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GrainGenes Sequence Report: AE017487

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Sequence
AE017487
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017487
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCGTCGCCAGCAGAGGCCGCCCGGGAGCATGTGGAGAAAATCCGTCG
GGAGCGCTACTACATCGGCCGCGGCGAGCAGAACCCGCTGTCGGAGGACA
TGCACCAGGCGGTGAACTACCTGAGCCAGGAGCTCTACTCCAAGGATGTG
CACTTCCTTATGGAGATCGTCCAGGTGAAGAATCTTGCTTTTCTTCACCA
CTTGTGCTGAAATCCCATTAACTTATTCATGTATTCAATAATTTTTTCGT
CATCTCTCTCTTACTTCTACTTTCCTTCTTTCTCAAATACGAAGCAACAA
ATCTTTGTTTTTAATTTTTTCAATACATTTTATTTAATACAGAGTCATTT
CCTTTACATACATTTTATTAACCTCCTTACATTTCGACACAGTATTTTTA
GTGCTAAACAGCTCTTGGTTTCTCTGCTCACCATAATGTCCTGTGAGCTC
ATTGGAGGCCTAACAGAACTATCCTTCAGTAGGTCAGTTGCATAGGATCA
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GTGGATAGAGTCCATGTGTTCCAAGAAATGGAGGGACAATGTTAAATTGT
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ACTTTTGTATGAACCATGCTAGGAAGAAGTATATTATGAATATTTTTTCA
TGTCAAACGAAATATGTCATGAATTCCTTGCCAAACTAACCAACCTAGAT
AGAGAAGTTTATCTGCATGCTTTTGAAACACTATCTGTTTATTTATGAAT
GGCGGTAGTACTCATTATGGTTTCTTGGTGACATGGTCTCACTTACTGAC
ACTAGTATCCAATGCATCCCTTGAGGTGAATGAAGTATTTTTTTTTGTAG
TATCCACATTAGAGATATCTTCTCATGCTGAATATTCACTTGAACTTTGA
CCATTTTTGTGATACATGGCAAAATACTGAATTACAAATGCTATTTCTTT
GAACAAGTCACCCTATGTTTTTCCTTTTGTAATATGCACATTAGAGGTAT
CTTCTCCTGCTTAATACTCCCATGAACTTTGATCAGTCTTTTAATACATG
GCAAAGTACAGAACTACAAATGCTATTTCTTAGAACCAGCCAGCCTGTGA
TGGTCTACATGTTTTGTTTTAGATGTTAAAAGCTATATATTTGATGAGTT
CTTGGTAATGATTGAATGTGTTCGTTATATTTCTAATAGTATTGAATTAG
ACATGTATTTCCATTACCTCCCTGCTATTTTTAGTCTACCCATTTGATAA
GATAACGTGATACAGTTTTCATATCAAGAGTTGCAATTACTGTGACTATG
CCGAAGTTGTGTGCTGCTACATGTGCTTGTTTTCTCAAATCTTATGAAGA
GATAAACTCTCATTTTCTAAGGGTGCATCCTTTGACATACATATTGTATT
TGTTCAATGCATCTAATATAGTTGTATTTGCTCATTCACACATTTTTTGT
TAATATTTTATTCCTCAATAATCAGAATGCTGAAGATAATGAGTACCCTG
ATCGAGTAGCACCATCATTGGAGTTCCTAGTGACATTAAAGGACATCACA
GGATCTGGTGCATCGTCAACTTTACTCATTTTCAACAATGAGAGGGGATT
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TCAAGAATCATTTTGTATTTTTTGGCCAGTTGAAACATTTTACTTTTTAA
TATTTAACTTCAATTTTGTTTGTGCGACACTGGTTAAAACTTTTAATGAC
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TTGTATTTTGAAAACAATTTGGATGCCTCCGTGCATACTATTGCTTGAAA
CGTTTACGGTGCAAGATATCTTGCATTCATATTCCCACAATCAGAAACAA
AAGATGTGCTGGACTTGCATGTTACGAAATATTAGTGTAAGAAAATAGTC
TTTAGTGCTATGTCATGTTCAATACCATACTTACATATATCCAGTTGAAT
GAATAGCCCATTATCAACTTTGTTAACTTTTTCAGGTACCACCTTTTCCC
TCCAGTGACATCTATGTTTCTAATCTAAGAGCTTTACTCTTCATCAATAG
CTTACTGAAGCAGATCAACCAACCACATACTTGTTATAAATAAAATTAAG
CATGTGATGCATATCTAACAAGTCTGTAAATTTTACTTCTGTTTTTAAGG
CAAGGTGTGCAAGTTATTTCTGGCCCAGAAATATTTTTTTTAATGTGCAT
ATATGCCATATAACATATTTGGCATTTTAGTTGAAGAATTACATTGTGTG
GTTTATGTACATTCTTATCAAATGTTCCCCTTAGATTAAGAATTACAGGT
TGTAATATCAATGTCTCTTTTGATTCAGGCATTGGATTCAAAAGTGTGTT
CCTGATATCGAGCCAGCCGCATATATTCAGCAATGGGTATGAAATCAAGT
TTGATGAGAAGCCTTGTGCAGAATGTAATATTGGATACATTGTCCCTCAG
TGGATTGAATCCAGAACTGTCCTTTCTGATATCAAAAAGATATATGGGTG
TTCCAAAAACCTTCCAGCAACCTGTATAGTCCTGCCTTTGAAGGATGAGA
AGGTTACTGCTGTGAAGCAGCAGCTATCAAGTTTGCATCCAGAGATGCTG
CTATTTCTATCAACTTTTGCCTCCACATATAGTACCCGCACTCTTCCTCC
TTCCCATTCTCTTGAGCTGATAAATGGAGTGTGTAAGACTCCGCATGCAT
GCTCTTCCTCATTTGGAAGTTCTTCTCACTCAGTATTGCAATTTCTCTGG
AGCATAACTAGAGCTAGTCAGCGGAATGATAGATTGTGTATTGCATCTGA
CATGAATTGGATGTCATGGCTTATTAGCTGGAACCGGGAGTTTCCATCTT
CTAACTGTCTGTTTGTGCATCCCAGTACACAGAAAGCTCTAGAAGGTTTC
TCGCAGAAGAAAAAAGTGACAGATTGGCTTCAGAACCATGCGAAAGTGCA
GATTGTATCTGTCTACAGTTACGGAAAGATTGTGGCTGCTAACTTGAACT
GTGAAAGGAGGCCTGTCATTGCTTTTTCTCACTTCCTATATCACTCATCC
AATAATAATTACATGGAGAGCTGCTACTTAACCGATTTGTGTCGTAACAT
GCCGGTAATTGACAACTATGGCAATGTGGTCACGAAAAGAGAAAGCATTT
TAGTTCCTGCAAAAGGTAGCAAATGGGTTGGACTGATAGGCACAAACCCA
TGGAGGAATGAGAAATATGTTGAGCTGTCGGCAGATTACAAGTCAGCAGG
CTATTTTGCAGGGAACTCCACACCTGAAGACCAGGTCTTGGAATTTCTCA
AGAAAAATGTGGGGGCCTCGGATGTGCCCTTCATTTTTTCGAAATGGGAC
CAGAGCCCCGGCCTCTGCATCAATAGATGCACACAGCCTTTTTATTACGT
AGTTCACAAATATCAACGTATTACAATCATGGATCAGCCAAAGTTGAGAC
AAAGATCAACCATCTAAAAATGAGAAGCAACAAATAGCTAGCCATTTTGA
ATTCTACTAGTGTGCCGCCTGTGCAACCGTAAGGAGCTGGTTGCATCCAA
AAACCATGGGCTCCCACTGATCCACCGGGGTAAGGTAGGACCATAGATTG
ATCCAGTGCGCCACCATACGGAAGACCTGCAAGAAATTTGTACCAGTTTG
TTTGTTAAAAATAATATTATTTCGGCATTTCCAAATAGCCCAACATAAAG
CTGAAACACCAATGCGTATTCTAGCTTTAGTAATCTTATCGGTCCCATTT
AGCCAATTCCCAAACATATTGGTAATATTGGTAGGTGGCGTAATATTATA
AGTACAGAAAATAATACGCCAAACAATTTTTGCAAATGGACAAGATATAA
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CCTGACCAATTCCGTTTTGCTAAATTATCTTTTGTTAACAAAACCTTATT
ACTAAGGAACCACATAAATTTTTTAACCTTAAGTGGGATTTTAAGTTTCC
AAAGGTATTTACGCAAATATCTTGTGTGATCATTCATTAGATCCAAGTAC
ATAGATTTGACAGTAAATAAACCGGTGGAAGATAAATTCCAAACAAAACT
ATCAGGCTCATTTGTGAGCTGGACACTCATTAATCTCGCACACAAATGAA
GCCAATCATTCCACTTATTACCAGTCAGGGCCCGTCTAAAACCAATATTT
AGAGGGGCCTGACCTACAACATCAGCAAGGAGGACATGTTTCTTCCTTAC
AATGTTATATAAAGAGGAATATTGTTGAGCCAGAGAAGTGTCTCCAAGCC
ACACATCCTCCCAGAAGCGAATCGTCAAACCATCACCAATTTTAAACGAA
CCTCTAGCAATGAAGTCATTTTTTACCCGCATAAGGCCCTTCCAAAATGG
TGAATCAGTTGGCTTTTCTTCTACTTGCGCTAAAGTTTTGTTGTGTAGGT
ACTTGTTAGATAAAAGTTGCTGCCACATACCTTCTTCAGTAAGTATTTTG
AATAGCCATTTACTTAGTTGGCATTTATTTTTAATTTCTAACACCTCAAT
TTCCAGTCCACCTTGGTCCTTTGGGCGACAAATAATATTCCACTTTGAAA
GCCTATATTTCTTTTTAGATTCATGACTTTGCCAAAAAAATCTTGATCTA
AAAAAATCTAAACGCTTACGTACCCCAATAGGTACCTCAAGAAATGAAAG
CATGAACATAGGTAGGCTAGTGAGGACCGAGTTTATTAAGACCAAGCGGT
CACCATAAGAGAGTATGTTGCTTTGCCAACAGCCCAACTTGGTCATAAAT
CAACTCTCAATTGGATTCCAATCCGCACTATGCAATTTTCTATAATGGAT
GGGTACCCCAAGATACCTAAAAGGGAGAGAACCCGACTCGCAACCAAAGA
TTTGCTTGTACTGGTGTTCCATCTCTTTTGCTTTTCCAAAACAGAAAATC
TCGCTTTTGTGGAAGTTAATTTTCAACCCTGATAATTGCTCAAAAATATT
CAGGATCAACTTCATATTTACAGCTTTGTCTAGGTCATGTTCCATAAACA
AAATGGTATCGTCCACATATTGTAAAATAGAAACTCCCCCCTCCACCAAA
TGAGGTATAAGACTTCCTACCTGACCATCCTCCTTTGCTCTCTCAATCAG
AATTGCTAACATATCCACAACAATGTTAAAAAGCATAGGAGATAGTGGAT
CACCCTGCCGAAGGCCCTTGCTTTGAAAATAATGTCCAATGTCATCATTG
ACCCTTATGCCGACACTACCCCTTGCACAAAGTCTTTGATCCAATCACAA
AAGACTGAATCAAAACCTTTCATGCGTAGTACTTGTTGTAGAAAAGGCCA
TTTAACTTTATCATAAGCCTTTTCGAAATCAATTTTAAAAAGTACTCCCT
CAAGTTTTTTACGATGTAACTCGTGAATTGTTTCATGCAAGACAACCACA
CCTTCAAGAATGTGTCGTCCCGGCATGAATGCCGTTTGGGTCGGTTTAAT
CATCCTGTGAGCCAAGTCCGTTATACGATTAGTTGCTACTTTAGTAAAAA
ATTTAAAGCTCACATTAAGAAGACAAATTGGTCGGTACTGCTGGATTTGC
ACAACATTCTCCTTTTTAGGAAGTAGAGTGATCACCCCAAAGTTCAACTT
AAAAAGTGGTAACTCCCGCTGATGTAAATGGGTAAACAAAGCCATTAAAT
CAGCTTTGATAACTTTCCAAAAAGTCTGATAAAACTCAGCCGGGAAACCA
TCAGGTCCGGGTGCCTTGTTATGTTCCATCTGAGAAATAGCCTCAAATAT
CTCTCGTTCGGTAAAAGCAGTCGTAAGAAGATCATTTTCTTCTGAAGATA
ACTGAGGTATGTCCGCGACCTGATTCTCTATCAAAGAGAAACCGTTTTTA
TCCGGATCCCCAAATAGCTTTTTATAAAACTCAGTGATATATATTTTTAA
ATTGTTCTCACCCACAATGGTCCCTTCCTCTTGTTCAAGTTGGAATATTT
TTTTCTTCCTATGTTTTCCGTTTGCTATGAGATGAAAATACTTGGTGTTA
TTCCCACCTTCTTGAATGTGCTTTACCTTGGATCTTTGAGCCCATTTGGT
TTCCTCATCCCGCATAAGTGAAATAACACGTTCATTCGCTTTTCTTAGAT
TCTCTTTTTCAGTAGCACATAAAGGAATCGATTCAGCTTTGATATCTAAT
TCATCAATGATAGATACAAGTCTTTCTTTTTCTTTTTTATATTTGCCACT
TTGATTTTTTGCCCAACCCTTTAAGAAGCGACGTAAGCGTCTTATTTTAT
TTTGCCAAACTTGAATAGGAGTATCCCCCAACGATACACTATTCCATTCA
GCCACCACCATCTCATAAAAACCGTCCTGTCGCAACCAAGATAATTCAAA
AGAAAAACGGGCGTTGTTTCCAATGTGGGCCTGGTTGCCGGAATCAATAA
GCAACGGCGTGTGATCCGATCCAGATCTAGTCAGAGCCCTAACCGAAACT
AGAGGATATTTTTGCTCCCACTCAACACTAGCTAGAACACGATCTAACTT
CTCAAACGTTTGAGTTTCCCATCTATTAGCCCATGTGAACTGTCTGCCCG
AGAGAACAATTTCTCGGAGATCAAGACTCTCAATGATGGCATTAAAAACA
AAAGGCCATCTAGGGTTGTAGTTATTGTTATTCTTTTCATGACTATTCCG
AAGTATATTGAAATCTCCACCTAGTAGTAAAGGTAGAGATTCAGTCTCAC
AAAACCGAACTAATTCAGACAAGAATTCTGGTTTATGAGTGTCTTGCGCA
GCCCCATACACTGGCATAAAAACCCATTCAAGATATGGAGTTTTACACAA
AAATCTCCAGTCTCAACCTTTTTAACTTGAAGAGTTTCAGCATTGATACC
AACAAGAATTCCCCCTGACCTCCCATGCGGAGGTAAGCAAAACCAAATGA
AATTCTTACCAGCAGCTAGATGTCTTAAGAAAGGTACGGTAATTTGATCT
CCCCGTTTCTAACAAGGCAATAAAATCTAAGCGATGATCTATAATAGCAT
CTTGGACATACAAATGTTTTGCGGGCTCACGAAAGCTCTCGCTATTCCAT
GTCATACCTTTTAATCCTACCATCATGAGTATGTTTTTTTGAAGCGAACT
CTAGTGCTTCTACGCACATTATCTTTGTCATAAGATTTCCGTCGCCGCGT
ACGACGAATGGGTTCCTTTGGAATCACAAGTTCCGCATGTTCTTCCTCAT
AGCTATGTTCCTCGTCCATCAAATCATCACAAAGGTTTGAAACACGAGAA
ACAATCAAGCTATTTTTTTGACCCTCCCCTTGTTGATCTAAACTCACCTC
ACTTTTTTGAAGCATAGTAAGTGTATGTTGTGTTTCAGTATCTAGAATTA
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AATATACTAGCCTTATCAATTATTTCATCCTCAGAAAATTTAAGAACCGA
AAACTTTGTATTTAAATGCGTACCTTTGTTGTGCATATCATTGCGCCTTT
GGGCCAACGCCCTTGCTCTCGCCATCTGCGAGTCATCGACATTGCCTTGA
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TGGATACGGAATTTGAGGTCAGGGAGTGTACCATTACCGGCTAGTTTCTT
GGCTTGTGTAAAACAGGGAAGTTGGCTGAGGACATCAGTTGGGTACAAGC
CACCGACCGAATCATTTATGTCCTGTTCTGAGTGGGGTAATCTGTTGCAA
AATGGATCTTCCTTTGTTGATATACCTACGATTGATCAACAATTCTATCA
AAACAAAATGCGTACGTACAAGGAGGAACTTAAGGTTATCGGGGTAAGAT
TTGAGTTCGGGGAGGCGTCGACTTATATTGGCAATCACCTCATGTCAATG
GCTGCAAGCAGTATGCTGACCAGAGAGAATGTATACGAACTGCTTCGTCT
GATTCGATTTCTTCAAGAGAAGGTATTGTCGCCAAGTAAACTGATCGACA
GTGTGAAAGATGGTCGATGGATGAAGAGTACTCTAGGCTACATGAGTCCT
ACTCGTTGTATTATCTATGATTCAGACTGGGCAGTGGCATCTTGTATCAG
TGACCAACCATTCCTTGATGTAGAATTCTATGGCAAGGCCATTCTTAACT
ACAAACAAGAGCTGAAGTTGCTTGGTGTTTTGGTTGGGTTTGAAAACAAT
GAAAAGAACTATAAGCGTATAATTGACAACTTCAAGTTCAATTCTGCATC
TATTACTTCTGATGCCACTGTACTAATCCTCAAGTGTATCCGGTATGCTA
GCCCATGTGATGGTTTCTTGAGGAAGCTCAAAGATTTGAAATGGTTGAAG
ACCAATGTGGGATTCCGTGCACCCAAGGAATCTTTTATGCTGGATCCGGA
ATGGGAGTGTCTTTTAATGGTATTGGATGGAATTCCTGTAGTTGATTCTA
GATTTTATGGGAGTAAGATCAGCCCATACAAAGAAGAGTTGAAGAAGACA
GGTCTGATCACAAGTTTTGACGAGGCATCCAAGGCTATAGCAAATATTTT
CAAGAAGATGGTCGTTGAATCATCGCTTACAAAGACGACTGTCCTGGATC
TGCTAAAATGTTATCGGCAGCTGAGAACACATAAACAAATTCCTGTTGAG
ATTTTCAGTTGCATGCGGAGTGAGAAATGGCTCTGCACATCGCTGGGATT
CAGGTCTCCCTCAGAGGCAATCTTATTCGATGAGGATTGGCAGTTTCTGT
CACCAGTAGCAAAGTTACCTTTCATCAATGATGGTGACTCTCATGATGGT
TTAAGCAAAGAGATGCATGGTTACAAAGAGGAGCTGAAGGAGTTAGGTGT
TACCACAGAAGTGAAAGCTCATGGTGCTAGGTTTGTCATCAATGGTCTTG
ACATTCCTGAAGACCCTGCAGACATCTCTGCAGCTACTGTCTTGTCGTTG
CTTGGGTCCATCCGGAGCTGGTTGGCTTGCACAACTGAACTCCGCAAGGT
CTTTATGGAGAAAATCAGTAGCTGCGAGTGGTTGAGGACAACACTAGGGT
ACCGATCCCCTAAGGAGTGCATACTCTTTGATCCAAAGCAGTCTTCCATC
CACATAAATGATGGCCCTTTCATCGATGAATCTTTCTACGGCTCAGAGAT
AGCCTCGTTCAAGGATGCCCTTGCGGCAATTGGAGTAACCGTGGATGTTA
GATGTGGAGGTGACCTTGTTGCTCAGTATCTGAGGAACCACAAAGAAACT
ACTACTATTGCCCGAATCTACATGTACCTTAAGGAGTGCAACTGGAATCC
TGCAGACAGAAAGTGTGATTGGATTTGGAAACCAAATGAAGGGGAAAGTG
GAGAATGGGTGAACCCGCCAAGCTGTGTTCTACGTGATCCGAACAAACTT
TTCAGTTTGCAGCTGCATGTCCTGGAGAAATACTATGACAGGGAGATTCT
TATCTTCTTTTCATCTGTTTTTGGTGTGAGGCATGGCCCTGATGCTGAAG
ACCATTGCAAACTATGGACCACATGGGAGAGCTCGGGTAGTGAGCTATCT
GTAGCTGATTGCTCTGCTTTCTGGCAATTCATTGCAAAGAACTGGAGTAA
GATCACGGAGAAGCTTCTATCTGATTGTGTGAAGGTTCCAGTTTGTACTG
ATGGGAAGATCATTTTATGGCAGAAGGGGGATGTGTTCATTCCTGATGAT
CTACTGCTCAAGGATTTGTTTAACAAGCTTCCTCAGCAATCAATTTTTGT
CTGGTATCCTTCTTCGAACCTTTCTGTCTCTCGAGCAAGGCTTAACAACA
TCTATGGTAGTATTGGTGTTCAGGCAATATCCAAAGCTGCCAAGAAGAAT
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GGTGATCCGTGCTGGTTTGCTCCGGACTGTTCTCTCATTCCTTGCTGACC
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GTGAATGTGAGTGTCCTAGAGACTCAGAAGCCAATCACAGTCGGATACTG
TGTGAAGTTGTCTACTGGAAAAGCTGTGGATGTGAAGACCAATAGAATGA
TCAGGTGGGAGAGGGAGAACTCGAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.