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GrainGenes Sequence Report: AE044873

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Sequence
AE044873
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE044873
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGGCCGAGCTCACGCTGACAAAGGTGAGCCCCGTGCGGCCGCAACACAC
TTCCGTTCAGCCGTGTTCCCCTCTCCCTTCCCCTCGTCTCGACCCGAACC
GGTTTCGGGCCCTCCTCGCATGGCCGAGGCTCCCAAACCCTAACCTGCGG
ATCCTTTGCCCCCTAAACCCTTCCCCAATCTCCCTCCTCTACACCCCAGC
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TCAGAGGAGAGGCGGCTGGGAGAGGGAGGTCACAATCTGTTTTGGAGGGC
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GCATGTTCTGAGTTAATCTTGATTGCCTTATTTTCTGTCCATATCCCTTT
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CTGTGAGCAGCCTGGAACTTTGGTAATAGCTAGTATGTGATATGTATTTT
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TTGAACTGAGGGATATATGAAGCAGTGGATGTTTAATGACCTTCTCCATG
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ACCTGAGGAGGTTGATTATGCACAGGAGGAACATGTTGAGTCTGCTGTTG
CAATATTGCGAAGGGTATGTAATGTCAGTTCTGGGTATAGTTTTCCATTT
GCCGTGAACTGCTCACTTTGGATCTGTACATGGATCAAACTGATGGTGTC
TGCTTAGTTATATTTGGAAGGTAAACCATCTCTTATCAGACTTGAGAGCA
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TGCAATGTTATGTAGAGCTAGAGTAGTTATTCAAGTGTTACCAACAACTA
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ATGATAACCAGGCTTCTGAACTAGATACCCTGTTGCTATGTTTCGATGAA
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GTAGATCTAGAGTAGGTATTCAAGTGTTACCAACAACTAAGATATGTCAT
CATTAAGTCTTGCATTATTGTAGAATGATGTTCATGAACATGATAACCAG
GTTATTATAATCAAGTACAATGTGGCAATTACTGATGAAAAATAAAGGTG
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GCCGCTGCGTAGTCTAGTCCATCATTGTTATGCATGCGACATTGCGACTG
AAGAACACATCCTAGACTGTGCTCTTGCATCATGCTTATAATAAGATGTC
CTTTCTTGTGGAGGCTATGTTTTTACAGCTATTATGGTTTGACATATGTG
CCGTACAATTTAAATTTTTTGCTTTAAGTTTGTGCCATGCAATAACCAAT
TTTATTTGATGTTGCTAAATGTGTCATTTTTATGCGAAATTTTGCTGTTG
TCACTAGGAGCGTGAAGAGAGACGCAAGAAATTAAAGAGAGAGCAGCAGG
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CCAATCAAAGTTGGTAGAGGACGGATTAAAGAGGCACCGCAGGGTACGAA
GAATCCAAACTTTCCTAAGGAGTTTCATAATTGTTAATACAATAGATGTC
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TTCTAATATTTGTATTTTCATGTTGTGATTTCAGGCTGGTTGGATTGTCC
TGCATTTGGTGAGCCAATAGATAGAATCATACCCTCCAAAGTTCCCCTTG
ATGAAACGTTCAATGAATCAGTTCCTCCTGGCAAAAGATATTCTTCCAAA
CAAGTAATAAACAAGCAAAGAAAAGCTGGCCGTGAAGTAAGTATTGGGTG
GCTGATAATTTCTAGTGTGTACCATACGTGTGTGCATCCTTCATCCATTC
CCTGCACGTGCACAACACAACTAGCACTGATTTGTGTATAGTGAAGGAGA
GTTTGTATGTCTTCTCATGTGCTTGTCCTGCGTGACTTGCTCTTACTCTT
CTCTGTAGTTGAACACCAGTGCAGCATAAATGAACCCACCAACCAACACG
AGAGATTTTTTTTCGTACATGTCGATTTTGGTAGATTAGAGATAGAAATC
GAGTGGGAAGTGACATAGACTGGAGGTGGAAGAGACATACATGTTAGCCA
ACTTAGTGAGAGTAGCGAATTATCCCTTTTTTTTTTCTGGCGTTAAAAAC
AAGTCCAAGGTTTGAAATAGACCGGGATTCATAAGTTTAGGGTGCCAACT
TCTGGGATTCGAAGTCTGCCGTTTGATTTAGCCAACTTCTACAAGTTCAA
AGTTCAAAATGGACTTTATTCTTTACTTAAACTATGAAGTCTTAATTATT
TCTTGTTTGTACCACAAGCCTTGATACTATTGGCACGCCTTTCTTTTGTA
TTCTTATTAGTCACTTATTACCAGCAGATAATTGTATTTCTGTTTTCAGT
TGTAATTGTTCTTTTTTCCAGATAGGTTTAGTCATTGATCTGACAAATAC
TTCTAGATATTACTCACCAGCAGAATGGACAAAGCAAGGTACCAAGCATG
TCAAGGTGAGAGAGTTTAGCTTAAAAAAATCTTCGTATGTTGAAAGAAAT
CCTTCCTAACACGTTCCCTTTTAGATTCCTTGCAAGGGGAGAGATGCTGT
ACCGGATAATGAATCTGTTAATGAATTTGTCTATGAGGTAGTAACAGTAA
TCTTTTTGATACAGATATTTACGTAAATTATACTCTGGATAGTGTATGTA
TTTGCGAAGGAGTCTGATGCTTAATTCTTGATATGATTTGACATCTCATT
TCACCCCAATTGTTTCATATGTTGTTTCTTTCACACCATGCTTTATACTG
CAAGGTGGTTATCAGTGGCACCTTACCTTTAATGATGGACCACTTTGTGG
ATTGGTTGATAATTATCATGTTTTGTGCTATGTGAACACCATCATGTTAC
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GTACCAGTTCGTTTGCAGTTTCAGTTAATTGGAATTGTGCATAGTGGTTG
CATGTTCATCTCTGTTTTCTATAACAATATGTTGGGAGCACAGATTTGAT
TATATACATGTGTACATGGATCTTTATCGTTTTGTAGGCTTCTGCGACTT
TCTTGTTTTCTTAATGAGATACCCTTCAACTCGACGTGGTTAGTTTTTTT
GTACTGTAGAATATATTGATCTGCATGTAGGTCATTATTAACTACCATAT
TCATAGAGTTCCTCATAAGCTACTTAAGTAACATTTTGCTATTTCAGGTG
ATGGCGTTTCTTGAACGACAAAAGCAGTCAAGGACTCCAAAATATATTCT
AGTTCACTGTACCCATGGTCATAATCGTACAGGCTTCATGATTATTCATT
ACCTCATGCGCACACACATCTCTTGGGTTGCTGAGGTAGGGCAACTAGAC
ACTGAATGTGATTTGTTCAGTGTAGTTCCACTGTTTGTCTTGACATCAGT
TCTCTTCCTAGGCAATAAATATATTTGCTCAGAGGCGCCCTCCTGGAATA
TATAAGAGGGACTACATTGAAGCGTTGTATTCATTTTACCATGAGGTTCC
TGAAAATATGATTGTAACATGCCCTTCAACACCAGAATGGAAGAGCCCTT
TTGATCTTGATTTAAATGGTGAAGCTAAGCAAGATGACGACGATGATGCT
GGCGATCTTGCACCAGTACATGTATGTATTTTCTCCCTTTAGGTAAAACA
ATTCCAAGTAATTGTAGGCTGCTTCCTTGCATACTTCACTTTTATTTTAT
TTGTTGGAACACAAACTCACACATCCTATTTTAATGATTGAATTTTATTT
TTTAACATCAGAGATGGGACTCAACCTTATCTTTGCTCATGATAGCTGAT
TTACTGTTTTCTTGCTCATGAGATACCCCCTTTGTATTTTGCAGAACGAG
GTTGAGGAAAAAGTTATAACTAATGATGATGTGCTGGGAGACGCTGTACC
TTTTGATCAGCAAGAGGCTCTGCGCATTTTATGTTATCGGTTGCTTGAAC
TGCCCCTTGTAAGTATTAAATCTTTGTCTCGCCCAGCTTACACTTTTTTT
GTGTGGATTAACATCAGATTGAGGATAGAGTCAAACACCAGTGTTGCCAA
TTGTCGTGTACTCTCCCATCCCAAAATATAAGGCGCACATTTTTCTCCAA
ATTTTAACTTTGACCAATGATTATATAAATTATGTGTCACTTAATCCTCA
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TCTGAGGGAGTAAAGTTTGCTTGCTGTTATTACCACTTTACCAGTTCCAC
TATTGGTCTTGCTTTTCAATTTTCAAGCAAGCAGACAGTACATTCATGCA
GTGTTACTGTCTGTCAAATACCGCAAAAGCATATGAATGAAATCTAGCGG
GACTATTTATGCAAGTATTTGCTCATTTCACTTGATGTGGCAGTTTTACA
TGGTGGGCACCAAAATTTTAACTATTTTACCAAGGTAAGCGAGATTGTAC
AAAGATCTGATTTTGCATTCTCTAAGTGTAGTCCTAAAAGGGTTATTGGA
AATTCAAAGTATATACTCCCCCCGTCCTAAAATAAGTGACTTGGGTTTGT
CTAGATTTGCATGTATCTATACATACGAATCTAGACAAAACCAAGTCACT
TATTTTGGGACGGAGGGAGTAGTACGTATATAATTTTCTATGGCATGGGA
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TTCCATGTATCAACCTTTTTTGTATTCAGTTTTGTGCATGTGGAGCTGCC
AAACGAGTTTTCTTACATCCTTTCTTTGGTTATAGACGCGAGGGCATGCA
CAATTTCCAGGATCACACCCAGTTTCCCTTAACAGGTAACCAACAGTAAA
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TATCACTGAAATTTCTCTTACATGTTCTATATGCATTCTTGGTTATTTCC
TTGTGTAGCTAGGAGCAGGAATTCTTATGAAGCATAATAAGAATGCAAAT
CAGTACCTAGTTTTAGTTTAATGCTCATTTGTTGAGTTAAAAGTAAAATT
ATGCAATTCTGGAAATTGGAGTCTTTGTTTTATGTATCAATTTTCTTTAA
TCTATTCTCATATACTCTGTTAAGTAATTCAATCCAGCTCTCCGATTTTT
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TGGGCGAACCTCAGGTTTTTGCAGGAGGCGCACATGATTATTTTTATACT
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TAGACGCGTTTTAAATAACATTTGAACGCAGTATCGAAATTACGATCTGC
GTTTGCTGTTGTGTTTCTTGCATTGACATCTTCAAATCTCGATCACGTGT
TGATAGGTTTTGCTGAACTTCTTTTGACGCAATTTTTCTAGTGCAGTTGT
TTCTGGTGCCCTGTGATTGTTTGTGTGTTGGCATTGGGTGCGACGCTAGA
TGTTCATGTGACGAAAACGTCGTGAGCCGGCGTAGTCAGTAGCGCGCAAT
GCTGAATGTTTGCCTTGATGCACTGTTTACACAATTCTTGAAATTTACGA
ATAATTTTGATTGATTGTACGTATTTAGTTTTTGTGAAATACCTAAAAGA
ATTGTGCACAGATTGGTAAAATTCAAGAAAACCAGGTAAAACTGTCGACC
TTGGCACTAGTGTCAGCACGGTAGCTTGTTGGTGTTTGACGCATTTGATC
TTGTCCATCCAATCTAATCTGATGTCTCGAAGAAATAAGTAGAATACATG
ATTTTTCTCTCTTAATTGTACATTTAACCCCTTGGTTACACCATAATGGT
TATGCTGGGGTGCCATGCTTTACATCCACAATTTAGTTGCATGGATGACA
TTAACACCGTGGATACAACACACAAGTATATTTTTTGGAAGATTCTGTAC
GAATTGTCTAAGTTGTTTCAAATAGAAAAATATTTTGATCCTCGCTGTAA
TGGCCAAGAAGGATTTGATTTTGTAGTGGTGGTTGAACTATGGGCTTTTG
TATTTTTCATTCATTGGCATTAGTGGGGATTAGTTAATTAAGTGTAAATT
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TTTTGTGAAGCTAATGTATCTAGACATCTTTTAGTTTGTATATTCGGTGA
ACCTACACACTAAAAGATGTCTAGATACATTCGCTTCACAAAAGCTAAAA
CATCTTATATTTTGAAACAGAGGGAGTATAATTGTTTCATATCACTTTTC
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GAGTAGTATATATATTGGACAAAATGTGCATTGTACAAAAGTATGTTTGC
TAGTGAAAAGAAAGAATAGTAGTGTTTTTAGCTAATCTTTATAAGAAAAC
AATAGTTATTTCAAGGGTATGAAAACAAGCAAGGTTCAGCAAAATTTCAT
TGTTTCTGAATTTTTATTATCAATATTGGTTCCTGGTGACCTATTGTTTT
CAAATACTTCTATTTCTTGTTTTAATCTAATGTTCTTGTTTCTTGCAATA
GTTATCAACCATCCCTTTTAATCTAATGTTCTTGTTTCTTGCATGTAGTG
ATAATCTGCAGCTACTTAGACAGCGGTACTATTATGCTACATGGAAGGCT
GATGGAACTCGATATATGATGCTTATAATGAGGGATGGTTGCTTTTTGAT
TGATCGGAATTTTTGCTTCAGGAGAGTTCAGATGCGCTTTCCTCACAGGA
ACCTTAATGAAGTAAAGTTCTTCTGATGCTGGAGAAATGATTGTAGTTCA
TTTTTACTTTACAAATTAACCTTGTTTCTTTGCCAACTGAAGGGCCTTCA
TTCTATGACCTTGATTGATGGGGAAATGATTATAGACACAATACCAGATT
CAGGATTGAAGAGGAGGTACTTGGCGTATGATCTGATGGCACTTGATTCA
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GAAGCCAGTTTTTTCGTCTATTATTAATGCTTCCATTCTCTGCTGCGATC
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CATGTTTATTGAAACAGTAATCACAGTTTTCCTTTTATGTTTTCATCTGA
TGTTGTTGATTGAAACTTTGTTGAAGCAACATAAAAGATCGCATTTGACT
ATATATGCTATTTTACCAATACGAGTTACTCGTTTGGTAGGTATTTGTTA
CGGTTACACCTTATTGCTGCAAATTATTATTTGGCCTTAGTATTGCTTTC
AATTCGTGGAATATTTTATGCAGTTGCCTTTTGCTGAAAGGTGGAGATTA
CTTCAAGATGAAATAATTCGGCCACGCTACAGTGAGAAAGAACAGTTTGA
GAGTGGTGCTAAGACCAATCCGATATACAGATATGACATGGAGCTATTTT
CGGTGAACTTATCCAAACATGCTGAATTTTCATGTTTATGTCGATGAGCT
GAATTACATTTCTAATGCTTGGGTGCATTACCAGGCCCGGAGAAAGGATT
TTTGGCTGCTGTCCACAGCAAAAAAGGTACTGAAGGGTTTTATTCCATCA
CTTTGCCATGATGCTGATGGCCTGATATTTCAGGTATGTTATTTGTGGTT
GTACTTGGAAGTTGTAAATAAGTAGTATTAAGATTTCTAGTGCAAGTCTA
TGCGATGCATAAATGCTTAATTAAGAAACAAGCTATAACGGTGAACTATA
CTACTCTTTGTCCCGAATTAGATGGCGCAGATTTGTCTAGATTCACATGT
ATCTATACACTATAACGTGTCTAGATACACTAAAACATGTCTAGATACAT
GACATCTAATTTGGGACGGAGGGAGTATTATTTATTTTGATAGAGTCTCT
TGTGAAACTGCATTGTTACACAATTTTGGAGTTACCACTAACAGTAGAGG
GAGAGAAAAGTATTTCCATTTTACTCTCCCTGATGTTGCAAACTACCGGG
ACTTATAATTATTTGAACTGTTTATTCCAGTTTGCGCCCACTATATTAAT
CATCGAGTACACAGGTAATTTGATTGTGATGTGCCTGGAAGCATGAAAAT
GTGGTATAGCAACATACAGTTAAAGGCTTTGTGGTAGCAGTGTGAAATTA
ATTTAGTAACAGTTTAGCTGTTAGGTGCAAATTTCTTCTCTTTGATCCCA
CCACCCATTTATTTTTCAGTTCACCTCGCACCAGCAGTAATGTTTTTGGT
GCCATGCCTGTTTGGTTGATCTTATCCTTATTTGTTAGGTCCCTTCTGAT
CCTCAGAGATCCACTCCCACGAGGATCTTTGATCTTCCTTAGGGAAGTTA
TTCACTCATGGATCGACCCGAGAAACACTAAAAGCGCTTTTTGAGGAAAA
CTAGACTATATTGTTCCTTGCTATAATGCTCCAGATTAATTCGTATCTTA
ATTTATGCCGTATTACTTTTCCGGCACCCAGTACTGCATCTAGTACTTTT
ATGGGATTGGTTCAAATTAGCCAATATGACGGTTGGCAACAGAATATAAA
TTAACAACATATAAAATCATATATGCAAATACAGGGGCAATATGGCCATG
CTGTTCCATAAACCAATTTCTTATTGGTCCACAACAGAGAAGCAAAATAA
CATCAACATCGATTGTTAATTCTACAGCGACTCGTGTTTTTCCCCTAGTT
CACCACTACTGCTGTAACAAAAGCTACATGACAAAGAACGGATGCTACAA
TCAATTGCACCATTCATTGCTGAACAACCCAACAGGACAAAGTCTGCACC
AAATCTAAATCGAAGGGGGTAGCCGGAGTTGTTTAGATGAACAGACAGAG
AGGATTGCAATGTGTACTCTGTTTTTGGCGCCGACACTGCAGTAGGATTA
GGGCTTTTGATGGAAATGTAGAAGGCCACACCAGAAGTTTGTCTGGTCAC
CATTCTCATCGCTCGTGCTGGCAGCCTCTAGGAGTATGACGGCTCATGTA
GTCATGGTTCGCCCGTTGCCTCCTATGATTCACGGAGAGAGCAAATATAA
GGGGAAAGAAGACAAGAATAGGAAAAAACTGGTACATTAAATTATGGCAA
TTACGGGTAATTATGCGGCGCTTCTCTGGATGGTTTATTTTGACCCCACA
AGAATTTACAGACAGGTCGCTCCTCCTGTCTACTTAAACTGTTCTGTTCG
ACGACTGCTCCCAGATCTCTTTATGGAGCCAGAAGTGTCTGGCTCAGCTC
CTTAGACTATCATAGGATCACGTGGGGAGGAAAATGTGTTAAGAAGCAAC
GAAGAGAGAGGGAGAGTGCCAAGCCTTGACGTGGGCCCGTTGCTATAGTA
CATAAAGTGCTTTTCACATGGACGAGCAGTCTGTTTTAACAATTTCTTCA
CATGACGAACTCATAGAGCAGGTTGGGAATGCCTGTTAGTTTTATACCCC
CTCTGTTTCATTTTAGTCTGCGCATAAGCTCAGACCCGCATACCAAGGAG
ACTGGTGGAGGGCTGGTTTCATTTTTCCGCGGACTGTTTTGCCCTGGTGT
TTCTGATGATCAGAGGCTCTGCATTTGTGGCAGTGCATGCTTGATTGGCT
CTCGTCTCAGACGTTTCGTTCTTGTGGCCCACGTCCCTCAGCATGCTGGG
GGTTCTTTTGGAAACCATCCCTTCTAAAAGGCAACACGCAGAGTATTTTG
GAAAAACTGAAAAAAGCTTACGCGCAGAGTGAACTGGAACAGAGGGAGTA
TATGGCTAAAGGTTTGTAGAACCAAGGGCTGTTATATACTTGAATCTTTG
CAATGACATCCTACCTGTGACCTTGAGCTTCCCTTGACTGTCTGTAACGA
TTTATGCACACTTTCTCCTCTGTCATTGTCGATATTTACTGTTGTTGGGA
ACAATTCGTTTCAGACGTCAAGAAGTACAGTTCTTTTGTCTTGGCTAACA
CTTCCATTCGTTCTTGTTCATTAGGGCTGGGATGATCCATACGTAACTCG
TACGCATGAAGGTCTTCTTAAGTGGAAATACCCTGAAATGAATTCGGTTG
ACTTTTTGTTTGAGGTGTGTATCATCCTTGTGTTCCCAATGTTAATGGTT
AATATTTTTTCATGGTGGTGTTTATTTCATCATACCTAACTTCTGCAGGT
TGGCAGTGATAATCGCCAGCTGGTTTTCCTTTACGAGAGAGGCAAAAAGA
AACTCATGGATGGTTCTCGGATGGTATTTCCAAGTGAGCATTTCCTGCAG
TTTTTTGTTCATTTATTTGTGCCGATCTGACAGCTTGCTTCCAGTGAACA
GTTTTTTGTGTGTTTTCATGCAATTCTGATTATGGTACTCCATTGTAGTT
ATTTGCTCTTTGCCCCTGTATTTCATCTTATGGTGTCATTTCAGTAGGTT
TCCCCTATTCATGCTCCTAGCTGATGAAGCTTATTTTTTCGATATTTATT
CTAGTGTTCTGAAACTTATGCAGATGAAGAAGATCCATCTTCCATCTCTG
GGAGGATTGTCGAGTGCTCTTGGAATAAGCAGGACCAGTGTTGGGTCTGC
ATGCGTGTTAGATCTGATAAATCAACTCCGAATGATATCAATACATATCG
CAAGGCTGATTCTCCAACCCCCTTTTCTAGAATTTATCTATTGTGCATAT
ATGGTTACATATTGATATGTGGTTCTTTTAATATGAAAACATTTATTTAA
TCATTTGAAGAAGACTCAGTAATCGATGGTTGCATTTTGAATCATTTACC
TCTGTAACTTGCATTATAATATTTTATACATAAAGAAGCTCCAGTAGAAC
TTGGCCCCTCAAAGCTGTATAATTTGTCATGGTTGCAGTAGATGCACTTC
AAGGTTATCTCCTTAGCTTGTTAGCATTTTTTTACTTTTGTCTCTTGTTT
AATTAGGCAATTTTTCACTTCCTCTTTGATTTGCTTTCCATGAGAAACAT
ATACCTTGTAGATTTTGAATAACTGGAAGACATCAATCAGTCAAAATGAG
GCAGTGGAATTACTATAATCTTCTGACAGTATTTTTGCGTTATCTGTAGG
TGATGAGGAGCATCACTGATAATATAACCGAAGACAAGCTTCTAGAAGAG
ATCAATGAGATTAGCTCCCTCCCGATGTATGCTGATAGGAAGAAAGCTGA
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TGATGCCACCGCAGTAGTGCTAGAGTTGTTGCAGTAGTGCTAGAGTGCTG
CTACCTGTCTGGGCAGGGGCGGGTTCCTGTAGGTTGTGTAATTAGTAGAA
GTTTAGGGCCGTATGATGATAGCTGGCCAGCCAACTAATTCTTTGCACCT
CTTCTGTGCCTACCGCCTGTATAGTTGTAGCCGCAGAGTAGTCCTGTAAA
TCTTGTAGTATCATGTTCTATATTCTCTCCTATGGTTTTATGTTCATGGG
TGTAGAATAGTCGTTTAACAAGGGGGCATGTTCAAGTATGTCTTGTATTG
CCTCTTATCCTACCTAGAATTGTATGCTACATGATATGGGTTGGCATGTT
CCCATCCATATTTTATTGCAATGCCTTGCTAGATGGTTAGTCCATTGAGA
CGTGT

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