Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE047669

[Submit comment/correction]

Sequence	AE047669
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE047669
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCAGGCCCAGGCCCATCTTCGTATTATCCTCTTCTACCTCTACGGTCGCC TTCATTCATCCTCCTCGCCATCTCCCCCTCTCCCCGCTCCGCCCCGCTCC CTCCAAAACCCCAGCAGAATGGAGGGAAACGCGCTCGCCCTGTCGCACTT CCGCACGCGGGTCGGCTCGCCGCTCCTCCTCTCCGCGGACGCCAGCTCCG CCGCGCGCAAGAGCTCCGGTGCGTCACTCGCCTCCGCATTTTTCCATGGG GCTGCAGCGTGCAGGTTGCCGCAGCCTGCTTGCGTAGCTTGGGCTAATTA ATGGGGCCCGCCTGTTTCGCTGTTTTTTTTGGAAGGGAGGAGCAGGGCCT CGAGGTACGACACGGGAGCGCCTCCGAGCAGAGCAGGTACAGTTGGGGAG GAATCGATGCTACAGCCTAATCGTGCTGTTCGATTGGTCCGGAACTCCGC AGGTTTTGTTTATCTCACGAACCGCTCTGCAATTTCTCCTTTTCTGTAGG GAGGGGTCGGGTCTGGAAGCGTGATGATCCGGAGGATTCACCTCGCCGTG GAGGTACAGAATGCTACTAGGATGTTTTTTTTTTGTTTGCCATTCACCTG TGACACTGGTTACTACATATATATTCAGATTACTTTATATGTCCAGCAGA TTAGTAATATGACCAAGGCCTGACGTAATGCAGCTTTCTCACCTGTATTC CTACTCGACGTACACGTGCCAAATCTCTTCTTCCTTTTTTTGCTTTTGTA AAAACTCGTCAGCGAATTAATAAAAGATCGAACAAAGTAGTGAAGCCAGA GATGAGCCCATCAACAACGCGAATCCTCCCTAGTGCAATGCAATATCATC TCAATGCATCTCTACGTTTGTCTGATTGAGTGATGCAAACCTCCTATTCT ATGTAGGGATTACTGGAGTTCCAAAGCTTAATCCCAAAAGCTCTAATAAG GGAGCAGGTACATAGCACCGCTTGTAATACCATAGCTTGGTTCCTCAGTT TAACCAGTTTTCCGTCTTTTCATAGGGACTAATAAGGTTCCGGTTGTTAA TTTCGAGGTTTCTCATCACAGAGCAGGTAAACTGTTAATGTTATGATTTT ATTCATTTTGCTAATCGTATTTGGTTTACTTGTATGAATCTCTAGCGATG ATCTAATTTATGGGATCCTTTTATCCATTTCATAATGTTTGCGTTCTTGC CTCGTCGGAGCAGTTGCAGCGGTGAGGTTGCTAAGAGCTGAGAAGGGGAA GGCATTTGTTGATCTTTTAAATGAGACAGCAAACGATTCTGGGGAGAATG AGATGGGCTATGTAGAAAGGACGTTAGGGTTCAGTACACGGCATTTGGAC GACAGGGATATAAGACTGGTAAATTTTACATGTTGCACATATTGAAATGG TTCTTCTGTCTATGACTTCCAATTTCTTTAGGGCCGAACGCTATGTTCGG TTATTGCTGGGAAACGGGATGATGTGAGAAAAATTACTCTTCTGTTCAGT GGCATAATGATGTTATTTGTATTTGATGAGCATATAGCTAAGTAGCTGTC AGCTTTTTTTCTTGATTTTCTTTTATCACTACCTGTGATATAGGGTGTCA TGATGAACATATTATACCAATGGCTCTGTAACACTGTAACAATATAACAC ACCTAAGAGGCTAAGACGGCCTTATATATATGCCTGCGTTGGAATTCAAA ACTTCTGACTCTCTTATGCTTGGATTGTTAGGTTACCGGCATTGTAGCTG GAACTGTACGTTGGAAACGCTACATTGATTATCTTATCATGTCACTCTGT AGCGACGAGAAGGTGTTCAGCAAAATGGAACCACTGCTGCTTCAGGTTTC TCTTACATTTCATATATAGCATATAATCTCGTTGAATACCCATTATAAAA GTTAACTTGTGCTTGTAAAATACTTGAAGGTTAGCACTTCTGATTTCAGA TATTGCGAATTGGCTTCTTTGAAATTCTCAAACTTAACGTACCAGCTTAT GCTGTCGTCGATGAGGTATGTTGATAGTATTTAACACATACTGAAATTAA GTTACCCCTTTGCGTGGGTTTTGGTTGACCAAAATGTTAAATGTGGCAAC CGTGTCTCTTAATTGAAAAAGTGATCTCCTTCATGTTTAGTTATGTTCCA AAGAACAAGGAGATGTAATACGGAGCTAATAATGCACCTATTTTTCTGAT CATTCCATAACATATTTAAATGGCGTAGATGGCTATGTTTCTGTTCTCTG TGAGTTGTTTCTGTTCTCTGTGAGTTACTAGTATGTTAGATATAAATTAT TATGATAATAGACAGATGCTACACGCGAACCCCAAAGGATGTTGTGGTTT ATATTCATGTTTTAATTCCGAAGATTTACTTTGTGTACCGATCTTTTTTT TGGTGGTTTTCAAACTTGACGTGTCCTTTATTCGAGGTTAACAACTTGAC ATGTAGCATTACACCTTTGTTGTCAGTTCTACTAAAGTTTGTTACCAGAC AACTTATTTGCTTATCTTTGTTTTAAAAAATGGACCTGATATGTGTCCTT GCAAAACCAATTTTAGAATGTAAGACTTGCGAAAGTAGCTTTAAGGCCCG GTGCCGGGAACATGGTGAATGCAATTCTGCGCAAACTTCTATCGCTGAAG GTAAAACCTAGTTTACTCAGACTAGTCAATAGGGTTATGCTGTAAGCCTT TAACGTCATTATGTTGCTTTTATAATTAGGAGACAGCCTCTCTTCCTCTT CCAAAGGTAGAAGGTGACGACCGTGCCCAAGCTCGTGCACTATCCATAAT TTATTCTCATCCTGTTGTAAGTTTGCTTTACTTCCTAAACTTCAATTCTC ATCCTGTTGCAAGTTTGCTTTACTTCCTGAGTCTTAGTTGACTTCTGTTT CTTAGTTTTTAATGTCAAATTCTTCGTTCAAACAATTAATACACTTAGTG CAGCATCGATAGCATTCCACTTGAACTCATTCCTATTATTAACCAATGTC CTTGTTAACTGGGGTAATATACCTATAGGGAGTTCAGTGTACTTGCTACG TCTGGCGATTCTTAAGAGCATACTATATAAGATTGGTAGTAGATATGTTT TCTAAACTATAATGTGTTTTCGTCTCTACAGTGGATGGTGAGAAGATGGA TTCGGTTTCTTGGAAAAGAAGAAGCTCTAAAATTGATGAATTGGAATAAC AGTGACCCCTATTTCAGTCTAAGGTTTTAACTAAGCGAATGCTCTTCTGC GAAATGCAAATTACCTGCACTGTTTATGCATGTGTTCCTGGCTGACTCCT GACTGATCTTTGTGCTGTAGGGTGAACACAGCAAATGGCTATACAAGGGA TGATCTTGTTAACCGATTGGAAGATTTGCAGGTACTTCCGTTAACTTTTA GTACCTCAGTTTCATCCTATTCATTCGTAACGTTTGACTATACTGTCTTG GGAACCATGATCCATGAATGCGTATTCATGATAAAGACATGTTTGTTGTT TGAATATGACATTTACCATGTATTTGTTTGAGCATGTTGGCTCGGTCAGC AATTGCAGCAGGGGTAGTCTTCGTGGACTGAGATGACATAAGCAATGCCC ATTAACGTCAGAAGGACTCTGCCTTGATTATTTGCATTGAATTTCATCAC TCGATTTCCTTTTGTGTAGGTTCACTACGAAAAGTCAATTATGGACGAAT TTGTCCGCATTCGTGAGGGCATGCAGGTATGAGAGCTGAATAGCTCTGTG GCCACTGCTGAACTGGTGCTTGGCTGATACACTCTGCTCAGGATGGTTAG AAAATGACATTTCAAAGCCTACTAAATTGAACATGGACAATAAGATACCA AACTTAATTTCAGTCCAAGGAAGTGAGACGCTGAAAACTAGTAAAAATGA ACGTTAAGAAAATTAACCTGAAATACTGCATTTTGATACTATTAGCAAGA AAGGGAAGAACAATTCTATACTTTTCATGTCTTTAGATACTATTTTGATG CTATTACTGAGGAGCACTTTAACCCACCATGCATTTTATTTTAGACAATT TGGCTGTGTATCATACAAGTTCCTTTATATTCAAGAAGTAACATGTGCAG CATTTGTGGGTCCACCGTTTCCTCATTTTTCCTTTTATCCATAAGAAAAT CTAGTGAATTTTTCTAACTGCATTTGGTGTGCACTTTTTTTAATGCTTCT CGAGATACTTGCTGGTATCTTGATATCTTAATTTCTTCCATGCAGGCAGT CTTACAAGCTGGATTGCTGAAAGAAGGCATGTGTGCTGTGCAGGATGAGA GTGCAGGTAAAGTTATGAACGTTATTTGTTAACCATCAAGCATATCCTTT TATTTATCATAAATCATGAGATTGAAATGATTTTCACTACGACTGCACAT CGATGGCTGTCTTGTGCTTTACACTTCATTAAGTTAAACGTATACCTTTT CCTTATATGGTTCCAAGTCTTGTTAACAACAGAAAGCTTCATTGAACAAA GCTTTTGATTGCTTGTACTAAGATTTACGGAACCTATTGCAGGTTTTGTT GTGTCTGTGGTCGATCCACAACCCGGGGAATCAATCATGGATTGTTGTGC TGCACCTGGTGGGAAGACTTTGTTCATGGCATCCCGGCTGGCAGGACAAG GTAAGAGATTGGACTGAGGGGGTGTGAATATTGCAACTGGAGAACTGTAG GAGCTTCTTCTGCTAGTGACTTATCTTTTCCTTTCTGGCCATGCCACTAT CTTCTGTAATGTGTTATGTTAGCATGTTCTGATTCTTATAAAAACATGAG CACATGCTCGGATGAATCACCTTTCACATCTTATTCTTAATGGCCTGATT GGGGTGTCGGGCCATCGGCAGACACTTGCTTGTTATGACCTGGTAACGTG TGCCAGTGGCTGTTATGTCTAGCTTTATTTGTCAGATATAAATCAATGAA TGTAGTATATCCATGCCCTTTAAATGTAGCATCTGATGGCTATTTAATGT TTAAAGTGTTAGAAGTTCTTCATCGCCATTGAAAACTAGCATTTGTGAAG GCTTATATTCAACAATGACAAGCAAATAATGCTCACAGGTCCAAAATAGT TTAGTTTTACCAGATCTGATCTTGTTAACACAGTATGTCATTGATGTGGA GTGAGCTTCTAAGTCTGGAATACTATTGAACTTGACATGATGATGTACTC TGATACAGGGAAGATATGGGCTCTTGACATAAACAAAGGTCGCTTGAGAA TTCTCATGGAGGCAGCAAAGTGCCACAATCTTGATGATATAATCACTGAT GTCCATGGTGATCTTCGACTATATGCTGTAAGATTCCAAGACAGTTCATA GTTACTAATCCATGAAAAGGTTGGAAAAGCAATTGGAAGTCCTGTATTTC CAAGAATAATGCACCTCCACTGGAAATATTCGTCAGGATATGGCTAGTTC CAATGATATATCCAAACGTATGATAAGGAGGCTTACACGCATGTAGAATT ATATTGCAGAAGGAAAGCACTGCCAAGTATGACAAGGTTTTGTTGGATGC TCCATGTTCTGGGCTGGGTGTCCTTTCTAAGGTAGCTCTCTTAATTATGT TCAATTATTTCGAGAATTTCACCGTCACATAGCATTGTAATATACTGGAA TTTGGCACATTTTGTGATGAATTAAAGTCACCCTTTTCTGCTCCCAGAGG GCAGACTTGCGTTGGAATCGACAATTTGAAGATTTGGAGGAGTTGACATG TTTGCAAGATGAGCTCCTTGATTCAGCGTCATCGTGAGATTCTTTCTGTT TCAAGTTTAAACTTTGTAAAAAGCAAATTCATCTTGACAGCATCTGATTA CTTTCAATGACTTCACTTGCAGGCTGGTAAAACCGGGCGGTGTGCTAATC TACAGTACATGTTCCATTGATCATGAAGAAAATGAGAACAGGATTACTGC TTTTGTTCAGCGGCATCCGGTACTAGTTCATATTTAAACCAATCATTGAT CTTTCGCAAAAGATACAAAGTCAATGTTCAGTTGATCTAAGCAGTATGCC TGTCCTTACAATTCGAGGCCCTGTTGGTACCTTGCTACTATTAAGCATGT ATACATTGTTTCTCCCCAAGTATTATTAATTTAGTATCACCAAACTTCTG GACATCTTTTAGACATAGGATGAGCTGAATTTCAGTCCTTATCCAGCAAC TGGAAATTTTTGCTGTCATTCCCACTAAATGTTAGCTTACTAGTTCAGGT TTAACAATGATATATCTTTTCATGCACATTTAACTCCAAAATGTTTACAC ATTTAGCTTTTCTGTAGCACCCATTTTATCTGATTGAAAAGTCTGTATCA TGTACGCTATCTTGTCAGTTGGTTATGTTCACTATCCTTCAAATCAATAC ACAAACATGCAACCAAAAGAACCACAATGAAACTTTTTTATTCTTTTGTT ACAAAGTGATTATTGCAGTTTAACTCCCCAAAGTATATTCATTCTACTGT GATATCCTACAGGAGTTTACCCTGGAGGGTGTACATGGATATGTTCCTGC AGAATTTATCACAGATGAAGGTTTCTATTCCTCAAGTCCAACTAAGCACT CTCTGGATGGGGCATTTGCTGCTCGTCTTGTCCGGTCAATACACTAGGAC TCCTACAACTAGGTGAGAATATGATAAGCAGAACCAAAAAACCAAATATA TTTCCTAACATTTATATGAACTGAATTGCTCCTTCAAGATGTTTACCTGA CACATGCTTTAAAAATTCTCTTGCTTCTTACAGTCTCTTAGAGGAGGTAG TCTTCTGCGCTCTGCGGTCCGTATTGCTTCTTAGACTGCATGCAGTAGGT TGTATCATAGACAATAGTGCTGAGGCCGTCCTTATAGGTACACTCTATCA TTTTGATGTTGAGTCCACAGCAGGGACGGATGTAGGAATTTAACTTTGGG TGTTCAAATTTCAACCCACACAACATATACATGTGAAAGACTGAAAATTG TTCATGCATTCACGCCAATAAATGTAAAAATTGTCCATTGTGGCAACGAT ATCTTGAAAGGTTAAGAAACTTGATAATAATATATAGAATTAAAATGACA TTATCTTACATATGCAGTATCTGCTACTGGAAGCATATCTGGTTGACCTA GTGGGTATTGTGTTTATTTTTTTCCTGGTGTTTTTTGCTCCGTTGGCAAC GACAAACACTTCATGTTGTAATATGTATTCCGTATAAGGATGTTACTTTA GGACTTTTTTGTTCCTAGTGTATTTAGCCCTTGTTTACTTCTCTGGCATT CGCTAGGATATTTGCGGGGATTGAAGGGGATTATTTCAACTCCCGCGAAA TCCCTGCAGTCAGTTTACCAAGCGGGTTTCGCCAGGATAATCCCGGGATA ACCTGACAATTTCTCTTGCTTTTGTCTAGATTAAAAAGTCTCATCCATAG TAGAGTATTTTTTTAGGAAAAATATTTGCGGGTATCAGAGAGGATTGGAC GAACATCAAATCTCCTCTCATCCCCAAACCTCTAGGGGGTAAAAAAATAC TAGAGAATAAAAGGCCTTAAGGGGATGGGAGGGGATTATCCTACCATGGT TCGTAGGAGACAATCTATTATTTCTAGTGTATTTAAGGGGATAGTTCATT TAGTAAGCTAGATTCAGAGGGGATAATCCTGAGAGATCCCACAACCCCTC ACCAAACCACTTTTTTTTCAACACTAAAAACTATCCACCATACCAGTGTA TTGGATGGAAGATGATAGGAGGGGATTCGGTGATGTGTAGCTATATTTGT TTTGCTGTAATATACACCACAATCGGCTTCAAGAAAATGGCGTATACATT CTGGAAAAAGATCTATTTTGCATCTGAATAGTGAAGTATGATGTGATGAT CTATGTCTATAGGCACAGTTTCCCCCTTTAACGGCACGTTGGTAAATTTG AAAAAATGCTCTCTGTTGGGCTGCATGGATGATTAGATGTCGAAACCACA CCGAGCTCATTGCTATAATTACTCCCTCCGTTCAGAAATATAAGACGTTT TAGCTCTGTGAATCGAATGTATTTAGATGTCTTTTAGTGTATAGGTTCGC ACTAAAAAGTGTCTAGATACATTAATTTCATAAAACAAAAATATCTTATA TTTCTGAACGGAGTGAGTAGAAGGTTGAGCCCATACTGAACTAGAAAAAC GTACGAACAGGTGATAAGGATTATGACTAGTGACACCATACGTCTCTATA CTTTATGCATATGAAAAAGAATTGCAGAAAACTTTGGGTGTTCAGCTGAA CACCCATGACCACTTGTAGATCCGTCCATGGTCCACAGTAATGTGTTGCG AGCTAGGTGTACCCGGAGTTGTGCCTGCCAGATACCTGAGCGTGTATGTT CCTAGTTAGGCCCTAGTGAATATTACCTGATAAGGTATGTTTGTTATGTA TTATGTCTCTTGTGCAGTACCAAGTGATAATCTCAAGGTAGATGATCATA CACAGAAGTACGTCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.