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GrainGenes Sequence Report: AE003913

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Sequence
AE003913
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE003913
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCCAACGAAAAGCGTGCCACCCCTGGAAAACAGACCTACACTACACGGCT
ACCCCGCACACAGAGAAAATCACGCTGCCGATTCAGCACAAAGAGCATCC
GCCATCGGCTTCGTGGTGAGCCCCGTCCCCACCGCACATACCCTGCATCC
CGCGCCTCGTGTCTGCCCGTCGCTCCTCGTCCCCTGCCCTGCGCTGCGCT
CCCTCCCAAACCCAGCTCCAGTTCCGCTCACCCGCCCGCCGTCGCCGTCG
GCGCGTCGCCATCCATCCTCGTGAATCGTGATAGAGCCCCCCACGTATTT
GAACCCAAATCCGCGGCTATTCGTGTCCAAATCGTGCTGCTCTACCGCCG
GCCACCTAGCTCTCCGTCGGTATATCTACCCACCCCGCTCCCCGGAACCG
CTCGCACGCACGCACGCGCGCAGGCTCTCCGTTCCCACCAGCATTCTCCT
CTCCCGCCGGCTTCGTTGCGCCGCAGTCCCAGGTACGCACGAGCAAGTAC
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CGAATCGCGGGGTTCCGGGCAAGCAGCCGCCCCGCGCGCTGGGCTGGCGC
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GGGCCGACGACACGGGTTGCGGGTTGCGATCGGCGATGTCACACGGGCAA
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TACTAGTGTTATTTGGGTTGATTTTGACTTTTTATTCCTTGATGATTGGA
CATCAGACGCGACCGTAGAATGGCTTGCACAGAAGATGATCTTCCATTTC
TACTCTCAGGCAGGGCAATTAGATTATTTATAGCAGTATCTGGCAATTAG
TCCTTGCAAGTCAAAGAGCACTTCATGAAAATGAGAATTGCGACGAATTT
TCATTTACAGAGTTATTTTGTTTTATATAAAAATGGGACAGTACTTCCCA
GTTGGCAGGGAGATCCCGATTACTTATCATGTTCCTTGTTTGAAACTTAA
CCGTTGTGCTGTCATGTGGTCTTTGTTCCTATTCTTATGATAGAAAACTT
GACCGTAATCATCTGTTTGAAATTGTGATAACCTGATTCAGGCATTCGTT
TCATTTCCAGGAATAACAGCGCTAACAGGTTCTTCATCGTGGCGCCTTAA
TTGCACTCATCCTCTATGGGGTCCGAGAGAACTGAAGTGCGTCACCCGAT
CCTTTTAGTTCTTGAATTCTTCGGTTCCTGGTAATTGATTCGTTAACACT
GAGAGCATGTCCATTCATTTCCACCTCACAGACAAACGACAGCTTGCTGG
GCAATGGAGTCGTCGGTATCCTCGCCGAGACTGTCAACATGTGGGAGAGG
AGGGCGCCGTTAACTCCTTCCCACTGCGCCCGTCTTGTGCTCGGAGGAGG
CAGGAGCACGAGCGGCGTAAACCGAATCATCGTGCAGCCAAGCACAAAGA
GGATCCACCATGATTCCCAGTATGAGGATGCTGGGTGCGAGATCTCAGAA
GACCTGTCAGAGTGTGGTCTTATCATCGGCATCAAGCAACCAAAGGTTAG
TATCTGAACCTGTTAAGCTAGATACTCCAAACAGACTTTGGTCTGTAGCT
GTGGGTTGTGACAAGTATCGTGGCTGTGAGAACTTCTTGAGGCTTGTTTC
CTTTGTGCAGTTGGAGATGATTCTACCAGATAGAGCGTATGCATTCTTCT
CGCATACCCACAAGGCCCAGAAAGAAAATCTGCCACTGTTAGATAAGGTA
CCTGCCATATCGCGCGTAAACATTTTTGCGGAGAATATGAATGCACTAAA
TTGCTAGTTCATGTTTTCAGATCCTCGAAGAAAGAGTGTCCTTGTTTGAT
TACGAGCTGATTGTTGACGATGACGGGAAACGGCTGATAGCGTTTGGGAA
ATTTGCTGGTAGAGCTGGGCTGATCGACTTCTTACACGGTCTTGGACGGC
GTAAGAACACTGTCATTTCTATGACCTGACATTATTGTGCCTGTGATGCT
CCCATTTACTATCCGGACTCATAATCAAGGGCATTTTTATTTTCTTTCAC
AAGCAAAGCAACTCTTCATGTTGATTATGCATTCAGCTAAAGCTTTTTTC
TTGGAATTTTAGGATATTTGAGCCTTGGATACTCCACTCCTTTTCTCTCT
CTGGGGCAATCCCATATGTATCCTTCGCTCGCTGCGGCCAAGGCTGCAGT
CATTGCCATTGGTGAAGAGATAGCTACATTCGGACTTCCATCCGGAATTC
TTCCAATAGTATTTGTATTCACCGGATCTGGAAATGGTAATTCTAATGTT
AACTTTCTCGTTTATGTTTGTTGATTCTAATAATAGAAGGAACTTATACA
AGTAAAGTGCAAGGAATTAACATAGATGACAAAATAGGACCTAATAAAAA
AACATTGCCTTCACATTAACAAATCAAAATCTCAAGCTGTACTGGTAGGT
TATTGATAACAGCACATTGACGCCTCACATATATAACTTCATATGCCACA
GTTTCTCAGGGCGCACAAGAGATATTCAAGCTATTGCCCCATACCTTTGT
TGATGCTGAGAAACTTCCTGAGATTTCTGCGGTACTGCTCCTTATCTCTC
AGAAGTTTTACATTTTAAGTGTTTAAGTGAGTGAATGCTTTCGTGAGCTT
TTTGTCCTCATTGAAAGAAATGGATTTTCTGTAACTGCGGAATACATGTA
TTATCTATGCTAACTAACTTGGATTATTAATTGAGTGGTGATGGATGTGG
TGTGGTATTTTATATTATTTGCAGGTATAGTTTCTTAATGTAACAAAGTT
TGCTCTATTTCTCCAATTATACAGGGCAAGAGTCTGTCTCCACATTATCG
GTCAAGCAGGAGAGCATTCCAACTATATGGGTGTGTTGTCACATCTAGAG
ACATGGTTTCACCAAAGGATCCCAGCAGATGTTTTGATAAAGTAATCCAC
ATTTATTAAATCTATCAAATATAAGTTGATTTTTAGTGCATAATAAGGAA
TGCTCAAGTACAATTACATCGCGATATATCATTAGCTTGCACAAATCTCA
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TTGATTCGTTTGACTAATTTTCTGCACAGAGCTGTTAAAATGTTTTGCCT
GTCTGTTTACATTACATTGGTCCTGCCCTTCTATTACTAATCCTATTCAC
TGAGGCACTGGTGGTCTCTTTAAATTCTCTTAGTAAATTTGAAAGGAAGT
GTTAGGCATACACATATTCCACCTCTTTTGTTTTATTATACATATATCAT
TAGCATTTTCCTCACTTTTCAGTAGCCTAACTGTAAGAAATCTTAATTGA
CACTACATGTAGGCTGATTATTATGCTCATCCAGAACACTACAACCCTGT
ATTTCATGAAAGGATTGCTCCATATGCCTCTGCCATTGGTATGGTCTAGC
TCATTGCTTCCATTTTATATTGTTTGGTTTTGTACATTTCTGTATCTTGG
AAAAAAAATGTAAAACAAACCTCAGCCATAGGATCGTCACCATCTACTTA
CTAATCTAAATGGTGTGGTTCTGGGTTTCTGCAGTTAACTGTATGTACTG
GGAGAGGAGATTTCCACGGCTATTGAGCACAGATCAGCTACAACAGCTGA
TGAAGAACGGGTGCCCTTTGGTTGGCATCTGTGATATAACTTGTGACATT
GGAGGCTCCATAGAATTTGTGAACAAGAGTACATCAATAGAGAGGCCTTT
CTTCCGGTAACACATTCCCCCCTTTCTGCTGCATATTTTGTTTTGGATAT
TCATTACGGATGCATTTCATTGCCTGTTAATTATGGATAAGTAGAACCAT
CTCTAGTAAATGGTAGTATTAGTTATCCAACTCTCTTTCCCACCCCCCTT
CCCCTGTAATTGCAGTTTAGTTGTAACCCGGACTTTGTATTTCCGTTAAG
CAAGTAATGGAAAGGGGATTAGCCCGGTTGGGAAAAAACATCTGGTCATA
ATTGGTAGTTTTTTCTTCAGCAGTCAGCTTTTGACAAATTACTGGATATG
CAAATCTAGGTACGATCCTTTTACTAATTTATATCATGATGATATGGAAG
GCGATGGTGTGATCTGCTTAGCTGTTGACATTCTCCCTACAGAGTTTTCT
AAAGAGGTGAGAGATTTATAGTAAACAAATAAAGCTATTCTTGTTGAAGT
TCCAATTTGTTGCAACGAGATGACCCCTATTCTATTGTACAAAATACTCT
GTAGGCCTCCCAGCATTTTGGAGACATATTATCTAGATTTGTTACTAGCT
TGGCCTCAACTAAGGGATTGTTGGACCTACCGTCCCACTTGAGAAGAGCC
TGCATTGCATATACTGGCAAGCTCACTCCTCTGTACGAATATATTCCTCG
GATGAGAAAGACTATGATGTAAGTTTCAAATGTTTCTCATTGTCACCATC
ATAGTTCTTTGTCATAGTTTAGCAGGATATGCATTTCTGTTTGTTCCCTG
AATCCTTGAGATCCTAGAAAGTAAATTACAAAGGGAACTAAATATATAAT
ATTGTTAAAATATATGCTTCATGCTGAACAAGATATATAGTTCCAATCTG
ACATGATCCGCCTATCCTTCTCCCTAGCACATGTTGGAATATTTGTGAAA
ATTGTTACTCCCTCTGATCCATACAACTTTGTACTAAATTAACGACACTT
ATTATGGACCAGAGGGATTACTATTGTACTGTCTGTTAGAATGCAGCTCT
GTTTAATTGTTTGACATTACCACATATTTCCACTGATATTTGCTAGCTTC
GAGCATGTTTTACTTGTCATAGTGTTATTCTAAACATTGTGTTTTGTTTT
TCTGCAGAGAATTGCCACCAGCTCCAGCAAATTCATTTCCTGATAAGAAA
TACACCCACCTGGTTAGAAATATAATTTCCTGTTTGGTGTATTTTTTAAC
TAAATCTTACTGCTCTTATATACTGTATATAGATACAGTTTGGAATTTAT
GTATGCTCTATACTGAAACAATTTCTCAGTTGCTTTCTCTAAAAATTTGT
CGATTAATGGAACAGGTATCTCTCAGTGGCCACCTCTTTGATAAGTTCCT
CATAAATGAAGCTTTGGACATTATTGAAACAGCCGGAGGTTCTTTTCACT
TGGTTAAATGCGATGTTGGACAAAGCATTGACGATATGTCCTACTCAGAG
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CCAGTTAGAGCAATTATTTTTTTGCAAGCACACATCTAAATGGTGTAACA
ACGAGATGTTCCACCTTGTCAGTTATTATTATCACATAATTGGGAAAAGC
GTGGTTGTCAGGCCGAACCGGTAGTGATGCATGGTAACTGCAGATAAATA
TTTTATCCATTACCGAAGTAAATAATACGAAGAATCTGAGAAGGGATTTT
GTGCACATGGGCACCAGTGTGCTCCCTTCACTTTCAGATTTTTTTCAAAA
CCTCACACTTCTATGTCTCAAAAATTAATGACATTAACTATATAGATGGA
TATATACAGGAGGAGTGTATGCAAAAAAATCCCATTAAAAAAACTTTATA
TTTTGGGGAGATATAAAATAGACAAATTTCTGACAGTAAATACTAGTAAA
AATAGTATATCTTTTTGTTAGAAATTTGTCTTTTTTGTATTTCCCAAAAT
ACAACGTATTTTTTAACGGAACTTTTTGCGTACACTCCTCCTGTATATAT
CTATCTATATATTTAACGCCATAATTTTTGGAGACATAGAAATGTGTGGT
TTTGAAATTTTCAAAATTCTGACAGTGAATGGAGCACTGGTGCCCATATG
CCAAAGACACTTTCCGGAAGAATCCAAAGATGTCTAAAATCATCAAATGA
AAGAAGTTGGATCTGGTAGATCCTGGCCCACCATCACACATCCCTATCAC
GTTATCACCTCTCCAAATAAAAAACAAAAATAAGAAGGACACATCAGTAC
GTCTGTAGCAAAAGCAATCATTGAGTAGGTTATAAAGTTCAGACTCCAGT
CCCCTTAGCGTACCAGTCTGCCCAGCCTTCCACTTCGACTAGCTGGAACT
CTGGACTGCCATGAATCAGTATGTGCTCCCCTTCCTTTCCTCTTTCTTTT
AGAACTGTGCTTCTTTCAACGATTTTTGGGGATTGCTCTTTGTTGTGCTA
GTGTAGTATCTTGCTACCACAGCTCCTCTGGTGATTCAAGGAATAAACAG
AAGGGTTCTATTTCTGGGAGCATTCTTATTTCTTTTGACAATTATTCCTT
TGATTCTTAAGCATCCTTCTTGATGCGCATGGATTCCCCACCCCACCCCA
CTGTTCTGGATTTTGAAATATGTCAGCCATTTTACTAGTACGTAACATAT
TGAAATTGTTCCTTTTATTAAATCAGGAAATCTTCCTCAGAAAAAAATTC
AGGACCCTAAGTGCTCTGCTACATCATATAATACTACATGAATATTAAAT
CAGAAAATATACATGATTATTTTAACTTAAGCATCCCTCACCAATTAATG
CCCTTTATTTGATTTTTTTCTGAAACATCTGACACATTCCTTTTTACAGG
TAGGAGCACATGATACTGCTACACTAGACAAGATTATCGATTGCTTGACT
TCTATAGCCAACGCACATCGTGGAGATCCTAATGCCACTGAGATATCTCT
AAAGATAGGAAGAGTCAGCGAACGCGGACTTGATGACAGCATGGATAAAT
CAGGACCGAAGGTTTTAATTCTTGGAGCTGGACGAGTTTGTCGGCCAGCT
GCCGAGTTTCTAGCATCTTATAGAAACATCAACATCGACGGTGCTAATGA
CTATAACACTGACCAAGTTCATGTTATTGTGGCATCTCTGTATCAAAAAG
ATGCAGAGGAGGTGAGTCTCACAGTACACTGCGCTCCCTAGCTCTTATGC
AGACTTTATTTGGAAAGATTGTGTGTTGCTTTTACCATGTTTGTCGATAT
TAATAATCTGTAGAAAAATGACTATGCTGTCATTTTGGCCAACCTGAATA
TGACATTTGTAGAATTCAACCATTAATCCGTTACTTTTCTCGTGTCTTTG
TTTCTCTGCATGCAGACTATTGACGGAATAAAGAATGCAACAGCAGCTCA
GCTTGATGTTTCAGATATTGAAAGTCTTACAAATCTTGTTTCACAGGTAT
TTTAACTTTGATATTTAATTCCTCTAGCAAACAAGTACTAATTTTCATCA
CCGTGCCTTACAGTGAGGCAGTGAGCATAAGAGCCCAGACTCGTGTCTCA
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ATGTACCAACTTACATGTAGATTAAAACATAATGATCTGAGCTCTTTTTA
CAGGTTGAAGTTGTAGTTAGCCTGCTGCCTGCTAGTTTTCATGCTGCCAT
TGCAAGAGTGTGCATAGAGGTAGGCTTGAACCACTACTGGTGCTATATGG
AAATTCAATAATTTCTTCAGTTTATTGAGTTATGTTTCTCTATTATAGCT
CAAGAAGCACTTGGTCACAGCAAGCTATGTTGATGACTCCATGTCAAAGT
TGGAGCAAGCTGCAGAAGGAGCAGGTGTAACTATACTCTGCGAAATGGGC
CTTGATCCTGGCATAGGTACTTCCTAAATATAATGCCCAGCACATACATG
TAGATGGAAATGATTTTCTTCCATATTGTATGCCTGTTAATGATAATTAA
GGCATGGCTAAAAATTGTCACTGAGTAATGTGATGAACAAAATGTTCTTT
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GAAGGGAAAAATAAAGGCATTTACATCTTTTTGTGGTGGACTTCCATCCC
CAGCTGCCGCAAACAATCCACTGGCCTATAAGTTCAGGTAAATTCAACTA
CCTTTAGTTACTAGCAGCCTAACAAGGTCTCCCGTTCTGGAGCTTGTGAT
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TTCTGGTCTTTCTTAGTTGGAGTCCAGCAGGTGCCATCCGAGCTGGAAGA
AACCCTGCTGTCTACAAATTTCTTGGAGAGATCATCAATGTGGATGGTAA
GTTAGTCCCGTATCTCATCAATTGGCCACAGAAAAGGAGCACATTTCAAT
GGACTCTTTTACTGACGCAACCAAATTGTACCAAAGACAAACCTTACGGT
CCATCGGGTGGATTGCACCGTACCATTGCTATGACCACTAGACTTAGAAA
ATACAATAGCTGTGTCACTGACATGTAGCCCCATAGCCCCGCTTATCAGC
CTCACATGTGGTGTACTTTCTAATTTTTACATCTTCACAATGGCTCTGGG
CTAATTTTCTATAGGCATACATTAACTTTGTATATACACTGGACATATGA
AACAGTCGGCAATCTGGAACATAACTGAAACAGATAGACAATGATCCATT
CTGCGTGCAACTATCTACTGATATAGAAGTACATATAAATACGAGGAATA
GTGGTCTCTTCTTTTTTGGGGGGAATAAAGATTCGGTCATTACCTACCTT
ATATGTTGATATCATCTATTTACCACTTCCATAGGTAGCAAATTGTATGA
GTCAGCAGAGAGGCTCAGACTGCCGGAGCTTCCAGCTTTTGCTCTGGAAC
ACTTGCCAAATAGGAATTCCTTGATGTATGGAGACCTGTATGGGATCTCC
AAAGAAGCATCTACAGTATATAGGTCCACTCTTCGTTATGAAGGTAAGTG
TTGATGTATTTTTTTCCACTGGGTCTTTCTTATTGCAGTGAGTAATGTTT
TCGTTGCATTTGCACAGGATTTAGTGAGATCATGGCTATCCTGGCGAAAA
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CCAACATATAGAATGTTTCTCAATGAACTCCTTAATGCGAATAATTTCTC
CACATCTAACACAAAGGTAAACGGTGAAGAATCTGGAGGACATGATGATG
AACTGATTTCAAGGCTCATGATACTTGGGCATTGCAAAGAGAAGGAACTA
GCTGTCAAGATACTCAAAACCATCAAGTTAGTTCTGATCCCTATGCTTCG
TGACATTGTTTAGGAAATTCTTCTCTTCTATAAACTTCTTTAGATCATTC
TAATCACATCAATGGTGTATATGTAATGACTATCTTAAGATTATGTTAGG
AACAAGCAACATTGCTTCTGAAATTCTGTGTTAGAACTGACAAATCACAT
CACCGGTCTTACACCTGCTAGGTTCTTGGGACTGCATGAAGAGACAGAAA
TACCTAAGGACTGTTCAAGTGCACTCAGTGTTATTTCCCAACGAATGGAA
CAGAGAATGGCATATGGCAACGATGAGCAGGTGAGGCTTATTAACTTACA
TCTTTGTTCTATCCCATGTATTGCATATAGTTATGAAATTATTTGTACAA
CAAAACATATCACACAAGTAGTACTATCTTTTTTGGACTCTCTATGACCT
CTGTTTTCTTGTCAGAGAAAAAGAACCACAGAATGTTTGATAACAGGCAA
TATCTCAACACTAGCAATTTCATTTTCCACTTTCCACTTTTCACATAATC
AAGTGTGAATTTTGCATCACCAAATTTCACACATAAAAATAATACTCCCT
CCGACCCATATTAGTTGACTTAAATTTGTCTAGATTCGGGTGTATCTAGA
CATGTTTTAGATACATTCGAATCTAGATAAATCCAAGTCAACTAATATGG
GTCGGAGAGAGTACTACTGATGGCTTATAAGTGTTGTAGTAGATTGATAG
TTTAATGACCAAACCGTACGTCTACATTTCACATTGCCTTTCAGCACCAT
TTCTCACAAGCCATTTCCATCAGACTTGGAGAACAAGCTAAAAGGAACTG
GCTTACTTGGACCACCATATCTAGTGAGGCGCTAAATGCTCACTTTGTTC
TTCTCATAATTCAGGATATGGTACTGCTCCACCATGAAGTCGAGGTGGAG
TACCCGGACGGGCGACCCACAGAGAAGCACCAAGCGACACTGCTGGAGTT
CGGAAAATCCGAGAATGGCAGATCCACCACCGCCATGGCCCTCACCGTCG
GGGTACCGGCAGCGATAGGAGCCCTGGTACCGCACTTCAACCGCATCACT
CAGCATATACCTCCACCTGAACTAGAGCAAACATGTGTTAATTCATCCCT
ATCTATCTCGTGTTGCAGCTCTTGCTCCAGAACAAGATCAAAAGGAAAGG
GGTGATCCGGCCTCTGGAACCTGAGATCTACATCCCAGGTGAGTGCAGAA
GCAAATTATCTGTGGTGGTGCTTACCACTGATGTATGTATCCTATGTTTC
TGACTTCTGTTTTGTGGATATGAAGCGCTGGAGATCTTGGAAGCGTCTGG
CATCAAGCTGATGGAGAGAGTGGAGACTTGAGGATGTGATGAGAATCCAC
CTGGTATATATGCTGCAAGAGAGAGGCAATGAGTAAATAAAATGATGACT
AGTCGCTGTTCTAAGTAATGAACTGTATATGTCTATATGTGTATATATAT
CAATAAAATGCCGAATCAGTCGCTGATTGGTTCAGTTTGGGAACTTCCTC
CGTGCTGGCGATTTCTTGTTCGTGTAGTGTACAATTGCCAACCGGAGACC
GCAGCTTGGTCTTCTTCTTCTCCGGCGGCGGTCGCCGCCGCTTCTTGACG
GAGGCCGTGAGCATGCCGTTTTCCAAGCGCGAGGCGATGCCGTGCTCGTC
GGCGTCGTCCGGCTGGAGGAACCTCAGTCCAAGAAATGGGGAACGGGATA
GTAACCTGGATGCTGGGCTTGGGGAGGCCGAGGATGCCGGTCGTACTGAC
GCTTGCGCTATGGGGGTCTCCACGATGCCCGCCGACGCAATGGGGGCGCG
CCTGTTTATGGCCATTCTTTGCTTGGTCTGCCGCAAGCGCCGCCGCCGCA
GTTTCTTTCTCTTCAGGCGTGTGAGCCGTCGGTCAGATACAAGTGGCTCG
CAATTTTCTCGAAATATTAAGTGAATATACTAGAATGCAAAGGCTTCTCA
TACTATTTGAATTCTTGCAACAAAACCTATTTGGTTGCTTGATTTGCATG
ATTAAATTTTATGGAACTTTTCGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.