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GrainGenes Sequence Report: AE044682

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Sequence
AE044682
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE044682
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCACTTCCCCTCTGCCTCTGGCCCAAAGCTTTTCACACGCATCTCCCTCT
CTGTCGCGGAACACTTCACACTTCACACCCGCACTGCGCGGCGCAGTGGG
CGAGTGGAGCGAGCCCAAGCGTCGCCTCCTACGCCTCATCATCGTCGCCG
GACGCCCCTGCCCGCCACCGGTGAGTCCAGGTCTCCCACGTTCGCCCATC
AATCTCCCGTCGCGTGGCCTGCCACGAGCTACCACCCGGCGCTCAATTGG
AGCGATTTGTGCTTGTTATAGGGATTTTTTCTGGGCGTTTGTTGGACAAA
TTCGGTCGAGATCTCGCGATTGGTGTGTCCATCGGCGTGGTGAGGGAGGA
GGACGGCCGGATTTGGGGGTGGTTCAGTTGATATCCTCTAGCTGCTGGTG
GTGGTGGTGTGGTGGGGGGCGCTCCACAGTACTCTGGGGAGCGATCTGTT
GAGGGCCGTAAGCAAGCCCGTAATTCTCCATGCATTCTGTCGCAACCGCT
TTTTCCTTGCTTTATTGGTTAGCCTTCGGTTATTAAAGTCTGGTTCGTCT
GATCTAAGTTACTGTAGAAAAGGCATGTTTTTCTCTGGTTCATGATCTGC
GTAAGATGGAGAAACAATGCTCGATGGAGGCAGAAGTGTTTGTCTTGTCA
TTTAAGAGTAATAATCAAACGAACCCCTCATGTGTTATGGTACGATTTTG
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AGCCTAGCCCCATGCATTTGCAGCTGATTTGTGCAACGCCCTGCTGCTGC
TGCTGCTGGAGGTTTTTTGGAGCTGGACAAATGCTAGGGTTGTTTGGAGC
TCATGCTGTATGTATTTGGACCGTGAAAGTCTTTGCCGCATGTTGTAGGT
GCCATTCCAGCTGAGTCGTCCAAGGGATCTTGCTAGTGAAGTCACAGAAT
TGGGTGATAATTTTGATTGGTCATCTTTCATAGTTAAACTGATGGGATTG
GTGGATGTACCATTTATTTGGATCTGAATTTGCCATGACGATTCTTGCAC
TGCCAGCTGGTTGCCTTGGAGGAAGGGGTGTGCCTTGTGCTGCTGCTTGC
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ATCTTTTTTATCAGTTACTCTAATTTGATGGTTACAACATTTCCTTACAT
ATGTTAAAACCATGGTTGAGGTGTATATTCCTTTTTTGGCTGTTCGAACT
GGATCTACTACTGTGGCAGTGTGGCTATCAGACTATGCATTTTTTGATAT
GGCACTCTTAAATTTACATGAATGTGTTATTACCTTGGTAACCACATGCT
CTAAGTGGTACCCTTTCCACCATTTTGGTATTACATAGTTAATTTGAAAA
ATGGATGATACAAGCTGGCTATATTACTTTGTTATGCTGAATACTTGCAG
TTTCTCTTGTAGGAGGACGGATAAAAAAATTAAGGTGGTAACTGTCCAAT
CATGCCGAAATCCAATTCATCAGAGGCTCGAGGTTCCCGCGAAACAACTT
CACCTGCACCATCCACATCATCTTCTAGATCAAGGTATAAAAGATCTCAT
TCTGTTCACTATTCTTTTGTTATGCTTATGACTTATGACCAGTCTGAAAT
TAAATTTTATTTTGCATTAGAAGTTTTCATAGAATTGATTGCTCTGCAAA
ATTAGCTTAGCTTCGTTGACTTGGTAGTTGTTACATCGTCATTTTGCAAC
TATTTGTGTTTATTTCAAAATTTCAAGCCTTTGTTCCTCTCTTTATTGTT
CATCCTTCTTAACTATTATTTGCATATTGCTATATAGGGAAGCATGCAAT
CTTGCAGATGTCGATGATCCTGAAAGTGCAATGTCCACGGTTGCTCGATT
GCTGGAGCAGCTACAAGGTAGCATGACAACACTAGCAGAGAAGGAAGTGT
CAACCAAACAATTACTTGAACTTGCCAAAGCGAAAAAGGAGGCAAGGATT
TTAATAGGTAGCCATTCTCAGGCTGTGCCATTATTTGTATCTATCCTTAG
AAGTGGGGCATCTTCGGCCAAAGTAAATGCAGCAGCACTACTTAGTGCAC
TCTGCAAGGAAGAGGACCTGCGTATCAAGGTTCTCCTAGGAGGTTGTATA
CCACCCTTGCTCTCTCTCTTGAAGTCTGAGTCTGCTGAAGCAAAGAAGGC
TGCTGCTGAGGCTATTTTTGAAGTGTCTTCAGGTGGTCTTTCGGATGATC
ATATAGGCATGAAAATATTTGTGACAGAAGGTGTTGTGCCGACTCTTTGG
GACTTGCTCAACCCTCGGTCACACCAAGATAGAGTAGTCGAGGGCTTTGT
GACTGGGGCTTTAAGAAATCTCTGTGGGGACAAAGATGATTATTGGAAGG
CCACGCTTGAAGCTGGTGGAGTAGAAATTATTACCGGCCTTCTTTCATCC
AAGAATACTGCTTCACAGTCAAATGCTGCCTCCCTCTTGGCACGGTTGAT
CTCTGCTTTCAGTGATAGCATTCCGAAAATCATAGCTGCTGGAGCTATTA
AGGCCCTTCTTCAGCTTCTGAATCGAGATGATGACATTGCTGTTCGGGAA
AGTGCAGCTGATGCTTTGGAGGCCCTATCTTCCAAGTCTATTATTGCAAA
GAAAGCTGTGGTGGACGCAGGTGGCCTCCCTGTTTTAATTGGAGCTGTTG
TAGCGCCTTCAAAAGAGAGCATGCGGGGGGATACCTGCCATTCTCTGCAA
AGCCATGCTGTTTGTGCTTTATCAAATATTTGTGGTGGCACAGCTTCTTT
GTTGCTTTACCTGGGAGAGATCTGCCAATCACCCCATTCAGTTGCCCTTT
CTGACATTCTTGGAGCACTTGCATATACTTTGATGGTGTTTGATGGCAGT
GATGGTAAATCCTTTGATCCAGTTGAGATAGAAAGCATTTTGGTTGTGCT
CCTAAAATCCAACGACAATAAGCTTGTTCTTGATCGTATTCTTGAAGCTT
TAGCGAGTCTATATGGAAATGCTTGTTTCTCTGGCAGACTCCATCACTCA
AATGGAAAGAAGGTTCTTGTTGGGCTAGTCACTATGGCGTCTGACGATGT
TCAGGAGCATCTCGTTCGTGCCTTAACTAGCTTGTGTTGTGATGGTCTTG
CACTATGGGAGGCTCTTGGAAAGAGAGAAGGAGTTCAGTTGCTAATATCA
TTACTTGGGCTTTCTAGTGAGCAGCATCAGGAGTATGCAGTTTCTTTGTT
GGCTATCTTGAGTGATGAAGTAGATGACAGTAAGTGGGCAATAACAGCTG
CTGGAGGTATCCCTCCACTTGTCCAACTGCTGGAAACAGGATCTCAAATA
GCAAAGGAGGATGCAGCTCATATCATATGCAACTTGTGCTGTCACAGTGA
TGATATCAGGGCATGTGTTGAGAGTGCCGGGGCTGTTCTGGCGCTGCTTT
GGCTTCTAAAGAGTGATAGCCCTCGTGGACAAGAGGCATCAGTCAAAGCA
CTCAAGAAGCTTATACGGTCCGCTGATTCTGCCACAATTAATCAATTGTT
AGCACTGCTGCTCAGTGACTCACTTAGCTCAAAGGCACATGCCATTACAG
TTCTTGGGCATGTCCTTGTGCTAGCTCCTCAGAGAGAACTAGTCCAGAAT
GGAGCTCCAGCTAATAAAGGCCTTAGATCTCTTGTTCTTGTTCTTGATTC
ATCAAACGAAGAATCTCAGGAATATGCTGCAACTGTGCTGGCTGATATTT
TCAGTATGCGTCAGGATATTTGCGAGAACTTAGCGACTGATGAAATTGTT
CAGCCATGCATGAAGCTTTTGACAAGTGGAAATCAAGTTATTGCAACACA
ATCTGCTCGAGCTTTAGGAGCACTCTCGCGCTCGGCTAATTCCATCTCGA
AGAATAAGATGTCATGTATAGCTGAGGGTGATGTGCAACCTCTGATAGAG
ATGGCAAAGACATCATCCATTGATGCAGCTGAAGCAGCGATTGCTGCATT
GGCAAATCTCCTATCAGATCTGCAGATTGCTAAAGAAGCACTAGATGATA
ATATTGTCCAAGCTTTGACTAGAGTGCTAAAGGAGGGGAGCTTAGAAGGA
AAAATCAGTGCCTCACGGGCACTTCATCACTTGCTCAAACAGTTTCCCCT
CAGTGAAGTTTTTCCAGATTACTCGTTGTGCTGTTTTATAATTCATGCTC
TGCTGGTGTGTCTATCTGGCATCACTTTGGAAAAGGTTACCAGTCTGGAT
CCACTGGATGTACTTGCTTTGATGGCTATGACGACGGACGGTCATTTTGA
CCCCCCTTTGTGGACTGCCTTTCTGGAATATCCAGAAAGTTTAGAACCTT
TAATCCACTGTATAAGTGTTGGGCTTCCCCCGATTCAAGATAAGTCCATT
CAAATTATTGCAAGGCTATGTAAGGACCAATCTTTTCTGCTTGGTGAGCA
CATAAACAGAAGTCAAGGATGCATCGGTTCTCTTGCTTGTAGAGTTATGG
AATCAGCCAACATGGAAATAAAAATCGGCAGTGCAATCATCCTTGTATCT
GCTTTGAAGGACAATAGAGAATGTTCAATTGAAGTTCTTGAAGCATCAGG
ACATCTGAGGAGTCTAATATCTGCACTCATCAATATGTTGAAGCAGTGTT
GCACTTTAACATCTCTAGACATTGAAGTTTGGAAACCTTACACAGATAAG
AGTTTTTTCAACTGTGATCGGGATGTTGTGGATGTGGCTGAATCAGGAAA
GGTTTTGGAAGAAGCTGTGGCACATTTGCTCTCACTTATTTGTTCTTTTC
ATCTTAGTAGTAAACTTACTGTGACGGATCTTGGTGGTGTTGACATTGTT
TCTGACAAACTTGCTAGCCACATTGCTAACCAACAGGTGCATATTTCACC
TTTTAACTTTCTATTTTCCATTGTGTTGTTATTACACTATTTTTGTAACT
CTATAACTGCAATCACCTGTTGATAAATTTAAGCTTTTACTTCTCTGAAT
TTCTATGCTGTCGGAGTTCAGGGATAGATCATGATTAAAAAAAACAATGC
CATCTTTGTGGGCCATGTACATATTTGGCTCTGCATCGATTACTTCAACC
TGGTATCTTTAAGAGCTAGTTGGTTCTTTTTGGCTCCATGTTTTTCAATC
CATGTTACACCCGTTGGTACCTCAAGCTGCATTTAAGTTGTACAAACATT
AAACTTAAGTACAAAACCAGATTAACTTATGCTCAGAATCCTGATTAGTA
TATACATGTACCAGTAATCTGACATTATTATTAAAAGCACTGGTATGTCC
TTTTTTAATTCCTGATAGTCACATACTCAGAATGAACAAATGTGTCTGCA
TGGATCCCTATAATACACCTCATTGTTAACAATTTGAGGAGACCGAAGTC
CTTGAATGATCCCCAAGCTACAACACTAGATGAATATGACGCAGACACAT
TTTATCAAATTTGTTTGAAATTAAGACAGACTTGACTTATTACCATCTTA
CTTGGTTACTTATAGTTTAGAACCATTACTTTTTTATTCCTTGATTCCCC
AAAAAATCTGTTGGAGCAATTTGCCTCAAAGGGCCCATAACTCTGTCTAG
CCTTTTCTTGCTACAACAAGATGTGCTTCTTGATCAGGATATACTTGCAC
CAGCAGATCATATTCATCGGCACATATCAAATTACTTACATGTTCTTTTT
ATTACCCTAACCCGTGAAACGCCTATACTTGCAAAACATGGTGTAAACAG
AAGTCCAGTCATGCATGCTGCAGATAAAGTGTAGTTACTTTGCAGGTATT
GATCTTTTGGTCAGTCTATGATCAATTTTTTACCTTTGCACTCCAGACTG
GAGTGCTCTGTTTTGAATACTAGAGTTGCAGTGCTTGGGTATGGGATTCA
GCGGTAATACCGATTACACTATTGCATTATTAGTACTACCTCATTATCCA
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AACTATCCTTTATACCAGAGATCTGATCTCTTATACTCCCTCCGATCCAT
AATAAGTGTCGCTGATTTAGTGCAACTTTGTACTGAATCAGCGACACTTA
TTATGAATCGGAGGTAGTACTCAACATGCGGCCAAGTGGCCAGTTCTTTT
CTCAGTTCCACTAGTCCAAGTTTTACTGTTTCTTCTCCCATGCCAAATTT
GAAGCTGTAAATTGCTCTGTGTTACAGGAACAAGATGATGATTCAGAGAG
CATGTGGACGTGCGCCCTTCTCTTGGCTACTTTATTTCAGGATTCAGTGA
TTGTTCAATCTTCAGGAATAATGCGAATAGTTCCTTCTTTAGCTTCATTG
CTAAGATCTGCTAAGATTATTGACAAGTACTTTGCTGCTCAGGCACTGGC
TAGCCTGGTTGTCACTGGAAGCAGAAGTATACAGCTTGCTATTGCAAACT
CAGGTGCAGTTGCAGGTGCTATAGCAATGATTGGACAGATAGAATCTGAT
ATGCCGAACCTTGTTAAAATGGCTGAAGAATTCAAGTTGGCAGAGAATCC
GAGTCAAATAATATTGAGAAGCCTTTTTGAGCTTGAAGATGTTCGTACTG
GTGCTACTGCTCGAAGGTCCATACCGTTGCTAGTGGATATACTTAAACCA
ATGCCAGACAAACCAGGCGCACCTCTTGTTGCTTTGCACCTACTGACTCA
ACTAGCAGAAGGTAGCGAAACAAATAAAGTTGCTATGGCAGAGGCCGGAG
CTATAGATGCTTTAACTATGTATCTATCTTTAAGCCCGCAAGACTCAACT
GAAACTGCCATTATCAATCTACTAGGGATATTATACAGAAACCCTGATCT
GCTTTACCATGGATCCTCACTTAGCACTTTGAATCAACTTGTAGCTGTCC
TACGTTTGGGCTCAAGAAATTCTAGGCTTAGTGCAGCAAGGACATTGCAG
AACCTATTTGGTTCAGAGAGTTTAAGAGATACAGAAGTGGCTAGGCAAGC
TGTTCAGCCATTACTTGACATGCTTGATTCAGGAACAGAAATAGAACAGC
AAGCCGCACTTGGTGCTCTAATCAAGCTTTCTGCCGGGATTATCTCAAAG
GCTTCAGCTATGTTTGATGTAGAAGGCAATACTCTTGAGAGCCTCTATAA
AATTTTATCCTTCAGTTCGCTCTTAGAGCTTAAGAAAGATGCTGCTCAGC
TCTGCTTTGTTTTATTTGAGAACTCAATCATACGAGCATCACCGATTGCC
ACAGAATGTCTTCAGCCACTGATATCTTTAATGTCATCAGGCTCTAGTTT
GGTTGTTGAACCGGCTGTCTGTGCTCTCAGCAGATTACTGGATGAAGAGC
ACAATGCAGAGATTGCTGCGACTAGTGAAGTTGTTGATCTTCTTGTTAGT
TTTGTTCCTGGAACAAACTACCAATTGTCAGAGGCGTCTATTGCTGCTCT
CATAAAGTTGGGTAAGGACCGTCCAAACTGCAAACTTGACATGGTTAAAG
CTGGTGTCATTGAGCATGCACTTGATATGATTCTGGATGTTCCTCCTTCT
GTTAGTTCATCCATTGCTGAGTTACTTCGCATTTTAACAAACAACAGTGG
CATTGCTAAAAGTTCTGCTGCTGCAAAAATGGTGGAACCACTTTTCTTGC
TTTTACGTCGCCCGGATGTTACCATGTGGGACCAGCACAGCGCATTGCAA
GCACTTGTAAATATTCTGGAGAAACCTCAGAGCCTAGCAGCATTGAAGTC
AACTCCCAGTCAAATTATTGAGCCATTAATATCATTTCTAGAATCTCCCT
CTCAAGCAATCCAACAACTTGGCACAGAGGTGCTGTCACATCTTCTGGAA
CAGGAACATTTTCAACAAGATATCACTACAAAAAATGCAGTTGTCCCGCT
GGTGCAGCTTGCTGGTATTGGAATTTTGAGCTTACAGCAAACTGCAGTTA
AAGCACTTGAAAACATATCTCAGAGTTGGCCCAAGGCTGTAGCAGATGCA
GGTGGAATTTTTGAACTTTCAAAGGTTATTGTCCAGGATGACCCTCAGCC
AAGTCAAGCATTGTGGGAGTCTGCAGCACTTGTATTATGTAATGTTTTGC
GCTATAGCTCTGACAACTATGTTAATGTCTCAATGGCTGTACTTGTAAGG
CTGCTGAACTCCACCATGGAGAGTACAGTCACAATAGCTCTCGGGGCTCT
TCTAGTGCAAGAGAAGAGCAATTCACGGTGTGCTGTAGCCATGGCTGAGG
CTGGGGCTGTACGTGCATTGCTGCAGCTCCTTAAGAGTCATCGTTGTGAG
GAATCTTCAGCAAGGTTGCTTGAAGCACTGATAAACAATGCAAGGGTCCG
AGGAACAAAAGTTGCCAAACACTCTATTGCTCCTCTCTCACAGTATCTGT
TAGATCCTCAATCAAAGAACCAGGCAGCTAAGTTTTTGGTGACTCTTGCA
TTAGGTGACATTTTCCAGCATGAAGCACTTGCAAGAGCAAGTGACTCTGT
ATCTGCCTGCCGTGCTCTTGTAAGCCTACTTGAGGACCAACCTACAGACG
ATATGACAATGGTTGCTATTTGTGCACTCCAAAGCTTAGTGATGCACAGC
AGGACAAACAGGCGTGCTGTTGCGGAAGCTGGAGGCATTTTGGTTGTACA
GGAGTTGCTCTTGTCTCCAAATGTAGACATTGCAGGACAGGCTGCTCTTC
TGATCCAGTATCTTTTTTCAAATCATACACTTCAAGAATATGTGTCTAAT
GAGCTCATCCGCACTCTCACTGGTTAGTCGCCCATCTTTCTGCCACAAGC
AGATCTATTTTTCAGTTACTTTTCATGTTCATGTGTGAACTGTTGCACCC
TTCAGTTTTTTCTGTTGTCATTTTGGCTATGATGACCTATATTTCATCTA
ACTGAATTTTGCCCCATAACTACAAAGCTATCCATCAGCATCTGACCCTT
CCAACTGATTGATCAGATGTGTTTATAAATATTTAAGTTGCAAGTACTAA
GTATCCCTTCACTGTTATGTTTGTACTTTGTAATCTAAACTGCAATTTCT
TTTAATTGCCTCAGAAAGTGAGCTGCTCGCTACATCAACTATCAATGAAG
TTATTTTGAGGACCATATATGTGATATTCAGCAACTTTAGAAAGGTCCGG
GTTTCTGAGGCAGCAACATTGTGCATACCACATCTGGTTTGTGCCCTGAA
GGATGGAAACGAGGCTGCCCAAGAGAGTGTGCTAGACACCCTTTGCTTGC
TCAAAGAATCCTGGCCCCAAATGAATGAAGACATTGCTAAAGCTCAGTCT
CTGATCTTAGCTGAGGCCATACCTGTACTACAGATGCTTATGAAGACCTG
TCCTCCCAGTTTTCATGACAGAGCTGAAAGCTTACTGCATTGCTTGCCCG
GTTGCTTGACTGTGACCATCTTACGTGGGAATAACTTAAAACAGACAATG
GGGAGTACAAATCCGTTTTGTTGCCTGCAAATAGGAAATGGCCCTCCAAG
GCAAACGAAGGTAAGTTCTGTAAGATGGTCTTCCCTTTATAATTCATCTA
TGTTGCACTTTTGCTTTGCATCCAGTAATTCCAGTTAAATGAGCATTGCA
AGACTCTGAACATGTTTTAGAGCCGGATAAATTAAACTGCATATTACTGT
TATATGCACTCATTGGCTCGTAGCATATCATTTGTTGGATATGTATAATA
ACTTTCTACTTGATATGTTTGTCGTCTTTGGTTGCTGATATTTGCACTGG
TTGTCAGGTGGTTAACCATAGCATCTGCCCAGTTTGGAATGAGGGATTCA
CCTGGTTATTTGACATCCCCCCTAAAGGGCAGAAACTGTACATCTTGTGC
AAAAGCAAAAATACATTTGGAAAGGTATGGTGTAGTAGCATACTTTCCTT
CTTCCTTTTATTGTATTTTTTTTTGTCTAACCATCTGTCTGAAACATAAC
AACTTTGCTCCAGTCGAACCTCGGAAGAGTAACCATCCAGATTGACAAAG
TCGTCACCGAGGGAGTATACAGCGGGTTCTTCAGCCTCAGCCACGACGGC
GGTAAGGATGGCTCAAGAACGCTAGAGATAGAGATTGTATGGTCAAACAG
ACCGTCCAATGACAGTACGTAGCATGGCTAATTTCATCTGGGGTCGATTA
TTATAGTCCCCGCTTCCATGTAAATGTGCCCCCCATAAACATCTGCATTC
ATTGGATTGGATTGTAGAAATCTACATCGCTTACAACCATCTGCTTCATT
AAATTATTTCGAGGTGTTTCGTATCCCTTATAGATGTAAACGGATTTTGG
ACCGGCTATATTTTTTTTTGTATAGGTGAGGTTATTTCATGTAACTATAA
TTCGGACTAGCTTGAGACGTGTTTGAAGATGCACAGTGTTTGTGCATGTG
CTGGCTGCTTGATGTGTGTGCTCTTTTGTTCTATTTTGTGGGCATTTTTC
TGTTGTAACGTTGAAATCTGTAGCCCCTTTTTGGGCACGTTTGGAAGGAT
AGATAATACGAGACCCTTCATTGTGTTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.