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GrainGenes Sequence Report: AE018832

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Sequence
AE018832
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018832
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCTCCAATAAATCTCCACTCCAGTCCTGCTTCCGATCTGAACCCTCGCC
TCCTTGCTTCCCGTCCGGCCGCCGCTACCGGAGAAGCAGCTGAGCACGAG
CGCGATGCGCGGGCTAGGGTTTAGGCTGCTGCTGCTGGCGCTGGCGGCGG
CGGTGGAGGTGGATGCGCGGTTCGTGGTGGAGAAGAACAGCCTGATGGTC
ACGTCGCCGACGGCGCTGAGGGGGCGGCGCGACAGCGCCATAGGAAACTT
TGGGGTCCCGCAGTACGGCGGGAGCATGGCGGGGGCCGTCGTCTACCCCA
AGGGCAACTCGGATGCCTGCGACGCCTTCGAAGGCGGCAGCAAGGAGCAG
CTCTTCCGCACCAAGCCGGGCGCGCTCCCCAGCTTCCTCCTCATAGACCG
CGGACGTGAGTGATGCTGCCATCTCCCGATTTTAATCTCTCCCACGGTCG
CACCCTTGCTCAGCGGATTTGCGCTCGCGTGTACTGCTCCTGCGGTTTTG
GGGGATCCGCTGATATATTTGCTCTGATAGCTATTGCAGTGTATACAAGT
TGGGAGGCGTTGATTAGAGCTGTTTTACTTAATTAATTTTCTACTGGCAG
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AATACATTTTTTGGGGATCCAGTCTTCATTACGGCGAGAATTGGCTGATT
TACACAATTAATTGGGAGTAAGTGCCTGTTGTGACTTTGCTTGTATAAAT
TGGCTGGCAGTGGCGGAGCTAGCCAACAGAAGGAGCCTGGGCAAGGCCTA
TTAGTTGCAACACTGCCCAGTATTTGCATCAGTAAACACCAATACTAATC
GCTATGTGACATCATTATTTAACGATGAGCGGCTGGAGCAGCCTGGGCAG
CTGCACAGGGTCGTGATCTTATCATGTTCCTGGGGTACATTAGTGTGTGA
AGGTTGTGGGTCCCACTACTAGCGTTAATTGGAAGGTTTGTCTTTCCGTT
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ATAAGTTATTTGATTTCCAAAACATCAGATTCTAGAGGTGACTTGGGTCC
AACTTTCTATGAAATGGTGTATATTAGGAGTTCTGGCAAGCAATAAACAA
GGATGGACAAATGACGACTTCAGTTCCTTCTCTATGATAGGGTGAATATT
GTACTCTCACCTTTGTCATCGACCCCCTTCCTTTTGAAGCAATGTGGCTT
CTCTCTTCATGGTAGTTGCCTTCTTATGAACCTGATCTTATGTTTGATCG
TTGCTTGTTCGTCACGTAGTAATTACATCGTGGTTTTATGTACTTTATCA
GTTTTTTTCATGATCTGTGGGCTAACGACTTCGGTAGTTGAGTGTTTGTT
TGATGGGTATGAAACGGCAGATGATTATAACCTTCCTTTTTGACATGTTG
CTACTGTTGCGGTGGTTCTGTATATCTTCTCATTTGATTTGTGATGTGTA
TGTCATTTCATTAATTCAAATGTCACATTTGGCTATTATCTGTCACTCTG
TCTCCTTGGTCCTATCTGACCAAAATTCTCTCCCTCTTTTACAATGATAT
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GCTGCAAAGTATATACAGAACATAACTATCCCTTCTGCTTTAATTGATAA
AAAATTCGGTGAACAATTGAAGAAGGCTGTTAAAGATGGTGAAATGGTAA
ATGTGAATCTTGACTGGAGGGAGGCTGTCCCACATCCGGATGACCGGGTT
GAATATGAGTTGTGGACAAATAGCAATGATGAGTGTGGGCCTAAATGTGA
TATGCTTATGCATTTTCTGAAGGAATTTAAAGGGGCTGCACAACTACTTG
AAAAAGGTGGTTATAGTCAGTTCACACCCCATTATATTACTTGGTACTGC
CCTCAAGCATTTGTGGTCAGCAAACAGTGCAACTCCCAATGTATAAACCA
TGGAAGATACTGTGCACCTGATCCAGAACAAGATTTTAGTACTGGATATG
AAGGAAAAGATGTTGTTGTAGAGAACCTGAGACAGCTTTGTGTGTTTAAT
GTTGCAAATGAGATTAAAAAGCCATGGATCTGGTGGGATTATGTGACTGA
TTTTCACATAAGGTGCCCGATGAAGGACAAGAAGTACAATAAAAAGTGTG
CAGAGACAGTCATAAAATCACTAGGTTAGCTGCTCTTTTATTTCTGAGAC
TTACCTTCACCTAAGCATGTTTATTGTAATTAGTTGTACTTATTTTATTA
GAATGCTTGTACATTTTTTCAGGAGCATACATAAGTTATGCATTTGAACT
AACAAATGTACGCACATAATTTGTACTCCCTCTGATCCATGGTAAGTGTC
GCTGATTTAGTGCTAAATCAGCGACTAAATCAGCGACACTTACTATGGAT
TGGAGGGAGTAGCATTGTATGCCATAAGGCATCTTTGTGATAGCTAAAAT
TTCATCATCAATTCATTATAAATGTAAGAACTATAATGATTTTACACTTA
AACAGGTTTAGACGTTAAGAAGGTTGATAAGTGCATGGGAGATCCAAATG
CTGATTCTGACCATGCTTTGCTTAAAACGGAGCAGGATGCCCAGGTGAAC
TGACCTTATGATGAATTGGTTATCTGACACATAAATAAAACTGACACTGC
AGACTATTATCAATAAAATTAATCACCTTTAATGCTACTTTCGTTTCTTG
GGGTTGAATATGATCTATGGTGTTATATAGATTGGGAAAGGGTCAAGAGG
AGATGTTACCATATTGCCTACTCTTGTTGTAAACAATCGACAGTATCGAG
GTAAATGTTCTACAAGGTCCTGTGTGAGTCTGTAATCAAATTGCATCTGC
TCTAGTTGATTTTAACCTCATGATTAACAGGAAAGCTAGAAAGGAAAGCT
GTCCTCAAAGCTCTTTGTGCTGGCTTTGAGGAAACTACTGAGCCAAATGT
TTGTCTGAGTGATGGTAAGAACAGACATACAATCTTTTGTATGCTGTACT
TGTTTTTTCATATAAAGTGCTAATTCTTGAGTTGTTTTAATACAGACATG
GAAACTAACGAGTGTCTGAGTGATAATGGAGGTTGCTGGCAAGACAAAGC
TGCTAATGTAACAGCTTGTAGGGTACGTATGAATATGTTGATGATTTTCA
CTGGACATTATGTTCTTGTGTTCTTAACCCCTCTCCTGGTTTTTAACTTT
GCTGTCGTCAACACTTGTTCAGGACACTTTTCGTGGCAGAGTGTGTGAAT
GCCCAACATTCAATGGTGTGCAATTCAAAGGAGATGGCTACAGCAACTGT
GAACGTAATTTCTTATAGTCCTTATGCTTTTGTTATGACTTCTTTGTGCT
TAGCAGTATTACTTCTTGGCTATGTTTACAGTTTCCATGCATAAGTGGCT
GTTGAAACAATTATGTTCTGGTGTAATTTACAACTCCTTGTTGACACTAC
TTGCGTCAGTTAGGGGCTAATAGTGAAACCATGATTGATCAACATTTTAC
TGGTTAGTAAGTTCTTTTGTTAAAACTTGCTATATATACTGATGTTAATT
TGATTTAAGAGAAACATGCTTAGTATTTTTGATTTATATGTATGCTAGCG
TGTCTCTTAATGCATTAAGAAGCAGGTAAACCATTGCGGAATGTGAAACT
GCTGTGCTATGTTATCATGCTACATTCCGTTAGTTTTTTGTTTCTATATG
TTGTGGACTCGCATTGGGGCCATCACAAAATACTAGAGGAGGTTCGATTG
AGAACTCGGATAGTGACAACTGACAAGGAGTTGGTGCAGTTCCATAGGAC
TCTTTTGTTTTAATAAAGCAAGAGAGTGCCAATGGTTTGCTGAGACAGTA
GAACTCCCGTAGGCTGTAGTTAGGAAGTGCGGAAGAGGTCTAGGAAATCT
AGAGTGTGGTCAACATAGCAATATGAGTTTCAAAATTTAAATGAGTTCAG
TCGGCCAACATTTTGTGTTAGGATTGCAGGTTAGTATAATAGTTCATACT
GTAGAGTCGGCCAGTTCATACTGTTAGGCTGCAGTTCGGAAGTGCAGAAG
AGGTCTAGGAAATCAAGAGTGTGGTCCACATAGCAATATGAGTTTCATAA
TTTAAATGAGTTCAGTCGGGCAGCATTTTATGTTGGTTAGTATAATAGTT
CATACTGTAGAGGTTGGGCAGCTGGGTATTATTTCTAGACATTGCAACCT
TTTTATATATACTTCTTCCCAGTTGCTTCCCCTACCAAATCTAGCCTCTC
TACTGTCTCACCCTTGGTGCCTATGTAATACTGATCATCGTTTTAAAGCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCAGCGTTGGAATATTGACCGCTT
CAGGTGCCTAGGCGTCGCTGTCAGAGCACCCCCAAACTGCTCTAAGATGC
CTTAACGCCTTTAAAAGTTAAAACCATGATACTGATAGCTCTGGGCTATG
GTGATCTTACAAGAAATACACGGGTAGAAAATTCACAAATCAATCTTGTC
CGCTTCAAACAAACAAACTTGCCATTAAACAAGTAAACAATAAGTAATTG
GAAAATTCCTTGCCATGTAAATCAGTACTGTACAAACAAAGAAATGAAGA
GCGACTGCAACTTGTGAAATAAACAAGCACACACCAGATCAGTATATCTA
TGCATGTATAATGTGGAGGGAAGAGCCCACGTGGTGGAATAAGGTGAAAG
GAAGCAGGGTGCATATTACATGATTGAGGTTGTGATTGACTGATTGCAAC
TATTGAGTCCACTTGCTAGCTTCATTCTCATCAGTTTAAAGATCATATAA
ATTTGCACGGTGATGCCATGCTAAAATGATATAAATAGGCCTATTTACTA
TTAAGACTCAAAAATATATAAATAATAGAGCGACAGGGCTGGTCCTGTGG
CTTTTTTTAATTAAGAAGAGACAAAGAGACAACCATGAGGCACCACCACT
TTTTATGGACTGGGCTCATACAACTGCATGCTTCTTGTCAACTGGTCGAC
GCCTGGTTCTGTAAAACCCCAAAATATCATATATTACTTGGCGGACATAC
TATATGATTTTACAGTTTTGTACTCCCTCCATCTCAAAATATAAGGCATA
TAAGCTTAGTCAAAAGTCCACATCTTATATTTTGGGATGGAGGGAGTACT
AATTTGTTTTATTTTAGTCAAAATGTCCACATCTTATAAGCTTAGTCAAA
ATGTCAACTGCTGCTTATTGGGGTAGTAAGCACTGAATGATTAAGCAGTT
AAAAGTTCAAGATTGTGGTTTTAGGTTCGATCTTTTCAGAATTAGCCATA
GTGTAATGTTGACTGATGCTGCGCACCTTAGAATTGCATTGTTTGTTTCG
ACTTGCATGATTATTTGACAGATTATGAACTGCACACGTTTTTTATTTGT
AATCTATGATTTACAACGAGGGAAGTTCATACTGATTTTTTATTTCATAT
ACAGCTGCTGGACCAGGAAAATGTTTGATAAACCATGGTGGGTGTTGGCA
TGAAACTCGCAATGGAAAAACATTCTCTGCTTGTCAGGTATGTTTAGGCA
TGTAATGAATCTGATAACATGTTTTTTGAGTCGTGACTCAAAGGTGAGTC
GCAAACCCCTGCGACTCAGTGATAGTCGACAAAAATCGCTGTATAGTCGC
GAGTCGCCGTGATTTTTGGAAAACGACTTGATTAGTCGGTGACTCAAAAA
CCATGTCTGATAAGATATCTCATAGACTCATACTCAGTTTTTTTATTTTC
CAGGAATCAGGAAATGGAGATTGCAAGTGTCCAGCTGGTTTCCGAGGGGA
CGGTGTTAAAAAATGTCACGGTACTCATAGCCTCAGCCTTTCCCACTGCA
TCTCAGAATAACTGATGTCCTACCAATGGTCCCATACGTGGATGAAAAGT
ACAAATTTATGCTGCACTACCTGTCTTCTCTCTATGAATTCTATTGTCAC
AATAGTCTCTTATTCCTCGCAGAAACAACCAACTCTCTTATTCCCTGAAA
AGATAAGTCTTTCTTGCAGTTCACTGTCCTACCAACCTAATGCATAAAAC
AGTCACACATATACTCGGGAGATGGATCTTTGACATGAATATTTGTTTGA
TTATGAATCTTCTGCTAAAACATTATATATTTTGTGACATAGGCAATAAT
AATTTAGTGCACAGATATAGCAGTTCTTAAACTGTAGCTTACTTTTCATT
TACCTCTGCAGACATTGATGAGTGCAAGGAGAAAAAAGCTTGCCAGTGTC
CTGAATGCAGCTGCAGAGATACGTGGGGTGGCTATGAATGTACTTGCAGT
GGAGACCTTTTGTACATCAAGGAGCATGACACTTGCATAAGTAATTTTTA
CACTTTGATTATATTTGTTATATCTATCTTTTGTATGTATCACTTAATCA
CCTTGTATGGTTAATCTGCAGGTAAGACAGCAGTTCAGGCTAAAGCAGCA
TGGGCTGCCGTGTGGGGGATCTTGGTAGCGTTGGCTGTTTTGGCAGCAGG
AAGCTACATGGTATACAAATACAGATTAAGGGTAAGCTAGCTGATGCAGA
ATGTAATTTTCATTCATGTAGTTTTCATTTATGCACCTAGCTAAAGGATG
AAATGCTCTGCTATTTCGAATGGTTTGTTCGGGACGTCTTTTTATTAGTT
CATATAGAATGCTTGCGTGCTGTAAATGGTGCTATGTTTATCCCTTGTTG
AATTAGCCTTATGGTCTTCATGATCTGTGCTGTTATATTTTAAGACATTC
AATGCATTGCAAAACAGTATTCTGCATTTCTGCTACACATGTGGCGTCAA
GCCACTAGGGCTATTGAAAGCTCACACACAGATTCATATCAATTTGCTAT
CATGTCCTTTTGTGCTATACACAGAGAGTAAAATCTCTTTTGGCATCTTT
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TTCTGTCAGTGACAAAGTTTTGTCCTTGGAAAAGAACTGGAAATAAAAGA
TGTTAGCCAATCATAATTACTTTGAAAATCGTATATCTGTTTATGATTAG
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TGATTCACTATGTCTACCAGTGGATTTAATAGATGTAGCACTTTGTCCAA
CCTAAATTAATTCTTCATCGATTCTGTAACTAGTTTGGCCATGCTTGTGA
CACACATTAGATTGGCGATTCAAATTTATCCTAATTGCTGTCGTCATAAA
AGATGGTCGAATTTTGTATGCGAATATGATACTAGCTTTCTTGGGGTTAA
TATTTTGAGACAGAATTTGCATAGAAAACTTAGATATGTAACCAATGATC
ACATGTTCCACTGTAGTTTACGGTTTTAAAGTCGACATTATCTAATCCCT
CTTATCCCTCTTATGCTTTTGAGTTTTGCCATGTGCTTTCATTTACCAGC
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TGTTTTCTGTTGTTTCTTTCAGTCATATATGGACTCTGAGATCAGAGCTA
TCATGGCACAGTACATGCCACTGGACAGTCAAGGAGAGGTCCAAAATCAT
TCACAGGAAGATCATCCATAAGAGTGTGATTTGCAGATCACATCATGGAA
CCCGTACAACTGACAGGCAGAAATGTGAAGCTCGCGCAACGATGAGAAGA
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TATTTGGTGGTAAGCTCCATTTACGGAGGTGCACCAACTTGTGGACAATG
AATTTTTTGGTGTGGTCCATGCGTAGTGGAAATGAAATCTAATGACCTTA
GATACTGTAACGACCTTAAAAGGACCATTTGACAGTGACTGGGGAATGTG
GAAATGGTGTGGGTGCTCAGGTCCCTTGGAACTCCTGGAATAAATAACCG
ACTGTCATCGGTTGTGCTGTGAACCCTGGTTGTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.