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GrainGenes Sequence Report: AE043154

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Sequence
AE043154
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043154
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGTTCCTTGCTGCCCGCACAAGGGGAGTATTTCTCCACGTAAAAAAAA
ACGCTAAGTATTTCTCGTCCTTCGTTCAAGCCGACCGGACGGCCGCGGGA
CGAGGCGCGGCGGCGACGAGAGCGGAGGCTCGAAAACCAGTTCGTGCCCC
TTGCCATGGATCCCATCATGAAGCTCCTCGAGGACGACGAAGAGGTGCCC
CCCCCCCCCTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTCTCCTGCCATTTTCT
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GCCTCCTCCTCCCAGCCTCTGGATCACGCCGCCGGTGAGCACCCAGCCCC
ATTACCCTCGTAGATGATTTCCGGCTCTAGAACGGAATTCGAGCCGTCCC
GTATTTTCCCCTGGAATCAGGTGTCAGAGTCCGCTGTTCTTGCTGGTAGA
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TGGACAAATAAACCAGTCATCAATGGACTGGCTCTCCTCTATGATGGAAT
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ATATATTGCCCAAGAATGTTAGCTCAGCCGAATGTGTTCCTTGAACGAAC
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TAGTGCATCCACAATACTTCACTTCAGCATTATGTAAACATATGGGACCT
CAGATTTTGAATGATGTGGAAGAGAGAGGGTGACCAATAAGCTAGGTACG
CGTCATGAGATTTGAGCATAAATTTCTGTAAATAAACCTGGTTGGAGCAA
TTATAGTTGTGTCATTTAAAATTTTCTTGGATTCTTTTAGATACACCGGT
GACCTTTAGATAAACCTAACATATGATGCACTGGAATGGCAGTTTCTAGC
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TAGCAGTGAGATTCAAACAAATATTTCTTGAAGTTGAAAACAAGTTATGA
CTTAATTCAGTACGGTGGTATTTTTCTTCGAGTATTTATTTTCCCCGTTT
GTTGTGAAGAACTTGAAGAAGAGTCAACATCAACGCTGGTGCTCTTGAAG
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TTAATTAATGAATTGTTATCTAGTATCTTTTAGTTGTATTTACAATTTTG
CATTCTCCTTTTGCTTCAGAGTATTTGAACTGGAGTGGAGAAGTGTGCTA
ATTTGACCAAAAATTGCAGGTACATTACCTCAGGAAAGGAACTCAGTAGT
AAACCAGAGTCATGGACAGTGGCAAGCTTCAGTAAATAATGAAATTAAAA
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TACGGTGGGAAAACCTCCTGTTGTTACATTTCATATGCTAATCCCGATTT
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GCAAAGTTACGGGTTGGTATTTGTCCCTCAGTTATGTTGAATTGGAAAAA
TAACTGGTCCAAAATATTTCATAACAGATTACCTAATCTTTTTATTACTT
AAATTTTACTTTTTATTTCCAATAGAAAAACGAGGTCAGCAAGGAACATT
TTTTAAAGGTTATTAGGACTATTGTTGGTGATAAGTTGCTCAAGCAAGCC
GCTTCACAATATCAAATGCAGGTAACAAAGCATTTCCACCCTAATGCACG
TCCATGTAAACATAACCTGACCCCACTTCATTTGTAGTGCTGCCTCACAT
TTGTGAAGTTAATATTTAAGTTAGGTCAATCTATATATCTGTCAGCAGTC
AATATATGGTTATTCTTACTCTTATCAACATATTCTTTTTTTGGTAGTTA
TTTTGGTCTTCTTTGGCCGCAGGCTACTCAGGCACAACGGAACCCCCCGG
CAAACCCAACCAACTTATCTTTGTTAAGTCAAGTTTCAGGTCAGCAAAAT
GAGAGCTCAAGACCACCTCAGTTTCGACCTTCGTCGTCTGGCCAAATGCA
GAGTAACATGGGTTACACAGCTCCAGAGGGTAATTTACAGAAGCCTAATG
AAACTGGTAACATGCCAGATAGGAAAGGAGTGCATATGCTACAAAACCGT
CCACCTAATATCCACTCGACCCCAGTGCAAGCAACACAACATCATCTGCA
GCGTCCCCAGACATCTTTGCCAGTGTTTGGGGCAAATAATATTCATGCCC
GTCCATTTCAACAGTCAGTTGGAGGTCCAACTGCGCCACTTAGACCACAG
ATGGCAGATTCTGGTCAAAGAGGACAATTTGTCCAAGGAGGTGTTGCCAC
ACGACCAGCACTGCAAAGTAATCAACCTTCATGGCAACACCCGTTAAACA
AGGAGCAGAAAGCTAACTCTTTCACCCCAACAGCACATATGAACAACGAA
GCTGCTCATCAGCAATCTGAATCTGCACAAAGTTCTTTTGCTACCTCGAA
TGCAAAACAAGTCAACCCAGCACTTTTATCTTCAAAGGGTGGTGGTATTT
TGGAAAATCAACCTTCTGTTTTGGCCAATTCTAAGTCTTTGACTACGGCA
AGCTCAAGTCAACCTCATCGATCTCATGGTACTCCAACAGACCTTAACAT
GCAGGTACACAATAGTGTGCTATTGCGTTGATATATGTGTTTGTGTGCTT
ATAGTTGTACTTACTGTTCAATTTGAAATCACTAGAATCATTTTCTCTAT
AGCATTGAGTTGAGGTATACACTAAGTTATATAGTTGTATGGGCCTATAC
AAGTATGCAAGTTATATGACAGGTTCATACACCTAAAAGATATGGGTCAG
GAGAATGTAATAACTTGAGGATGAGGGTATGGAAACTAGGTTGATCCTAC
AACCTTTGTGAAGAATTTTGAAACTTGAACCTCTGTTGAACATATTGGAG
ATTGATGCTTGCCTGCTGGTAGTGGGAACTTGGAAATTATGCACTGGCAC
CAGTATGCTTGATTGGATTGTTCGCAGTCTGTATAGTAACAATGCTGTAA
GTTACAATAGATATGGTGCATCACATGAAGCACCAATATCAGCCAACAAC
CAATGAAGCCAGATAATCTTTGATATATGGAACAAACTGGATAACTACCG
CCATGAAGATGGCTGGACGACACAATGTAGGGGATGGGGGAGTAAAACAT
AGGTTGGGGCAGACGAGCGAGGGAGACAACAGACTGATAACTACTTTCTT
ATTGCTTGATTAGATCTGTTACACACTAGTCCTTTATATCGGACGACTAA
CTTGATCGACACGCCGTATCTCAATTCAAACTCAAGACTAAACCATAACT
CTACTTTCCTAGTTCAATTGGACTGTTCGTACCAAATTATTTATTCATTT
TCCTAACCTTCCTATCTCTAAAATGACCTATCCAATGCCTTCACGGATAT
GCCTATGTCCTGCACCCATGACCATAACAATATAGTAGTAGTTTCAAGTA
AGATCATCAGTATCATGATACACATCATAGTTGTTGAAGTATAAGTGTAT
TGCCCACCGTTCTCCATCAGCTTAAGCTTTTCGGTGAACTTGTTGGGGCA
TGCAATTCTACATGGTATCAGAACCAAGAGGTCTTACTGCGGTAGGGTTG
TGGTCCATCTATTAGAATCGATAGGATGTCATGATACTCATAATAAATTA
TATCAGTATATAAATTTGGTATTTTGATACTGATATATGTATTTTATGAT
TGCAGTCGGTTACAAAATATGAAGATAAAATATGTTTAATTGAATGTAAT
GTGAATAATTGCACCCACCACCCAAACATATATATTTGATTCAAAGTCCA
CAATCTGTATTGTAGGCATACATATTTCAGTGATACTAACATAGCTGGTG
CAAAAGGCTTTTTATATCATCTAAGTGCAAGTCGTAAACAGCTGTTATAG
TCTGTAGTGCACTGGCTTGCAGCTGCCTTAATGCTCACACCCTGTCAGTT
GGTCTGACCAGTACCTCATGAGGGAAGGATCGTGGAGTACCGTGGAATAC
TTATATCGTCTCTACCGCTTCATAACAATTGAATTCATGAAGAAGTACAC
TTACTGTACACAGTCAAGCAGGTGACAGATCATCACATAGAGGTCTTCTG
GACATCTCTTCGGCTGCAGAAAATATCGTAGTATTGGAAGCCAGGGTGTT
GGCTCTGATGCCAAATGGGATCTTTATGGGATTACTACAGTCCGAAGGAT
TGCTGAAGCAGCACAAGTGAGGGTGTTAAGGGACAGACTAAGTGCCTCTT
TGATTTAGAGAACTAGATGATGCCCCGCACGATTGCTGGGGAAATAGATG
CTCTAAATAAAAAAAATCAGGAAACATCGAGTAAAACATGTGTGGTAATG
TTAATAAGGTTGTCACAAAATCCACTCTTGGGTTTGTTGTTATCCCTAAT
TCTGACAAGGTACAACGTACTTGCTTTATAAATTTTCTAACAAAAAGATG
CTACTTCCCTTTGACTTATTTTTTTTGAATAATTTTGATTGAATGAAATA
TAAGCAGTGTTGTATGCTAGTGACTTAGAGACATTCAGACAAAAAATATT
TATACCGGTGACGGTCGAGGAATAAGGGCATTGATTCCTCACATTACATG
GCTGAAAGATGGTAATGTGACATTACGAGGGAAAAAGGATGACCATGAAC
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ATCACATGCTGCCAGGCTAATGTTATCTTTGAGGAGTAGAGCCGAGTCAT
TCTACTAATGCACCCAGATGAATTGTCAAAAAATAAGCATGGTTTCAAGA
CCTGAGAGTGGAGGATTACCAAAAGCAAATATTATTTACCTTGATAGTTT
TTACATTACATTATATTGTGTGACTAACAACAAATAATGAAATTGGCACG
TTCAAGTTTTCACTGCTAATCTATGTCTAGCACAGGGAAGGTTAATCAAA
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CATGTCTAGCTGCTTCAGTTGGATCAATATACATGACCACTGAAACATGG
CAACACGCCCACGTTGAGAAGAAGAAAACATGCCTCATGTATATCTGGAT
ATATTCAGTCCATGCAATGTGTACACATCTCAAAATTAGTTGTATACATC
TATGTGATTCTCACCTCTTAGATTGATATAATATGCATCAAATTATGTAT
GCATTAATTCTTTGTTCAAGATAGAGTGATCAAAAGTATTTTTTCTGCTG
ATACAGTGAAGTGAAGGCCATGTACAGTAAAAGTGTAGAACTGATAATAA
AAGAAAGGAAAATGATCCTAGTTTTATTTGTACCTGCGTATGATGATTCG
GTGGGGAAACTATGGTGCCAAGGGCTAAATCGAACCAACTGAACGAAAGG
ATTAACGTGAAGATCCACGGTGGGACCCCACCAAGTTGATGCAATCCTGA
AATTGAACATTGGTGAAACGGACCAAATTTTCAACAGACAGAAGGAGACA
TAATCAGAAGGAGCGGAACCTTGATTTCTATTTCATCTTGGAGCACCTTT
TGTTGGATGTCCAAACCCTGTTCAAACCTCAATAGTGCTCTGCCGGGGAC
GCACCGTGGGAGGTTACATGGAAATTATAGGATGTGTGACAATCACCATA
CTGCAACGACAACGTACCGCCTGGAAGACGGGGCTGGCGGGCCAGGCATT
TGGAAGAACGCTATCATGAGGGACTCGTGAAGTAGGTGCTTGATTTCTCA
GATGCCCCACTTTTGTTGGATCTCCTCTACTTGCGTCTCTTCCGTTTAAT
TTTGATCGACTCATGTTAGATAGAGGAATTTATGGGGTTCAATCCGAACA
GACGTATGGAAGCTCAAGAGACCGATTATATAATAAGAAACATGAAGAAT
GGGAGGGTACTGAGACTTGATGGGAAGACCAAAGGAGGCACCTATCGAAG
GACTCAGGCCGGGAGATTAATGATGATCTTGTGGAAGATGAGAGGACACG
TGTGGTACAGCAACGGAGACAAACTCGAGACACATAGGAGTCGAACTCGA
GACCTTGGCTCTGATACCATGTAAAGCTTAATGCACTAACCAACTATTCC
AAAAGACCGATCTGATGGAAAGTGTTAGGCCATCCACTTATATACTTCAA
CACCCCTTCTCACGTGTGATGGAAGACAAGTCAACACGTGTAAACTCAGA
GGTATGGCACAAGAGTCCAATACGTGGACGGAGGGGGCACCAGCAATTTT
TAGGAAAAATGGCGCCACACATGACTCGAACTTGAGACCTTGGCTCTGAT
ACCATGTCAAGCTTCATGCACTAACCAACTATTCCAAAAGACCAACCTGA
TGGAAAGTGGTAGACAATCCACTTATACACTTCAACAGGGATCACCTATT
TAGTTATTATTAAGATAAAAAAATCACTAGAATAAGAAAAAATGTAGGAT
TGCAATGCATTGTGATGTCATACCATCTTTAATCCTATAGGGCTAATTGA
ACCACAGGACAACCATATGTATGTTCCAAGAGTTATGAGCCAAAAAAGCC
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CAGGCTAAATTCTTAGGGATGTAATCCCCATGAAAACTCCTTTGGATCAA
AGACGCAAAGATCGAGGGATGACTCTAGGAGGAGACTAGATTGATTAACT
TGTCATGCTTGCCCTTAAATAAGGATGCAAATATTTGGTTTCAAAATGAT
CCTATCTCTAAGCTATCTTGTCTCAAATCCGAAAGATACAATATTAGCTA
ATTCCACTTGCCTAACTAAAGGGACATCATCCTTTATGCGGATAATAGGG
CCTTTTGTCCCCTAACCAGGTCACCAAACATTATATGATTCTATCATTTC
CATTTGTGTTCTACATTGCTAGATGCACCAGTTATACTTACTCTGGCTTG
GAATAGGCGAGCAAGCTTAAATTAGGTGAATAGCAGACTTAATTGATAAA
GTAGTTAATGATTTACCAGACAAGATGATGGAGTGGTGGATTTAAGAATG
CAAGTTAAGCAATTTGATGCTGGCCTCATTGGTTGATAATGCCCTGACAT
TCGATTGCAAAAGTGAAATATTCTTTTCATTTGTTGTGTGCACAAAATGC
ATGCATTCCTGCCTCTTTCCAGTTTATTTCTTCTGCGATTTGACTAATTA
TTCCCTCTATTCACAAAGTGGTTCTGTATCATGAAGGATTTTGATGTTTT
GCTCTAATGATCGTTGCTGCTTCATTAGATCCAGCCTGCTACCCAAGCAC
CTCCTTCTGGAGTAGCTTCCAAAACGCCTCAAAAGAAGCCATCTGCTGGA
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ATTTTATTTTTCAATGCTCATTCTTTGGTTGGTAGATCGCAATTTGATCG
TACTTGCTCTTGGTTCGTGATGCCTTTTATATTGTGCCAGCAAAAAGCAG
AAGGGATCTGGAGGTTTCCACGATCAAAGCATTGACCAACTGAATGATGT
TACTGCAGTTAGTGGTGTTAATCTGAGGGTATGTATACATACATTCTGTA
ATGTGCCTTTGTTCTTTTGATTTGCTTTCTGCATACCTGTTATGAAGGAG
CTTCAATGCTGTAACTATTATTTTTGCCAGGAAGAAGAGGAGCAACTTTT
CTCTGCTCCGAAGGAAGAGAGTCGAGTTTCAGAAGCTGCTCGAAAAGTTG
TACAGCTGGAAGAAGAAAGGCTCATTCTACAGAAGGAACCTCTGACAAAG
AAATTAGCAGAGATCAGTTAATACTTCATCATTCAACAGTAGTTAAATTG
ATAGAGGAACTTTGTGTTCTGTTCTCTAATGTTATTGGGTTGGCAGTGAG
GAAATATAATCTGAAGAGCATAGGCAGTGACGTGGAACATTGTCTATCCA
TGGTGAGAGATTATCTAGCAAGCCCCTTTCAAGATTTGGCTTATGCCTAA
TCTAACTTGAGCTTTCTCCAGTGCGTTGAGGAGCGGTTACGAGGATTCAT
AAGCAATATTATAAGGCTTTCAAAACAGGTGCAATACCTTAATCTCGTTG
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TATTTCTTTATTTATTTGCAGCGGGTTGACGTTGAAAAATCAAGGCATCA
TATTTATCCTTTATCTTCTGATGTTCGGAGTCATATATTGAAGGTCAACC
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ATCAGAAAACAAAGTGATGTTAGTTCTGCATGATTTTTATGTTCGGTTCA
TTTAATTTATAGTTGCATATATATTCATGTAACGCATGCTTCGTATGGCG
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AGTGGTACTCTAGATGTAGGTACTAATGTTGAATATTTACAAGCTCGCTA
GGAAATAAAGTTTGCTGACTTATATCAAGACTATTTAGTGTGAGTTATGT
GACACAAGTGATACCGTTGGATTTGTATTCAAAAGTATTTTCCAGTAATA
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CACATGAAATAAGTAAAAGTATATGCTTGCAACTGGGGATGCATTTAGTT
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ATTCTCCGATGATTAGGCTTGAGAGTGCATGTGGTGATTGGTTCACCAAT
GACCAATTCGATCTCACTACTAGTTTCTTTTTAGATAGGAAGAACAAAAG
ATCAGATATTTGATCTATCTAATGTTTATTGCATCAGTTAATATGGGTTA
GTTGTAGCAGGTATATGGAAAGTGCAGTACGATATGTGTGTGTACTGCAA
TATTTCTGTTGAATTGTTCATTAAGTGTTTGTTTCATGGAAACAATCAGA
CATCCAATGTAATTCCAGATTGTTTTAGTAGAGGACTATTGATGTATGTC
ATACTGACTACTGTTTCTTCGAAAGAACACACAAGCTTGGCATCTCAGTG
TTACAAAAGAGCTTTTGTGGAAACCTGAGACTAGGCCACAACAAGCATGT
ACCACATCCCAATTATGATAGGTTTCGTTGTAAATTATAGCTTGGAGTCC
CATATATTCGTATTGTATTTATAATTTAATCTACTGTATAAGGTTCATTG
TTTTATACAAGTAAACTTAACAGCTTGTTATATGTAAATGTAATCATGGC
TTGATATTCTGTATCAAGGCATTCCAGTTAATTTGCTATACATAGTCCCT
CTGACCTACTGCTCCTATTATAGGATTATTATACTGTTTTCAAGATTTGT
AATTTGTTACTCCCTCTGATTCAAATTAATGGACTCAGATTTGTCTAGAT
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ACCAGCATGTTTTGTGTTTTCATTGAATTGGAATTAGACGCCAGTGTGGA
GTTGTCTAGAGCAGCACTCCCTTTTCACTTCAGTTTTGTTGTTCATTAGA
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AGCCGTGGCACATCAAAGCATGCTAAGGTAGTTATCCTTTCACCCTCATC
AGGTCCCAGATGATCATTATGTACATTGTTTCTTACTTGAGATGTGTATG
GTCTTATTTGCATTGTAGACTTACAAGGAGGAAGATGATAAGATGAGAAC
AACAGCTGCAAACGCTGCTGTGCGAGTTGCAGCCGGAGGTGATGATATGC
TTTCAAAGTGGCAATTGCTAGCTGAAAAAAATAAACAGAGGGGTGAAGGA
GGCGACGGTTCTTCCAGCTCCCTAACCAGTACCATGTCGCCTCACAAGCC
TTCACCCAAACCTGGAAAGGGCTCAAGAGAACAGCAGGAAATTGAGAAGC
GAGGCTATTTTTCAATGCTCGGACCTGGTAAGCTCGTGATAATTTGGTTC
TTGTGTTGTTCAGTGTCTATTTTCATGACATAGCAGGCAGCAGCAACCTT
AGGAGTTCAATAAGGATGTAGGAGTTTGGTACTTAGCTTAGTCCAGGAGT
AGTATTTGCTAATTTGTTTTTTGCTAGGTAGTCCGTTTAGTTGAGAAGTC
TAGTAGTTTATGTTACTTCGCCGAGTCCTATTATCTAAGAAATACTGGGT
AAATACATGTCTATTAGTTAGAAGTGCCTTATATGTGAGTTGTAAATCTT
CGAGAATTTTCTTAGTTGATTTTCTCTTCCTCTACAAAAGAGGGATGCCA
ATCTTTTCCAAACGGAAGCAATCAATCTACCATATCCCTACCATCTCTGT
TCTCCTGTACGTTCTTGGCTTTCCTGATCAGTCTCCTTCCCTCTCTTTCT
GTATTAGTCTCTGTCGCCAGCAGCCCTGCCCACTTTTATTCATCTGCCCC
AACCAGGCGTCTGTAGTCTTAGCAGAATCTGCCATGGCAGATGAAGAGTT
TGACCACTCACTTGATTGCAATTACTGACCAACTCGATGGTCTAGTCAAA
CATGTCGTTGCCACCAGTGGCTTACTGCCTGTGTTGGCGCCATGGTTATT
CAGTTTCAAGTTTCCTATGGAGGGAGGATCCACAAATGTTGTGACCAATT
TTTCGTCTTCAACGCACCATGGAGGAAGAGAAGGTTTGGCTGGCATCATA
CCACGGGAAGGGTTAGCCCAACACTGGTCTACCTGCTGGAATGTGATAGA
GGTGTGCGGGCATGGAGTACCTGTATCTTGTTTTTGGTCCTCCGATGTGT
ACCAACCACTTGGGAGAGCTCATTAGTCTAAGCATGACTGGGACGGTCAA
GGAGTACCAGGGGAGATTCTTGGCACTGCTCTGTGTGCAGGTAGCCTCAC
ATGGCCGCAACAAGCACAGCTGTTCATGGCAGGACTGGCAGATCACATCG
ATTTGACGTTGAATTGTGGAATCCACAACACCTGCATTTGGCCATGAGTT
GTATTGTAAGGATGAGGACCACGGTTGCAAAGATGTATGAGTATGTAACC
GCTTTAAGAGTTTTGTTAGGGAGTCGTACTATTATTTCAAATAGGAACAC
GGGCCTGTGTGAGCACAACCTGCGTCTTACTCAACTTGAAATTGGTTTTG
TGTTTCTTTTATATAGAAACAATGCCTAGTTACTCATAGGTGCCGTCGTT
GGAAGAAACATTTTTTGTTAAATGAAGAAGAGTTCTATCTGCTATATAAG
AGTGGTGATCTTCTGGGATTTGGTTAGTTGATACCGTAAGGGATTTCCTC
TATAAAAGAAATAGCAGATTTCAAAGGGAAGGAAGAAACCAGTCAATTAT
CCTCAGAAAGTGGTAGAAACAGATGAGCTTTGTGGGAGTTGAATCAGGAA
ATAAATGCATGTTAAATCTTGAGAGTATCTGCCCCCATGCTTCCATTTGT
TGTTTAACCCGGAATGTGTTGTGCTTTTTGACTAGGTGGCGTTAGAAGGT
CAGCACACATGAAAGTGGCACGGAGTATCATGGTGAAGGATGTGGTTGCA
GCACTTGAGAGAGAGCATCAGATGTCAAAATCATCTTTACTATTCAGGTT
ACATGGGAGACAACCGACAGAACCAGCCGCGAAATAGTTTTCTAAGCTCA
ATTTTGTAATTTTTCATGTTTTGTCTTGGCCAAATAGAGATGCATCTCTT
CTCTGAGTAGAGTGATATCAGAGGTTCATTTGTCATGCGATGATCAATTT
TGCAGGCACTTAGAAATCAATAGTGAAAGCAACAAAAATTTCCAGACAGT
ATCGGTTCGGACTTGTTCTATGTTATTCTTATCCATTTCTCCCATTAATC
CTGTCATACTTTTCAGGGACAGGTTAATTTGGGTTACAAATAGCACCAGA
CCATTCTCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.