Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE026343

[Submit comment/correction]

Sequence	AE026343
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE026343
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TGTACATCGAACAAGGACAGGGAGAAGACACCAACCCAATCCTTAACTGC CCTCCGGCCGGACACGAAACTCCCCTTCCTCTTCCTCCCCTGTCTCTCTC TCTCTGCCACCCCCTGTCTTCATCCCTGCCTTCGTCGGTTTCATTCTCCT CGATCTCGGTCTTCGTCCTGATTTCCTCAAGACCAACAAGTAGGCAACCT GCTGCTGCTGCTGCTTCGATCGGGTAGAGGAGAGAGGCGCCGGCTGCCTG CTTTACCTGTGTCCGCGGTGGATTCTTGCCGTCCTGGTCGTGGGTCGATC GGCCATGTTCGTCAAGAAGCTCGTGGAGAAGGCCTCCAAGAAGGTAACCT CTCTCTCACTCATCCCACCCATAGAGTATGCTCTCTGCCTCCGCTGCCAT TATCATCCCTTTAGATGAGCCTCCGTACGTGTTCTTCGTCGTCCATGGCG GCTCCATGCTTCGTGGTATAGGACTTAAGATTACAGACAGTCACGCACAC AAGCGTGCCTAGATGAAATCAAAAGGTGGGTGGGTATCCTGATTAAGGAG CGGTAGTTCCATATCTCACTCCTTCCATTCCCCACCGACCGAAATTTGCA CGTAATCCCTTCTTCAAGAAAAAAAAAACTGGTTCTCCGGAAATGTCACT TTCTTTATATTTTTTCTTTAACCATTTTTTTGTCGTGCAAACAAGAATAG AATGTTGGCTTATTGCCTCGTAGACGCCGTTGCCGAATGGTTCCTATGTT GACAGAGATGGATGAGTGTCCTTGTTTCGATCTGAAACTCTGTTCAAATT TCAAACATGCCTGAACGCCATGGGACGATTCAGAGATTAAGGCAGCACTG CCACTGTGCCGGGTGACCAACCAACTGACCATGTGATCGCATTAATGTGG AAGCAAGGACGGACGCTTTTGTTTACGGGCTTCGCTGCGCGCGGAATGGA TAAGAATTTCGATTGACCAAGTTCGATGCATAGATCATGCACAGGTAGAG TTCGGGATAAAATACTAGTATCTCCTAGGCCGGTTCTTCGAGATCGACGA GATTTGCTTATTCTTATTATGCTTCGGTGCCGGCTTTGGCCTGTTGGCAC CACCTCTTTTACATCATGCCGATCTGCATCATGTCTCGTACGTTTAGCGA GAGGTTTAAGTCTAGTACTAGCATGATGCGTGGTTCGTTTCTGACATCAC ACTCTTGCTAAAGGACATGGACATGATGATGCGTGATTTGACTTTTCAAA GACAAAAACGGTAGCAGTAGTACCGGTAACTTCACAGTAGGGCAATTCAC CGGCTAACTGAGCAAGGTGAAAAGTGGACAAAACAAAACAAAACAAAACA AAAACGAGAGCAGGAGCAGGTCGTGTGCTGCTGACAGTGACACGGTCAGT AGAATTGGTACTAAGAAAATGGTGATTCAAGCTGCATTTTGGTTGGAGTT CAACTTTTTTTTGTTGACATATGGTCGAAGTTCAACTAAGCTGACGCGTG TACATGTCCTGGTCGTTTGGATTTGTGTACAACTAAAATAAGGTGTGCTA CGTGCTCACTCGATGTGACAGGGCCATGTGCGTGGTCGGTTGAAATCATG GACCGGGTGATCAGGACATCCTGACACGTACGCATATGATTACTAGGAAG CTGGAAACGTGACATCTTGTACTTTTCCTTTAGTTTATTTCTGTGAGATC GTAGAGTCGTAGCATGGAAGAAAATGCCAGGAAAAAACGATTTAGTTTAT TTATGTGAATGTCATAAATGCAAAAAATGATAGGGACCTAGCTCCCGGCG AGGATCGAACTCGCGACCTTTCGCTTACGAAGCGAACGCAATACCACTAT GCTACGGAAGCTGTTATGCTCGAATTTCCATGTGACAGTATTTATTTACA TGTCCGCAGCAACACACGAGCGCTATCCGTAGCTTGCGCGCTGAGGACGT GAGCCCGCGGCTCGCCTTCCACTACGGCGTCCCCGCCGACGCCGCCCTCC TCGCCTACGACCCCCTACTCCACGTCCTCGCGGTCGCCACCAGGTAACCC CCACCCGCTTCCTCCCCATCCATTCCGACGGATGCGCCACCCACTTCGCC CCGCTGTTGCTCACGCGCTCGCCTGCAGGAATGGGCAGATCAAGCTGTTC GGCCGCGACAACACGCAGGCGCTGCTCCAGTCCCCCTCCCCTATCCCCTC CAAGTTCCTGCAGGTAACCACCACTCCTCTCCCTCGCGCTTCCAATCCCA CTGATTTTCTCCATCGAATGCTGTATTGCTGAACCTGAACCCGATGTGAC TTAATTCGACGCTCCGTTTCAGTTCGCCGATGGCCAAGGGGTTCTCCTGA ACGTGAACACGCAGAACCAGATTGAGGCACGTTCTACCCATGGTCTATGT AGTAAACGATGTTTCCTTCTTATGCGTTTGTTAATTCGGAAAAGCATTGT ATGCAGGTTTGGGACATTGACACGAAGAAGCTGTGCTTTCTGCATCCTAT TGAGAAGCAGATAACCGCGTTTACGGTGCTACAGAAGAGTTTCTACATGT AAGTGATGGCTAATGACTACTGAGTGCATTATGGTCATATGGGTCCTGAA AGTTTTGCTGTGTGCTAATGGGGATTGCCTTTGTTCAGATATGTAGGAGA CAGTTTCGGAAATGTGTCGCTGTTGAAGCTTGATTTGGATCAGAGATGTC TAGTTGACATGCCATATTGCATTCCTTTTTCTGAATCTTATGGTAGGTTG TGTTACTGATATTTTTTTTAAAGCCAGCTGCATACTCCACTTTATTTATT CGTCTCATTCTTTTATTTAGTTTTTAATTATATTCAAAATATCACCCTTA TTCAGGTATTTGTTCAATTTATAGAAAGTAGCTTCACAATAACAGTGGTA GTAATAATTTCATTGAGATCCAATGTATTTGGAAACTGAAAATATACATT CCGTTTGATTTGTTATTGAAGGTTCCACGACAAATGTTGGTAATGGGGCA GAAGTTGTGTTCGTTTCACCACAGCCTTCTGCTGAATACAATAGGTTTGC CTCATATCCTTACCACGAGTTTGGCATGAATAGTTACATTTTCTGAGCCT TGTCGTATGCATATTGATCTTTCATTATTCATTAATTAATCCACTATCAT TGTGCATAGTGAAATGTCTCGTTAAGGTACACTCTTCCTCTCAGGTTGCT CATTATCTTCCGAGATGGGGTCATGACTTTATGGGATATTAAGGCAAACA AAGTGGTATTCGTATCCGGTAGAACTACGCAGCAACAATCACACCAGGAG GAGAAAACCGTAACTTCCTCATGCTGGGCTTGTACCAATGGTAGCAAAGT TGCTATTGGATATGACAGTGGTGATATCTATCTTTGGGCTATTCCTGGTA TTTCAAGTGCACAAAATTCCTCGTCGTTGGGAAATCAGAACTTACCTCTG CAGAGGCTTAACCTTGGATACAAGCTAGACAAGGTCCCAATAATCTCTTT GAGATGGGTCGCTAGTGATGGAAAGTCTGGACGTTTGTATATTAATGGGT TTAGCGAACATGCATACTTATCTCAGGTAGAAACACTGAAATATTCTCAC GTTGTGGTTACTGTTCCTACCACACGTTTCAAGTTCATGTTTTACCTATG GATATTGTTATCCTAAATGTCATTTTTAGTTACCAAAATTTGCATCATGT GTCCAAGCATGTTTTAGCTGATTGCAAATATTTGGAGTGGTGATATTCAT ATATCTACCTGATAGGACTGTCTTTAAATAACTATCATGTTGTCAGGAAG ATACTGATTTTATTTTAAGGTGGAATTTCATTCTAGAATGCCAGTATGCC CTGTATGATTTTTTAGGGAAATCCTTTCTTTGATTTTGCTTCTAAGTATA ACAATTTCTAGGGTTTATAAGAATCTGGTCGATCGGTAACAGATCAAATT AAACTGGATGGTCTACTGGTTTGAACTATTAAAATTTTAAGGGGACTACT TCAAGTAAAAGCTTAGCAGAAAGGCCACAAACTTGTTATTGTTTTTCCAG AAACCAGACAAAAAGGTCCATTTTATGAGCTTAGGTGGGACTTGGAATTA CTGATTTCTTTCTGAAGAATATTGTGATGGTTTACATGGATAATGTCTTG ATTGTTTTGTTTAGTGAGAATTGCATCTTCACTCAATCTTCCATTTGGTG CTTTCTGATCACAGGTCCTGATACTGAATGAAGAGAGTGAATCTCGAATT GTAAAGATGGTATTACCCCTCACAGAAGCTTGCAAAGGAATGGAACTTGT TACAGGGCTTAGTGACCCAAATAAGCAAAGACAAAGTACTCTCGTTCTCT TGTTGAAATCTGGTCAAATCTGTTTATACGATGATTCAGAAATTGAGCGC TACCTCCTTCACTCTCAGTCTAGATCACCACCAACACTACCAAACCACTC ATATGTGAAGCAACCTTATGGTGATTCAGGCATCAACATTGCGAAGTTCT ACTCAAGTGGCCGTACATCAATAGCTGACGAGGCATGTCTATAATTGCAA ATTATACCTTGCAAACAACTATGAACTCTTTGACCAGACAGCTTCATATT TTAATGGACAGGATTATTTTTCATCATTGGCCACCAAATATCCATGGTTG CTCTCAATGAAGGATAAAGGCCAGAATTCCACAAATTTTACAAACATCCA TAAGACCAGGAACCTATATATAACTGGACATATGGATGGAACCATAAGCT TTTGGGATGCATCATGTCCTCTTCTCGTGCAGATTTTTATGATAAAGCAG CAGGTAGCTTCAAATCAAAGTTATTTTATTAGATATTCCACAATTATGGA TTTTCATACAAACTGCTATTTTTTTACTTCATTCTAACCACGAGTTTTTA ATAATTGCACAGAATGAAGACAATACATCAAGTGGCACCCGTATTACTTC ATTGCAGTTTGATATGTCCTCCAGCATTCTTATATCTGGGGATCAGAGTG GAACAGTAAGCTATTCCATGACCACAAGGCGGTTTGTTGTTTATGTGTTT GATGCAATTGCAGTGCATTAATTTTCTTCTTCTTTTCAGGTCCGCATCAT CACATTCAAAAAGGACTCTAACGACAATATATTATCCTTTTTACATGGTA CTGATTTACCATTTCCCACTGGACGAGTTTCTATCTACTCCCTCCGTCCC AAAATAAGTGACTTGGGTTTGTCTAGATTTGCATGTATCTAGACGCGTTT TAGATATAGATGCATGCGAATCTAGACAAACCCAAGTCACTTATTTTGAG ACAGAGGGAGTAGATACTAACTTGGTTTTTTATTCTACAAAAGAGTTTGT CACAATAATCACAATATTATTATTGCGAAGTGTTGCACTTTACCAGTTAT ATTTAGCACATTCAGTGATTCTTTTTGGAACATTAAACTAATATGGCCGG TATACACTGATTATATTTAAGAGGAGCACGTTTTGAGTCTGACATCACTT TCTTTCAATAAATAAACATAAGTTTGCAGCTTGTGTGATCAAGTTCTGAA CTATCATAACCATCATGTTATTTATAGAATTTCCGTGACAAGCCTTTTCA GTTAAAAGTATTGATATTATTGTTTGATTGGTCGCAATATTAAAAAACTA TCATCTAGACAAATAAAATGGAAATAATTATATCAACAACCACTTTTAGC AATATTAATACTAGTGAAGACTGAAGAGATGATGTGGAGTTGCTGCATTG TTTTCAGAGAGGACAAATGTGTAGTGCGGAGTTTCTTAAGAGTTTTGTGT TGATTTTTGTGTCTACAAGTAGAAAGGATTTATGGATATAGTACGAGAAA AGCTACATAAATGGTTGCCAGCAGTCCAGCACTTCTTGGTCTTGTCATTG AGTTGATGCACTATTCTTAATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTTG GGTTTGTCTAGATTCGGATGCACCTAGACGTGTTTTAGTGTGTAGATACA TACGAATCTAGACAAATCAAAGTCACTTATGGGACGGAGGGAGTAATATT TTTGCATCTATATGAAGTTTCTGTGTGTTATTTAACCAACATTTTTGTGA CTCGTCAGCTAAGCAAGGGGATAACTACCATGCTAGAAGTATAAAGCTCA AGGGAGCTGTAACCTCAAGCTCTATGATCTCTAACTCGAAGCATTTTGCT GTTGGGACAGAAAAAGGAATTGTAAGAAATCTTTTGCTGTGTCAAATTTT CTCGATTTTTGGAACTACTAAGCTCGAAGCACTGTTAAACCAACATGACA AACCCAGTACCTCTTACCAGCTTTTTTGTATCATGGCTTCAAAATAGTAG CACTCAAATCTTATCACTTTGTCTACAATAGTAAAACTGAACAATAAAGC TACTAAATAGTATGTGTTTGCTATACTATCTCACATAAATTTTAAATTAA TGGTGGCGATTACAAGAATTCAACAACTCTTGTTTAAGTATAACTCGTGT CATGTATATGTCGATGATTATTTTGAAGATATAGAGGGTGGTTATCAAAT TATAAGCATATATCTGAATGTGTTCTTTAAATATGGTTATTCAACTCAAT ATCTGGGCTCCATATTCTATCAACAAAGTGACAGATCCCAAAAATCTTGT TTTCAGGTATCAGTTATCAAAATAGATGATGCTACTATATTGTATCAAAA ACAGCTTGAGTGTCGTGTATCTGGTGGAATTTCCTCCTTGCAGTTTGAAC TCTACAGTCATAATGGATACGATAAAGATCTTTTGATAGTAGGAATGGAA GATTCTTCTATTTCTGTTCTCGAGGAAGAAACTGGAAAACTTTTGAACAC CAACCCAGTTCAGACCAACAGACCATCAAGAGCCCTTCTGTTGCAGACAT TGGGTGAGCTATATGACCTTAAACCATATTTCATTGTATTATCTAGCCAT CAACCCTTTTTGAAGATAATATTGCCACACTATTATGTCATTCTAAAGGC ACATAATGCCATTATGTAGAGTTATATCCAAATGACGTATCTGATAACCA ATCAAAGGAATCGTTGTTGTTACTTTGTACCGAAGATGCAATCCGCTTAT TTTCCTTGACCCATGCGATTCAGGTACTTCTATTTCCAGTTATCTCAGAG TTTTGCCTTCCGTGTGAGTCGATGTTGTTCATTATGGAGCTTTCCTTTGT GCAGGGAATGAAGAACATAACTAACAAGAAGAAATTAAATGGCCGTTGCT GTTTTGCATCTCTTATCCATAGTGGTTCTTCTGAAATTGGACTTGTATTA GTCTTCTCCAATGGAAAAGTAGAAACAAGGTAAGGCAACGGTTGAATTGA AAACTTAGCACAAAGGCATTGAAGTAAAGTTAATGAATTCCAGTGTATTT GTGAAACTGCAGATCCCTCCCAGATTTATCCTTGTTGAAGGAAGCCTCTT TGCGAGGTTTTGTATATTCAAAAACAGCGAATTCCTCTAGTTCCATAACA TGTTCATCTAATGGAGAAATCATCTTGGTAAGGACTGCACCATGCTATTA TCTAACACCTCTTTTAAAGGCATTCTGTAGTGACTTCAGTGCAGCTCTAT TCATGGTTTTAAAAATTAGCTTTCTAGTATAAATAGTCTATTTTATTATA CAGGTTAATGGAGACGAGACGTATTTTTTCTCTACTCTCTGTCAGGATGG TATCTACAGGTATGCTAGTATGGCTCCTTTATAAATCTGGCAATAATGTA TAGTTGACCATGTTTGCCAACATTGGAGATTTCCAATTTAGTGCACTAGA GACCCATTGATTCATCATAGAGCTCCCGCTCTGATCTTCAAATGCCCAAC ACAATAATTCCGTTATTAACTTCGATCTAAATTTAGAAACACTTCTTCTA TCTAAAAAAACATGTGTTATCATAGTGGTTCCTTTCGGATTGCTTACATA CTTATCTAAGTAGTGTGGTTTGTACACAGGCATGTAGACAATATTAATAC AGTATACAGAAATGACCAGCTGCCCAGGGAAGAATCTTCATATGTAGTGA AGTCCCCCAAAGAAAAGAAAAAGGTAATTATTTTACCTTGGGTCAGTTGA AATCATCTGTGTTGATTTGTATGACAATGTAAATTCTCCAGGGCTTATTT GGAATGATTATGAAAGACACTAAAGGAAGCAAGGGCAAAGAGAGTGATTC AAACAGCAATGAACAGTTCATCGCAACAACTACTGAAGAACTGGCTTCAA TATTTTCCTCCGCTAACTTTACTCCGCCATCTGAGAGAAGGAACAGTTCA TTAAAAGATGACGAAAACATTGAACTAGACATAGGTATGCTTGTTCAAAG TTCTAAAAGTTGGCACAGTTCTAAAAGTACCATGTAGGAACTAGGATCAC AGTTCAACTTAGCCACACAGAGCCTGCTTAGCACGGGTTTAGAACATGTT TGATATTACATTGATTTTGCCTGTTTAAGGGTCTAGTTATACTTATGGTA ACATGCTTCTTTCTGAAGATGATATCGACATTGAGGACAACACACAGAAG CAGAAAGGACCACACTTCCCGGGTCTAAGCAAACAGAAAATTAGCAAGGG ATTTCAAACTCTTAGAGGTCAGCGAAGTGTGATAATTAAAAATTATATGT AATTTTGTAATCCAAAGTATGGATCTGTAAAATTAGTATTCTGGTGCAAC TGTGAAGATTTAATATGGTGTTCAAATGCTGAATATGCAGGAAAATTGAA GCCCAAAACAGAAGAAAAGGTGAATTTGGGAAATAAGAAACCTGAAGATG AACCACCGGCTAGACAGATTGACCAGATAAAGATGAAGTATGGATATGCG ACAAGTAATGTGAGTGCATAGAAGACCATTAGATTATCAAATTATGAATT GTAATGCATTACCATTACACACGGTTTATACTTCGGCCTTCGACATTATG CACATAGACTTATTTATATTACCAACTGATGAGCATCTGCATTGAGTCAC ATGAGCAATGCACAGAATAATGCAAACATAATAATTTAGTTCCCTTCAAG GAAAAAATATAGTTAGTTTTGGACTTCCCTTACCGATCTTTTAATGTTTA TTATCTGAACAGGACTCCACCAGTGTTCCAAAAATGATTGGGAACAAGCT GCAAGAGAACATTAAAAAGTTGGAGGTAACATCATTTTGCTTCCCTAGTA GTAGTGCTACATGTTTACTCCTGTTACCATGTCTGCTCTGAACTATTTAG TTTCTGAACATTTTTTGGTTACCCATTCCTCATTCCCTACTTCCATAAAT TCTTCAAAAATCCATATAAACGTCAGTAAAGACCCCCATACAAGACATTC TCCTAAAACTTGAGGGCATTAACATGTATTTATGCGCTTCTCGCAGGGCA TTAATCTTCGATCTGCAGATATGGCTAATGGCGCCCAGTCCTTCTCTTCA ATGGCAAAAGAGCTGCTGCGAACCACAAAGAACGAGAAGAGCTCATCGTA GCAATGACTCCAGTTGTAAAGTCCTCCTTTTGATGTTTGTTTGAGAAGGC TAACCACACTTGCCGGGCAGTCAGCTGTAAAGCCCTCTTGGCTTCTTTTT CCACTATATGGTTTGTCTGAGTGTGTTATCAAGTTCGCCTGACATATATG TGGATCATTATGTAGTGATGCCCTAAAATGATTTTGTTGTAGATAGCAAA GAGTATCACAGTGGAACTTTACATAGTCAATTGTTTCACTGCGCCAATTT TGATTGTATACATGCACAACCGTCTTATGGTACTTGTATCCGATGAAGAT AACTCACCACAACTTCATTGTTAACCCCTGCATACATATGATGCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.