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GrainGenes Sequence Report: AE048972

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Sequence
AE048972
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE048972
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACTTGTTAGATAACACATTTCCTGTAACATCTAACCGAAAGTACGTAG
TCCAACGGGTCTAAGGTAAGCCCCCATACATTTGATTGTTTAATATCAGT
GACATGACTTGTCAGCACTCCTTATTTTATCTTCTGTTCACGTTTGCACT
CCCTTCATCACTGGATTTTGCTTCTAAATTTCAATGACAATGACATATAT
TTGTAGCTCGTGTTACTTGTGAATTGCGCGAATCCGTTTTCTCAGTTCGG
ACTGTTGGTTGTGTTAGCTAGTGCATAAAACTTGACAAAGTATCAGAGCC
CAAGGTCTCGAGTTCCGAGTAATGGTTTTCGCAAATTTATGAAAAATTGC
TCATGTCTCTCCTTTGTGTTCACATATGTGCCTCTTGAGTCATACCTTTG
ACCATGTATTGACTTCCTTCTCACTCTGTTTGTTCATCAGTTCGGACTAT
TGGTTGTGTTGGCTAATGTGCATGAGGATTGAAAGCTCTTACATAAATAA
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TTCCATTTCAGGCATGCTTCGTAGGACACAGGTGTGAACTTAACGACTAG
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TGTGTTCCACACCATGTAGGTAGTATCTACTGAATATGTACGTGTAGCAT
GAAGTATTATAAGACTATTTGGTAGTATATATATACTACTTTTGAGGTAG
TATGTACAAGTTTTTCACATACTCTAATTTTACGTACGTGTAGTATGAAG
TATTATAAGACTATTTGGTAGTATATATATACTACTTTTGAGTTAGTATG
TACAAGTTTTTCACATACTCTAATTTTACATACAAATATGAAGGGTATTT
CGGAAATATAGGGCAAACTATGACTCCACTTGCATTTTTTTCACGTAACT
TGATTTGAAATATCTTAGATGTAGCATATGAACATACAAGTATCACGTAT
ACTTTCGTATAGGAGTATATAAGACGTGGGTGTACACCCAGGAGTAAGAA
GAATTTTTCCTATATATATATTTATTTAGGGAAAATACTTCTTACTCCCG
GATGTAACTATACCCACGTCTCATATACTACTTTATGGAAGTATTTGTAA
TACTTTATCTGTTTGAGTATGTTCATATACTATATCTAAGATACTTCTAA
ACAAGTTAGATGAAAAAATTGCAAATACACTCATAGTTTGCACTATATAT
GTAAATTTTACGTACATGTAGTATGAAGTATTATAAGACTATTTGGTAGT
ATATGTATACTACTTTTGAGGTAGTATGTACAAGTTTTTCACATACTCTA
ATTTTACGTACAAATATGAAGGGTATTTCGGAAATATAGGGCAAACTATG
ACTCCACTTGCATTTTTTTCACGTAACTTGATTTGAAATATTTTAGATGT
AGTATATGAACATATAAGTATCACGTATACTTTTCGTATAGGAGTATATA
AGACGTGGGTGTACACCCAGGAGTAAGAAGAATTTTTCCTATATATATAT
ATTTATTTATTTATTTAGGAAAAATACTTCTTACTCCCGGATGTAACTAT
ACCCACGTCTCATATACTACTTTATGGAAGTATTTGTAATACTTTATCTG
TTTGAGTATGTTCATATACTATATCTAAGATACTTCTAAACAAGTTAGAT
GAAAAGATTGCAAATACACTCATAGTTTGCACTATATATGTAAAATACCG
TCATATTTGTACGTACTATGTGAATAAAAAGTACATACTACCAAAAAAGT
ATAATATATACTGCCCAAATATTCTTATATACTTTATACTACCCATATAT
AGTCTCCAGTATGATAGATACTACCTAAATGATGTGAAACATACGTGGGT
GTAACTACATCCGGGTGTAGTATGAATATCTATATATATATATAAATAAA
TATATATATATATATATTACACCAAAAAATAAATCACCTTGCGTACACAC
ATCACACAAAGCACCGAATTCTGAAGAAGAAATCCGGCTTCTTAGAAAAA
AAGTATAGATTGATAAATATCTAGAAGACTAGAAAGATCCTATATATAGA
TTTATTTTACAATTAAAAATGTACTTTGATTTGGGTTCAAAGTTATTTTT
TTACATTAATTGTAAATTGGATTAAAAGAAAATTGAATCATTTTTTGATA
TTTCGTATGATTTCAGCTTGATATGTATTTCTTATTTTAGTTTGACTCTA
TACTAATATTGATTTCACCGGCAAACACTGCAATAAGTTCAGTAATGGAC
TTAGTGATTACACACTTTGAAGATAGATTTTAGATTTCTATAACATGAAG
AAATTAAATTAACCTGGGCCTCTGCATCCTTCCGCACACACATCCCACAA
AGCACCAAATTCTCAAGAAGAAGAAATCAGGCCTCTTACAAAAAAATGTA
TAGATTGGTATTCATTTAGAAGACTAGAAATATCCTACATTTAGATTATT
TTAAATTTAAAAGGAAACCCAATCTTTTTGGTATATCTTATCATATCATT
TAAGCTACATATGTATTTTTTGTTTTAGTTTGATTTCATATTTATTTTTA
TTTCATAGGTAAACACTAAAACAAGTTCATCATTGAGATTAGTTATTATA
CACACTTTTTTGGTACACTTAATATTCCTTTAACATCAAGAAATGAGATT
AACCCTGGGCATTTGCATCCTTCCGTACACGCCACACACAAAACATTGAA
TTATGAAGAAGAAAAATATGTAGAAGATATCATGTCTCTTACAAAAAGAG
GAGTAGTTAGTGTTGGAGATATGCCCAAGAGGGAATAATAAAAGTGATTA
TTATTATATCTTTGTGTTTATGATGAATGTTTACATCCCATGCTATAATT
GTATTATTAGGAAACACTAATACATGTGTGTTTTGTAAACATATAAGAGT
CCCTAGTAAGCCTCTTGTTGAACTAGCTTGTTGATTAATTAATGATCATG
GTTTCCTGATCATGGACATTAGGATGTGATTAATAACAAGGTCATATCAT
TAGGAGAATGATGTGATGGACACACACCCATAGTAAGCGTAGCATAAGAT
CAAGTCATTAAGTTCGTATTGCTGTAAGCTTTCAAATACATAGTAACCTA
TTCCTTCGACCATGAGGTTATGTTAATCACCATCACCGGATGGATACTTT
GATGTCATCAAACGCCGCTTCGTAACTGGGTGGTTATAAAAGTGTCATTG
GGTATTCTGAAATAATGTGTTGAAGCGCATGAACCAAGATTGGGATTTGT
CCATCCATATGACGGATAGATATGCTCTGGGCCCTCTCAGTGGAATGTCA
TCTAGTTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGGTCACAAGGGATGACATATCAT
GGAACGAGTAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTAGAACTAGGTATGGAG
ATACCGACGATCAAACCTCGGATAAGTATAGTATCGCGAGACAAAGGGAA
TTAGTTTCGTATGTAAGTGGTTCAATCGATCGCGAAGTCATCGTTGAGTA
TGTGGGAGCCATTATGGATCTCCAGGTCCCGCTGATGGTTATTGATAGGA
GATGTGTCTCTATCATGTCTACATATTCACGAACCGTAGGGTGACACACT
TAAGGTTCGAAGTTGTTTTAACTAGATATGGAATATGCGTTGGAGACCGA
ATGTTATTCGGAGTCTCGGATTGGATTCGGGACATCACGAGGAGATCCGG
AATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATATAGGAGATCATTTTATGAGTTAG
GAAATGTTCCGGAGTGTTTGTATGAGGGTTCTAGAAGGTTTCGGAATGTT
CCGGAAGGTTCTGGAAGATATCTTGGAGTTTGCTTGAAAATCAAGATAGG
GATCAAGGAGTCCTGGTGGGTCAAGATACGGATTCGTGGGGGAGGAGGAC
TCCTCCCCCCACCTCCAATCCGCCGGCCATACAAGGGGAGGGGAGTCCTA
CAAGGACTCCCCCTCCCTAGGCGCCTCCCCTCTTTAAATAGAGGGGCAGG
GGCACCCCCTCCTCCCACGCTCTCATAACGTCCAATCTCTGCCGCCTCTC
TCCTCCACCATCTTCTGCACAGGCATAGGCGAAGCCCTGCAGAATTCTCT
ACTCCACCACCATCACCACGCCGTCGTGCTGCTGGGATTCCGTGGAGAAG
ATCTACTACCTCCGCTGCTCGCTGGAACGGGGAGAGGAAGGTCTACTTCG
ATTCCGCACGTGTGACCGACTGCGGAAGCGCTGCCAAATCATGGCGCCGG
AAGGATCGTCTACTTGACCAAGGGCGGAAGCGCTGCTGCAACGCGACACC
GGAAGGATCGTCTACTTGACCGACGGCGGAAGCGCTGCTGGAACGCGACG
CCGGAAGGATCGTCCACACGACCTTGAGATCGGCAAGTGATCGACTACAT
CAACCACGAGATCTAATCTCGTTAACGCTTTCGGATCTACGAGGGTTAGT
TCCCATCTATCTCGTTGCTCATGTCTAATAGATTAGATCTTGGCTTTTAT
CTAGATTAGATCTAGGTTTTGTTCGTTCTTGCGGTAGAAATTTTTTTGTT
TTCCATGCTACGAACCCTTCAGTTAGAGCATCTTCACTAGGCCTCCCAAT
AGCCCTACCAATAAGGCTATGTGACTTATCTGACGCCTAACACTAAACAA
CTTCCAGTCGGCCTCCCGGTAGCCCAAATTTGCCTGGTGCAACCCAATGA
GAAGTTCGGAACTCCCACAATTGCCCCAGCCCATAGTGACTGATGTGTTA
GTGTTGCCACGCAGAACCACATCGGATCTAACAGGTGGGCCAACTCTGAT
AGCAACACAAAGCACTGGTAAAGTGCTCAACTTTAGTTGAAATGCGCGCA
ACCACCTCGATGGTTCCTTAGGAGAGCACTGCCACTTCATCAAGCAGCGA
CGACACATCTTACCCACAACTCCTTGTCTCGAAGAATGAGTTTCTAGGAG
GATATACATTTTCTTCCGGACCCTAAGCCCTCCCTCGCTGCCGCGGGGCC
ATTTGTCTTTCCGGCAGCCCCAAGAAGGAGAGGACACCATTCTCTCCACC
GCAAAAGAAGGTGAAGGAGAAGGTGACATACTAGGAGGTGGGTCACGAGT
ATGGTGGCCACTTCATGACCCTGCCAACCCGTAAGAGGAGCCAGGCTTTA
AAAACGCCCTACGTGAATACACCTAGCGGTGGTCGGCATGGAACTCCAAC
ATCATCAACATGGACGATGATAATTACTCTAGTAGCGGCCTATCTGTGTT
CAACGATGACGATGGTTCCCACAAGGCAACGGGATCAACTATAGCACCTT
CTAATGGCGTGGCTAGATTCTAGGAATCTAGGTTGGGCTTAATTTTCATT
TAAAAATATATAAACTTTCCTATGAATTTGAATGAAATTTGCAACTATTA
TTTGTATATGAGTCAACTTTTTTATTTTTGTAAATCCAGGGCGTCGCTGG
TTGCAGCCTCTCAAAATACACTAGCAACTTGAGTTGGCACCTCCCATAGT
GTTTATCGGGCTTTGTTGCATGACGCCCTATAGGGAGCGTCGGTGCTGGG
GACACTAGACTACAAGAACTTAGAAATGACTTAAATAAATAGGAGAACAT
GTCATCCATAGGCATTTGCATGTGTTCGTGTGCCAGGCCATGAATTCTGG
GTGCATCCGTTAGGGAATAATAGCACGGGCATTCTACAACTAATTCGATT
GGTATTTTGATAGACGTTTAGCATGTTGATGCAAAGTCGATTAATATTAC
CCTATTTGACCCGTCATTTGTAATAATCTCTAAACATGCTCAATAAAGTA
ATAAAAGACAGTATGCATCGATTGATGAATAGGCCGTGTACTCCCCTTTT
GAAAAAAAATTGCATGTGTTCCTCCAATGGCCTAAACTTTCCCTATAGCA
TGTGTGAGTCCACTCGCAGCACTTTCTACCGGCGTCCCAAAGCTTAATAC
TTATATTTTTTCCAAATATCAAACTATGTAAAGTTTGACTAAGTTTAAAA
ATATTAATATTTAAATTACAAAATCCATACCCTTTGATACATCATGAAGA
ATATTTTCACATGGTATTTATATAATATCATAAATCTTGATAGTTTTTTC
TAAAAGTTTAGTCAAACTTTCCATATCTTGACTTTAAAAAAGAAATATAA
GCCTTATGCTTTTGGATAACCATGGCCATGGCCATGTCAAACCAAACAAA
ACCATGGCCATGTCAAACCAAACAAAATTTATAGTATGCCCGGGTGAGGA
ATCCTGTTACCTAGTGTAAAGGACTGCCACGGGGCGGATATCGTTTCACT
AGGCCAGCGATCTCAACTCCGAGTTCCCCCTTGCCACATGGCAAGTTGCC
ATGTGAACGGGCACTAAAAATCCACAACCTATTGGTGTCCAAAACAAAAC
AGATTCTTGGATAGTGCCTATGTACACCGAGATTGCCTGACCTGCATGGC
CTAGTATAGATGGTAGTGGGTCACCATTAGGGCACCCTCTACCCTCTTTA
GAACTAACTTTTATGATGACATCATCATTTTGAAAAGATTAGTTTATGAT
TTTAAATTAAAAATGATATAGGGTACCCTATTGTTGACCCACTTCCATCA
CTATGGCCTAGTGTACGCCCAGGCCGGCGGAGGAGCAACGGTTGCCAGAG
ATATATACTAGAGATATAGTCTGTGTGGGAGATGGTGCGTGCATGGTGCC
ATAACCCCAAACTGTTCTACCGCCACCATCAACAAAGACGCCACGGCCAC
ACTGGCAACCACAGCCACATAGTCCTAGGTTCCTGTCGTAGCACTACCAT
CTGCTAGGACATAGGCCCCTCCATGTTGGAAGTATACAAGTGCGACACCT
CCCCTGGCCATGCACCTTGTATTCATATACCCAAATCCATATTCACAGTG
GCGGAGCCATGCACAAGTTTGAATTGACTACACAAGGTTAATTTGCTGGC
TCCGCCACTGCATGATATTCATGTCTTTCTTTTTTTTTAAACGAGGCCAA
AGCTTTGCCTAGTTGGGTGTGGCAGCTGCAGGGGTGCAGTTGGCTTGAGG
GCTTGGCTTAGCTCTGCTTGGCGTCCCTCGGTTTTATTGAGGTCTAGGAT
AGTTTCCACCCAAGGAATCCTTCTAAAACTCTAACAATTGAAGCTAGGGG
TATAAACGGATAGGATACTTTTCTCAGTGAATTTGTTTCCGATCCATTTT
AGAGGATCCTGATCACGTTTGGAGGAACCCGACAAATAAGGATACCCGAT
TCCGAACTGGTCACTGAATATGGTATATGATATGGTATGCAAAGGAGCTC
CCGGATATCCGTGTCAGAAAATTATCCAGGATTATCCAATAGTTTTTATC
CGAACAAGAATCCAATTTTGATCTGAAATATCGAAGCTAATTGAGCATAT
TTAGTAGTTAGTGAGCTACCGAGTTGGTCCGTTAAATGATAGCTAACTTA
CGCACTCGCTCTATCGATTGTGGAGTCCAAACTTGTTATGATACTGGCTA
CTGAAGCATCCGTCGGTATTATCCTAGTCCGTGTTCTTGTGTTATTGCAT
CCATATGGACCTACTTTGTTCATGTGGTTATGTTATATTTATTTATTCTA
TCGCGTCAAAATATTTATTTATCAGTATTTTTAAGCTTGTTTTGACAATT
ATTTTTGTTGTATGGTTTGCCAACCTACTTAGGCATGTACATAATCTGAT
TAATCTGTTTCCGCCCCTATTTCCATTCTGACTCCTCATATATCCATATC
CTTTCTAAAACCTGTCATTATCTGATCCTCTCGAATCCATCGTAAAAATA
TGCTATAGGGTACGGTAACAACAAAATGCAGTCTGATACGATTACATCTG
TAATTTGAAATATAGCACGAGTCGAACTGCAAGTGCGGTTCAGTCGGCAC
CGCATCAAGATCTCCTTGCCCCGCCCTCCCTCCCCAAAGGAAGGGAAAGT
GGAATATAAATTAGTTTATAAATATTTTAACACAAATTGTATCAATCTCG
TAATTATATATTTAGATCTCGTAATTATATATTTAGATGAAGCCATTACA
GATTTACGATGAGGAACCATATATGATGGATGAGTTAGAATATTTGTTTA
TTTTTTGTTGTGTTTTCACATAGGTTAAGCTTTGATCTACACAATGCTTG
AGGACCTCTGGAGTCTCGTACTACATGGAAATTTCCATAGCGCAGTACTA
AATAATATTAGTATTGGGTTTGTAGAAAACATGCATCTTGTGTAGATAGG
ATATATAACGTGATACAATTAAGAGTGAAAAATAATGTTCAAAACTAAGG
CATTCAGTTTGGAAGATTATGTTATGTGGATAATTTCATTCTAACTTGTA
TAACTTATTATAAACCAGGTAGTCTCGTACACACAAAGCAAGCATGCCTG
CTATGGGGAGTTTGATCAAACTATTCAATATGTGGGAAATCCAGCTTCTT
CTGCCTCTCAGCTTCACACTACAAATTTTCTTGTTCTTTAGTGGGAGCCT
TCGACAACGTAGCACCAGCATGTTCCTAAGGCTCTACATTTGGGCAGCTT
ATCTGGGGGCCGACTTTGTAGCAGTTTATACCATTGGTCTTATCTCAAAA
TATGATAATACCAGTGCTGGACAGCACATACCAAGGGAAACACAGGCACT
GACTTTCTTTTGGGCGCAATTTCTCATTATCCATCTTGGTGGGCAGGACA
CCATTACGGCCCTTGCCACGGAGGACAATAACTTGTGGTTGAGGCATTTG
CTGAATCTAGTGGTGCAAGTTGTCCTAGCGGCATATGTTTTTTGGAAGTC
CATTGGAACACACAGCCTGGAGCTTCGAGTGTCTGGTATATTTTTGTTTG
TTGTTGGAATTATAAAGTATGGGGAAAGAACATGGTCTCTCAATTGTGGG
AGCTTTCAAAGCCTCCATAGCTCAGCTGGACAAAGGTACAAGAATGCATT
GCTGACAGTCTTCGATATTGAAGAGGGCAATAGAGATGACTATGATGCCA
TTGTCCGTATAGCTCTGCGTTCGATGTCATATGTTCATGATATCTTTCCA
GGACGTGGCGCGATATCTGAAGAGAGAGTATGTGTAGAAGACAATAACAT
GATCAAGATGGTCAATATTGTTCTTAATGTGATGTATGCTGATCTCTACA
CTAAAGCTCTTATCGTCAGAACAAATGGAGGCATCATTCTTAGATGCATA
TCACAGATGTCGGCTGTTGTGGCTTTTGCTCTCTTCCATGCAAGTGACAA
ACAGAGGTATAGCAAACCTGACGTTGCAATCACGTACTCACTTTTTACTG
GAGGCTTTTTCCTAGAACTATGTGCAGTGTTTATTTCAATGATGTCACCA
TGGACATGGGCATGGTTGGAGGCTCGAAAATGTGACACGCTTGCCAGGTT
GTCTTGGTCTATTTTTTCCAGCAATATTGGATGGCCGGAGGAGAAGCAAT
CGGGGCCAAAGTCAATGGGACAGTACATGTTGTTAAGATGGGTGAATAGC
AGTGTGCAAGCGAGAACATGGAAGCAACAAGTGATGACCACATTCAAAAG
GTTTGCATATTTTGTCCCTATCAGAAGGAAGAAGATATTTTGGATTAGCA
AACTGTTAGATACTGAGTACGTGGTTGTGGATAAGATGACTATGGAGTGT
GTTTTACAGGAAATTAGTGTCCTACGTGATGAATTCATGCATGGGAACCT
GAGAGAATGGCCGAACGTGTTGGGAACAGTTTACGGGATCTTAGGTGATG
ATGTTGGTGTTGGTATTATTTGTCTTCATGTGTTCACCGAGACACATTTG
AGTAAATATCCTAATGATGCAGACATGAAAGCAAATGGTTTTGACATGAT
TGAGGTGTGCCGAAAACTATCCAACTACATGATGTACCTTCTGGTCACCC
ACCCTGCTATGCTACTGCTCAATGTTAGCATTGAAGATCTGGTGGGGAAA
AGCCGGAATCCCAAGAGTCGTGATCTTATACTCAAAGAGGCCAATCTCGA
GCCAACCAAGGAAGTATTGCAGGAGTTGGTTTACATATGGGCGAGGCTCC
TTATTTATGTTGCAGGCCAATCGAGGCCGGAGATGCACGCGACAGAGCTG
AGTAGTGGAGGGGAGCTCATCACCTTCGTCTGGTTGATCATGGCTATGCA
TAAACTTGGGGATGCCCAGCTTAGGAGGATTCTATATACCAATAATGCTG
CCAAAACCGGGTCTGAAGAGATATGCGCCTTCCCTTTCCCTGAAGCAAAT
CGGCCATTAGAAAATAGAAGCCACGGGAGGTAACTGTGGATGTATCATTT
ATTCATTCGTGAAGCAAAGAAGATCCATGTTTAATTTTGTTTATTTGCCT
TTTCTTCTTGAAAGCAGGGTGGCAGAAACAGGCGATTTATGATTTGCTCA
ACTTCATCTGTATTTCGTCTTGAAAGTGTGTCATGGTGTATCTGACTTAC
GTTTGTTGCAGTGTGGGGACGACATTCGTGTATTGTATGCGATCAAATAA
TCACCATGTATATAATGTAAGGTGCCGTATGTTTGTATGTGCGAATTATT
TCAAATTTGATATGTACTTGCAAAATTCCAGTTTGTGCATATGGCATTGA
TATAAGTTCTTTTTTCGACCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.