Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE043223

[Submit comment/correction]

Sequence	AE043223
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE043223
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCCTCTACCACCGCCCTCCCGTTCTTCTCGCTCCCCCCACCCCACCCCC AACCCGAGGTTGCGGATTTCAAATTCCGAATCCCTTCCCGAGCCCTCCGC CGAGCACCAAAACGCTAGCCCGATTTCCTCGTCCCCTCCCAACATGAGTG ACGCATCCGGCGCAACAGCCTCCGCTATGGGCAGCGGCAGGGAGCTCGCC AACCCACCATCCGACGGCATCTCCAACCTCCGCTTCTCCAATCACAGCGA CCACCTCCTCGTTTCCTCCTGGGACAAGGTCAGCCACGCCGCACTTCCCT TCCCTTCCTATCCCCTCTGGTCCTCAACCCGTCATAAACCCTAACTGCCT TATCTGACCTCATTTCGTTGCTCGGGCTCTGATGCAGACGGTTCGGCTGT ACGACGCCGATGCGAACGTGCTCAAGGGGGAGTTCGCGCACCCCGGCCCC GTGCTCGACTGCTGCTTCCACGACGACTCCTCTGGGTTTAGTGCTGGCGC CGACCACACCGTCCGGAGGTGATATTTTTTTTATGTTTTCGCGTTTGCCT TGGATTTTGGAGTGGGAAGAAGCTTATGTATAATCGACTGGGTTATAGAT TTGTAACCATCGTACTTGGCATGGAATGTGTTTCCATGGTGGTGAAGTGA TATTAGCTTTCAGTTTTCACTTTTAGTGAACTCACTGCATGGAATGAGTA AATCGATCTGCTTCAGTGGTTGTCCTAGTTTGAGCATCTCTAGCAGATAC CGCATATCGGCCGGCCTGCAAAATTTTGCGCCGATATGCGGTATCGAGGC CAAAAAATGGCCTTTCCACATACCATAAAGGGCCGAAAATTGCAAATTTA TTTGCGGTATCCCGCATCGAGGCCCATCCGTCCCGCATATATTTGGTGCG GGGGGCCTGGATGCGGGATACCGCATCCGTTTTTCCCTTCCTCCCCCACC CAGAAACCCTCGTCGCCGCCCGCCCCCGTCTCCGATTCCGGCCACATCCG CCGTTGAAAAACACACCGCCGCCACCCACCTCCGTGTCGACCCCCCATCT TGCCATGGCCGGCCAATCGAGCCGCAATTTGGGTGGACGCGGCCATGCTT CTCCACGCCGCGGCGGGAGCTCTGGCTTGCGAGCTCGCCCGCCGCTGCCG TCGGAGGAGGAGGTACGCCGGCGCCGCTCCGAGCAGGGACATGGTCGCGG CGCCCTAGGGCGCACCCGTGTGACCTTGCCTGCAAGGGCGGGGCTGCTGT TCGACCCTGCCGCGGACGATGCCGAGGAGCTCTTGGTGAACGAAATCTGT GCGGCCCCGTTGGTCGTCCGCGAGCCTGCTCCCGCCGACGCTAACAACTC GGACGACGAGCACGAGGAGCTCTTGGTGAATGAGGCGAAGTTCAACTCCC TCTGCACCGCGCTCATGGACACCGTGGAGCACCGGAAGCGCCGCCGCCTC GCGTGCGCCGCGGAGAAGCGTGCCGCCGCCATAGATGCTCCGGTGAGTAG GTACCGCTGGTGGAGCTACGTAAATGCTAGGTCTAGTCTGGATGTAGGGG GTGGCATCATTTTTTGCTAAACATATATCGATCTCGATGATCAAAATCTC CCATATGTATGAATCTGGCGCCAATGTGTGATGTCTTTTAAATATGCAGT TTGGATCTAGTGTATGTGTTCTGTCCGAGCGTTTATCATACTGCAAACCA GGTTTGCAGTACCGCGGGATGTGGTATCTGCTAGAGATGCTCTTAGCACT TAACAAATTATCAGTAATACTCAAATTGCAACATAGCACAGTAGATAAGT TCTATGCCTGGTGCATTAAAAATTATGATTGATCAACGGCCTGGCAGCAA ATTCGGGTGCAGGGTGATTCAGGTTGATATGTTGGCTACTTCTGCTACTT TCCAGGGTTTTTTAATTTAGGATCCTAGCCAGATTGATAGTCTACTGTAT GCCTATTGGACCTTGTTCTAGAATCACACATATAAAGACTTTCGGTACAA AATTGTCCAGCCCTCCTTAATATTATTAGTGGTGCGTGAATCTTAATTTG AACGATCCATGTAATATTACAAGCAATATGCCCATATTAGCATTTAATTT TTTTTGTAAATTGAATGTTGCAGGCAAGACTAGCAAGAACTATGCCCACA GTGCTTATCTGAATGTTCCTTGTAAACTGAAATTTGTGAATTTTCCCTTC TGTAATTACCAGTTATATCCAGATTTAGCTAACATGACTGCATCAGATTA GCATTTACTTCATCAAAAGAGGATATTCTGGGGCGTCATGATGGTCCAGT TCGCTGCGTGGAGTACTCTTATGCTGCAGGTACTCTTACATACTCCCTCC GTTTCATAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGACTTTCACAAAGCTAA AACATCTTATATTATGAAACGGAGGGAGTACATTCCTATTGAATTTCTTT TGTTCATGTTTTTTCATGGAAATCTTTGCTGCAGCTTGAAGCAGTTAAAA GGTTAAACAAAATTTCATTATTGTACTAATAATCATATCATCATTGAGAA TGCAGTTGATTTTTTCCCAAAATCATCAGTAAATAAAACACACTGCTTAC TGAATTCATGTTTATTCTTAGTCACAGTCTATAATTTGATTCTTCACAAG CTTGCAAGTCTAATCTTGCATTGCATATAATGAACTAATAATGACAATTT TCATTTGGGTTATAATAATGCTGCAAGAATTTGTTATATGCCCCAATGTA ATAGACTTGTTGGCTGGCTTGTTGACAATGCTTTCTGGTAGATAGTCATG TTGACTTGGCTCGGTACTTGTTTGTTCCAGTGCGTGTTGAATATTGATAG GCATTTGTTCATTTTGAATTGTTATCCATATAGTTTAGCATGCCAGTGTA ACATCCATTGGACTTAATTCAAGGACAATGATGTACAAACATTGATGTAC CATTATTCTATTGGGACGACTCACATGAGAATCGTTCTGATGGAGATCAA GCAAACATGCTTTCTAATCACCTCCCTGCTCCCAATCCCTCCCTCCCACC CCTAGCCCCGCTGCCGACGTGCTCATGCCGGTAGCCCACCATAGAGCAAC CGCTCCAGCCCCCTCACCCCTCCCCCAGCTCTCCCCCCTCCAGCGCCATG TCCTCCGGCGACAGCAGTGGTGACGGCCACCACCGTCGGGAAGATCGATG GATGGTCTTCAATGGGTCGCCTTCGAGCCAGGGCTTCTGCAGTTACATCG ATGTAGCGCGGACACCGGCTCCACCATGCGCCGCTCTGGCCGTGCCTCCA CAGCATGAGGTCCTGTCCGCCACCCGTTTTGGCCCCCGCTTGGAGGTCCA TCGCGTAGCCGATGCTACGCCTCGTGGGCCAGATGCCGACGGTTGGCATC AGCCCAGACGCGTACATCAGCAGCGTAGCTGCCCGTGCCGTGACGACAGG AACCAGCAGCGCCGCCGAAGACCAACCCCGGAGGCGGTGGCTGGCCTGTG CCACCGCTGCCTCGAGCTGGGATACCGCATGCGCAACTGCACGACCGAGG TCCATTGTTGTCGCTGCTTTCTCTCTGGCCAGGGGTACTGGTGGTGCACG CCGGAGCATCGCGCATTCGACGTACCTCAGCATCCCCCTCACAATCAGGA AACCAACCACGGCCCATGGAAGGCAGGGCCAATGGACAAAGCTGGGTGCC TGGCGCTCGTGAAATCTGTGTTGGGCGCAATACCCCTCCATCAGCTGCTC GTCATCGCTCCTGCAAAGAAATTGCTCAGGCCAATTGAAAGAATCTAGAG AGGCTTTCTCTGGGCAGGGCGCGCTGCCGCCAACGGTGGCCACTGTCACG TGAACTGGCGATGCGTTGCTCGCCCCGTCGCCCTTGGCGGCTTGACTTGG AATGCACCAACCTCTCTCTACGTATGTGCTGGCTGTGGCTTAGCCGCATT GACAGCAGAAGAGCCTGGCACGACATGGACATGGAGTTCACCAAAGCGCA GCGCGACTTCTTCCTCGCCTCCACCACCATGGTCGTAAGAACGGCCTCGA CGACAAGTTTTGGGATGACTGTTGGATCAACGGGCAGACCATCAGCGAGG TCGCCCCGCGACTAATGCCTGCATCTCCAAGCATTGCCGGAAGACGAGGA TGGTGGCCGAAGCCCTACAAGATCACCGCTGGGCTCCTGACATCCAAGGA AACCTGGGCATCCACGAAATTTGACAGAACCTGCAGGTATGGCAGACAAT CGAGGGCACTACCCTATCTGAAGAGGCCGATTGCCTATGCTAGAAGTGGA CTACCAGCAGAATTTACACCGCGTGCTCTGCCTACATAGCGTCCTTCCAT GGATCCTCGGGGAATCACATCTGGAAGACCTGGGCACCACCACGCGTAGG TTTTTCCACTGGCTTGCATTGCAGGATCGCTGCTGGACCGCGCAATGGCT CCAACGTCATGGCCTACAGCACCACCCCCGGTGCCTGCTATGCGATCAGG AGCCGTAGTCCACGCACCACCTTATCCTGGCATGCCCCTTGTCACGGCAA ATCTGGCATAATATCATGTCTTGGCTGCGCATGACCTGCAGAATCCCCAA CAACGATGATGCTTCTCTCGTTGATTGGTTGGAACAAGCAAAGTACGGCA CACAGAAACCATAACGCAAGGGCCTCACAACAACCGATGCTCCTCCTGCC ATGGATGATTTGGAAGCATCGGAACAGCTGCGTCTTTGACGGACTGCAAC CCTCAATCAGCAGCCTGACAGCTGCAATCAAAGATGAGGCTTTCCTATGG GCACAAGCTGGTGCATTAGGGCTTATAACCGTGCTGCTAGCCACTTGGGA TTTTCGTTAATTTTACTCCCTGCATCCTGTAACTTAACCTCTTGGGAGGA GTGTATTCCTTCGTTTTCAATAAATGAAACACAAAGATTCTTTTGCGTTT TCTCAAAAAAAGAATTGTTCTTATCTATTTGCTTTTATAAGATTGGTAAG TAAGTCTCTACTTCAGACTTTTAAGTTGCCGAAGTAGATTAAACAAAGGA TCCTAAACTAAAGATGCTCCCTTGTTAAAAGAAAGATTGAGAGAGACAAA AGAAGAGTGAATTTCACAAAACTGCAGGTGTAATAAGTAGTTTCAGAAAA CAACAAGTACTTGTACTTCTGCAATTTGTATTTAACTGATTCTTAAACCG GTAGTTCCTTGATGGTTGTAACAAAAGCCTGTATTCTATAGTTTTGTGAC ATTTTGCTTTAAGTGGTTGTGGCATGCATGGACTCTGGATAATCGGTAGT TCATTCTAGTGATTGGTTGGGAAGAATGTTATGAAAGTATAATGTATGAT CTATCTTATGATATTGTTTTTGTATTATAGATGTTGACAAATTTTTCTAT AAGCCCGGTCAAAATTTAAGTCGTTTGACTTTTAGAAAAATTATATGCCT TCCTTTTCGGAATGGAGGTAGTAAGAAATTGACTTTCTGTCTGTGTATAT TATCCATTTAGGACAAGTGATCACTGGCAGCTGGGATAAGACAATCAAGT GCTGGGATCCAAGAGGAGTAAGCGGACCAGAGCGTACACTTGTTGGGACA TATGCTCAACCAGAGCGTGTGTATTCTATGTCATTGGTAGGAAATAGGTT GGTTGTTGCAACAGCAGGAAGGCATGTCAATATTTATGATTTGCGCAATA TGTCTCAACCTGAGCAAAAAAGGGACTCGTCCTTGAAATATCAAACACGT TGTGTTCGATGTTTTCCCAACGGAACTGGTAACTTGTTCTCACCATTTAC TAGGCGCACTACATTACTGCATGTTTCCCATTGTCAGCCTGATTTCAACC ATCACAAGAAAGATTGCATAGATTACTGTAATATGTGGTTATCAATTTGG TGTTTTTGATCAACCGCAATATTGGTGCTTCCTTTGAAATCTGCCTTGGT TGTGTAGATCTCTTGTTGTGCTTGATATTCTACCTGAGAAAGATTATTAA TCTGTATGCTTAAGCTATGCTTCATTCTGTAAATTTTGATTTCAACTGTA TGGAATATGCTCCTCCAGACAGGACGGTAATCATTGTATGCAGCATTTAA CCTTATATGTGATTGAACTATTACAAAAACATGTTTATGCATGCAATGGT ATAAAATTATTGCTAGGCATTGCCGGTACATGAATTTAAACATTACAAAT CAGGTTTCAAGTACTAAAGTTTGTCTATATACATGCGTGAAATAACATAA ATGAACTATGTGGTATAAGGTTAGTGCCACCTGAGGAAAATACAGCAACT ATGTTTTGAACATTACCATGTACAAACATGTACATGCCTGCCTTCATCAG TATGTTTACAAATACGTCGCTCAAGCAGCCTTGAATTAGAACAATCTTGT CCTTTATTTTTCTATTTTTTCCTAATTAATCTTCTGTAATCCTGTTTGCT TCAGGCTATGCTCTAAGTTCTGTCGAAGGACGAGTTTCTATGGAGTTCTT CGATCTTTCAGAGTCTGCACAATCTAAAAAGTATGTATTCTGCATTTTAG GTTAAGGCATCTGCTTATGTATTTGCCATTGTTTTACTTATCACACTTGC TAATATTTATTTCCTGGAGTATACCACAGTTAAAGTAATGGATGAACAAC TCTAGCTTCCATCTCTTGTGGATCTATCTGGTTATGTCTTAATATTTAGT GATCCTTTCACTTGTCATATCTAGTTCAAAGAATATCTAGGTGATACCGT GGAAACCACTTCGGTTTGAGCCAGAAATTCAACACAGAACATATAAAACT TACAATTTTGTGGAGCTAAAATATGTAGTAGTATTGTACCACCTCCAAAC TCAAATTTAAACTAAAACAATGGTGTTTTAAAAATCATATTGGAATTTTA CTTTGAAAAGTAAGCTTTATATTTTCCATTCATTAGATTTATTATCTACA TTTCTCATTTCCAACCTTGTGTTACCTCCTGCTACCTATGTCCTTTATTA GGGGACGGAGAGATTATAAGTTTTTGTTCAGTTTTTGGTCAGGACACCAT GAACCAAACTGTGGCTGAACAGACCTGGGTGGTATACTTGAGTTTCTTCC TCTACCTAAACTAGGATTTTGTGGCAGCATTAGCTGCGTTTAAGTCTCTT CAGAATTTGCATAGGAGCTCTAGTATTCCTGATACGAGAGAGGTTGGCAG GCAGACTGGTCTCAGCCTCCCAGGTACGATCCTGGGTGAATGGCGGTGTG TTCAACACGCTTGGCCAATTAAGCAGTGGTTGGTTCCAGCTGCTTTAACA ATCACTCAAGCTCAAGCACCCCTTTTGTATAGAAATGTAGAATACTGGAA AGAGTGGTCAAGCTTGTTATCGCCAGTAGTAACGTAAACTACATGGATCC AACCTGGTTTTTTTGCTAAGAATTTTAGCTTTTCGAAATTGAGCTTTGTG TTGGTAAAGGTGGACTGTGGTATAGTGATCTTGACTTTCTGTATGATCAT GCATTAAACTCATGTCATAGCCAATCTAATGCAAAACTAGCAGAAAATGA TAAAACGAAAACACTATACCTGACTTGTAAACCAGGAATTGGATTAGAGT CCAACTCCAAAACCCACGTATCCAACTGATGTCCACTCAAATGTGATATG ATTCATATCCTATCCATAATTAATTGCATAGTATCCAAGTCCATCCAATC CAAGTAGCTCTAACAAATGGATATCCAAGGCCCAATTGGACCTATCATTA GGCACGTTGAGTGTTGGCAAACACACACGTACAGAAGCTAGCTTGCTATG CATGCAAACAATACGAAGCAGTTTGGATTCCTACAGACAGTCTCGTATTG ATTCACGGGTGTGGTTTGCAAGTGCTGTGTGCCATGTATAAATACACGGC GACAACAACCTAGACAAACACGACTCGGTGATGGACTCACAAACCAACTT GGGCTGAACTAGACACGTGCACACGACGCCATGCCGATGTAGATTGGCAT TATACCGGAAGCTGAGACATCCATTGGACCCTGGACTATCCAATTCTCAT GTCCAAAGTGTGTCCATCTCTATTGGATCATTTGTCCATGGAGATCCATG TCCTGCGAAGCCCAGTCCACCAATAAGATCCAATGAATTAGTCATAGAAT GAAGAAAGCTCATAGAGAGAGGTTGTTAGGCTGGATTGCTGCTTTGCAGT AGCCCTTTCTTTCCACTTTGAGGGTGGCTGGTGGTATATAGTTTTGTATT TTTTCCCTTTTGTTTTTAGATTTTATCTGTAATTACTCTGTTTTGTTTTG AATAAATGTGGAGGCTGTGGGGCTTTTGCCTCACGGTAGATAGTCAAAAA AAAGGATCCAATGAATTTTAGGTCCAAAGTCTGTGTTGTTTTGAATAAAT GTGGAGGCTGTGGGGCTTTTGCCTCACGGTAGATAGTCAAAAAAAAGGAT CCAATGAATTTTAGGTCCAAAGTCTGTTGGACTATAGAGATCCAATTCCA GATTTACTGGCTTGTAATTGTGCATAATCAATCACTCTGCAGTGCTCACT CTTTTCATTCAGTCGCTTAGCTCGAAGATACAATCTGCTTATCTTTCTAT TCCTATATAACCTACACTGAGTCATGGTGGCACTAACTGTCTAGGTTAAA ATATTGTTTTACTCACTTGTTAATTTTCTTTCAGGTATGCTTTCAAGTGT CACCGGAAATCTGAGTCTGGCAGGGATACTGTTTATCCTGTCAATGCAAT TGCATTCCATCCAATGTAATTTCTTGTTTTTAGTTTCCGTGCTGATTTCT CATAGGTTTATGTGCTATGAGTTTTCCTTAATATTTTTTCTGTTGTCTGC AGATACGGTACATTTGCCACTGGAGGGTGTGACGGATTTGTAAATGTATG GGATGGCACAAACAAGAAACGATTATATCAGGTAATTGAGAGTTTTGCTT CTTGGAAAATGCGACTATCTGATGTGGCCTGTGTGTTCATGATCTTGTGC TTTGATTGCAGTACTCGAAGTATGCTTCGAGCATTGCTGCTCTGTCGTTC AGTAAAGATGGACATCTGCTGGCTGTGGCATCAAGCTACACCTACGAAGA GGGAGAGAAATCGTAAGACTAGACTTGGCCTGCAATTTTTCTGTCACTAA ATTGGCAAAAACGTTAAGTTTTTTTTTCACAACGGATTTTTTATCAAGGG AAGTTGACTTAACCGGATCTCTTGCAATTTTCAGCCACGAGCCTGATTCA ATATTTATCCGAGGGGTGAACGAAGTGGAGGTAAAGCCGAAGCCCAAGGC ATTGGCTGCACCCCAGTAAACTCTGGGAGTGAAGCATTACAGCGAGACTT TACATTTTAGTGTCAATTGTACTCCCTCCGTCCCGGTTTAAAGGGCTTAC GCGACTAATAAAATATAAATTATTTAAAACAAATGTTATACCACTAGAAA GTATAACATCTAAACTTTCTAATGATATAATTTTTATGTTAAATAATTAA TATTTTATTGGTCAAATTAACGATCTAGATATAGTGTATGCCCTTTAAAC CGAGACAGAGGGAGTATTAGTTGACGGAATCCCTTATTTATGTTAGCCTG AAATGTCAGTATCCATATCTGGCAACTTTTCTACTCTCTTCGTCTCAAAA TAATGTCTGAAGGAATCGATTTGAATGCAACGAAAAAAAATCCTACCTCA CCCCCCGGTCCTTATATGGAATACTATTCAATAAGAACTGTTTGGGTGTT TTTCTTTTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.