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GrainGenes Sequence Report: AE045172

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Sequence
AE045172
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE045172
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCTCCTCCCTCTGCAGTCCGCACTGCGTGCCTAGGCCGCCCGCACGCG
TTCCACTGCCGTCCACCCTCTCTCCGCAGTGCCTGCCAAAGCCCGCGCTG
CCGCAAACCGACCCTCTCTCCGCGGTGCATGCCAGCGCCGCTTCCTCCTC
TCTACCCGCGCCGCCGCAAACTCACCCTCTCCGCCTGCCGCGTCTGCGTG
TGCCAAAGCCGTCGCCTCAACCTATCCACGCCAACGCCAACGCCAACGCC
AACGCCAACGCCAACGCCAGCCTATCTAGCGCTGCGCGCCGCCCCACGCG
CCCTTGGCTGCGCCTCCCCAGCGCCTACCAAGCACTTAGCCATGTCGTCG
TCTCTGGCGTCCTCGTCGTACCGCCGCAGGATCCTCGACTCCAAGGTGGC
GGCCACCCACGCGCTCTACTCTTGCCGGCTCCCCTCCCGCTCCAGGCAGA
TTGCTCACACCAGGATTGGCGCCGCCACCAGAGGTAAGACCTTCTCAAGA
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CTATAGTATTGTAGACCTAGTGCGCAAACGGGCTCATACATGTTATCCTG
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GGTACTAGGCGAGTGCATTTGAATTGATACTATGAGAGTTTGGTACTAGG
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GTCATTCTTGTACCTATTGCTAGCAACATGTAAATAAGTAGGAGTAAAGG
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TGTACTGATTTAATTTCGAATTGGCATTTACTCCCTCCGTCCCATAATAT
TGCTTTTAATAACATCTTATAGTATGGGACTGAGGGAGTAGCAAATTAGC
TACATTGCATAAGTGCTACCGGCCCCTACAGCTTTCTAGTATCTCAATAC
ATATTTGTTAGCTCTTGCTATTTTGCACATTTAACTTGTTTGACTGTTGT
TGGTTGCTTCTCATGTGCAATACTAGTAGACTTGGTATCTGACAGACATC
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ACTATGCATCACTGGGAGACCTTGAATCACATGGCGTACAAATTTGGGAA
GCTTGACAAATGTCATGGAAAACTGGCCTTGAAGATACTGGGTTCTATCG
TGCAACAATCAGGTTTGGAGCGAATTACACATATTTACTGCATGGCTGCT
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GCATCTTGCTGTGGAAGGCTTCTCTTGCAGTGCTATATTTAGCTCCCTTT
TGCGAACCATCTCGCGTTGCGATTCCAGCCCCATGGTTTTTGACCTTCTT
ATTAATGCATATCTGAAGGAAAGAAAAGTTGTAGATGCAAGTAAGGCAAT
TTTGTTGATGGATGCCTGTGGATTTAGGGCTTCAGCTCATTCTTGCAACA
ATGTCCTTAATGCTCTTGTGGATATTGGCGAATCAAAACATGTGTGGTTC
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ATCTTATGCTGCAAAAGATGAAAAGTCGCTCCCTAACAAATGTTGTTACT
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CGTGCCTACCTTTTGCTCAAAAGAATGAGGGAGGACAACTTAGCACCTGA
TGAATGTACGTATAATACTTTGATCAAAGGATTCTTTGATGAAGGTAAGA
TGAAACTTGCTATCTATATCTTCAACGAAATGCTGAAACAGAGCCTGAAA
CCAAGTCTAGCTACTTACACTACCTTGATTGATGGGTACTGCCGAAATGG
GACAACTGATGAAGCTTTAAGAGTTCTATATGAAATGCAAGTTGCTGGTG
TGGAACCAAGTGAATTAACTTATAGTGCAATGCTGAATGGTTATTGCAAA
GCTTCCATGCTGGGACATGCAATGAATCTTATTGACGTTCTGAAAGCAAG
AGGCACACCAATCAATAGGACTATGTATACTATCCTGATTGATGGTTTCT
GTCAGCTAGGACTGGTTTCTAAGGCCAAACATATTTTAAAGAGCATGCTT
GTGGATGGGATTAATCCAGATGTTATCACGTACTCAGCATTGATAAATGG
TATGTGCAAGATGGGTAAACTGGACGAAACAAAAGATATTTTGGCAAGGA
TGCAGAAAACTGGAGTTTTGCCTAATGAGGTGCTTTATACAACTCTAATC
TGCTATTGTTGTAAGGCTGGATATGTCAGAGAAGCACTGAAATATTTCGT
GGACATCTATCGAAGGGGCCTAACTGCCAACACTTTCATCCATAATACAC
TGTTATGTGCATTGTATGGAAAAGGAATGATTGCACAGGCTGAGCAATTC
AAACAATACATGTCTAGGATGCAGATATCATTTGATGTCACCTCTTTCAA
CTGTATAATAGACTACTACTGCATTACAGGTAACATGCATGAGGCATTCT
CAGTGTATGATAATATGGGTAGATATGGTTGTTCTCCAAATGATTACACA
TATAGGAATTTGCTTAGAGGATTGTGCAAGGGAGGCCACTTGGTACAAGC
AAAGGAGTTCATGGCCTGCCTTGTTGACATATCTTCTGCCATTGATCAGA
AAACGTTCAATGCATTACTTCTAGGGATTTGCAAAGATGGAACACTAGAT
GAAGCTCTGGATTTGTGTGAGAAAATGGTTACAACCAACTTTCTACCTGA
CATCCATACTTACACTATTCTTCTTAGTGGTTTTTGCAGAAAAGGTAAAA
TTGTTCCTGCAGTCATGTTGTTGCAGATGATGTTGGAGAAAGGGTTTGTC
CCGGATATTGTTACATATACCTGTTTGTTGAATGGTTTGATCAAGGAAGG
CCAGCTTAAGGTTGCTTCTTACCTGTTCCAGGAGATCATATGCAAGGAAG
GCATGTACGCTGATTGTATTGCCTACAACTCAATGATAAATGGATATCTA
AAGGCAGGAATGGTACATAAAGTAGATATGATGATTTGTGATATGTATTG
TAATGAGGTTTATCCAAACCCGGCTAGTTATAACATTCTTATGCATGGGC
ACATCAAGAAGGGACATTTGTCAAGATCTATTTATCTCTACAAAGATATG
GTAAGGAAAGGGATTAGGCCAAACAATGTGACATATCGTTTGCTTATGCT
TGGATTTTCCAAGCATGGTATGGTTGAAATTGCGGTTAAGCTCTTGGACA
AGATGGTCTTAGAAGGCATTTATCCTGATAAGTTAGCATTTGACGTACTC
ATAACTGCATTTAGTGATAAATCTAGGATGTCTAGTGCTTTACAGATTTT
CAACTGTATGAAGCGGTTATCTATGTCACCTAGCAGCAGAGCATACAGTG
CCATGATAAATGGATTAATCAGGAAAAACTGGTTGCAGCAGAGTTGTGAT
GTTTTACGTGACATGGTTGAAAGTGGGCTTGAACCAAAGCATACACACTA
TATCGTGTTAATCAATGCAAAATGCAGGATTGGGGACATCAATGGAGCAT
TCAGGATTAAAGAGGAAATGGCAGCTCTTGGTCTTGTGCCAGCTGAAGTT
GCTGACAGCTCAATTGTTAGAGGTCTTAGTAAATGTGGAAAGGTTGAAGA
GGGTATTATAGTTTTCTGTAGCATAATACGGGCAGGAATGGTGCCAACCG
TTGCTACTTTCACTACCCTAATGCATGGTCTGTGTAAAGAAGGCAAGATT
GTGGATGCTCTGGACCTCAAAAGGTCAATGGAGTTGCATGGATTGAAGAT
TGATGTTGTCACTTATAATGTTCTAATCACAGGTCTGTGCAATAATCAGT
GTGTTTCTGATGCGTTAGATCTGTATGAAGAGATGAAGTCTAACCAACTT
CGACCGAACCTTACAACATACACCACAATAGCTGGAGCTATTTATGCATC
AGGCAAAATGCTGGAGGGAGAGAAACTACTCAATGATATAGAAGATAGGG
GCTTTGTTCCCACATATAAGGATCAAAGTCCTGAATGGAGGATGGGGAAT
GCATTGAGAAGGTTAAACATGATAAGAAATTGCAGAAAAGCAATAACTTC
TGAAAATGAAGTCGAGCCACTGCATGCTGATCATGAATCCATGCCTGCTG
AAGACTGAAATCCTCTTGAAATTAAACTTTTCCAGAAAGTGATACATTTG
ATCGACATATATATGTATCAGTAGCTCTGATCCTTCTCAGAATCGTCATT
TTAGCTCTTGGAGCTTCTTTGCAAAGGAAGGTGTCTCCTCTCCCCTACGT
CCTACTAGTGGCATGGAAAGGAGAGGATCAGGTGCATTTTTTTCTCTTCA
ATGCTACAATCTAAGTTCCTGGATATCAGCATATAAAACCCTCATTACTT
GCTTTGATTTGTTCCACCATTTACTTGGCAGTTTTTGCTATTTTCACACT
ATTTCTTCCTTGCTGCAGAAACATAGTGTAGGGTAGCAAGATTGCAGTTT
TGTTGTGCTATATGTACAGTTCTCAGAAGAAAGATTCTGTGCATATTTTG
TCTTCGAAGGTAGAAGAAAAAAGAACACAACCACTAGAAAGTGTGTTAAG
AGTGAAACATATTATAGTTACAACTCGCATAACAGGAAAACAATATCTAC
TCTCTGAAGGAGATAGATTACCCTTGTGTTAATGTTTAAACTTTAAAGTT
GCTTTATTAAATGTGCAACTTACATTAGCTGCAAATTTCAGTTCACGTGA
CTGGACTAGCATCCCAGATGAAGAAATCTTGTGATTGTTGCAAAAGATAC
GTGGGCCATTTGAATGAAATGTTGAAGTGTTTCCATAGGCACATGGCTGC
TCAGTGTCTCAAGTGTACTGGATTGGTTGGATTTGTTATGGATAGTTTCT
TACTAGTTGGTTGGATGTCTCATGTGAATAGATTCGGAACATCACTGCTA
GAAAAATCTGTAGTTAAACTCTTTGGTTCCAAACAAGCAGCTAATTCTGC
ATGTCTGAAACATTGTAGCAAAAGAACTTCAAAGCTCAGGATGATGATTA
ACATTGTCTGTTCTAATTCTAGGTGTTAGGATTCTGTATAGGATAAGACA
CTGAGGCAATAAAGGCCGCTCTAAAATACCCATCCAAGGATTCAGGTTAC
ATTTTGATTCTCTCTGCATTAACATTACTTTCTGAATCATATGTTTGCTA
TTAGAGTTTATTATTGACGTTTTCACCATTAAGATTATGTACAGGGGAAG
ACTCTGAGGACAATACTTCTGAAAGCAGATCATCTTTTGTGTTAGTTAGT
CGTCAGACACCTTCCTGGCATGATTATGTCTTATATCAGGCAAGTATTTC
TGGCTATCATGAAGCTGAGCTATGTCACCTGGAGTACAGGAGGAGAAAGT
AGATACGCTTCTCCAGGATGTACGAGCTGAAACTCCTGTATTTGTGGCTA
TCACGAAGCTAAGCTACGTCAAGTCACGAAATGCTTCTCTTGTAAGTTTT
GCTGTTCTTTCTCTTCGAATTTATCGGTCATTTTTAGTGCTTAATATTTA
TAGTTCTATATGAACTTTTATTCCATTAAATATTTGGTATAATCATGCTT
TTAGATTGATTGCATGAACATAACAGGGTTCATTAGAGGCACAAGTTTTC
CTTGAGAGGCTAGATTAGAAATACCCACATTCAGAGGAGGTAAAAGAAAA
GTATGAATCAGTATAGTTATTTGAGTTAGTAAAATTATGACAGTTCTGTT
TTCAGATATTAGCATATATGATGTGGAGTACATTGTACTCCCTCCGTCCC
ATAAAAGATGTCGCACAGCTGTTTTTGCAAAAAAGTCCTCCGAATTTCTC
CGACAAGCCCACGGGTTATTCTCTTCTTCCCCGTCTCTGCCGCCTCGCCA
GTGCCGCTCGCCGACCGTGCCGCGCAGCTCAAGCTCCCTCGGTGGTCACC
TAGCGCCTCCTGCTCCGCTTCCCTCGCCTGCTTCCCTTCGTTCTTCCTCG
CCGGCATGACCAGAACCAACGAGGAGGGGAGATCAAGAGGAAAGGGATCC
CTTTTCCGGCAAAGCGCTCGCCTTGTACTCGCTGGACGCAGAAATCGGCC
GACCATCGAGCTCGTACTTGTTTGAATCGGTAGATCCTCCGTCAGCACCA
ACTCGGGAGGGCCGCCAAGCTCGGATCCTTTTGGACGCCGACCGACCGGA
AGCGCCCTTGGTACCACCTCGGGAGATCCTTGAGCTGCAGCATTGCCCTC
GCGATGTACGTGCATGGCACCCTTGGTCCACCTCGGGAGCTCCTTGAACC
TGAGCGTCACCCTCAAGCAGCCCCAGTCACTCCAGTGTCAGCGTCCGCCC
TCGTCATCATTCCAGGTGAACTGCTCTGTAGCTACCCCAGTGTCACAGTA
CTAAAAGTGTTCTTCAAATTGAGAAAGAGCAACTGTGATTAATTCGCCCT
TAGTACTACTCCATCAGTATCTGAATTCATTTGCTGCTGAAGATATACTG
CAGTCTTTGTTCCTTCCAAAATTAATTCATATTTGCCCTGAACTAGGATC
AGGAAACACAGCTTATGGATGCACTTGTTAAACTTTGAAGTATCATCTGC
TTGCAGTATTAGTTCAGAAACACTTTGGTGTCTCACTACATGTTGTTGGC
TTGCTGCATCTTCCGGCCCGACTTGCCGCTGCATATTTCTGTTGTTATCT
TGTACTCTGAGAACTTGAGGTGGAGATGGCTCAAGAACGGATACAGGTAC
CTAGATTCCTAAAATGAAATAATGAGACACCAAAGTGCATCTTGTTAATG
TTTCCTATGCAAGGAACAACAATTCTTTTATTTCAGAGATATATATTGCA
TATGGTAGATCTGTAGCTGCTTACTGCTGCTTTTAATTTTCAGAGATATA
GACCTGAACCTACTACTCCAGTTGCTGCACCTAAACCTAAATTTGTTCCT
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TTGACGAGTGGTTCACAGTTTTGGGTACTACTTGGACCCTGGAAGCATGC
AAATCTTTTCAAGTGTAACTGGGTGCTAGGAATCCTGTCAACTTGTAAAC
TGAGCATCAACCTGTTTGCATTATCTTTTGTTTGATAAAGAGTATGGTGC
ATCCGTTTGTACTAGTTTCAGTCAGCAGTGCAATACTAGTGTTAAAAAAG
TTGTTTCTATTTTAGAACTTATGCTCCAGATTCCAAACTTATTACTTTAT
TATCATGATTCCAAATTATGCTCCAGATTCCAAATTATGCTCCAGATTCC
AAACCTATTTTAGAACTTATGCTCCAGATTCCAAATTTTTACATCATGAT
CTTATGCTCCAGATTCCAAACTTATTACTTTATTATCCAAACAGGGAACC
ATACAAATATTCATAGCACCTTATCTTTCTTATGGTCCATGCAACTATTT
CCTTCTAAACACTATGTATCTAGGTAAATTCAGCTGTATGTGTACATACA
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GCAGATTGTTTCATCACTTCAGAGTTCACCTGAAACTAACTGCTTGTTAT
TCTCATTGATGCATGACCATCGGCAAGCAGAAGGACGACTACCAATAGCT
CTATCTATCACGACAGAGCTACTTGGAAAAACCTATGCCCTTATAGAAGA
AATGGAGTTCGAGTTGTTAGAAGTTGGTGAGTCTTGTATGTTAGATGAAG
GTACACTCTTTCTTTCATACATACATTTTCTTTCAAGTTCTTGATTTCAG
TTACTCCCTTATTTATTCATGTTATGCATGATCTACTGTTGATTCGTATA
GATGAGTTCAGGAACAAATTCTTTCAGTACTGTTGTTAGTGCTTTTATTG
CACAATGTCAAAGCTTGAGCTTTGTTATTACTAGTATCCTCTATCAGAAA
ATGAATTCCCCGATATAATTCTATTCCATGGGTTGTGGTAGCATGTTATC
TGCTAGACCAAGTTAAAGATTTCATGTTAACAATGTTGTTGTCCAATATA
GCTTACATATTTCATTTCATTTTAATATCTATGATATGGCATCATTCAGT
ACTCATTTCTTGAAGTTCATAGAGTATAAACACTTGAATTTACTTGATTT
GGTCTGTATTGCAAGATGCCTCCTTTACAAAGAAATAAGAAAATGGAAGC
ATTGTCATGAACACCTTCAGCAGAGACGTGCATGTACATATGTTTGACAG
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CATTTCCTTTTCTATTGCCCCTTCCATGTTCAGCTTCTTAACAAGATTGT
GAGAATATTCTTTATGATTCCATATTTGGCTTTCTTGTTGAATCTGACCA
ACAAGTTAATGACTAATTTGTTTCTTTACACTTGTATATTCATTGTCTTG
TTTATGGAATTGCAGAAAATTAATTCCACAAAACAAAAAGTTTCTTTACA
CCTGTTTATTGCTACTAAGAATTACACCTGTTTATTGCTACTAAGAACCT
GGTTGTGATTGGAATGACAATCTTTTCTAGCCTTTGGTTAATAAATCTCT
TTTAGTGGTCAGCTTTTGATACTCCTCATAACATTAGTGCACTGTATTGT
TTGAACTAGAACTGTTGAATATTATAAGTAGTGTACTGTGCTACTTAACC
ATGCTCTGAAATTTTCTCAATGAACTTGATAGTCATCAAATCTACGTTGT
GCATCAATTTGATCCCTGCTTTTCAGGTTTCCTTGCATGTTCAGTATCAA
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TCAAAATTCAGGTGAGGTAACCTCGAAAAAAAATTCAGGTGCAGGAGTAC
CAATATCTGAAGCTGTCGGAGTAATCTCCTGTAAGTTCAGAACTTAGTAT
TGCCGTGAAAATTCATCTGAGATTTTGATTTTTTGACTCGAACTCATACT
GCTGTCAGAATTCATCTAAATTTTAATTCTTTGGCTCGATACTTTGACAG
ACTCAGTACAACTGAACCTATACAAGTCAGGACACAGCCGGGAGCTAGCG
GCCTCGTCCTCATCCCCAAAGAAGAAGGTCACGACCTCCTTCCTCGGTGG
AGCAGCAGCGGATGGTGAGGGATTTGCGGAGGCGGGGGAGAACGAGAACA
GAGAGTAGCGCGGCTAGCTGGCCGGCCGCCCGCCAGGTCGAGCATCTCAG
TCCGGTGTCCTCGATCCGGATTGAGGGTTGATCATGGCCTGCGCGCCGGC
GATCGATCTCCAGCGCGTCCACGAGCTCGGACTGCCGGCTCCGGCAGGAG
GCCGGCGGGATCTGTGTGCTTGCTTCCGGCGGCGTGAGGGCAGCAGGACA
GTGACGGACCGGTCGATCGACGGAGACAGCGCGACGGTAAGATTCCAATT
TGGATTTCAATTTTGAAGCCTAAATGTAAAACGTTCTAAATGTATTAGGG
ATATTTTTGCAAAAAGTAAAATGAACTGGGGACTAGGAGGGCTGCGACAT
CTTTTACGGGACGGAGGGAGTAATATCTATCCGTGTATTCTAATGTTAGT
TTGTACACGAAATACACTTGAAGTTTGCTATAAGATAGCTGTTGAAGTTA
TTGCGTACCATTAAATATTGTGCTAAATTCCGTACATTGCATCAGAAACC
ACAAATTATGCTGGTTCAGTCGCATAGATTGTCTTGTAGTGTGGACACTT
TGGTACTAGCATCACATTTTCCTGAGTAGCATATGTGTGCTAGGATCTGC
ATGTCAGCTTGCACAGGCCGTGCATTCTCCATCGATAAAAAAGTTTTGTA
CAACCCGAGATATTATTTTCTTAAAAGAACTTTACATTAATCCGGAGTTA
CTCTCTGAATGAACTGATCCCAATGTAATCATATTTATTGATCTGTCAGA
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CAGATGAACACTTCGCACGAAAAGGTCAAACCGTCACACTGCAGCGCCCA
GGCAAGAACAAAATGTGGTATCCCAGAATTTACATCAGGAAAGATCAGCA
TTGGTGCAACCTTTCTGGGCCTGGTTGGTTAGTCTTTGTCCACGACAATT
GAGTATATGTGGTTGATATATCCTGCTTCTTTGAAATAATGAAGGGCAGT
GGGAAAAGTTCTCATTAATAGTTCATCTACTTCGCAAATCAATGGTGTAT
TCCGTCCGTGGAAGTGAAATTGGTCCTAAAAGAGTAAACCCAACACACGA
CATAGCAAGGGTGAATTTGGCTACCCCTAAAAGAGTAAGCACAGCTGATG
GTAGAACAAAGGCAAAGGCAACTCCAACAATCCGAGTTAAGAAAGGAAGC
ATATAATGATATATGAAGACGCCCTTGGTAGACTGAAACAACTTGGTGCA
TTTCAAGTTCCCATTTACTTGTCAACAAGAGCAGTGTTGGTGTCAACGTC
TATGCTGTAGTAAGTTGAAGTCTTTTCTGGACACATATTTCAGCTATCGA
TATGATGTAGTCCTTGCTCACTATATTTTCTTGAACCTGGTAAGGTTTCA
GGTAACGAGTTATTTTAATGCAACATTTGGTGTCTGGAAACAAACCATTT
GCAAGTATGCTGCTGGCTATTTCCCAGCCAGAAATCAGGCTGTGGGACTC
ATGAGGGCAGAGGAGCAAGACATGTGAAGTCGAGATGCATCCAAAGATTG
GCGATGCCCGAATGCTAATGGGAGGTTGGTGTAAGTTTGTCCAGGACAAC
CGTCTAAAAGTCCGAGATATCTGCATGTTCTAGCTGGTGTCGAACCAGAG
TAGGCTTACGGTGATAGTGCACATCATTCATCACAATGTCAATCACTGCA
GTGAAAAAAAATATGAAAAAAGGAGTGATGGAGTCTCTGTTGGTATTCTG
CGTGTTCTCTTTTTGTGGTTTTGTAATGTGAAAGTGAAAAAAAGTGAGGG
ACTGGCCGTATGGCTACTCTTGAAAAAGAAGGGAGGCCTGTTTATTCTTG
CTCTCTGATCTACAACTAATGAGGGGCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.