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GrainGenes Sequence Report: AE047657

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Sequence
AE047657
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047657
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCCCGGCCCACTACCCAACCGCCGTGAAACTGTCGGAACCGGCGATGCT
CCGCCGGCGCCACCCCCTCCCCGCCCTCCTCCGCCTCTTCTCGACCTCCT
GCCGCCGCCGCTCCCCCCTCCCTTCGCAGCCGATTTCCCCGAATGCCGAC
ACCCTTCCGCCGCCGCCGCCTGTGGCGAAGAAAGTCCCCTTCACCGTGTC
GGCGCACGGGAGGTCCTGGAGCGACCCCTACCACTGGATGCGCCACACCT
CCGACCCCGACCTCACCGCCCTCCTCGCTGCCGAGAATTCCTACGCCGAT
GCCTTCGTATCCTCGGCTGGCGGCGGCGGCCTCCGCGCTCGCCTCGCGGC
GGAGATGCGCGCCCGGATGCCCCCTTCCGTTGCCTCCCCGCCTCAGCCCT
GGGGCCCTTGGTTCGTACTGCGGCATTTCTTTTGATCCCATACTGTCTTG
TTACCTAATCACTGTGTCTGCGAATTGTGAATCTGTGATGGTCTTAGGAC
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TTTACCATTTAACCAAATGCTTATGACTTCACACTTGTTCGTTGTTGTGC
TTGCCTTTTGCATCTCAGATAAGTGAGCTAATCCTTCTAGTGTAGCATTA
TGTTTTTTCTTGTGTCGCCTGGCCTTGCACGATTTAGTGTTAAATCGTTG
GTTCTGCCAGATGTAGTGCACTGCTTGTCAAATCTCATTGCCACGGACAT
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TATATTCTTCTGACTAGAAACATAGCTTCTACACTCTTATTCAGGGAACA
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GATACTGCACAACAAAATACAGTTGCCTTCGAATAGAACATAACTTGTTG
TTGATCCAGGTCATATTACCAGTATGTTCCAGGCGAAATGGAGTACCCAG
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CTGGTGTGTTCTACACATACGTGCATAAGATACTGATACGAGTTTCCACC
GTATAGTCTTATATAGTTTGATTATTATATTCCTGCAATTAATTTTGAGC
ATTGCTTTGTTGCGTCATATCATCAATTTCTCGTGACGAGGACATTTTAT
TTCCTTGTGCGTGAAAACTTATCAGTGGACCATTCTGTAACTTATGCAGG
TTATGTGCACATTGGGAGTTGCCGAATATCTCCTGATCATAGGTTTCTTG
CATATACTCTCGATACATCTGGGGGTGAATTATTTTCGCTGGAAGTGAAA
GATCTTCAGTCTAAGCGTGTCATTTTTAGTTCACCACACAAGGGAATAGT
CAGTTTAGCATGGTCTCACGACAGTGAAAATTTGTTCTATACTGTATGTG
ATGAGACTCTACGTCCGAATCAGTAATTCTCTTTCCTGCTAGTATTTGTT
AAGCTTATGATGCTTGTATTCTATTACTGCATTTGATACGTTTACATGTT
ATAGGGTTTTCTGTAAAAAGATGAAGTCAGATGAAGCAAGTTTTTTAGTT
TTTACGGAGAATGATGTAAACTGTTGCGTCGATATCACAAGCACAAAAGA
TTTCAAGTATATTACTCTCAATTCTAATACGAGGACATCATCTGAGGAAG
GTTTCTATTTCAACTTTTCTGGGTCCAATACCAAATATTTGCACGTTTAG
ATCAGTTATGCCTTTTTTCGGTTTGTTTTTTCTGATGTTTGCTTATGTTG
CTGCAGGTTTATGTGATGGAATCTGGTAATGTAAGAGAAGGCTTATGGCC
TGTACAGAAACGCACTAACAAAGTGCAGTACTTTTTGGAGCATCATAATG
GATTTTTCTACATTCTTACTAATGCCCCTCTGGAAGATATTGAAACCTCA
GCTGAAGGCTACTACCTGGCCAGGTGTAGAGCTGAAAAGTCACTGATGGA
TAGATGGCAGGTCTCAGCCTCCCTCAGAAATAAGATTTATCAGCAATGTT
TATCAATTTGTTAAAACAAAATATCTCCTTCATCAACATTGACTCCTTCC
TTATTAAGCCCTGATGACACATCTGTGCCCAAAATTTACATATAAGTAGT
ACATTGATGGCTAGTATGGATATTTCAATGTCGTGGACTGAAAGCAGTTC
TTTTCTTAATATACATTTAAACGTATTCTCATTAGAGCTCGTACTTTATA
AACTTGGTGCCTGTATTTCTATTGCTAGGTTGTGGCACTCCCTGGGTCGG
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GTACGAAAAGATGGGCTTCCTCTGTTTTGCTCCATTGATCTGCCAGTCAA
GGTTGACTTTCAGGTATATTGGTTGATTCATGTCATGTTATTAGTAGTAT
CTATAAATTATAACTCATAAAGATATAGTGTATCACAATGTCTTGGACCA
TAAAGCTTTAACGATTTAGATGACGAAAATACTACCCGGCATTGACTTTA
TCTGGACTGCTTTGACTTCTGCTGTACCTCCAGCTTGATATTTTTATGTT
GGCACCTGGTCATTCTCTTTGCTGTTTTGTATTATGGTCTACGTTGTTAC
TTGTGAATCCCGAGCCTTCCCCTGTATTGTGTTCTTTATACTGATGATAT
TTGCTTACCCCTCAGGAGCCAAAGGAACTTGGTGATCTCACTCCATGGTT
TTTCCCAGTACCTTCAAATTCATGCAGCATTCTTCCTGGACCCAACAATG
ATTACATGTCATCTACTTATCGCCTGGTGGTGTCATCGCCAGTGGTAAGC
ATTCCACCAACTTATCACTTATCTGTGGATGGATACTCATATCACGAGTT
CATATTGGCTTCAGCTCTTCTTTTCTTGATCTCCTAGATCTCATCAAACT
ATTTAAAATATAGCACCCAGGAATTTCTTTTTTCTACACACTAAAACCTG
TTCTATCCCTTGCCACTCATAAAGCTATACAATTCCATTAACTGTACTAT
TGATTATTGCATTGTACATTATTGTATTGAATTGTACATTATTGTTAAAG
AACATATAATTGAACAAAATATTCCATAATTTTAATCTGCTATTTATTAT
GTAAATTAAGCAACTGGAAGTACAGTGCAGCTGGTGTGTTGCTAGACATA
ATTTTTCCCCAGTGAACGTTTAATTTGCTTAATATAGATTCCAGACTTAA
CTGTGGACTATGACATGCGGAAGAAGACATTTACCATCCTTCATCAAGAG
GAAGTAACTGGCCTTTCTTCAAGTCTATGCACAGCAGGATTGCAATCCAA
TGTTTCGAGTATTCAACAAAATCTGCAACTTATTGAAGATACACAAAGTT
GGAGTGATCTTTCCAAGTTATTCTCTTGTGAGAGGGTCCAAGTTATTTCA
CATGATGGTGTCTCGATACCTTTGGTGATCTTGTACTCTCGGGAAGCACA
TATTCATGGAGAATCACCTGGGGTCTTATTTGGATATGGAGCTTACGGAG
AAGATCTGGATAAAAGCTGGTGTTCTGATAGGCTAAGTCTACTTGCTCGA
GGATGGGTTCTTGCATTTGCAGATGTTAGGTACAGTTTGACGCCTGCGCC
TTTTTTCAGCTTACAGAACTGCACTTCCCATCATCTTTCAGTATTTTCTT
ACTCATCTTATTGACTTGCTGCAACATATGAACTTGTGCCTTTTCATTTT
GTTAACTAGACTAGTTGAATGCCTGTGCTTTGCCACGGGTAATCATATTT
TATTTTTCACTGCACACGTAAACATAATGCACATAAAGTTAAGTGACAAC
CGGGACTCGCTCCTTTTGCTTTCTCCCATACTTAAGGAGGCGCACTTTCC
TTCTATCCACCGTCCACGAGGATGCATGCTCCTCTCTCTTCTCTCGTTGC
TCCGTTGGTGGTCGGAGGGTAGGGAAGCCGCAACTCTGATCCTTTGGCTC
GTCGTATAGATAGGTGTAGGATATGTGTTTTGGGCGATAGTGCTTGGTTG
GAGCCGGTGTCGTCGCCCCAATAAAGTTTTTCGGGCCACCGCTACAATAG
AGGCATCGAGGAGCCGCAGATTTTTATCTCTGACGCTCGTCCAAGATGAT
GAATGTAGGGCTTCTATGCAAGGTCTTCAAGGCGTCGGCAGAGATCTTGT
TGGGAAATTTTGTTTGTCGGCTCCAACTACGTCACGTCGGCGTATTCTCC
AACACTATGGGGAAGCCCCCCTGAGAAGGTGTACGAGAGTCGTAAGTCAA
GAGGCTATTAGGCTAGAGCTTGGGAGGTGGAAGGAGGTTGGCGGCACTAT
TATTCTTCGGCGAATCCGTTGCCTGGAGTGGACAACGTCGAGATCCAAGT
AGCGCGGGGATCTTCTCCGGTTGTCGTCCCATATCGGCAAGTGTGCTGCC
GCTCATGGCGGCACCTCTTCTCAGGCTCACAGCGCAGCTTGGCTGCTATG
ACGTTTCCTTGGTACTACCTTAGGTTAGAAGAAGTTATACCCATTATAAA
TTATGACAATAAATTAGTATTACCAAGGATACATACCCATAAAAAGTGAA
CAATTGTATATTAAAGGCTCCACCCTGGCCACTTTATTATGCCATTATTT
ACCATGCCCATGTCTTGGTGCCACAAACATGTTGCTTTTCTAAAGTTTGG
TGGATTTACAAAATATCATATGTTTTAAAGTTTACAAGGATGAGTGTCCA
TATATATAAAAACATGTGGGTGTAATCAGGTTCGTTAGAGCTAAGAGAAT
TCAAAGTCCACAACCATTAAAAATGACACACTCTTATAGCACAAATATCA
TTAGTAAAATTCTGGTTGTTTGAAGTTACTTAAACGAAATGCATGTCACT
TTACCTATCACGGGTTGGAAACAACAATTTTCAAAACAAAGACCTAAGAT
GTGGGATATTTTAACTGATAGAGCGAATTGGGTCTATGCGTTGAGACGTA
ACAATAAACATGAATGTACAAATTGCTCAAATATTTGGTTGGAATGAGCA
CAAGCTTGTGCTTTTATCTAGCTTCAGCCTATCCAACAATAATTGATTCA
TTATGCTCTTCTTCCTATGCTTGACAATGTTCTCTTCCTTGACAATGTCT
TCCTTCACATGCGTCTTGTTTATGCCATCTCTACACTATCCCTCTATGCA
TGTCATCAAGTTCCCTAACTTAAAAAGTCTGCTCAGAATGTGGCAGGATC
AAGAAATCACGGTGTCAAGAGAACAATCCTAATAATTGTGTGCACTAATT
TGTTGCCAATAACAACACATAAAGCTCGAATTCCACTTCCCGGAACACCA
TCTCAGCCGTTGCTTGTCATGGTCTGGCAAAAGAACTTGCTCCTATCATA
GTCTTGAGTGTATACAACATGAATAAGAAGAATGTCATTGTATCCACTTC
GACAGAATGTTCACCTAGGCAACACATTGAGCCCACACATGACGATCCTT
ATGAAGTGCAAGTACCCAAGTAAGCATTACAAGGATCAAATAGAATACCG
TTCTTAATTTTTTTTGCTATGTTGCAGGACCATACCCTTGTCCATGCAGA
TATTTCCCTATAGAAGTTAAGATCTTGCACTCCACGATGTAGCTTTGTTC
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AGACACATCGAATGAACGTAAATACATCGATTGGTATATAAATGAGCCAT
ATACCGAGGATTAGATAAAAAGAGAGAACAATCTAGCCTTATTTTCTTAA
TTGTAGGAGCCCGTGATTGATATAAGAAACTGAATAGTCTGACCAGCATT
AATCATTCACCAACTACCGTTAGTAATTCAACCCGGGATATCAAGTAATA
ATAAAGATCGCATTTCTAGCTCCAAAGAAACATAATAATCATGTTTTTCA
TGCATTTCACAAAATTATTCCCGACAAGATTAGACGGCTTAGCTTCTTCC
TTCTATAATTTGGATAGTAATGACATTAATTTTATAGACACAGTAGAGAT
ACAATTTCCATTCCTAAAAAGACAAACAACATATGAATTGGGACTTCAAT
AAAATAAAGAGTTATACATACATGACTCCCACAAGACGGCAAAATGACAC
GATAACATATGTTTCATGATTGAGGGTAAATAACTAATGGTTCTAAAAGA
TTATTTGATAATTAATGTGTTCTCTTATATAAGAACCGATCTGTTACCAT
GATTGTCGACATGAATATGGAAACTATAGGGCTCGAAAACCATTTACCTT
CAGAACACACATGCCAATTTCTTATAAACATGGAACAAAAACAATTGAAT
GTTCAACTTTGCTCCCCAAGAAATATGAACTACCAGTATTTTCGCCAAGC
AATATCAATGATTTTGTTCTAACTATGCATAAATCTCTATACTGTAATTT
CATACCTTCTGAAAAAATACTATAATTTCATATATGGAGGTTGTTCCTAT
CTACTACTAAGACATAAACAACATGTGATTACTGGCCAATGTCCCTGCCC
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TCGGATTTGTAAAAAAAAGTCAATCACAATGGTACCGTGCCACTATGACT
ATGCTGGATGAAGTGTAGTAGATGCAAATCAGCAAGAAATTTAAGGAAAA
TCTCTGTAATAATTAATTTTTTATCACCCAGACCATCAAACTTGTACTGA
ATTCTTGACTACATGAATATGTTTTTTTCAAGTAAATCGATTACGTACTA
CAATGAGATCACGGATGAAAACAGGAAGTACGAACTATAAAAGTTCTGGC
ACCCGAGGAGCTAAACATGCTTCGTGTCTAAAAATGCAAAATATTTCTAT
CTTCCCACATGCATCTACGTATGGAAAATTTATTGATTCAGTTGGTGAAG
GAGTTCTTGCATATGTAGAAAATAGGGCCACTCTATTAAGACCACGGCCA
TGTCCAGATAGCCCAAGACGGCTGCGTCCACCGGTGGACACAAACATGTC
GTCGAACAAAGGGGCACGATCGAGTTCGTGCTCGTGCTCGCTGCCGATCC
GCCGATCCTGTCACAGTTCGCCTTGCCATGGAAAGAAGGTGACTTGCCCA
ATGCGGTTCGACTCGCCGACGAACAGAGAGCCATGTCCAAGTCCAACGCG
GCTCGACTCGTAGACGAACAGAGGGCACAACCGCGTCCGGCACTGCTTGA
CTCACCATGGAACGACGTGTTCAACCATGTGGAAGTTCGGAGACCGGCGA
GGCCAAGAATACCCCATCCCCGGCCATTCCCCTCGGCATCATCACTGTGT
CCCCCTCTTCTAAAAAAATGAAGACCTTAAGAACCAGTTTACCCATCTAC
AAACATAACAAGACTGAGAAGGGAAGATGGATTACCTTCGTCGCTCTCGA
TCTCAAAGAAAAAAATCTTCAGCTAGTTCCTGGGCCACCCCATCGAAGTC
ATCTTGATCATCCTAGTCGATGGGTTCGTTCAGGTCCACGTTCGCCATGG
TTTGAGGAAGAACGACAGGAAGAATAAGATGAGAAGTGCAGCCATGGCGC
CAAGCTCTTATAGGACCTGGGAATTTAGGATTTTCAAACTATCATTGCCT
CCATCCACTTGTCTGATCTTGATCTGCACCATGAAAGTTGGGACTAATCC
ACGGCAAACAAATCTCCCAAGTGGATGATGAACGGGTTCCACTCTGATTG
GCCAACAAATTTTGATACAGACCTTCAACTCCATTGAAGGTGTGTGCGTA
CGTGAGAGAAAGAGGGGGCACGCTGGAGGATGGAGAGAGAGGGCGACGCC
GGGAGCGATAAACAAGGGAGTCCGGGCGAGTAATGGGAGGCAATTAAGGA
GGTTTTTTACTCCGTGCATGCAGCGGCAATATAGGAAGGTTTTAAGCTGC
CGATCGCCTCCTTAATTGCTGCGTTAGAAGATTTGCACCGTATCCTCAGG
AACGGTGGGAGTAGTGATTAGTGGAGATATAATTAATACGGACGGGATTA
GCGGGGAGGGGATTACGGGAGACAAAAAAACCGTGTGTGCGACGGGAGTT
GGACGAAAGATTGACGGAGTGGTAGTGGCAGAAAACGGAACCACCAAATT
CTTTTTAGATAGTAGAGATAGAGATTAGGTGGGAGGGTAAAATGGTCTTA
TTTGAAAAAGTGTTGACGAAACCAGCGACCGGAGGAAACAGAGGAAATTC
GTGCTTTTTAATGTTAATAATAATAACTAGATATTAAACTGACAACCAGA
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ATCTTATTCACCAAATCAAATATTCCGTATTAAGAACATTATCTTTATTT
CCATCCGAATGAAGCATTAGGTGCTCCGCTGCAAGCATATTGAGGTATTG
ATCTATCATCTTGTGAAAGGAATGCCTGATCTCCCTGTTCTGGAGTAGAG
CAGGTCTCCGATCTGGTGATCCCTATCACGGGGTAATCAACCAGAGTTCT
GAAAGCTAGCCATTAATAGTCCCCAAAGTATCAATTTTTTCATGAAGATT
TGGAGGTTATTTTTAGCTCACATGGCACAGCTTCAATGTGGTGTGAATGT
GTGATATACCAGCTGCCATTTCCTTAGCATGGTCCACAAGAAAGTTAAAA
ACAGGATAAGATAGTAATAAAGCGTCCTTTATCGGAAAAAAAACTAGGGG
TGCAAGTCTAGAGACAGTGTACTATCATGATTAAGTAAAAAATGACGTCT
GGATATAAATGCACTAGTCAACAAGCAACTAGTACAATGACAGCTTATAC
ATACAGTAGCAGATTACCTGTTTTGTTTTGAGTATTCCTAACTTAGCAAC
TTACCGATAACAATATACACATTTATTGTGCATATTCCTGTCATATAAAT
TAAATTTATCCCAGCAGCCAGTTTTGGAAGATTACATAGGTATTTTGGAA
TACTGCTACATATTTAGTTTACTCCAAAAGGTAGAGTGGACTAACCAGGG
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GTGAATAGTTGTTCTCAACTTTCCATTTATGAATGCAGCGCATTTTGTGA
TCTGGACTGCAAAATTCATGTTCCTGATTATTTGTAAGTCTAATCATGTA
GGGGCGGTGGGGACCCATCATGGCATCTGGCAGGGACCAAAACCAACAAA
ATAAATTCAATTCGAGATTTTACTGCATGCGGTATGCATCTTATGAAGGA
AGGTTTTGTACACGAAAATCGTCTTTGTGCAGTGGGGTGCAGTGCTGGTG
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GCTGGGATTTGCCATGCCTATTCTCTTCCCTTCCTACTATGCATGCTTGA
GCTTTTATACATCAATGACATGTATCTATGCTAATAACAGGTCCCTTTTC
TTGATATCTGCAATACAATGTTGGATTCTACTTTACCTCTCACCATCTTG
GACTACGAAGAATTTGGCGACCCTAATATCCCAGCTGAGTTTGATGCAAT
CCGCAGTTATTCTCCTTATGAAAACTTATCTCCTGGAATATGTTACCCTC
CAGTGCTGGTGACTGCCTCATTTAACGACACAAGGTTTTCTCTACTTCAT
TTTACTCTTGTGATGATTTACATACACTTCGGGTCATTTGTATTTGTCCC
ATGTTAAGTGTCAGCTGACGACGCTAGTCAATGTTTCTAGAAGTGTACTG
TTAGTTTTCATTTCTAGTTTTGAACTTCTCTTATTATTTGACAGGGTAGG
AGTCTGGGAAGCTGCTAAGTGGGTTTCAAAAGTGCGAGACGTCACATGCC
CATCCTGTTCGCAGTCTGTTGTTCTCAAAACTAATATGCAGAGTGGCCAT
TTTGGTGAGGGTGGACGCTTCATGAGCTGCGAGGAGACAGCCTTCGAGTA
TGCGTTTCTAATGAAGGCATTGGGGATGGATGACATAGGTGCAAAGTAAT
AATTAACTAATGCTTTTTGTGCTGCAAGAGTTGTTGTGACACATGGAAGC
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TCATTATAGGCTGAAAAGCCATTAAATTTTCGGGTTCCTGCATTGCACAG
TGGCAACTAGAGCCCTCAGGAACAGCACAGATGGATTCCCTCAAAAAAAA
AAAAAAGATGGGCGTTGTCCGTTAAGATGTTAATGTCAGTGATCTTCCGT
TCTCCATCAAAATTAAGGTCAGTAGCAAGGAGTCCATGTCATGGTAGCAG
TAGAACAAACCTTTGTAGAACAAACAGTTGAAACATGTCGTACCTAACAT
CAGCTATCAATGACTTGGCCATACAGAAATGTCCCGATACGAGTTGTTTC
GACGGGCACATGAATTCAAGTTGGCATATGGCTCTAGCCTGCCTGATGCA
TCATGCTTGTTGGGATGTCAAGACGGTGCTAGACACGGCACTGTTGATGA
ACAAATAAATGTCCCAGCATGGGTTTTGGTTTTGACATCTAACTGTACCA
GGTCAGTGTATACCGCTTCCAAATTTTTGGATCTTTTAACCGATCAGGTT
TTGACATCAACTGCATGTAACATTCATATATGTGTACGTACATTTTATGC
GTTTGACCGTGGCACTGCCAGTTTCCATGATTCGTACTCCCTCCGTTCCA
AAATATAAGACGTTTTAGCTTTATGAAGGGAGTGTATCTAGACTCTTTTT
AGTGTGTAGGTTCACTCTAAACCTAGATAAACCTATACACTAAAAAAAGG
TCTAGATACGCTCCCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGG
AGGAGTACTAACTGTTAGTGGTGACTTGTTAAAACGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.