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GrainGenes Sequence Report: AE049039

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Sequence
AE049039
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE049039
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATAAAGCAAGCAAGCAACTGTCATTCCCTGCGAAGACTGCCAACACAAAT
TCATCCTACTACTAGCAATGGTAGGAGACCATATTTTTCTTATCACTGAT
TACATAGCTATCATCGTCTGTCTATTTGACCGTAAATTTGAGCTAACTTA
CTATATATGTGCATGTATTAATTGTGTCCAGGAGACGCCCAAGAAGATTG
GCCCGTATGGTTACGGGGCAGGCACTGCTTTTGACATCGACGCCAAAAAA
TTGCCCAAACAACTCGTGCACATCACTATTTGGAGCATTGATGGTCCTAA
TAGGCAAATCAATGCCATATCCTTCATATATCGTGACGAGAAAAATGATC
TAGTCGAGATAGGTCCATATGGAACCATAGATGGTACAAAGCACACGGTA
TGTAACTTCGCATTCATATATGTTGTGTGCTTGCTGCCCTGCATAAATTT
CATACACACTATATAACATGTGCAATTTATTGCTGCCCTACATGTTTTTC
TCTCTCTTGAAGTAATGTCGGAATTTGAATGAAGTGTTTAAGAGGTATAT
ACTAGTCCCTCCGTCCCAAATAACTCTGCGTTTTAGGTTTGATCAAAGTC
AAACATGTTAAAACTTGACTAAACATCTTCAACAAAATAATAATATTTAT
AATATAAATTGTATACAATATAAAAGTATGTTTTATGGCGAGTCTAACTA
TATTTATTACATATTTTATAAATTGATATTTTTTCTTATATTTATAGTCA
AAGTTTATGAAGTTTGACTTTGACTAAACCTAAAACGCGGAGTAATTTAG
GACAGAGAGAGTAATTAACTAATTAATAAGTAACACTAATAGCTTCTTTC
TGCATTCATTGTAAAATTGCGCAGATATCCATTAAGCAAGGTGAGTATTT
GACCGTGGTCTCCGGCTACTTCAACCCATCCCTCACTGCGCTCAACTTCA
ACACCTCTGCGGATGCTAGGTATGGGCAGTTCGGCAAGTGCCCAAACATT
GGAGACACTTCTTTCTCCATTGATGTGGATCACGACTCCATTTTTGCCCT
CTTTGGCCAAAGCGACAACAAGGTCAGGTCCATCAGCGCCTATTCTGGTC
CCCGGGCTTGATCGATCAATCCTTTATATATATCCTATAGGTGTGACCTA
CATACCTAGCAACTACTTGCTGTTAAATAAAATTTGCATCCCGCTAGCAA
ACTGGAGTGCATGCCACAGAGTAGATACTCCATGCGATGGAAGGATCCAT
GGCCTTTGCTTGTTCCATGTAGTATATTGTATTTTACATCGTGTCATGTA
TGCGTGGTTTGTACCTTCCTTGCGCTGGTATGCTTGTTATAATAATAAAT
AAATATTTCAGAATACATGTTATCCCCATGACTAAACGGCTACCATGATT
GGTATATGTTTACTTTTTTGACTAACTCTTTCAGATGTGATGGCAAGTTC
TGACTCCGTTTTCATGCTATAACTTAGACCAGAGGCTCTTAGGACCTTAC
TACGGGGGTGTCGACTATAATGATCTTTCACAAATCGTCAACCATTTCAG
CAACTAGCCAAGCTCGGTAGGCTAGAGAAGATGTGTAATCACACTAATTT
GTAGACGCGTAGCCAAACGTTCTTCCTAACAATCAAGCTGCAGTCTGCAC
AAAGTGAGGTCTAATATACATGACCATCGCTAAAGAGAAATGCTCTTTCC
GGGTCAATGTACACTTCACTAGCATTGAAATAGCTGGCAAGCATGGCAAG
TATTACCGTTTTAGGAACCATGACAATTTTAGGAACCCTGACATTAATCG
ACTAGTGTAACAATGCTTGGCATACTTTCTCTCACACGAATTCAGCGTGG
AACTCTCCCTCGCCTTTCACCACTTATTGAGCCAGAAATCCGGCAAGCTC
CACACGGAACATTCTTTGTGTTCCAAGCACGACGGGGGATGGTCGACGCC
TTCCCCGTCCCCTTCGTCATTATCAATTATGATGTGGATGACGACAATAA
CGAAGCATGCCATAATGCCATTGTTGCCTCCTTGGTGAAGGGAAAGCCAC
GGACGAGAGTGGATGTCGCTGGAAGGGGCACAGTGGGGTCACCAATCGAG
GTGGATTCCGACAATAGTGTCGTGATATTGGTTTAGATGTTGTTTAGGTT
AGTTCGAATTTCGGTTGTGTTTAGTGCGAGTACAATTATTGTAATGGGTT
TGTCTAGTTATATTGAGAAATATGAATAGTTGCGTTTAGTGTAGTAACAG
GGTGTAAGTGCTTCCATTTTAGAAACTGTAACCATGCCATTTGCATGCGG
AAGGATCCACGTACATTACATGTAATCAAATCACCAAAGTCAGATTACAA
CCATCGGACGGTAGTGGCAGGATGGAAGAGAAGTGGTGACACTTGCTTCG
AGGGGAAGGAAGAGAAGTAAAGGGGACGTGACACTGGAAGGTGGGCCCAC
CGAAGACGTGACACGGACAGTCGGGAGCACGCGATATTGCCAGTTTGTCC
GGAGCAAGTGGACTTTGCAACATGACAACAAAAAGCTAATGCGAGTAATT
ATAATCTGCCTGATAAGTAAACTCGTCGAATTCTTAGGGAGTACTAAAAA
ACTGCAATTGGGATACATTCACACAACACGTGTATTCTCCATACCGCTTA
AGTCATACACTTAACGATAACATAAGTACTACAACTACCTATCTGTCTTC
TCGATACAAATATAGAAATGTATCTGCTTGAACAGTCCAGCACCGAAAAG
GTACTGAGATGGCACACATAGGAACGACCTCAGGATGCAAACTCCACCTC
TCACGGCGTCGGGCAGGTTGGCGCCTTGGTTGTCACAAGCATGGTATCGG
CCGGCAACGTCTAGGCATTCGCCCACATGCGCACCATGTACAGGGTCCAG
ACGCTCGAGACCGACCTGGCGCATACCGCACACATGATGGTGGCCTAGCT
TTAGTTCCCGGAATGCAGGCGGAGATGGTCAGGACGAAAACAGAGCCGTC
CCCCTCTCAAAAATGAGCCGGCGGCATGCCGGTTCAGGGAACGGCACCTG
CTCTTGGAGAAGTTGGGCGTGGCCATACGAGATCCGAATCAGTTCAATCA
AGTGATCCTCTGCAAGGTGGACCACGAGCTCTGCCAGCGGGCTGGTGTAG
TTGCAGCCAGGCTCCATGCGGGGCACGCGTCGTGCAGACTCGCGAGCTCG
TGGAGCAGTAGATCCTAGTAGGAGTAACAGCGGAAGCACATCCTAGGTGG
GAGCACATAAAGCGGGTACGTCGCTAGGATGTGGCACGCGATGATCTCCA
GATTCTTGGGTTGTAGTAGCTCGCACTCCTTTGGTAGCTCCCACATCTGA
AGTCCATCGAGAAGTCGGATAAAAGATCCACGGTTAGTTAAGCCAATAGC
AGGAATATGTAAGATAAATTCAAATGCTTGTAAAATGACATCTTACCTAA
ATGTAGGGACCCTAAAGTTAGCGACTGTCGTCCAGGCATGGTGCACGAAT
GCCGGTGGCGTCGTCCGCGCACAGGTAGTGGGGTGGAGGATGGGGCTATG
GAGGAGACGTGCTCACTCACGAGCTCTATGATACTACTAGTAGGCTAGAG
AGGAGTGGAAGTAATAATAATATAAGTGAAAAGTAAGCGCGGCCAATCAA
TTCGCAGAATAGTCTACTCGTGGATCGCTCTTACAAAGAACCATCCTAAT
CGTCCACATGCCCCAATCGAACGGTCTGTAACAATCGGGAAAGACAACAA
GTTCTTCGCGGGGGTGGGCCTTGTAGAATACTCGATCTAACGACCAACAT
TCGACGCGCCCGATCGAACCGTTTGTACCAATCGGGTGTTCTTTTTCTAA
ACAATTGGACACATGGATCCACTAGAGTCATTGCATGTGCTCTTTTCCTA
AACCACCTTGATCCACCTGTGTCATTGCATGTGTTCTTTTCCTAAACCAC
CTTGATCCACTAGTGTCATTGATCCACATGACCACATTACATGTGTTCTT
TTTCCCAACACCATCATCCACATGAACACACATACTCTAGTGGATTCTGT
GATGCAATCTCTACCACATTGGTGCAACATGAATGTGGAGGCTGCTTTCT
TATGTGTTTTTGGTCTCTGTGACCATAGTTTGACACATGGAGTGTCACTT
CATGTGTTCTTTTCTAAAACTACTATGATCTATATGACCACACACACTCA
AGTGGATTCTGTGATGCAACCTCTGCCATGTTGGTGCACCATTCCATTTG
GAAGTTGCATTCCTATGTGTTTTGGGGTTTCTGACCATGGTTTGACACAT
GCAGTGTCACTGCGTGTTCTTTTCCAAAACCACCATGATCCACAAGAGCA
TACACACTCTAGTGAATTTTGTGATGCAACCTCTACCATGCTGGTGCACC
ATTGCATGTGGTAGTTGCATTCCGATGTGTGTTTGGGCTTTCTGACCATG
GCTTGACACATGGACTGTCATTGCATATGTTCTTTTCATAAACCACCATG
ATCCACGTGACCACACACACTCTAGTGGATTCTGAGATGCAACCTCTGCC
ATGCTAGTGCAACATGCAATGTGGAAGCTGCTTTCCTGTGTGTCTTTGGT
CTTTGTGACAATGGTTTGACACATGGATCCCCTAGAGTCATTGCATGTGT
TCTTTTCCTAAACCACATTGCTCCACTAGTGTCATTGCATGTGTTCTTTT
CCTGAACCACATGGATCCACTAGTGTCATTGCATGTGTTATTTTCCCAAA
CCACATGGATCCACATGACCACACACACTCCAGTTTATTCTATTATCCAA
TTTTTGCCACACGGATGCAACATGCAATGTGGAGGCTGCTTTCCTATGTG
TTTTTGGTCTCTGTGACCAAGGTTTGACACATGGAGTTCCACTTCATGTG
TTATTTTTCAAAACCACCATGATCCACATGACCACACACACTCAAGTGGA
TTCTATGATGCAACATCTGCCATGCTAGTGCACCATTCCATGTGGTAGTT
GCATTCCTATGTTTTTTGGGGCTTCTGACCATTGTTTCACATTTGGAGTG
ACACCGCATGTATTACTACGGGCAAAGTATCCGTGTGTCCTTTGTATGAA
CTACATTCATTTCAGGCGCGTTCAAAAACCCCTTGACCTAAAGTTTAGTC
ACGAATCATTATAATTGAACTGAAATGACCTGTTGCATTCCTAGTTGACT
GACTTTTCATTTTGAAATTTGTATATTCTAAATAAATTTATAATACACTA
AGTTCTATATTCTTCGACTATGTTTGGTGAAGTTGTTCATATGCCTAAGT
TATCTACTCTTTTACTAAACCTTGTGCAATTTGAATTAGGAGGAGAATGC
TTATTGATAGCTAGGGGAGAGTGAGTGCTCACATCTGACTTTGATGGTGC
TACTGATGGATTGATGGATGGTTGCTCACCGATGACTTGATATCAAATGG
CTCGCTCATGACTTGATATCAAATCTATATGTGATGGTCTGCCTGTCATG
TGGGGTGTTGGAGTTATTTGTGATTGTTCGGCTGAACTGCTAAAGTTTTG
ACTGTTTTGTTACTACGCACATTATATATTGTTTGAACTACCGTTGGGCT
GATTTGGCTGTAACTTTATTTTTTTGAAAGGCATGTTGATGTTTAAATGA
TATTAATTTATATATTACTAACCTGATTTCATTGTAACTTTGTTTTAGAA
AGTCTTTTGGCATCTGTAGGCCTTTGGCATTTGTAATAGACCAAAAGACT
GTGACCCAGACAATATTTTATGGAAGATTACACAATTATGAAATAAGTAA
TGGTTGTAAAATTGCCAAAAACTCGAAAGATACACGTAATGTAAATAGGC
CACAACCCAAAAAATGACGTAGCCTATACATAAAATGCACTATAAAAGGC
AACGCCCAAACAGAAAAGCATAGTTAAATGATAAAATCCGAATATAAAAG
GCCCAAGTGATGTTGGGCTTGACCCATTTAAAATGCTGAACTGGACCGGA
ATAAATGTTATCTACGACCAATTGGTTTGGTCATAGAAATATGCCACGTC
AGATTAGGTGAGGTGGACGGGCTAGATAGGTTAGATTACAAACGTAATCA
AGCAAATATTTTCTACCAGACGTATTATCTTAAAACTCTAGACTAGAAGC
TATGCTGGTAGATAAAAGAAAGAATGACTTGCAAAGTCAGTCATGCAAGA
AAAGATCCATTCAAACGCGCTATTATTGGCAATTATGTGCGCAGATGATT
ATACAATTTCACAGTCCGACCAAGCCTTTTGTTCCCACGTAACATAAATC
TTGCGAAAGACTTGTTTAAATATGTTCCCATTTGATTATATCCCTAATTT
GGACTGGCGCTAGGGTGGATGCCCAGTTTGTGGGGGATTATAAATTAAGG
AGGCAACTAGAACGGTAGGAGTAGTTGAGAGGACAGTGTCCAACTGTCAA
AAATTGAGATTAGCGTAAAAACAGGGGTACAAGACAAATCTGACGATTAG
CGTAAAAACAAGTGTTTTTTTAAGGGGTTACTTTTCTCATGTTTATTCGT
GCAAATGTAAAGAATATTAGTGGCGTTTAAAATAGAAGGTTAGTGACGTT
CAAGCCGCACATCGCTAGTCTTGTGTCAATAATAAATGTTACCGGTGGTT
GTTCCTCGAATGCCATAATTAAGATGTTCACTGCTGACATATGAGTGGAA
CATCACCATTACATTATATATTTGTAGCATTTGCCGGGGTGTGAGTTTAA
ATGTCACTAGCAGCTTTTCAAATATATTAAAAAATAGCTACTTTATTATT
GAGTTCCACAACAACTTTATATTAGGAACTAGATATCCATATCATTACGG
GGAAGAACTGTGTCGTTGTGTGTGCAAACCACATGTCATAGGATCCCATA
ACACGGAAAAGTCGTTACCATGCCACAATACATGACAATAATGAAATGAA
TTTTAGTTTTCCATGCTAGTGATCTGCGGCACCTCATCGTCAACCAATTA
CAGAAAAGCATACAGATCATGTGTTTCTTTCGTGGGGGGCTTTCTCAAGT
ACTATGCTCGGTAATTTTTTTCTTATCTCGTATTTAATAACGTTTGCTTC
AAAATTCATCACACAAGTAAAAATAGTTTTTTATCCCTGCCTAGAGCAAC
TCTCGCAAAAAGGTGGGCACTTTGCCTAAAACCAAACAATTTAATTTTGT
AAGGTAACCAGCAGTCATATTTCCATCACCCGCTACGAGCATGTCCCCCT
GTCCACCTTGTTTCCGGGAGTGCTTAACGTGGCTATGGGTATTAACACCA
TGGATGTAGTATTAGTCAAACATTTTTTGAGCATAGGATTAGTTGGATAC
TTGGACCTGCTGCCTAAATTTTTTCTATGCAATTATTATAGGACTATGCC
ATTTAAGGCATATGTCTGAGATTAGTTTTTCGTGGACACAGATTTAATTT
GGTAACCCAATCATGCGTGCATGCATGCGGTTCTGCCATCATGTGCGATT
CATTTTCACATTCAAATTTCAAATGTTTTATGCCTTGAACCATAACTCGA
AACTTATACCTGTTTTCATTGTTAGCTTTTTTCGCGACAGACTGGCTCTA
CACTGCCTTTACGTTCTCGTCACCGCTATGTTCTACATACGTGGAAAATG
AAGAAGGTTGAATTTCTTGTGCCCATCAGCAGTAAGTTGTGCGGGGATTA
GTTCGCGACCTACACGTGGTAGTCTTTTTCTCGCTCGCAGGGGTACACGT
TACCACCAACGTACTTTCGCGCTTTCATCAGTAAGGCTGCTGTGGCGCTA
ATCCTTTTTCCGGTTTTGGCAATACCCCGTGGAGTTAGAATATGCACATA
ATCGTTGTAAGGCTGTGCCTCTGCCCAAAACTTGTGAGGACTACTCAGTC
ATGATTAGGTCAACAATCATAAACATTGTATAGAAATTATTAAGACAAAT
ACTAAATAGTCTTACACCGCCGCCAATCATGATGAGATCAAGATTACAAG
TATAGGACTATGACAATGGAGAGGGGACAATGGCGGCTGATCGACTCACC
TTAGATACGAAAATGGCTTCAACTATGTTTCTACAGACAGTCGCTACTGT
TTCTAGCAGCTCGGAGATAAATCTGACATAGGCGCCTTCACGAAAGTTGC
TTGTGTTGACCAGGCAAAGGCGGTGGAACCTGGAACGGGCACGTGGTATG
GTTGGGTCCAAACCATACCAGTGCTCTTTAAACCTTCCGGAGATTTTCTC
CATGGCGTCTTTGACTTGGGATTATTGGCAACTCTTGATTCTTCATTAAT
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AATAAGGGATTAACACATCTTTGCAATAATTAGTCATTACCTAGGTCCAA
ACCTAGGAAAATCGCGTGCTCCAATCTTGTCCCCAATTCTCCCTATGTCG
TTGTGCTCCGTATCTCTGGTCCATCGCGCGGTGGTACCTGCCCTGGCCAA
TAACCTAATTAATATTCAAGTTATATCTAATGGAACACTTGCTTGACCTT
ACTTGATATATCATCAGTTGGGATAATATATAAATGTACAATATGATGTG
CATGGGGCCCTCCAGATTAATTTGATTGATCCTCTATTATGCCACCTATT
ATAGTCTAATGATGCGTACGTAACAGAGGTGCACACCTATAAATACATAA
TATTATCTAACGAAACTGAATAAGAAAAATCTATCTATTTCTTTCTACTG
GATTAAAAAACAATTGGGAAGAGATTACTTCCACGCCTTATTTCATCTGT
GAAATGCTTGGATGTTGACGTTGAATGCTTCAAGTTTATGTATTCATTAA
TTAGTTGACATAAAAGTTGTTCCATCAAGCACACATCAGCACTAACAACA
ACATTATCTCTGCTCAATTATTTCCACGACGAGGCCGCCACCTAGTTAAG
ATGAACCGGGCATATCTGATGTGTTGACAAACAATGATTGTGGTTCCACC
CGATCACTTCAAAAGGAGAACAAGAAATACAACCAAGGACCCCGACTCAA
AATATCAATATAATTTTTAAAAGCAATGTGTTTTCTATGGCTAAGGCTAG
GATCCAATCTAACTCGTATGTCGATATGTTATCATATATTACTCATAAAT
GATATTTGCATGAATACTTATATATTTGCTGACATTTGGGTCAAGACATG
TCGATCCATGGTTGGAGTGGGACTCGTCAGGGTATCGCTAGGGTGGCCGG
GTTCAGCCTCCGCAAAGACCTTATTGCCTAGATGAAACAAGCTCTGCCAT
GCTAAGAAGAGGTGGGAACCCTTGAATGATGGGAGAGGAGGGCATCGTTG
ATAATTTGGGCATTCAAAGATGGTTTTAAAATTCCAATTGTCCACGAAAA
TAGGGAGGGTAGGATGCTAATTTTATAGTTCAAGTTTCGAGATGGCATGT
TTGGCAAAGTCTGATCGACAACGCTAGCCCAAACCTAATCGTGTCGAATA
GCCAATTTTTTGTGTCGGCCTTTGTTAAAAATGACTTCAATGGGTGATAT
CGGAAATTATTTTATGTATTAGTGATACAGATAATTAAGCCTGTAAATGT
CACATTCGGTCCTTCCACACGTTCTCCATAAGATAGATGAGGTGAACAGT
GCATGTATGGGTTGCAGCGTTAGAATGTGTGGACATTGTACCATCCTGGC
AACCATGTAGGTTTGAGTGTCAAGACCAACGTGGCTGAATTCCAGGATAC
ACAGCTGAATGGAACATTGTTCCACATGTGGCAAACCATCTCGACGACAA
AAAGAGAAAGCTGACATGTACCTAAGGTTATGGGGTCGTCCATGGATTCC
CAATATATTGATGGATTTCATAGTAAGATAATGGAATGCACCAGCACGGA
AAACATGAGTTGGGAGTGTAGAACTCAATCCTATGTGAATACCGACAAAT
GAAACTCTATTAAAATTGTAATAACCAAAGAACTATGCTAGCAATGTGAC
AATAAACGAACTATCTTTCCATTTCTATCTAATGGTACGCTAGCTTGACT
TGACTATATCTATCATCAATTGGACGAATATATAAACTTATAAAGAACGT
GATCCACATGGGGCCCTCCAGATTAAATACGAATGTTCTATACGTAATAG
AGGTGGATATGTATAAGTACTACAAATGAACTAGCAGCCTAGCTGCATCA
AGAAAAACTTATCGTCTTCATGCAAATGGATTAACAAACCACGGAGTGCC
ACATCCCAATGCTTAATATTAATATTGGGTTTCGTACGCTTGCCATGGCT
TACGTAAGTGTCTAATTAATGTGGTACTAATACACCTGCACGACTTGCAT
ACTCTCAATTTCTCTATAAATAGTTGGGCATACTAGTCCATGGATCATAA
AGCAAGCAAGCAACTGTCATTCCCTGTGAAGACTGCCAACACAAATTCAT
CCTACTACTAGCAATGGTATGATACCATCTATTTCATATCACTGATTACG
TACATCCATCATTAGGTAACATCGTTTGTCTATTTGATCATACATTTGAG
CTAACTTACTATATATGTGCATGTATTAATTGTGTCTAGGAGACGCCCAA
GAAGATTGGCCCGTATGGCTATGGGGAAGGCGCTGCTTTTGACATTGACG
CCAAAAAATCACCCAAACAACTTGTGCACATCACTATTTGGAGCACTGAT
GGTCCTAATGGGCAAATCAATGCCATATGCTTCATATATCGTGACGAGAA
AAATGATCTTGTTGAGATAGGTCCATATGGCACCATAGATGGTACAAAGC
ACACGGTATGTAACTGCGCATTAATATATATTGGGTACTTGCCACCTTGC
ATAAATTTCATACACGCTATATAACACATGCAATTTATTTCTGTCCTACA
TGCTTTTCTCTCTCTTGAAGTAATGTCGGAAGGGGTATACACTAATTAAC
TAATTAATAAAAAACACTAATGACTTCTTTTTGCATTCATTGTAATATTG
CGTAGATATCCATTAAACAAGGTGAGTATTTGACCGTGCTCTCCGGCTAC
ATCAACCCATCCCTTACTGCGCTCAACTTCAACACCTCTGCGGATGCTAC
GTATGGGCAGTTCGGCAAGTGCCCAAACATTGGAGACACTTCTTTCTCCA
TTGATGTGGATCACGACTCCATTTTCGCCCTCTTTGGCCAAAGCGACAAC
AAGGTCAGGTCCATCGGCGCCTATTCTGGTCCCCGGGCTTGATCGATCAA
TCCTTTATCACCAGCATGTCATGCATGTGATATATATATATATACTATAG
GTGTGACCTACATACCTAGCAACTACTTGCTATTGAATAAAATTTGCATC
CTGCTAGCAAACTGGAGTACATGCCACAAAGTAGGTACTCCATGCGATGG
AATGATCCATGGCCTTTGCTTGTTCCATGTAGTATATTGTATTGTACAAC
GTGTGATGTATGTGTGGTTTGTACCGTCCTTCCACTGGTATGCTTGTTAT
AATAATAAATAAATATTTCAGAAATACGTGTGTTCCCCATGACTAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.