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GrainGenes Sequence Report: AE045100

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Sequence
AE045100
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE045100
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TATAGATAAGGAGAGAAGGAGACGGGCAAGGCGGCATGAATCCCCGTCCA
TGCAGCGAGATCAGTTGGTCAGTTGCAAGATCGCATCGAGGATCGGAAAC
AAAAAAAGTTACCACCGGCGAATCCCGGGCAAGGTTGATCCCGAGCGAAT
CCATCCATCGTCAGTTTACCACCGGTGCTATTCCACGCCGACGATCAGGC
ATTAATTAACCCAGTACCACCGGCGGCGAGAGAGACACAGAGAGGTCGTC
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CATGGAGCTGAAGCGCGCGTGCGAGGCGGGCATCCTGAGCAAGGAGAAGG
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ATTGCTGAAAATTCCAATGAGGAATGTTTTGCATTTCGGTAGCGGTAAAT
GTCCACCTTTCTTTTTTTTGCAAAGATCCTTCTTTGATAGCCAGCGCACG
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ACTGTAGAGTTCTTTGAACTTCATAATATTGTCAATATGACTTAAGAGAA
TAACCTTGAGCAATGGAAGTATGGAACCATGATATTCATTTCAGAGAGGA
GAGCTTGAGTTTTCGGTTCAGTTAGTGGATTACATTTTCTGTTCGGATGG
GCGGGAATTTGGACAGAAGCTCGTTCAAATCCACGGGATTGGCTATGTTC
CCCTCATTCCGTGCCTGAACTATACGTAGTCCAAACAGGCTTAAGCTCCC
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AGTGGAGGCGTCACGGTCTTGCCGCTCGCCGCGTGCTCAACCGCTAGGCT
TTCCCTACCCGCCACCGATCTCGCCCTAGGCTGTAGCCATGGAAGCCTTG
CACCTTGCCTGTTGCAACTGCCTTAAACCTGTTCGACGAAACGCCCACCA
GAGCAAAGCAATGCATTGACCGGGTGAGTCGCACGAAGTTAACGCATGTT
GCATGTTGGGAATCATAAAAAAGGTCATGTTGGCCCATACAATCATTTGG
CCTTTTTCAGTGTGCCCTTTGCATATGAGTTTATGCAACACTTTTATAGC
ATACTAAGCATATTTCTGGCATTTTCAGCACCACAATTTTGAACACTTCC
CCCGCAAATTTTTTTTTTGAACACTTGCATTTAAAGAAAACTAAGTTTGA
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AAGAAGAGGACATTGAGGCTCTCCTCGGCACGTAAGTTGCCGAACCGGCA
GTGACATACTTGGAACCGATGGAGCACGCACACTTCTAATTCTTGCATAG
AAAATAGGGGATAACGATGTTGGCAATTTTACTACCGCAGCTATGTCATG
GCCATTGGTGAAGCAGAGGCATTTTCAGAAAGGATGAAACGTGAACTTAC
AGCTCTTGAATCTGCGAATGTTTACGCCCTGATGGAAACGGAGTCTGTCG
TGGAAGAGGTACGTGAGCATTTTCACTATTCTCTCGATGCATTCTTATCA
TCTGGATGCCAGTTAGAGCATCACTGTTCCTCTATGTAGCACCCAGTGTC
AATTCAGTATCTAAGTTTTGCCCACTTTAATCTCGTATTGTATCATCATG
AACTTGCACATTTTCTATGTCTGCCCATTATAGGTTCTTACCGAAATTTT
AGTCACTCCAGTTTTATATCTATTTTCAGCCTACCCTTCCCTAGAAAAAT
TAATTAATTAATTAGCCACACACCTCCTAAAAGTAGTAGTGCTGTTTTTT
AGTGAGCCAACAGAGACATTTTCATTAATTAAGAAGAATAGAATTGTCCA
ATTAATTAGAGAAAAACTAGGCGAAAACCCACGCAAACACCTGAAACCGG
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CTATAAAGAAGACAAAATCCATTGAGGTTGCCTGCAAGCATCAGCGTCAT
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CAAAGTCCATGCTGGCTCGCCATCAGAAACAAAGTTGCTTAGTCTGCATT
GCCACAGACACCAGCACTAAGCAACTCTGTTTCTGATGGCGAGCTTAGAA
GGGGAAAAGAAAGGCAAGGCAAGGCTCGTGCTGATCAGGATATCACCGGT
CACTGCCCGGACGATGCCACAATACTTTTGACGGCATAGCGGTAAACAGA
GCATGATCCAGCGAACAAGACATAAAGAAAACTACCAAAAGCTTGCTGCG
ACACAAACCCCACTCGTAACCTCACCATGATTAAATGCTGATCCCCACGA
TCGTCCATCCTAGAAAACCCAGACCTGAAGTTTTCCTTCGAAGCCTGGAC
AACCGGGAGGAGCAACACACTGGCAATGCCTCCGAGGAGTGGAACCGCGA
CCAGAAGTTGTCATCTACCACATCCAACCAAGGCCGGAAACAGATATTTA
CCTGGAGTTAGCCGGGCGTCCCACTGCCCACATCAGCCAGTCAAGCCCAC
ATCCCATCACGCCACCCATGGCTGCTGCACCACTGGCATGGCCATGCTGA
CTGTCAACTCGAGTAAACTGACTCGGGTCTTTGCATATATCGCCGGAGAA
ATCGTGCCAAGAAAACTAACCGCAGAAACATATCAAATGCTCATACAATT
TTTTACCCTCTGATTTAACTTCTTTAGGGGTAGTGGATTAGCTTTTATGT
GCAAAGGTTAAACAGTTTCATCTGATTTATTTTTCTTGACCATAAAACAG
TAGGGGAGCTACCCACCTAGGAATTGGATCTGATTATTGTTTGTAGCCAC
ATTTGAATGTACCGGTTGTAGTTGGTTTTATACCTTATATACATCTTACT
TATTGTCAGAGAAACCTAATTCATTATACAACTTCATTTTTTGGGTTCTA
CAGGTATTGGAGGGATTAGAAATAGCTAGTATCTGTGTTGAAGATATGGA
TGAGTGGCTTGGCATTTTCAATATCAAGCTCAGGCATATGAGAGAGGATA
TACAATCTGTAATTTTCCTTACCTCTACTATATTTGTGAACTATATTCTG
TTGGTTCTCTGGATATGTTATGTGTGTGTCCCTTCTCAAGCGAGCCTGTT
CAGAGTACTTGATACATCTAAATGACAAAGTTTGTGACTTTCCTAAGCGA
AAAGAGAGTTTAAATACATTCATTGTAATTTTCACAGATTCATGCCTTTG
TGTATCTTATTATTCAGATCCACAGTACCTGGAAATCTAAAAGTTAATAC
CTATGATGTGTCTTATCCTTAAGAAACTACAAATGGATTTCTTTTCACAT
ATATATTTTGTTGTTAGAATTTTAAAATCATAGTTAGTACTTAGCAGCAA
GAATACTGAAGATAATCAGACTGGATTATGATATCCAGTTATTGTTTTAA
AGTGAGTTTTTTACATGCAGTTTAAGTGTGAGTTGGAATAAATGAGTAAA
ATATTTATTTCATCACCTTGAGTATAAGATTAACTAATGTCTTCCTTTGA
TTTTGCAGATAGAATGGCGTAATAACAGGTTGGAGCAGCAATCTGTGAGT
AATGTGGCATTAACTGAGGAGCTAGACAAATTGCTTGTATTCTTACAAAT
ACCACCAGAGGTGGGCACTGAATAAACTTACTACTCTTCTGCATTATATC
CACCTATGATATGTTAATTACCAAATTCATGTGATTAATCATGGTGTAGT
TTGAGGAATCATTGACTGGAGGCTCATTCGACGAGGGAAATATGGTCAAG
AACGTAGAAGCCTGTGAATGGTTGACCAGTGCTATAAAGAACCTAGAAGG
ATCCAATCTGGATCCATGCTATGCGAAATTACGTGCTGTATGTTCTACCT
TTTCCTTGTATTATCATTATTCTGTCCTGGTGATTACCTTGCTTAGGTTT
TTATCCTTTAGTAGCTATTGTGCATCATTATTTAGATTGAACAGAAAATT
GTTGAAGAACTCCATCTTCTGGTAAGTTACCAACTGATTTGGACCACACA
AAAAAAGACGAAGGCATAATATGTAAACGCTGGATGAATCTCCTAGACAC
TAGTAGAAACTTATAGCAAACAAGCAGACTTCTCAAATGGATGGTTGCTG
AAATGATATTCACCTCAAAGAAAATTAGGCAAATATTTTAGAATCGCTTC
AAAGCTTTACTGTGTCCTTTTTTCTTAACAAAGGAGATAACAGTGTTCAG
AAACTCGGTCCTTTTAGTTTGGTATTCAGTTCTTTACAAGCCAAATACTG
ACTTTTTTTCTAGTTAACTTTGCTACGAATTTTAGGTAGTGATATCCTAT
CAGCATGGAAGCTGCAACTTCTTTAGCTTTAAAGGTTATCAAAATAATAT
TTTCTGAGCCAATGTGCATTTTCTGTTGAAATCCATACAGGTTAGAGAAA
AACGTGCAGAATTTGTACTTCTGAAGTGCACATTTGTTCGGAGGGCAGCA
GAATTTTTAAGGAATTACTTTCCAAGTTTGATTGATTCTATGCTAAATGA
TAAAGGCAACTTCTCTCAGGTAAAACAGACTCCTATAATTGCAACTTCGA
TTTTTGGACCAAAACAGCACTTGTGTGAACATAATTGTTGAAACTTGCAG
AAAGGGCAACTGCAGAGGCCTGATCATTCTGATATGAGGTACAAATGCAG
GAAATATGCAAAGCTTCTACAATTCATCAAGGTTACTTGCATGTTGTCTT
GGTGTGAGATCATTATCCTTCCACAAATAGGGAATGATTAGCTTACTTGC
ACTTCATACTACATTTTTGTAGAGTCTGGACAAAAGTTGTATGGCCCCTT
TGCGGAAAGCTTACTGTCATTCTCTGAACTTGCTAATTCGACGGGAGGTA
AGGTAGCTAATGTGCTTTCTCGAGTGAAACCTTTACTGTTCACATTTCAA
GATACCTGATGCATCTATTTGGTAGAGATGATATGACCATGCAAAAACAA
CGACCCTGTTTTCCATTTTGATAAATGAACATTTTTTTGGTATATAGCAC
AGCCTATAGGAAGCTATCCTCCAGAACATTGAACTATTTATGTAATGCAT
AATACAAACTTAGTTGTTTGGTGAGAATATTGAGCTACATACAGCAAAAT
GGAAAGTAAAACTGGATATAACATGTGCAAGTTTATTGCAGGCCCGTGAA
TTTTCTAATGAGCTGCGATCTAGTTCAAAAGCATCAAAGAGCAGCACACC
ATTGTTTGAGGGTCCTGCAGGTGCAAATCAGCCATCTGGTATTACAGATA
GTTCTGCAGATGCATACGCGAAGATGATTACTGTATTTATTCCGTTTCTT
GTTGATGAGGTTGTTTGTATTTCTACGCATTTTTATGTGAAATTTAAATC
CTGTTATGTTACTATATTTCACATGTAATATTTTTTATCATGCATATCTA
TGATGCAGAGCTCGTTCTTGGCACATTTTATGTGCTTCGAAGTTGCTGCA
TTCGATGATTCAGATAGCGAGACAAATAGTCCTTCAGAAGCCTCAGCAAG
TAGTGTTAAACCAAGTAAATGAACTACTAACAGTCAACTTAAACAGTGTT
CTCACGATGATTAAATTGTTCTTGCTTTCCATGATACAAAGCTATCATCT
TACCACTTTTTTCAGGTAATGATGCAGCCGATTTGGGATTGCTAAACGGA
TGCTTACAAGAGTTGCTAGATGGTATTCAGGTTGGTGTTCTTGTCTTCTC
CGCTTGTAAATTTGGAGGCAGGTTAACTACCAAAAATTCTTTTTGGATAA
GCATGAGACTATAATTTGAGCTATTCCAGGCGTGGAGACTTCACATGTTT
TACATGCCATATTTTCAGGAGGACTTCTATGCTTTAGTTGACTGGGCATT
CAAGCTAGATCCATTGACTTGTATAGCAATGCACGGCATAACAGATCGAT
ATATATCTGCTCAGAAGGCAGAGGTTGCAGGATATGTGCCTGTGCTACTT
GATGATTTGGAGACAAGAATAACCATTTTGTTTGGCAGGGTTTGACTCTA
CCTCTAGGCAGTCGTCATTCTGCTCGAGACTCTGTTTGGTTCCTTAGTGT
TTATTTTTTTTGGGCAGGGCAGTTCGTAGATGATGCATGTTTCCAGATCG
AAAAGTATGAGCGCAATGTTAGACAAGTTGGAGTAGTGCCATATATTCCC
AGGTACATTATTATTTGTCATGATACTTCTGTCTATATGTAGGTTTTCAC
TGTTTCCTTTTCTGTATATAGGTTTTCTCAACTTGCAGCGCGTATGGAGC
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TATTAACTAAGAAAAAATTATTTGTAACTAAGAATCATGTTAGATGATAA
TCACTGACGGTTCTGTTCAACCTACTCCAATGCTACTAGTCGGAGCTATA
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AAATAGGTGACCATTATGTTTGTGACTCTGGAGAAAATTGCTCAAGTAGA
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ACAGGTTTTTTTCCTTCCTTTGTGCACCTTCAATGTACAATTTTTGTCAA
GAGTTAACACCACTTTTATTAAGAATGCCAGATATCTATGTATGTATATC
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TATACAGTCTATATGATTTAGCGAATGTTGTGCCAACACTTGCTAAATAT
TATCATCAAGCTAGTGAAGCTTACGAGCAAGCCTGCTCGCGCCATATTAA
TCTTGTTATATATATTGTAAGTTTTTTGTAACTCCTTTTGGCTCCACACT
GCCTTTGTCCATGTATACAGTGAGGCATTTATATTTCCTTGTTCCAAGTT
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ATAGCGGCATTCAATCCTGCACTTGAATTTGAAATTCACAATTTCCATGC
GGCTCTGATTACATGCATGTCTTGATCACAATAGGAGCTAATCTTTTTAA
TCCATTTCAGTCGTGGTGCATATCTTGATCACTTATGTACCCTCGGTAGA
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GCTTTTTTTAATCGAAACATGATATTATTGATGCTTTCCCTAATGAAACT
GCTTATTTTTCTGTATTCACATAGCAAGCTGTAATATGAAATCTCTCATG
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CATACAAAGTTTCCATACTGAAGATTAGTCCATAGTGATCATTTTGTTAA
TATTTTACATGTATCTCTCTTATGACATAATTGTACAGATACCGTTCCAA
GTTGGAATGTCAAAGGTAGATTTCCGCAAGATGCTGAAGTCCAGCCTAAC
TGGTGTATGTAAAGAGTACAATCATGTTTTTTCTCTCTTTCCTATTAATT
ATCTGAACTGATCTCACATATACTTTTTGATCATTTCCATTTAAATTTGA
TGACAGCTGGACAAAACAATCAATGCAATGTATAGAAAACTACAGAAGAA
TATGACCGCGGAAGAGTTGTTACCTTCTTTATGGGAAAAATGCAAGGTAT
TCTATCGTCTTCAATTCTGAGACTAATAGATAAGGAGCAAGTGCCAGTTC
CGTAATGGCACATATTAGTTTCATGTGGCTGGTGCATTTGATCGGTGCAC
CTGGTAAAGTTTAGCTTGTAAAGCATGAGTAGTTCGTTCCAAATATCAAA
GAGAAGTAGTATCTTGCTAATTCTATCTTGGGTGATCCCTTGGTTGCAGA
AGGAGTTTCTCGATAAATACACAACCTTCCTCAAACTGATTGCCAAAATA
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TTAGATTGCAACATGTAAGAGTATATTTATTTCACACAATCCTTTGTCTA
GGCATTCTGGCAAATTGGTTGCGAGAGGGATGGGCAGATCTGGCTTCGAT
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CATATAGAAGTACATATCTTAATCAATAGTGGCATCTGAACACTTTTTTT
TGCGTGATGACCAAATGTAGGGCAGTGTTCCTACTAATCTTGCATGTATG
TAAGAAATAAAGTAACACGGTGTAGATTTTTGTGAGACTTAGGACTTAGG
TCCTGCATATGTTCTGGATTTGCACAAGAACATGTCACCTGTATATGCTG
GCAATTGCGCTTGCTAAAATACTTTCACCAGATAAAAAAAAGTACATACG
GTCACACCAGTATGACCGTATGTACTTTGATTACATGACAGTACTAATGT
GGTTTAAAGCTGTCCGAAAATAGTATATATTCTAGGTACATATATAGAGA
AAATGCCTATTGTATATTTCAGTGTAGCAAAGGTTCAGAAGTTTTGAAAA
AAACACTAAAGTTGGAAAAATGTAAGGTGCCCGGTGTCCTGGACCTTTGA
TCGATCGAGCAGGAGCATCTCCGGGTTCAAATTTTTCCCGCGGCTGATTT
TTTACATCTGGTTGGTTCCAAAAGAAGAAGAAAACACGCCTGGTCGATGG
CATGATAATAGTATCGGTAGCAGCAAGGAGTGAGAGAAATACGAGTACGG
AGTTGGGAGAGCAAACTCATACTAAGAGACAAAATTGATTATTTCCCATG
TATAGTAAAACAAGGTGTATCGCTACTAAATCTCATTTACACAATCAATC
AGTACTGCTGCTCAAATATTAATATATACACACGCACACACTAGATTGCT
TCATACCAGCAATAATAACCGCCTACCGTTTCTGGAAGTTCAAGACCTTG
ATGGAATAGCCAAACACGAAGAAGAAGCCGATGACGAAGGCGAAGTGGGC
CAGCACGACGTAGCCAAGGAAATCATGCTGTATTCCCAGACTATCGTCCA
GAAACTTCTTCACCGTGACAGCGACGTCACCAGGGACCGTAAGTTCAGCT
TCATTCTGGCCAAACTGCGACGCGACGACGCCGTAGATGGTCCAGGACAC
AGGGTTGGCCCAGTAGTACCACCTCCACCAGATTGGTATCAACTGCAACA
ACAGAAGCAAACCATCCAAACATCCATCGTCAGTCAGTTGGTCGGTCGGT
CGCTGCATTTTGGGCATGCAACACGGTTAATCGCAGCTTTGCTTACCGGT
CTGGCGACGAGGAATCCAGCAAACAAATTCCAAAGAGGCATTACAAAGGA
TATCAGTATGTTTGCGAGCATCGCGGATGGGGTCAGTGACACCAGCATCA
TGCCAAATAATGTGAAGTAGTTGAAGCTCGAAACAATGAAGAACGTGAAA
TAGAAGAACTTGTCAACTTTCCAGTCATATCCAATCATCGAATAGATGAC
GAGTGTGTATAGACACCCCTGCAGGGTGTTGTAGATCACCTCCACAATTG
TCTGCACAAAATCACACAATGTTGAGAGTCCAGAACAGGCTCAATGCATC
CAGAACAATGAAACTTCAATCAAAATGAGTATCAGATTAACAAGAAATTA
CCTGAGCTAATGCATAGGATAATGGAGAATACATCCCGGCCGCCTTTTCA
CGGTAGAAAACTGTTCGCTCGATTGCCACGACGGGTTGAACTGTGATGCA
ATTGGCAGCCCCAAGGAAGAAGACAGCGGCATACGTGGCTCCAAGTAGAT
TCGACAAATCTTGTTGTTCTTTTCTGCCCACACACAAAAATAATTATTAG
ATAAGAGTTAAATGTATCATCTTTCAACAACACCGCTCTCAACTACAGAA
ACACAACGGGGTCGTACAATTTTGTTCCTTTTTGCCAAAACACCGTGCCA
AATACAAGACCATTGAGCAACGTCATAAGAAAGCGCATGGCGTTGTGGGG
TGGATTCTTCCAATAAGATTTGTATTGCTTCCAAAAGTTTGCAATACATT
GGTTGTAGAAATTCTGAGAATACTTTGTAGGAAATGAGAGATCCTCATAG
CCAGGCGGGGGAACGCTCAATTCCTTAATAAGTTCTTGGTTTTGCCTGGT
CATATTTAACAAACAGAGCTTAGTGTGGATAGTATAAATAAGAACCACTG
CATTTTTGGCAACAGAATATGTATTTGTTCTAATGGAAATGATAGCCTCT
GGTTAAAAGTGGTGAAGAGTTACGTTTAACAACTGAGGTAATTACCTATA
AAGAGCAGAATTAGCATAAATTTCAGCAAAATTTACTTCCAAGCGAGCCT
CAGCTAGAGGGGAGCTAACTTCCAACATCCATGTTGCAGGATTATATCCT
TCTGTGATCTTTGCAACACCTGGAATTGCCTGCAAATACAATTACAAACT
CTACGATTAGTTTTTTTTTTTTTACTTCTACTAAACCTGCAAAGAGTTCA
AGATTTGCTTGGTCTTTAATGGCCTTTCTGAGCCCACTGGTAATATTTGT
AAGCAGGTGTTCAACTCAAAATTAGTGAAATCCTGGCTACCCCCAAACCG
AAACATGTACATAAAGTAACTCACCTCAAAATATTCAACTAGTTTATGAG
AGTGGCGACCAAGTTCACCAGCATAAATAACCTGCCCTCCTCTTTTCATA
AGTAGAAGCTACAAAAGAACCAATTATGAGTTAGATAAAGAGAGAAATGC
ATAGAAATAGAGAGAAGCATATGTATACTGAGAGAAAGAGATAGTACGTC
ATCAAAAGACTCGAATATATCGATGCTGGGTTGGTGGATTGTGCAAACCA
CAGTACGGCCAGTGTTGACTGTATTTCTCACCGCCCGCATGACAATTGCT
GCTGCTCTAGCATCAAGACCAGAAGTTGGCTCATCCATGAATATGATTGA
AGGATTTGATACCAACTCCACGGCAATTGTCAACCTCTTCCTTTGTTCAG
TCGATAACCCGTCAACTCCAGGGAGACCAACCATAGCATTACGCAACACA
TCAAGCTCTACAAGGGTCATTACTTCCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.