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GrainGenes Sequence Report: AE048545

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Sequence
AE048545
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE048545
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTGAAGGCACTGAAAAGAATTGGAATCGCTGATGCCTTTTATCTCTTTA
TACTGTATTAGATTCCTCCACCCCGCCCCGAGCGGAGACACCTCGTGTCG
AGCTGCAAAAGAGCGGGAAGGAAGCCGAGAATCCCAAATCGCCGAAATGG
AGGGGCAGCCTGCCACCGCGGATTCCTCCGCCGCCAGTCCGACGAACTGG
AGGAAGGAGGTGGACGAGCGGCTTCGGCGGCTCCACTCCCTCCTCTTCGG
CGCTGAAGCCGCGCTCGAGCGCGGGGATGCCGCGGCGGCGCAGGCGCTCG
CGCTCCGCCTCCTGGGCTTCCTCGATTGCCAGACCCTCTCCACCGACGCG
GGTCCCGAAGCCGCCTTCTTCGCGCCCATCCGCGCCGCAGCCTCTTCCCT
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CCTACCCGGTGCAAACTCCCGGTTCTGCGTCTGATTCATTCAGTACGGTT
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ATGCACATCGTTGGAGAATGCAATGACTGATGATTAGTTTGCCGACCCAA
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ATTCACCTTCCAGCACCACGACCTGCTATCTGGAGATCCAGGAGTAAGGT
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CTAAACCCAGAGGGGAAGCTGCACATCCTTCAGAACTTCTTATCTGAAGC
CAGAGCCATCTAACCCAGTTGACTTGGGTTTGGTTTCCCAAGTCCACCAA
CTTCTTTTGACATGCAAAGGAGAAAATTGCCTTTTCTAAACCCGGAGGGC
AAATCATTCATTCGAACCCTGTCATTCCATTCATCTTTCCAAAATAGCAG
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GAGTTGACCAAGCAAATAAGAAATCCTCGATAGACACGACTTAAAATCAT
AATATCTTGCTGCCAGAAGAGCCATCAGAGGGTGCGTGGAATGGAACAAT
TTCGGGATTCTTTGATTACGGGGCAATTTCCTGAAGTAGAGAAAAGAAAC
TGATACATGTGCACATGGGAATCCAAACCTAACACTGTTTGATGAATGGA
TTTTCCCTTTGTATGAATATTTGAATTTTCTTTCTTTCAAGTACACGGGT
AATAAGGTTAATTCTCTTCTTTTCTATGATGAATATCTACGTCATACGTT
GGGCCCATTCCGATGGATCGCTGTTCTATTTTTTCTTATGAACCGGGAAT
TTCTTGTGAGCGTGCAATTAGTATCTTCCCTTCAAGTACGAGACAATGAC
ATTAATTTTCTTTTCTACAGTGAATCTCCATTGTTATAACTCAGGCCCAC
TCCGATGCATGTTCTAGATATTTTCCTTGTTTTTCCCTAATTAACATGGA
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AATAGTTTAAAATTCTACATGTGCCAAAAAAAATTTTGACCAAAATTGAT
GGGAGGTACTTAGTTGCGGGTGTGTTCTTCATAGCATTGTTCAAAGATTA
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GCGTCTCATTTCATTGAAAAGATAGAGTTGGGTTTACAAGCCTCCTAAGA
GGAAGAAATGAATGTATTTCAGTAGGCCTGTTATGTGGAGCAAAACTAGA
GGACGCAAGGAGTCTTTGCATGCTCTAGTTTTGCTCCACATAACAGGGCT
ACTGAAATGCATTTATTTCTTGTGCTTGTTATTATGTGTGAGAGAACACA
AAATACCAACCTGCCACCCTGAAGAATTGCCTGAGTGTTAATTCATTTTA
AGCTGAAGACTCGCAGACCGTTACATTGTATATATTACTTACAAAGATGG
ACATGTGCTGGATCATAGTTGTTCTTGTATCATCACCTTTTTTTTTCATA
TCCATGTGTCCATCAGTGAGGATAGAGGTGTTGGCGTATAGAGTGTTGCA
GACATTATAGAACACTGCTAAATTATATAAGATTCAAAAGTTAGCACCGA
TTGCAAGAGTTTACCAGGTTGTGGTCTCAGTAACATCATTTCAATAGATA
TAAGATAGGAAGTAGCAAACATTATCAGAGCCAGGAGTACAGTAATTTGA
GATTTTTTCTGTGCTGATTAAGATAAAATAATATTTTATCACTTTGAAAC
TATTAAGAAGTTTGTTGGGTTTATCGTGAATTGTGCATTTAACTATATTT
ACTATTTCTGCCATGCTTTCTTTGATAAAGTTCAAGTTTATACTCTGAGG
CATGCGCTCTTGAACGTATTTCTCAATTTGGTAATCCTTACTTTGGATTT
GTTTTGAACTCAGTGCAGTGTTTGAACTCGCAGCAAAAGATGTTTATTGT
GTTTTTACTAAGCAAGGAAACGTCAACATTGAAAAGATCAAGCGTTCAAA
GTATTTTCAAGTTCTTCATCAGAAATCCAGTCGAAATGCTGCTGATCAAC
TGGTACGATGTAGTTTATGTTAATCTTAAAGCGCTTCCGCTTCATTGACT
CTTCTCATTCTCTACCCTGTTTCACCCTTTTTGGGGGGGGGGGGTCCCCC
TTTTTGCTTAACTTGGTTATATGGGTTATATGTATAAGTTTTCTGAAGGT
CATTTACCTATTTTGGAATGTATTACCTTGACTTAAATCATTACTTCAAA
AGTCTATATACGCGTTTATTATTTGCAAATACTGGGGTTTGCCTGCTAAC
TTATCTTGCCATTTTCTCCTTGGCATGCATTGAAATTCAGAAGAGCGCAG
CTTGCCAAGAGTTCACAATTCAAGGGGGGTCACATATTGAGGAAAACCCA
GCTGACCTAGAAAACGAGAAACTTAGCATCAGGGCTTCAAAATTAATGAC
ACAGACAAAAATAACATCTTTGTACAGCAGCAAGTTCTTGAAGGCAAATA
GCGTGTCAGACAAGAATATGTTCAAATCAGAGGGGAACATGTCTAAAGAG
TTTGCTTGTGTTGAAAATGAGATCAGAACAAGTCAAGATAATAAGCATCA
TGTTTATCTGGGGGTTGAAGACGATGAGAAACACTGTGGGTCATTGCAGA
TTACAAAACGAAAGCATACAGGGTTCAGAAGTCCAATATGTGAACATGCA
AATTTTCCATCAAGCAACGATGAAGCTGATGCTCCTGCAAATGGGTTTGT
GACTGCCAGGACAAAGTTGGTATGTGCACTTGTCAAATTCTGTACTTCTT
AGCTGTACTGCCAACATTGGTTCAATTTTTTCAATTCCCTGTTTGATAAA
CATTTTAGACGAATTTTTAATGTTTTTCCAAGAGAAATGCACAGATCATA
AATCACCTAAAGTTTATAAAAGGTAGGTGCAGATTTTGTTAACTAATCCT
CTTACTGACCACTGCTACTAGTATTTGCTACAAACGCCTGAATGACCTGG
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GTTCTCCCCACATACGCTGACACTACTGCCGTGATGCTAGATGCTCTTGC
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GCCAGAAAATACTTTTATCCTATTATTAAATCCATGCATTGCAAGGGTAG
TTATAGGCTTACACTCACTTCTATCGAAGTTCAACATATTTGTACTTGTT
GCAACCTTGTTCAGTGGATACCTTTGGCTTTGTAGGCGATGGATGCTGTG
CAAAAACATGGGCATAATGGTCACCAAGGTGCTTCTGTATCTCCACAATG
TGATAACAACCTTAGTACACGAAGTTATGGTGCGAGGCCAAGCTGGAATT
CTCGCCGTGGACCACGTGGTAATTTTGTCCCTCCTATCCGAAACAACGGA
GGATCCGCTACAATCAACTCACGAATTACTGGGAAGAATGATGATTCCAT
GGAAGATTCAACAAAAAAATGGTCTGTAATTCAAACTTTTGTCTGGTACC
ATTTGAACTCATTTGATCACATGTGATAATTTAGTTTCTGTATATAAAGA
GTTTAGTGTTATGCACCCTCAGTTATAGATCTGCAACTTTCCTTAATATT
TAGCATATGCACATCTTACACCTCTTCATTTTTCTTGATGGGTTACACTA
TCGGCATTACTACAACAAATTTGTTATGTTGTTTTGAATAGCTTTGCAAT
TAGAACCTAGTTACAATTACATCGATCCAGCACATTGAAGGTCAAGGTAA
ATTATTGTATGCTAATATCATCGTTCCCTTAACAAGTTCAGAAGAGGTTG
ACAATTTGATCAGGTGGGCCCAGTAACATTGAGATGTACGAAGAACCAGT
GCCGGATCTAGGATTTTTCGCTAGGGTGGGGCAACTAGACAGTTTTTTTT
CCAATATCACAAATATAACATGATAATGTGCATGTATGGAATTTACTAGA
ATACTCAATTGAAAATAGATTCTCGAGGTCACACGTGCAGAATAAATTCA
ATATTATTTGAGTGAAGTAATAGTACTTACCTGCAACAATTTGCACTTCC
CTAGCAGCCGAGCTAGACTATGCAATATTATTGGCTACATGTTTCTAAAA
AGAGATGTAATGTCTCCATCACTCATCATGATTCAGTAGTTCTACAACAC
GAAGTTATGAATCAATTCACCAATTCTCTAAATAAAATGAATTAAATTCT
ATATTTATTGATCGCCGATGAATGATTCTGGGATCTAAAAGCTATTCAAG
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CCAAGCCTAGACTGCGTACACGACAGGGATTACCGACTGTGTGTTTGCGG
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CCTACAGCTCTGGCGCCCTTTCTACATGTGGTGTTGGCTGCCACCATGTT
CTTGCTGCCATCGCATGATGCCTTTGTTTTCCTGTTTCGTGGGGCTATGT
GATCCGATCGTGGGGCTATGTGCTAAGTTAATTTAAGTAAGTAAAAGGCA
AGCATCTGGAGTGCTGAACAATATCTAGTGAGTTTATGCACCATTTTAGC
TTCTGGTTTCTTGCTCGGTGATAAAAGTAGTATTTTGTCGAATACTTTGG
ATATCTTCAGATATCAACCATTTCCCTGTCAAGCAAAAAAGCGGTTGTCC
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ATTTCTTGCTACTAAGTGTATTCTGCATTAATATCTATGTTACCGAAATG
GATTTCACATGCATGAGTAGCCTTAAAAATATATGTGCATGGTATTGGTG
GTGCTTGCATACATACTTACTAGTATTTTTCACCACCATCAGTTTAGAAA
TGCTTTGTGGCCCTGATGGTGAGCTTCCTGAGAAGCTGAGGAATCTGGAG
CCTCGCCTTATTGAGCACATTAGCAATGAAATAATGGATAAAGATCCAAA
AGTTCACTGGGATGACATAGGTTGGTACACATTGCCTTTCAGTTCTTCGG
AATTTGTGTGTCTCTTGTGTAACTAATTCATGCCAATCTGCAATAGCTGG
TTTACATCATGCAAAGAAGTGTGTGACAGAGATGGTTATCTGGCCCCTAC
TACGTCCAGACATCTTTCGTGGTTGTCGGTCTCCTGGAAGAGGTCTACTA
CTATTTGGACCTCCTGTGGGTATTTTATCTCATCTGGCTCTGTTGTGCCT
AACTTTTTTTCTTAACGTTAATGTATGCATGCTTATTTCACAGGGAACTG
GCAAAACCATGATTGGAAAAGCAATAGCTGGTGAGGCCAAGGCAACATTC
TTCTACATATCTGCAAGTTCACTCACAAGCAAATGGGTATGTCTGGCAGT
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TATTCTGTTTGGGGCTGTGGAAGTTGGACAAGTGGGATAAGTGGGTTCTC
ATTTTTACATCTCTATACTAACTCTAGACTAAGTGGGACAGGTGGGATAA
GTCACAAGTGTGATTTGTGACTTATCCGTGACATATCCCACTTAATTTAG
AGTTAGTATAGAGATCTAAAATTGAGAACCCACTTGTCCCACTTCCACAT
CCTTAATTCTGTTATGCATATTTTTTACGTACTTATGAAATGTTTTTTCA
ATGTGCTAATTTATGTTTGTGGTAATAAGTTTGTCATTGTCCATTGTTCC
AAACATAATAATAAAGAACTGGAAGCAGGATTTTGTAAGTTGTGTGAACA
TGTTTCTAAACTTATCTGTTACTGTACTTTTTTTTGAGAACCCGCTCCTA
ACTTGATATGCAAATAATATTGTGTTAGGATGCAGCTTTTTTGTGTTCCT
CATTAAGTACAGATAGGTTGCATCAGATTTGTTATAGAATGAAAATGGCA
AATATACATATCTCTTCCAACGATTATTTCTGTTGGTATTGTTAGTTCAT
TGCCATGCTTACTCCACATTAACTTGACTTCATTGTGCATGCGAGTTGTA
CACTTCTGTGATGAATTGCTCAACTTAGCTGTTTTGGCATAGAATCTTGA
GAAGCCTTGGCACTCTTCAGCTCTATGGAGCATATAGTTACCAATTCTCC
ATGTTTTTTATTCACAATAGATCTGGATTAGGTTTATTCCAGTAATTGTT
TTCCTCTCAATATTTCCTCTTTTATGGTAAGTTAGATGATAATAACACTT
CCAGAATGGAGAGTGACTTATTTGGGCAATTTAATACGATTAGTACTTCC
TCCGTCCGAAAATAAGTGACTCAGGTTTGTCTAGATTCGCATGTATCTAC
AAACTAAAACATGTCTAGATACATCATACATGCGAATCTAACATATTATT
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CTGCTGGCTACTGCTGGTTTTGCTAGCCAGGAAATACATGGGATATTGGT
GTCTATTGTAGATTTACAATTCGTGATGAGAATAGAGACTGGCTTATTTG
TTTTTGTAACGTTGTATCCCGGGATATCTGTATCAAGGGTGAAACAACCT
TCTGTGATTATAGAAAGTATAGGAAGATTTTTGTGTTCGAAATTCTGAAT
GGAGATTCTATTTCTGTGTGTACGTGAATGTCTGTTTTGGGGAGTTTGAG
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ATTCGTTTGCTTTGGTGATATTGATTGTTAATTTTTCTTGCTGGTGCAAG
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AGGTATTGTTCAGTTTGTTGTTTTGGTTATGCCCATAGACGTTGCATGTT
TTGACACTTGACAACCTTAAGCATGATTGCAGCGCAAATCTGATGGTGAA
CATGAATCAAGTAGGAGGTTGAAAACACAGTTTCTAATCGAGATGGAAGG
TTTTGACAGTGGAAGCGAGCAAATTTTACTCATAGGTACCGCATGAATAA
ATAACTGAGTTTGCTATATTACATTACATTTCTGTCATTGTAGGACTAAA
AGTACCTTATGGGGTTGAAGCATCAAGAAAATCTACATTTTTTCTCTCCG
TAAACGCAAATTGCATATGCACATTTTATTATAGCTAAGCTTTGATGTTC
TACTACATAGCCTGTCAAGTGGCGTTGGATTTCATATCACGATTGATGTC
AGAGCTTACCACAACATTGGCACATTCCCCATCATATATCCCAATAAACA
GGCTAAAGCTCCTTCACGGGTTATGACTACCACTGCATGTTAGACTTGTG
TTCATTACATAGTTCTGCCTTTTGCTGCATGTATTTTTAAACTTTACAAT
ATACAATGTGGAACTTGGAGCATCAATGATCATGACTTGTAGCATATTAA
TATCGTGGCGTAAAAATGATGGCAGGAGCAACAAACAGACCTCAAGAATT
AGATGAAGCAGCACGCAGGCGACTTACAAAGCGTCTGTACATCCCCCTTC
CTTCATCAGGTAATGCTCTGTTTCCGTTCTATGGAATAGCTGAAGAAATC
TGACTATTTCATGGTTGTGAAGAAGCACGTACTTGGATAATTCGCAATCT
ACTGGAGAAGGATGGCCTTTTCAAGCTCTCAGAGGAAGAAACAGGTGCCA
TCTGCAAGTTAACAGAAGGTGCATGGAATCATCGAGCTTTCATCATGTTG
CTATTAACCTAGACCTTCATGCCATCCTACTAAGTTTTCCTGTTATAAAC
ATTTAAACCGTCTTGTTTCTTAATTCCAGGTTACTCAGGATCTGACATGA
AAAATCTTGTGAACGATGCTTCAATGGGGCCACTAAGAGAAGCTCTCCAA
CAGGGCGTTGAAATCACAAAACTCAAGAAGGAGGATATGCGACCGGTGAT
GCTCAAGGTACTAGTCAAATACGTACTCCCTCTGCCCCGAATTAGTTGTT
GCAGATTTTTCTAATTATGCATGTATCTAGACGCGTTTTAATGTATAGAT
ACATATGAATCTAGACATATCTGTGACAGCTAATTCCAGAGAGAGGGAGT
ATTAAATCCATAGTGGTTCACATGCAACTTAAGTGCATGCATGTCGGCAT
GCAAGATACAATATCTATGCATGTAGATTGGCAGTAGTAAGAGTTTTCGG
TATGTGCATAAAGTTTTCTAGTCTAGGAAAGGAAGTGATCCAGGCTGCAC
TAGCTGCAGTCAGTAATAGCAAGTATTATCTCTGTTCCAAAATATAAGAT
GTTTTGGTAGGCTATTCATGAACAGAGGCAGTAGAAGCAAAATCGAAATA
TGCCTTAGCTGTAATAGTACGTGTGCCAGGTTAGATAGTTCCACTATGTT
GGTAGCTAAAGCAGAGTCGTTCTGTGAGTATAAAAGGACACACAGTCCTC
TTTCTGTTGTAAGCTTGTACTGTATTACATTGAGAAGAATAAATATAGCT
TCATCTCTTGTGTGCACTTGTGTGTGAGACAAAAGAAACATATCAGCTAA
GCTAGGTGTGTGTTTGTACACGCGCGCATCACATCTCCTGGCGAGAGCTA
GTAGCTAGCTCGAACAAAAGGGTGTTCACTGATCATTCAAAAAGTACACC
ATTCTCCCAATTGATCAATTCCCAAGGTTTATTGCATAGAGGTAATTGAA
AAATGAGGAACGCTTTTCTAACATGGTTCTGTCTTATGAATCAGTCCCCT
AATTTTTTTTTGAATCATTCCCCAAATGATGTCTTGTAATTCTGAATGCT
TATTCGGATGGCAGGATTTTGAGGCTGCTCTGCAGGAGGTCAGACCTTCT
GTTTCAGCAAGCGAACTGGGGATTTATGAAGACTGGAACAAGCAGTTTGG
CAGCTTATCAATCTAATTTGCATAAAAGTATTCTTTAAAACTAAGTACTC
TCTCCGCCCTGAATTAGACTTCGCACATTTGTCAAGATATGCATGTACCA
GAGAGAGGGAGTAGATATGAATGTACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTACAAATAA
ACCCATCAGAGCAGACAAGTGGTTTAGTGATTCACCATGAATATTACAAC
AGAGAAGTGGTTCATTGATTAACAGACGATATTACACCGTCACATGTACT
TCCATGCACCTCTTAAGTATCAAGTGTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.