Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE011180

[Submit comment/correction]

Sequence	AE011180
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE011180
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAGAACCTCATGTGCTTATGTTTCGTCGTCCTACCTATCATAGTGGC TGTGTCTGGTGATGCCTGCGAGGGTGACAGACAAGACATGATTCGAGAGT GCGGCCAGTACCAGAAATGTCCAGCAGAGCCAAAGCTGGACCCGTCAAAT GCGTGTTGCGCCGTGTGGCAGAAAGCGGACATCCCTTGTCTATGTGCCGG TGTCACCAAGGAGAAAGAGAAGATGTGGTGTATGGACAAGGTCGCGTACG TTGCTAATTTCTGCAAGAAGCCTTTCTCGCATGGGTACAAGTGCGGAAGT AAGTGAAATCTAGTGTCGAGATGAGAATTTCATGCATACGGTTTTGATCT TAGTTATGATTTTTATATGCATATACGTGCTCTTCTAAACTAATGTTTGG TTTAATTTGAATGGTGTTTGCAGGCCACACATTTCTTTCTCTCGTGGAGT GATACAATTCAAGTCGTAGAAGGAGAAGCATCAAGTTCTAGTTTCTAGTG TATGTCATCACTAGAGCTCCCGTTACAAATTTGCAATCCACGAGGTTGTG CTTAGGATAGATTCTGTTCAGCACTCTGTATGGGAATAATTGTAAAAATA ATAAAGCCTTCTCCTCAAATTGTTTGATTTTTGTTTGTTCATATCATTTT TGAGTTCTACTTATGGATCGTGGTAGTGGTAAAAAAAGGGGCCTAAATAT TGGCTTGCTAAAAGAGACACATTTATGTGCTTTTTTGTTTAAAAAATTGC AACGACCGTCATCATTATATGTTTCGATGTCATTCACAATGCGTGAGCTT TTTTCATTCTCAACTGGAATTAAATTGTTACCAACCAATAGAATGTATGT ACATGTGACGCAAGATTTCATCAACACCATGCAACAACTAGAGTTATTCC TTTCATCCTAAAATAGATGGTGTATATTGTGTAGTATGATAATTAACTGG ACCAATATTGAACAATAATGTTTTCTAAGATTGACCAAATATATTGAGGC AGGGACGGTCCTGAGAGCTCGGGCCCCCGGGGCGATACTAGAATATGAGG GCCCTTAAAATATAAGCGTAGAGTTTTGGCTCTAGAGCATATGCTATCAA GATGAACTATAAAATCAACTAAAATTAGAAAACAAAATTCAAAATGACTG AATTTCTCTGTATTTTTTGCTAGTGGCTCAGTGCCTTCTATGTTAATGAA AATTAGCATGCAAAAGTGACACTTTTGTTACACTAAGAAAAAATTAAAGT GTAATGATCTAAACAAGCAAAATATTATTGTTTTGAAAATGGGCATCTTG GCCTCTACATTGATTCATGCATATGGCCTCTTATTAAGAAGAAAAATATT TGACATTCAACTTCTTTTAGTACATGTCATAATATATGTGTTTCCAATTG AAATTCTGCAAAGACCAAGCGACAGGAATATCAGCACGTCTATATTTTTC AGTAACTGCTTCTAGGAGCCAGGTTGTATCCGATAATTCATGCATATTAC CGCAAAGATACAAAGCTACTAGCCCACCAGATTGATTCGGAAAAATCTTA TTAATTACCCCGTCCATCTCGTGCATCACACATCCCAATAACAATTCTAC CCAAATAATGGCCATTAAATTGGGGTCTTGTTTCGGGATGTTCCCCTCGC CTCCAAACTTCTGAAACTGAAAATAGTAGGACGGCCAACATTAGCCGATA CCCCTTCAGTTTGGAATCATGAATTGATATCGGCCAATCTTGGTCGTCCT TGTCTTTTTAGTTTAATATAAGTTTGGGGGAGAGGGGACACTGAAGTACA CCTCGTCAGATTGATGGTCGGGTCAGAGTAGTCCTCTTGCAACGACGAGA CTCAAGTTTTATGGTATAGGCGAGAAAAGTAGAGACGACGGACCTCATCT TAGTTCTTTGGAATCAGGCGTCGTGGTGGCCGGTCTGGTAGTCTTCTCTC AGACCTTGGTGATACGGGCAATATGTGTGCGCCTAGGGCAACCCAAGGTC GGGCGACCGGTGTTCGACTGAAGAAATTAGCGATCAGGACTCCGGCGAAG TGGGAACTGGAGCATGTCTTGCCGATATGACAATGGACTACATAGAACAA TCTCGTAACACACATGCCCCAATGGGTGATTTCCTCTCCGCGTGGGCTGA TGGATGTGGACTGGGTGCATTTTGATCTGTTTTCCTTTCGTTGTCCGCTG TGAAACTGCGCTGACTGGTGTAAACTTTGAAAAACCGGGCCAGGCCAAAC TAGACCGGTATGCAAAGAAGACATACCTGGGGCCCCTAGTTTTCATGGGC CCGGGGCGGCGGCCCCTCTGGCCCTGCCCAGGGACGGGCCTGTATTGAGG GAAATAGCAGCAACTATTTTTCTTTTTGCGAAACTTTCATGATCTATTAA TAATCATCAATATTAGTACAAAGAGATCTAAAAGAAATAAAAATGACAAA TAGTTCCTCGGATCTCCTAGCGACGACTATAGACACTAACACGAGCCAAA GGATGTGATCCAGATAGTGGATGAACCGGGACAATGTGATGGATAGACGC ATGTTTCTTCTTCTTCGAGTCTGTGATTGATAGATGCAAACTTCTTCTTT GAGTCCTGAATCGAGACAGATGGGCCTTCAATCGAGGCAGATGGACCACG CATGCACGCAGATCGCCTGCCATCCCTTCCCACTTCGCTGCTGACCTCGC TCACCTCCGAATCTTGAGAAGCTAGCACCGCCGGAGAAAAATCCGAGGTG ACAACAAACCTAGCGTACTGGGTCACGTTTCGGCCACCGAATCCTACCGT ACCCCACCTCGTTCCCGAACGTGATTCCAGGTCAATGTTCCCGAGTCAGG CACCGTTCCCCGTTTCTAGCTATGGTCCCAACCAACTATGCCCGATTCAT ATCCTCGCGAAGGATTTTTGTATTCACCCAGCCTAAAACAAGTTACTTAT TTCAGGACGGAGGAAGACGGAGGAAGTATAAGTTTTGGCTATACTTCGTT ACTCACATGCTGACACACTCTGGAAACACTTGTGTTTTCGCTAAACGAAG GCAGCAGTACAACGGTTATTCAACTTCCGCTATGATTGTAGACGAATTCA GGCAATGGTTGTGTAGCAGGAGCTGGTGTTTTGGAGTTCGGTGTGATTTA CGTACTACCTTCGATCTTAATAAGTGTCACCGATTTAGTAGAAAGTTGTA CTAAATCAAAGTCACTAATCTTTTTTGTTGCTTTGGTGAGTGCTCTACCT AATTGTTTGCGAGGACTGCATGATCATGTAAGTTTTCTCTAAACAAAAAT GATGGGCAGGCAGAACCAGGATGATGTAGATGGCGCAGGACGTCAAGACT ATCCTGACCACGCGCCTCGATCGCTCGATGTTCTAATTAAGCCTCCCAGG CAGAACCAGGATGATGTATCTGGTTTACGGAAAGTATTTTTTGCCTCCCA GAGCTCCACTGCTCCTTTTATTTTTTTTTCAAAATTTTAAAAATCGTAAT TACAAGTTTTTTTTAAAAAAATTCTTGGCATAGTCGATGTGTATCCTACC GCTACGAGCTTGCAAAATGGTAACCCGACGTTCTTTATAATATGGGCTAT AAAAATGACAAAGTCTCTGAGAAAATCTGGAGATTTGAAAATATATCTAC CCAGATCCACACTCTTGTCAATTTTGTGTAGCTCATAATGCAAAATATTC GAAATTGAGCAAGTTTGTGGGATACATAGTTGGTCACGTCCGATGTTCTT TTATTTATTGTTAAACTTTGAAATATGATTTTCAATTTATTTAAAAGAAC ATATCACTGATATCTATGTGAACAAAATCTCAACTCTATGGTTTAGGCCT CTTCGGGCCACTCTGGTTTAGGCCTTCTTTGAGCCTATAAGCCGGAAGCA CAAAGCCTCTCATGACGGAGAAGTAATTTGGGGACCAGCTCAGCTCCTTC GGGAACTAGTTTTGCCCGTTAAAGTTGGGCATGTCTGATAGCTTGCAGAA CATTTGGGCAGGTCCACAGGCGACGAAAACGAATTGATTGGTTGTTTATA TCCTCTCCATGTTGTGCCCTGTACACGATCTACAAAGCAGCCCACATCTA GGCCCGCGTACAACATTTGATTAAGGCGTTTCTAGCCGACCAAGCTCCGT CGCTGCAACTGGTACGAGCGGATAAAGTGACGTTAGTTTCTCTCTCCCTA AACATTGGCTCATCTCTAACCACTTCTAATTAGCACACACATGTTACGAT TTAAAACAATCTTTACATAAAAAAATATGCACGTCGAGATGGGCTGGGTT TCCATCCAAACCATAGCACCGAATTTCGTGAACTGCATCTTGTCAACATC GTGCTCATGTTTGGAGCTTTTTTACACAAATTTTGTCTAATTCGTCGCAC ATACTAAATCGTTCGACATTTCCTTTTAGGAGTAGTTTGACCTCCCTTTT CCGCACAATTCTTGTGTTATAAGTTTATGTCGACATAGACGTATTCAACC TATACGTGATGAATCTTTCTGTCTCCTCTCTTAGAGTGCTTCCTCCCTAA CCCCTTCTAATTAGCACAACTATGCATAGATTCAAATAAACTCCACATGG AAAAGATGCACGTCAATGATGGGGTTTCATTCTGACTATCGGTACCGAGT TTGTTAACTGTATCTTCTCAAATTCATGTCCATGTTTAGAGATTTTTTAG ATAAATTTCGTTTGATTTATCGCACGCAATTGGCCATTCGAAACATATTT TTAGCATTAGCTTCAACTCGCCGTTTCGCACAGCTCTCGTGTTACAAGTT TTTCGTTTTGATGGAGTAGAGTGTATTTATGTGTACCTGCTAATGACTGT TTACATATGTCTGTTAATGATTGTTCATGTGACAATCAAATCGAGTACTG ACAACCAAATAGTGGGCATCTATTTCTATCCTCATGCAAGAAAATCACAT GCATGCAACCAATCTACATGCACGACATGACTTTTCACGTTTTCTGGTGG ACATGCTGCTTGGGCACTACTCGAGGGAGATGAAAACCGCATGTAGTCTA CCAAACGCGCCTATTGTAGCCTCGCGTCTTGATGACCAAAAGACCATATG AAGTCCCATATGCCATGAAGAGCATTTCTGCCCTGACTTTTGAACCCGAA TATGGGTTTGTCGGGACCAACCGTGAGTCCTCATGTTTACTGAACATGTA GGGATGCAAGCCGGCAATCCCCAAAACAAATTTTGTCAAAGGGAAGTCTA CTTAGTGTTATTTCTCTCTTGATATTAACATGAGGCTGACTTCGGATATG CTTATGACTCTCTCTTGACATTAATATAATGACTTTGGATATGCTTATGT GTCTACTTTTGCGGGGTCCCTCTTGCATCCCTATGACCATGGCACCGACA TCAGATTCCCCGTACACCTCATCGGTGCTCATATGGATACACTTCGTGTT CTTGGCTTGCATGTAGGCATCGAGGAGGACGTGAGTGTAACACAAATTGT TCTTGGTGAATGCGAAGGAACCGCCAAAGGATTTATCAATGTGATTCTAC GTTGTGAAGTGCACGACGGTGTCGATCGACTCGTCCATGAGTAGCTAGTG CATTATTAGGCCGGGGCTCACGATGTCTCCTTCGACGGACTTGAAAATTG GCAAGCATGAATAAGGCTTGAGATTTTTGAGGATGGATCAGTAGTCCGCC TTGTCCATGACAAGGATGTTATAGCGAGGGTAGTTGGCAACAAGAGAGTT GCCGCATGGGACATGATGAAGACCACGACGCTGGTGATGAGGATGTTCTA GGACTCATAGGTTTTCATCTATATCTTTGTTTGCTTTTGATTTGCCTGCA AAAGTTCTCCAACCTTCAGGTACTTGTAAAATGATTGAATAATGAGTAAA TTATTCCCACATGGTTTGTGTTTTGTCAATATTAACCAGTACTACGTATA AGATGTTATTATAAAAAATATATTGTGCCATCGAATACCATTGTGTTACA GTTAAGCATAATGGAGTGAGTACTAGGAAAGCAAGGAGAACCAATTTTAG TATATTATTAGTACCATCGATTTTTTTCCTTCAGACCTACATGTCGAAAA TAATTTGGGGTGCGGCATACACTAGGGTCCATCTTACCACAAACAACACA CATGGCAATTGTGTAATGTCATTTGCTATATCAGTAATGATGAATGGACC ATCCATCTTCAAAGAAATGTAATTACTTCTACCAGCATGCATATACATGA ATAATGTAAGAATCTAAATGAGAAATTAATCTCATGTCATTGCATGTTCT CAACTTTTCTCAATATTACTATTTATTATCTATCCTCAAATGTGGGTGCA AGATGTGGATCAGTAGTCTGTCTTGTCCATGACTAGGATGTCCTAGCGAG GGGAGTTGGCAAGAAGAGAGTTCGCCGCATGAGACATGATGAAGACACGA CGCCGGTGATGAGGATGTTCTTGGACTCGTAGGTTTTCATCTATACCTTT TTTTGCTTTTGATTTGCCTGCAAAAGTTCTTCGACCTTCAGGTACTTGTA AAATGATTGAATAATGAGTAAATTATTCCCACATGGTTTGTGTTTTGTCA ATGTTAACCAGTACTACGTATAAGATGTTATTGTAATAAAAATATATTGT GCCATCGAATACCATCGTGTTACAATTAAGTATAACGGAGTGAGTACTAG GAAAGCAAGGAGAACCACTTTTAGTATATTATTAGTACCATCGATTTTTT TCCTTCGGACCTACGTGTCAAAAATAATTTGGGGTACTGCATACACTGGG GCCCATCTTACCACAAACCACACACTTGGAAATTGTGTAATCTCATTTGC TATATCATTAATGATGAATGGGCCATCCAACTTCAAAGAAAAGTAATTAC TGCTGCCAGCATGCATATACATGATTACTCTAAGAATCTAACTGAGAAAT TAATGTTATGTCACCGCGTGTGCAGTAGGAAATGTGTGAAAGCTCATTTT TTCTCGATCTTAGTATTTATTATCTATCCTCAAATGTGGGTGCAAGATGT GTATTCTATGGATACACCAATGTATGCATCCAATTTCATAGGTAGTGTCA TTTCCTTACATGGCTCGGGGCATGTTTTCAGAATAATATGTAATGTTTGG ACGTGTAGATATTGTTTGATATGGTTCCATATCTTCGAGATATGCAACTA ATATATGCATCCAATTAGTCAGACATATCATTAAGATATACAACTACTAT ATTCATATGTAGATATGCAATTGATGTATGACCGTGCTTATGTTTTTGTT TGTGCATATATTGATTGAAGTAGTGCCAAATTAAAAAGATATACAACTAA TATATTCATGTAAATATGCAACTGATGTATGACAGGTGCTTATGTTGTTT TATGCGCATATATTATTTGGTGTCGTGCCATATCTTCAAGATATACAGTA TGCATTCAATTAATCACACATCTAATCTATATATACAATTAATATATGCA TGTAACTATGAATCTAATGTATGGTTGTGCTTATGTTGTTCTATGTGCAT ATATTGTTTGTCGTGGTGCTGTATCTTCAAGATATAATGTCTAGTTATTG CGACATTCTATCAAGATATACAATTAATACATGCCATCAAGATATGCACT TGAACATAGTGCCATATCTTCAAGATATACAACTGACATTAGCGTCCGGT TTTTTGTGTGGGTAGACATAAGCATCCAGTTTGTCATACATATCATCATG TCTGCACATAAGGCTATATAAACTCAACCAGACCAAACAAATCGTGTGCC TCACATATTCACATAGAACGACACAACTCTTCTGAACTGATCCAATACAT CATCTGATAGAGAGAAGGAAAATACTTACCTAGTTAACAAAGCAGATACA CAAATATAGCCATGAAGTACCTCATGTTCTTATGTTTCGTCCTCCTATCT ATCATAGTGGCTGTGTCTGGTGATGCCTGCGAGAGTGACCGGCAAGACAT GATCCGCGAGTGTGGCCAATACCAGAAATGTCCAGCAGAGCCAAAGCTGG ACCCGTCAAATGCGTGTTGCGCCGTGTGGCAGAAAGCGGACATCCCTTGT CTATGTGCCGGTGTCACCAAGGAGAAAGAGAAGATGTGGTGTATGGACAA GGTCGCGTACGTTGCTAATTTCTGCAAGAAGCCTTTCTCGCATGGGTACA AGTGCGGAAGTAAGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.