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GrainGenes Sequence Report: AE006839

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Sequence
AE006839
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006839
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTACAGTGTAAGGGAGATCTAAATCATCATCTTCCTGCAGAATGAGCT
CTCTCTGTTCCTTTAACTGTCTTTCAACAAATTTGTTGTGACCTTTTTTA
TTGTGATCAGGTTTGCCACAAACAGAGCAGTGTATAGTGACTCCAGACTT
TGTAAGTGTTTTGATACCTTTCTTCATTTTTTCCTCAGGTGCTTTTTTCC
TGTTCTTTTTGGGTCTGCCCATAACTTTGGTAAACAAAGGTGGACGAATG
ACCACACCATTCATCTTTTTCCAAAATGGCCTTCCTCTAAGTGGAGACAA
CTTGAATTGATAAGCTTTCAAGTAATGTCTTTCCCTGGTAAACACCAATA
CACCTGGAGTATTCCATCCCTCTGACAACCAAGATATCTGAGTATTTCAT
CAATACTTGCAGCTGACCAATTATGAGCACTACAATTGTCAAATACAGAA
GTAGATGCACATATATAGGACAAGTTCTCTTTTAATCCACAAAAGAAACC
ATTGTGGCATACTTCCACTGAAAAAAGATTAGAATTGCCTCTTGCATTGA
ACACTGGCAAAATACAACTAATTCAGACATCATTGAGATATAATGCATAT
TATCAGCGTAATATGTAAGGAGAGAACATGGCATTAACTTGCACAAAATT
CATACATGGAAACATTCATGTAAATGGTCACAGAAACTACCTAATTTGAA
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AGAATTGCCTCCTGCATTCCTACTTATGCTTTCTTCTAAATGCAGACATT
AAAATATAAGCATCAGAAAACACTTTTCAGCTCTACAGAGAATAAAAGAA
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ACAGAACCCCATGCTTACTTCTAAATACAACCGGGATTCATTAGCTTTAG
TTACTAGTATGACTTCCATCTCGTGCAAGATGTATGCTTACATATATGTA
ACGGTGACTAACACTTGTTCCTGGAACCTAATAACTTGCTACGGTATTAT
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AGCCTCCAACATGTATAAGCTAAATTATGTGAATGGCTACCTGCAGGCTG
TTGAACATAACAGTGTCCATGATCAGCAAGTTCAGTTAAAAATTCAGAGA
TAATCCGAAGTGAAACAGAGCAATCTTGCTCAATTCTTCTAATCATCATC
TATCCATCTTGAATAACGACAAACATATTGTCTAAATGAATGGGATTTGA
TCAATTAATTCTATGTAAGTTAAAAAAATCACTAAACTGCGACGTGGAGC
CGTCACAACCAGAGGATGAACTGCTCGTAAACCTGTAGGTAATCGAAGAA
TTTGCAATGCCGCACTACTACTACGACTTTCCCACGGCTCAAAATACATG
AACTCATCATGATCATAAGGGGGAAACCCTACCAACAGCCATTGAATCGA
TCATGTGGAGCTCGGGAGAGGAAATTTGGAGAGTACCATAGTCAGGTGGA
TCTTCGTTCCCGCGGTATGTCAGGTCCAGTGACATCTCTCAGTGAATGGC
ACCACGGATGGCAGGGAGAAGGAGGCGGCACCACTGATGGCAGGGAGAAG
GAGGCGGTGCCGTCTGCTTCCACGGCACAAACGATGAAGGACGAACAAGG
AAGGTGCCGATAATTGTGCTGCAGGCGCGCTAAGCGGTTGCCAAAACTTT
CGCCCGACGCACACCTACATGACACGTGGGGGGCCTAAGTGCAATGTGTC
GGCGCGATATCGTCCGGTTTGTTCCTTTTCCTAACGACCGGAGCGGTCTC
GCTCAGTTCGTCGCGGTTCGTCGCAAAGTAGCGAGTTGTGGGGCGGCGGA
GTCTAGTTAGACAACTTGTGAGACTAATCTTCTCCTAACGTGCAAGTTGT
GGGACTAAGGGTGTTAATACCTCATTTTTGTACATCTGCAAACTTCTGAG
TGCTGTCGGAATTTTGTAAAACGTCTTATATTCTGAAACGGAGAGAGTAG
TTTCTTTCTTTCTTTCTTCGTAGTGGATGCAGTAGATTTGGACAGAAATT
GCAACACAGTACGTCCAAAAGATGTAGTAGAAACTAGGGTAAAATACTCT
ACAAAGTGTAAATCACAGTATAAACTACTTTAAAAGTGCAGTAGAAAATG
CAACAGACTCCAAGAAAGTGCAACGGAAACTAGTATTAGAAGAAAACTGC
TGTACACTCCAAAAAATAAAGTAACTGAATGTAAAACACGATAGATATTA
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GCAGAAACTTTTTAATGTTTCAAAATTGGTTTTTAATAGCCGACAACATC
TATTCACAAGATAGCATTTTTCAACCAAGTTAGTTCAAGAGGATGTTAGG
ACAGAAAAAATAAATAATAGCATTTATGGATATATAAAAATAAAACATAA
TAAAAATATGAATCATTTACTTAAATGTTAAAACGTCACTGTACGCCTGT
TATAAAAATGCTTTATTGAAAAGGTGATAACTTTCTCATACTATCACGAG
AGAAGGAAATGTACTACAGATAGGTCGGCGTTCAGAAAACAATCAGTATT
TTGGTGCACTTGCCACAATGTTCCTTCTCGCCCTCTGCATAATGGTTGAC
TAACTTGCACTCTAGGCAGGGAAACTTATGGTCCAAGTTTCAGGCTTCCA
ACCAACCGATATCATGTGGGGACGTGCTACACCTGCACACTGATGTAGTG
TCATATGTGAAGAAACTTTTGATTAAAAAATGTCTGGAGAAGTTTCATGG
ATACTTCCCTGGTCTCGGTTCACAACTTTGGTAGCCTTCCTTCCAAACTC
GGTATTAATTTATCCATGTAGTGTACGATAAGGCTGGAACTTATCAGCTA
TATATACACATAACATCATTGAACATTGGAGCACCTCCTATTTCTACTTA
TCCGTTTGTTCAAGACACTCGAGCTTGTTTAGTTTTTAGTTTTATCTATA
GCGAAATAAGACCAGAGAAATGGAGCTGCAGGAAGGGAGGAAAGGGATAC
CATCTCTGCTGTCCTCGCAGGGGGAGTGTATTGCATCCAACATCACACAG
GTGCCTAATTTCTCTGTACATTGTCATTATTCCATGGGTGACCTTATTCC
TGCTTGTTATGTTTAATTTGCAAGTAAATTATGTGCCTTCCAGCTCATTG
GTTGGACACCACTGATCGAACTGAAAAATATTGCGGAGAAAGATGGCATA
GGTGCTCGGCTGATCGGGAAAATTGAGCCATACCAGCCCCTTTCCTCTGT
CAAGGATCGGAGTGCTCTCAGGTGGCTATCCGTTTTCTTTCCTTATGAGG
AAGGATTGCTTCGCCTGAAATCTACCATATGAGTTAATCAATGCCAAAAT
TTGCAGACTGATCGAAGATGCCGAGGAGAAAGGCTTGATTACACCTGGCA
TGACAACGCTGGTGGGGGTCACGAGTGGTAATCTCGGCATCGGCGTGGCA
TTCATTGCTGCTCAGAAAGGATACAAGTTCATTGCGGTCATGCCTGCCAA
ACTGTCGCTTGATAAGCAGATGCTATTGCGATACCTTGGCTCTGAAGTGC
TATTAGTTGGTAAGAAGCTAAATACCATTCCTCCTCATATCGCATGTCAG
ATGGTAACATGCTTCTGTCCTGCAGATCCTGCACAACATGGATTCAAAGC
ATTACTTGATAGGGTAGAACAGCTGAAGAAGGATCTGGGTAATGTGCATG
TTCTAGATCAGTTCACCAATTCTGCAAATCCTGATGCGCACTTCAGATGG
ACTGGTAACACAATTTCTTTGAAGTAAAATAGGACGCAAGAGAAGTAGTG
TTAGAGTAACTTTAGATTCTTCTTGAACAAGGCTAATATAGGCATCATGA
TGTCCTGTACTCGACTGAAGACTATGAACTGAACAATTAAATGTTCGAAT
AAATTAATATGGATGGTGTGAAATATATGTTTTTATGTGGTCCATATTGT
GTTTGTCATTGCAGGATCTTACTTCCATGCAATGTCTCTACTCTTACCTA
TTTTTGACCAACAAATGAACCTCAGCAGTAATGTATTGAACTAAATATGT
CCTTAGGGCCTGAGATATGGAAAGATACAGCAGGCAAAGTGGATATATTT
GTAGCTGCTTCTGGTTCAGGAGGCACCATCACAGGCGCGGGCAAGTATCT
CAAGATGATGAACCCGTCCGTAAAATTAATCTGCGTTGAACCAGCTGAAA
GTCCAGTAATTTCAGGTAAGAAACTTGACCACCAAAAAATGATATTTTCA
ATCTAATATACTATGTGAAACACAGTGGATAAATGATAATAGGCATGCAC
GATTACACTCATCAGTAGCCTTGCTTTCTTTCTTGGCTTGTAAACACGCA
GAATCTTGCTTGTCTATGATTCGTAGGTGGAGAACCAGCCTTTCACAACA
TCCTAGGTATAGGGCCAGGTTTTGTCCCAGAAATATTGGACAGGTCCCAA
ATAGATGAAATTGTAACAGTAACTACTCAAGAAGCTATGGACATGGCTAA
ACGGTTGGCAAGGGAAGAAGGATTGCTTGTTGGCATATCTTCAGGGGCAA
ATGCAGCTGCCTGCTTAAAGGCAAGCTTTTTTTTTCAAGATTCTAGGATG
TTTCGTTTGCAAATAGTACAATGAAGGTTACATAAATCTGGTTATTGTGC
TGTCTCTGATTTGTGGACTTCCTGATAGGTTGCATCAAGAGAGGAGAACA
AGGGCAAGATGATTGTGACAATGTTTTCAAGTGGTGCAGAGAGGTATCTG
AACACAGAGCTCTTTGCACAGGTGAGGGAGGAGTGTGTCAACGTCAACAT
GACCTTCTGATGCTCAGCTCGAGACAGATGGCAGCATAGGGGTGATCCCG
AGGTGTAGTGTTATTTTACTCTAGCTTATAATAACTGGCTATTTCAGTTA
CTCAGTTGGCAGACATTGTCTTATTAAGAGATGAAATGCAATGCACTAGC
ATCATAAGTAAACATCTTACAGTTGCAGGTTACAGAAGATATTTATTGGG
TTTTCTTAGAGAAATCACCTCTGATCCATCATGGGGTGACCCAATCCCTC
AATTTAATCTAGTACTCCCTCCATTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTT
TGTGAAACGAATGTATCTAGACATCTTTTAGTGTGTGTGAAACGAATGTA
TCTAGACATCTTTTAGTGTGTAGATTCGGAGTGAATCTTTTAATGAGGTG
GTGATATAGACCAGCCTGTTTCATTCTTCATCGTGAGTTAGGTCCAGAGC
GAGGATTGAATGGTGCAATCACTGACCACTTCCTCGTACCAAACTCCCTA
TGCTTAACCATCGCCATGACGCTGACATGAAATAAAAGAAAAAATGAATA
ATTGAAATTTGTACAAAGCAAACAAAATTCACCACGAGATCCAGCTAGCT
TTCTTGGGATCTTTTCTCATGCTATGAAGCATCAGCGTACAAGAGGAGGG
CGGGGACTGATAAATTAGATGATGTAGCATGATTAAAAAGTTCCAGGGTT
GGGATCACTTATAGATACTACTAACCAAGTTTCCAACACATTTGTATTAA
GGGAATCATTATGCTACCTTTTGACCTTTCCACTTTATATTTAACTAATT
ATGCTACATTTAAAAAAAATCCACTTTATATTTAAATAAATGCTTCTCCT
GGTAGCAGTTACTGTCTTCAGAGGAGCTTGGCTGGTGCCAGTGAAGATGT
AGACCTTTGTGCTGTGTGCAACTGGTTTAGGAGAGCTTTCGGTTATGCTG
TACATCCAGATATCCAATTCGGCTCACGGGTGCAAATGAACCCATTATTT
AAAAACATATTTCAAAATGTCAAAAAAAATTAGGAAAAAATATTCGCATG
TACATCCGGACATTCATGAGTGAGAGTTTACCATTTCTTTCACAGAAAAA
AGGTCTCAACGGGCCCACAATACTTTCAGGCCCACCACAAGGAAAGCAAT
CGACAGTAACGCATCCGAATAATCAGGCAGGATAGCACTCAGGTCAGGTC
TCACGTGCCAGAATAAAGGACTTTTTGGTCTTTGTATTTGTCTGTGCCTA
ATTATTACAGCTACTTTGGGTGTGACGGGCACTGATAGACAAGGAGTAAT
CCACGCATTCTGATCACACAATCTGACTAGTTTTTTTTGTGAAGGAGGAC
ATCTTGACTAGTCAGCAGGAGACTTGCTGGTCAAGAGATCACTCCAAATT
GAAGGTGTGTCTGTCCACCACGCATTACCCCTCCCTAACCAAAAGCCCAT
CAAGTTCATCTTCCCTAGCAAGAGATTTCCAACCAAAAAAGCTTCAGCAT
ACATGGCTAACAACTACCGCGCTAGCTTCTCCCTATTCTTTACAGCACTA
TTTCTCCTGCCAAGATCTTGCCCGCAGTCCACAAACGAATCTGGTGATGA
ACACCAAATCCTCCTGGGACTCAAGAGATATTGGGGGAGCTCACCTGTAC
TTGGCAGATGGAACCCCAATTCTTCTGATCACTGCAGCTGGGGAGGAGTT
ACATGCACAAATGGTATGGTCACTGCCATCTTCCTTCCAAACCAAACATT
TAGCAAACCAATCCCTCCCTCTCTTTGCCACCTCAAGAACCTTACGTACT
TGGACCTCTCGTACAATAACTTCTCCACTTCATTCCCCACGGTGGTCTAC
AATTGCTCCAATCTGAAGTACCTAGACCTTTCCAACAACGCCTTTGCAGG
GCAACTCACAGCTGACATAAACAGTTTATCAGCAAAGCTCGAGCATCTCA
ACTTATCAGCCAATCGTATCACAGGCAAAATTCCAGCATCCATTGGGCAG
TTTCCATTGCTCAAGTCACTACGCCTCGACACCAATCAGTTTGACGGAAG
TTATCCAGCACATAACATAAGCAATCTGGCCAGCCTCGAGGTGCTGACTC
TCGCAAAAAATCCATTTCTGCCAGCTGCAGTGCCGGTAGAGTTTGGCAAG
TTAACACGACTCACATACTTGTGGGTGTCAGGTATGAACATGACAGGTGA
GATCCCTGAGAGCCTGTCGAGCCTCACAGAGCTCAGTCTCTTAGCTATGA
ACAATAATATGCTGCAAGGCACAATTCCGACATGGGTATGGCAGCATAAG
AAGCTTCAGTACTTGTACATGTATAGCAACAGTTTCACCGGTGAGATTTC
ATCCAGTGTCACTGCCGTAAACTTGGTGGAACTTGATGTGTCCTCAAACA
TACTAACAGGGACAATACCAGATAATTTAGGTAAGCTCATCAATCTTACT
ATACTGTTTCTCTACACGAATCAACTGCACGGGTCAATACCGTCAAGCAT
TGGGTTGCTACCGAATCTCAGGGACATCCGGCTATTCGAAAACATGTTAT
CTGGTCCTCTTCCACCAGAGCTTGGTAAGCACTCGCCACTAGGCAATCTT
GAGGTCTGCAACAATAACCTCTCGGGCGAGCTGCCAGCCGATCTTTGCTA
CAACAGGAAGCTATATGATATCGTTGTGTTCAATAATAGCTTTTCTGGAA
AGCTTCCAGAATCGCTAGATGGATGCTATATGTTGAACAATTTAATGCTG
TACAATAATCATTTCAGTGGAGAGTTCCCCAAGAGCATTTGGTCAGTGGT
GACGAATCTGCTAACGACAGTTATGATCCAAAACAACAATTTCTCTGGAA
CATTTCCTACCCAGCTACCATGGAACTTTACACGTCTTGAGATCAGCAAC
AACAGATTTTCTGGTCCTATTCAGATTTTAGCAGGCAAAATGAGAGTATT
CAGGGCAGCAAACAACTTGCTTTCTGGCGAAATTCCCTGGGATTTGACGG
GCATTTCACAGGTAACAGAACTCGACCTTTCTGGGAATCAAATTACTGGA
TCAATACCCATGACAATTGGAGTGCTGAAGCTCAACACACTTAATCTAAG
TGGAAATCAGATATCTGGTACTATACCTGCAGCGTTTGGGTTTATGTCAG
TACTAACCATCCTTGACCTCTCCTCAAATGCGCTATCTGGTCAGATCCCA
AAGGATTTCAATAAGTTGAGACTGAACCTTTTAAACCTCTCCATGAATAA
CCTCACAGGGGAAATTCCAACATCATTGCAGAACGAAGCATATGGGCAGA
GCTTCCTCTTCAATCCAGCCCTCTGTGTCTCATCGAATAATTCTATCCTT
AATTTACCGATTTGCAGGGCAAGAGCAAACAGTAGCAATGATATCTCCAG
GAGGCTTATAGCCCTCTTCTTTGCTCTTGCCAGTATAATGCTTCTGGGTT
CGGCTGTTGGTGGTTTCTTACTATTAAAGAGGCAAAATAATAGCCAAGAT
CCACTAACATGGAAGCTGACCCAGTTCCATGGACTGCATTTCACAGAGTA
TGATGTTCTTTCTGGGCTCTGTGAGAAGAACTGTATTGGAAGTGGAAGGT
CCGGCAAGGTATACCGAGTTTGTGTTGTGGATGGAGAAGGTGGTAGTAGG
ATGGTGGCTGTCAAAAAGATATGGAACATGCAGAACCTTGACAAGAAGCT
GGAAAAGGACTTCCTTGCAGAGGTCCAGATACTGGGCGAGATCCGACACA
CAAATATTGTCAAGCTGCTCTGCTGCATCTCAAGCTCAGAGGCAAAGCTT
CTTGTCTATGAGTACATGGAAAATGGAAGCTTAGACCGATGGCTGCATCA
GAGGGATAGAATTGGTTCACTCACACCTTTGGATTGGCCCACTAGATTGC
AAATTGCCATTGACTCGGCAAGAGGTCTCTGCTACATGCACCATGGTAGT
TCACCCACCATAGTGCATTGTGATGTAAAGTCTTCCAATATCCTTCTAGA
CCCCGAGTTCAGAGCAAAGATAGCCGATTTTGGGCTTGCTCGGATTCTTC
TGAAAGCCGGAGATCTTGGGTCAGTTTCTGCCGTAGGTGGTACCTTTGGC
TACATGGCACCAGGTAAGAGCTAGAAATGCAAATTCAAACTAGTACTCCC
TCCGACCCATAATAAGTGTCGCTGATTTAGTACAATATGGACCGGAGGGA
GTATAAATTTAGGTTGTTCATGTGCTGATCAGAGGCTAATTTGTTCACAG
AGTATGGATATCAGCGTAAGGTGAATGAGAAGGTCGATGTCTACAGCTTT
GGAGTGGTCCTGTTGGAGCTCACAACTGGGCAGGTGGCAAATGATGCTGG
CTTGGAGTACTGCTTGGCAGAATGGGCATGGAGACAGTATCAAGAGTATG
GCCTGTCAATTGATCTTCTTGATGAGGGCATTCGGGATCCAGCCTACATG
GAAGACACATTCGCAGTGTTTACGCTAGGTATGATATGCACAGGAGGACA
GCCTTCAATGCGGCCATCAATGAAGGATGTGCTGCACGCTCTTCTCCGAT
TTGAACACAAATCCCTGGAAAGGAGCCCGCAGCATGCTGTCTCCGAAGAA
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GTAGGTGATTTTCTGTTTGGTTTGTAACAACTAGCTGATGCTCTTTCACA
GGCTACTTTGTCCTGTGTCGACATAAAGCTTGTGAATTCTACAAGAATTA
TTGCAGCCACAAACTGCGGAAACTTTTTTTCAGGCTAAATGCTGAAAATG
CACGTAGATATTATTCTAGTACTACAACATACCAAATACTTGAGGGATGG
ACACTGCGACGGGCGGCAATCCAAAGATTCTGAACAGATGCTGAAAATGC
ACGTAGCTATGGATGAGTACATACAAGATATGGATGTTGGATTATGAAAT
TACATGGGTTTTCTGTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGCAACAGTGAGCTTTCCTAGATGGTTCATACTGAACAAAATGGGTG
GGTGGAGATAACCACATTATCATGAACGAAGTCAATGATTAAAGCTGTCA
TTTAAGAAAAAATCTAGTAACATTCTAGCTAGAACGTATGCACATAAAAA
ACCCGTTCTGTATCACAATAAAAAATTCTGAATTGACTCAGAACTTTCTT
CGAGGAAAATTGTCTTGGAATTTCATAGTACATCACAACCAAAAAAGAGT
ATTGCATAGGACTCCTAAAAACTGACCCTCATATGCATCCGAACAAAAGT
TTTGATGATTTTATCCAACATTTTTCAGAGGGGGCGATTTGATCTGACAT
TGCAGCAGAACGAGTGGAGTTCCAGGGGCTTACTTGCTGATTTAGAACGG
AGGGGCGAGGGGTGACTGCAGGTGGGGAACCGGAGGAGATCTCCTTATCT
CCGGCGGCGGAGGTGGGTGAGTCCAGTCGGAGGAGATGGGCATCGGGCGG
TGGAGTCCGGACCCCTGCACGGGACGCAGATCCCTTAGCCGCCCGCGGCA
GCTTCTCCACCAGCGGCGAAGCGCCGCCTCCGCCGCTTGCTTGAGAAAGA
AGTTTATATAACCCCCCTTAACTATTAGGTTTCGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.