Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE029782

[Submit comment/correction]

Sequence	AE029782
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE029782
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCACGGCACCCCCACCACACACAGGGGAATTATAAATAGCTACGGAGT ACTAACCAATGCAGTCCACAGCTTAGAGGAAAGAGCAGTTCCTTCCACCC ACCACCTCTCTCTCACCGACGGCGACGGACAGCGTGCAGGCGACCGGAGC AGCGAGGTGTAGCACGGCGAGGGCGACGTCGGAGCAAATACCAGGCCACA AGGTTGGAGTTGCGCAAATTCTGCCATGTTTCTTAATTATGCATGCGTAT AGCTTGGTGTGTTGATCCTTTACTGAGGTAGCTAGCAGCATTTTTTTTTC TGCATTGATTGAATCCCTACTTTGATGTCTTGTTTACTGTTACACGAACA ATTTCTTGGCTCCTTTGGTTTGTACCGTTTGGAGATGACTTAATGTGACT CGATTTGTTAGATTTCCAATTTGGTAGTCTTTTTCTAGGAGATGTTCAAA TCCTTGTCCACAATAATTGAGTTGATCAAATTTCCGTTGAAAATATTTAA AATGATGGTCATCTCCTATTTAATTGGGATACCGATAATATTGATTTTGG TAATTCAAACACGAAAATCATTGTGTGTTGTGTTGAGTTGATTTCAGATG TAGGAATCACATTGAATGTTATTTCAAAACGTGTTGATTTATGGATCCTC ATGTTTCAGTTATTTTACCAGTATCCAATAATTTTTATTTTGAATATACT GTGAAATCTTTGGAATAACCATGTACAATTCAGAATATAAAAAGCCCTTT GATTCTGATTTGTAAAGTTCACCAAGGAAAACTGTTGCCTTTTTTAATTG TCATTTTGCCAATTCCTCTTTATGTGTAACTAGCACAGTGGCCCTCGCAA TGATGAGAGCATTGTCTTTGTGTGTTTGAAAAATTAGTTAAGAATTTCAT AGATCTTTAAGGTATATCAGTACAAAAATATATTTATATATATAGCCACG GAAAATGAATGAAGTCCTTGATGTGCCTCAATGCATGGGTGCAACAATAG AGGGCGTGTGTGTGGTTCGTGTTTGGAAACATCGCTTTGGAGGACCATTG TGTTGTCATGTTGTCAAAGGAGGGAGTTAATACTATGTTGTACTGTCGTG TTGAAGATTATTGATTCATGCTCATGCGCTCTAGGAATGGATAGCTGGTT GTTATTCTTTTTCTTTTTATTAATTGGTTGTGTATGTACTTTAATTTCTT TTTGGTTCATCTTATGTATAACAAACTAGAAGAATACCCCGTGCGTTGCA GCGGAAATCTCTTTAATAAACTTACCCATATCACCCATATTTAAAAGAAA CAACCTCTCCTCCCCGTCGGAGGAGTAGCTGCCCCTTCCCTCCCCCCCCC CCCCGCTCCCCTCCTCCCCCCGCTCCCCCAAAAGGCCTCCGTGAGTACTC TCCCTCCCTCCCACCGCCGCCACCGAGGGCGTCGCGGGGCAAAGCCCTGG TGGCGTGGTGGCGGCGGTGGATCTCCTTGGCTGATTTCAATTCGGGGTGG CGGCGATCCTGTCCCGGTTGATCTACGGCGATGTGGCGGAGTGGTGGCGG CCAGGGATGTCTCTGTGCGGCGGCGGCAAGGGATCAGTGGGTGGTGGCGG GATGGATCAGATCTGGCCCGATGGGCTCGGACGATCCTCGATCCCGATCT GCTGCCCGTTGCATCTCCTCGGCGACGGCTTTGGCGCACCTGGATTACTT CTGCTGCATGAGGTTGCCTAGGGCAACGGTCCTGGGCATGGTGGTGGCGG CCTCCTTCTTCGCCGGAGGTGGTCGACCAGGACTGGTTGTGGTATTTTTT TCCACATCTAGTCCCAGCGACGAGTTGGGGTGGCGGTGCTACCGGTGAAA ACCGAGCTTGACTCCGGTCATGGTGGGCGATGGCGGCACATCTGTGTCGT TTTTCTTGTTGAAGGCATCGTCAATGCAGCTCTCGTGACCCCCCTCGTAG CTACTCCGGGGGAAACCCTAAGACCCCCGGGTCGGGCGATAGCGGCACAT CGGTGTCGCGTTCTCTCTTGGGAGCATTGCTTGTGGAGCAGCGCTAGATG GAAGAGGCGGGAGAGGTGGAGCGGCTAGCGCAGGGAGGTGGTGCTACTTG GCACCGCGGTGGTGTTGGTGGCGAGTTTGCCATGAGTCTGCGCATCGATC TACATGCTGATAACGGGTTGGCGGAAGATATTGAAGGCGGCGACATCCGG AGCATGTGCGTGTGCACTGATCCGTGGATAGGCTGTGCGGTTCTGGGGCT CCTTTTGCTTGTGTTCGAGCCGCCACGCCCAGGCACTCCAGCTTCTATTG GCGAGTGGCAATAGTGAGAGTGACCTTGGGGCGGGTTCGAAAGAAGACGC CAGGTGTTTGCTAGATCTTGTTGTGGAGCTGGCGATATGGTTATCGTTTT TTGCTCGGTGTTTTGTTTTGGCGGTTCCGGTTTATATGATCTTTGTAATG GCTTTTGCCAAACTTTTGTGGTTCTAATAATGAATAAAGGCTGTGTGCAT CGATTGATGCAGAGGCCGGGGCTACGCTCCCCATTTTGAAAAAAAAATTA AACTTATTCGTATAAATGAAGTTCTCTAGTATAAAAATTTGTCAGATTGG TCATTTAATTAACATAAATTGGTGTATATTTGACGACTAACAGTGAAAAA GTAGATGACATGGATAGCTTGCATGTACCATAAATGAATGCTAATGAAAT GACATGGCCAATTGATTGGCTAAAATAGTGGGTGATATGGATAGCATGCA TGTTGAGATAGACTATCATAATTGCTAGTTAGTGAGGTTTTGCTTTATAA GAAAGTATAGATACAGGGTGTCACACATATTAAAGGGTGAACAAATTCTC TGATGTGGAACTAGACATCTAAAACACACATGGTTATAGATAGGACAACT AAATAATTTGAATTTTCATTTCTCATTTAATCATGTTGTATGGACTATAT ACATGGAGTTTAATTTTCACTGTCTATTTGGAAATACATGTCATTTTAGA CATACAGACCCGTCACGAAGATGCAATTTTGACAATTATTTTTCACTCCC GAGCCATAGATAGGTTACCCTTGTCTAAATTTTTCCTTTCAAACTGAGTT TGTAGTAGAAAAAACTCCTATAATTTCATGTTTTGTAAATCCCTTTGGCT AAGCCACCGTCTGGTTAAACTTTGGGACCTGCATATCCCTATATAGGGCT ATACATTGGTCGAGGGGAGTAATTTTTCGTATTAAATGTGGGTTCAGGTT AATCAAAATCTAGATCATTTAAATTGTACGGTGCTACTCAATGCATAGAA CAAATGTACATATCCATTTATGCTCGAACTTCATTCTTTTATTTTTGGTC TACTTTTAGCATCGATTGTTGTTTTACACAATATAGCTTACTCCCTCCGG TCCGATTTATTAGGCACGCACGTAGTTTAAGAAAATCTTTGACTATCAAT TTTAACCAATAAAATATATAATATATGTTCTAAAAAATATACCATTAGAA ACTACTTTTGAAGACTACTTTTGAAGATGAATCCAATGGTATAATTTTTG TGACATATTACGTAAAATTTGTTGACCAAAACTATTAGTCAAAGTTGTTC CCGAACTACGTGCGTGTCTAATAAACCGGACCAGAGGGAGTATTCAATAT GGGTTTTAATTTTTCTCATACCATGAATGTAGCTTATTCAACACACATAT GCAATTTTTCTCACACTGGGCCCTGGACGGGCCTGTCCACTGCTATCTGA GTTGCGCCACTACGACACCATAAAAACGCTAACTTTAGGGATCTTGATGA ACGCCGAGCGTAGGAGTAAGCGGAGGAGGCGAGGACCCGTCGATCTCCGG TGGGGAGGAGGCGGCGGCTAGGGATTTTTTTGGAGGAGGCGGTGGCTGTA GAGTGCGAGAGGGAAAAGGGTTGGCGTTGGCTATGGTCAGACTCCAAATC ACTAATGAGCCGTTCTACAAACTATTATGTGAGCAGGCTATGGCCCACCC CCTTGTATTCGGCCTTTCACAAAAGAGTGCATCTTAGCATGTTTCATAGA AGCAATTAAAACTTAAGAAACAACTAACACAATGAATTGTTTTATTATGT TGTTTCTTACTATTGATTTTAATGATTTTAGTCTCATAGAATGTGTGTGA TTAGACTAGCCATTTTTTTTAGCCTATGGTAGGGTGCAAAGGGTTCTTAT TGTACTACTACTACAACAATCCCCTCTCTCTCTTCAGTGAGTGATATGCC ATATAAGAAAAATACCTAAAATAACATGCTAAGAAATACCCATCATGAAA GGCCTCGCCTAGACCGTGTCCACCAAATTTGGGTCGGACAATTAGTTACT TGTTCCTCTTTTTTAGGATACAATGTACCTACGGTTTATTTACTATTGAG TATGGACCATTTAATTCTGAGTACAACTTAAGTAGGCAATTACTATGTAT CGACGAATCCCTATGCTAAGTTGCTAACAACTTGTATGATTAACTTGGAT GCAGGAGCCATGGCGGTTGTCCTGGATGCTTTGGCGTCCTATGTGAAGAA GATGATCACCGACATGGGGGAAGAAGAATTGAGCATGTTGTTGGGCGTTG AAGCCGAGATCCAGAAGCTGAACGAAAATGTCGTACACCTCCAGGACTAC CTCACTGATGCCGACAGAAGACGCATCACTGACAAAAACGTCAAGGCGTG GGTAGGGAAGCTCAAGGACATCATGTACGAGGCCAGTGACATCCTTGAGC TCTGCCAGCTCGAGGCCATGGAGCGACCAGAAAAAAGTTACAAAGTTGGC GGCGCCTCCTCCTCACGCCGTTCAACTTCTTTTTGTGGGAATTTGAAGAA GAAGCTGCACGGCTGCTTCCGGCCGTTGCTTTTCTGCCTGCGGAACCCCG TGTTCGCCCATGAGATAGGCAGCCGCATCAAGAAGGTCAATGAGGATCTA GATAACATCCAAAAAGATGCCACCAAGTTCAACTTCATCAACCTCGGCTC CTACGAGGAAATACGGAAGCTGGCAGATCCGACTCATATTAAGAGCAAAA AGATGACGTCGGGGTTCAATGTGTTGGAAGTTGTGGGAGAGAACATCGAG AGGGATGCAGAGCATCTTGTGCAGAAGCTAATCACCCAGGATGGCAGGGA CCTTAAGGTGGTGGCCATCGTTGGGCAGGGTGGCATAGGAAAGAGCCTCC TCGCCAAGAAGATCTTCGCAAGCGAGGTCATTAAGGACGAGTTCAAAACC AAGATATGGTTGAGCGTCACTCAACACTTCGACAAGGTGGACCTGCTAAG GTCCGCCATCACCCACGCCGGGGGGGAGCACAATGAAGAGAGGGATGAGT CCATCCTCGAGGGGACCCTCACCAAGGCCCTCTCGGCGAACAAGTTTATA CTAGTCTTGGATGATGTATGGAGCGACACAGCATGGAAAGACATGCTACA AGTTCCCATTGCTAACGCCAGTCGTAGTCAGCCGGGAAGCCGTGTCTTGG TCACCTCCAGAATGGAAGATGTTGTTCGGAGGATGGGAGCCTCCAGCGGC GACCTACTCCGTATTAGAAAACTAGACGATGAAGATGCTTGGTCATTGCT CAAGAAACAGCTGCCGGAGCCAGAGGTTAGTAGCTCAGTACTAATTCGCA CGGTCAAACTAAATAATTTTCTCTTCACTGCATGTTAATTTGGAGTACAC TATATATGCTTTATGGTTGTACAATAGTTTAAGTTTTTTCTAAGTTAAAT GTTTTTTATTTAAAGTTTTACTAGGAGGATACGTAGTTAATATACGTTTC TAACAATACACCACATATTTTGTGATGAACGTAATAAAACACATTTGGTG TTTTCAATAATTTTCTTATAAAACCGAGCAAACTTAGGTGAGTTTAACTT AGGCAAACCTGTAACTATTACAATTATGAAACATAGGGAGTACTTTCTAG CATACGTGTGAGTGCCTATACGCATAATAAATTATAGGTTTCATAAGTAG TTTTGAGATTTTGCACTAATCATTTCTATCAAAATTTAAAACATCCATCA ATTACCAAATTCATATGATGTACATTAATACAGTTTATGAGTTAATATTT TGATCGCTTTCTTTTAAATATGTTGATTTTAGAAATAAATTAGTAATTAA TAAATATGTTTACTTAATACATTTGTTCTATCAATTTGATGTTATGAACT ATTCATTACTATCCTAAAAATATAATGTCGATCAAACAAAAGGAAAAAAA TCTAAGCCATATAATTTGATGGGGTCAAAATTAACTCAAGCTTATTATGA CATTACCGGGCATTACATCTAGTAATATATTAGAATCCAACTTGAATTTT TTGATAGAAATGTTATACCTAAGTGCTAAGAGGAGTTCATCAATTTTGAC ATGAGGAGTCATCGCGCACGACATAAATAGAATTGCACTCAACTACATTG TGCAACCACCATGAATTAACCATGAGCATGGCACTAGAGTAAAAAGTAAA ACCAACGTTCACATCACCATAACTAACTCTAGCCCACACAATACAACAAC TAATTCTTTGGTAGTTAAACCAAAAGCGTTTTGTCATATGCAACTTTTTG CCAACGGTTACATTTGGGCAACCCTTTGCAAATCATAAGTTAATATTATT CAAATAGTTATTCTCCAACAAAAAATCTACATCATAGCTACACTATTTAT ATATTAATCAATCCAACTAAATTTTCATGTTAGTGGCAACAAAACAATTC CACCCTATATCTAGAGGACTTTTACATTTTACTTAGGTATTGAAGTTAAA AACTTATAGTTGCCACATAAAACTAATTATGGTCTATGAACATGAATTCC TAGATGCTTAACCACAACGGCACACATCGGCCATTCATTAGATTTTGCAG TTGCATGTGGCCCGTGTCCAGAAATAGGAAATGAAAGAACCCGTGAACTA AACATACGGATTAAGGAAATAAATGGAAACTAAAACAATGGGACATGCTT ACACGCATCAAACACGTGGGATAGATATACCTGTCCGCAAAGGATATCCT AAAAAATTAAATGCACACATATACACTTATATTAACCTATATTTTCCACA ATTAGAATGGTAGCTTTTCGATTGCTTTAAAGTTGCTATCTCCCATTCAA CCACCGACCGCAAAAATTGGATACAAATTAAAAGGATTTTGATCATAAAA ATATCCACCTAGATCTATATAGAGTTCTAAGCTATAGACATGTTATGCTC CAAGAGCGATGAAATGTTGATTGCCTATGGCCCCGGCGGTACCAAGAACA CTTATCCTCCACCTTCTTTTGGCAGTGTTGCTAGCCCACCACATCGTAGC CACCACCATGACACAACTTACATAGTACCACTTCTGAAATTTAAAAATTT AAAGTTTACCACACAATGGTGGATCTAGGCTCATAACATTGGGCTGCCAA AATTCACATGAACAACATAACTTCAATATAGTGGTTATGATTTTATGAAG ATTACACTACAAATAGTATATTTTGATCTAAATATCATCATAATTATAAA AATTATAAAAATAATGCTTTAAAAAATTAGATAAATTTTGTAATTTTTAT GATGTAAGATAATTTAGAATGCTTGCACCTTGGGTCTTGCTCCCAATTCT AGAAAACCACTAGAATTTGGCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTGAGT GAAGTCAATGGTATGGGAACATGTGGGGTGATAATAAGGTGGAGCTTGAG ATAGAGAGAGGATTTGTTGTTTGTGAATAGGTGTTAGCGGTGAGTTTATT TAGGGTAATTAATTGGGACCTTCAAACATTATCGCATCTTCCCCATAATT ATTACATGATAGGTCAACAAAATATTTAAATAAAAAATGAAAACATAATT CATAAGCCTTTAATGTGATTGTTGGATATAGTATGATTTGTTTAAATACC CAACTCAAACATTTTCTTGTGGTACAGAAATATAATTTTCAAAAACAATT ATGGAACATTTTTAGCTCTAAAGTTTTAAAGTTTTTCTATATGTTTGTTT AAATGTATTTGCCTTGTTTTCTATGTTGTGGGTTATTAATTCTCGATATT TGGTGGTGGCATACAATTTTTTTTATAGAAGTCAATTTTTATTTAATCTG GAACAACACTTTTATTTGTTCAACAATTTTACAATATCTATGGATACCAC ACATTATTGATTTCATTTCTGAAGTCAACTATTTTAGAAGTACTTTTTGT GCCATATTTCATTACTAGAATCATAGTTCACTACATTAGTAATTCATGAT GTTAGATTAGTATTATTTAGTCTTAAACTAATGTACTTAATAGATCTTCC GGTAATAAAGTACTCTATATTGCTGTCAGGTTACGAGTGAGAGTGATTTT GATCATATAAAAGATATTGGGTTGAAGATCATTAGAAAATGTGACGGTTT ACCACTTGCTATTAAAGTGATGGGAGGACTATTAAGCACAAGGCGCCCAA GCATACTTGAGTGGGAAAATATTCTGAAAAGAATTATTGAATGGAAAGAT AATGGGTTACATGAGGAACTTAACTCGTCGGTGCATTTGAGCTATGATGA TTTATCTCCAGAGTTGAAGCAATGCTTTCTATATTACTCACTTTTTCATA AGGGTTCAGCCCCTTCCCTCGATACAATGATTAGCATGTGGATAAGTGAA GGGTTTATTCAAGGTCAGAGGAAATCAGAATTAAACAAACATGATCTAGA AGAAATAGGAATTGAGTACCACCGAGAGTTGGTCACTAGGAATCTTTTGG AGCTTCATGATCCATATGGGAGCCTATACAAATACAGCATGCATGATGTT GTTAGTTCCTTTGCTCAGTTTGTGGTTAAGGAAGAAGCGCTTGTGTTACA TAAGGAGCAAACTGACATTAAAAATCTTCTTTTGACTACCCAAAAAGTAC GACGTCTGTCAATAACTCTAGAAGATTCAATACTAGAGTGGGGAATCCTA GAAAATCTAGAATCATTGAGAACATTACTGATAAACTGTAACATTAAGCA TGGTGGTTCATTGGCTAGTTTTGGAAGTTTACGGGTACTCAGTATAGAAT CTACTGAGACTGACTGGATCCTCGATTCTTTGTGTCAGTTGAGGCACCTA AGGTACCTGAGACTCAAAGGGTCAGATATATCTAGACTTCCAGAAGATAT TCATAAGATGAAGTTTCTTGAGCACATAGCACTCCTCAACTGTATCAGGC TCAACAAGCTTCCCGACAACATTACAAAGCTAGAGCGTTTAAGGTTTTTG GCCCTAGAGGGGTCCAATGTTGATGTTGTACCAATGGGGTTCAGTGCCTT CAAAAAATTAACGACGGTCTTTTGTTTCCCAGCAAATATGTCTGGGGATT GGTGCAGTTTAGAAGAGTTAGAGCCTCTTTGTGATCTAAGGAATCTTTCA ATAAAAAATCTAAAAAATGTGCCTGATATATCAACAGCTGCAAAGGCCAA TATTAGCAACAAGAATAGATTAGTCTATTTGGACTTGAACTGTTACAGAG ATGATGAGGCGGGGGATATGGGAGAAGAGGAGAAAAATACAGAGGAAGAG GAGAAGCGAATTGAGGAAGTATTCAATGGGTTGTGCCCTCCAACTTCCTT GGAAGATTTATTCTTGTCAAGATACTTTGGTCATCGACTGCCAATTTGGA TGCAAGCTCCAGCAGCTGCTGCCTTCAGGAGCTTGAGGGTTATTGGTCTA TTATGTTTGTCCAGCTGCAACCAACTACCTAATGGTCTATGTGGGATGCT CAACCTAGAAGAGATACGGATTGGCCATGCTCCATCCATTGAGGTTGTTA GCCCTGATTTCCAGAGCCTGGACAGTCAATATGGAGGCGCCGTTGTTACT AGACCGTTCCCAAAACTGAGAAAATTGGTATTGTGTGACTTGCCTAGATG GAAGGAGTGGGACTGGGAGGAGGAGCAGGGCAAAGCTATGGCCATGCCTG TCCTTGAGGAACTTTATATTCAAGACTGCAAACTGAGCCGTCTTCCCCAA GGACTTGCTAGCCACAACAGGTGCAACTTGAGAACCCTGCACCTGTACAG TCTTAGCATCCTAGCATCGGTGGAGAATTTCCCTTCAGTGGTGGAATTCG TTGTGCTCAACTGCCCCGAGCTCAAGAAGATCAATGGATTCTCCAAGTTG CGTAAGATTTCCATTCATAGTTGTCCGAAATTGAAGTTGTTGGAGGGTTT CCCCGTGCTCTGTGGCATGGTGCTGGATGATGAGCGATGGGAGATTACTG GAACACCTGCACTATGCACACCCAAGGTATATCAAGTTGGACAGATGCAT CAGCTTCCTGAAAACTTCACTATTACAAGATAGTAGATCTGATCTCCGGT AGTTAGTCCATGATGAATGCAAGTGCACATGTTGTATGTAGCTAGTTTCG AAGTAAGAGTATCGAAGCATGGAGAGCTACTAGTAATGGTATTTATGCCC CTCGTTATGGATTTGCCAAAGAGTTCCTGCAAGTTGTCCTTGATTCCAAG CAAGAGTGTATTGAGAGTATTTGTGAATGTGAGCAAAACAATATTAAAGA GTATAGAATGTAAATAGAGAGGGTCGTGTTGTAAGTAATATGAAACTACA ATAGGGTTAAAAGAATCCGCGGGGAGTATTGGATTTACCACTAGCATTTG AGTAGAACATGATTATGATATATCATTCTATGTATGTGTATGCGTGTGAG GAGCTCCAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.