Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE046080

[Submit comment/correction]

Sequence
AE046080
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE046080
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTCACTCCACTCGCCACCAGCCCATCAGCACCCGCCGGAGATGCTCGGC
AGATTGGCCGCGCGGCGGCTCCGTCCAAGCACGACACCTGCCGCCGCTGC
CTCCTACCACTCCTCCGCGGCGGTCCGCGCCCACGGAGGAGGCGCCTCCT
CCTCGATCCTCCCCGACGGCCTCGACCGGAGCTCCGACGCCTACGCTCAC
AACGCCGCCGCCGTCGGCGGACTCCTCTCAGACTTGCGCACCCGCGTATC
CCAGGTGCGTGCGTGCGTGCCGCCAGTCTCTCGCTTCCTTCACACCTTAC
TGTGCTGACGAAACGGGAGTCCGTGCCTCCGTGGATGCAGGTGTTGGGCG
GCGGAGGCGCGGGGGCGGTGAAGCGGAACACGGGGCGGGGGAAGCTACTC
CCGAGGGAGCGCATCGACCGCCTGCTCGACCCCGGGGCCTCCTTTCTCGA
GCTATCTCAGGTCGGTCATCAGTGAGCGTGAGCCCCCTTTCCCTTGCAAT
GATCAGTTGATCAAGCGACGGCTGAAGTAGCCTGTACTATGTTGGTACAG
TTATCCTAGTTATCATCGCTAGATTTTGGTAATTAGGGCCAGGGAGAGCA
TGAAACTCAGTGCTACCAAATTGCAGCAGGCAATCATCTCTTAGTCAAGT
ACTGTCTTATAAGCTCATAAGTTTGTTCTGAAGTACGAAATACATCTGGA
GTTTGAGTTGGGATAATACCTCCTTAGGCCTTATGAGTTCCACCTATTTT
CTCTTTGTACTAAAACAAATCTGATTGTGGAAACTTTACTAGTACAATTT
TCATTTGAGAAAAATGGGCCCGAGTTTTCACCTTGCAGCTCTACGAAATG
CATATGACTTTTCACTAACTTTTTGGAGTAATTTTGTATTCAGATATACA
CATTTAATAATGCAAGTGCTAAGTATGCTGGCATTCAATCCAAAAGCTGT
TTGACTGAGTGTTGGCTGTAGTTCAAAGTTGGTCCCTTCCTCCAAAAAAT
CATGTATTTAGTACACATAAGCCTGTAGTAGAGGTGTCAATTTAATACAG
ATCAATAACGTTCACAGATAAACTGTTGCATGACCTGCATTTTATGTATG
CATCCTGATTATCTGAATACCTTCGTAATTTAATTGAGTAGCATGCAGAT
TTCATATCCGCACTAACTAGTATGTTAGAAATACACTGGACAGTGGACAC
AACTACCAGTCTGATAATCGAGGCTGTGACATATTTGACCAGGTTCACTT
GGTATCAGCTTCATATTTATACTGACCATTATAAAAAAACATATTTGACC
CGACGCTGTTGTCTTCCAAGTTCCAACACATATCGGTATCATGCAGCCAA
CTGCCTCTAAATATTCCGACATGCCAGAAACAGATGTTTTTAGACTAAAA
TAGAAGCAAATGTTATCATAGTTTTCCATCTTGTTCTGGACTATCAGCGC
TTGATGGTACCTTTTGCAATAAAGCTTGCAGGATCTGATGTTTATGAGGA
AGCATTACCATCAGGGGGTGTAATTACTGGCATAGGGCCTGTTCATGGAC
GATTATGCATGTTTGTGGCCAATGACCCAACTACAAAGGGGGGTACATAC
TATCCTATCACTGTCAAGAAGCATCTGCGGGCACAGGAAATAGCTTCTGA
ATGTAAATTGCCTTGCATTTATCTTGTTGACAGTGGAGGTGCTAATCTCC
CCAAGCAAGCGGAAGTTTTCCCTGATCGTGATAATTTTGGTCGGATATTC
TACAATCAAGCTAAGATGTCTGCAGATGGTATTCCTCAGATTGCAGTAGT
GTTAGGTTCTTGTACTGCCGGTGGTGCTTATATTCCTGCAATGGCTGATG
AAAGTATAATCGTTAAGGGAAATGGAACAATATTTCTAGCCGGTCCACCC
CTTGTAAAGGTTAGTATTTTCTGCCTACAATTTTGACAAATATCTAAATT
ACATGTTATGTCTAAAGGGTAAATTCTGTAGGCTGCTACAGGGGAGGAGA
TATCTGCTGAGGACCTTGGTGGAGCATCAGTGCATTGTAAAATATCAGGA
GTCTCTGATCATTTCGCACAAGGTACATTTTAACATATGTTGCCGTATAA
TATGACTCGATTACTGGTCTTTTAGATATATAAGTAATGGAGCAAGGATG
GTCTGAATGTATTATCAAAAGATACATTTTTGTGCTGCTTCTTTGTTTTT
TTTTTCCTCATCTTCTATTAACAAGTACATTATTAAACAGTGTCTCTGGA
CATTCTATTGTTCCTAGTTTATTTGATCATGCATATTGTTTCCAGACCCT
CATACTTTTCATGTCCTTGTCACTATTGTTTATGGACATATAAGTTGGAT
GTTACTATGACGTGTTAGACTTTTTTATTTTTGCACTGTAAATTGATACA
GATGAACTTCATGGACTTGCACTGGGGAGAAACATTGTGAAGAACCTTCA
CATGGCCGCTAAAGTAACAAATGTACCAAATTCTGCTTGTGATTACCAAG
AACCGTTGTACGATGTACATGAACTTCGCTCAATTGCACCATCTGATATG
AAGCAATCTTTTGATATTCGCTCAGTAATAGCTCGTACAGTTGATGGAAG
TGAATTTGATGAATTCAAAAAATTGTACGGAACAGTAAGGATTTCTATTA
TACTCGATTATCCTTTTGCATTCTGTACCTTGTGCACTGTGCAACTTAAA
TTTGTTTCACTTTACTTTATGCAGACACTAGTGACTGGTTTTGCAAAGAT
ATGTGGGCAGCCAGTTGGAATTATCGGAAACAATGGAATTTTATTTACCG
AGTCAGCGCTAAAGGGTGCCCACTTCATTGAGTTGTGTGCTCAACGCAAT
ATTCCTTTGATATTCCTTCAAAATATTACTGGATTTATGGTAACTATTCA
GTTCATTCCCTGATGAATAGTTTCACATCAGTTGTGGAAGGGCAAGTGAG
CTAATATTGAACTGCGATTTTATCGTCCCTAACCTCACAAGTTCAATGTT
GAGGATGGAACGACCCCTTATGACCAACAATTGGTATCAAAGCCTGGTTC
CCACATCGTGGACACTAGTGTTTGAAGGCCTAATGGACTGTGGTCGCTGA
GGGGCCATCCATTTATTGTGAAAGGGCACGTGAGCCAGAGAGACCGTTCA
TGTACAGTGAAAGAGTGTTGTATGACCCTTTAAGGGCACAAATGAGTGAA
AGGGAGATTGTTGGAATGGTCCAGCAATGGTTGTAGAAGGGAAAGAGAGC
TAATGTAAAAGTGAGAGAGTCCCTAAACTCACAAGCTGGCTCCTGGGGAT
GAGAAAGCCTTCTACCATCGAACAAATATGAACTGCAAACATACTAAATA
GGATGTTGTTAATATTTTGTGCAGATAGTCAGGGATGCTAAACTTAAACA
TAAAAGTTAGCTTGATTTAAGTATGAGCCTTCTAACTCTAACCCTTATCA
ATGCCAATGTTTCATAGGTTGGGTCGAAATCTGAAGCAAGTGGAATTGCG
AAAGCTGGAGCAAAAATGGTTATGGCAGTTTCCTGTGCCAAGGTCAAACA
TCCCTATAGTTTCCCATTCTTGCTCTCCTTTTTAGCTAAGTAGTGAGCGA
CTGATGCTTTATCCCCATAATTAGGCAGTGTCACACATGACATAGCATGG
ATGTATGGTTATAAAACGGCCTGTTTCTTTCATTTACTAGTTGTGATTGT
TCCGTTTTGCTATTAAATTTTGTTGAAGGTGTGCAACACATACCTAGTCC
TGTCATTTTTAGCTACGTGTAATGTTCAATGAAAAGTGACTCCCAGCAAA
ATCTTGTTATTTTCTTGCCATTTCTAGAGGTGTTGCCTTTGTTTTATTGT
TGAGTGATGTGTGGGATACCTATACAGTCAGTAGCATTTTGACAACCTGA
GTGAATCACTAGTTAAGTCTCATATTAACCATCAATATATGTTGGCATAA
ATGTTGCACCCATTGAAGGACGGTCATGCTTTTGCAATATTGAACTGTCG
ATACCCTCTTTTGATGACACCAGACCTTAAACCAATATAACGTTACAATA
ATATATGTATCTACTATTTCTGCACAGGTTCCTAAAATTACCATAATTGT
CGGTGGGAGTTTCGGTGCTGGAAATTATGGAATGTGTGGACGTGCATATA
GTCCGAATTTTTTGTTCATGTGGCCAACTGCTAGGATATCTGTTATGGGT
GGTATCCAGGTAAGACACTTGGACCTGTTATTAACTTTATAAACTGTTTT
GCCGCTTTACTAGTACCATTGCCATGTAAAGGATGTCATGACCTATGGGA
TATTTGGCAGCACTACTAATCCAAGGTGTTTGAAAGCATGTCAGATGTTA
CTCAGCTCCAAAGAAAAGTAGCCAGCATGCTGTCAATATTTTCTAGACTT
GGCTGCAAAACATTGTCTCCACAAAAAAAAAATTAAACTGAAAACTGTAG
GGGAGCACGGGCAGTAAAAGTGTCTGCACAAGTGTTGCTTAATAGAAACC
TTTTCTTGAGGTGCAACCAGGCAAACTAAAGCAGAACAGCGGAATAAACT
TCCATGCATTTACCTGACATCGGCCTTCTCATTCTTCAGTTCATGAAGGT
TTGTAAGTGAATAAATAATAGGAAATAATACTTACAGGCTGTACATTATT
CTGGAACTAAAGCTATGGTATCTTGGCCCGTATATTTTGGGGAGAATGCT
TACGTGAAAGAACAGTAATTATAACTGTGGAGTGGGTTTGTTTGTTTCCA
GCATTATATGTTAGGAATATGCTGTATTTAACTAAGCTGCACAAAATCAG
GAGAAAAAAAGGCATAAAAATAGGAGACAAATAACCATGAAGGTGGAAGA
ATCATTTTTCGCAACAAAACATAAACAGAGCCCCAGGGTCCACTGTTTTA
CTGGATTTTTTATTCTGTCTTAGCTTTTTCATATTTCCTTTCCGTCTCTT
TTGTTCTGATCACCCATAATAGTAGTTAGACCAGTTCCATTCAAATAGCT
CTGCACCAAAATCGAGGTGCCATAATGTTGTCTGAGAAAACACAAAAAAC
ATTGCTTGCTAGTATGTTCATAGAAAGAAAAGTTATTTACAAGTCTTAGA
GAAGGTAACCCATAGCAGATGACCAATCTTCAGTAAGGAAGGCAAGTGCT
GAGGCGTTTGACTCAGACGAAGGTCTAGCCTCTTGATCTTGTCCACGAGT
CATGGCACCACCGGGTGGTCATTGTCGAAGACACATGCATTGTACTGCTT
CCATACGAGCTGACTGCTGAGGAGGATAGACTGACAGAGGACACTCCACT
GAACCGGGGCTGATGATCACATTGTCAGCTGCCACCCAATCAATGACCCC
CCTGTTGCGGCCACTGTCCATTAGATCCGATCTATGCTAGAACTTCATGT
GTGCCTTACCGAGAGAAACACAGTCCACAAATAGGTACAACATTGACTCA
GGGGCCTTATCGTGGGGGCAAGCAGTCACATAGTGAGGTAGTCCTCGCCA
TGCGAAGCGATCGGCTGTCCAGCAGCGGTCTTGGCACACAAACCACAGGA
TCAGCTTTGTGCGGTTTGTGTTGCAATACAATAGTAGCCGGTGCTGTTCA
CAAGCCTACAGCAGCAGCCTATCAAGAACCAATGTCTCTGGTGTTGGTAC
CCCAAATAAGAGGGTGTGCATTAACTGCTAGCACCCGTATCATGTTCAAA
CACATACATAATATAACCGTGCTGCTTATTTTCATGCGCCAAGCAGTTCA
CCAAAGGTTATGCTGTACGAAAGGGGAGGAATGTGTTAAGAATGGACTCT
CAGATTACTAAGTTCTGTGCAACATTCATCCGCTTCACCTAACAGTTAAA
GCTATTGCGGAGATGTGAGCAATGCATGTCAACCCTATTAATATTAGTTG
GTCTGTTACTTTGTCTATGCGGTAAAAGATTTGCCTCCCTGCACAGAAAG
ATAAGGATTTCGTGGATCTCAAGTGTTTGTGCTGGCAAACCAATCTGTGG
TTGGGTGGCTAGGAGGGTGGTTGTACCCCCAGCCCACCAGAGTTCAAACT
CCAGGTTTGACACTGTGTGTTGCATAAAAGGCGGAATATTCTTTCAGTGG
GAGACGATGTTCCCGTCGACAGCGAGACGCTCGTGGTGACTTCGTCAATC
TCAAGACCCGCTCTGCCGGCTCAGTCTATCGGAGGTGCTCATAGGGGTAG
GGTGTGCGTGTGTGCGTTCATAGGGGTGGGTGCATGTACGTGTGCTCATA
GGGGTAGGGTGTGCGTGTATGCGTTTATAGGGGTGGGTGCATGTACGTGT
TGTGAGCGTCTACGATTGTACTGTGTTTCTCAAAAAAAAAATGTTTGTGC
TGAAAACTGGAAGTTGTGGATCTTATCCTGGGGTCGTACTCCGTCTGATC
CACAATCTCTCTCATGCGCACATAGCTAAGAGACTCATTGAAGTAATATT
GGATGGTGTTGGACAATGCATGCCCCTATTTGATACATGTACCATTATCT
GAGCAAGTATGGTCCATGTCCATCAATCTGTATCGAAGGCATGCGCACTA
GGCATATATTTTGAAACGGTGGTAGTATGCATAGATCATGTTCTTCTACA
TGTGAAAATCATTGATATAGTAACTGATCAAATTTATTCTACCTACCAGT
GAATGCTCAAACAAGAGCCAAGCTACCATAGGTTCTTATTAATATTTTTC
TATCAAACCTTTTCAGGCAGCAGGTGTTCTTGCTCAAATAGAGAAGAGCA
ACAGGAAACGGCAAGGAGTGGAGGTATAGTGCTTATTTATTTGATTTAGA
GAACATAAGACAAATGGGGTGCTAAAAAATAATTCTTACTCCCGGGTGTA
GCTACACCCACGTCGCATATACTACCATACGAGAGTATACGTGATACTTT
ATCAGTTTAAGTATGTTCATATACAACATCTAAGATACTTGAAATCAAGT
TACGTGAAAAAATGCAAGTGGAGTCTAAGTTTGCACTATATTTCCAAAAT
ACCCTTCATTTCTGTACGTAAAATAAGAGTATGTAAAAATATTATACATA
CTACCTCAAAAGTAGTATATATACTATTAAATGGTCTTATAATACTTCAT
ACTATGAGTACATACTTTTCGGTATGACAGATACTGCCTACATGGTGTGA
AACACACGTGGGTGTAGTTACATCCGGGAGTAGTATAAATATGTCCTCTC
TCTATATATATATAGTTTCTTTGTTAAAAAAATGTCCATCTTAGACAAGC
AAATCATAGCTTCTGGAAAAAGAGAGGTTTCCTCGTAGGAGAATACCAGC
TACAAATTGGTTCACAAGTCCCTTCCTTTAAAAGTACTCCCTTCGACCCA
TATTAGTTGACTTGAATTTATCTAGATTCGGAAGTATTTAATAATAAAAC
ATGTCTAGATACATTCGAATCTAGCCAAATTTGAGTGAACTAATATGAAT
CGGAGGGAGTAATAGAAGAGTTGCAGAAAGTGAAACTAGATACTGGTTGA
AGACTAGACTTTTTGTTGTTATATACAGTGGACCAAGGATGAGGAAGAAG
CCTTCAAAGCCAAAGTTGTTGAGGCTTATGACAAAGAAGGAAGTCCCTAT
TACTCTACCGCTAGGCTTTGGGATGACGGGATCATAGACCCCGCGGATAC
CAGACGGGTTTTAAGCCTTTGCCTTTCTGCTTCGGCCAAGCCAGTCCCAG
AGGACACAAAATATGGTGTTTTTCGAATGTAGATCTTGTATCGTACGCAT
CGCTCAATCCCTGTTCAGTAATAAGTAAGTACTTGCTTTAATGCTTCAAA
TATAAAACGGAATAAAGTGTTTATTCAAGGCTTATTTCGTTGCCAAAATT
TCTCCAGCCCTGCTATTTCTAGTTTCCTTTGTTTATGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.