Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE004853

[Submit comment/correction]

Sequence	AE004853
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE004853
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GACACAGGTCGAGCGCTCCCAGCCGGCAGCCGCCTCTCCCTGGCCGCCGC CTCTCAGTTCCTCCCCTCACGGCTGTTGCGGCCTTGCTGGCTCGTTGGTA CCTGGGGTTTTGAGCTCCTCCCAGGCCAGCAGACTCCACCGCTGGCTGCT GTGCTCGTCCCCCCCTGCTCTCCCTCACGGCTGTTGCTGCCTTGCTGTAC CTGGGTTTTGAGCTCTTCCGGAGACAGCAGACTCCACCGCCGGCAGACAC ATCGCCTAGTCGCGACTAGTCTTTGAGTCGGTACCCAGCGACCACTTTCG ACTCATCGACTCACAAGGATAAGGGTGCCAAATCCGCTATGGACATGGAT GATGCGCCCACGCAATCGCGAAACAAGCTTCCTGACCACCTTGAGCTCCA GCGCACCCGTGTCCCTACTCATGTATCCATCTATATGCCGCCCCTGTCTT TTGCTTCCTTATGTTTTACACCACCCGTTCCATAATTCTTGTCGTGGTTT TAGTTCAAATTTAAGCTGAAATCACAACAAGAATTATGGAATGGAGGGAG TAGTTCACACTCCGTTATGCATGTGTTCATTTCTCCGCGGCTAAATTATC TGTGTGATAAATTCCACAATCAAATCATGTGCTCTGCAAATTTCTTACTT AGGAACCTAATTTCTCTCATAGAAACACAAAGCATCTACTCCCTTTGTTG CAAAATATAAGATATTGTCTTGAATTTTGCGATGTTGAAGCTGTTTTAGC CACTCGAAAACATACAAAACCCTTCTGTCTTTTGGAGTGGCTAAAACAGC TTGCTAAAACGTCTTATATTTTGCAACGGAGGGAGTATCTTAGAACACCT AGTTGCCTGATTAGTATAATATATAGAAATGAAGGTGCTTTTGTTTTGCA TCATCATTTGATGTGCTATTTTACTAGTGTTAAAGTCCTGAACACATACT CTTAAGCATCTTTGCTTGTTCCTTATAGTAAAAAGATTGAATATGTGAGG TATTTACTTTGAATTTGGTTGCTAGCCAAAAAACCATTTTCAGTTCTGCA GTATTTGGTTATATTGCTTTATAGTTCTCCAATTATGCTGGCAAAATGGT GCTACTTTAAATACAGTCTGGCATCTCATGTTTGAAGCAGAATTTTCTGT TTATTACTGTTGGATGATTATGTAATCAGATCGATAGGTCATATCTTTAA TTTTGTATGCTTTGTCATTTATGTTTCAAAAGACAGAAGGGTTTCAATAC TCGGGTGCTTTTGCTGCTATGGGGGTTGATAATAGTGTATCCGTGGAGAA GTTCTGCAATGACTTCAAAATCAAGATAAATCGACTTACAGACGATGATA TGGAGTTTGATATGATTGGCATTGATGCATCTATAGCTAATGCTTTTCGT AGAATCCTCATTGCAGAGGTAGCACATTGCTGTCATCTGTACCATCTCGA AAATTATTCTAGCAAGTCATATATGTTTCAGTTCCGGTTCAATATCTAAG TGTTAGATGTGTATTCTGTAAAATTAATTCATAGGTTCCTACAATGGCTA TTGAGAAGGTCCTCATGGTTGACAACACCTCGGTTATAGCAGATGAGGTC CTTTCACATCGACTAGGCCTTATTCCACTTGATGCAGATCCAAGGCTTTT TGATTATATCTCCGGTCAGTGACATAAATTTCTGTTGTTTCACAATCATA AACATTGCTGCATTTTTACAATAAGGGCCATCTTATGCTTTTATTTTGTT TTTGTAGATGATGTCCCAAATGAAAGGAATACTATTGTATACAAACTGCA TGTTTCATGTGAAAAGGGTTCCCAGCGTCTTACAGGTATAGATATCTCAT TCACCTGCAACCTGGACCCTAGTATAGTTTATTCTCTTCGTTAGGAATTT CGTCCTTAATGTATATCGTTCAACAAACTATTTCTTCCCCCAATAATAAG CTCCAGCTTATTCTGCGCTATTTGGAAGGCTAGAAATGCTAGAATTTTTT ACAATATAATACCTAGTAAAAATTCCTGGTCTTGCGCTTTCAAGAGGGAT CTTTTCCTTCTCTCTTACATAATGAAGGACCATCTTAGAGCTCCCCTTAT TAGCTGGATAAATAGATAGCTTGTAGCTATCCAATGGGCTACGTCCCTTG TATATGCCCTCTCTCTCTTGTAAGTATTTTCCCTTAGATATAATTTTTTT ATTGTCGGGGCCTCCCTGCAGTTTTCCGCTTAAAAAAAACTCCAGCTTAT TCTGCTGTATCATTATAGTTGATTGCTTTTGAAAAGAAATGTGCGTGTGC TTTGCTCATCCTTATTATTATAAATATAATGTCACAATACTACCTAAGTG AACGGTGGATATTTGGTTCTCAGTACTCTATTTTGGCTTATTCATCTTAT TTAGAGAACATGCAGTGCCCTATCTTGCAATGTCATATGTTAAATTGCCA TCAAGAAGTTACTTTGCTAAATACCTTTATGTCAAGTCAATGTAAATTAA ACGTTTCAGTTTTAGTTCTCTTGTACATCTTTATCATGTTTTTATGGGAT ATGGTTGGGATTTTGTGGTATATCAAGTGCTTACAGCTTTGTTAACTTGC AGTGAAGTCTGGTCAATTGGAGTGGTTGCCAGAAGGTAGCCAATTGACTA TTGCAGCTACTACGCAATCTGGGGACAAACAGAAGACCTACACATCCTTT GGTCAAAGCCAACAGAAGACGTCTGAAAGTCCTCTTGGTGTGAAGTATGA AGATATAACAATTGCAAGGCTTGGGCCAGGACAGGTAATTTGTTGTTATA GTTATATTGCTTTGTACAATTAGCTGATAGCTCTAGCTGATGTCCTTTCA ACAAAAGATTTCAGTTGAAGTGTTCTGTTCAGTCTGTTGTTGATCTAATC CTGGCGGAAACGATGACCTCGTTGGAGGCCTCGGCTACGTGTTATATAGC ACAGGAAAAGCCCCTGGCGTGGCACATTACACGGACCGTATATTGGGTTG GAGTACTACTCCATACCTGTATACGTAAAGGGAAAAATATAATAACATAT TGTTTAATAACCCCCCTTAATCACAACCTTGTGAGAGGTTGAGATTACGC CTAAATTCCCGAAGTTCCTTGACTGGCAAAGCCTTGGTGAAACCATCTGC AACCTGATCTTTGCTTGATATGAATTTGATGTCTAGAAGTTTATTTGCAA CTCTCTCACGAACAAAGTGGTAGTCTATCTCAATATGTTTGGTTCTTGCA TGAAAAATAGGATTGACAGACAAGTAGGTAGCACCTAAGTTATCACACCA TAGGTCTTACCCTTAGTGAGACGCCAAGTTCACAAAGAACAGCCTTAACC CATATCAGCTCTGCTGTAGCATTTGCTAGAGATTTATATTCAGCCTCAGT ACTGGACCTTGATACTGTGGCTTGTTTCCTTGCACTCCATGACACTAAAT TCGGTCCAAGAAATATAGCAAAGCCTCCTGTAGATCTTCTAGCATCAAGA CATCCTGCCCAATCTGCATCTGAAAAAGCACTAAGCAAACTAGAGGATGA CTACTGAAAAGTAAGTCCAACCTTTAGTGTGCCCTAAACATATCTTAAGA TCCTCTTTGCAGTTGTCCAATGTGCAGTAGTAGGAGCATGTAGATATTGA CAAACTTTGTTAACTGAGAAAGATATATCAGGTCTAGTCAATGTCAAATA TTGTAGGGCACCTACAATGCTTCTATATTGTGTGCTATCCTCAGAGCCAA GAGGAGATCCCTCGGATAAAGAAAGTTTTTCATTTGATGGCAATAGTGTA GGACAAGTTGTGCAATTTGTCATACCAACTTTTGCAAGCAGATCAGTAGC ATGTTTTTCCTGAGTAAGTAACAATCCATCATGAACCTTTTTTACCTCAA TACCCAAGAAGAAGTGCAGGTCACCCAGATCCTTGAGAGCAAAATCATCA TTGAGATCATGGAGTAATGCTGATATAGCCTGATCTGAGGAGCTAGTGAC AATAATATCATCCACATAGATAAGAACAAACATAACAACATTAGCCTTGT TGTATAGGAAAAGTGAAGTGTCAGCCTTAGAGGGAGTGAAACCAAGAGCT TGCAACTTTGTACTAAGTCTGGAATACCATGCACGAGGGGCCTGTTTTAG ACCATACAGAGCTTTGTCAAGTTTGCAAATATAATGAGGAGTCTGTGAGT TTTCAAAACCTGGGGGTTGTCTCATGTAAACCTCCTCTTCCAGAACGCCA TGTAAGAATTAACTGTCGCAAGCTCCAGCCCCTAGAAACAGCAACAGCCA GAACAAGTCTGATGGTAGCTGCTTTGACAACAGGACTGAAGGTGTCTTCA TAATCTATTCCGTATCTTTGTTTGAACCCTTTTGCAACCAAGCGTGCTTT ATACCTGTCAACTGTACCATTAGCATTTTTCTTGATACGATATACCCATT TGCAGTCAATAACGTTTTTGATAGAACTTGAGGGAACAAGGTGCCATGTT TTATTTTCCATTAGAGCATTGTATTCCTCTTGCATTGCCTTGCACCAACG ATCATCCTCCAGAGCCTCTGAAAGTGTGGTTGGCTCTCCTGTAGAAGTAA ACAGGCCATAGCGAACAGTGCCACTAGCATACTGTTTGGGTTGTCGAATA TCTTTTTGTAACCTTGTTCGTGGTTCAGGAACTGGAGGCGCTGGAGAACT GTGAGGTGGAGAAGTAGAGGCACCGGGGCTGGCCACAGAGGTTCCAGAAC CAGACCCCCCGGAACATGAGCTTCCTCAGGTGTCGCAGCGCGCACGTACG AGCTCGTGGCTGAAGCAGGCGACGCGTCGTCGCTGTGGCGTGGTGTGGAC CCGCCTGGTGACAGGGACTCCTGCCTGGGCGAATCAGGAGGCGAGGCTGG GGGCGTGATGTCGCGTGGTGGAGCCCGCAGCGGAGAAGGAGCAGGCGACG GTGGCCGCTGCAGGTCGACGTGGCCCGGTCGGCGCCGCGTGTACACATGC ACGGGAGGGGACCAAAACCGGGACTACAGCGACGTCCGTCCAGCTTGTCG TGCGCGAGGATCTGCCTCGGGATCAGGTGGCGGCTGATCCGACATAGCAG GGGAAGGATCCTGCTCGTGCTCAGCGCCATTTTCGCCGTTTTCTGAATTT TCTGACATGTCAACGGTACTCGATTCTGCACCGTTTTGCCTCAAATTTTC AGCTGAGTCTTGCTGGTCCTGGTGGGTACCTGTGGGCATGGAATGTTCTG CAGTACACTCATCATGGTTAGACACAACAGGTACAATAGGCAAAGGCATA TAATCATCAACATGTGCATCCCCATTATTTGATGTAGTGGAGGACAAATG TGGAGGTAAAAGAAGGATTTCATTGCGAAGTCTAGAACCAACGTTCGTAT GTAGAGACTCAAAAGGAAAAATGTTCTCATCAAAGACAACATCTCTAGAG ATATACACACGCCCAGTTTTAGTATCTAGACATTTTACTCCTTTATGACA CGGGCTATAGCCTAGAGAGACACATCGAGTGGAACGAAAAGCTAAGTTTT TGTTTGTTGTATGGGAGAAGGTTTGGCTAGCAAGCACAATCAAAAATCCG AAGAGAGTCATGGTTTGGTTTTGTGTGAAGGAGACGTTCAACTGGTGTTT CATGATTAATGACTTTGCTAGGAAGCAGATTTATGAGAAATGTGGCTATG AGAAATGTGGCTGTCAGGAAGGCTTCATCCCAGAATTTGAGAGGCATAGA TGCATGAGCTAATAATGCAAGTCCCACTTCAACAATGTGACGGTGTTTGC GTTCAGCAGAACCGTTTTGTTGATGAGCATGAGGGCATGAAACATGGTGG GTGATGCTAGCCTTTTGAAAGAAACTGTTGAGTTTTTCATATTCACCACC CCAATCAGTTTGCATAGTAATAATCTTCCTATTAAATTTGCGTTCAACAA GTTGCTGAAAATTGAGGAAAACTTGATAAACCTCAGAGCGTTTCTTAAGC AAATAGATCCATGTGAATTTGCTGAAATCATCAATAAAACTTACATAATA CGAATGTTTGCCAACAGAGGAAGGTGCTGCACCCCATACATCTGAAAACA CTTGTTCCAAAGGAACAATGGAAACACTAGTGGAGATAGGATATGGCAAT TGATGGCTCTTAGCTAGTTGACAGGGATCACACACATATGGGTTTATTTC TAGAGAATGAGAAATATTATTTTTCCTAAGGATTTGTTGAACCACAAATG AGGATGGATGTCCTAAACGACGATGCCATGTTGAGGAAGACGCCATGTTG AGGAAGACGGCTTTATTGTGATGAAAGCTTGCTTGGAGGACCCAGTGGAG ACAGGCACTAGCGGGTAAAGACCACCATGGCAGGGTCCCTTAAATAGAGT TCTTGTTGCCTCGTCCTTGATCAAAAAGAAATATGGGTGAAACTCAAGAA ACACATTATTATCGAGAGTAAGTCTATGAACAGATAGCAGGTTTTTGGAT GCACTAGGAACATGGAGAACATTTTTGAGTTGTAATGAACTATGGGGAGT GCTCAATATTGAATGACCAATATGACTTATTTGCATACCGTTACCGTTGG CCGTGTGAACACAGTCGCGCCCATTGTACTTGTCATGGGTGGAGAGCTTG CTTAATTCTGATGTAACATGGTGAGTTGCACCAGAATCCGGGTACCAGTT GGTGTCAACGCCATAGGATGCAACATGTGCACCCTTGTCTCCATCATCGT CCTTGTCATCTTGGAAGTGCCACCAACAGTCGCTGGCGAGGTGGCCGTGT ATCTTGCATATCTGGCAAGTTACATCGACGAAGCGTGTGGGCGCACGTCC ACGGCGCCGTCCACCATCATCACGGCCGCGGCGACGCCACTGGCCTCCAT CGCGACGATCGTCATCGTAGCGGTCACGGCGATAGCCGCGATCCTCCTGG CGAGCACGGTCAGAACCGCGATCATAGTTGCGGTCATCTTGGTGCCCGCG GTTCTCCTGTCGTGGGCGATCGTAGCCACAATCATAGCCACGGTCATCAT TGCGCCCACGGTCACCGTACCGTGGGCGATCTTCCTGGCGTCCTCGGTCG TCCTGCCGACCGCGCTGCTGTGGCCGAGCATCGTGGCCACCGCCACCGCG GCGAGCAAGATTAGCCGAGGAGGTGAAATCCCCGGTGTCCTCTGGATCGT CCTGTCGAGCATCATAGGCAACAAGTTGACTATACAGATCTGCAAGAGTT GTACCAGGGTTTGCATTGATAGCAGCAACGAGAGCATTGTAGGAGTGATC GAGCCCATCGAGGATGGATCCGATCAGTTCATCCCCGTCCAACGGTTTTC CTGCAGCAGCGAGCTCCGACGCGACCGCTTTCTTCTTGGCGCAGTACTTC GCGGCCGAGAGGGTGCCCTTCTTTGTGCCTTGGAGTGCAGTGCGTAGGCT CTGGATCCTCGACCGAGATTGGGAGGAGACCATTTCCTTGATCGCACTCC AGACTTCAGCGGATGTGTTCAGCTCGGTGACATGGGCAAGTATATCTGGT GATAGCGAGTTGAGCAGGAAACGAAGGACTTGCTGATCGCGTGTGACCCA AGCAACATACTCGTGATTTTCAATGGTGATCTTCTTGTTGTCTGTCTTCA GCCTCCAGGGTTTCAGCCGGCGCAGCTTCAGATCCCTCGACAAGAGCGAG GACTCTGGCACCACGCAGAGCAGGGAGCATCAGCGCCTTCCATGGGAGGA AGTTGTCACGCGTCAGCAGTTGTGCGGGAGGAGCTCCTAGGGCCGCAGCC AGGTTGGTCGGTGAAGAGGTGCCAGCCATGGATGCAATCGGAAGGAGAGG TTTTGGATGTAGGGCGGCGGCGGCTGATCTAGACGACCACCGGCGGCGGC GGCAGATATCTTGTTGGGTTTTGGTTTTGGATGTAGGGCGGCGGCAGATT TTTTTTTGGAGCGGCGGCTAGGGTAGGGAAGAGGGCAGCTCTGATACCAT GTTGTTGATCTAATCCTGGCGGAAAGGATGACCTCGTTGGAGGCCTCGGG TACGTGTTATATAGCACAGGAATACATGGACCGTATATTGGGTTGGAGTA CTACTCCATACCTGTATACGTAAAGGGAAAAATACAATAACATATTGTTT AACACAGTCCACATGGTACAAGAAAGCCTTTAACGTAGTCAATTCAGAGG TTCATTGTATGCAGCTTTGCCTTAATTTATGTGAATAACCTTTTGTCGTG ATTTAGATAATCAAGCCTTAATTCGTGGGCATCAGTGTACCCATAGAAAA TGTTGCTAAAATATGTTCTTGTAGCCGGTCTGCTCCTTTAAAATTCTTCT ACATAGTTTCAGTGGGTGTTGTTTGTGTTAAATGTAAACCATAATGTTTT AGTTTCCATTTAGGCTATTGAACTTGAGGCACATGCTGTTAAGGGAGTGG GGAAAGTTCATGCGAAGTGGTCTCCAGTTGCTACAGCCTGGTACAGGATG CTTCCTGAGGTAAATTTCTTGTTATGCCATTTCCAATAATAAGTGGCGAG TAGCGCACATTGTTTCTGCCTCACCTGTTGATTATTATGTTATCATATAG GTTGTTCTTCTCAAAGAAATTACAGACGGTGATGCGGAGCAGCTAGTGAA AAAATGCCCAGTTAATGTTTTTGACATTGAAGAGCTGGGAAATGGTAACT TGTCTTCCACTTTCTGTTTTGAGGTCTGAGAAGTTTCAATTAGCTGTAGG TGTACTTTATTTTTTATTTTTATTTTTTGACTGTTATATTTGGGTAGCAA GGGTGTGGTTTGCCAATCTTAGTAACAGTAACTCTACCAGGTCGTCTCCA GCTCTTGATACAGTATTTGTGATGTTGCCTGTAATTTTAGAACTAAAAAG TCCTGCCCAGCTTCATTTTAATTAAAAACGAAACATTCAATCGACCACAC TTCTTATTAGAAGCTGTTTTATATCACCACTCCCCAGAAAAAGGGCATAA CCTCCAAGACTACTAGATCATAACAACCCCGACAGCAACAAAAAAAAAAC ACTACACAAACGTTCTGTTTTACTGTAAAGAAGTATAATTATCATCACAG CATTTGCAGGGTCTCTTAGCTCTTCCAGAATCGAGGCATCTCCCTTGAGC ATCTTCTTTTCGTGAGCGCCAGCCAAATTCCTGCATTCCCATTGCTTTTC TACACAATTCCTATGACTTATAAGATGGCAGGCCCCTGCAAGGCAGTCTC CTAGCACTTGGCCCTGTCTCTATCACGGTACCTGCATCTGGAAGCAGCAA ACCTTTGGACCTTCGGTAATAGTAAATCTCATTTCTCAGGTTTCATGAGA AATCATATTGATAGTTTTAAGTCTAGAACCAATCAGGCTAGCAATTTAGT TCACACCACTATCTTTCTTATCCAATTTAGAAATTCCATTCCACCCAAAT TTTGTAAAAGCACTTTCTAAAAATAGGTGATTTCTAGGAAAAAAACATAA AATGAAGGAAAGCTTCCAAAGTGTAGGTATGAACACAGGAGTACTATAAC GGCAGAGCAGCAATTTCCTTGACACCAGATTGTCATGGACCTTTGTCCAC AGCGGGTAAACTGAGGATAATGATCCGAAAAGACTTGGGTAGGGCACTCA CCCTCTTCAGTCTGGTGGGAGGGTTCGTCACTGAGTTGAGAGAGGCTCTG TGGTGTAAATGGAACTTCTGTTTATTAATTTCTTGGCTAAAATGGTTACA CACTAGTCTTTATATAGGACAACTAAGTTGATCCATAAGTCGGATTTCAG TTCATACTCAAGACCTATCAAAGATAGTCATGACCTAAGACCTATCTACC AGGTTTCCTTGTGGTATGTCATATGTGCCTATCCTGCTGCAAGTCTTCTT AAGCGATACAAGCCGTTTCCATGTAGTTAGGAAACTAACTCATCACATCT TGGACATGCCGTCTGGCTGCAGGTCCCAGGCCCATGACCATAATACATAT AGCATGTATCAAACCAGAAGAGTGGGGCTTTCTGTATAGTCATGCATTTT AGTCAGCAGATAGAACGATATAATAAGCAGTCTGAACAAGTTCCATCCAC TGAATTATATGATTATCTTTACAGTATCTTCTAAAGGCTAACTTTAACTC AGCCATCCATAGTTGTGTTTAGTGAGTGGGACCCGAGCACCCCACTTGAC CCTAATTCCTAAAGTTTGGGTCTTGCTGTTTTTGAATATTTTCTAACTGA CCAAATAACCTCAGCATTCATTTTTCATAGAAGTCAATATGGGAGATAGT TAAATTGGTTCAGCTTCAAGCAAGTAACTCGTAAGGGCTAAGAGTTGGCT AATAGATTAAAAACAATTAAATAATCCTAGTGTAGATATAGGTAACCATG TATTGTGTCTTTACTCTTTTCCAAGATGCGTTCTTACGAGAGGCTTATGT TAACCCCTTTTATTTCCATATGCAGGGAGGAAGAGAGCAGTTGTTGCAAG GCCAAGAGCATGCACCCTTTGTAGGGAATGTGTTAAAGTGGCCGATGATA AAGCAAAAAGGGATAACGCAAAAGTGGCCTGTGATAAAGTAGATGAAGTA GAACCTCAAGTAGAGCTACGGCGTGTTAGAGACCACTTCATCTGTAAGTA ACGCAGAACCTGATTATGATGTTTCCAATTCGTTTAGCTTGTTGTGAATC ACCATGTCTTTTTTTTTCTTGTTTTTTGTGCTGGTTTAGTTACGATCGAG TCTACTGGAGCTCTTCCACCAGAAGTGCTCTTCACAGAAGCTGTGAAGAT CCTTGAGGAGAAGTGCGAGCGAGTGATATCTGAGCTTTCCTGATTCTCAT ACAAAGTTTTGAGTACAAGTTACTCTATTTTGCTGTGCGCCGAATCTTCA ACACTATGGTTACTGTAAAACTTGCCTATTCCCTACACTGGAGTCGCATT CAGCAACCATGTAACTAGAAGTAAAACACATAAGCTAATTACTGAGCTGG AAGGTGGTGTTTGGATGGGGGTGTGGAAATTTTTGTGCTTGAATCCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.