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GrainGenes Sequence Report: AE048230

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Sequence
AE048230
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE048230
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGGCGGTAGGGGCGACCGCGGCAGGGCCGGAAGCGGCGACCACGAG
CGCGATTGTGCAGGCAGCAGCGACCTTGAGCGGGGCGGGTGCAGCTGGGC
CTACTGCGATGGCGCACTGTTCCGACGTCCGCCAGCTGCCATGGAGCAAC
TAATTGAATCTGGCACTGCGCCGTCCCATTTTTTTGAGTTTTCGATAGTG
AATGGAGAAATCTAGGAAGATTGTGCGGTTTATATTTGTAGATCTTCCGA
GGGATTGCAACATTTGTTCATATTTTTTCTACGCAAATTTTGTTCCTATG
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TGCATCCATAATAGAACATCAACCTGATGATTTGAAACAATGGATACAGG
TTATAATTTATGTTTCTTCTCACAGGTCATACACCAACGGATACAGTTCA
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TTTTTTTCTGTTTTTTCCTTATTTTTCAGCTAACTTCTGTTTTTGGAAAT
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GGGTGTGGAAAGGAAAGCTCATAAAACATTTCAGTGAGCTGGATAAAGGA
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GCCTTATCTTTTTTTTCTATTTTTTCAGATAAAAGAATTCTGTCAAACAT
AATATGCACCTGCTGCAACTATGAGTACCCAAATGCCTGCTGATCCGAGT
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ATGTTTTTTATTCTGTTTGAATAATACCTTATTCAATCTTTTCTTTTGTA
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GATGATAAGAATCTGAATTTGGAAACTTCTCATGAAGCACTGATGAATTT
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TGTCTCTTTTCTTTTTAAGAAAACAGTAACAATAGTCTATATGCATTGTT
TTCTTATTTTTGACTCATATCTATCTGTACATACCACAGGACCATGTTAC
AAAAAGTGATAATGCAGGAGAAACTATTCTAGCTTCTACTGCGCATCATA
GGACATGCATTAGTTTGAACCACACGCCATCTGTAGATGATGGAATCACT
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CAATAATGGTATTTTAGCTACAACTTCCAATATTTTTATGCATTACTGTC
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AAGATATTGCATTGACAGAACCAAGCACTGCACACATTGGTAATTTGTGA
ATGCTAATTTTCTTTTCATGTGTACAAATAATGGGACGCAACTAAATTAA
TTTTGGCTATTTTTTGTCATTTTTGTTCTGATTATGCTGATTCAGGAACA
GAATCCATAGTGCATCTTTCAAGAAAAGAATATCTGAAGGAAGCTCGTAA
GAAATATTTCTTCAAGGTCTCCTCATTACCTTCATTCAGATTGTTCGAAC
ATGAAGATGACAACAGCAAATACATTGAGGAAGTAGAACTATGGAGGCCC
CTTAGAGCAAGTTCACAACATCTAGATGAGGTTATTTTCTGCTATGTTCT
TTCTTTTTGTTGCTTTGTTGAACTTTTAGGTGATATAAAATGAAGAATTC
TATTATTTTTAAATTTTATCTATTTGATGTGTAAACCTTCCCTTTTTTAG
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AGACAATCAAAGAGAGGTGAATAAGTGTGGTCAGAAATTAAATCTAGCAG
TCCAGAACAACAACAGCATTCAGTTTCAGGTTTGTATTTTTGCATCTATC
ATTTTTAATTTTACAAAACATGCAGCATCTCAACATAATTTTCTTATTAT
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TGCTAAGACCAAATCTCCAGCTTACAAGGTTATTTTTTTGTGTCTTTGCC
ACCGTGTTTCCATAGTTTTTACCATTGTTTTGGGTGATACACTTGCAGAA
TAATTATCTATGTTATTTTTCCTTTTTATGCGCTATCACTGTTCTCTTTA
CCTTGTCAATGATTTTCTAAAAATTGCAGAGAACTACAAGCTCTGATTTT
GAATTTAGTTCAATACAATGTGCTCAACGGCAAGCAAGTTACAGTATTCC
ACAATACAAAGACAGAGAGGCTACAACAGAAAACGAAATAGAAGAATTAA
TCAACCTAGATGTGAGATTAAGATATTATTTTTCCTGTATTTTCATTCAT
ATATTTTTCGGACATTCTCTTTCTCAATTTTTTATGCTTTCCCTGTTTTG
TGTTCCTTACTGCTGTTTTTTCTACTTGTTATTCAGCCTTCTGAACCATC
AAAGCTTTTGTCAAATAACAAGCTCCTAGCAAGATGGAATATAGCTGGAA
GGAAATTGTTTCAAGATGAATCTGAGATGACTCCAATATCAAAAATTCAA
AAGCTAAAAGAACCTGTGAGCTTATCTACTTTCTTCAGTACAAGCACCTA
ATTGTTAATATCATCACTGCAACATTCTTGTATGCAAGTTAAAATAATTA
CATATCCAAATATATGTGTCAATTTTTTTGATTCAACTAGTTTTGATTCA
AAACATCAAATTTTTAGCGTCAATTTTTTTGGCCAACATGGAAATGCAAC
TAGCATTTTTGATTCAAGTTATGTGTTCATTATAGCATTATTCATCGTTT
ATAATGAAAATAGGTTTTTTTCCTGAACCACTGTTCTTGTTGCAGGTGTC
TCCTCCAGAAGTCGAATTCCTTTGCGAAAAACTCAAAAAAATGTCACCTG
AAGTACAATTTTTAGGTGAAAGATCAAACAGAGATGTGGCATCCTCACCA
GAAGTTCAATTCTTGGGTGAAAGGGTTTTCAAAAATATCTACAATGACAT
GGCAATAAGAAGCAACGATTTGTATAACGCTGGATTGACCTTAGGGAGTA
GCACTGTATCAACAGGGAAGGAGAATGTACCCCCAAAGCGAGTTGTGAAA
CCCGGTTATTTCATAAGATCGCCTTTCGAGAACACTACCAGAAGTTCAAT
TGAGCCACACAAGATGATAATATATGAAACAATAACTACACTATGTGATG
ACCCTGATTACCGAGAGTAAGGAATATCACTTTCTTAGTTTTTTGTTTTA
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ATTTTATTTGTTTTTTGTTTTCTCCTCAATAAAACAGTAGATGGATTATA
AACATGAACAACTGTAGAGTGTCATTAGAACAGCTCGGAACGTCAATGAA
ACAAAATGGATGGGTGGGGGCATGGGTGATTAATGCTTGTTGTCGCAAGA
TTTTCAAGGATAACCATCCACGATTCTCAAACAAACATTTCTTCTTCCAT
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TTGCTTTTCTTTGGCAACATACAGTTGGTATTCAATATGTTAATATTCAT
TATATTTTTATGAAACATGAATATTTCCTTGAAAAATGGCCTAGTGATTA
CATGAAGAATGTTTGGAATAAGAATGTTATTAAAAATTTCAAGGCTGCAG
ATTCAGCAAAAAAGTTGCACCAATCTGAAAGGGTAATTTTGCTTTTTTCT
GCACATTATGTTTTCTATTTTACAGTATGATCATTTTAATCTATATAAAC
ACTAATTTCTCGTTTCTGTAAAATGTAGTTAAACTTCCCAGCTTTGTATG
ACAATCACTGGTTTGTGTTTGCCGTTGATATGAAGGCCCGAAAATTCTTG
TTCCTTGATTCACTATATGGAGAGACTAGTGCACTGCATCAGAATGTCGA
TAACATGCTGGTATGTTTGTATATTTCAAGCACAGTCACACCTAACTCTT
GTATTGGGTATGCCCGAGACCTACGCATGTCCCGTTGCAATTTTTTCGAA
TTTAATATTTTCTGATTTCTTATTTTCTTCTATTTTGCTGCTACAGGTTA
CAAATTTCATAAATACGTGGAACGAATGCAATCTGAAAGATATGCATTTC
GAGAGCTTTGGCAGAATGTTCCCAAATTTGCCAAAACAGAAAACTCAGTA
CGTAAATCCTTTTAGTTTTGTTGTATATGTTGTTATATATTCTGCATTAT
ATTAACATACCCAATCCCTAAATAGCAATGATTGCGGAATCTTCACTATC
AAATACATGCAGAAGTATTGCACAAGGAACCCACATTCTTGCTCATTTTC
AGCACAAGGCATACCAGAGTCCCGTGTTAGAATAGCAATAGACACTCTAT
TCAATGACTACAACTCAGAAATTAGTCAGATGGATTTCATAAGCACGTTT
GACATACAAGTAAGATTCTTTTTCATTTTTGTTTGACAATATTCATTTTA
TGTTTGAACTATTCTGTGTGTGTTTACTGCTCTGTTTTGTTGTTGGTTTT
AATAGGCTTACAAGAACAAGAAGAGGGATATGGAGTGAAAAATCTTTTCC
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GCGTAAAGTAAATTCAATATCAAGAGTACAGTTTGTACCTTACAAACAGC
AGCAAGCAGACATAAAGTCGAAGATTCTTTCTGATGTTTTTGTGCATCTC
AAACTAGTCTTATATACTCATGTGGAAAGCATTTGTAATATCATGGACAT
GAGCTTTTATTTTTTATTTTTGTGTGCTTTGTGATGTTGTGGGGGAAAAA
CACATAAAAACAATATGCCTACTGATTTTCAGTTATGAGTATAGTATGGT
ATGAATGTATGTTAAATTTGGGAAATATTTCCAAATTTTTAGTACATATT
TTTTATGTTTGTGCATTAACAGGACTAAGCATTTGAATGTTCGATACTCT
ACAATAGGATGTGAAAATTGATGAAGAATTTTATAGTATGAAGAATAATT
CAAAAGGTACACATTTTAAAGCATTTTTCACATATGAAAAGATAATTCAC
GTATGTCAAATTTGTTTATTTGTTTTGCACATGTATGAGCCTAGCATGAT
TTTCTTTTTTCCTAAATGCTTTTTTATCTTCATCCTTAGCCTATTGTATT
AACATTGAAATGTTTTTCCTTCAGGCATGAACAACAAATGACGATGAAGG
ATATTGATTTTCTGTTTCGCTGATGAACAAATTGGCGAAGTAAGCTTTGG
AGATCACAACAAAGGTACACAATGAAAAAACTCATGTTTTTTGAACATTT
AATTTGCCTGTATTACTTATAAATTCAATATTAATTTAAATACGGGACAT
AGAGACACAAACCAAGCAATAGTTTTTGCACTGCTCTACATAGAGATGAA
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GACAGAATGGCAACAGATGTATATCATTCACGTCTAAAATCTTGTTGAGC
ACAAGAAAATAACACATAATTTACAAATTTCTCTTGCTTGTCTATTAATA
GCATGCATCGTCTTTCACAACTCCATAGGACTGAGTTGTCCTTTAGACAT
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GCGAAGTAGAACCTGCAGAACAGATACAAAAGAAATAAATCAACTAAGCA
GATATAAGTTACTTTATAATTCTACATTAAACATTAATGTATCATGCCTG
AAGCTTTTTTGTTTGTAGTTTTCTTGTCGAAAGTACTCTTAGGTAGATGC
TTCGACTTGCATGTTGCATAGTTGTGTTCATGTGAACCACAATGGCTGCA
TGTTATTTTCTGTTTTGTTCGGATTTGTTCAGCTAAAGTTTTATGCCGTC
CAGCTGTACTAGGTCGCCCTCTTGGCTTAGCAACATCAGGATTCTGAAGA
ATATTAGTGTAGCCATCATCAATTATCAGAGGCTGCCTAGCTGCTTGCTT
TCTTAGCAGCTCTTCTTGCTCATCAGCTATACTCATTGCATCCAACTTCT
CTTGTATCTTTTTAGCTTCTTCCACAACCAATAGATACCTCTCATTTGAT
TTAGAACCATCAGATGCAATGTCAATAAGCCTGTCGGACAAAAGACTAAA
CCTAAGGTGGTTGTCTTTCTCCGTGAGTTCCATGGGCAGATTGAATTTCT
TATCTCTTATTGTTTTTCTCTCCTTTGGCTTCCACCTGTCTATAAAATAT
TTTTCTGGCAACTCTGACATGTTGAGGTTTACGAGAACACGAAGTATGTG
GCTACAAAGAATGCCATTTTTCTGAAATTTGCAACAAATGCAAGACAAAT
CTTCTTGTGGTAAATTAACCAAGACAATGAACCGCCGAGGCCTAAATTCT
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CTGCTGAAATGATAACTAGGATTAGTAGTCCTAGTAATTGAGTCCCGCTC
TTTCTCTTTTTCCTGAATTGCTTCACATATTCTCTGGTATTCACTCAAGA
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ATTTTAGGTGCGCAACAGCATATCTTTCAATCATCTGCGGCCACAAGAAT
TCAAATTCTTCTACAGTCAATGAGTTGCGCAAGATATCTGAGAAGTCTGC
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AAACATCAGTAGTCTCATTCTGAAAAAATGCACAAGCAAACAAGCAATTG
TTTCCATGGCCTGTCACACCTACAAACGGTGCAAATGGGAGGTTGTATCT
GTTGGTCTTGTAAGTTGTGTCAAAGCTAACACAATCTCCATACAGGTCAT
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CCCTCACCAAGTTCGAAGTCATAGAAGAACCTTGGGTCAGCTTGTTTTCT
TTTCCGGAAGTACTCCAACACTTGGGTCATGTCATTCTGCCTGCACTCAT
TCCTTATAGCTGTTCGGACATTGCTGACATATTTTTTTGTGTAAGGAAGA
GTACCCACTCCACCTCTTAAGTAAGCTAGGATTGCCATTATTTTCCTCGT
GGGTAGTTTGACTGAATTGAATGTGCGGATGAAGAGCTTCTCTTGTTCAG
TCATGTGCTTATGAGATCTAAGAAATTTCGTCTCGTCCGGTGGGCTCAGC
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TAGTGAAACCACCATCTTAGCCAGGCAACCTGTTATTTGTACAACGTTTG
CTCGTCTTATTTTCTGTGTTTCAACTGGCACAACGCATGTATTCTCTTGT
TTCCTTTCTTGCCTTCGTTTCTTTCTTGCCTCCAAAGTATCCTGATCAGG
AATTTTTCTTGATTTGTTGCATGAAAAGGTAGAACGTGTATGCCCAGCAC
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AAAAATCATGCCAAGATGTGGAGTATGCTGGCGACGGACTTCTTGACTGC
AGGATTCTTCATTTTCAATCTCTAGGAAATCTTCAATATCTTGCTGTGAT
AGAAGCTCAACAGGTTCTTTAGTTGCTTCTGTTTGAGCATGGCTTTCTAT
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CATTTGGTGCTTCTTGAACAGTAGCATTTGCTGGTTCTTGATCAGTGGAA
GCATCTGGTGGTTGTGCATCACCAAATATATCATACTCTTGTGGTGATGG
CTCATCCCATTCTCCATCTGAATTATCAACATTTTGAGGTATGTTGTCAT
CAAAGTAAAAATTAGATGCATCATCTTCATGGAACATGTATGTTGTTTCA
CTTGAATTATCTTGTAGTTGATCACAACATTCATCCTCTTCTTCCATACC
AGCATTGCCATCAAAACATCTACCAGTGATCATATACAACTTGTTCTGCA
TATTTTGGTTTCAAAATAAAATAAGCTAAGAAGTAACAGAATGAAAACTT
AAAAAACTTAGTTCTGCATATTTTTATTTTGAAAGTAAATAGCTTGTTCT
CCATATTTTTTTTGGTACCTCATCTGTTGCTGGACCTTGATAGAAATTGT
TGTAATGTTGTCCTTCAGCTGACTTCTCGACTCCAAACCACATTTGTGTA
TAGGACAAACCATGTCCTTCAAAATAATTAACCTGAAATCAAAATATATA
TTCTTTTACATGTGTGTGCAGGTGAAATATGTTTTTATGCAGTTTGCCAA
CTAACTCCATTGCACATGGACTAGTGTCCACATATCACATTCTGATTCAA
ATGGTGATTAAATTTTTCAGTTCATATTATCTGAGTCAAAATGTTGTTGT
TCAATCTTAAGTCAAACAGATTGACTTGCATTGTTGTTATTATATAGAAG
TACATGAACATATTGACCTGCATCAAGTTGTTTTCCAAAAGAACAGATTG
TTCATGTACATATTGACTTTCATTAAGTTGTTTCCAAAAAAGAATCATGC
AAAAATAAATAACCTTTTTCTGATAAAAGTAAAACAATGATCTGATGTTC
AATACCTTTGATGTTTGCTGCTGTGCTCCAATTAGATAATCACCATAGTC
CTGCATTATTTCTGCACAGAAAATATTCATGTTTGTTGATGTGAAATCAA
CTTTCTTCAGAGAAAACAAGTTCTAATATCAAGGGTAAGAAGGAGATCTG
AAAGAAAGGAGATGGGTTTCTCTAACCCTGGTAAGTACTTGGTGTTCCTT
TGTCCATAAAACCTGGAGATAATTACAGAATGTTATTTTCACCAGATTTC
TGAGAAATTTTTTCTCCAAATAACAAATATGACAGCAGATGGAAGAAGCA
AACAAAACATTCGAAGGAGGTGAAATCAACTTTGTTCAGAGAAAACAACG
TCCGATATCAAGATTAAGAAGGTTATCGAAAGAAAGAAGATGGATTTTTC
TAACCCTGGTAAGTACTTGGTGTTCCTGTGTCCATTATGCCTGGAGATAT
TCTGACCAGATTAATATGACAGGAGATGGAAGAAGCAAACAAAAATTCGA
AGGAGGTGATTTTTTCTTTTTTACCTGGGTACGTGCTCGTTGCTTCTGCA
TGGTTTTGTCGTTCTCCTTCCCCGGACATGATTTTCAATCTCAAGTCTCC
TTTCTTTTCATGGAGATTTCGTTTGCTTGGAGAAGGATCTGGTGAGACGG
GTAAAACGAAGAAGGAGGCAGAGTAGTTGGGGATACAGATGTAATATCAC
ACCTTTTGTTTCTGGATACTTTCTTAGATACAGGACAAAAGCCCAACAAC
AAATATGACAAACAATCCAATCAACAGAAACAGAACAGGAAAAGCCCAGG
AGCAGAATACTAGTTGAGCGTTGGGCTTAAAGTGGGAAACTCGATGGGTT
CAGATTAGCTCTGACGTCATGCGACTGAGACCTACTTAAGTCTTAGTCGC
CTGAGACCTAGGCACGGCATCTATTAGACTAGAAAATTTGACACCGGAGC
GCGACCGTCTAGGTCATGGCTTTATTTTAGTTCGGCCCTATACCAGCCCA
ACGAGTAGTATGTGTGGGCTATATTGGCTACTGGCTCTGCAGACCATGGT
CCCGTACTTCTTGAGCCCACTGCACACCCTGACTATGCTTTTTGGCCTAC
GTGGCTCGGCTTTCTTCCCGGTTGTTTCTTGGTTTCCTATTCGGTTTTCT
GTCTTTTGGGTTTTTGAAAAATCACCAATTTTTTTTAAAAAATTGAACAA
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TTTTCGAATATGAACAATTTTGCATTTAATATTTTACAAATCTGAACATC
TTCAAGATTTAACATTTTAGCATCTGAAAAATGAAAAAAAAAGGAACTAA
AAAAAAGGCCAGCCACTAAATGGGCGAGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
ACACACACACACACTTTGTGGGCCTCTTGTTTTCGAGCATGCTCTCTAAT
GGGCCAGATTTGCTTGTAATCAGAGCGGTTCGCAAACTTGGTAAACGACT
TTGCATGTGATATTCATTGTAGAACAAAATTCATGATTATGAATAGGTTG
TGATTACCCTATTCAGTGCTTAATGGAAATGTACATATAATGCAGCCTGA
TGTGCAAATCACAAAGCATGAGCCACTCATGTGAGCTATTTTCTTACTAA
TATGCTATTTGCTTACTTAATTATGAGAATCCCATAATGTGCCTATTTTA
ATATATTTTCCTATTTTCGCTACTTATATGTATTGCATTATTCTAGATGT
ATATTGTCCGGATTCTGGTAATTATGTTTGTTGGTCGATCCATATTACTT
GCTTAATGGTTTTATTAATCCGCAGGTCATGGGGGCGTGCGCCAAGGTGC
ACCCCTAAATTAAGTTCTCAATAGAAGAGAGTCGAGTCCCCATCATCAAC
ATCTGTGTCGCTACCATATCTAACTTGTTCGTCAGATTGTCCCGCGACTT
CAGTAGTCACTCTGTTTTAAGACGTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGA
TGTTTTAGCTTTGTGAAATGAGTATCTAGACTTTATTGAACCAACACATT
AAAAAAAGTCTAGATACATTTCTTTCATAAAGCTAAAACATCTTATATTT
TGAAATGGAGGGAGTAGCTCCTTGCAGCTAACAGCATTCTGGCCCGTCGT
TTTTCCACCGAAAGAGCCATGTTTGGCACGTTGTGCTCAACTGTGGTCAC
CCGCACCGTTAACGATGGTGGCCGTGCCGTGATGACGATCTGCAATCACC
AATCCTACCGCCACGGGACTGACGAGTACTAAGCACCCTTTTCCTCTACA
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GGGATTTTACGAGGGATCCCAACCCAAGCCAAGTGGTACTCGAATCGCCT
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TTGTGTGTGGACCGATACCATTGTTACGATCCTAGCTAGTGGCAACACAC
CAAATAGCGCTAGATCCTCACGTGATCGGCAATTCACAGGAATTCGGTAC
AAGAGTTTAAAGTCTGAGAGGAGGAAGGAGGAACAAGGAGGAAGAGAGGA
GTACAATGCGTTCACGCTAACGATCGTCGATGCCTCCCCCGCACAAACTT
CCACCACTTAAGGACAAGTAGGTGTCTAACTGTTGGAGTTAATAGCATAA
AACCACCACATATCTGCAGAAAGTTCGATTAACCACCACTTTACAAAAAA
ATCGCAAAATGTGACCACTTTTCAACAGATTTTTTGCAATTCGCACTAAA
ACTCGATTTGAGACCGATTGACAGTGTTTCTGACATGGAGGCCCCACTAG
GACGATGACGTGGCGACGGGGTGATGGCTCCGAGCCACGTCCGTTGCACG
CTGGCAAATGTGGGGCCCACTCCCAGTCCATGACCGCCGCCGACATACAC
CCTTCCCTGTCTAGGGACCACCGCCGATCACCTTGGCCAGTACAGGGACC
GCCGCCGCCCCGCCCTTCCCCATCCAGGGACCTCTGCCGCTCGCCCTGTC
CCGTCTAGGGACCGCCGCCACAGACCTCGTCCCGTCTAGGACTGCCATGC
CCCTGCGCGTCCGACCGCCGCCGCCCTGCTCGTTGATACATTGCAAATGT
AACTATAATTCTTGATGTTCCATGCTTGGTTTTATCTACTTTCTTATGTT
TTGTTCCAACTTTGGATTACTTTTCATACACTTTCTTGGACTAACCTATT
AACAAGATGCCACAGTGCCAGTTGCCCGTTTTCTGCTGTTTTTGGTTCCA
GGAAAGTCAGGAAATCAATATTCTCGGAATTGGACCTGACAAAAGCCAAA
GTCGATATTTTACTGAAAGACTCACGGTGCCAGAAGACGAGACGGAGAGG
GGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.