Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE007007

[Submit comment/correction]

Sequence	AE007007
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE007007
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGGCACCGCTCGCTGCAGCTTCAAACTCGTGCTGCTCCGGCGCCTGGAAC TGGAAGGTCGCCTCCCTGTCACGAGCCGCTCCTTCCTGTGCTGTGTGGGT GCTGCAGCCGCCGGAAGAGAAGAGAAGGGAGGCAACCAGCGGAGGTCGAC GGCGGCGCAGGTGTGTCCTCTGATCGTCTCTCGCGCACTCCTCATCCTCT CGTCTCTCCGGCGGGTACTACAGCGTCTTCCCTCTTCCCGGAGGTCCGCC GCGGCCCCATCCCCAACCTCGCTTCCGCGCGCCCCCTCTCCAATCTCCTC TGCGAGTCGCGCACCACAGCCCCCTCCTATGGAGCCCCGTCACCTCCGTC TGCACCCCATGGCGGATTCCTCATCGCCCACGATTCCGCCTCTCCTCCCG GTCCCTGTTTTTTTAATTAGTTCAACGGCGATATGATTCATAGTTGATCG GAACTAGGGTTCGACGATGGTCTGGACGAATCCGGTAACCATGGCTCAAG GTATTGGATCTAATTTCTTCTCTCCTTTTCGTCTATGCAGTTTCTGGTAC TTCTTTCTCTCCTCGATTAAATGGGGCAAGGGGAGAAAGATTCAGCTGAT GCTGCTCCATCTGATGATAGGAACGAGCTCGAAGTGGAAGGTAATTGCAT TGAATTTATCAGAGCATGTGTATCTGCAAATGCCAAATAATTGGACACGT ATGCATTCCCATCCCTAAAGAGAAGGGGGAAACTCCGGCCAGAGAAAGAT ATAAATTAATTTTAAAATCAAGATTTTCTTCACATAGAATACATTTACGA AAGGAAAAAAGGTTTTCTGTAGACTTTCTCTGTCACAACATAATACCAGC CTTTTTTCATACCATCTACACTCATGTGCCTCTATGATGTAATATATAAG ATGATTGCCTTCTCCCTGTTCCTTTTATTCAGTTAAGGAATCAAAACATC TTGTTCATGATATTTGTTACTCTTGCAGATCGTGTGAAGGAAAGGTGCTT TGAGCAGAGAGAAGCTCTTCCAGGGGAGCCTCGCTGCATTATATGTGGTC GATACGGCGAGTATATATGTGATCAGACCGATGATGACGTCTGCAGTGTC GAATGCAAGACTGCTCTTCTTGCTAGAATTGCCGCTAAAACAAAGACACT AGCAAAAACACCAGTGCACGTAAATGTTCCTTTTGGTGATGAAAGCTTCT GTGTCAGAGATAATAATTTCCCTGATGTGCCGAGTTTGCATGCTAGCCAG ATCGCTTCACTAAGAAATAAACTTGACATTTGTGTCAAGGGCGATGCTAT TCCTGATCCAGTCACGTGTTTCTCTTCATGTGGTCTTCCTGAGAAGCTTG TGCACAATCTTGAGACTGCAGGGTATATTATGCCAACTCCAGTGCAGATG CAAGTCATCCCTGCATCAATAAGTAATAGAAGCTTACTTGTCTCTGCAGA TACTGGTTCAGGGAAAACAGCTTCTTTTCTAGTTCCTATAATTGCACATT GTTCACGGAGGCGGCTGCAGCGGTGTACAAGCAAGCGCGGGCCCTTAGCT ATAGTCCTTGCTCCAACTAGAGAGCTATGCATACAGGTGGAAGATCAAGC AAAAGTGCTCGGAAAGGGTTTAACTTTTAAAACTGCTCTAGTTGTTGGTG GAGATCCATTAGCTCAGCAAATATATAGAATTGAAAATGGTGTTGAGTTA ATTGTTGGCACCCCAGGGAGACTAATTGATCTTCTCATGAAACACAACGT TGACCTCACGGATATTTCTGTATTTGTTTTGGATGAAGTGGACTGCTTAC TAGAGAGGGGATTCAGAGATCAGGTCATGCAGATCTTTCAGGCACTGTCA CGTCCACAGGTTATGATGTTTTCAGCAACAGTACATTCAGAAATTGAGGA AATGGCAAACTCACTTTCTAACAACATGATGCATATTACTTGTGGGAACC CAAGTAGACCAAACAAATCAGTTAAACAAGTAGTCATTTGGGTGGAGTCT AAGCAGAAGAAGCAGAAGATTTTTGAGGTAATGACAAGTAAGCAGCACTT TAAACCTCCTGCCATTGTGTTTGTGAATTCCAGAGTTGGTGCTGATCTCT TGTCTGAAGCAATTACTGCTGCTACTGGGTTGGAGGCTATTTCTATTCAT GGTGAGAAGACAATGAAAGAGAGAAGAGAAAGATTGAGAAGGTTTCTCAC AGGAGAAGTATCTGTTGTTGTTTGTACAGGGGTCTTGGGGCGTGGAATGG ATCTCCTGAAAGTACGTCAAGTTATTTTGTTTGACATGCCAAATTCCATT GATGAATATGTTCACCAAGTTGGAAGAGCGTCTCGAATGGGTGAGGAGGG TATGGCTATTGTTTTCGTGAATGATGAGGATAGGAAACTCTTCAGAGAAC TTGCTCAGGTTCTGAAGACTGCAGGAGCTCCAATTCCCCGTCAGCTCTCT AATTCAAAATTCACCAGCAATATTTCTCTTGGCACTGACAGGAAGAGAAA ACTGAGTTCTCAGGCCCGATCTTGATCAGGATGCATAACAGAGAGGTGGT GCATTTCTTAATATGACACTTTTGTATGCACTGCCAATTATATGGGTTTG TTATTCAATAGTCAAGTTGAATTTTGTAGAAAGACAGTACATCTGTGCAT CCATCTCCCTGTGGATAAGCCAGATATCCGAATATGCAACTTCTGAAATG TATAGGAACTTCCTGTGCCAGAGTAGTCAACCAGTCTAAGATGATTCCTC AGGGCATGTGCCTGGAATGAATTCATGCAGAAACTGTAAAGAAGTTATCA CATGTTTTCATCACAAAATGTAAGTCAAACACACACACAGTGCAGTACTG CAGTTGACTTCACAATGGTCCAATTTGTGTTTTCCTTGATTCATTTCCAA CTTTACATTATTGATTTCTGGCTTAGTTTGTTGTCTTTATGGTCCTGGAT AATCTGAATTATGGGAGCTTGGATTATTCAATTATTGTGAAAATCACTGA ATACTGAGTATTCAAATAAGTATCGTGATTCCAGGTTCATTAGTTCTCAT GAACAATTACATAAGAGTAGTGAGGGTAGTAAACATATAACAATATGGAT CGCGGATAGATGAAGTATCAACAAAAAAATTAATGGGACACATTATTAGT AGCGAAGCACAATATGGGACCACTTTTATGTGGTACTTAGACCTACTCAA AGTGGCAGATTTGATCCTGTACTCCACTGGTTGTTCTTGCCCATGCCAAA GCTATGAAATGAGCTATAAATTGTCTGTTTCTGACCAAATATGATGTTTC AACCTGAAATTTAACATTTGACGAGAACTGTTCTAATAAATGTTGCTCTC TTGGACTTTTTTTTATAATATCCGATTTATACCCTCACTGAGAATATTCA TTATTTTGTTTACTTTCTTTTTCTTCCTGCATACTCATTTTGTTTAGGAA ACATATATTTTTTATTTACTAAAACTAAATTCTTCCATACTACAATGGTG AACTAGCCATATAAAGCGAATTGGTGGAATCGTCCTTCCACAAGCACTTC AATATTGTCGTGCAAGCGGATTTACTGTACCGGGACATCTTTTTACAACT ACAATGAGTTTCCATTTTAACTACTATAACAACTGGTTTTCACTGGGCAC CTGATTTTAACAATTCACATTTAAGTGGATCACTCGGTAATACTTCCATG TTACATTTGTTCAACTTATTCTGGCATTTCTATCATGTGGAACCATCTAC CCATTGATGCTGTATGTACTGTAACCATAGTACATACTCAAATCACATGT ACGTCTGATCTTACTTAAACCATATTATGTAGATCTAGCATACGCGTAAT TACACTATCACTAAGTAAGTAACTTGATCTGATATGCTTTACAGTCTTAA TTAAGATGGCTTCACTGATTTGTTTGAATAGTATTGAAGCAAAGGGTAGA GTTAATGTCGAAGGAATAAGATTAAGCCTGAACCGTTTTTCTAGGGTTAG GGGCTCTGGCGGCGCGTGTGGGCGACCAGGAGGCGATCTACCGGCGTTCA GGTCCTGCACGGCACACGGAGGCAATCTACACCACGTCTTGGATCATCTC CCGCGGGATCTGCCATGGTGGAAACGCGGTCAGGGATTGGTGCAAGCCTG GGGGAAGATGGGGACGGAGAACGAGTGATCCAAGGGGTCACGTCAAAGCT GGCCAAGCTTGGTCTAACCGCCAAGGAGAAGACGATCTTGGTGATGGAGG ATGAGAAGGAGGATGAAGGGGCTCCAGTGAAGTTTGCAGTGATGGGCAAA GTTCTGTCAACAAAAAAATTCCATATTCAGACGATTGACAGTGCGTTGCG GCCGCAGTGGGGAAACCCTAGGGGTCTGTCCTTTACGGCTAAGGGTGACA ATGTCTTCTTAGCTAGTATGGACTTTGAGAGAGATCGGAAGCGCATCTGG GAGGGGGCACCATGGACAGTATCAAAACATGCAGTCGTCCTGGATGATTT CGATGAGAGTATGAAGCCATCGGAAATCAAATTCAAGAGACTTCCGATGT GGTTCAGATGTGATGATCTGCCGTTTAACTGGATGAATGAAGCTCGTGGA AAATCTATTGCTAGCCAGGTTGGAGAATTTATCAGGCTAGATCTGCATGG CAATGGCTCCAGGTCTGGTTGGGGGCAGAGTCTGCGTGGTAGAGTTTGGA TTGATCTTGATGAACCTCTTATGAGGGGGTTCCCGATTGAATCTAAGAAG AGGAGGATGGTAGAGTGGTACCCCATAAAATATGAGCGTCTGCCATATTT CTGTTTCTCGTGTGGGAGAATCGGTCATTCCGAAAAAATTTGTCCAACTC CCGCTGAAAGAGATGAGGAGGGCAGTTTTCCATATGATGCCTCGCTGCGC TACCAGGATCCATGGAAGCAAGAATCTTATGGGCAGCAGGCAAGGACCAG AGACGACACAAAGATGCATTATCATAGCCGGGAAGGTGACTCTAAGGTTC AGCGTGATGGAACCGCTAAAGCTAATGGAACTGACCCTGGAAAAAGTTTT GATCCTTCTACTAGCCATGTGAAGAATGTGGTATTGAATTTTAACTTTAG GGCTACAGGAGGGGCTCGTGATGGAAGTGCCAAAGTGTACAAGAGGAGGG AGATGCCGAAAGCACCGCTGGAGATTGTCTTTCCTGCTATTAAAGGCCCC AACGATGTCGTCATGTTTGAAGATGATCCAACGGGCAACAAGCGAAATGC TCTAGTTAATTCTCCAAGTAAAGTTTCTGGTATTAGTATCCCGGCAAAGC GAACTAAGGGCACTGGAGATATTGACGAACAGCAATCCGAGTCTGATTTT TTGGCGGAGGCTGAGAACCAGCCCCGCCTGGACCAATGAGTTGCATAGGC TATAACTGTCGGGGGCTTGGGAACCATCCGACAGTTAGAGAACTCCGCAA TGTTATTAAGCGGGAAGCGCCCTCTCTTCTCTTTGTTATGGAAACGAAGA TTGGAGGTAAAAGAGTGGAAAAATTGGCAAACTCCTTGGGTTTTGGAGGG AGTTTTGCAGTGAACAGCGATGGACTCAGTGGTGGTATTGGGCTGTTCTG GAAAGCAGATATGGTGGTAGAACTGAAGAGTTTTGGTTCCAATCATATTG ATGTCCTTATCAAATCTATGGGGAATGATGAGAAACCATGGCGCTTCACC AGCTTCTATGGTGAACCCAGGAAGGAAAATAGGAATCTGAGTTGGACGCT CTTGAGGCGGCTAGCTCACTCTCTAGATTACCCATGGCTGTGTGTGGGCG ACTACAATGAAACGTTGTTCGCTAGTGAGCACTTTAGTACCTCGGAGCGC CCGGAACCTCAAATGTGGGCGTTTCGGGAGTGTGTTGAAGATTGCAATCT AACTGATCTTGGCTGGATGGGACTTCCCTTCACTTGGGATAACAGACAGC CGGAGGGATCGAATGTGAAGGCAAGACTGGATCGGGGTTTTGGTACGCTT TATATGAAAATTTTATGGTATCCCGAGCCCAGCACTTGGGCATGGTGGAG TCTGACCATAGTGCCATTCTTATTCGGATGACAAGAAAGAATTTAAGTGC TGGCAAAAAGAGACAGAGAGTGTTCAGGTATGAGAATGTCTGGCAAACGC ACACCGAATATGATCAAATTGTTCAAAATCTGTGGACAGAGAATGTCGTC GGTGGTGGTTTGAGGGGTGTAATGAGTACACTGCAGAATATGCAGAAGGG GCTGGATAAATGGGGTGACAAAACTTTTGGAAATTTCAAGAACAAGTTAT CCAAGCTCAGAAAGGATTTGGATCGACTTAGGGTGAATTCCATGGGTTCT GGCCCAGGCAAGGATGAGAGGGAGGTGATGGCTGAAATTACCAAAGTCCT TACTCAGGAGGAAATATGGATTAAACAACGCTCCCGTGTCCAATGGTTAA AGGCAGGGGATAAAAACTCTGCCTATTTTCATGCTCAGGTGGCTCAGAGG AAGAGGATAAATCGAATTTCCTCTCTCAAGAGAGATGATGGCTCTTTGTG TGTTGAAGAAGGAGAAATACATGAAGAGGTTCAAAACCTTTACCAACAGC TGTACACTTCTCAAGGGGCACCAAATATGGATGCACTACTGTTTTTTGTC CAGGAACGTGTAACAGATGAGATGAGGGTGTCTTTGGATAGACCATTTAC GGAGGAGGAGATCAAGTACGCGCTATTTCAGATGCATCCGTCTAAAGCTC CTGGGGTAGATGGTTTTACCGCGGGGTTTTTCCAACGTCACTGGGAGACC GTGAAATCTATCGTGGTTCCGGCGGTGTTGGAATTTCTGAGTGGGGGCGA GCTTCCAAGTGAGCTTAATGACACATCCATTGTGTTAATCCCGAAGGTTC GAAACCCCCAGTCCATTAAGCAATACCGACCGATCTCCTTGTGTACAGTG ATTTATAAGATTTTTACAAAGGTGATTTCTCTGAGGTTAAGGCCGGTTTT GGAGGGAACAATTAGTCCAGAACAGAGTGCCTTTGTTCCGGGACAACGCT TTGGTGGCTTTTGAGTGCATCCACACAATGAGGAGAAGAAAGAAGGCCAA AAAAGGAGTTTGTGCGGTAAAGCTTGATATGATGAAGGCATATGATAGAG TGGAATGGCCCTTTCTTGAGGCTATGATGCGCAAGCTGGGCTTCCCAGAT CACTTGATAAATCTTATCATGAGATGCGTCTCGTCAATCAGATTTTCAGT TAAGGTTAATGGTGAACTGCTGCCACATTTCAGTCCTTCTCGAGGTATAC GGCAGGGTGATCCGGTTTCTCCCTACCTCTTTCTAATGTGTGCAGAAGGT CTCTCAGCGCTCCTAAATAATTATACAGGGGGCTTTGTGGATCGAGGCAT GCGGGTGTGCAATCGTGCACCATGGATCACACATCTCCTATTCGCTGATG ACTCCCTCATCTTCATCAATGTATCTGTCCAGGGTGCAGATCGTCTAAAC ACTATTCTACATATGTATAATGAGGCTTCGGGTCAAATGGTAAATAGGGA GAAAAGTTCCATTTTCTTCAGTTCTGGAATTCCCGATGACACCCGTGATT TGGTGAAACAGGAGCTGGATATAATGGTGGAGGCCTTTAGTGAGAAGTAT TTGGGTCTACCTACGACAGTGGGCAATCTCACTAATGAGGACTTTGTGTA TATTTCCGATCGCATAAGGAGTAAGATAACTAGATGGGATAAATTGATGT CTTATGCGGGAAAGGATGTGATGATCAAGGCAGTGCTACAGGCTATCCCA ACCTTCAGTATGAGTTGTTTTCAGCTTTCAAAGGGTACTTGTCAGAAAAT TGTATCCCTTATTGCGCGATTCTGGTGGAGTGGCTCGTTGGATAAGAAAG CTATGCATTGGCTTTCATGGGAAAAACTTGCGCGACCGAAGGCCTCCGGC GGGATGGGTTTCCGTGATTTGGAGCTATTCAATTTGTCCCTTTTGGGGAA GCAAGGATGGAGACTGCTGACTCAACCTCAATCCTTATGTGCCCGAGTTT TGAGTAGCAGGTACTATCCAAGTGGCGATTTTATGTCAGTTACCCCAGCT TGGACTGCATCAAAAACCTGGAGGGCAATCCTTGCAGGACGACAAGCACT TGAATTGGGACTGTTAAAACGGATTGGTGATGGGTCTACTGTGTCTATAT GGCAGGATCGGTGGATCCCTGGTTTGGCTGCTAGCCGCCCAATGGGTAGT TTGATTGACACTGATGTTGTGACAGTTAATGAGCTCATTGATCCTGTGCA GCACCAGTGGAGAACTGAGAAGATACAGAAAATTTTTCTAGCCCCGGATG CTCGAGCGATTTTGCAGATCCCTCTTCGGAGGAGTGTAGGAGAAGATTGG CTAGCGTGGCATTATGAGAAAAATGGAGTTTATTCTGTTAGATCGGCCTA TCGTGCGCTGTTGTCAGCAAAGGAGGGTAGAGAGGCAGCGATCACTAATG GAGTTGGACATTCTAGTATGCACAATGATGAAAAATGGAGAAGACTCTGG AAGTTGGATGTGTTACCGAGAGTACGAGTTTTTTGGTGGCGGGTTTTGAA AGGCATCTTGCCGGACTATGCAACTCTCACCAGGCGGCATGTCAGAGTAG ATAGTACATGCTCGGTATGTAAGACAACATCAGAGACTTTGTATCATGCA TTGATGGAGTGTGGGCATGCGAAACAATTCTGGAGAGCTGCCCGAGACAT CTTGCATTTGAAGTTACCGAATCTGCATCCCGAGACTTGGGCAATGGACA TCTTATGTGATGCTATGTTCAGTCAAGGGGAGCGAGAGAGATTGATTTCC ATAATGTCAGCAATTTGGGATTCCAGAAATCGATGGACGCATGAAGATAC GGGATATGACCCTTCTAAAACACTAGAGTCTATTGCTGAGACATTGGGTT ACCTGGAGATGAAGGTCTCTAAGGGGGGAGCTAGTCGACCACCATGTACC TGGCATGGCCCAGGGCCGGATGTTATAAAACTGAACTGTGATGGTGCAGT TAGAGAGGAGCAGGGTTTTGCAGGAGGTGGAGGTGTTGCGAGGGATGCAG GGGGTTTTAGGGCCGCGTGGTGTCATGTTTACCACGGCATCTCGGATCCT CTCTCTGTCGAAGCACTTGCCTTCAGAGATGCAGTTGCTTTTGCTAAGCA ATATGGTTTTGTGCGAGTCATTTGTGAGTCAGACTGTGCAGAGTTGGTGA ATCTATGGAGAGGAAGGAAGACTCAGCGCTCGGCTTTAGCCCCTGTGTTT AGTGAAATAGACGAGATGAGCTCCTCTTTTGAGCTCTTTGAGTTTAGTTT TGTGGGTCGTAATGCAAACAAAGTAGCTCATGAGTGTGCACGCTATGCTT GTACACATGTAGAGAGTAGGTCTTGGGGTGAACCCCCAGATTTCTTAGAG AACAGTCTTAGGACTGATTGTAATCCAGACCAAAGCAGCAGGTTTTCAGA CGCACTCTTTTCCTTTCAGGGTACCGAAGGGGGCTGGAAGGTTTTTAATG AGGCGGGCCTGTTTGCTTAATTTTAATATGTTTTTTTCCAAAAAAAAAGA GTTAATGTCGAAGGACCACCAGAGCTATCTTGCTGGACATATTTAATTCA TGCTTTTGCAACATGGGAGTTCCTTGACCAGCTAATGTGGTACCAGAAAT TATGGAACACATAATTCTGGAAATTTTGGGGTAGACAGTCATATCCTCCT CTTCTGAACAATGAGGATATAATTACCTAACTAATTCACTTATTCTTGTC TTGTTCAAAATTAACGGTACTATGTGTTTGTCATGCTAAAATTTCTTAGT TTGAACTTTGATGTATGCCGGAGTGATCCAAACAGATCGGCAAATTGACC CCCTAGTACACATGCATGTTAAAGTCCACCATTATAAGTTGTATACCTTA GTAATTAGCAATTAGTATATAACACTTATCAACCTTGTATATGAAAGAGG CAAAGCGAACCTTCGAACTTTGGTGTTGTTTCTATAGGATCCTGCCCTTC TATTCTGTTATTGTGCATCAAGAATGAAGAGAGGTGTGTAGTGATGCTAC ATGGTGCTTGTGCAAAGGGCAGGAGGTGATTCGGAGATGATACTACATGC ACATCATTGCAAATGTTGGCAGAAGTCTGAAGAAACAGGCGGAGAAAGCT TTTGCTTGTTGCTTGGAGGTTCCCTGTGAGGATGGAATCTGTGAACTACT ACAGCCTGCTGAATGGAACAAAAATCATCAAACAGACCTTCATATAAAAT ATGTGAGTAAGACAGACAGACATAGGTAGGCGAAGAGACAGTCGGTCTCC ATCCAAACATTTCCATATATGTATGGATAATGACTAAAAAAGTAAGCAGC TTAAGTATCTTAAGAAAACTTGTGAAATGCCATTTATTCCATGACCTAGT GACTCAGCACAGACTATGGTTGGCAACTTTTTTCCATCTATGTTATTATT TTCTTCTTTCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.