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GrainGenes Sequence Report: AE022680

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Sequence
AE022680
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE022680
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCTCCGGCACCGCTTCCAGAAAACCCCCACGACCGTCTCGCACCAACCT
AGAAGTCTAGAACCCTCTCCTTCTCTCCCCGAGAAGCGGCCGGAAGGGCG
CACGCAGCAGTTCATCGCCCGTCTCTGCACCAGTCAAGGAGCGCTTCCAC
AACGTCGCCGTCCTCCGGGATGGAGGCCTCGGCGGCGGCCTCCGACGAAA
CCCTAGCTGCCCTCTTCGCCCAGCTCAAGCCTCACACTATCGCCCTCCTC
GGCGTCCTCCGCAGCCGCGGCCCCGCCTCCAACTCCGCCGCCTCCTCCTC
CCTCCGCGCCATGGCCGCCCTCCTCCGCTCCGCCCCCGCCCCTGTCTTGC
AGCATGTCTTCGAGTATGTATACATGCACTCCTCCCCCTCCTCTCTGCTG
CTTGACGAGAGATGGAATTCTTTTTGTGTGTGTGTTGCTTCTCTGGTTTG
TGATCTAATCCTGGTGCAATGTGCTTTTCTCTAGCTATACGGTGTTTCCA
TTGCTCATGCTCCTGGATGCAGCGGTGCTGTGCAGGAAGGAAGGCAAGGC
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GCGGGCTCGTCTGCCTTGAGATACTCCTCTCCAAATGCCGCCTCACCTCA
GCCAATCAGGTGATTAATTCTGCTAACCTGATTCTGCAGTGTACTCAGTC
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ACGTCACTTGTTCTTTGTTGAACATTACCTTTGGTACCCAGTTATTCTAT
TATTTGTGCATACACGTTTATTTAGATGTGATCATGTCCTAGTAAGATGG
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CAAGAGGTCACCGTGGCAGTGGAGGTCTTAGAAAGGAGTCATTGCTTGCA
TTGCGCAGTCTTATTGCCAAGGTGAGATGTTCTGTGTTACATCAGTGGTT
TGTTGGATGAGATATTTCATTTATTAACTAGAACCCTGCGTTGCTAGTAT
TTATTCCCCAAAAGCCCCACGGATATTTCATGAAAAGATAGAAGGTACAA
GAACCGAGAGAATGTTACGCGGTTGGCACTGGCATATGAGTCAGGGCAAC
AGTGTTTTCTCATTTGAAACAAAAGAGGATGGGGTATCTTGAACAGTGTA
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CAACAGTAAGAGTCAGCATCGCCTTTGTGTTTGGCATATCTGTATCTTTC
CTGTGGGCATGGTTCCTCTTTGCATAGAAGCATGGTCGAGTGTTTTTTTA
GCATGGCTCCTGCTGAGATTATTATTTTTAATTATTTGCACAATTTTGTA
AAAGTTTTATTTCTTGTTTAGGTAGGTTCTGCTGACGCACTCGCCTTTTT
CCTGCCTGGTATCGTCAGCCGTCTTGGAAAGCTTCTCTACACATCTAAGA
CTATGATTAGTGGTGCTGCTGGGAGTGCTTTGAGCATTGAGCAAGCCATT
CTTGGATTAACTGAAGCTTTGATGATAGTCCTAGGTGACAAGGAAAATTT
GAGCGCACTTGATATGCCTGGTGACAATAGTTCTACTCATTTTTCTGGTG
GTGGTGCTTCAAGTGACCATGTATTGCAGAAGCTTCGCCAATTGCCGACA
AAAAGGAATCTAAACAGACAGGCAATGCTGAAACTACGGAAGACACAATC
TCTGATGTCAGTAATAACTCTGCTGATAGAAGATCATTGCATGTAAAACG
TACAAGAAAATGGCTCGAGGAAACAACTACTAATATTGATAAGTTGTTTT
CAGCCACATTTCCACATGTATGTTTACCCCCCAGCACCACCTCCGTGGAT
TATTTGTTAGTCACCCTTCTAAGTCAGTTTAATATTTTATCATTATTACA
GCTTTCTATTCATCCATCTGAGAAAGTAAGGCGGTCGGTGGTTAGTGGTG
TAAGGGGGCTTTTGTCTAGTTGCAGCTACACATTAATGAGAAGCAAGATG
TTACTGGTGGTGAGCTTGTAAATTCTATTTTTTCCCGTCACTTTTGAAGA
GTATATAAATTCTTGGATCTGTAGTTATGCTCACAAGTTATAAAACTTTG
CCATCACTATGCAGCATGTCTTTTGAAATTTATACACCATACATTCTTAT
GTTTGGCCCAGCCACCCCTAAAAAACGGAAGATATATATTTGGCTCAGCC
AGCATTCTCCACATACTTGACTGAAAGCTCTATTTATCTTAACTTCACAA
ATATAATGCAGGAGTGCTTATGTGTTCTAGCGTGCGATGATGCGCCAACT
GTGTCTGACGCTGCGCAAGATTCTCTTAATCATCTTTTTATGAAGGGTCA
GAGTTTTCTGTCAGAAAATGAGGTTTCTGATATATTTACCAGGTTTGTGT
TATTTATTTGCTAGAAACAACATACTCCCTCTGTCCCAAAATCTAAGGCG
TCTAAGATAGTCAAAAGTCAAATCCTACAAACTTTGACCAAATACTTAGG
AAAAAACATCTGCAACTGTAATATTGGATGGACACATTGAGAAAATATAC
TCTATGGAGAATCTATTGATATTGATTCAGTATTGTAAATGTTCATATTT
TTCTTGTATAAACTTGGTCAAACATAGAAATATTGACTTTTGACTATTCT
TAGACGCCTTACATTTTGGGACAGAGGGAGTAGTTTACAGTGGAAGCAAA
TCTCTCAACTTCTTTGCATGTAAAACAGGCTGCTTGAAAAGTTACCACAG
CTGGTACTTGGAAGCGAGGAGATCACTGCACTTTCACATGCTAGGAAGCT
CTTGGCTCTAACTTTCTATGCTGGCCCTCAGTTTCTGATAAATCACCTTC
ATCGCTCTCCTGTAAGTTCCTTACATTCCTTTCCTTAGATCAATGGCTCT
TCGATTGACTTTTGACTTGATTTTGATTGCACTGACAGGTTGCTGCTGCT
CGCTTCTTTGATTGTTTGGGTTTATGCATTAGTCATGGCTCACAGTTTTC
TGGTTCCATAGATAAGCTAATTGTATCAAAGCCACTATCTGTTGGGTATC
TGTATTCAGTTGCTGAGTTAAAGAGTGGTGCCTATCCTAAAGATAGAAGT
CACAGTTCTCAGTATGCCACATCTTCATCCATAGCCCCCAAAATATCTGT
TGTCCGAGAGGATGGTTCGTCCGCGAGGCATGGTACAGTTGAATATGAGC
TCCCCCACGTACCTCCATGGTTTGTTCATGCAAGTAGCCAGAGGCTATAC
TTTGCTCTGGCTGGAATGGTTAGGCTTGTTGGTCTATCAACAGTCTCAGG
TAATTTGTCAACAACTACTTTCAATGCTTGCCAGACTTATGATCTGCGCT
GGAGTCTTGACTTGTCATTTTTTGTTACGTGTGATGATGCTAGGGCAAGG
AACCAGTGCATCTTTATCTATTTTTGTTGATATTCTCCTCAATCAATTCC
GGAGGTTGAGCACCGAGCTGCGCGCCAAAGATACTCAGAGATTTGGTGTG
CAGAGGTGGTACATGAAGAGTGATTCTGGACAAATACTACGCCAGGCAAG
CTCTGCTGTTTGCATGCTCAATGAGCTCATATATGGTCTGTCAGATCAGT
CTCTCTGTATATGTCTACAGTTATTCAACAAGAATTCTGCACAAGTGGTA
GGGGTACCTGGTCAAAATGATAAAACTTCATCTGGTGAACATAGAGTTAC
TGATAGCAGAGAAGTTTGGAAGATAAGTGAGGAATTGGGAACTAAAGATG
ACATTATTCTCTGTATTGGCAGTATTCTACATGAGTATATGTCTCCAGAA
GTATGGGATCTTCCAACAGAACCGAACTCTGAGCTATGCATAGGAGAAAC
CAGTCTTCCATTGCATTTATTCCGTGATACCACTGCTCTGCAACAAGTAA
TTATGTGTCGCTGCACTTCGTCAATATTTTTCTTCAAGTTCTTTCTCTGC
TTGTTCCAGTTTCATCTGTATTTAAAGCTTTGTTCTGCATCAGGTAATGC
TTGACGGGATTGGAGTCTTTGGTATAATCCTTGGTCAAGATTTTGCACGT
AGTGGGTTTATGCACTCTTCACTTTATCTTCTACTCCGGAAACTTATCAG
CTCAAGTGCACAGATTAGAATTGCGTCAGATGCTGTCTTAAGAACACTTG
CTACTTCTGGTGGTTACTCTACGGTAATTGATTGCCTTGTTTCATGCAAG
ATTCTTTTACCGCTATCGTTAGAATGTCCATTTATGTTTTTTTTCCTGTG
CAGGTTGGCCAATTCGTTGTGGCAAATGCAGATTATGTTGTTGATTCTCT
TTGCAGACAATTGCGCCACCTAGACCTCAACCCCCATGTTCCTGATATTC
TTGCGTCCATGCTGAGTTACATCGGTGCTTCTCGTGACATTTTACCATTT
TTGGAAGAGCCGGTATGATAAGGATGGTTATGAATCTTTCCCATTTTTTT
TTGTCTTTTATTACATAGTCTAGTGCTACTGTAAAGGATCTGATGCTCAG
TGGGAAAGTAAAGGAGAAGTGATGACCTTTAAGCAAAACAGAACATGATT
CTTTTCTTATAATTGAAGCAAATTCCATGTGTTTAATCTCATTGCAGTAC
ATGTATTTCTTACAGATGCGGGCAGTTTCTTCAGAGCTGGAGATTCTTGG
TAGGCATGATCACCCACATCTAACTGTTCCATTTCTGAAGGTATTATGAT
ATGCATTTACAAATTTTGACATCATGTATGGCTACTTGATGATTTTACTA
AAACGGTATTTGCATTTCCAGCACATGTATATATTGTTGGCTGGGGTTTC
AAATTTTAATTACTGGTTTTCACCATTTTAACTATCCCATGCTACTGGCA
AGGTTTTAAGTCTCTGTTAAGGCTGTACATCAACAGCTCCTAAAACCCAT
TAAACAGTGCATGGAAGTGGATGCAGCTGTCCTGTGTAGGGCGTGCTGTC
TTTAGGCACTGGCACGGTTTGCAAGGGTTTGATAGCCTTTCTATGGTTTG
TGTTACCTCAATTATTAAGTATGCATGTAGAGTACGGTAATACTAGTACA
TGCACTATACCATCTAATGTGTAGGAGGTGATGATAGCTAAATGGTCAAA
CAAATAGTGGCACAAAGCGACTACTAAGTGCTATTTCCTCTGTATTGATA
TCCAAGTGGTGAAATTAGCTGAAACACAGTATCTCACTATGGTTTCCTTC
TGATAGAGTATACAAATACGCCTCTTCTCTTTCCAATTTTGTATAAAGTT
CAGTATAAATTAAAGCCCAAATGCTTACCTCTGATTTTCTTCATTGCTTG
TATTACTGTTGTGTGCATTGGTGCATGCAGAATTCAGGACCACCTGTTTA
CTTTTTTTCATCTCTTCCTTTGGTCATGTTTTGCTTGTACATGTTTTACT
GAGCAAATTCTTTTTTATTTTGGGTTTCTCTAGGCAGTTTCTGAGATCGC
GAAGGCATGTAGTCATGAATCTATTAGTTTACCAGATGAGGTGCGATCAT
TTTATGTGAAAGTCAGAACAGAAGGTCAAGCAGTACAAAATTTGATAGAG
AAGAGAAGAGAAACTAGTGTAATGGCTGGTAATAGACAAATTTTGTTTTG
TCTACATCTTCTACAGTATTTAGTTTGGTTCAGTTCATCACATTTTTTTC
ACCATACCATCATATTCATGTTCCCCAGCAAGATAGGGTTTAGATGGTTT
ACTTGATTCATGAACCCTTATTCACGTAGTTGTTGTCTCATAATCTACTT
TTGTGGTTGCATCAGAAGCAACGGATGTTGATGCTCAACCTGAACTTCTG
AGTTTGGAATATTGGGAGGATTTACTTTGTAAGCTAAATGATATGAGAAG
ATACAGAAGAATAGTTGGATCTCTTGTTGGGTCTTGCTTATCAGCTTCCA
CTCCACTTCTCTCCTCGACCAAGGAAGCGGCATGTCTTGTAGCCCTTGAC
ATTGTGGAGGTATTTTTATATTTCTTTCTTCTGATTATGACAGTGTATTA
TGATAAATGTTGTTTCTGGTTCCATTTCATAAGATATCTTACTTGCCGGG
ACACCATGTTTTGCTGACCATTTTGTTTGGCGATATCTTTTGGTCATCTT
TTGAAATGGCATCCTGCATACTGGTCTTGTTTGGTACAATCACTTGAGCT
AGCTGTTGTCTATTGTTTGTCTGAAGGAACGTCAAATTCTACAGTATAGA
GGTTTCCTGTAATGTGGCTGTGCACTTGTCTGTCGCATATGTCTTTTCGG
TTGTTTTCAGTATTAATAGAACTAAGCATAACACTCTATTTAACAGCTTT
TGCAAAATTGCTGCCTTGTTTACTTGTCAGCATAGTTGTTGTCATTTCTC
GTCACTTCTATATTTAATAAAAGTAAAATAAAAACAATGCATTCAGTGAG
TCATCAAACAAAGAACAGTTGCTTGGAGACTTCTTTCTCATCCTAACAAT
GAAGTTTTCTCTGGCATTTCTCGTCACAATAAGATCATTTTCTTCCATGT
GCAGAATGCTGTTGTATCTATTGCCAATGTTGAGGAGGCTTATAAGTGTG
AAATTGAAAGCAAAGCTGTCATTAATGAGGCGGTCCAGCTTTTGTCATTG
GATGAACTTCTTGATGATATGGATGCTACTGAAGATGTTGACGAGAATAG
ACTACTCCCAGCTATGAACAAACTATGGCCATACTTCGTTGTCTGTCTTA
AGAACAAGATCTCAGTGGTGCAGTTTCTTCACATCTGATATTTTTGCATC
GTGTAAATCATTTTTCTGTTATTACTTGCTTATCTAGTTTTCTAGAATAA
ATGCTCATCAATAAGCCACATGTCCTTTTGACCAGAATCAGAATATCAGA
TATAGGGCATTGGTAGATTCCTGTGTCGTATCTGAGTTCAGCATCTTCAT
TTGCCATTTGCGTCCCTATAGCTACTTCGGAATCCTGATATTATGTGTGA
ATATGATCAAACTCAAATACTATTCCATATTTATTTCTATTAGACTGTGA
CTCATGTTACTTATCCCAGTCAAGTAGCCTCGCCTCTCGAGTGACACCTA
CTTTTTTCGTATCTTGTTTGATGACCCGTCATTTTGGGTTAATCCATAGC
CTTCACAACCCTGCTCTCTATGTGATCAAATTTGTATGAGAACTCTGAAG
TAAACTTGACCACAGTGAACACGTGCCACCAGATTTCTGTCCGTGCTCCA
GAAGATCGTGTTTATTCTTAATATAGATGGATTGAGTTGATTTTGTTATT
ATGTATGTGAACAATATGCCCATCTCAGTTCAATGAATGATGCTGCACTT
GCACGGTTGCATCCTTGTAACTTAGCCTTATATGTTTGCTCAATGAATGA
TGCTGCTCTCGATTCTTTGCATCACCTTATATATTTGTCCCTGTCATTGA
ATGCTAGATTCATTTATAATTTGACAGTGATGGAACATATGCTCTCCAAC
TGACCAAAACATGAAATTCTGATTTACGGCACAAATTATTTGCAATATTG
GTTTGTACATGAAGTGGATCACCTAGTACAATTTTTTATTGGATTGGATC
TGGAATTTCCTGTGACCTACTTGCATTGCAAATTTGCTCTTGAATCTATG
AGTTGCTAGACTGGTTGAGTTTCAGCTATCTGTTTGTGTATTTCCAGTCT
TACTGTAACTTATGTGAGTTCTACATGATATCTGCTCTTACTGTAATAGG
GTTTCTGCAGGCCATTGTCAGAAGATGCACAGAAGTGTTGGGCAGAACCA
TTCAGATATGTGGTGGTGATTTTTTTATACGCCGATTTCATAAGGATGGA
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GTCATTGATGGATGAGAAAGCAATTATTTTACCATACAGGAATACCTCAC
TTACCTCGGAGGAACCTATGGCTGAGATCTCCAGCCAAAAGATTCAGATC
GCAGTCCTGGACATGATTACTGAGATATCTTCCAATAAAAGAAGTGCCAT
TGCATTGGAAAGTGTATTAAAGAAGATCTGTGGCCTTGTGGTAGGGATTG
CTTATGGTGGTTTGATAGGTTTGCGAGAAGCTGCTATAAGGGCATTGACA
GGACTTGCCTGTATGGATGCTGACCTCGTGTGGCTTCTTCTGGCAGATGT
GTATTATTCAGTGAACCAAAGGGATATGCCCTTACCACCTATCCTATATC
TGATGGAGCTATGCGATCTTTTGCCCCCTCCGATGTCTTCAAGAGAGTAC
CTCTTTGTGCAGTATGGTGGTGAGGGTGTTAGATATGATATAGACCCTTC
GTCTGTACATGAGGTGTTCAAAAGGATGGAGGATACGGTCTTCAAATGAT
ACCCTGTAACCATGCAGTTTTGTCAATTGGATTGTTGTCTCGTGGATCTT
CTGTTGGCACAGTCAACACCTTGGAGAGGACATTCTGTCTCATTGTCTCA
TGCTTAGGTCAGTCATGAAACATCTCTTGGACACTTATATAGGGTACACT
TCACGCTTTTCTCCCCCTCTGTTATACTCCCTCAGGCTTACATTGTGGAA
CAGAGGTAGACGAGGAAATTTGGTAAGCACCTACGTGAAAAACAGAACAG
AATAAGAAAGGCGAACACTCACAATGTGTTTCTGTATTGTGGATACTGTT
CCTCAATGAACTCTTGGAAAACTTTCTATTAATTTTTTTATCATGGAAGC
TGTTTGAGAAGTACTCCATCTGTCCCATAATATGAGGTATTATTACAGCC
AATATATGAGTAGGTTATGTTTTCCGATGTGTTTCAACTTGAACTTGGAG
TCGTGGATTAGTGCTTTAGTGATATCGTTTAATCTCTACTCAGAAACATC
TTGTTGGTTTACTACTGCTGTTTCTGGCTAAACATCACTGCATGCAATCC
AGTTCCACATTATTTTTCTCATGTGTCGATGGTGCCGTTATGGTTTGTCA
ATAGTCAGAAGCATGCACACCGCGAGAGTAACTATTTATTTCAACAGTTT
TATTAAAGTGGAAGATGGTATGCTCTCTTTATAATCGAAGCTACATATTA
GTCTAGCAGATATCTTATATACTACTACTTGAACTTCCTCTGGTCTAGAC
ATGGGTTGAATTGAATTATGAATGGCCACTTCCTCTCACGTGGAAGAAAA
ATGAATGAGCATTTTTAACCACATATATGGAACTCCATAGATATTTTTGG
ATGGTCATAATAAGTTAGTAATGTTCTTTATGCAGATATCATGGTGAAGG
GTGAAGTGTAACCACATGACAACTTTTTTTTAGCTGAGCAGACAGAAAAT
GTGATTTAAGTTATGTATGTGATGCTGTCTGCCATCTGTATGTATCTTCA
AGTCAACCGACAAAGGGGGCGCAACCACTTGCGCCTTGGAACTGTTGTAC
CATAACAACTGTACAAGACAATGCCAGTTTTGTCCACACTTTGTTCTCAC
AGGGAGACGTTTCTGTAACAATTGTAGTCTAGAGAAAGAAAAAAAGTGGA
GATGGGAGGATTCTATACTTTAGGATGCTCTGTAGGAAGTAATTATATCC
GCCTGGTACACTTAATTTTTTTGAGAAACGTTGTGTTGCTGTCATATCTC
AGTTTCGTTTGTATCTGAAGCGTTACAGGTGTCAGTTGTTAATGTAGATG
CAAACATTTAGAAAGTTCTCATAGCAAGCAGTCTACCACATGAGTTTTGA
GTTGATTCCCTTCGTCCAAAAAAAAAACATGAGTTGATTCCTTGCGTTTT
TGTACATGGAAATTCCAATTCAAAAGACAGATTTTTTGATGCGCACTCTC
CAGAGTTATGTGCATTGTATCCAGATTATATGACATGCAATCCATGTCTT
CTTGCTCAGGTAATTTTGGTTGATTGCACAAGCAAATGGATACCTATTAA
TGATCAGGTAACATGCCCATTGCCTCTTCAGCAACATCAAAATGTGCAGT
AGTCATCAAAGAGCAGATGGAGATACCTAAAGTACAAGGCTGAGTTGGTT
GATATTGTATTGGTGCACGCCAGACTTTGCCTAGCCATCAGAAATTTGTG
TATAACAAAGACGTGGAGAATGCTGCATTATAGCTGTGATTTTCAACCTT
GCAGGTATGAATAATGAGATCTATTACATATATACAGTTAGCCTAGTAAA
GGGCTCCCCTCTTTGGCAAGAACAAACAAGCCGCCTCCATCACCTCTTGA
AATCCTCAAGTCCTTGTCCAGGTAGGTCGTCAAAAGCCAGGACTTGGCCC
TGTTGTTGCCGGGGATAGGTACCTTGAGGGGTGGCTGCCCAGAGATCGAC
CCGGCAATGTTAGCAAAGGCTTGCTGCAAAGGGTTCAGCAGCTGCTGGAC
AGGCTCCAGGCTGATCTTCTGCCCGAATATGGCGATTTGGTTAGGTAGAT
TGACTGATGATGATATCTCTGGTGGCTGGAAGCTCCCCTCTTTGAATTGG
AC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.