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GrainGenes Sequence Report: AE047606

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Sequence
AE047606
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047606
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATCGCCAGTTCGGCACTCCACTCCACTCCCCTCCCTCCAGAGCCGCGAA
CCTTGGAGAGGCGCCTCATGACCCGGCGCTATAACTAGCCTCGATCCCGA
ATCAAACCCTTCCTGCTACCTCGCCCACCCCCATTTGGATGGATTCGGCG
GTCTCTACAAATCGCTCCCCGCTGCGCTCCGCCGCCGCCGCCGCACGCCG
AAGCAGCTCGGGCCGCTCCGCGCTCCCGAACCGGTCAGTTTTTCTCCTTC
CGTTCGTTTCGCCTCGCTGCATTGTATCGATCCGTGCCGTTCGGCCGCGC
TGAATGGTGTACGTGTTCGCCGGGATTCCTGTGCAGTGTGGTCGCGACTA
GGTCTGGGTGCGGAGGAGCGCAGTTTGGAAAGGCGAGTGTCTTTGTTTTC
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TGTTCTAAAGAAGTTAAGTGTTTGCTAGATTAATGAACTCCTCTTTTCCT
CATAGGTGAGCCCATGTGGTTCTGGGCTTCTGGTTGCTTTGAAAGCTTAC
TCTTCCAACCCTGATAACTCTCACTGCTTCCATTCCCACTGTCTTTGTAG
CAGCATTAAGATGTAATGATATTTTTTTAAGCAGCACTGTAATGTATCAA
AACATTTTGCAAAGTGAATGCACAAGCCAATGTTTATTTGTTCCTCCGTT
TCCCCATTTTGTTAGTCAGGCCCCGTTCGGTCAATGGGTTTGAGAAACAA
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CATGTGGGATTAAAAAATGGACGGGCGTTCGGTCCACGGGAAACTTTGCT
GCCAAGGTTTCTGAGTGGATGTTCTTTTTCCTCTGAAAAGTACGGGATAG
GAAGACTTTCCAAGGGAACAGCTCGAGTGCATTCCTTTGAATCGAACGGC
CCTACAGGAAAACTTTCCAAAGGAAACTATACCGGTGAAATTCCTTCAGA
ATTCCCGTGAACCGAACGGGCCCTTAGTCTAGGGCGTTGGCCTGGTTGAA
AAGAGCAGCATAGTACTTCAGCTTGTCATCTTACATTCTCTTTTAATGGA
TATGATTTGTCTCATCATCTGACATACTGGATTGTCCCTCAGAGGGATCC
AGGATGAAGAAAATGCAAAAATTGTGGAATTTGCTCTAGATTGCCAGGAG
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CTTCTAGCATGTTTCACATCTGTTTGGTTTGGACTTTTGGTCTTGGCTGA
GAATGTTCTGTATTGTATTTATTCCTACGAAGAGGAATCTATGTAGTTTT
CCATCTGTCTATTTCAGTCTTGGCCTATTTTGCTTCTATGTATGTTTCCA
TGCATATATGCAGAATGAAACCTTCTGTACTTTCAGGGATTGCCTACTTC
TGGAGTTTGTTACGGATACCGTGTTAATGGTCCTCAAGGATGGGAACAGG
GCCATAGGTTTGATAGCAACATTATTCTTCTTGACCCTTACGCGAAATTA
GTTTCTGGTCGAAATTACTTTGGGGTTGACAATGACAAGCCAAGTCAGCC
TTTTGGAACATATGATTTTGATAGCTCTCCATTTGACTGGGGTGTCGATT
ACCAGCTTCCAAATTTGCCTGAGGTACTATGATCATTTAATAGAAGCAGA
AAGCATCCCAAACATGAAGTTCAGTGCTTTCATTCTGTTCTTTAATCTAG
ACAGATCTAGTTGTATATGAAATGAATGTTCGCGCTTACACTGCGGACGA
GTCAAGTGGGCTTGACCCAGCTGTTCGTGGAAGCTATCTAGGTTTCATCG
ACAAAGTAAGTTTTAATATCTTCTTTTTTGTGTGGTTTATGATCGCAGTT
ATTTATTTTGTCTTTACTAAAGGTTATTGTGGCAACAAATATGTTTCCAC
CATTTTTTGTTCCAATATTAGGAACCTGATATGCGTATTATCTACCTAGT
TCTCCCTCCGTTCAGAAATATAAGACTTTTTAGCTTAGTGAAACGAATGT
ATCTAGATGTCTTTTAGTGTATAGGTTCACTCCGAATCTATACACAAAAG
CCATCTATATACATTCCTTTCACAAAGCTAAGACGTCTTATATTTCTAGA
CGTAGGGAGTATTATTTAATGACTAATGCTTGCAATAGTTGCGGTTCTGT
AGATCCCTCATTTGCTGGAACTTGGAGTTAATGCGGTGGAGTTACTTCCT
GTTTTTGAGTTTGATGAGCTGGAGTTCAAGAGATACCCCAACCCAAGGGA
CCACATGGTAAATTCTGACATGCTTCATTCATTCATGATTTTTGTGGAGT
GACTTTTCATCTTCTGAATTGCAATCAGGTCAATACATGGGGTTATTCTA
CAATCAACTTTTTTGCTCCCATGACCCGCTATGCAAGTGCCGGTGGTGGA
CCAATTGCTGCTTCCAGAGAGCTCAAGCAGATGGTCAAGGCATTGCATAA
TGCTGGGATAGAGGTATGGACATCCAGTAGACGTGGTAACCTATTGTGGC
AGTCTTATTCATCCCACACATGATAAAACTGTTTAATGGTATCATAATTT
TGTATAGGTTATTCTGGATGTTGTCTACAACCACACGAATGAAGCAGATG
ATGCTAACCCTTATGTTACTTCTTTTCGTGGCATTGATAACAAGGTGATT
TATATATCTATTTGAGTTATCCGATAAGGGAACCTATCTGCTTGTCGCTA
TCTTTTCTAAGTTCTAACATGTAGACTGTATTTTGTTCAGGTTAATAAAA
CTAGGTTAGATGACCCTAATCTGACTAGGGTTGCTTAACTCAGTTTTGGT
GTATTTTGCTTATTCCACCCTTTTGCTTGTTAATTTTATAATGGACCAGT
ATCTAGATACAAGGTTACATTAATCCGTTTTAAGCTACATGTGTTTGGAA
GTGTAACCTGCTTCATGTTTTGGATGAATTTACCAAAAACACTACCTCCT
TTCATGCAGGTTTATTACATGCTAGACCCAAACAACAATGCACAACTGCT
GAACTTCTCGGGATGTGGTAAAACCATGGTTCCTAAACTTGTTATTTAAT
TATTTTCGTTGTTCTTGTGCTAGGTAAACATGTTCTTGGATGCTATCTGA
TGTTTTCTATTTATGTTTATTTTATGCTCCGGATTTAGGGATGCTAATGT
ATCTTGTTTTGCTGATGCACTTATTACTGTGTACTTCATGAATTCATCTT
GCAATTATGTGTTTCTAGGCAATTGAACTGTATCTGTGGCCGCTACTTTG
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AACCTGCGTCATCTATTTTGGGATGGAGGGAGTATGTTTTATTATTTTCT
TCTGCATGCCAACATGCCAGCAGACTGAACCTTGCAGGCATGTTAGCTGC
TATATTGACTGGTAGAAGGGTTAAGAGTGGTCAGTTGATCATTATCTGGC
TGCAGCCACTATATGTGTCGAGCCTTGAATTAGCAGTGAGCCTTCCACAT
TGCTACCCATGCGAAAAACCTTGTTATATTGCAAAAGCCTACTTGTCTGA
TTGACCTAACATTTGGATACCTAGATATTTAATGGTCTGGTATGTTTAAA
ATATTCAAGTGAGTGGAACTTGTGTCTACTTGTAAGTCTAACAGTACACT
TGTTTTAATCCAGGAAATACACTAAACTGCAACCATCCTGTTGTCATGGA
ACTCATACTCGACAGCTTGAGACATTGGTATGGCAAGGCTTGCATGCTTC
TTTTTCAGACACGCCATCTGCATTTTGATTTGATGCATATTTCTGTTTTC
ATCTTTCTCATCTCTTTTGTCTTCAGTAACCATTATAGTCACTGCTCCGA
TGGCACCTGTTTTTACTTGTGTTCCAGTCCCATGGTCAATTGCTACCAAA
GAAGCAAATTTGTATATGGAATTGAACTCTCAGATCTATATGACAAACCA
AGATGTTCCTGATAGACTGAAATTAAAGAAAACCGCCTCTGTTTTACAGT
ACACACTGCACTTATTAGTTCATCACTATCAGTCACCTGGTTTGTGACAA
GATACCGTTGATGGGGGCAACTTATGAATTATCATACAGGGAGGGCTGGC
CTTCATGGCATAGAACACATGACTTGAGTTGCTTGATCAATCGAGGTCAA
TAACGTGCCCCAGTGCCGCAACCTTTGATGAAAGAACTCACGAAGAAAAA
ACATTGATGGGATGCAATGGTTTCTGCTTGAATCCTTCAGTTCTTGCATA
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CACCAGCAAAGTGATTAGGGGCCAAGCCCATTACAAGCCCTCTTGGGCTG
AGCCACTTTGCTCAGAACAGGAGCCACAATTAGGTATTACCAGTCTAACC
GACATTGAGTTCTGGTTAGACCAGTTGCTCACTGTGCCTCTGAACCGAGC
CTTCAGTAACATGGTTGTTCAGACTACTTTCGCTGTTGCAATCCGACCAA
ATGGAGCTTGACTTACCATCCATTCCTGTTTCCTCTCGCTTGTTAGTGCT
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GAAGTTTACAAAGTGTAGAAGCATCAGGTTGCAAAACTTCCTATGAAGTT
TTGTGTTGTCAACCTTGCATTGAGTGACATCACTAGGGATGTCCTCATCA
GATTATATATGCTCTGCCAAGTCCTATATTAAATCTATCACTGCAAGGCA
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AAGTATTTTCTTATGATCTCTTTTAAAAAATTCGTAATAATTTAAGTGTT
TTTTCTTATTTGCATTAATATTTGATGCTTCTAGGGTTAAGGAGTATCAC
ATAGATGGTTTTCGGTTTGACCTTGCAAGTGTTCTTTGTCGTGGACCGGA
TGGCTGTCCGCTTGATGCTCCTCCACTCATCAGGGTAATTTATAGTTGCA
GAATTGCATTGTTTAACTTTACATCAGACCTACCATTTTCCTCTTCTTAG
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TGCATAAATTACTAGGTATAAGTTAAATCTAGGGTTGACTGAATACAAAT
CATGACCCAGTAGTGAATTCATGTAAACAAATTGTGGATGTCAGCTTGAA
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TGAATGAATGAACTACATTTACAGACCTTGGGGTCCTACGAATGTGTAAC
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CTTCTCAAGACTCTCTAAATCCAGTCCATCAATATCTGATTATTTGACAG
CTTACATCGGTGTTTTTGTAAAACTACCAGCCTACAATGTTTTTTGGTGT
TTTTGTATGATTGTTTATTGTTTTGGTCTCAGGAAATTGCCAAAGACTCT
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GAATGGAATGGAAAGTACAGAGATGATATGCGAAGGTTCATCAAGGTATG
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GTGCATTTTGGTATAATAAGGTGGCAACCGGTCTTCTAATCCTGATCATT
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TGAGGTGAAAGATTGAGGATCCTCTACCTTATATTGGCATCAACCAAAAC
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GTATGAAGGGGGTGTTGGCAACTCGCGTGTCTGGATCTGCTGATCTGTAC
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TCGATCCGCCGAGGAACTTACTTGCTTAGTTATCTCATCCTTAAACGTAC
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CGATCCATCGAAACGTTTAATGGTATTGACTATAATCAGTTAGAGATGAC
ATTTCAAGGTGTCAAATCCAGTTGTACCTGTATGGAGGTACTAGGAGCCT
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GTTCAAAACAGGAACATATGTGAAGTTAAATCCCCCTTGTGTGATTTTGC
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CACATGATGGGTTTACCTTATGTGACCTTGTTTCATACAATTTAAAGGTA
ACTCGAGTATACCAAACAGTATAAATTCAGGTTCCTTCCTATGCAAGTAC
TGGTATCTATGTTAATATGCTTTCTCTTTGACCAAAATTATAGCACAACG
ATGCTAATGGAGAAAGTGGACGCGATGGTTGCAATGATAATTTTAGCTGG
AACTGTGGTGTTGAAGGTACCAGCTATACCCAATATCATGTATTGCTCTT
CACATTGAAATTAGCAAGTGAAAAGAGATGTTATTTCTGAAGATATCTTA
CAGTAATCAGGAGAATGAGGAAAATTATTCTTTTGTTGAAAACTTGTTCT
GTACTAGTATGCTTGACAATTTGACGGAACTCAAAGACTACTCATAGTAT
TGAAGCTTCTGTATCAAGATTAGACTGAATAACTGTACAAGTGAATAACT
ATAGAAGTGTGGTAGTACCTTTTCAAATACAACCATGGAAGGTTATCATT
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GAGTATTGACATCTTCAATGTTGTTAACAACTTATGGTATTGTTCACCTA
ACAGGAGAAACAAATGATTTGAATGTGTTAGCTCTCCGTTCGAGGCAAAT
GAAGAATTTCCACGTGGCATTAATGATATCTCAAGTAAATATTACTGATC
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ATGTGCTTTTACGGGTGTGCCGGAGCTATATGCTAACTTGTTTCCCTCGT
GTTTGTGTTATATAGTTGAAAGAAAGAAGAAATGGCCATTTCAGGTTTTT
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GGTTTCTTAATAAGGTATATTCAAATTTGTACTGTTATTCTTGGAGTTGA
CTAGTTTATTGAAATTAACATTTTCTTCCTTCACTAAGAAACTGTTAGCT
GTGTCTGATGAGTATTTGCTAAGTATGTCATCTCCCTGGTCTCTAATTAT
GCATTGCATATTGGAGAAGATAGTTCCTAGTTTTTATAGGATGCAACGCT
TGGTTTAGTTGTTCTTGCGAAGGTATTCACTGTATTGTGAGCTTTCTTGG
TTGTAGAATGATGTCACCTGGCACGAGAATTGTTGGGATAACATGGAAAG
CAAATTCTTGGCATTCACGTAAGGAAGTTTGTTTATCAGTTTCGGTTATG
TACTTCATTTTGACTATATGAAAGTATTGTTGTAGTTTGGCTGCAACAAA
TTCCTGAATGGTTCTTTTGGCATTTTAATGTAGGATACATGACGAAAATT
CTGGTGGAGATATCTATCTGGCATTCAATGCCCATGACTATTTTGTGGAT
GCTGTAATTCCCCCAGCACCTCATCTTAAACGCTGGAACCGTGTGGTATG
TATACTTTCTTGTCTTGTTAAACTTTTGAAACTCGGTAGTCCTAGCATGG
TCAAACTCTAATCATGTAATAGTACTGTCTGTAGTTCCTCCTGTTCTACT
ACAGCTATTTCTTGGACAAATCTACCAATATTTTCTTCACAATCTTTTCC
AAGAGATACTAAGATTTTCGCAAATTTGGAAGCAAGAGGCTTAGTTCTGA
ACTTGCTACAAGTGGAGTGTGATAATTAGCCTGAAACTGCTATTGTGGTT
TCCTGCAGGTGGATACTAACCTGGAATCGCCAAATGATATTGTACCGGAA
GGGGTGCCGTTTACTGGATCAGGGTACAGAATTGCTCCGTTCTCTTCCAT
CCTGCTCAAAGCAACCCCATAGGCTGGATTAGAGTAGTCAGTCAGGCATC
AGAATAATGTCAGCTTCGCTCATTTTGGCGAGCTGTTGGCTGATCTCACT
TTCCGAGATTTTGACAAGCCTACCGCAAAGCGTGACAAACTTCAAGCTGG
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TACATAAGGCTTTGTCTAATAATAACGCACGCAGATCACACTTTTGTTTC
CACACATAAGAAGCATGAAGAACATGTAGACTGAAGTTGCTGGCCATTCA
GTTGTGGGACAAGAAGCTCGAGGGAACCTAGTCCATAGGTGTCTGTTCTT
TCGTTCTTGGTATGACCTGCGAGTATGTCTACCAAGCTCTTGTTTTTTCT
ATAATAATGCGGCATGGAAATGCCATCGTTTTACAACTTAGTTTGTATTT
TTATGGCACAACAAACAGTCCCATAATGAACATTGCCGTGGATAGATATC
GT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.