Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE043997

[Submit comment/correction]

Sequence
AE043997
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043997
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGCATTCCTCCCCCCTCGCGACTCCACTCCACACCCTCCCTTCCCGCC
TACGCCTCCCTCTTCCTCACCATCTCCAACCCCTGGCTAAAACCCTACCG
ACCACAAATCCCGTCGCCATGGCGCCGCAGCCGCCTCTCTTCCCTCCCTC
TGCCTTCGACCGCTACGAGGGCCTCCCCCCCTGTGAACCCAGCCGATTCT
CCTCCGACCCTGACTTCGACCTGGGCTTCCTCAAGGCGGCCTTCGACGGC
GATCTCCGCCTCGTCAAGAGTACCTACCTGCCTCCGCCGGCGATTTCTTC
CTTCATTTTCTGGTTCCCGTCTGTTTCCGTGTTGATTTTGGTGCCGATCC
GTTTGCGTCTCAGGGGGCGCCAGGGCGGTGGGCAGGGGGGCGGAAGGCCG
TCGCCTCGCGGAGAAGCTGGGTGCGGTCAGGGACGGCTACGGCAATGGAT
TGCTGCACTCCGCCGCCATCGGCGGCAGCCTGCCCGTGTGCCGCTACCTT
GTCGAGGACCTCCGGCTGGATGTCGACGACGCCGGCCCGCAGGGTGCGCT
ACCTTGAACCCCTCTCCCTTCTTTGCTTAATTATCATATAACGTTGCTCA
GTTTCGAAAAAAGGAGCTGCTTTCACTCACACCCAGAGTAAGCTTAACTT
TTTTTTGGGACTATAGTGTTTTTTTCCTTCAGTGCGCTGAATGTGTGCTA
AGCCTCTCTGCTTTGGTGTCCCTGGCAGGCGAAACACCTTTGACCTTTGC
TATTGGCCGTCAGAATGTGGATTTGGTGCGTTACTTTCTTGATCAAGGTG
CTGATGTACACAAGGTCAACGACAGTGGCAGTACTCCTCTCAATTTCGCT
GCCGCAACAAGAGGTAGCATCTAACTCTACGCCATAAGTATCTATGGCTC
ATACTCATCTTTCCTAAGTGTTCTGTTTCTACATTTGTACTTAGTGAGAT
ACCATATACAGTGAGAGATGGAATAAACATATCTGATTGGACATTCCTTA
TATACAGTGGCATATATCTCAAGAAAAGGAGTTAGGTGATGTGTGCTGTA
TGCGAAAGTTCTTTCCTTTTTTCCCCATAGACATCATATCGTGCAGAAAA
ATAAGTGGCAGAAAAATAACTAGCAGGCCATTGTTTTCTAATTACATTGC
TAATATAGTTTAGCCAAGTCTGAAAAGGTACAAAAATCTGTCCAAATTCT
GCATGCTCGACCAATTCACAAGCAATAATTATTGACTCTGTATTTCAGTA
TGTCTTCTGTCTAGATTTCTAAACTTGTTTCTTATTTGAAGTGTATTACT
TTGTCGAATTTTTTTTGAAGTGTATTAACACATGTTGGATAGGATGGAGA
TAGCAAATCACTGCCAATACAAGGACTTGCAACAAAGAATCTATAGTGGA
CTAAAGATATATCCTGTATTTTAATCCAGGATGCTGTGAAATAGTAGAGC
TCTTGCTCTCCAAAGGAGCTGATGTTGATGAAATACATTTTGGTGGGACA
GCACTGCATCTTGCTGCCAATCATGGGCTGGATGATACTATGAAGGTTCT
GCTGGATCACCATGCAGACGTAAGGGTCACTCCCACCTTTTCTTTTTTTC
TGAACTCGCGGGCTATTTAGAAGGGTGAAATCCACAATAATGGTTGTTTA
CTTAGTATTTCGTAGTTTCTGTATTCATCAACTTTAAACTATTTGAGTTT
TTTATGTGACTAGCTTTGTCTTATTGCATTTGTGGTTTTATTCCTTCTAG
CTTTAAGCTGTAATTAGGTGAAGCCTGACTCTTTCATCTGCTCCAGTTTT
CAAACCATAGTGTCATTAATATTGTCTTGGTAACATGAGCAACATTGTTC
ATCTTTGTTCAATTTTTTTTTTTTTGAGATCTTTGTTCAATTCTCTGATA
TACTGATCAACTTGTAGCCTTTTTTTGAGCACTGAATTTTCCTGTTCCAC
TGCACACGTTCCTCTAGTGACCAAGTGGAGTCTACAGTCTAGAGACCTTC
TTTTAGGTAGGTGGAATCTAGAGACTCGGCTGTGCAACTACAACATGCTT
CTTTTTTTGAGCATATGCAAAATTGGACATGAATTTTCAGCACCATCTGA
GCTCATACTCTCTTTTTTACCAGATTCAAAAAATGAGTTAAGAAAAATTA
GTAGAAATTTGGCATGTAGACTAGATTGAATCATCTACCACCAAGTTCTT
TTTTATTAATTTCCAAGAGTGGGGAGCTAAAAGGGCATTTTAGGTCCTTG
GGTTATTTTTCCACAGCCCAAAAGAATGTATATATTTTCATTAAACATGA
AATCTGAACGTAAGAATGATTTATCTACATGTGAGAATATTTCGGAATTT
TGTTGAATAACGAAAAATTGTTAGTTCGAAAAGGGACCAGATGACCCCGA
ACGCATTATCTATGCATAATCTCAGTGTATAAACTGTACTTAATGCCTTT
AGTTTCCACCGTCCTTGCATGATATAGTCTGACTATTGAATCCAACGTGC
TTAGTAATGTCTTAATGAAGCATCACTTTACTGTATTCATGTGTAGTGCT
TGACCATTAATGCACGCTTGTTTTTAAGATCTAGCTTTGCCTCTTTCATG
GCCATGGTTTTGGTGCTCTGGAAACTCATTCTTGTCCTTCTTTTATCTGC
TTTTCTTTAGGTATTTCCTAAGCGGATTATGAGGATTCATCAACTTCCAT
AAATAATATGAGAAGCTATTCCGTTTATTTTTGCAATGTTTCTGTATGCT
AATTTTTTTTTTCATTATTTTGAAAAAATGTTTTTACACACAGTAGAATA
TATCTGCTATCTATCCTATATATAGGTACCCTTACTGTCCTTTAAGTTGT
ATGCCGGTTGTAGCTAGACGCGATTTCTAATTTCTTATTCTCTTAACAGC
ACAAGATAACTTTGGGTGGTTCTGGTTATACAGCTCTTTTTATTGCTACT
GCTATGTGCTCACTGAAATGCGTGAAGCTCCTGCTTGAGGTATGTCATCT
TCATACATCAACTTACACATGATTGTAATAGTGTAAAGAGAGGATCTTAC
CGCATTGACTTTCTGTATTTTTCCTCAAATGATTATGACATAATTTATAT
CTGTTCTGTGAAACATATAACCAGGCTTTTATGTGTTAGGCCGGAGCTGA
TGTGGATGGTGCTTGTAAAGAGACACCCTTAATGGTTGCGGCCACTGCTG
GATCAACTGACATCCTTAAGTGCTTAGTTCTGGCTGGCGCAGATGCTAAT
GTTCCTGACAGTGTAAGCTGTTGGTACCTTGCTGTTATATGATTCTCTCG
TCCGTACCGAACAGGAGATAGTCTAGCAAACTGTTCAGCGTTTGAAATTG
TGAACTTCAAGAAACATATGTGGATGAATTTGCTTGTTTGGCAGGTCGAA
TTTTTAGTGTTTGTTTTTGGCTATTTAAGATTTACCCATAAAACTATGTT
GTTTCTTACATGAATGAAACAGTGAAGCTACATATCAGATTCAGTACCCT
ATTCTATTTTATTATTTAGAGAGACATGTGATGGTTCTAGACTATGTACT
GTATTTAGAAGAACATCCTTTAAAGTTCAACTTTGAACAATTTTTTGTGC
AGTTAAACACGCAAAGTACTTGTTTGGGTTATTGGATGGAAATATAACAG
TTGTTCTCAACAGTTTGGAGGATAAAAGGAAGAGTTACTCCTTATCTGAT
TCATCCTGGAAGTTGTTGGGATAGTATTATCATCGATGATCACTTATAAT
AACAATGTCATTTTTGAGTTGTGGTTGCTGTCCTGGACAACAATAGGAGA
CACTACTTGGTTTTTTTAACAGTTAATGTTCTGCAAGTCTCTAGAAAATA
TTTGATTTTATACCATATGTGTATGCTCAGCGCTTGTCCTGATACCTTGA
ATGCTACAGGTTTGCTATTTTCTGTTTTCAAAGTGAAGTTAATCCTGCTT
GTTATCTTGGCAGCTAGGACGTGCTCCTATAGAAATTGCTGCTCTTTCTG
GTAGGCGTGAAGATGTTGAGATTCTATTTCCGGTCACTTCTCGTATTCCT
AGTGTACGTGACTGGAGTGTTGATGGAATCATTAGTCATGTAAAATCAGT
GCGCCCAGCGAAGGTATAATTCAGAACACCATTATTATATCTATTTAAAT
GGTTTAGTGTGCAACTGTGTGCGTTGGCTGTTAACCTTTTGAGGTTTTTG
AAATTCATTGTTTTAATTGAGAAAAGCACTTAAAACCACACTTCATTGTC
CATTCTTCCTCTGTTGAATATTTGAACTTGCCATTTTCATTAATTAAGCA
AAAAGAGCTGGCCGGTTAATTAGCGGGAAACCGGCTGAAAACCGGTACAA
ACACCCTCTCAGACCATCATAAATTTTGAACTACAATTGGTGGCTAAGAG
TTAAGTTGATCGTGATTGTTAAGCATGGTTTTTAAGGCGTTAAGGCGACC
TAAGGCGATCTAGGAGTGCTCTGACGCCTAGGCGGGCGCTTTGGATGCCT
AGGCGCCTAAAGCGGTCATTTTTTCAAAACGGAGGAGGGGCGCCTGGACG
CCTAAGCGTCGCGTAGGCGATGCCTTTAAAACCATGATGTTAAGTTTGCT
GATCATATTGCTGCATTCTTATTAGCTCTGAGTCGGTGAAACAAAAATAT
GTCGCATGTGTTGCATGCTAAATCATTTGGGAGCAATAAGATTTTGATGA
AAGCAGTTTCAATATTACCTTTATCTGTTCTGTTGAACTTGTCAACTGAA
GTCTTCCTGACATGACCTTTGGTGGCACTTGCATGCTAAGTTTGTAGTAT
GCAACATGAATAGTGATTTATCGTTATCCCTGTGTGTAACAGCAAGGCGA
TAGTTATTTCTCGTGAACACCTTTTATTCTTGTAAGGAGTAAGCTAGCCA
GGGTTATTCCCAGTTGATTTTGAATCAATTTGGATAGAGATGAGCATTTA
AGGACCAAGATAAAATAATGTACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCGAA
AAGTTGCTTAAATTTAGATTTACCTAGACACTATTTAGTGTATAGATCCA
TCCAAATTTAGACAAACTTGCGACATCTATTTTGAGATGGAGGAAGTACT
AATAAATTGTGAAGAGGTAATAATAGTTTTTTGTTATGAGATTCTGGTCA
GTGAGGATTCTGCAAAAGTAGCCTACCCCAACTTGCTTGTGGACTGAAGG
CTTTGTTGTTCTTGCGGACTGAAGACTTTGTTGTTCTTGGTCATCAGAAA
TTTAGATAATACACGTTAAATATTTGTACCAGAAACAAATCAGACTAACT
TCTGTCAGCAATGTGGATGGGGAGGGCAGAAAAATCATGTGGAAGTTGAA
ACAAATCAAAAGAGTCCACTAACTGCGGACAATATGCTTTATTATTATTT
TTATGGAGAGACCAGGAGACATGAGGTTTCATATTAATTAATTTTCATGA
CCACTTCATAAATGGTAGAAATATTGCATTGATTCGCAGAGAAAGTAGTT
ATTACACTTGGGAAGGGATTTGGGGTGGTACTGAATGTTTGTATCATTTG
ATTGTTCTCAATGTTTCAGAAAGACATGCTTGCTAGTGCAAAATTTAGAG
CGCACGAGGAGTTCAAGAAGGGGAACTATTATGCTGCAGCACACATTTAT
AAAGAGGTATTTACTAATCTTGCTTGTTAAAGTTTATGGACTTATTGATC
GCTCAGAAAAGTTCAAGGTCCTAAGATAGGCTATCTTGTTTGTCTGTTTC
CTTCTTGGAATGGCATGCGCTATGGAAATTATGCTTTTTGCACACTTTGC
AGACATGTTAATGTCGCGAAGTTTATAGAATGCATATGTGCTAATGTCTC
TGATCCCATCCTGTTATGCTGCTGTTCCCTCCGTCTCAAAAATTTAGACA
AGTTTGCGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTACTTCTGTAATCTATTG
TAGTGCACGCTTTGATCCATGATGCAGTTGGATCAGGGCCAGAACAAACC
GTACCATACATTTAATTGGACATAGGAGGCCATGCAGCAGCACTAGCAAC
AGCATATAAGTGTAGGGGCAGGATGAGACCAATACTAGCAGCCAGATTAC
AAGGCTATGAGGGAGAAGTTGACACCTAGATGATATCTATGAAGAATAGT
AGAAGAATGGTTTTGGAATTGGCTTAGAGATATAGTTCGTGGAATTAGCA
AGTGGATTCCATATGTGTCAGCATTCTATTAGGCATTCTGGTCCTGGTTG
AATCCTTCTAGATGAGTCTTGTCAGTCTATAACATGGATTCAGTTAGGAT
GTCTAAGTAGCCCTTATAAACGAATGATCTGTATGTGGTTCCAAAGAAGG
CGTAAATTACTCTAGTTCTTGTCTAAAGTTCCTGTCCCAGTATATCTCTA
TTATTTTTTGCGAAATTCCACCAATTTATTAATAATCATCAATAACAGTA
CAAAGAGTCCCAAAAGTAATAAAAATTACAAATAGGTCACTGGACCACCT
AGCGACGACTACAAACACTAGCACGAGCCGAAGACGCGCCGCTGTCCTCG
CCCCTCCATCATCGGAGCCAGGCAAAGCTTGCCGTAGTAGAGCTTGTTGT
AGTAGATAGACGGGAAGTCATCGTGCTAAGACCCCAAAGAACCAGTGCAC
GTTGCTGAAGATGACAATTGTAAATCAGAAGAGACTGACCTAAAGTATAC
CTAGGCATCTTTCGGGCCGGGCTGGAGAAAGCCCGCCCGCACAAATCCTA
GGCCCGAGCCCAGCCCGGCCCGACTGTCGGGCCTCAAATCACGGCCCAAG
CCTGGCCCGCACTGCGCAATTTCCTCTGGCCCGTTGGTCCGGGCCTTCCC
TTAAAACTGCGTTTCCTCTGGCCCGAGCAGCCTACGGGCCGCAGATCTGG
AGCCCAGGCCCAGTCTGCGGGCCTGAAAAGCCTGGCCTGTTGGGCTTTTT
TTGGGCCGGGCTGGGCTGCCCACGCCCAGGCATGTCCTCAAGCCACACCA
ACGAATACGAAAAATGGCCGGATCCCAAGAGATCCGCCGAACACATGATT
CCACGCGCCCTCCGCCGGACACATGACTTCACGCCCCCTCCATCGACGCT
AGACGCACCACCGGAGCGAGGATAGGGCGGGGAGGACCATATTCTGACTT
CAGGACGTAGCCGCCGCCTCAACATCTCGAAGAAGACACTGAAAACAGCC
TAAACAAATAACATGAACCTTCCCGCCGGCGAGAGGCTGTGGTCTTCCAC
ACCTCCAAGGCACCAAGGCCACCGGAAGCGGAGCGGACCGGCGACGTCGC
CGGCGAGAGGGACGAAGCCCTAGATGGGTTTTGGAATCGCTTAGTTCACC
TCTCCTGTATCTGCCCGTGCGTACCGGTTCAAATACGATGTCTCCCAGTG
TATCTCTATTTGCCTGCTTAACGAACCCTATTTCTTTCAAGCCAAGCTGT
CTGGCCATCTTCTGTTGCCAGTTACCCTGACACCTACTTAGGTTCACATC
ATTTGTGAGACTACGTTGTAATGAGTTTTTCATGTTCTTTGTTATGTTAA
AAAATCTGTGAACATTTTACTTTTAGTATGTACATGTGCTCTAGACAATC
TCTGTATTTCCCAAGGGTGGATCCAAGTATCCAACTACTACCTCTGATCC
AAATTAGTTGTCGCAGGTTCATTGAACCTAGACAGATTTTAGGCAATATT
TTCCCTAACTCTACGTCAATTAATTTGGGTCGGAGGGAGTAATAAAATTT
CTTGCTCACAGCATGGCAGTGGCATGTAAACTTGGGCATCTCTTGTCAAG
TTTTTTTTCTTTGAGATGGAGCACGTTCATTGCATTAATCAGAATCCAGA
GTGGCTGAACAGAATCACTGGTTACAAGCATACATGTCTGATGTACTGAC
TGATGACCTGTCATTGCACGTGAAACTCATATGTTAAGATGTAGGAGATG
CCACCTGCCCAGGCCAATGGGAAACACGTACAGTACTACTCTAGAGATTG
GGAGGAGTGGTAGATAGGTTAATGATTGTCCAATAGTAAATGGTATGGTT
TGATGAGGTTGGGTCTTCCTGGAATGTTTTGCAGAATTGTTGGTAAACCA
GTACCCAATCATGAGAATGTTTATTATCTGGAGACCCGCAAATGAACACA
CAATCTAATTTTGTACTGTATTCTTCTTTATAAATTTCCACTGTTTTTTC
ATTCTTATTTTTGGATCTCTGTATTGATTGGCTTTTATCTTTTTTGTGCT
ATTTTTTTTTTTTTGACTGAAAGGCAGTCTGGCCTTCTTTTCATTGATAT
TAGGGAGAGAGTACAAGATGTATGGGGTAACCAAAGAAAAGGAAAATGCT
AAAATTAAACTAATCTAGCAGCTAGGGGTTACAAGAGAGAAACTCAGTCT
GGCTCTCTCGGTCTCTGGAGCAGGTCAAGAGCCCGCGATCTTCCTGCATC
CTTCCAGTTTCTTGCCTCCTCAAGTATCTTGTCGTGAATAGCTGCTAGAG
ACGTAGCTTTGTTTTGAAAAATTCTGGCATTACGCTCTTTCCAAATGTTC
CACCAGGTGAGCTGAACCAGCGGTGTCCATTCTTTCCTTCTTGCTGATGG
TTGGGCCATGTAACCACTCTTTTAGTTGCTTTGTGTCATGCTTCGGTGGT
AGGGATAGCGGCAGCTGCGCCTTGTGCAAGATTTTCTTCCAGAGCCTGAT
AGTGACGGGGCAAGTGGCCAGCAGATGCAGCGCGGTCTCCGGTTCGCTCA
GGCAAAGGACGCAAGCAGCATTGTGAGGCTGTTTCTTTTTTCTCAGGCAG
TCTGCAGTGTGGCATTTGCCCAAAATCGCCAGCCAGGCAAACATTCTGCA
TTTTAGAGGAGCTTCACTGTTCCAGATCAGCTGTCGAAATTCACGCTTCA
TGGATCCCTCAAACTGAAAGTCGTAAGCAGAGGTTGCTGAATACTGTCCA
TCCCTCGTCCATTTCCATATAACCTCGTCAGGCACGTCATGCCGCAACTG
GATATCGGCAAGCTTGTCATGTATCTCCAGGAATTGGGAGAGGGCCATTG
TGCTGAGATTATGTTTGAAGTGCCGCTGCCATTTTCCATTGGCCAGGGCC
TGTGCAACAGTGAGGTTGCGCTTTGTGCACTGCTGGAACAAGTTTGGAGC
CATGGTCGCGAGGTTCATGCTTCCAAGCCAAGGGTCATGCCAGAAGTTAA
TCCTCTGTCCATTGCCGAGTTTAAATTCCACAGCAGCGTTGAATAGGTCA
TGTGCACGGTCGTCTCTTCCAAGTGGCAGACCAAGCCATGCCTTGCCAGT
TTCAATGGATTCAAATTTTGTACATCCAGGAGCAGATTATGACTTCACTG
AGCAGTTTTCCTCTGTCATGCTTATGCAAGTTATACTGTAATTGATGACT
TGTCTTTACTGCATACTTGTTATCCAGTTAGTCATAGTGATTCACCTAAG
CACAAGCAAAACCTGCGGGCAAATCTATAAACAATGTGCAGGATTGTGCT
AATACTTCTTCCATCTGTTGGCTGTAGGCAATAGACCTTGACCCTGGCAA
TGCAACCTTGCTTTCAAATAGGAGCCTATGCTGGCTTCGCTACGGTGATG
CGAGGCTGGCCTTGAAGGATGCTCAAGTGCTCAGGATGATGCGACCTGGC
TGTCAAAAGGCCTGCTATCGTGAAGGGACTGCTCTAATGTTACTGAAGGT
GCGGAAGATGCTTAGTTCAGTTCTACGTTTTCTTGAAAAAACATTTTGAT
GTACACAAATTCTGCATTTTCTGTGACAAATCTTTTTTTATGCACGTACT
AACTCTTTGTCCCCAGGACTATGAAAAGGCATGTGGTGCATTTCTTGATG
GTCTTAAACTGGATCCAGGGAACGTTGAGATCGAAGATGGGTTACGGTAT
CCTCCTTGTCCCTTTTGGCTACATTCAAGTCTGGGGAACAGTGATAACCT
CTGAATTCTCAATTCTTGTCGCAGTGATCTTTCACTCAGAACAGTCTCTA
GGCATCTTTACTTATCATTCAAAAATAACAATTTGCAGGGAGGCTTTAGA
ATCCTTGAAGACATGTCGCAGTAGCCTTGGAGAAGATTAGCTGGATCAGC
ATGGCCAAAAACATCGTCAACCATTATTTACCTGATTTACACTGCTTACT
GGAGAAATGGACGTGCCCTGTTTTGTGTCCCGTAGGGAGTCACGGAAGGC
TTTGAGATTAGGTAATTTTTGGATGGCCTTTTCGCTGATCATCATCAGCA
AGATCGTGAGAAACTACGAAGCCCCTCTCCTCACTGGATGCGCGAGACCA
TTCCGTGATTATGATTTCTGGAGCGAACGTTGTTCTTCTGCCTGCAGAAT
TTTTTCGATGGTACCGTTGATGGGAGAACGTTTCTACCATGGACAGCTCC
GTCCAGTTGTTTGTGATTTCTTTACATCCTCTGAGTTGAGCATATTGCCA
GATTGACGTTGGTGGTCTGTGTTTCGCTTCGAACCTATCGGCTTGGTTTT
ACTCGTCTTTAGTAGAGTACATGCTATGTGCATGCGTTTACGTTTTTTAA
AAAAAAAATCACCATGTCATCATCCAGTTATTTCTGGTTACCCATATTAA
TGTTCTCAACTTTGTCTAGATTCAGATAAATCTAGTCTAAATCATTAACT
AGGTATATTTGAATCTAGATAAAGTTAAGAACAATAATATGGGCGGGAGG
GAGTACATATTTTTTCCCAAATAGAATCTGAGGACCCCTTACATCCTTAT
ATGTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.