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GrainGenes Sequence Report: AE005729

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Sequence
AE005729
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE005729
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCAACCACTTGCGCCCATTCGTGCATATAACCTAATCAGCACTTTCTC
CTTCTCCATGGGCACAGCTAGCTAGACGAATATTGGAAGCTTTAGTTTCT
CCCATCATATCAACCCATCACCGTCTTCTTCTTCTTAGTTCACTTTGTAC
GTTTCTGTCACTAGTTATATCTTCCTTCGTTCTTGGTGGTGTTCCCTATC
TTGAGCTAGGTTTTGTGATCTGCAGTTAGATCTGAGAGAAAGATGGGGAG
GGGGAAGATAGTGATAAGGAGGATCGACAACTCGACGAACAGGCAGGTGA
CCTTCTCGAAGCGGCGGGGTGGTCTGCTCAAGAAGGCCAAGGAGCTCTCC
ATCCTTTGCGACGCCGAGGTTGGGCTCGTCGTCTTCTCCAGCACCGGCAG
GCTATACGAGTTCTGCAACACCAAGTAATTAATTCGCTTTGGGTGTATAT
GTATCTTATACTAGTACTACATATGTGCTATGCTGAAGTTAGTGTGGATC
TCTGATTGCTATTTGGTTAACTAGGTTGCTTCCTGGCTTGGTCATGTGCT
AGCACCGCGTCCGTTCTTTCTTCTTCTCGCTAGTTTTGTCCTTCTTTGGG
ATTTTGTGCTTCTACCTAGTTAGCTATGTAATAGATGTGTATAGATCAGT
TGAGGGGATCTATCTCTTATATCAGAGTGTTATTTTAAAAATGGATAAAC
GCATTTGTAGAGTAGTTGACTAGAATTTGCATAAGTTCAGTTGATGTGCT
CGAACTATCTCTTCTTCTTATTTCGATCCAAGAGGGTGTGATCTCACTAG
AGCTCCATTAGATCTGCAAGATGAAGACGCCTTTGACAGCTGACACATAG
CTATTGATAGTTGGCACATAGCTAAGAAAAATTGGCGGAGCAAAGAGCAC
AGGGCCTTGCCGAAGAGAGGTTAGGTTGGAAGGCCCAAGCCACAAGGCCG
GTGGCCTCTCAACTAGGGGTTAGAGTTCTTCTCAAGTATGGCTGGGTTCG
GAGGGTCACATACGCTAGAGATACACTGGTGCCCGCGCGGCTTACTAGTA
GGGTGAGTAACGATGGCGTGTCGCCACACTCTTGAGCAGAAAGGCCTCGT
GGAGCTTCAACACCGACACATTGTAGAGCAACATCTTGCAACTTTGTACA
AAGCCTCTATTCCCCAGGGTGGAACTGAAGAACTCAACTATGTTGGCAAG
ATGGGATACAAGGTGGTGGTAGTCACTTGTGGAAATATGGAAAATTCCAT
TTTTGGAATTTGCAATAATGGGATGGGAGAACAATGGGAATTGAACCGGC
GTACGGTGGATTCACAATCCACTGCTTTGATCCACTTGGCGACATCCACA
CTTATCCAGCTAAAGGATTTATTTATTTATTTTCCAGTTCATACTCTAGT
AGTGTCGATGGCCCTAGCGGCCACAAGCCCCACGACATGGTTGATGTGCA
ACTTTTGAAGGGAAGATCGATCGACGAGTAGGACGATGGTGGCAACATTG
ATGGAGACGGTAGCAAGAAAGACTCGATAGGTAGCCACCGGAGATGGCGA
TGAGGCTAGCAAATATCACTAGTTCGTGGGAGAGATCTTTTACGGTTGGT
GACTAAGTGTGTGCAAGGAGAAGGGCCGCGTATGTATGAGGCGTGTGGCC
GGAGGGAGGGGAGGGATGTCAACTTCCAAAATTGGTGACCAGAACATGTG
CAGTAGTAGTTCTTTTTTAGGAGGGGTGAGATTTCTGTTAACTAAGTTAT
CACAGAAAATATGTAAATCCTCGTGCACTTTAGACAAGATATCATTATAT
TTGTCACTATGTACTTTGCGGTAGAATAGGAATGGAATCTGCAATTATTA
CTTACTAATCAATGTAATTTCCTCTCTGTCCCAAACTAGTTGACATAGAT
TTGTCTAAATTTATATGTATTTATACACTAAAACACGTCTCTAGATTAAT
CAATGTGTTCACTGCTTATATAGTACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGAC
GCCTAAGGATTAGTCAAAATTCAACATTTTTTAAGTTTAACCAAGTTTAC
ACACAAAAATATAAACATTTATAATACTGAATCAGTATCAATAGATTCAC
CATAAAGTGTATTACTAATATGTCCATTTTATATTCTAGATTATTTTTAT
TTTTTCCTAAATATTTGGTCAAAGTTAGTAAGATTTGATTTTTTACTAAT
CCTTAGGTGCTTATATTTTGAGACGGAGGGAGTATCTTTATTTTCGTTAA
CTTTTTTCTCGCAAACTTGTTGAGCAGATGCAAATAACCCGAGTAGGTTA
TGTGAGCTTAGAAACTCACATAAAAAACAAAGAATGAAGTATATGCAACA
TCTTATAAACATACATATGCATGTACACCGAAATGATATGTGGTGGAGTA
ATGAAGTTGTAAGAGTAGGTTCCGACCATATTCATACCGAGAGTTTGAAT
GTGTTACTGTGCACCGTACCCATCGTGGCTGCAAGTTCAGAGAAGGCATA
CACTGACCGGTCAATTTTCTTTTGCCTGTTTGTATGGCAGCATGAAATCT
GTGATGGACCGGTATACCAAGGAAAAAGAGGAGCAGCCAACTGGCTTGGA
TGCAACTTCACAAAGTAAGGTAAACGTGGGTAAAGATGATGCCTGTGAGG
CTCTGATGCTTAGCTGACTATTAGTCTTACTAACATCAAGTCTTCAGGGT
TACTGAATTTCTTCTTCAACGACGCTATTGTCTGCCATGCTTAGCTGGTA
TATTGCGGTACCTCGCATGGATGCATGCACTATGCAGAATGTGTGTGCTG
TTTAAAGCAGTGACAAGGCCAAAAAGGTGTCCCACAAATCAAAAACTGAC
CAACCACTCGATGCCCATGTTTGTGTGTTGTTTTGAGCTTAGTTTATTTG
TCTACACTACTATTGCACGGCGCACATCAGTTAAGAATCATATTGATAGA
AATCTATATCAGACAATTAATTGACTCAGCTTTGTCTAGATAAATCTTAT
TCGATTAATTTCGGGAGGATGGAATACACGAACTTGATAAGTCATAGGCC
ATAGCATAGACATTTTCAAGCTGCAACCAGTTGATGAACTACCACTTAAG
GCAGCACTCGGATTGTTACTATAAGCTCGAGTATATATCGGATAGTAGCC
ATTGTTACTGCTACAACGCATAGTAGCCATTGTTGTTTCTCCACTCTACA
TGGCCTGGGTTAGTACTTGGAAGTCCCAAAAGAGAAAAGCCATATTGGAG
ATGCTGTCCTGCAGACATCACAAACCGATTGTTCACTCTCTGGCAAAGCG
ATAGAGGGCACTTTGCTCATTTGCTAGTACATCATATGATTTCTCTTGCT
TCATGCTGGTGATCTCTTGCAGAAAGACTACAGCCAAACTGTTGTTGCAA
TAAGAAGCCCAGCCAGCTTTGGAACATGATAGGCTTTTGGCAAAGATCGA
GGGGCATGTCCTTTGCCAGTTGGCACTTGATCATATGCCCTGTAGCCTTC
ATAAACTCTCCGCTGCCACTCCGTTGCATGCATCTTCATCATGAAGCCAC
ACTTCAGCAGCTCAGCATATGAGAACAGCCAATGACCCACCGCCTTGTTT
GGAAACAGGGTCGAAATCTGGGCCCTGGGAAGGCATATCATACAATACAT
TAACACACGGTACATGACTAGATCAAGATGATCATATGAGATATTTTGAC
TTTATACATACATTGTGCTTGACGCAGCACCCCTTGTTGAAGAACTGTAC
TGATTGCACTGCACCTTGCTACTCTGTAACAGATCCTATATAATACAAAT
GTGCAATCACAAGTTATCACACAGTACATGCCGGCCCATATTTTTACAGT
GAAGCCAATTGACCACACATTCATACCTGTTGTGCCAGCTTAGAAGTTTA
GAGTAGATGCCAGATGTTCCTTTACGTCGTACAATAGAATGCTTCTAAGA
ATTCAAATGATACCATCAGTAGTATGAGCAGACATATTGCAAACTAGTAA
AGTGTAGAACACCAGGATCCTTCACAAATTAATCGGATCTGGTACAAATA
TGAAACAACTATCCACCAGCAAAAGCTTGCATATGATGATTATGTGCTTA
TGTTATGAAATCACGGACCAGGAGAGCTGTTTGAATAAATTGATAAGTTT
TGTGCATTCTGAAACATTATCCCATATTGCCATTGTTTAGTGACCAGTTT
GCTAGTTGTCAAGAGAAGGGCAGAATCATGGATCCACTTGTTTCATGATC
TTATTTTGCAATATGAAAATACACAAAAAGTGAGCCAATATCTGACTCAG
CTGATATGTTGTATGAAGAGTACAGCCAAAAGATACCCAAAACACATCAC
AATAACCACCAAAAGGAAAAGCCAGAACTGAGCGCCCCAGCATACCTTCA
GGTGCATGCAATCGAAGCCCATCATCACCTAACTTGCTGGAGATACAATT
CCTTTTTTACCTTGAGCTATTTAGGAGCCCAGATGGAAATTATAGCCTTT
GTTTCAGAGGAAGCGTACAGAGACTTAGCGGGACCACATATATGCATAGT
GGCGCCCCTGAATTAGTAAGAGAGGACATGATGCAGGGCGGAAGCTGACA
AGTGTGTGGTCATATGATGTCCTGTTTTGTTGTCGTTCAGGGCAAAAGCT
CTCATCTGCGCAGAGTTTTTCTACAACTATTACAGTATCAATATTGTTTT
CAGCAAATTATGGGAATCTGAAACCCTGAAATACTAAAGAGTGTATGTAA
TTATGTAAATGGACTTCAGAGGCTAAATCTGCACCAACAATCAGTGGTCA
ATGTCTGCTCCATAACTCAAATGAGAAGGCTAGACTTGTATGTACTGCAA
GTAGATCAAAACTGGCCTAATGCCATGACAACTACATATGCAGTTATTGG
GTATTTATAGACTACCATTAACATATTATGCCATTTATTTGTAGATTAAG
TTTGTGATACAAAATTTATAGTTAAAGGAAACTGAAAAATCTTCCTGTTT
TGCTGATAGCTCTGGCAAAGGGAGGCAGCAAGCTTGAGGCAGCAACTGCA
CAACTTGCAAGAAAGTCACAGGTATGATAATCTTCTATTGATCTGCAGTG
AAATAAACTACCATCAGTGTCAGTGTGTCACAAGGAGATGTTATACATAA
TTTGAAAGTCACATGGAAAACTCTGTAAGAACTGCCCAAACAGAAGAGAA
TACTTCACCAGTCAGGACAAAGAAAAAAAAACTATAAACTATAACACACA
GAGTAATAACTGCTCTGAAAGGGAGACTGACAGTGACTCTCTTCAGACAA
CAAGAAGAGCTGTTCTACTTCAACCAATGTCAGCAGAACAGGGTTGTAGC
ATGGTGACATTTAGTTAGGGAATATTCTCAAGTGTATTCACGAATTAATG
TGAGAAAATTGTTTGCATTGTTATAGGCAGCTAATGGGAGAGGAACTTTC
TGGCCTAGGTGTGACAAACCTCCAGGGTTTAGAGAATCGGCTTGAAATGA
GTCTACAAAGCATCAAAACAAGGAAGGTCATTACAAGTGTTCTTCATTAA
ATGTAATTTAGTGTTCCTGTTTTCTTTAATCTAATGACGCAGCGAACATC
TACCAAACAGGACCACATTATGACAAGTGAAATTGAAGAGTTACACAGGA
AGGTTTGTCACTACAGTCTATAATCAATGCCCTTAAATATTTCAATGAAA
TCAGTACAGTAGAAAGTGTGTACTTTGTACAACTACTAACGATCCAATTT
TAAACTAACTGTGCAACAGGGAAGTCTAATCCAGCAGGAAAACATGGAAC
TATGTCGAAGTTTGAACATCATGTCACAACAAAAAATGGAACTGTGTAGA
AAGGTTTAATGCACGACATTTTCTCAGAAACGTGAACCAAACAATGCCAC
GTTATTAGAAACAAGTGAAACTAACATCTTAAATTTCAGCTTCAAAGGTG
TCAATCGGCAAGTAAAAGCTCTAGCACTCCCTACAGCTTTTTACAAGCTG
CAAATATTCCTGCTGATTCTGAACCGAGTCAATCACAACAAAAGGAACAC
GAGCACAACAAAGCAGGTGTTCCTGAATTGGGGTAAATATTCTTTTTCTA
GAATCCGAAATTGCAATATTCCAAGAAGTGTATAGAAGCTTAATCAAGAA
CCTATGCTCTGAAATGTAGCAGATTTCAACTGACCTAAGATGATCTGGTA
CGGGCTGGACAATGCCAGCATTCCACATTTTCAAAACAAGATGCTTTATT
GTACAGACTACAAAGCAGACATGTTATGTGATCAGAGTTCTACTGTATTG
AACATGCATCTTAATGGTTGTTGTAATGATACTGGCTGTAACATCATCAG
CCCAAAAGGTCTATTAGTGCTGAAACGGTATTTTAGACGCTCTAGCAATA
AGAGGTGGGAGGAAGTAGCAGGGTTTGTTACTTTGTTACACATAATTATT
GAGTACACCTTCCGTGCTGGCTGCCAAGTGACATGTCTACCAGACCCACA
GTCAACCCTCTCTCGCTGAATGAAGTTTAGCTACGGTTATACATGTACAT
GGTTAAATGGGTATATTTTGCTTTGCTAAGTTTTTCATGTGCATATTAAT
CTTACATGTTAATGAAAAACGAAAATTCCTGGTAAGAACCAAGTAAATGC
CAAACCATTTTGATTTAACGTCTGTTGATTCCGTCACCCTGCATGTCCAA
CTTAACAAACAGCCCTGAGAACACTATCCTATGTCACACGATGTTGTCAC
CTGTAGATCATTATTGTCCTACACTCGAACAAAGTAAGGAGCTTGCTTGG
AAGGTTCTGTGGGTTGGCAAGTTCGAGATGATACCTCATTGGTTCACATG
TATGGTGGTTGCTGTTAACAGAGGTGCTTAAGTTGTTGTAGTGCTCGAAA
CTTTTTGAGACACTGGGGTACTTGTAAAATCACTTTACAGAGGTACATGG
ACAAAACAAGTATCAAAATACTCACAACTGCATTCAGAGACGAACAACAA
AGTTGCAGCCCCTTCATAGCTAGGAGCCTAGGAATGCTTGCCTCTGCTCC
CATATGACACAAAAGTTGTATGTAGTTCATAAACGAATATAATCGCCATT
GATTTGTCTAGTTCTTGTTCCAAAGCAATAGTCATGCTGGTTAATACTTC
AAGTTGGAGCTGGCAAGTTCAGATCTAGTAACATGGAAAAATATGATATC
CATGGGGCTACACTTCCTAAATGCAGGGATAAAGAAGGATAGGCTCCACC
AAGGTGTATTACAGGACCAAATATGTCTCTCGGTGAAAATTAATTTAACA
AGATTCCCGCCAGCTCTCAATACTACATGCCAAAAAGGCCAGTTGCAGAA
CAATAGCTCATTCTCAGGATCAAAACCGCTGGAATGATACATAGTGACAT
GAAGAAATATAACATGTTCCAGTGTCTTACTTGCGCCTTTCCCACAAGTG
ATGCAGCTTTGCGGCTTCCTGGCAAGTAATGCAGTTACTGCCTCATGCTT
GGTGCCGCCGCATGCAATTACTAGCCTAGCAAAGGACCATCAACGTCAGA
ATATTCAGTAAGCTATGTCAGCTGAGTGAAGTACAGTTGCAAAAGGGGAG
CCGAACACATAATAACGTAGCATCCTTGCTACTACAAATAACGATAAGGA
AAATAGGGAAACTGCTAGCTCACAGAAAATGCTAACGAGGCAGAATGCAA
TAAAGCTAATGAGTCATCAGAGCTAGGAAGGTGGAAGCACAAGGAAACAA
AGAATGAAGAGTTGGTGGAAAGGTGGATCAAGGAAGGGGTCCTTGAACAA
ATGCAAAAGATGGGGGGAGCTAGGACATAGAGAAGCAGGTTGTCCTAAAA
ATGGAACAAAGAAAAGGTACAAACTAATACTTGTTTCTGTTTTCTATGGT
TCTTTTACATGAAAATAATTCTGCCACAACTAATACTCTACTTGATGTAG
GAAAAGCAACGGGAAAAAGCATCCATCATAATGGTTGATGTTTCAGTTAG
CAACATACTCCCATCTACACCAACCAAGAGCACGAATGCTGCCACAACTA
GTAGGCCCAGGCCTTTCACAAGGAGCCAAGCTGCTGCTACACCACAAAAG
TCTCCAGCCACAGCTAGTAGCACCAGGCCTTTCACAAGGAGCCAAGCTGC
TGCTACACCACCAAAGTCTCCAGCAAAAGGAAAGAAAAAAATGACTCCAA
AGAAGAGGAAATTAAGTTAATTGTGAACTTGTTTGTGGCTGTCGTGAACT
CCTTTATTTGCTGCGTATGTGAGGTCGGGAGCTCACTTTCATTTGATGTC
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CTATTATTGTTGTCATTGCAATCAGATTTGCTGACAGTTTGCATCTTTGT
GAAACTATATATTTGCTGTCAATTGAGAGTTTGAGAATGTTCAGTATTGC
AGGGAAGTTATAGTAGTTTTTTTATTTGAAACAAAACACATACTGACATG
TACCATTCTGACAACATATTCAAGGGTAACTAGGGGGTTAGAAGGGAGTG
AGGCAAAGAATGGGGCTTATGTTGCCGTGGCGCACCAACAGAGGGTGGTG
GGGAGGGGTTATAATCACTTCCCCCCGGGAAAATTAACTGCGTTATCAAA
ATGACAACAGGGATACAGTTTAGCTTTCCAGGGTACACGGTAAGGCACAC
CCCAGCTTAAGTACTCAACCTCTATCAATTTACTGAATAACGAGCAGTAC
AGTGACAAATGGAACGCAACATCACTGCTACTAAAAATAAACAAGATGGA
AAAAATGACACCTTATCATCAAATAAGAGTTGAAAAATGGAGATACTTAT
CATTAAATAACAATGTAGATTTTCTGAGAATTCAAACATTGTAGCCTATT
CTCCCTGCATGAAACACAGCCAACGTCTGATTCTGTTGCGCCTTGGCTTA
TGTGAATTTTACCTGTATTTACTACTTCTAGCTGTAGTTTTCAGTCTTTT
GGTCTCATTTTCAGAATGACGCCCTGTGCGGATTTACCAGACTTGCAGGT
TTCATTGCTAGAATGGGACCGGGATAGTATCCCTGTTGCTCAACGAAGAC
GCTGTAGCACACCACAGTTTGTTTTAAACAGTAGCACACCACAGTTCAAC
CTATTACTTGGAAATTTCGACTACAAAAAAGAATCTGCATTGCAGCCTCT
TCTAATTACTCACAGGAATCTATCAAATCTGCTACATATCCGCTACTTTT
CAAGCTGGAACACCCCACCGGCGAAAATCTAGGCGAAACGCAGCAGCAAA
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GTGACGCTCACCGGTATTTAAAGGCGGAGACGCCGAAGGGTCTGGAAGGA
TCCGGATCGGTCTAGAAGTCTAGAACACCGCAAGTGGAAGATAGAAAAAT
CCGGGGAATGACGCAGTGGAGAGGAGAAATGGCTTTCGGCGACGGCGAGA
GGGGACGGAGCAACGGCTAGGCGAGATATTAGGGGGGTGATCCGGGTTTA
GTGATTAATTAATCGCGGCCTATGGGGAGGATTAGTGGCTGTGCACGCGG
CCACGTCAGCGGCTAGGGTTTTTAATGGAACAGGTGTCGGGGACCGGAGC
GTGGACGAACGGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.