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GrainGenes Sequence Report: AE016885

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Sequence
AE016885
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE016885
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGCCGATAAGGTTCTTCGGCGCGTCGTCACCCTCTCGTCCCCCTCCTTCC
GTCCCGCCTCCTCCACCTTCCCCCATTCCTTCTCGCTGCAAACTCTACGC
ACCACTCTCGAGCTCGCCTCGCCCTCCTCCCTTCCCACGGCATCGCGATG
CTCGCGAGCCCCGCCACGCTCCACCATCTCCTCCTCCCGGCGCCGCCGCA
CCTCGTCTTCGCTCTCCCGAACCCCGCGCCGCCGCTCCACGCGTGGCTCC
CCATCTCCCGCCTCGCGCCGCCGCGCGTCGCGGCATTTGCACATCCCTCC
TCGCGCCGGTTGAGACGGAGGGATGGGAGGGCTAGGGTTGTGGCTGCTGC
AGGAGACGAGGCGGTGCCCGCGGTGGCGGCCGAGGAGGCGAGCAGCTCCG
GCCCGACCAAGTTCTCCGTGAAGATTCCCGTCGGCGACCGTCACGTGAGC
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GACTAATAGTTCAAATGCTTTGTAATATACTGATTTCATTCTCTGGGCAG
AGCAGGAACCTGACCATTCGTGATTCTTCTGCATTTTAGGCTCCCATGAA
ATTCGTTGTGCCTGAGCGTGCATTTGAACCAGATAAACCTGCCTTGCTTC
TTCTGTTATTGTTTTCATAATTTAGTAATACCAGTTCCAGAGGACAGCAA
TTTTTCCTATGCGTATCAACATTTCAACTTTCTCACGTTCAACTAAGACA
GATCTTATGCTTCATTGCTATTTTTCAGTAACATTATAACCTAACTAATT
GTACTGGCAGATTGTGTACTGTTCTGTTTGTATGGCTGATACTCCAAGCG
ACCCTTCTGATTTTTTCCCAATGTCAGTTCACTATCAGGAGCGCCTTTCA
GCTGCTGGAAGAACTAGGTACAGAACTAAAATAGTTCTTGCCCTTGTATT
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ATTGAATCCAGTGGTGGTTTCTTTAAACGAGAAGGAAGGGCAAAAGATCA
CGAGGTTCATTATAAGGACTTTTACTACATTGCTTTGCTGTGTTTGTTGG
GTCACTAGAGTTTCTTTCTTACTATAATCGCAGGTTTTAGTATGCAGATT
GATAGACAGGCCTCTACGCCCTACTATGCCCAAGGGGTTCTATTACGAAA
CCCAAATTCTATCCTGGGTAATTCAGTGACCTTTTTGTATGCATACATAA
CGTATACCATCCTTTTCGAGCTTTAGCACATTGTCTCATTATTCCACCAA
TTATTACTTGATTTTCGTTGGTGAGCTTTATTATTTATACGATGAAACGA
CAAATTCTTACTATTGCAGGTCTTCAGCTATGATGGTATTCATTCCCCTG
ATTGCGTGGCTGTGACAGCTGCTGGTATAGCCATGTAGGTCTAACTGAAA
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CAGTTTGTTATTAATCCAACTACTGAACAAATGGAGGACTCTGAGTTGGA
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AGATTTCTTGATAGTTAGGTATTGATTTTCTGGAGATGGGAATTAAGATG
TTGTTATCACTGATCTAGAAGCATGTAAAATTACCAGATCTAGCTTCGCT
GGTATAAGCCATGCTGCTTTTCTTTTGACAATAGCCCGCCAGTAGCTATT
GTGAGCCTTGTTTGGTTGGTACAATTTTTTCACTACCCAGCATTTGGTCA
CGAAATCGGCTGCCATGAATTGACCAAATTTACAATTTGGCAAGACAATG
AATTAACATAAAATTTAATTGCCTAGATCTGATTAGTCGCTACACTAAAG
ATAACATCAAGTTTAGTTGTTGTGATACATTTAAAAATAGGTCAATTTGG
GTGAACCAGGCTGTAGGTTCTTGTTCTTTCATTCCTGTTATCTTCTGTGT
GATGGGCAAATATGAGTAGCATATGATATCCTTAAATTGTTTTTTGATAT
GGTTCTCTGCCCTTGATTCTAAAGATAGGTCAATTTAGGTGAACCAAGTT
GTCTGCCATGATAGTTCAGTCATCATGATTCTTTCACCTTCCTAGTTATT
ATTTTATTTTAATATCACCTATTCTTTTCTGAGTTCTGACTAGTTCTTAG
TAGGGATTCTGTGATTTTCTCACTGAGGAGAAGCTGCTTCAAGCCGTGGA
AACAGGACAGGTTCTACTTAGCTTATAAAGTCTTATTATGATGCTTGTAG
ATACAAATGTTTGCTATCCATAGTGTAGTTTGACAAAGTATGGTCCATCT
GATTGGAAGATGCTAGTGCTTAGCAGTTAATAGTCTAGTCAACCAACAAC
AACAAAAAATCAGCAAGTTTTTGCTCAAATATTTGATTTATTTTCCCTTT
TTTTTCTGTATCAACTCATGCTGTTATCTTTTGAAATTAGGGATCTGTGG
TCCCTCTAATTTGTAGTTCATTGTAAGGGGCGAGGACCTTTATAGTTCCT
CTAGATGCAAGGATAGTGAACCCCAAATGTCAAGTTACTGAGACTTCCTC
CAACAAGAGACCCAGGAGTTTATCTATTTGGAAACATTTTTAGAATCTCT
GTTCTCTGCTAATTATTTATATTACACATTTTTGCATTAGTCACCTGCTC
AGCTGATATGATAACAATCATCTCTTTTGATCCAGCTCTACCATAAATAT
TTGTTCTGTTTCAAAACATGCAAACTTTACTTTGTTATCTTCTCAGGGCT
CCTTTTGGACTGTCGTTATATTGTGTTTGTCTTCCTTCTTTTGTGATTCT
AACTTAAGTAAAAATCAGGAGGCAATTCGAGAAATCTGCAAGGCAATTGA
TGTTCTTGTCCAGACCTGTGGGAAGAAGAAAATGGTTGAGGCTATCAATT
TACCACCCCCTGAACTCTACAGGCATGTTGAAGTATGAACACACTGCAGC
CCTTTACCTAATCAAATTTATAGTATTTTAACTTTTGATAGGCCTATGTA
ACATTTTCAAGTTCTTAATAGTCTTATAGTAAGTGAAAACAGCAAGCATA
CTATTGTTTTTAGTTTCTGTGGTGAGTAGCGAGCAGTTGCTGACCTGCTG
TGACCAAAGATCTTACTGGTCCTTTTCTATCCTACTTTCCTACATGTTTT
GTTATTTTCTTTCAGTGGTATATTGGCCACTCTTCAATACTAATTGTTAG
TATCACTGTTCTCTCAGATTCTTGCTACAGGTGGTCAAATGGTCAGGTGG
ACTGAGAGGGTTTTCATGGTGTCTAGATCTTACATTACATATGTCCTTTG
AATTGTTTTACCTTATTTTAGGCTATGTGTGCGTCTGCTTGGTTTCTCTT
CCATGTCAAATTGTTCTACTTATGTGGTCAATTTTTTACGCCTTCCAAGG
ATGCCAGTGCTAAATTTGCCAGGGGTAGAAATGCTTGTTCTAGTAATATG
TGAACACCAACAGTGTTAAATCCCAGCTGGAAAAAATGATTGATAGATCA
TAGAAAATTAGAAATACAACATGCCTTCTCTCAAGACAGCATTTTGCATT
GCTATTTAATACACTTTCTTTTCCTCAAAAGCCAAAATCATGTAAAAGTG
TATCTTACGTTTCTTCTTTTCTACACTCTCATTTCTGATTAAAACTGCTA
ATATTTTCCAGGATATTTCTGGAGATGAGTTAATGAAGGCATTGCAAATA
AAACAAAAAATTCCCCGAAGAAAAACTCTTTCAGCACTGGAAGATAAAGT
AATAACGATACTGTCAGAACAGGGTTATGTGTCCAAAGATGAGCCATCTG
GACCAATTGAAAATTTAGCTGATATTGTCGAGGAGGAAGATGAGGACGAA
ATTATAGAGGATGGTGAAGTGGATGAAGGTGATGTTCACATCAAGCCAGT
GTCAAGGAAGCCCCACCGTCAGGTGAAGGTCATTATTTTGTTCTCACTGA
ATATATGATTTTATGACTCAAGTTCTGTTTGTTGACACTGTTTTTAGCAT
AGTATCTCCTGCACAATTTTCATAGTTATTTTCACTGATCCAGTGTTTCT
TCTATGTAGTTATATTCAGAAGTCGATGTCAAGCTAGTCTTCAAGGAAGT
CTCGTCCAAATATTTGCGAAGGCGGATTGTAGAGGTATTAATTGCCCTCA
TCCTTTGAAGGTCATAGCCGCTAAGATTTCCCTTGACCTAAATGTTAGTG
CTAGCGTACTTCGTTTTATCTATTACAGCATTTGTTGGGTAGGTAGTTTC
ATGGTGAATGATCAGATACAAAGCATGATAATCTTGAAAGTCAAGGCGAT
GTAATTTGAAGATAGCCAGAAATAGAGTCTGAGCACAGTGCTGCTGCTAC
TGCATAAGAATCAGAAAATCAGATAGAGAGTGCTATAGTTCTAGTTACAA
GACTGGCTTTCTTGCAGCGTTACATTTGGATCACTAAGATTCATCAGCCT
TGAAAACGATTCCCTGAATGTTGCATGATAGTCCAGGTCTACAAATTTGA
GTGATATTATAATTCCCGACAGTTGACTTCCACAAACAAGAAATATGTCA
AATGTAGTTGTATCGGTGGGAGGTACTGTTGTTAATTGTGATGGTAAAAT
GGGTTAGTTGCATACCACTAGTAGAGGACTCTCTGTAGAGAATATGGCTG
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ATGTTGCTCAAACTTCAGGGTGGAAAGCGAAGCGATGGACGGAGTCCCTG
TGAGCTTCGCCCCATTAATTCTCAATGTAGATTGCTTCCACGGGCACATG
GTAGTGCACTGTTCACTAGGGGAGAAACACAGGTAAGGTAATACACTTCG
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TTTCTTTCTGCATATCATGCTATTGTTATTGTCTCACTACTAATCCTCTT
TGACCCCTCCTGTTTTATCAATCTTGCATGTGTAACATATGTGTGTATTT
CTCTGAACGATGTTTCTTATCGCAGTCAATACTTGTTGCCACTTATTTTA
GATCTAATCTATTTTGAGGAGTAATTTTGACTTGTGTACAATTTAGTGCA
ATTTCGTGACTTAAGAGTGTAAAAGTTTACTCATCACACTAATCACAATT
TCACACTAACAAGGGTAGCTGTGTGTGTCTACTGTTTTCTCTTCAAACAG
AGGCAGTCTCTGCTACACATAACATCTACAATCCATAAGTTCTTAATATT
TCTTATTTAATCATGCAGGCACTGGCTGTGGTCACTTTAGGTGACTATCA
GATGGCACAAAGAATTGACACCCTTGTTGACACTGAGGAATCAAAGAGTT
TCTATCTCCAGGTACGTGGTAGGAATGTTGGTTGATGATATATCATCTTG
CTTGGCCAGTTTTCCATCTCTAAAGTTCAAAAGTCTTCATCTACTATTCT
CATAATGCTAAAATACCCTATTCTAGAGAGTTTTGCTGATGAAAAATGAC
ATCTGTAACGCTCTGTTGGGCTTCTAGATAGTGCCATTTACTAGGGCAAT
CGTTTTCAACTAGTCCTTATATTCCGATCTGCTAAATGAAGGTCCATGAA
CTAGCTTTTGTCAAAAGGAAAGAGTGAAAAGTAATGTACTTGTATATTAA
CATGTCTTACGTACAGTTGAGTGTTATCTTCAACTACTAGCATTGGATAG
AGCTCTGTCATAATGCTTTGAAGTACGATGTAAGCTGTGAAGATACTGGT
ACTACTTCCTAGTTTAAGCAGTTACTTTCTGAACCCACTACATTTGCTCT
CGAGTTTATAACAAGCACACTGAGTTTGTACATTTGCTCTCGAGTTTATA
ACAAACACACTGAGTCTGTACAACCGGAGAAAACCCAGGATCGGTGCCAC
TGCTAGGTTCTTTCTGGTTCAGCTGATGGAATTTTTATCTGTAAAAACAA
GTGAAAAATATTATTATTTGGAAAAATCCCTGTCATAAGACCAATACGGT
TTTGCACTTATTTGCTCAGTAGTGTAGGCAATATGTATTAATATTTTAAA
TACCGCTCATTGAGCTGCTTCAGACTGCCGGTTGCATGTCTTACATACCA
TGAGATGAACTGACAAACATATGCCTCAAAGTTCCACTGACCGTTCAGTT
TATTGTGTGTTGCAGACTGCTGTATGCATGTGTTACATCCCATGATTACA
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CATCTGTTGGTGAAGTTGGTCGAACTGGAGCACCTAATAGGAGAGAGATA
GGACATGGTATGCTTGCAGAAAGGGCTTTAGAACCAATTTTACCTCCAGA
GAAGGATTTTCCGTACACTATTCGTGTGGAGAGTACTATCACTGAAAGCA
ATGGCTCATCCAGGTAATGATCATTTCATGCTTTATTCCATTACTTTTTC
TAAGTTTTTCCACGGGTGAAGGTTTTATAGAGTTGACACTAGACGTTGTA
CCACTATGTTCTCTTTAAATTACTATTACTATCATGTGTGCTGTCACTTC
TCGCCTCCCTATAGGAGTTGTTATAATATAGATTCATCCTTCCACATGTA
AGGTGCAAAAAATTGTCATATTTTTGTGCAGGCTGCAGGATAGCCTTGAT
CTTTTACCCAATGCTTATCATAACAACCAGCATCATTTTTCTTGCATGCA
CTGTAATTTTTTTAATGACAATATATCTCTGGTAACGTATTTCTGTTATC
TATCACCAGCATGGCTTCTGTCTGTGGAGGTTGTTTAGCACTTCAAGATG
CTGGTGTTCCAATAAAGTTCCCTGTAGCTGGAATAGCAATGGGCTTGGTT
CTTGAAACTCAGGAATTTGGTGGAGACGGTACACCACTTATTCTTTCTGA
TATTACTGGATCTGAAGATGCCTCTGGTGACATGGATTTCAAGGTGTAAC
TTGTATTCTACTTTGTGTTTTTCCCCATATAAATACAGTAGCCTGGTTAA
TGGTTGATGCCGTTTGAATCTTTTAATCTGTTTACCAGTCAATTCCTCTT
TCAGGTTGCTGGTAATGAACATGGTATATCTGCTTTCCAAATGGACATCA
AGGTTGTAATTACTAACGACTAGATGAACCAACATTTTTCTTGTAATATG
ATATTTGGTGGCATAACATCAAAGCTGAAGTTATCTATGTGCATGTTATG
CTGTGGCAGGTAGTGGGGATAACTCTACCTGTAATGGAACAAGCACTTCT
TCAAGCTAGAGATGGTAGAAAACATATTCTAAGTAAGTCTGTAGCCTGCG
CGTAACCTTCAATCTTGCTTTATTATTTGTGGATACCATGCTCAAAATTT
CGAATCCAGTTTCATGATACTTGCTAACCTATGAACATTGTATCTAAACT
GCAAGCTGTAACATTAACAGAATGAGAAAAAAAATGTAAATTATAGCAAC
ACACCTAAGTTCTACTAGGCTTGAGCATTTTAATCCTGTTGTTGTGTACA
AACATCAAACCCAACTTATAAGTTGTGTTAGTTCTGGACAAGGAATATGC
AGTGCATATCTTTGTCAAATGGATCACCTTAGGTGACATTTATAAAGACA
GCTACTCCCTCCGTTTCATAATACTAAAAGGCGTCTACATACATTACCTT
CACAACTCCGAACCTACACACTAAAAGGCGTCTACATACATTACCTTCAC
AAAGCTAAACCATCTTATATTATGAAACGGAGGGAGTACTAAATAAAATG
TGAGAGATCTATCCAAAAACTTCCAATAGTATAAACATGATTGGAGCCTT
TGTAGATAACAAACTCTATTCTTAGATCATAAAGAATAGTACTCCCTCTG
TTCACTAATGTAAGACATTCTAGCCTTTTTTTAAACACATGTATGTAGAC
GTGTTCTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTGGAGTGTATCTAGTCCTTGAA
ATATATAAAAGGTCTTACATTAAGGAACCGAGGGAGTAACAATATACTCG
TCTCTTCCACAGAATGCATTATGGTGAAAATGCCATTTGTACTTTAATTT
TCAAATGAATTTTAGGTATTTCATCTGATGTTACATTTCACTGTCTTTTT
CAGATGAAATGTCGAAATGTTCACCTCCGCCAGCTAAAGCACTGTCTCCC
TATGCTCCCGTAATTCATGTTATGAAGGTTGGTACATTGTTTGTGAAGCG
TGATGTTTTTTATTTTCTTGCAACTGTAATGCTTTAAACTTATCCGGAAT
TGTTCTTATGCAAGGTCAAACCCAACAAGGTGAATTTAATAATTGGTTCT
GGCGGAAGGACAATAAAAAGCATACTTGAGGAGACTGGAGTATATGCTAT
TGATGCTCGAGATGATGGCACGGTAAGGAGACCTTAGTGATAGCCTTTGA
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AAGGACATGGAAAGCTTAGAGAAGTCAAAAACCATAATAGAAAATCTAAC
CATGGTTCCAAAAGTTGGAGAAATTTTCAGGTGTCAATTTGTTTAATCTC
TTGGTTTTATGTGCATATAATATCTTCGTATTACATTATTGCTTCCTATA
GATTATCTAAGCACTTGCTTTTAAATGCACATATCTGGGGTTTTAGCTAA
TGAAACTCTTGGAAATTCAATTGCCAGGAACTGTGAGATCAAAACAATTG
CTCCATATGGAGCTTTTGTTGAAATTGCACCTGGGCGTGAGGTGAGAAGC
TAGTAATATTTACTTTATTAATTCCTACGTTAACATAATTATTGCACGTT
TGCAATGCAAAAGAAGCAATGCTACTTCTAATTGACAAATCCACGTTGCC
TCATTGGGCTTCTAAGGAATCAGTTAGTTTTCATGCACACAGTTATCTCC
GGTAAGCTTTGATTAACTTATTGCTGTAATTCATATCCTTAACTCAATGT
GCAGGGTTTATGTCATATCAGCGAGTTAAGTTCGAGTTGGTTGGCCAAGG
CTGAGGATGTGAGAACATATATCACAATATTTTGTTTGTTTTGATTCTTT
TTGCGTGTTAAAGCTAACCGGTCCATTGTTCTTCTTTCCAGGCTTATAAA
GTTGGCGATCGTATTGATGTCAAGCTTATTGAGGTTTGTAGTTCTGTTTA
AAGTGTAAACTCAACATGAATGCCAAGTAAAACATTGAAAGTTGCACCTT
TGGTATATGCTGCTGGTACATATAGATTTCTCTGGTTTTAATCAATGGTT
GCCAAAGAGCCACATATTGTTGAACCTTTCAACCGGAGTATAGGTTACTG
TTGCTATCACTAATTTTAGCTGTCTTTTTATGTTAACCTGTGGCATTGTA
TATATTGTTACTCATGTTTTCAGTTGCCCAGCTAGCAAGAAGATAGTTAA
CAATTGCTGTATGTCTTTATAATGCTTAGGCTACTATTCCCAATCCTACC
GCTTTAAATACCATTTGATAAATTTATCTGATTTCATATTGACTCTGCTT
TCTGAACGTCTATTTTCTTCACTTTCCGAACCAGATAAATGACAAGGGTC
AACTTCGGCTAAGTTGCAAAGCCTTGCTTCCTGATGCAAACCAAGAACCC
AGCAGCAACAAGCAGCAAACGAGCGGTCCGACAAAAGAAAAAATAGTGTA
CAAAGATGATATCATTAAGGTGACTACAAGAAGATCCAGACGCAAGAAAG
AAGGTGAGCCATCTGCAGCTGAAACTGCCACAGCAAAGACCCTTGAAAAC
AGCACAGCGGAAAATGCCTAAGGATTTGGCTTCACAAGACAGCTAGATGG
GGAAAGAAACAGGGTGACACACGAAACATTGCGCTTCATCACATGGATTG
CCTGAGAACAGCCACTAGCTAGGATTGCAACGACATTCAGTAACCGTGTG
ACTGGAATTGCATGACAATGCTGGCTACGCAGATTACCCACTCTCAATTG
GACTCCTACAAAAGGGTGAATTGTTCATATGTTCAAGTCTCCTTGCTCTA
TGATGTGCCGAATGAAGATGCCACAGAAGAAGTGAAACCTCCCCAGATTC
AGGTTGCTGCTTCAACATGCACCATTTTGGCTGTGTTGCGCGTCCTGCAT
TTTTCCGACCAAGGTCGAAGTGCAGCAAGGAATGCCTAGTGGTTTTGATT
CCTGACTTTAGCACGAACATGGTAGAATGTTAGTGAACTTATATTCGTAA
TAGAAATTGTTGTCCTTGTCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.