Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE048867

[Submit comment/correction]

Sequence	AE048867
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE048867
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTCGCACACACTTTGCTCCTCTGCTCATGGCCGCTCGTTTCCCCGCCTCG CCGCGTGTCCTCCTCCCCTCCTCCTCTCCAAGACCCCACCGAGAAATTCC GAACTTCAACTCCACAGCACGCCAGCCCGTCTCGCTCTCCCTCCCCGCCT AGCTCGCTTCCAAGCTGAGCGATGGCGTCCTCCTCCGCGCTCCAGCACGA GCGCTGCTGCCTCCTCGCCGCGCCCCGCCGCCGCCGCCAGGCGCACCACC TCCTCCGCATGCTCCCGCCGCGCGCGCCGCCTGCTTTGAGCTTCCTCTCG CGCCGGCGCTTCCGCCGCGGGGCAGCGAGGTTCTCCTCCGGGGACGGCGG GGGCGGGGCCGGGTCTGCGGGCGCCGTGGAGAAGCGCTCGGTTCCGATTC CGGTTCCGGAGGGGGCAGAGGAGTTGGGGGGAGGGGATGGGGGTGAGGAG GAGGAGGGGAAGCTGGAGCTGACGTGGCCCCCGTGGGAGGGGCTGCCCGA GCGGTACAGGCTCATGGGCGCAACCTCCCTCGCATTCGTCATCTGCAACA TGGACAAGGTGCGCCTCTCTCGTCGACAGACTTAACCGCTATCTATGCTC CATCGCTGCCTCCGTAGTTCTCCTCGATCTGCGCGAAGATGACAAAAACG GAGAAGCGGCGGGGTTTGAAATTGGAGTACCGCTTGGGTTCTGAAGAGCT GTGCGGTTCGGTTTACAGTTTGGCCAATCGCGAAATGGTGCAGCCAACTT GAAATGGCTTTTACTGGTTATTGCTTGGCATAATTAGTAGAAATGGAGTG CATGCGTGGCATTGGGTGAATGTTGTACTGATAGTAGAGCAAGTGAGTAG TCTTACCACTGTGAATCCGTGATGCTACATGGGTTTAGGTACTAGGAGGA AATGGTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTGGCATATACACATAGATAGAGATCA TAATGTGAGAAACTTCAGATCAGGGCTACTCGTTGGAATCGTCCTCTTGC GACGTTGCTTTATGCAAATGCCATCTCAAACATGATGTTACATTTAGCGA ACACCTGTTCTGGCATTCGTTTGCATCAGTGGACCAAGTTATGAATGTTT GCTGTCAAAAAAGGTCTCACCAGCTAGACAGCTTGAAGTCGTTAATGCAG TTTTGATACACACAAATTCACATACTGCAGCTATTTACTTCTAGGTGGCA GCTTATGTGGATTTTATGATATCTCATCAGGACTTTCTACTAAATGCAAA TACTGTGGTTTTTTCAGGTTAACTTGAGTGTTGCGATTATCCCAATGTCG CATCAGTATGGTTGGAACTCATCGACTGCTGGCTTAGTTCAGTCGTCATT CTTCTGGGGCTATGCTTTGAGTCAACTACCTGGGGGCTGGCTGGCGAAAT TGATTGGTGGAAGGTTTGTTTGGGGTAACCAAAACTCCTTTACTTGTTTT GATACAGCTAAAGAAGTTACGTTTAGTCTCGCATCCATAAATACTTTTTT TTTTCCAAATTATGGATATGGTTATTCTCGGCGGTTGCTGGCCTTGCTTA AATGATAGTTATCTCTTCCTCTCCTGTGCATATTGTTAGCATGTCTAACT TAAAGTATCCATTCATATCATGGAAAATTGAGTATTGTAGGTAGGAGTAG AAAAGCAAAAGAGCATTATGAACTGTGTTGTGCTAAATGCTAGAATGTGA TTTGTGACTTGTATGTACATCTTCTTCACCTCTTTGGGGGTTGCAGATTG CTTATTTTGTCACTGTAATTAAAATGTTCAGTTAATCTATTAGCAACAAA AATTCAAAGGAAACACCCAATAGTAGATTGATTCAAAGATAATTTCGAAC TCTCGGACCTTCGGCGTCTCTTTCATAATTGACAGGAGTATCTTATTTTG CTAGTACTATGCATATTCTTCATTTATCCATTATTATATTCCATTGCTAA ATGGTGTTGTCTCATTTCTAATTGTAGGACAGTGCTTAAGGTTGGCGTTC TCGCGTGGTCTTTGTCCACTGCTGTTATTCCTGCTGTAGCAGGATTTATG CCAGGACTTGTGCTATCAAGAATTCTGGTAATGCGTCTACTCACTAATTA GTATCGATACTTGTTCAGAGATTATGTGTTACATTTTTCTGATTTCATGT TTGTCTTAAGAACACATATCCTTATAAAAGCATGCCTTGATCCAAGAGTG TTGGTTGTCATTTGGGTTAAGACTTGTATTTTGAGCAGCACTGCAATTAG CATAGATGTGTCCTGTATGGAAACATTTTGTTAACATTACTTTTTTGTGA ATGATTGTTTAATAACATTAGGATTGCTATATTATTTAGATATGCACATT TCATGGTGGCAGATGTACCATATTGAAAACGTTGCTATGGTGTAAATATA AATGCCCCCTTTACCCCAGCAAATAAAGCACCCCATAATTATTGCAGTTC CTATATGTCAGCCTCGGTTTTGGAGCATTCATGTGTGATGGCAACATCTT GTTTATTATCACATATTTGTGTCGGTACAATAGGAGCGTTCCTTGTGATG CTTTACTGTATTTATTTCTTTTTAACTGTGTTGCTATGGTAGGTAGGTAT TGGAGAAGGTGTCTCACCATCAGCCGCTACAGATTTAATTGCAAGGTAAG ACCAAATATACCTTTTCTTTAGAAGCAGCTCTACTGTTTTCATCTACTTA ATGCTAATTTGGTTCTCATGTGGATATATATTTTTCTAGATAATAATGGT GAATGTTGTGGTTATGCACTGTACCAAAAAAATTATTGGGATTGTTTTTG TAACGACTATTTTAGTGTTCAGATAGATTCTTCTGTAGCTCTATGTGCAG AGTTAGGGGTTGGTGGCTATATTCTCCAAATAATTTTATTAAATGTATAA AAAGATTGATTTACATTTCTTATGTAATTGTTATGACGTGCCATTTATTC ACAACTCTTTCAATGGTTCCATTGACATTGGCATGGATATAGTTTAACTT CTCTCTTGAGATATTTATCAAATAAACAGAACCAGGGACAGAGCAGCGGG GAGCTTGTTGGGACCACCCTATGCTGCAAAGTTTTGTGAAATCCCCTTTG TTAATATGTGGATTTGACCCCCAAATTTACCTATATGGCCCCCTCCAATT TATTTTATGTGCAGTTGGCCCCCCCTTGTGTCACATTCCTGGCTCCGTCC CTAGCAGAATATAGATAAAAGAAATTTGAGTAGCATGATTCTCATACACT ATTATTGGATATTTAACTGCTATAGCTGCACTTGCAGGACCATCCCAATT CAAGAAAGATCAAGAGCGGTTGCTGTTGTTTTTGGTGGTTTAAGCTTTGG AAGTGTCTTGGGGTATGTGTTTTCAGATATTTTTGTTGGTTAATATGTTT ATAATTGTGCAACTTTCAGATTCTTTCTGCTGATGGCCTGATGGCTATAT GCTGCTGCATGTAAATGTTGAACTCAAGAAATTGGATTCCCAACTATAGA AAGTTGCATATTTCGGAAATCCTGATAGCTATCGGACCTTAGTAGCCTGA TGTGATTTGTTTTCTCGTTTCTCAAACAACATAGTGTCACATTCTGTTTG TATGACATTTATTATGACTACACAACTTAATCCCTGGTCTACTGATAATA TTACAGTTATCTGTTCGCCCCTCCCATTATTCAGAACCTTGGATGGGAGT CCGTCTTTTACATATTTGGTCTTCTTGGAGTTATTTGGTAAGCAAACATT TCTACAAAGCTCATAACGGATTATTTGTTCTAGCTTAGCTTTATTTTCTG TTATATCTGCAGGTGTATAGGGTTTGAATCTATAAAAGAACTGCAGTCAA GTGACAATGAAGACACATTAAGTATGTACATCTATCTTTATTTTCAAAAC TCATCTATCTTTATGTGTCTCGACCACCATTATAGATATTCTCTGTACAA ATTCACATTTAGTGTTATTGTCTGTTTATGGAATAAAAATAACTGTAGCT TGCAGGTTTAGCTGAAGGAATTGTAATTTGTCCTTAATTCTATGATAATA GTATGTGATATTCATGTGTAGATACTTGGTTTCTTTCATAAGGAAACATT GCATATCTAGTGCAAATCATAGCTTAGTTCAGTTATTAAAAGTAACTTGA AAATTTCTCAAAAAAAGAGAGTGGAGCAAAAAGTTACCCATGTACTACTA TCGATTTTATCTTTAAATTTCCATTTGGATGAGTGGGTTTGTGTGTTGGA TGTGCTCTCGTTTTGCATTACTATCCTTTTTATCTAACAAAAACCTATTT TGAAGTTTGGATTTCAGTTATTCAGAAGATACTTGATTTTTTGTCAATTT CAAGTTAATTTGATGTACTAACCAATGCGTCTGCATGATTATTCCTAAGT GTGGTTTACAGTAGATGTATCCCTTTAAAACATTATTACATGTTGTGTCC AATATTCTTGGTATTGAGTATTCTTTGAGATAACTGTATCTACTGGCTAA ATAATTGAAAGTTATGACTTATAACCTTATGGTTAGAGATGCAAGTGGGT CACCATTAGGGTACCCTCTACCCTCTTCAGTTCAAAAAAATGAACTAACT TTTCTGATGATGTCATGGGAAAAGTTAGTTCAGTTTTTGAACTAAAGAGG GTAGAGGGTACCCTAATGGTGATCCACTTGCATCTATACTTACGGTATCT GTCCAAATTGGTACAAAATTTCAAACAACTGAATCACCCAAAAAAATCAT CTCGTTGCAGATCTTGAACAGACTTCTACTGGATCCAATGGCATTATCTC ATCACCCACGTCATTGAAATCATCAGGCACTTCATTGGAAGAGATGAAAG ACTCAATAAAGGTTGGCATGTCGCTTAATGTCTTGTTGGTACATTGGAGA TATGTTCAGGGATCAAGTTAAACTGTTTCCAAGCTGTGACATTGATGAAA AGCTTTCACAATAAAGACAGAACAACTAATATGATCTTTTTTTTGTTGAG ATACACCAATCAGACTGGCAAGTATCTCTAATGATCTGGGAAACTTTTCA GTCCATTAACAAGAAAAGTGTTGGTTGCTAGAGTGTTTCAAATCAAGTCT TATGTGAACTGTTTAGTACTGTAAAACTGTCGAGAGACTTCTCTTGGTTA GATTCCGTGCAACACAATCTGAACTAACACTGGTGTACATTTTGTGCTAC TCCTCCGTCTCAAAGTAAGTGACATAGTTTTGGCTAGATACACATGTATC TATACACTAAAACACGTCTAGATTCATTCGTATTTGGGCAAAGCTGCGTC AGTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACTATTAATCGCTTGGTTTACCTAGCA TTCTTAATTACTCCATCTGTTCCATAATTCTTGTCTCTGGTTGTAGTTCA ACCACAGACAAGAATTATGGAACGGAGGGAGTAGTTTATGGTATGTCCCG GCTAGTAGTGTTCTGCTAGACTGCTAGTACCATTGTGCAGTGACTGTCAT CTATCACCTGGGACTGCATACTACATGCCGATGTAGACTTCAGTAGGGCT GCAGATGTATGTCCAGTGTACTTGTCTGCTATCATTTTGTGGAAGTGATA ACCTGATAACCGATTTTTTACCAGCTGTTTCTTTCAGATAAGGATTTCCT TTACCTGTATCACATGGTCAGCTTGGTGTAACTGTAGCAAGCAACTGTGT ATGTGTTAACATAGTTGATGGTATAAGTAAAGAGCTGAGTCTCTCTTTAT TGTCAGAGTCATATACAGTACATGCTGGCCTTTCCCTCACCAGGCAGCAG TTGAACACCAATGCTTTGACCTAATTCAACTAGCTGCGGATTTAGTTTGT ACTCCCTTGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCCTTTTTCTGATACATAT GTATCTAGTCATCTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTGCTCCGAACCT ACACAGTAGAAGGCGTCTAGATACATATGTTTCAGAAAAAGGCTAAAACA TCTTATATTTTGGAACGGAGGGAGTAACTCCCAGTAGGATCATGTGACCA TGTTGAGGGATTACATTATTATGTGTAAAAATCCTGGTAGTTGGTTTATT TTCACATGTTACTGATATAGCAAGTTCACCCTTTGTTTTGTAGGATGTTC CTTGGAGGGAATTTTTCAAAAGCAAGGCAGTGTGGGCCATGATATATGCT CACTTCTGTGGAAGCTGGGGACACTATACTTGCTTGTCTTGGCTCCCAAC ATTCTTTAGGTTTGGCACCTTGCATATTTGTCTTGTCATTTTTACTCAAA TGGGTCACTTTTAGATCTGTCACTATTTTGTTCTAATGAGTAGTTCAAAT GAGTTGGGCACGCCTATTCTTGAGCTATTCAATTGTTGGTGCTATGAAGT GCTTTATTTTTTTGTTCGAAGCGCTTTGGTCTTCATTGACAATCTTCTTC ACATTTTATATGAAAGACTTTCTTACATGTGCACACTTACTGCTAGTTCA TTTCAGCTTTTTGCAAAAAGATTGACTTCAATCAAGATAGGAGGACCAAC CAAAATTGGGTTTTGAAATTGTTTACATTTGAATTCCAAAACTTCTGCTC AAGTTGACATTTTGTTTGCGAGGGTGCTCATATTTTTTCAGTCTAGTAAA TGTTTGTAGGAATCTGAGTTTTTCTATTTCACATTATGTCAAATGTATAT AATAATTGCATTCCATGATTATGATATATTCCTGTTCAATCTTACACAGT GAGGAGCTAGACTTGAACTTGACAGAAGCTGCTTGGGTACGTGCATGCTT ACGTTTCTTAGAATTATAGGAACACACTTGTACTACCTTGTACTGAAACC CTGATATCCCTCCTCACTACGTGATCATCGATTGTCCTTGGTTTTTCATT TACGATTTATGCTCCGGTCTCATGTGTAGCTTATGAATTTCCATATTTAC TGTAGGTTTCAATTCTTCCTCCGTTAGGCTCAATGATCATTACATCTATT GCAGCACCTTTTGCAGACAACTTGATATCAACTGGAGTTGACACCACAAA GGTAAAATTACCTTGTAGATGGAAAAACAATTTGCTTAATTTAGTGATTC CGTACTGGAAGAATTGATTCTGTACCGGAGGTTCCTATATGGACCATCAT ACAGTTTGTTTCTAACGGTTGGAACATTTAAAAGTCATTACTGCCTTGTA ATGAGTGCACACAGATCTCTTTCACAATATCAACTTTCAGGTTGCATCTG TTGTAGGAAAATGAAGTCTAAGTTGTTTAATTTGTTTTGTAGGTACGAAA GATATGTCAAACAATTGCGTTTCTATCACCTGCAGCTTTTATGATGCTTT CCTCTGTGGATCTTGGACTGCCTCCCTGGGTAATCGTTGCTTTCCTTACA AGTGGGTTGGCGCTCTCCAGCTTCGCATTAGCAGGTCATGTTGTTAATCT TGCACTGATTTTCTAATTTTTACCGTATTTCAAAGGTCCAAATCTAAATT TTTTGATCCACAAACAGGCCTTTATTGCACCCATCAAGATATATCTCGGG AATATGCAAGCATTCTCCTGGTAAGGCATGAAACTTATATCTGTCTTCCT GAATTTTTTTTTCATTTATCTTCTACTGAAGAAACAGAAAAAGAAAAGAA AGTTCCTGTGCTTGAGTGCTTAAACGATGTTGGATACCACATAAGACCTG TTTGGATAGGGATACAGATGTGAACCCTCAGGATTTTGTTGAAACAAAAT CGTAAAACTTTGATGGAAATACCCCTCATCCAACGCAACCTAGTGTTTTT ATTTTGATAGTCCATATGCTTTCTCTATCGAGTTCGTTGAATTCATCAAA GAGTGGTTGCTGCCTTTCTGTTGCAGGGAATCACAAACACTGTAGGGGCT GTGCCTGGAATTGTTGGTGTTGCACTAACAGGCTATCTCGTCGACACAAC TCATTCTTGGAGTGTATGCTGGCTAATCCATCTATGTAGTCAACATTTTT CTATCATGTGAAATTATTCTAACTTGCATTAATATTCCTTCTATGTGCAG ATATCGCTCTTTGCGCCTTCAATCTTCTTTTACTTAACTGGTACTGTGGT CTGGTTAACATTTGCCAGCAGCGAGCCCCAGGATTTTAACAAGTCAGCAT CGGAGTCGTTAGCAGAAAGTAATCAGTAGTTAAGAAAGGATCATTCAGAG GGAGAGTTTGCCAGAGTTTAGTTCGTGCAGCCCAGCCAGCAAATTTATGG AGCTTCTGGGCGCTGGATTATTAGGGTTATCAGTTGCCATGAAGAGACTA CTAGGAAGATGTAGACTGTAAATGTACATGCCACGTGGGTATTTTCCGCC ATATATTGTAGAGATCTCTGTATAGGCCTTTTCTGTAGTGAAGGTGCCTG TCACTGGGTTCCTAAAGCTAAAAGCAGACTGCCAAGAATAAATAATCATT TCAGTTGCACACACAATGAATTATCTTAAGAAAAATTCAATAGCAAATGG TGCCTGACAGCACATATGTCACTCTTGCGACCACACCATAGTAGTAACAA GAATTAGATTGAATGCATGACTTGACACGGTATCACAACTCCAATAACAG AACACAGCAAAGTTAAAGACTACATGCACAAAGGGGGGCAAACACAAGAT AACATCAGAGTTTCAACGTTCTCCTACCCTATGAGACCCAACAACCGAAG CCACAAGCTACACAGGTCGGTACCAGACCTGCCCAATCATCATCTAAACA GCAGACAACTAACAGACCGAAGGGATCCACAGCAGGTGGACAGATCATTT CTTCTTCTTGGACGGCGGCTGGTCCTCGTCTTCCTCCTCCTCTTCATCCT CATCTTCGTCCTCCTCATCATCATCGTCATCTTCACCACCGTCTTCACCA TCATCATCATCGTCGTCATCGCTTCCACCTTCACCATTCGCCTCAGGGTC AGCTTCCTCCTCATCATCATCGTCATCCTCGCCCCCTTCTTCACCTGAGA AATCCTCACCAGCGTCATCATCATCAGCGTCAGCGTCACCGGTTTCATCA TCCTCATCTTCATCATCGTCATCATCGTCGTCATCTGACCCAGCGTCCTT GTTCTCAGGGACAGTTTCAGGCTTGCTTCTGCCAAATTGCCTTCAGATAT TGCAGTGCACAACCAGTCAGCAACGGAGAACAGTAAATTAGAGTCAAAGG CATGCAGAATAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.