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GrainGenes Sequence Report: AE008117

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Sequence
AE008117
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE008117
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTCCCCCCTCTATTTTCCCTTCCGCACACGGACACACACGAGCGTCGCG
TTGGGCAGACACACAGAGACTGTGACATGTCGGCGGCTAGCTGGAGCATT
CCGGCGATCCCGCGCGCCGTCCCGCCGGCCAGGGGCGGGACGCCCGGGGA
GGCCTTCCTCGTGGCCGCGCGTCCGCGGGCGGGCCGGTGCCGCGCCGCTC
CGAGAAGAGTGAGGCTCGGCCGAGCTGGCGGCGTCGTCGTGGCCCGCGCC
GGCGCGGCGGAGGTCCCGGTGGCTGACTCCGGGGAGTCCGCCGTGGTCTT
CTCCCAGAAGTTCCCCTTGCGTCGATGCCAAAACGTAACTTGTTCTATGT
CCCGTTTTATGGATTCTGCTATGGCTCTGCCTTTCTTTTTTCCCTTGTTG
TGGACGGCGATGAATTTGATCTTGTGGTGTGTCCAGGTGGAAGGGAAGGC
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TGCATGATGGTGCGCGAGCGATATGTATTCTTGGTTCCTTTAGTGTTTTT
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AATTAGACCTCCTGGTTCAGTTCCAATCAAGGTTGTTCTGATCTTGTGAA
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TTGTCTGTGTGACACTAACTTGCTAGGAACCTTTTTCTTATTTATCCTTG
AGCTATAATACCATAATCTAGGATTCCAATTGCTGAAGAATATTTGAAAC
TTTCAGGACTCTGCAATTGAAACACCACTGGAGATTTCACACAATTCAGA
AGGACGGATGCTTCATGAAGTGCAAATCAAATTTGATAAGGACACTCCTA
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AAGTATCGTAGATTTGTCTAGGTATGCATGTACCTAGACGTGTTTTAGTG
TGTAAATACATGTGTATCTAGACAAATCTGTGGCAATTATTTCCGATTGG
AGGGACTTTTTCTTAACTTACTATACTATATAAAAAATCTCACTATAAAT
ATAGGACTCCCCAATTCATTTCCAATTAAAACTGTCGCTGAAGGGAGGGT
GTCTATTGGAAAGTTTTGTGTGCATTCTCCAGTTGTCAGTATATCGTGTA
CCAGACATTGTATGTGTGCATAATAAAGGCAATACGAAACATATGTCTCA
TCTGGGCTGAATGTTTTGATTGATCAGTATGTTAAGTTCTACGCATTGCT
CCGGCTCTTTTCAGCTTTAGGGTTTATTCAGGTTCCAGTTTTAATGTATC
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TCTCAGATGCCAATTACTTTCTCTTAGATTATTTCTACTATAGTGCATTA
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CTTCAGTGGAAATACTTGATACCATTGTGTGATATGCACTTATTTTGGCA
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AGATTTGAAACACATCCATTGGTTATCCTTGCCCACTATGATGAACCACA
CAGGTTTGGTGATGAGTTTGTCATCCCGGGAGCAGAGTTCGCTCCTCCTG
GGGGCAGCGCAATGGAAGATGACAAACACATCAGTGGATGAAGGAGGAAG
CAGTGGTGACAAAGACAAGACCCTTGCCCCTCACCTTGGTGATATGATAC
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GCTCCCCTATCCTAGATTCTCAAATTTTTGCTCATCTAAAGGATGGCGGC
CCAAAATCAAACCCCTATATTTAACTCCTCAAATCTTTTTGAGCTCAATT
TTCAAACATCTCTCATATACATATCAAACTATTTCATGGAATATGATCAA
TCATTAAAGTGACTTAAATTCATCAACTAACAATTACTTAGCAATACGTT
ACAAATAGTTCAAAATCTCGAGCACTCCAAATTCAAACATGCATATAGAT
CATCCAAAAAGGCACCACATAGACCAAGTTTGATCCAAAAGCACAACATA
GCATGTTAATATTTTGTGGACATCACCACCTCAAACACCACCATCTCTTC
ATCCTCATTGTAGTTTTGTGTCCTTTTATTCTTGACCGAGGATTGTGAGG
TTTGTGCTGCCACCTCCTCCTCTTCGACCACCTCCTCCTATTCATCATAG
ATGAGATCATTGAGCCCCTCCACATGTGACGAATCCAATTGAGACATGAA
TTCGGCGATGCCAATCTCGGTCACACTCGGTTGCAGCTGGCCGGCCATTT
CATCGAGCACATCGCGGTCGGGGTCTCGGCCGCGAGCTGCGACGGCCGCG
CGCATAACTGGCCTGGGCGTGGAGGCGGCCTTGCGAGCTTCCGTAGGCAT
GGTTTTTAAGGCGTCCGCTTTAGGACGCCTAGGCGACGCTTAGGCGTCAA
GGCGCCCACCCTCCGCTTTGCAAAAACGACCGCTTTAGGCACCTAGGCGT
CCAAAGCGCCCGCTAAGCGCCCCCAGATCACCTTAAGACGCCTTAACGCC
TTAAAAACCATGGCCGTAGGCGAAGGAGACGTCGTGGTCGACGCCGCGTC
CTTCCTCTTCTTCTTTTTGGCCGTCGCCTCGGCGAGAGCTTTCATGGCCT
CCGTCGGCTTCCGCGCCCACGGGCCGCTCAACACTGGCCCAAGGGGTGGC
CGGCCCACCTTCGCCGCCATTGCTGAGGACTTGCCGGACTTACCATCGGC
CTTGGACGATGCTCCCGTCGCCCGCACCATGCCAGTGTTGCCTAACTGCT
TCCGCGGCATGGGAGGCGTCGTGGGGGTCGATTCCGGCGGTGGCGCGTCG
GCGGGAAACTCCATCGGGATTGCAGAATCGCCGTCTGGTCCTATTCCGTC
CGTGGTAGGGGTGAATGTTGGTGCTAGCAGAGAGGGGCCGCTTGTCCCCC
CCTACACCGATTGCCCTAGGCGTGCAAGATTGGGCGGGAGAGTGGGGCGG
GTTGGCAGGAGAAAGTAGAGGGGATATTTTTGCTCAGCCGTTTGGCCTCC
GAGCAAATATGAGAGAGTGGAGGCCGAATTTAGGGGGAGCTCTCAATTTT
TTGCTCATCTAAAGCCGACAGGAGTTCGGCTAGGTGTGATTTAGATGCCT
AGGCGAATGTTTTGCTCATCTAAAGGATTTTAGGAGTTCAGCTAGAGATG
CTCTTAGGACTAGAACTTATTGTATTGCACAGCCCAAAGGGACAAGGACA
ACACTGCAACCCAAACGGTAGACCAATAGGAAAGAGCTATAATACCCTCC
CCCCTTCGTTCATGGCAAAAACATATTTCTGGAAGTATGGTTCAGCACAC
ATGGGAAAAATGAACTCCCATGTTTGCCATCTTAATTATTCTCTGTCAGT
ATAGAACATTATCATATTGCAATGGACTTTCACTTGCATAAACCAAGTAA
ATCTTCTTTTGAGAAACCATAGTTGCAAGCAACTGCCATAAATCTGCCAT
TGTTGTCTTTGTGGATGAGTTTTACTTTTGTCCTCGAGTAAATTACTGTT
TTGCAGTAGTCAGTACCATCCTCAGAGAACATGGTATTTTTTTGATCGAA
TAATTACACGGCATTGGCTTTTAAAAGCAGAAGAATCTGACTTCTTGGGG
CCTCAGTGAAAACTATCTAACATATTGAATTCTCTTTTGTCTTAGGAGAT
AAACCTGAAGGATCAAATGCTCAGCCAAAAGAAACTGTATCTGAGGATAA
AGGTCCAAACAGAAAATGTATTTCACAGTTCTATGGGGAATATCCCATAT
TGAAACCAGAGTATGTTGAGAATTCTGTATCTGTTACTGTGATGGAAAAC
AGTGAGACAGATAAAAGTCGCGTGGAATTTGATACTGACATTACTGGCGA
TGTTATCATTCATTGGGGAGTTTGCAAAGGAAATACGATGACTTGGGAGA
TCCCATCAGAACCACATCCACCAAAAACCAAGATCTTCCGAAAGAAAGCT
CTGCAGACCTTGCTAGAGGTAAGGAGATAACCTTGAGCCCTTGGTAGATG
GAGATATGAAATTGGACTGTGTTAATCAAACATGCAGAATAACCTTGAGC
CCTTGGTAGATGGAGAGATGAAATTGGACTGTGTTAATCAAACATGCAGA
ATATACTCTTGAGCTTTTATCTGTAATAACTGGCATGCAAAGGAGTAAAA
TCACATAATGCCACTTCTATATTATTTTCTGATTCACCTATACACTGAAA
CTGGACATTACCACTTGCACTTTGCGAATTATATGGACTAGAATTCACCA
CCCCACCATATATTGAACAGGTAAATTATGGAGGGTGCTTACTGTAGACT
ATCCATATGATAAAACTAACAATTTCTAAATGCATGAAATTTTGTATGTA
GTGTGGTATCATTCACTTTTCCATAAACTGCGTTTACTCTTCAAAATTTT
CTGCAAATAAATTTTTTGATGTCCTTGCAAGATATTGCCCTGCAATATTA
TTTGTTTGCTAAGAGGGATACTTTGTTTTATCGTGACCCTTTTACTAGGA
AAATTGTACAAAGCTAGTTCAGGTATTTTAGATCTCTAGAAATTTTGGAA
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TGGCGGAGTCTTTTTTTTTGTCTCCTTTTTTTTGCTATGTGCATCCTTAA
TGTCTCGACTAGCTCTTGACATTATGTTGTTGCAGAGGCTGGGTGTTATT
GGTATCAACTTGATATTAATATATTCCCTTTATCGAAAATGAATGGATTA
CCTTGATTTTTGGGTGAGAAATGTTCTGCAGAACCATGGAGCTGAGGCTT
CACTTCTGCACCGTTGGATGATTCCTTGGGATATGGGCCACCAAAGCCAG
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ACATCCTTTGAGGCCAAAACGGCACGGAGAGTGGCAAGACGTGCCTTTGT
TGTGGCGTGGGTCAGCGGTAACCCATGATACGGGCTCGATTGGTGCTAAC
CGTAGCAGGCTAGCAGTGGCGGAGAAGCAATGACGAAAGCTCCTCCTGTT
CCATCGTCCCATCGAAGGAGGTGAAACGCGTACTAGAGTATATCTGATTT
TCATGAAAGTTTTGCAGAACTTGAACAAAAACTTGTCCCATTGCAATTTC
ACTTTTTGTTCGGTGTTGACCTATTATTTCCTCGAACCAACGGATTTTCT
GGACTTTGTTAAACCCACTGTCAACTAAAAATATATCTTCAATGCACACA
TAAGCACGATTTTGTTGTCTTGATATGACAATATGTGCTCTGGGAGCCCT
ACCATTTTTTGTATCTTTTTCCCCATCCAGTAACCTTAGGTTCCCGAAAA
ATCAGTTAACTATTCCTATGCACACATCTTCCTCATGCTGCAGCAAAAAA
CTGATGGAACAGGCAACGCTATATCATTCCTACTGAATGCTGACTACTCT
GGTCTTGTTTTCGTGCTCAAACTTAATGAGGATACTTGGTTGAGAAATGT
GGAAAACGGTTTTGATTTCTATATTCCTCTTACGAGAGTGGACCAAATTG
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TCTTTGCAAACCGATGGCCTGATCAGTGATATACGAAATCTGGTGGTTGG
TCTATCATCTAGAAGAGGTCAACGGACAAAGAATAAAGTTCTGCAAGAAG
ATATCCTGCAAGAAATCGAGAGGCTAGCAGCTGAAGCGTACAGCATTTTT
AGGAGCCCCACTATTGATACTGCAGAAGACTCTGTTTACATCGATGACAC
AGAAAGTGTAAAGCCAGCTTGTTCTGGCACTGGATCTGGATTTGAAATAT
TGTGCCAAGGATTTAACTGGGAGTCGCATAAGTCAGGAAAATGGTATGTT
GAACTTGGTTCAAAAGCCAAGGAGTTGTCATCCCTGGGTTTTACCATTGT
CTGGTCACCACCACCGACTGATTCTGTATCACCTGAAGGATACATGCCAA
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TATTCATTAAACTATCACCTTATTTTGTTTAATCTATTTATGTTATGTGT
CATAGTATTTCCTTTGCTGGTCCGTTATAAATGATGTCAGTCCATAAATG
TGCTAACTAGTACTGGCTTAGCTATTTGAGCTTGAAAACAAGTAAACTTG
ATTAACAAATCTTGCATGCGAAATGTCTCAGCGTAATTTTGTGCAAGACG
CAAAAAAAAATTATGCTAGCAGTTATCCGTGAGATATGGCATCTTCAAGT
TGTATATTCTTTATCATGTAAGGCCTTTCTGAACTTTGCTAGTAAGTACA
ACAATTATGGCTGTTGATCTCTTATATGTGCACTAAATATTTGAGACCTT
ATTTCCTTCCAAGGTAAATGCAAGCACTGCCATGATACTGTTTCCTACAT
GAATTGTTCATTCTGTTGGTCATGAAATAGAAAATTGGCAAACAAATGTC
TCATCATGTACCCATCTGAGTTATTTGTGATTTTTCTTCTGTAATCTTGT
GCCTGTTAGTGCTCAGTTGTGTATTAGATAACTGATGGGGTACTGTAGTA
AATGCTTTGATTCGTGTATATTTATTGTTCTGAATATCTTTCTACTGTCA
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ATCCCAACCTCATCATGTGAGCTGATGCTAAACATTACCATGATACCATC
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CGTATGAACTGGGATGACCGAGCGGTCGTTGCTGATGATCCACATTTCCA
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TTATTTCGGTCTTCCCTTGCCTTGTTCCACTATACTTTATAATGAAAACA
CATAGGAATGGGTTACATCATTCCTCCTCACAGACAATAATTTATTTCAC
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ATAAAGAACTTCATGGACCTTGACCTGTGTTCTAAAATAAAATAAAATAA
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TTATGTCTGTTCGTGTTGAAACCTTTATGTTGTAGGGAAGAGGAAACAAG
AGCAGTGGAGATAACTTCCACGCTGCACCAAACATTGATCACTCACAAGA
TTTTGTGAGAAATGATCTTAAAGAATGGCTTTGCTGGATGAGGTCTGTTG
TCCTTACATTTCTTGGCAACATCTCCTACTCCCTCTGTCCCAAAATAAGT
GACTTGAGTTTGTCTAGATTCGCATGTATCTAATACTAAAACGTGTCTAG
ATACATACGAATCTAGACAAAGCCAAGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGA
GTATATTTTTTTCATGATTAACTGTCTGTTAATGTATCGGATGTTCAAAT
GTTATTATAGTGCAGAATCCACATAGAACAAATTTATAGACTCCGTACAT
GCATTATTTACATGTCTAATTTGCAGCTGTTAGTTATTGCACTTGTACCC
TCAACTCTGATGACGTCAGTTAATTGGTCTGGAGACTGTGCGAGCACAAC
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ACAATGTTCATATAAATAGTGCTTCATATGACCACTACCTAGTAAGGCTC
GCTTCATTGAAATAAGAAAGAAGAAAACTCAATATGGCCCGATACATGAC
CCAGAGAAGACATTCAAGGATAACTTCCAAGCTCATTTAGCTCACTTAGT
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AAAAACTTTTACTATTAAATCTTTTTTAAATATATGTATTGACTTTTTTT
CTTGAAAAGTAAGTTCGTACTACTATATTTTTGTTGGATTTATAAGTCTT
GGAGAGTGTTGATGTCTAAAGCAACAATGTTTAGAGAACTAGAGTATATT
GCAGTCTGCTTAGCTCCTACAAAAAATTAGAATAGATGATCTGGGACCCT
GCAAGAAATTAGAATAAATGATATGGAGCACTGCTTTGGAGTTTAGACTG
CAAATTCTCAACAGTTTATGGTAGGGAGAGGTTTATGATCAAAGAAAGGG
TTGAAGTTCTGAGGGACAACACTTTTTTTTTTAAACCGCACCCCCCAGAT
AGAAAATCAATCTGTAGAGCAGTTCTGGATGTATTGCTGTTGCCCTGCAG
ACTTTGAAATGATTGATCTTCTTGTAATTTTGTTGTGATTCCTTGTTGAT
GAAAGTCCCAGGTTTCCCTACAAGTTTAAATAGGCAAAAAATAATAAAGT
TATTACAGAAGTTTTCTCTCAATTGGAATACAGAAAATTATTTGTTGAAT
GGGCAGCATATTATTAGGAAACACTATCTGTTTGTTCCCACTACTCCAGT
ATGGGGGCACTAGCTGACGAGTCTTAACGTGGTTGGTAAATTTTCCATTA
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AATATCAGTATCACATTTTTATTCATAGTTTTTTTTCTCGAATTGCAGAA
AGGAAGTTGGATATGATGGATGGAGACTTGATTTTGTTCGTGGATTTTGG
GGTGGATATGTCAAAGACTACTTGGAAGCAAGTGAACCATACTTTGCAGT
AGGAGAGTACTGGGACTCTCTCAGTTATACTTATGGTGAAATGGATTATA
ATCAAGATGCTCACAGGCAGAGAATTGTTGACTGGATAAATGCTACAAAT
GGAACTGCTGGTGCATTTGATGTGACCACTAAAGGAATACTTCATATGGT
TAGATTCCACGGAAATTTATTAAAATCTTACCATGTTGCTTATCGATGGT
TTTGTTAACTTTGGTTGTCATATGCATCATGAAGCATTGCATGACTGCTT
GGTTGAATTATGTCTTGCTATTTTCTCAATGTTACAGGAGGATCTTGTAA
CATTATGAATTGATAATCGATTATTTTCCCTACAATCAGCTGTCAAATTT
TTGTGTGATATGAAGATGCAAAACCATCATGATCTCAATTAATTAAACTT
GCATTGTGCATAGTTTTTCCATTCCATTAATTATGATACATCTGTTGTGA
AGTGATTTCCTGATGAGATTTATCTTATAAAAGAGTTTAATCATCGTCTT
ACCCATTGTTTGTTTGTTTACCGGACGAACTTATGTACTCCTTTCCTACC
TTTTCTTCTACCAACTGTTTCCGCACCTGTGATATGGAATTTTCTTCTGT
TGCACAGGCACTGGAAAGATCTGAGTACTGGCGCTTGTCTGATGAAAAAG
GAAAACCGCCTGGAGTATTGGGTTGGTGGCCTTCACGTGCAGTCACATTT
ATAGAAAATCATGACACCGGTTCCACTCAGGTACCCGTACTCTCTAGATA
CATGAATTGTTTTGTCATGGACATGGTCCCAGCCAGTTTAGCATGTGCCA
CAATGTTAGCCATATCCCCCTAACTACTAGTATTTGCTCAAAACCAGGTA
CAAGTGGACACATCCTAGCTTGATTGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAAGAT
GTCGTAAATTGATTTAAATTTGGATATATCTATATACTAAATAGTGTCTA
GATTCATTCAAATTTAGACAAATCTAAGACATCTTTTTTGGGACGGAGGG
AGTACTATTTGAATAGGAATAGTCAAAAGTTCATTGACTTACATGCCAGG
GCGTATCTGGAATCCGTCTTAATCCATTATTGTTGAACTCTTCTGAATCT
GGAATCTCTTATCTTGAAAATTCTGATAAAAAATGAATCGATGTCCAGTT
ACAGTTATAAGACCACCACGTTTCCAAATTGCAATATCCAAAATATGCAA
GTTTCTCTATGGCCTGTCTTACTTGGCACCCCCTAACATTTATTTTTGGT
ATAACTGTAGGGCCATTGGAGATTCCCCTATGGTATGGAGATGCAAGGAT
ATGCCTATATCTTGACGCATCCTGGCACTCCTGCGGTCTTCTATGACCAC
ATCTTCTCACACTTACAACAAGATATTGCCAAATTAATTGCTGCGAGACA
ACGCCTAAAGATTCATTGCCGCAGCAAGGTATAAAACATGTACATGAAGT
AGCTGAATAAATTCCTAGAGCTTTTCCCACCATGTTCATATATGCAATGG
CAAAATTTAAAACTGTGGTGGTATTATATGATTGATTTACAGATCAAGAT
ACTCAAGGCAGAACAGGGTTTATATGCGGCCCAGATTGATGAGACAGTAA
TAATGAAGATTGGCAGCGGACATTTTGAGCCAAGTGGTCCCCTAAACTGG
ACTGTTGCTGTAGAGGGACCTGATTACAAGATCTGGGAAGGGTCGTCGTA
GACTTGAGTTCCAGACGACAAGTGCTCAGTATTATAATCTAATAGCATAT
AGCTAGGAAGAGATGGCATCAGAATACAATGGCTGGCTGGCCCTGGTTCC
AAGAAAAGGCAATTGCAATGGCAATGGCAGCATTGTCCTGCAGCAAAGCT
TTCACACAAGTGAAACTATGTATGCAATTAAGCATTTTTTGTATGTATGC
AGAACCATTCTTTACCTCTGAAGGCATATTGCCCACTTATTTGGAGAGGC
ACCTCCACTTTGTTGGATCTATGTAAGAGCATAGATTAAACATTCACAAT
AAAGCACACATATTGGAGTCCACTTTGTTGGATCTATGTAAAGAGATACA
TTTGCAATAAAATACATATATTCAAGTATATGAATGCAGTTCTGTTGTAC
TGTAAGTTCAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.