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GrainGenes Sequence Report: AE027630

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Sequence
AE027630
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE027630
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGAAGTGGCACAGCCGTGCCCCCTGCCGGGTGCCCGGATGGCGGCGCTA
CAGAAGCAGTTGGTCGGCACAACTGGTACTGAACTGTTGCTTCCAAGAGG
AGAACTAGCTAGAAGAAAGGTCAAGGCGAAAGTGTGGAGGTGCGATGGTG
GAACGCTGGAGCAGGTTGGGTGCAGGGAGACGATAGGTAGCAGATGCGTA
TGCTGGAGTTGAAGGGTATGCAGGCAGGAGGATGGGAAATATATAGAGAA
GGAGGTCAAGTCACCCCAATGGATAGGATCAAACTAAAATAATCGCTGTG
AAACTAATAACAACTCGTGATCCAGATCTCGTGCTGCCTGGCTGGTCTTC
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TCTGCTAAACAGCCAAATTCAGAAAACAGATTATTGAACAATTACATCAA
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GCCCGCCTCCGTCCCTGCCTGTGCTTGTCTTCTTCCTTGCGCCGGTATGA
CTGATCTCGAAGGACCTCAGCGGGGTCTCGGGGATAGGATGCGGATGAGA
TGGGAGGCATCTCGACCTCCAAATCGTAGCCGCGCTCGGGCGGAGGTGGC
GGTGAAGTGCCTCTCCCTTGCAGGTTAATTCTCCAGCGCTGCTCCATCGT
CTTGCCTTTCTCTCCCCGTCCACTTTCTCGGCAGCAGGCGGTGGTCGAGC
TTTAGTCTAGCAGTGTCGATGAAGAGGAGAAGGATGCTTCGGTGGTTTCA
GCGGCGGTGCGTGTGATGGGTATGTGGCCGCCATGAGGAATTTCTGCTCC
GCCTCTTTGCCACTTACACCTCTCCCTGGCTGAATCTCTGCCTGGTCGTG
ACGTGTCATCCACTCCCATGGGTACTCTGTCCCTCTACCTAGTTGTACTC
TGGTCGCGTTGGTGCTGACGCTCCTCTCAATAGCTGGGATGGTGAGGGTG
ATGTATATTTTCGAATTTTAATGTTTCTGCACTTTAGTATGGCATGATTC
ATCATTTCTCGTTTGATTGATAGGAGCTAGCAGCATTTTCATTGATCAAT
ACAAGGCTTTTGCCAACTGTTATCTTTCCCGTTTACATCAGTTGATAGGT
CATAGAAGGTAATTATGGATTCCACGTACAAAATTGAACTCGTTACATAC
CTATGAGTTGTACATATTGTACTCTGCAGGTTAGGCTCACAGGTAATAAC
TAATAACTACGTGCTTGTTGAAAGTGCTGATACGAAGTAACAAATAGCTT
TTTCTGTTTCTGATAATTTTCATGAAGTTTGTACATAAGATAGTCTTTTT
TTATCAAGTTAATGGTAATCATAATTAATAACATATATGCTAATATAGTT
TTGCTACTGTTTGCAGGTCACGCACAAGGCAGTGTCTTTTGCCTTCAGCA
TATTGTCCGCTGGTCATGTTACATATGTAAGTAAGATACTACAATATGTG
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TGGTATTGCAATGTCTTTATGTCCATCTATTTTTCTGTCTGTTCCAGTAA
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ACATGTATTGACTGAAGCTGATACTCTCTTTCTTTACCATGCTTCATTTT
TCTTCACATTTATTATGAATAACTCACTGAAGATTGTTTAGAGCAAAGAT
ATGCGTTACGCTGACTGTGGTTTCTCTAAGTTATTTTCAACTTGGACATT
TTGCCTGCCTAGGAGCCTCCACAGCGATTTGGGTGCCTGGACCGTCCGAT
CTGGCAATCTAATGGTCTGCAGTGAGTTACTTAGTCCCGAAACTTACAGC
GATGGTTTAGTTCTCTTCGTCGTCGCCTGGAGGTGTCCAGCCTCGTTGCT
GGGCTGCTGCTCCACAGAAGGAGTTGGACGTCACCTACTTTGTCGGGCCG
TCGAACTATTAACTGGGCCGAAAATTTCTTCAAACAGGTCGATTGCTCAC
TACGAGATCCACTTCCCTTCCTGGTCACGGCCCTTGCGGTCGATGGAGAT
CGAGGCGATGTGGTTTTCACGCACGCCGATGCAATCCTCCGCGCCTAGTG
TTGTGGGGGCGAAGCGGCTGCCGAGTGATGCATTGCGGTTTCCAGAATGA
TCAATGGAGTTATGCGTTACCGTCTCGCCTATTTCATGCGCTGCTTTGTT
TTGTTGCCTCAGGATTCTCCGCCTCATCATCATGTCCCCTTCCCTCCTTG
TGGGCAACAAAGACTGTACGCCCAACATAGCTCTCACTCATGGTCGATGG
TGAGGCGGCGGAGATGGTGGGTGCGAGGCGGCGACATGAAGGTATGTCTG
GCTCGTCCCTTACACAATAGGGTGAGGCGCTCCTGCTGGCGCGGGGAGGT
AGTCGAAGCCATAGATTGGCAAGCCAGATTCGAGCATGGTGGCGGTCGGT
GAGGCTGGAGTGCGGCCATGACCTCCATCTCGGTAAGTAGCTATGTAACA
CGAGCCTTCCATGTCTACAGTTTTTATGTGCGATCTCCTTTTTTGTTTCT
CTAGCAGCCAAGTTGTTTACCTAGGTAGCTGGCCTCATGTATTTGTGCGG
ATCTGCTATGTATGTTGGACTCGCTCCCCAATTCCTCCCTTCATGTGGTT
TCATCATGAGGTCCAAGATGCAACTATTCAATCTGGTTAGTGTACAAAAA
TGTCAATGGTATCCACGTATTATTTTTATTTGACATATAACGGGAACAAG
TTAACATGGGCCAAATTATGTACATCATATTTGCTTAGAGCACTATGTCT
CATAAGTTTCAGCAGAAATTCCAGAAACTGATCACAAGAATGAGAGAATC
ACCCACCGCCAAATAATCCAGGGAGGCAAGGCTAGCCCTGGGGAATGCCT
GCTGCAGCGCTGCTTTGTGTCGAGGTCACTGATCTGACCTTGCCGTCAAT
AGAGAAGCCTGCTAGCTTAATGACCAATTGCCCATCTTCCGGCAGTGGGC
GATGAGGAGGAGGAGCAGACCATGCTACCGTCAGTGGCTTGGGGACGCAA
ATGAGGATAATGAGGAAGCTTTGCCAAGTCAAGAGAACACGGTGCAAGGT
AGCTGGCCCTGGCTGCTCACCTTTCCTATCTTTGTGACCTCGCTCTCCAT
ATGTTTCCTAACTTACAGATTTCTCCCCCATGAATTGTTTCTATCTGCTA
ACAAATTGTAAAAAAAATGTTTTTTGACATGAGTACAACTGACTGAGACC
ACAGAGTTATGGTGCATCTGATTTATTCCTTTGGCCTTATGACCAATCAG
AAGGCATCTATGAGAATGTTCCATGGAAGACAAGCGACTAATTCTTATAT
GCCTTAAGTGCAAATGGATATTTGTTGTACATATTGCTGGTTCCAAAAGT
GTCTTGGACAATTCTACGATATCATTTGTATTGTGACTTGTCAATGATCT
GACTATCCTCTAAGCTTCTTAAGCTCCTAGCATGTCTACCACCATTGAGA
AATGATTGTCTTCTTTAGTGAGCAACTCCACCAAATGAAAGAGGATTCTA
AAATATTTTCGAACAGTCCCAAGTACCCTCTTGAATACATCTATGTTGAA
GGTTGTATGTGTTGTTATAACTAGAGTCGTATTTCACCCCCATCTTAAAA
TTAAGTTTGTTAAGTAAGTTGCTGAATAATATACACACTGTTTCTTCAAT
AATAATGGATGCGGCCTGTATGATATGGTTACTTGTACAAATTGTTTCAT
ACCACTTGCCTTTTTTTGAATTGTTTGTTCATTGAATTCTTACATGGAGG
TGCCTGTTCTCATGCATGTCAGCTCTTAACCGATGGCTTAGATTGAGAAA
TTTGATGAGAATTGGTCCAAGAACAGTTGTTTTGTTTTTACTACAAAAGG
TTTTTTCAATTGCTACAGTTGCCTTCATATAAGTACGAATTTATTGCATT
TCTTATTTTCTTTTCTATTTCTGGGGCCGAGGTTTCATTTACATTATATC
ATTGACACTGTATATTATTACTAGGTGTGGAATGGTTCCCCGAAACCATT
ATCAACAATCAGTTAACAACTGGTCCCTTGGTTACTTGAAGGTTTATCAG
AAGCCCACTTGCTACATGTGTATGTTTTTAAAGACATTTGTCAAATATAT
AGTTTTTACTTATCCATGAAGTTTCTAATTGTTAGTGCAGATAATTCCTT
TCCTTTGAAAGCACAATGTTTTCCACCTAAACGGACTTGGAGCTAGGCTT
GGAAATATTGGTCTCCTGGATACACATATGTTTCAATGTCTGTTGAATTA
CTTCTCACTGAATTTTACATCTCAAATCAAAGAGTTGGGCAAGTAAGTAC
ACTTGCTCTACTTAGGTGCTCTCACGCTATGATGAATTAGGTATCCCAAC
CCCAACCATCATTTAATTTCGAATATGCTTATTTACTATCTGACCTAATT
CCAGTTGGCAGTTGTTAACCAAAATTTAAGTGATGCACCTTTTTTGGCAG
CTATTATACTTCTTGTGTGCATATGAATTAGATTTAAGGTACATACAAGT
TTTCTATATAAGTGAAGGCATCAAGTTAATCCCTAGATATATATTTAGTT
CATGTACAAATTTAAGGTTGAACTGTTACTTATATGGAAGTGGGCTAAGA
TGAGAATAAGAGGCTTGTGATTTTATTTGAATCATTTGCATCGAGGGATC
AATTGAATATGAACACTATATGTCATTTGATTTGAAAAAATAGAGAACTC
CTAGTTGAGCAACTCAATCCTGTTTCTTTAACACACTCTCTGTCTTGCAT
ATTTATGGCCACGGTTGGCTACTAAGTGCAGCGATAAGTTCCTAAAAGAA
GCTAATTTATTTGTCATCTTGGTATCCTGTGTGGGAAATTGCTTATCTTA
TTTCTGCCTATTTTTTGCGAGTTATTTCTAGCCCTAATTGTGTTATTATA
AGCTTGCATTGAAGAAAGAAAAGTCCCTTCCATATGGACTCGAGAATTTG
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GCTACTATCATGTATCCGATCACAATGGCAACGATAATTTGCCAATCATA
ACAATAAGCGGTAAATGTATTTGGAAAATTTGAACGCCATTATTTTATAC
CTTCATATTTACAAAACCTGCTATCAGTATATAAAAATAGGACGGGCACG
GCAATACGCGCTATCATGGTCTAGTGCGTCTAAAAAATAAATGGCCTAAT
AGACCTCTAGCGATGGTGTATAAGAGGAAAGCCAAAGGACGTTTCCGCTG
CACTACACGCTTAGGAAAGGAACCGTCAACCGATCAGGCCTTTTGGAACC
GATCCTGCGGCCTTTCTAGCGAGTCAGCGACCCTGCTCCCAGGTGGCCAG
GCCGGCGAGGCCGCCATCAGCAATCAGCAAGGCCACGGTGTTCAGCGATT
ACCGATCAGCATGGATTAGACGGTTATTCAATCGGGGGTCTGATTCCAAT
GGTAAAAAATCAATCTACTTTTATGCAGGATCGATTTAGGGCTCTTGTTT
AGTCCAATTTTTTGCCTAATCCAGACTCATCGATTCATCGTATTGCTCGT
TTCAATTTTTGGGCCCTGATCACCGGAATATAAATCTAGGTATACTGAAT
GTTTTATTAATATTACCTGATATTTACCTTCACTTACATGATGCCCAATT
TATACTATTCAATATGTGACGCAAAATTGTTTTTCAGCATTGTGTTTTAT
CATGTGGTCCTCATTGAGAAAATGTCCATCTGGTTCTGCTAAAAGGAAAA
GAGCGAAAGAGGTTAATGGTTTGGCAACGTTATGCATCGAGAAAAAAATT
ATTGGATGACATCAACATCGAGCCCATCACAAGTGACTTTGCATGATTTT
TTAAGGTAATATGTATAAATTGTTTGATATGTTTATTAGTTTTGGATGCA
TTTAAGTGTTATTATAACATATGTTTTATGCGTATAATATTCATTAGTAT
TATTGTGATGTTTATATTAAGGGTTATTAAGGGTCTCAAGTTTTGATGTC
GCCCCTAGGCCCCTAAAATCTGAGGACCACCCTGAGACTAGGGTGCCTAT
ATATTTATCAAATGAATCTTGGAAGGAATCGTACTAGACTAGAACTCGGG
GAAGTGTCCAACACTGAAGGGAGTTGCAAAGCCAGGAAACCCGTTGGAGA
ATCCTGTTTCCCGAGGAGATCGTCGATCGATATTAGGAGTATAGTAGCTA
GGGACACGTACCCATTATTGGGGTTTTCGTTCGCCATGGCGCAGAACCCG
GCCGCTGCATCAGCTAATCACGGCCAAGGCCTCCGGCTACCGGAGACATC
GTCGCGTTGCGTCATCGATGGCGTGACCCACAATTTCGAGATAACCAATT
GGACGCTGCTGGAAGGCATGGGCGCCGGAAACCTCGTTGCCTCCAGCAAG
TTCAGCGCCGGCGGCTACGATTGGAATATCAGATTCTACCCAAACGGAGA
TCACAGAAAGGATTCTGCCGGCTATGGGTCAGCCTTCTTGAGTTGTCTCA
GCCTGCAGGCACTACGGGAAAATTCGGCGCTGCTGTGCACTGGGGCTTTG
CCGTATGCCAATGCACGGCAAAGATAATCAAACAGCACGACACACTACAA
AGAAGTGTTGCACGGCGGTACGATAGAGGATACACGGTAGAAAAATCCCT
CACGGCAAAGCCCAGAAATAACACACGGCAAAAAAGCTATCCACAACAAA
GGCCAAAAAAGGCCCACGGTAAAGAAATCGCACGGCACACCATTTCGTAG
GGCCCACCGTTTCGACGCAGTTGATGGGGCGTGCTAACGGCATGGCTTTG
TCGTGTGCCTCACTGCAAGACACGACATAGTTTTGGATTCTAAATTGTAA
ATATTCTCGCAATTTATTTTATTCAACGCGTGAAATATTCCTGCTCATTT
TATTCAACGAGGGACGTTCTTTGTCATGCACCCTACACGGCAAAGGCTCC
TTTGCCATGCACAGGGCACGGTAAACCCTATTTTTTCCCATTTCCCCTCT
TTTTTGCCTCCATTTTCTTTAAGCATATATTTTATCTCAAATATCACCCA
TATTGCATCTATGGACACTTTAATTATATGGTTTGGCCAGCCCACTTTAA
TTATGTGGTTTTTTGGGATTTCGGTGCTCCAGCGGTTGTCTCCCATCGAA
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TATACCCGCAGCGGGACATTTTCACCTAGAGTTTCAGGAATCTGAAAAGT
GTTATCGTCCGAATGTGAAGATGGTCACACCAGGGAGCTATGTATTCTAT
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TTTCCTAGGTTCACGTGCAAGGTTTCGCATTCGTCCCGCGTGCAGGAGGG
GAAAAGACGAGGGGCCGCGCGCAGACAACATCGACGAGGCACCGTGCGCG
CCTCTGCCTTGCTCGTCCCGCGTGGCCGTGCACCTTCACCTCACTCGTCC
CGCAGAGTCGGCAAGCCCCCTCCACCATCTACGGCCTGGCGCAGTACCGC
GACGACCACCGACAAGTCCCCCTCCACCATCTATGGCACTACGCAGCGCC
GCGGCAAGTCCCCCTCCGCCGCCGGCAAGTCCCCCCTCCACCGTGGAGCA
GGACACGCAGAACGCCACCGGCTCGCCGCCGAGGCCGGCTAGACCAATCT
CATGTCCCCGCGTCACCGCCGAGGCCGCGAGCAAGGGGCTGGAATGGTGC
ACCAGGGACATCACGGACGTCGATTGCGGGCTATGCGTGGGGCAGGCCCT
GCCGTGCAGAAAGGCGGTGATGTTTTTTTTATTTATACCAACGAGTCTTT
GCCATGTAGTTTGTCTCTCCTCGCACACGGCAAAGGGGCCACGAAAAACA
CACGGTAAAGGGGCCAAAGAAAATACACGACAAAGACTTTGCTGTGCACA
GTACACGGCAAAGAGTCCACCACGGCAGAAGACAGCTGCGCGGCGCCGAT
CTACGCACGGCAAACTCGACCGGTGGGACCCATGCGCAAAACGCACGGCA
AAGGCGTGATGGGACCCACTGTCACGGCGTCGTCTCGCTCGTGGTAGCGT
CAAGTTATTTGTGTGTGCCGTGAAGGGCTGCCTAGCACACAGCAAAGCCT
TCGCCGTGTTAGGCACACGGCGAAGACTCCTTTGCCGACCCGATCTTTGT
CGTGCGGTCAAACACGGCAAAGGCTTTGCCGTGTTTATTCGGGGCTTTGC
CGTGTCTGGACTGTGACACGGCAAAGAAAAAAAGTCCGGTAGTGAGGCCA
AGGACAGCGTGAGGGCAAAGTACAGCTTAACCATGCATGCTGGACGATCA
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AAACTGCTCTCTGGGGGTTCCCAAAATTCATAGGGAAATCGAAGCTGAAA
TCGTCACATCACCTCGATAGTGGCCTCCTGTCCATAAGGTGTGTCCTCGT
TGTGATCAAAGAACAACCCACTGAGTGCAACAAAAATCTTATTGTGGTTC
CTACGCCGGAGTTATCCGGTCAACTCGAGCGCACCCTCAAGAACGGGAGC
GGCGCCGATGTCACACTCCTCGTGGGTGGCAGGGAGTTTAGGGCGCACAG
TTTCATTCTAGTCGCGCGGTCGCCGGTGTTCGATGCTCAGCTATTTGGTA
CAATGATGGACAAGAATAAGCAACTTATTTTTTTCGAAAAGGAGGCAGTG
CCCCGGCCTCTGCATCAAAGTGATGCATACAGCCACTTATTTTATTGCAA
AATTGCAAAATGAAAAATCTCACGAAGAGTTACAAAAGGTCTGAGACAAA
ACAGTAAACAACCAACAGCAGTACTAGACCAGCTCAAACCTAAAAAGATG
AGAGACAAAACCTAGGCTAAAGCATCATGATGTGATTCTAAGATCACATC
GCCACCCACATTGGCTGTAAAGGCCCGTGTAACCTTCTCCAGCAAGTCGC
ATCCAGTATGCATAACCTGTCTGCTCTTCGCAGGCTACAGGAGCGACCAA
GTACGGATCCAGTGGGACGCCATAAGAATAACCTGCAAAAAAGATATAGA
TCGATTGTTGTTAAAGATAAAATCATTTCGGGCATTCCAAATTGCCCAAA
CAATAGCACAAGCTCCCACCCGAATATTAACTTTTTCCTTCTTGGGGATA
CCCTTGAGCCAATTCCCAAAAAGATTAGGTATGCTAGATGGTGGAGATAT
ATTTGTAGTAATGTGGATTATACGCCATATGATTTTAGCAAAAGGACATT
CAATGAAAAGATGTTGTATTGACTCGGCCTTGTCATAAAAACAACACCCA
GAATCCCCATTCCAATTTCGTTTTTTTCAAATTATCTTTAGTAAGGATCT
CTTTACGGTACACGAACCACGTGAAAATTCTGATTTTTAGCGGTACCTTA
ATTTTCCATATGTACTTCTTTAGAAACCTTGTGTTTCCATTTATTAAATC
AAGATACATGGACTTGATAGAAAACTCACCACATTGAGTCAACCGCCAAA
TAAATCTATCTTTTTCGTCCGTTAAATTAATTTGCATAAGCCTATTCACC
AGATGCAACCATGAGTTCCATTTGTTACCTATCAAAGCTCTTCTAAAAGA
CATATTCATTGGATTTGAAGATAGAACATTAGATACGGTGACTTGTTTCC
GTAAAGTAATATTATATAGGAACTATATTGTTCTGCTAAAGTAAGCTCCC
CCAGCCAAACATCCTCCCAAAATCGTGTGCTAGAGCCATTATGGACTTCG
AAACGACCTTTGTCTAGATAAACCTGTTTCACCTTCATCAAGCCTTTCAA
ATAAGCAACTTATAGAGGTCGATGACATGGAGCCATCCATCTTTGAGATG
CTTCTTCACTTCATGTACACAGATTCGCTGCCGCCATGTATCAAAGAGGA
TGACGGTGTTGGCACGATGCAGCATTTGCTCGTTGCGGCATATCGGTATG
GTCTGGATAGGCTGAAGGTGATGTGCGAAGATAAGCTGTGCAATAGCATC
GGCCTGAATGCTATCATGAGTACATTGGCGTTAGCAAATCGACATTATTG
TTGACTTGGATTTGTTTAAATTCATATTAGTTGACTTGGATTTATTTAGA
TTCGAATATATCTAGACATGTTTTAGTGCTACATACATCTGAATCTAAAA
AAAATTGAGTCAACTAATATGGGTTGGGGGAGTATTTTTTCTGCACCGTG
TGCAAGTTGTCATGGCTCACAACCTAAAAATCCGGGCTCTATTTTTTGGC
TTGCTGCGCTCGTGCAAACCCGGGGCGAACACACGAGATTAACTTCACTT
TTTAATCGCTGGTCAATTTCGAGCCATATGTTAATATCCGTATCAGTAAA
TTTTCAAAAATAACTCTTATTCTCCTAGTACATTTTTCTTTACGAAATTT
CACAAGAAAATTATTCGAGATAATATTGCTTATCTTTATTGCTCAATCAT
ATTGTTTAAATGAATTGTGATTGAATTTCGTACATCAAGGCACATATGGT
GCCCCTTTCTAAAGCTATAGAATGCTTAGCTAGATTATGAGCTTCAAAAT
CTGAAGCTCTACCCTCATAAACAGATTTGCATTCCTGGAAGAGTGCCTGC
TATCTTCTATTTATCACATTACAGAACCATATTTTTCCAATGTACCTTCT
TGTAGATCAACGATCACTATCTTGCAATCAAAGGCCACACAGATGGCTTT
CTCTAGGGATTTCTATTTCCGTGTCCTTGGTTCGTTAGCTGTACTTAGTT
TTTTCCAGCTGCTTAACTTTTCCTTATTTTTTCCCGTCTCCTTGTCCGAA
ACTCTCACACCGTCTGAAACTCGCTGTCCGTCAGCCTTGCCATTACGTGC
TGACAAGTGGGGCTACGTTCAGTCGGGTCCCGTAGTGGACCCCCTCCCTC
TTCCCATTACGTGCTGACAAGTAGGACCGGTTGGTCAGGAACATATTATG
CTAACATGTGGGGTCGTGCCATGTTGGACTACGTGGGGCCGACTTGTTGG
GAACACGTTTTAAGGGATGTGGTGTGGGACCATGTGTGGCGCGTTTGGTA
GTTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.