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GrainGenes Sequence Report: AE019670

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Sequence
AE019670
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE019670
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCAAACCATACGCCAATGACGCAGGCCCTCGCCTCCCGCTCGCTCCTCC
TATCCACTCGCGCGCTTTACGGCGCCACTACCTCCCCTGCCGCGGCCGCC
GCCGTGGGCGGCCGCTGTGGCAAGGGGAATCACCGGCGCGGTCTCCTTCT
CCCTGACGTTCGCGACGGTGGCGGCGGCCGAGGTGCGGGCCAAGGAGCAT
TTCCCCGCGGATCTTCTGCCGCAGAACGTCGTGCTGTACCAGTACCACTG
TACCAGGCCTTCCCCTTCTGCAACAAGGTCAGAGGTGAGATGCTGCAGTC
AAGCACTTTTTATTCGCGGTGCAGTTCTTTAGAAATGGTTTCCTTGTGAT
CCTGTCACACTTCGAGATTCAATCAGGAGGTTGGCCTGGCCTTAAAATTT
ACATTTCGGGAGTGTTCGGTTAGATCTGTATTTTATTTGCAAGAATTATC
CTAACTGGATTAAATTAGAGTGTAATCGTAGCTTCTGAGTTTAACGGGAA
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GTGTGCCTGTGAACCTCCCATTATGGCATAGTCATGTGTTAGGCCCAAGC
CACAGACTGTCGCTCTATCCATCCGGCAGCTACACACAACAGTTGCCTTT
TAGGATTAGGATTACTACTGTAATGTGTGCTAATTGTGTTAGGTATTAGA
GGCTTAGCTGAGTTAGGGAATCAAGTCTAGGTGGTATTCCTATTGATGGG
GATAGTACAACTATAATGGTCCATAAGGTGAAAGCTACTGAGATTAAGCA
AGAAAATATAGGAGTAGTTCTTCTAAATTGCCTCTGAGAAATAGCAATTT
GCTCTACCTTTCTCAAAAACCCCAGGTTAATGACATTATGCCAGCTGGGT
CCAGGAACACCTTGATTACACCCGAGGGAGCTTACCCCAGCAGCTGTTGC
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AACTTGTTGTCTATTTTACACCCTATTTCAGGTATTCACACTGTTAAAGT
TGAATATTCAGAAATCTCTACAATGGAATTTAATACCTTTGATGCATGTG
AGCGTATTAGTTAGATGCCATTGTGTGAAAATTTTATTTGACTCGAATCA
TGAAATGACCATTTGCTTTGTGAAGAACCTTGAGATGACAATTTGTAAGG
TTTTCAGTTGCCAATGGGCCGAGGGAGCTTGTTGTAAAAACCAAATATGC
GCTTCCATTTTTGCTAGCTTCCTTCTGCACGATCACCTTTTGTCTGACTT
GTTCTTTTTTGCCTTTGTTTCAGCTTTTCTAGACTATCATGATGTACCAT
ACAAAGTTGTGGAAGTTAATCCACTGAGTAAAAAGGAAATCAAGTGGTCT
GACTACAAGAAGATTCCAATATTGACCGTAGATGGTGAAAATCTGATCGA
TTCATCAGGTTAAACTTGTTGCCCGCTATGTTTTTGCAATCATGTCATTT
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AATGGCGCAGGTAACTGTTTCTTTAATTGATTGATGTGCCACTACTGTGG
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CATTTGAAAAACTTTGAGCAAAAATACTTTTGGGATATAATATACCCTGT
TTCCATGACATATCCATTCTACTTTCTTAGCAAGTTAATTGCTAAAACCG
AGTGCCTGCCCATGCCAAATTATCTGAAAGGAAAAACCTAACAAATTGGA
ATTCAGGTTCTATTATCAGTTTTTTGTATGTGTTTGGTATTCAATATTTT
GTTCAGTTGGGCCCTTCAGGAAACTGTATATGTTTTCGCTATTGTATGTG
CTTGGTATTCAGTAATTTGTTCAGTTGGGCCCTTCAGGAAACCGTATATA
AGACAGAAAAACGCTTAGGCTTAAAGTATCGGAGGCTGCTGGCTAAGGCC
CAATCCCATCTGTTACTCAACGTCACATTCCAACCCCAACCCCGACCCTC
CAGGATGCAAGCCATGCGCGGAGGTGCTCCTACACCTCCTTAGCATTGGC
ACCTCTACTCCCCAGTGTGGTGGTGCTCATTCACCTCCTTGGTCCTGGCA
CTCCTCCACCTCCTCCCCTTTGGTGTATCGGCATTCAGCCCTCGGACTCA
TTGTGCTGCTATGCTGCCTGACCAGATGTTCTGCTGCTTTTCTGTTGACT
GCTGAATAAATCTTTAGCTTGAGCATTACCCGGCCTGTATAAATCAGTTT
CTTAGGTTTAACATTTTCAAATGAACTGAATGCCATCCTACTACTTTTAT
CCATGGTCCGGAAATTGCACGAAATAAAGTTGGGAATATTACTTTGTGTA
GCTCCGGTCCAACTTTGTGCCTTTTCCTTGAATTCGCAAGTACTTAATGA
TTTTAGTGTGAATCATCTAGACTTGTATTTGGGAAATGGCAGGTACATGC
TTTATTTATCATGTTAAACAGTATTAAATTTTACACTCTTGAAAGATCTC
AGTACCCTTTCTTATGTCATTTGAAAGCCTGTGCAAATAAATTATCGTAA
CTCTGATCAAACCCATGTTCCAAAACCAGTTAGGACCAGTCCAGCTGGTA
TCTGGGGATAGTCGATTACAACTGGGAGCAGTTGGGAATTGGAACATTGT
ATTGACATTCGTACAACGTACCATTATCTGCTTGAGCATGACAGTTTTTT
TATCTTCCTTTGATCTAGCTGGGTTGATGAGCACCTGGTGCATATATTGT
CACCAAATATATGCCGCTCGACTTCGGAGGCTCTATAGTCTTTTGATTAT
ATTGTGAAGCATGGTAAATCTCCACAACTTTCCTCTTCTATGTTCCCTGT
TATATGTTGTTTCCTTTTAATTATGTACTACTGTTAAATTTCTTGCCTAA
TTATCAGTGCAAATGCCTATGTTACTCCATGCTCACTGTGGAGTCTAGTT
GTTGAGGATTACTAGAGAAAGTTATAAATGATCACAGAAGGTGGTTGATA
TTTAGGTGATATTTGATTACAAACAAGTCCCATGTGTGTTCTCCAAATGT
TACTTCTGGAATGGTAATATAATTTTAATAGGCAGTCATCCATCTGTTTC
AAATGTTATTTCGTAACAGGCCTATGGACAGGTCCAATCATGTGAAATTG
TTTTGACTACATGGGTTACCTTTTGTTACTTTTAATAACCAGCAACATTT
ACCCCTGTTGCGTGCAGATCTGTTACATCTTTGTTCTCATATTTTGAGTA
TTAAGCACCTTGCACGTTACTTAGAATTTGCATTGGTTGGTTGGTGATTT
GTATCAGATCAATCTTAACAGCACTACAGTGGCCAGTGGGCTCCATATTG
CTTACTACAGTGTACCATTAAGAGTTGTGTACCAGTAAGAGTCCCAACTG
CTTGGACGCATGATCCTATTCCAAATTTGCAAGAGACTCGCTTTAAAATA
TTTGTTAGCTAACAATCTGAACTGTTTTTTTTTCCACATGACACAATCCA
AATAGCTACACATACAATACATGGCATACCATACCTGTATGTTATAGAGA
TATATGCTGGGATGTATCATACAATTATCATAAGTGATTTTGTAATGGCT
ATGTCACGCCCAAGGTTTTGGAGGTAGTAGTCGTGGTGGGTTTCAGGGCG
AGGGCGAGGTAACTTGGACTTCCGGACGGCCATGGTCGCAAACTGGCAAC
CTGGGTTGCTGCTGTACGTGGAGCCTAATCTCCTTTTAAGTGTATTGCTT
GATTGATACCCTAGTACAGCTTACATCCCTTTATGTATTAGGGATCCCTT
ACAGAGTATGAATTGGAACAGAACTCCTAGGGAACCTGCCTAAACTGATA
TGAACTGCTAACTCCAGGCTCCTTGCAGTGGCGTACATGTATGCGGCCCG
CATTGCAAAATTTTGAATTTGTGAACCAGTCTTTTGGAAAGGTGAGCTTT
GCACTTTGATTCTGTGGACCCTCAAACATAAGTGCACATGCTAGTCAGTT
TCTATACACGATTGCACCCCACTTTCCCTTGATGAATCGGAAATGCAGGA
CAAGTTGCTTCGCTGCTGAAATGATGCCCTGTACCTAATGGGTCTTCCTC
TTTAGGCCTTGTTTACTTCTCTCGTATTTTTATCCACTAGAGTTGTGGGG
ATATGCGGGGATTTGGTGTTCACCCAATACTCGCCAATTCCCGCAAATAC
TCTTCCCTGAAAATACTCTACCATATAGGAGAGTTTTCAATCTAGACATA
AGAAGGATTTACGGGATATCTCGGCATTATCCCGGCCAAATCCGGAGTAG
TAAACGGACTACGGGGATTTTGCAGGAATTGGAATAATCCCCTCCATTCC
CCGCAAATACACTAGTGAATACGAGAGAAGTAAACAAGGCCTTACCAGGA
GCACAAAATCATACATGTAACTGGCTAAATTACTGTTCCATGATAAAAAA
TTGAAAATGCTTAAAGATGTGCTGCTCTGCATGTTCTCCATGTTTGACAC
TCTGAACACTTTGAGAGATGATATTGCATTGGTTTTAACTGTTGGGAACT
TAAATTTACTCCTGTTCCCGATCTCCTCGCTGCTTGTTAGTGGACACCCC
CACGGCTGTCCGTCAGCTTGCCACTTGTGCCCGTTTAATTAAATGGGAGT
AAGGTTTTGCTGCTTAATTTCACCATAGTTCCGGTGTCCGTCAGCCCGCT
TGAGCCCGCCAAAAAGCGACAGGTAGCCACTCGAGTTGCAGTCAAGCAGG
AGCTCACCAATGCGTTTGTACTTCCAAGAATCGTTCGTGCACAGCCCGCT
TAGAGTTGCAGTCAAGCACAGGAATGCCCACTCACGGCTACACCACCGGA
CTCGCTGCTGACGGCCGTTGTCATCCACAATGCCCGCCTCGACCCCGTGT
CCTGCTCCATCTCCGCTCCCATAAACGCAAGCAGTCGCTGCCTCATCAGC
AGGTGATGCGGCTGTCTGCTCCTCTGCAGATGGCGCTCATAGCAGCGGCA
ACGCTCCTGCCTCCGGACACGCTGGAGGCCGGTCTGTCGCGCAGCTGCAC
CTGGCTGTCGACACCCCTGCCATCATCTGCGCTGAGAACGTGGGCTGGTT
GGTTGGGCTGCTGGGGCTTCTTTTCTGTTTCTCCTTTTCTTCAGCTTCTC
TTTACTTCTCCATTTCCCAGAACATTTTCACAGAAAGAAGAGAAGTAAAG
GTTTGTGAAAAAGAAAAGGGCGCAAACATTTCTAAAATCTGGTTATTTGA
CTTAAAATAATTTTTCAAATACTCCCAAATTATTATATATTGGGTTTTAT
TTAAAATAAGAAAAAGGGAGGAAAATGGTTTATTCAATCCTAGAATAATT
TGGGAAAACAAATAAATAGGGTTTTCATCAAAATAATCTTTGGGTTTAGC
AAAACATGTCAAAATATGCAATGCTTATGATGCAAAAAATATAGAACAAA
CAAATCTAATATATAGGGTAAACCCCCAGGATGTTACAAAATTACGCACT
TGAGTTTTGTTGCGACGATTAGACTCACCAGATTTGCTAGTTAAGTGGAT
CGAGGTGGCTAGGGAGCCGGCTGATTCTCCCCTCAGATCATAATTACAAT
GTGTGCATATTGGATAGAATGTGAACACAATTCTATTTCATCTCGTTACT
TAACACATGAACTCAAATCTTATATTTTTTTAAAGGAACATGGCTAGATC
TTTTTGGAAAATTATAGTACCCTAAGCAAAGTTAAGAAAATTTGTTTATA
AAGTTGTAAGTCCGCGCATTGATTTCTAGTGTATAGAATTGTATATCGAA
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AAGGTTCAAGCCCTCGCGGATGCGACTTTGGTTATTTTTAAAAAATCGTT
GTAGGGGTCTGCCCACCACTTTTTTTTAAATAAAGGAAATACGGTGTCAA
CAGACAATTGTTTTTAGTAATGAACATAGACACGATAAATTGTACACAAC
AGGAATAAATATGAACACGATTCTGTTTCATGTCTGCATGCCTTCGGCTG
GTACACCATGGTTTTTTTGCAAAGCAGGTGCATGCAGAAAACAAGAAAAC
TGGGTGTCCTGCTGTCTTCACACGCCGACTCCTTTCTGACAGCCAGCGCA
GACGCGTTTAAGCAGTTGGGTATTACTTAACACATAAACACAAATCCTAT
TTCTTTTGGAAAGGAACACAGGATAGATCTCTTGACGTGTTACAACTAAT
ATTCTTTTCCACATCCCACAGCCATCGCCTCGCACCCTTCCAATTTTAAC
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ATGAAATTTCCTGTTGTACTAGCTGTAAATAGCTACCCATCTCTCATTGT
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AGAGAAGAAAGGCGAGAGTTTGCACATATGTATCTAGGCATGAAAGGCTC
ATCGACCACTGACGAGGGAATGGAACTGAAAGTACTGGAGGACGTCCAGG
AGAAGGTGGAAGAGGATGTGGAGCAGCCACCAGATTGGCTTCCCAATGGC
TGGATTATGGAAGTCAAACGTGGTGACGATGGCACCCCCTACCAGGTACG
TTCTGTACCAACCATGTGTTCATGCAAGATGGGTACTAGTATAAAGATTT
TAACACCTGAACATTCTCTATGCATGCTATTTTTTCTATTGTTTTGTTTT
GAGATTTCTGATTACTTTTCTTCGCCAGTATTTCGTCTCTCCAGTGTCAG
GGTGCAGATTCATGATGAAGGCGGAGGTCCTGAACTACCTTTTCTCCGAG
ATGGATGAGCACTGGATACAGTCTAAGAAGTCTGCTGAAAGTCGCAGCTT
TCTCCCTGTATGTTTTTCGTTAGTCTGCTGAGGTCATTATTTTTTTGGTT
TGGCCTATATCCATGACTGATCTGTGGGCCGTTCTGTCATGATATGCAGA
AGGTGCACGAATGGCTTCCAAAGGGGTGGTTGCTTGAGATTAGAGCAGGG
GGTGAGAACATGGACAAGATGTTCAAGGTAATAGCCTTTACCCTTTTTTA
GTGAATAAATGACTTCTTAGAAAGCATATAATCGTTTTTTATAGCTTTGG
CTACTATACACACTAAAAACTCTGGTTGGTAAGGTGCCAATATATAGTTT
CCATTGGAGTTTTCATGAAAAGTATTTTCATAATATAAATCTCTTCATAA
TAGCCTCTTTGTCTGCATGAATATCCAATCCTTCTAATGGATTTTGATCA
TGTCATATGAAAAATTATTAAAACACATCTTTGATGGTATGCATGGTTTA
ACTAGTGTACAAAGTGCAACTCCCAACACAGCAGTTTGCTATTTCCTCTA
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TGTAGATGATTGGATGTGAATTAAGCGAGCAGTACGTGTTATAGTAGGTT
AAAAATCATGGGTCGTATGATAAATACATGCCCTTGAAAAGACTAACATC
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ATAACATTGTGCGTATACTTTTTGCAGTTTTATGTTCACCCTGCAATGGG
AGTACGAGTACTATCTAAAGAAGATGTACTACTTTATGTTAAGGAAATGA
AGATCACTGAATGTGATACAGATGGACAATGTGACACAAATTCTCGAGAT
AATGTATGTTTCTGACTATCCCTATTTCTGCTACATAACTAACAATTTTA
CGTCTTAAATGATTTGACATTCTTAAACTAATTTGTATCCTTATATGGTA
GATTCTAGCAGAGGTGGAGTTCAACCCATCTGGGTTGCCCCAAGGATGGG
TCAAAGAACTAGTTTACAGAAAAACAAAGGAAGGAAGAAGGAAAGACCCG
GTATATAAAAAATGAAAACTAAAAACCCTCCCTTTTTTGTTGAAATTTGT
TTCAATCTTCTGATCATTATCAATTGTGCAGTACTATACGGATCCTGTTA
GCCATTATGTCTTTCGTACTCGGAGGGCTGCACTGCGCTTTCTTGAGACT
GGAAAAGTCACAAAACATGAATTTGTTCAAAAGACAAGTGTTCATGACTT
GTACTCTTTTGAAAAATCTGCTGATCTGGTAATTGAGCTTCCAATATTAT
ATATTTATACTAGTAATTTCCTTACAGCAGTGCCTCTTCCCAGAGTTACC
GTTTTCATTATATGGACTTACTTGTCTTAGAAGAATGTGCAATGTAGTCT
TTTTATTGTCCATGCTTATGGCGCACAATCAGTGAAATTAAACGTATTAA
TTAACGTTACATGGGTACATGTATATGTGAGAAAACTACAGTATCTTTTT
AAAAATATGCTTCATTATTCATCATTTCATTTGTAAATAACAAGGTACGG
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TAAATGACCACCTGAGTCTCGCCTTCTCTTTCGTGTATCATTCATGTGGG
ATTGATGCAGTTTTCACGTGTAAATATGCACGTGCCGGGTCCAAGTGATT
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ATTTATGTTTAAGTGCCTCATTTACGTTGATGTGGAAAAATGGTCATATA
TCAAACTTGTCAGCCAAAAGGTATAGCACAGGTTTAGTTCATATTTGCAC
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CTGTTTTGCCACACAGAAAAGCCAAAGTATATGATACGTTGGAATTGAAT
AGAGGGTTAAATGTCCCTTTCGTGGGCAAGTAAACTATAACATAGTTTTT
CAAATTCAATTATAGGGTCATTTTAGTTGTATAGTAAAAACACAGTTTCT
TCAAACAGACATGCCTAATTTGGTCAAATTTCAGATAACCTACACTAGAC
TAACTCGACATTCAACAGTGTTGGTTTTTGTCTACTAGTGTGCCAATTCT
TTGATGGTGACTTTGAAGAGTTCACTAAGCTTACAACAAGACTGGTGGCT
ACTGGCTTGCATTTTTTTTCTCAGACCATGCATGATATGATGATTAAATT
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CGCAGTTTACAGTTATGCATATTGCAAATATATTACTATAATAAATTGAA
AACACATGAAAATATTTGAACTGTTAGCTTACGAACAAACATATTGCTTT
AGCCTTGTTAAAGTTTCCATTTTTGTCAATTAAATAATTATTTGTACATA
TATTTGATACTATATATTGCATACATTTAACTGATTATTTTTGTAGCATG
AGAGTTTGTTGAAGAGACTAACAAAAAAAGGGAAGGATGCTAAAACACCT
ACAAGTTCACCAAAGCTTAGAGGATCAGCACTGAGGGGGAAAAAGAAGGG
TAGTGGCCAAACATCATATAGCAGTAAGTTCCTCCTTATAGTTGATATGG
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CTTCCATCCTGTTTAGTCTCAGTACTTTTCTCATTACCAAGAATAAACAG
AATCACCCTATGCTGTCAGAACCTATGTTGCTACACGGGTCCATCAACAA
AACAAATACCTCAGGCACACTACTACACTTATTCTATTTAATCAGCTGCT
TTATGTGTGACTGTGTTGCCCAGAAGTTGATTTTTTTCCTTCATTTATCT
CATGATGTCCATTAGTACATTAATCTAATATGCATCCTTTCGCTCGACTT
TATGTTATCAAATATGAGCCTATTTAAGTTTCCCAATGCCTTGGTATCCC
TTTTTTTCTAAACTGATGTAAGTATAGTATCTTCATGTCAAGTTTACAAC
TTGTACGTACAATCTACTTCCTAACCAAATGTTGATGTTTCGATCCATTT
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GTTGAGCAGTAGCAAAACATATATGTTTTCTCTTGAGAAAAAACTATTGG
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TTTTATCCATCTACCTGATACTAGTGCACATGGCTTGTGTTTTTTGTGCC
AAAAAATGAAGGAAATAAAGGTCAACAACATTCATTTGGACAATTAAAAA
GTGTCCAAGTCTGTGATAGACATAGCTGATCTTAAGATCATATTTGCATG
CCCTTCCTAATAACTCATTCCTTTTGCTGGTATAGATGAGGACACCGATA
CGGATAGCTCTACAGACTCGGTTTCACATGAGCATGAAAACATCATGAAC
AAAAGCATGAAGACTAAAAGGGGACAACCAAGCTCCCCTGAGATTATCAA
GCGTCCAAGAGGGAGACCATCCAAAGTCGCAAAACCAAAGGGATGGAACA
TCAAGAAGGCTATGACCAAAAGAGAAATCAAACAACATACTGGATAATTA
AGCAAGGGATAGCAGGACATGAAGCGAGGCCACAAACCATAGAAATCACC
GGTTTCCGTGGCAAATAATATTTAGCCAGCATTTTGTTCAATTTTGTTTG
TTCAACTTTTATTAAATTTCCAACTTGCTCCCTAGTATCGGTTGGTTTGG
GCAATGCTCGAAACTAAGGCAGTTGTGGCAATCGTTAGGTCCTAAGACAA
GAGATCCCCGAGAGTCCTGAGACTCCTCATACACATTGAATAAAATGCCA
CAATTCCGAATTAGTGGATTGGCACATGTTCCGAAGAAGATTGGATGATC
ATCTATTTATATAAACTAATCTTATTTTGTTAAGTTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.