGCAACAAGCTCGAGATCAGCAGCCACA GGAAGAAGCGCGCCAAGCAGCTCAAGAAGCTCATGCAGCGGGGGCTCATG GACCCGGAGAAGGCCGACCCCTTCTCCCTCTTCCTGGAGACGTCAGACAT CACCTACTGCCAGTACAAGGACTCTGAGAGGGTTCTCGGCAACACATTTG GCATGTGCATACTGCAGGTATAGCTTCCAGCTTCAGTCTCATCTATCCAT CTTATTAGTTCTGTTCTTTGTTGTTGCCGTACGGCCAGTCCTATGTTGTC TCGTTTCTCTGCACCTAATTAGTATCGCTGCAGCCTGATGAGATAGTTGT GATCTGATTGATATTGCTCCAGCCTGAACTCAATTAATGAAAGTCTAAAC GACTACAACTCATATGGCGTGTTGCTATGCTACCGTTCATTTTCTTATTT ATTAATCTTGTCATCATGAATGTACGCATGAACTACTTCTGCCCATCTGA ATGATACTACTGCCAGTACTGTACGCCCCAACTCGTTGCGATTGGATCCC ATCGATAAAACTGAGCGATCCAGCCTATCATAGCTACATCTAATTAGGGG CCTGCTATAATTTTGTATTACTCTCTAAGTTCTTAATGGGTATTTTACCA ATGTACAATCAACTTTGGGTAGATAATCCAAGACCGGTGAACTTTTGGGT AAATAACCAATTTTCCCTAATTTCAATTGTTTTGCCGTGATGTTGCTATG ATAAAATGTCTGAAATTCTGTATTTATTTGTGCAGGACTTCGAGGCGCTG ACGCCCAACCTTCTGGCCAGAACCATTGAGACCGTTGAGGGAGGCGGATT GATCATCCTGCTGCTCTCTTCGCTCTCCTCGCTAACCAGTCTCTATACCA TGGTCATGGTGAGCTCACTTCTCTCTTGCAAGTCCCCTCGCTTTTGTTTG AGAGAATTCCTTATTTGACACTGCCTAAAAATTCAATTCCCTATTTTACA CTGGAAAATTTATTTCTTCCCTATTTGACACCATGTCAAATTTTGTTTCC CTATATGACACTCTAGTTCATTGTGAGCACTAACGATGTTAAATGGGACG TGAAAGGACGCTTTTGCCCCCAATGCATTTTGTGATAAAAAATTGGGCAT GCAATATAAAAATCTGAAACTAAATGATTTCATCTTGTGCCATATATATG CAAACGTCATGAGATGTATATTGCTAAGTCCACTTATGTATAACGCTTTT GAAGAGGGCTTAAAGTGAACACTGAATCAGTGAAGCTGCAGAAACAAAGT GAACACTATTCGGTAAAGCTGCAGAAACAAATATTCCAGGCAAATTGTTT CAAATAATAAATTGAGACATGAATATTTAACCAGAGATCATCTACAAATG AGAAAACAGTATGGATAGGCGCATATGGCTGATAATCATCTGCAGCCGAG CACTTATCCGTGCCCGGTGGCCACGTACGCATTGGCACCCAACACTGCAG CTGAGATCGGTGACGGGCACTCCGCCGCGGCGTTGTTTCCCTCCCCCGGT ACGCCTTGCCTGTTGTTCGCATCCCCACCATGCCTTCCCTCCCCGGATGT GCCTGCGTCGCCGTCCGGAGCCATACATGGCCGCCACCCGCCTTCGTTCC CGGGGCGCCCACCCTAACTCCGCCCTCCGCAGCCACAAGTTTAGTCTGCG CCGCCGCTATGTGCCCGAACGCCGTGCCGCCGCTAGGTATCGGGTCGGGG GCAGGGATTGAGGAGGGGTTTCTGTGGACAGGGACGAGTTGATTGGGTCA GCTCCTTTCTTTTCTAGTGTTGCCGTTGCACATCGATACTTGCATGGGTA ATTTGGTCCTAGAAAAGAGGGTAACTGAACCAACGGCAATGTCATATAGG AAAAGAAAGTTTGATATGGTGTCAAATAGGGAAGATTTTTTTTCTAGTGT CAAATAAGGAATTAACTTTTTAGCTAGTGTCAAATAAGGAATTCTCTGCT TTTATTTCTGAGCAAACAATCATGATTTCGGATTCAAGGCTGAGCTGAAG TAAACGAACTTGGGTGCTAACAGGATGTTCATGAAAGGTTCCGAACGGAG TCTCATACTACCGCAGCCACAAGGTTCAACGAGCGGTTCTTACTGTCCAT AGCATCATGCAAAGCATGTATTGTGATGGATGACGAACTCAACATTTTGC CTATATCATCTCACATGAAATTTATACAGCCAGTTACAAACAATGAGGTA TGATTTTTTTCTTATGCCCTTTGAAGCTTTGCTTTTGAAATTATGCATCT CTTGAAGATTCTGGTTGTGCCAATTTGGTTATCTAATTCCTTTTTGACAT GCATATTATACCATGTGTTTAGGATTCCGAGGGTTTGTTAGAAAGGGAAC GAGAGTTGAAAGACCTAAAAGATCAATTCCGTGAAGACTTCCCAGTTGGC CCTTTGATTGGGAAGTGCTGCACTATGGATCAGGTGCAATTTACATACCT CATACACTGTCTGTGTTTTCCTTTGGACATAAAAAAACTGCTGGTCCCTA CCATAAACTGAAAATGGAAAAATATTCACAGGGTAAAGCTGTCATCAATT TCCTGGACTCTATTTTGGACAAGTCCCTTAGGAGCACTGTTGCCTTACTC GCTGCTCGTGGACGTGGAAAATCAGCTGCCCTTGGTCTTGCTATTGCTGG AGCCGTCGCAGCTGGGTAAAGCCCAACTCAGTAGTGTTATTTATGTATTC ATCATTTGCTCCTTTCATTAAGGCTAATGCTTTGGCTTTCCAGGTATTCA AATATCTTTGTCACTGCTCCAAGTCCGGAGAACCTTAATACACTATTTGA TTTCGTCTGCAAAGGAATAAACGCATTGGAGTACAAGGTGTCTGTTTGTT ATCTTGTTTTATTGTTGAAGTTTAAACTTATGTTATGTTGTTGAGAAATG CATGCTTTATTTTCCCCTTTCAGGAGCATTTGCATTATGATGTAGTCAGG AGTGCTGATCCAAATCTCAGGAAAGCAACAATACAAATAAACATCCATAA GCAACACCGTCAAACAATCCAGGTAATAAGAATATTTGCTTGCAAACATA TTTTGCTACCGTCAAACATCACTTTGCTCAGTATCAGTGAACTGGTTCAA AATTTCTCATGTTTGCAGTATATGAAACCGCATGATCATGGAAAGCTTTC TCAAGTTGAACTTCTTGTCATTGATGAAGCTGCCGCTATTCCATTACCGA TTGTTAAGTCCTTGCTTGGTCCATACCTTGTTTTCCTGTCTTCCACTGTC AACGGGTATGTTTGCTTTTAGTTACTAATGATCTAGAATCACAATTCATG AGGGTGATTGTTCTGTATATTTTCCTGTTGAAGGTATGAAGGAACAGGTC GATCCCTGTCTTTAAAGCTCCTGCAGCAGTTAGAATCCCAAAGCCAGCCA TCAGCTTCGAGTGATGGACCCAATTCCAGTACGAGTCATCTTACTTCCAT CTAAAAATAGTTTCTACATTTTGAGAGAACCTTCTGAGTATTTGCATCTT TTACATGTGTTTGTGCTTTATTTTGGCTTCTAGGTAGGCTATTTAAGAAA ATTGAATTGAATGAATCCATTAGATATGCATCTGGTGATCCTATTGAAAC CTGGCTTAATGAGTTACTCTGTTTGGATCTTGCAAACTCCATTCCAAATA TCAGTAGGTGAGTATGATCTGATTTATGGCTGTGCTGTATTTTTCCTTTC TTATATTGTTGCATGCTTAGCAAGCAAGTCTGTGGTTTTGTAGGCTACCT CATCCAGAAAAATGTGATCTGTATTATGTCAACCGGGACACACTTTTCTC ATATCACAAGGAGAGTGAGGTATTCTTACAGGTATGAACTAATAATGTTC CGTTTTCTGTAAATTTATATATTTGGTTTAAATATGATACTGAAATATGG ATGCTTTACATGTCCACTAATGGATATTTATTCTGTATACTTAATATTTC AGCGGATGATGGCACTTTATGTTGCTTCTCACTACAAAAATTCACCAAAT GACTTGCAATTAATGGCTGACGCACCAGCTCATCACCTTTTTGTACTGCT TGGTATGGAGCAAATTGATTTGCCGGCACGCCATTTTAATATGATGACAC TATTATATAGTACTAACTTGTATTCTTTATTTGTTAGGCCCGGTTAATGA GTCTGAAAACCAGCTCCCTGATATTTTGTGTGTGATTCAGGTTTGGATAC TCTATCCTGATTATCTTGTGGAGGATCTTAAATTTTGAAATTTTCTCCAG ATGATAGGGTGGTTTATTAATTGCACGGTGACTGAACTACATGAAACAAT CGTACATACATGAGGATACATGCTAATGCCAGGCACAAATAAGACATAGA AGATATTCTTTGTTATTTACCTACCACATTTGAGCTTTGTTTGTAGTGGA TATCATGTGTTTGGGCAAAACATCCTATCCTAGTTTCTAGTTAACCAAAC TGAAATTTTGCTATTTGCTATCTGTTGAAGTGTAAAATCACTCCCTGCTC ATACTACATATAAATAGAGCTTATTGCTTAGTTGAAATCACCAACCATGT ATAAAGTTACTCTGTTTTGTTACTTCATTGGAGTGTGCTCAAACTACAGG GGTGCAGTTAACGTCAATAACTTATGTCTAGTACAGTTGTTCAGTGGTCA TTGTATGCTGCAGGTGCACAACATGCTGTACGTATAAGTTAGAAAATTCT GGTCGAATTTGGGAATATGACCTGATCACTCTCATCTTATCTTAGTTGCA AATTTTATTATTTAATACCGTTTCCTACTACTTCAGTTTAACCTCCATCT GTGTTACACACGCGCTTTAGGATGCCTTATCGCTTTAAAAACCATGGTTA TATTACTCAAAAACTGCCTTTATTTTCTGATAGTCTTATAGTTCTATGGA AAAAACGTGTTTCTGTTTTATACTTGAACTAATTCGTTTTATCCTACTGG TTAAACTCACTAGTTAAGCTATGTTGATTGCTATTCCTTCCGCCTTCATG ACGTGGACAGTTTCCTTCAGTCGACACCATTCGAAGTTCATCTAGGAATT GAGATTATTATCTTACTAGATAGCATATACACTCATTCACCACATTTTAA GTTGCTAGAGCCCGTTTGAAATGTTCAGGTCTGCCTGGAAGGACAAATAT CTCGAAAATCAGCTATTAGAAGCCTAAATGAGGGTCATGCACCTTCTGGT GATCAAATACCATGGAAGTTTTGTGAACAGTTTCAAGATAATGTTTTTCC CAGTCTTTCAGGAGCTCGGATAGTACGGATTGCTGTTCATCCAAGTGCCC TAAGGGTCAGTATTTTGCCTCAATTAAATGTGATTCTACCTATGTTAACA TCACTCTGTGTTCTAAATTCTCTCTTTTTTTAATAACGCAGCTTGGGTAT GGTTCAGCTGCCGTCAACATTCTAACAAGGTTATATGTTATTTTTTTTAT TACTCCATCTAGGGCTCTATCAGTTGAGGCTCTTACGTTTTTCTGAAGCT AAAATTTGACAATTAGTTAGGCGTATGATAAGACAGGGGAACTTGCAATA TCTTGGTTGTACCGCCCTGGAACATGACTGCTAGGCCCATGGAGGGGCAG GGAGGTATGGGCAATTTCAAACTTCGACGAGGGCAATGAGGCAAAAGATG CTGCCTGCAAGGGAAGATGACTGTGTCGAAAGGCTGTAATCCTATATTTC CTTCGGAGGCGAATGTAGATAAAGCTGCAGGCATGGCTCGCCATCGTTCA GTGAAGTACGACCTCTAGCAGTCTTGTGGTGGTGACCTATGCCGTGAAGG CAGTACCAGCTACGAAAGTGCGGCATTGCACAGTTCAGTAGGTGTTGGGC ATGGATGGGTCTGGCCTACGTTACGTCGGTGTACACTGACCAGATACTTC AAATACACCAGGATATATATACTGCATGAGTTTGGAGATATTCGCACTCC CTAAGAAAACAAAATAAATGCCAATGCTTACGGGATACCCTCTCCCATAC CCACCCAATGCATATAACCCTATGGAGGCACCATTAGGCCTCTTGTACAT TTTTTATAGTTGACAGTGAAATAACTTACAATAGAGTGCGTATCAAGCTG TTAATAGCATTTGCATAAATTTGTGTTGTTTGGAGTTGTACTGAACAAGA GGCATGCCTGAAGTATTTTGCTTATTTCTATCTCTGCAATATCATAGCCT AATTTACTATTTAGTAGTTATTTCATGTAAATCTTATGCTATGCTCAACC TCTGTCAAATATATTAGTCTTAACCTATTCCTATTTTGTTGACAATTACA TTTGATTTGATTGGTTCCATAGGTACTATACAGGAAGCATGACAGATTTT AAAGATGAGGAGGAAGTTGAAGAGCCTGCAGTAAAAATTAGTGAAGCTGC AGAGAAGGTTCATTTTAACAACTGTGTTTTTTTGGTTCTTTTTCATATCT TAGTGCGGCAGCATGAAGTTCCTTTATTGTAATCTTGGAATCATATATAT CTTTACTGTCCCATACTCTTGAATTTGTGCAAGTTCTACTTTATTTCATC ATGTAAGAATGATTAGGTCATTTTTCGATGTATGTATGGCTTGTGCCTCT CCTCACTTGTGTACCTTCCAATTTTGTGTATGTTCTTGCAGGCTTCTCTG CTAGAAGAGAGCATACAGCCTAGGGCAAATCTTCCACCTCTCCTTGTTAA TCTTAGGGATCGTCGTCCTGAAAAACTCCATTACCTGGGTGTATCTTTTG GGTTGACACAGGAGCTTTTCCGATTTTGGCGCAAGCACGACTTTTTTCCG TTCTATGTGGGCCAGATTCCAGTAATGATCTGATCTGATTTGTTATTTCA TGAGGTTAATTGTTCTCACCCTTTACCATGCTTTTATCATGGGCATTAAT TAGCTGTTTCTGTTTCATAGAGTGCTGTTACTGGAGAGCATACCTGTATG GCCCTCAGTCCCCTAAATAGTGATGACATCAAAGTGGGTGATGATAAAAT CAAGTCTGGATTTTTGGAACCATTTTATCAAGGTATACCTGAATGTTCTT TTATATTTTGTAGTGATTGGTGTTTTGAACTGAAGCTGCTTGAGTTGTAA CTGTATACGTTAGAGTGAACAGAAAATGCTATGTTGTTTTTTGCCTTAGC TGATAGATGCACAAGGTAGTATTGCTTCTTTTGTTTTACAGCATGCCTCT GCTTTAGAAACATGCTTTTGGTGCTCTAGCTAACTTTATAAGTAATATGT CCAGATTTCAGACAAAGGTTCAGGAGGCTTTTGGGAACATCTTTCCGGCA TCTCAACTTTAAGCTTGCAATTAGGTATGTTAAGCCTTCATATTATTCTC TTAGCAAAAGACATGTGCTTCTCTAATATATTTTTTGTCATGTTTCTAGT GTTTTGGCTTCCAAAATAGATTTTTCACATCATGAGCCTTCAGAAAATGA TACCAGTTCGACACTGAAGTTACTGAGAGACGTATTATCCCCACATGACA TGAAGCGGCTAGAAGCATATTCCAACAACTTGGTCGATTATCATCTGGTA AGAATCCGGTGAAACAATATGAAGGCTGTCTATTTTGAATGCAGTTGCCA TAATACGTTTCTTTTTAATTGTTGTAAAATCTCTATTATCTCTTGATTTG ACCTCATTGATCGCCTGTGCTGCAGATCATTCTTGCCACGTGCTTAGTTG TAGTTACTACATATGTCACTTTTGCAATCTAGCTGTAAACAATTTTTAGG TTTTATGTTTTTATCTGAGGTTATTGTCTTCTTTGCTTCCCACTTAGTCT TTTTTATCTCCTGAAATGCATCTTTCCAAAGAACTTGAAATCTTCATTGG CTGCCAACGTTCCTGTATGCAGAGTGAACCTCCTCCTACATATAGCTATA CATGGTAGAAACCTTTCCAATTTAAATATTTTTATTTTGTAGATTTTGGA TCTTGTCCCTATCCTGGCACATGAGTACTTTTCAGAGAAGCTCCCTGTTA CATTACATGGCGCCCAAGCTTCAGTTTTGTTCTGTATGGGTCTGCAGGAC AAGGACATAAGCGCTACAAAGGTTAGCTCAAGTTGATAACACGTAAACAC ATTTTTCTGAATTTTTCATCAAACTGGCTGGTAATTCTCTTGTTGTTCTC TGTTAACAGGAAGAGCTTGGCATAGAAAGGGAGCAAGTTCTATCTAACTT CATAAAAACAATGAAGAAGTTATATGGTTACCTTCACAATACCGCTGGAA AAGAAATTGAAGCAACCTTACCGCGACTTAAGGAGGTAAGCAAAAAATCT TGTTCTCTTGTCAGTTTAATGTGTGCATGTAATATCTCCGCCAAAAAATG TTCGCATGTTATAATTCCTTTTTGGATTTTGGTTTGGTGCCATGTTATAT TGTTGAGCATGCATGCAAGGTTCATGGTTTATTCACACGGAAAATTGAGC ATGCATGCAAGCTACTTCATTTTCTCCTATATTTTTGTTTTATTCAGATT GGAATGACCCCACTTAGCAGATCAATGGATGAAGACCTTGATGAAGCAGC TGAGGAAGTGAAGGTGAGATTTCAGAGATGCATTACCTCGTCTTTCAATT GTGATGCAGAGTAGCTAGTAAATGTTTCTTTTGTCACACACAATTTCTCC CCTGTGTGTTACTGCCTTTGGTAACCTTTGCTCATAATATAGGAGAAAAG AAGAGCTGCAGATGAAGCTACTGTGGACCCAAAGTTACTGCAAAAGTATG CAATTAACAACGATGACTTTGAGATTGAGAAGGCTCTGCAGACTGAGAAG ATGTCTGCAAGCGGTGTTATCAGTGTAAAATCCAACAGGACAAATGCCGA CAAGAAAGAGAAGCACAGGGAAAAGGAAAAATCTAAAAGGAAAGGAACAG ATGGTAGTAGATCAGAGTCCAAGAAAAAGAGGACTTGAAGCTCTCCACTT GAAATTGAGATGGTCTGATGGTTTTAACCCTGCTGTTCTGAAATCACCAG AGGAACTCTGTTGCCCAGAAAAGAAAACCCTTTTAGCAGCCAGAAATTGA AAAGGTTTGATCATCTATCTGAAGAGAAGTAGAAGAGAGCAGATGTTGTG CGTAAGCTCCATTATGGGCTATAATTTGTAGATCGATGATAAAAGCAGTA CTGTGCCCTGTAAAAGGTCTCCAAAAAGGCAAAAACCCTGTGGCATTATA ACGCCCCAATTTTGATCCTACATCATTTGTTCTAATGGAATACAGTTTTG CTTTCTCGTGACTGTATAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.