Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE043874

[Submit comment/correction]

Sequence
AE043874
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043874
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAACCAGAGGAGGGTTTGGCGCTCGTCGCTAGGGTTTGCGCAGCCATT
GGAGGAGGGTACGTGAGGGACCAAAACTCCAGCTCCAGCGCCTCCGCACC
GCGCCCGTCCATGGATGTGGACCCATCGCCGTCCCTGCGGCAGCCGCCGT
TGTCGACGCCGGGCTACTTAGACCCGGAGTCCTCCCGCCGCCGGGAGGAG
TACCGCCGCTACAGGTGAGAAATGCGCGCCATCTTCCCCTTCCGCGTCTC
GATCTCGTAGTTGGGCTGGTTCGGTAGAGGGTTCGAGGTGCGCCTGGTGG
CTGGCCAGTAATCCAGTGGCGAAATGGAGCGACTGTGAGCGGTGAAATCG
ATGGAATTCAGTCGTTGTAGATGCTAGTATCCACAAATGATTGATTCATC
ACTGAATTAGGGCACCTTACTGCTCGTTCCACCTTGGCAGCATTGTTTCA
ATTATCCGTTGTGATTAGACAGTTGCAGCTTGTTCTCAAGTATGCTACTG
AATCAGGCCATATGCTACGTACCGTTCGTAATTTCCTCAAGCATTTAAGT
AATTCTGTTCTGATGTGATCATTTAATTTTATGGATCTGTGAAGCATGCT
TTGGTCGAGACTCGGTTATTTGGTGGTCAGGAACATTCTAGAAATCAGAC
AACCCAATTGGTGGTATTGCATGACAATGCACAATAAGTGTATGTGGTAT
CTGTCACCATAGAATCACCCCCTCTGTGCTTGCAAGTGCGTGATCACTGA
GCACCTGTACCATTAAAGATCTCTGCAAGAAGATACCGGTACTCTAGCTC
ATTTCTTCGCCAAGTTCCTTTTTTTGTATGGCGGAACACTTAGCGTATCT
TAAAATGCAGGGAAGGGTTAATATAACCTACTAGGGTCAAATGTGAGAGC
ATGCTACTTCAGTACTTCTACTGGGAGTAGTTGCTACACTAGCTGATTTG
TTGTTTTATTTTGCAACTTGCTCAGAAAGAGACTATCTTCTTCAAATGAC
TCCCCACTGCTGGGGAGCTCGGTGTCCAGATTGTCAGAAGCAAGGGTGTT
GCATGATGGAAGCAGCATACCTAGGCGACCAAATGCTGGTCTACTCCTTG
AGGAAATCAAGCAGGAGGCTGCTGATTATTCTGACATGGACGGTTTGGAT
GGATCAAAACTGTTCGGATCAGCGAAAAGAAGGACATCGTTGGATGGTAG
TTCTGCAGCAGACGCAGGTTTTGTTTCAGGTAGAAAGGCGGTGAGGTCGT
CAATGAATCCGGTCAAGCTGGAGGCCGATATGCTACAAGAAGGAGAAACA
ACTTTTACAATGTTTGCATCCCTTCTTGATTCTGCGATACAAGGTCAGTG
TAGCAATGTAATTTGGCTAGTGAGATTCTTAGTATCTATCATGTATTCAT
GTTCTTTGCTAGTTGATAGTTCTTAATTTGAATGTTTTATTTACACATTG
TAATTATTATTATTGCCGTATTATTATTATTATTATCAACCATGTTTAGT
TGGTACATGTCATTGTGCCTCCTTTTGTTTTCTTTAATCATCACCAACAA
TACAATTACCAAAAGAGCCATCGCGCAAACTAAATTGCACAAATCTTCAA
GTAGCACAGTTAACAGCGAAGTGGTGGGCGCTCGAGTCATCTGTCAATTT
GCTTAAGAAAATGTGATTCCTTCTTCAATTTCCTGACAGCACAGAAGCAT
AGTGATCTATTACCAACCAGATTAATAGCATGACCAGAAACATGCACATT
TGGTTGGTGAACCCGAAACTTTGAATTGGGTGAATGCATAATATGTACCT
ATAATCCTTTGTTTGCATGGCATAAGAGTAATCATTTTTTACTGTCATTC
CAGCTGATTAAATTTTCAAGGTGTCAGTTGTGTTAACTGGTGTGTTCCTT
TGTTGCAGGATTGATGCCCTTCCCAGATGTGATTTTACAATTTGAGAGGA
CATGTAGAAGCGCTTCAGAGTCGATAAGGTTTTATATTGCCTTACACTAG
TAATATTTTCCATTGTATAACTTCCTGCGATTGGCTAGATTCTATTTCTC
ACCAACTCCTAGGTGCAACTCTTGCCACATTTAAATTTCCTGCTACACAA
TACAACCATTGTCTTCATCATACAATGATGCATAGTACTTATGCTCCAAG
TACTTTTTTCAATACAATAGATGCTTGTACCATAGGTTGGATGCTAATAT
GGGAATATGTGGCTAATGCTTTTAAAATTTTCAGGTATGCTGCCACAGGA
AAGCTTCGGATGGCAGAAGATAAACTTATGCAGCAAAAAGCACAACTGTT
ACTAGATGAAGCTGCTTCTTGGTCACTTCTTTGGTACCTCTATGGGAAAG
GTAATAGTTTTATGATGAATCATTTGAATATATTCTCATATAGTCCATTT
TTCCTTGCAGTAGCAGTGTCTATAATCAATTTAGTAAACTGTTTATTGTA
TCCTGTATGACATTTCATGTGCTACATCACAGCAAATGAGGACCTTCCTG
AAGAGCTATTCGTGGTAAGCTGCACTACTAGCTGTAAATATACTAAAATA
TGTTTTTCCTTTCACTTGTTCATTGTGTATGTAGATTCATCTAAAGGATG
CTATTTTCTGTTGACAGTTACCAACTACATCCCATCAGGAGGCTTGCCGG
TATGTTGAAACAGATCATACAGCACAATTGTGTCTGCGGATTGTCCTTTG
GCTTGAAGGACTTGCTTCGGAAGGTCTTGATTTGGAGAAAAAGGTAAAAG
ATCCATGCTAGTTTTTAAATTACGACTTCAGTCTTTTCTACTTCCTGTTT
TAAATACTGGAGTCCTGTAGTGACTGATGGAATGGAGCAGCCCACCTGAA
GTTATATAGGAAGTTCCATGACTAGATGAATTAGGAAAAGAAAGAGATGC
ATCTCCACATGATATTTGAACATATATGAATTTGAGTTGTAGTATAATAT
TAAGCTACAATGTGCTCCCTCAATCCAGGAATGTAAGGCACATCGACCAA
TATGATACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTGGATTTATCTAGATTC
GGATGTATCTAGTACTACAACATGTCTAGATACATCCGAATCTAGACAAA
TTCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACTAGAATTATCTACACTA
CTACTCCCTCTGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAGCGAA
TGTATCTAGACATCTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCCGAATCTATATACAA
AAAGATGTCTAGATACATTCGTTTCACAGAAGCTAAAACATCTTAGATTA
TGGAACAGAGGAAGTACCAGTTAATCCTTCTCATTATATTTATTGCAACT
CTTCTCTACGCCATCCTAACCAATTAACTCCAGCAACATCAAATAATGTG
TGAAAGAAAATGCATGCATGCACCAACCTAAATGTACTGTGACACTGCCA
CCAGGCGATGCATGAGAGGCATTGAAACCAGAATGCAGGCAGCCAGGGCA
GGGGCAGTAATACTTGACGGAATGAGCTATAGGGTAATTCAGTATTTAAG
AAATAGGTGATCTTTTAACTTCTCACGAGCAAACTGATGACACCTACGTC
TTTTCTGCTGTTTATTTCTGTTTTATAGGTGAGAGGATCTCATGTTGGTT
CCTATCTACCAAGTTCCGGTGTTTGGCATCGTACCCAGAGGTACTTAAAA
AGACAGAACAATGATCCTAATATAGTGAAGCATGTGGATTTTGATGCTCC
AACTCGTGAAGGAGCCCAACTTCTTCCTGATGACAAGGTAGTCTTTAATT
TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCAAATAC
AGTGTAATCCTTTCAGAAAGGTGCTAATCAGTTATTATGCTAATGTAAAT
GCTGCAAATATGCATTATAATTGGTTCCATTTGGGATTGTGAGAACTAGT
TTTTGATACTCTTTGTGTGATAGCGCATCAACGTTCACCTTCTAACCTCA
CTACCTAACCTTCCAAATTTACTTCTAATAAAGCAAAAACTACTGTACTA
ACAGCACTACAAAGAAGACAAACCTGGTCACTTTGTAAAGATCCCTTCTT
GTTAAGTATCTCTGATGAAGTAACTAAAATTCGCCTAGTAAGACCAGTAT
TCACCTTTCCTTTATGTGTATAAGCAGAAGCAAGATGAATTGCTTTTAGA
AGATATCTGGACTCTCTTAAGAGCTGGAAGACTAGAAGAGGCATGTGAAT
TGTGCCGGTCTGCTGGACAGGTAGGTCAGCTTGTATAGGCCTATTTCTCA
TGATGTATCGTCTATACTTATTTGTGATACTAATGCCTTGGGTATATTCA
GGCATGGAGAGCTGCTACTCTTTGCCCCTTTGGTGGCATAGATATGTTTC
CTTCCCTGGAGGCCATGCTCAGGAATGGAAAGGCTACAACGTTACAAGCC
ATTGAATTGGAAAGTGGTATTGGACGTCAGTGGCGTCTTTGGAAATGGGC
ATCTTATTGTGCTTCAGAGGTGAACTCTCGTACTGTACTCATGTTGTTGA
AACCATGCTTCTTTGCTGTTATATTTAACGTGGTTTGGTAAATGTTACAA
CTGTTCTGTTTTTCTTTAAATCCAGTTATGTGTGTGTATGTAACCAATAC
TCGATTTGTTAAACTTAACTCCAAATAATGCTATTGCAGAAAATTGCTGA
ACACGATGGTGGCCGTTATGAGATGGCTGTATATGCTTTACAGTGTAGTA
ACTTGAAGCGTACCTTGCCAATCTGCACCGACTGGGAGGTACGTTGTTTG
TTCAACTCGTCCGTAACCCTAACTTTCAATTTAATGTTATACTCTCTCCT
TTGATGCTGGTATATTACCTCCATGTGATCCATCTTTTTCCTTCCCATCT
CATAGTCAGCTTGTTGGGCAATGGCAAAATCTTGGCTGGATGTTCAAGTG
GATCTAGAATTATCTCAATACCAAACCAGCAGACCAGAAGAGAAGCAGTA
TGATGATGATATGAATGGAACCCAACCTATGCTCAGTTCAGTGGGTCCTG
AAAATTGGCCATACCTTGTTCTTGATCAGCAGCCTCGTGATATAGCTGCA
CTTCTGCAGAAACTCCACTCAAGGTATAAACATTATTTAGTACTTCCTAG
TATCCACCGCCTGCCTACTTACATGATGTGTCACTTGCGATGCAGCGATC
TTGTTCACGAAACTGTTTCTCGAGCATGTCGGGAGCAGCATCGACAAATT
GAGGCAAGTTACATTTCCAAGAATGAAGAATAACTACTTCCTCATTCCTA
TGCATTTTGTCCACTAAGTCCTTCTAACCTAATTTCGCTTGCTACACATA
TTGTTTGACATTGAATAGCTGGAAATTGGGAGCAATTTACTATTGCTGTA
CAATTTGCCAGTTTGCTGACTAGTCTAGAGTCTAGACACGCTTTTCAGTT
ATGTAGACGAATGTTCAGAAAACCAAGCATTGTAATGTCATCTTTGTTAT
CTCTTTTCATATTTTACGAAATATGTAATATTCTTGTTACTCAATAATTT
ATAGATCATTCTGGTGACTTATATAACTGGAAAATCTGGAGTACACACAT
GCTCCAAAATACTTACATTCTGTGGACCCAATAGTTTAATCATTACCCAA
TTGAATTTACGGTTGCTTGTCTAACCATTTCATGTTTGTTTATTTGGTAG
ATGAATCTCATGAGTGGAAATGTAGCTCGTCTTCTTGACCTTCTATGGTC
ATGGGTGTCACCCTCTGTAGAGGATCATAACGTTTCGAGGTATTGCTTTT
TGTGACTTTAATGAAGATAACTCCAAACACTTAATTAATTTGCTTATACC
ATCTAACGTTTGAATAACTTCTTAGTCCACTTAGATCCCGTGATGATCCT
GAGATGATACGTTTCGGGGCACATATTGTTCTTGTTATGAGATACCTTTT
CAGCGAGGAAATGGAAGATGAGTTTGAGGAAAAGCTGGTTACTGTTGGTG
ATCTCATTATCAACATGTAAGTATTGTTTCATTGAATTACTAAGTTTTTT
GTGTGGTTCTTTTTAGTCTCTTGGACTCATCCCATGTTCAAATGGTATCT
GTTTGGTTTCAAATATCATTTTTTTTGGTGACGGTTAACATAGTAATTGT
TATAATACTCCGCTGCGTATGTAGCATGCTTTCTTTTCATCATGTCAAGG
GCTTAATCCTATGTTTCTAATTTTGTCTTACTAAAGGTTAAACTTGGCCA
TTTATCTTCAGTATAATATTTCGTTCTTATCTTTCTCCAGACGATGTTGG
CACCTTGCTTTTGAATGTACTTTTATCTCTGCAATAGTAAAAACTAGTGA
TTCATTCCAGGTATGTGAGGTACTTATTTTCAGAGCAGCAAGAAGAGTTG
GTTGGAGTATATGCCTCTCAGCTAGAACGTGATGTTTGCATCGATTTGTT
TGTTGAAATGATGGAACTAAGGCTAAATAGCAGGTATTACTATCATACAC
TTATTTGTACCTTTTAATCTTTTTGCAATCTGGGAAATCCACAATATTTG
TAATTCCATTCGGTTGTTCATCTTGTGACATATTAGTGGCTGCATGATGT
ACATGTTAAATTGTTATTGGCTGAATGTTCTCCATATTTCTGGTGGATTG
TAGTTTGGTAGCTATGTGTCTCCAAAGCCTTGATTTAATCTTGGGTTTAT
GATACCTCATTAGAAAGTATTATAATAGGTAAAACGTCTGCACTCCCAAC
TATAGGTTTATCCTTCAAAATTGGGTACTGAAAATGTTTTTGTTATTTGA
TTATTTCACATACAACATTCTCAAACTTGTTATTGTCGATGATTTATTTT
GCTTACTTCCAAGACTTGAGTTAGCTGGCCTTACATATATATATATATAT
TCTGCGGCAGCTTGCATACCATGTACAAGCTTTTCCTCTCTGCTGTGGAG
TATCTGCCATTCTCGTCTGGAGATGCGTCCAAGGCTTGTTTTGAAGAGAT
AATCGAGAGGTTTGATGATTGTCGGGTTACATATAACATTGGAGTACACC
AAATTTCAGATATTTAGCTCATCTGATTTATGGAGATTTTCTGACAAGAT
TTTTATTTAATGCAGAGTTCTTTCAAGATCTCGAGAAACCAAACCAAACA
AGTACAATGAAGATTTTTCTGATGTTGCGGAACGGCATCATTTGCAAGCA
CTTCACAAGGCAATGGTCATTCAGTGGCTTTGCTTTACCCCACCATCCTC
AATTCCAGGCTTTCAGGTGATCACAGGGAAGCTTCTGATGAGGGCATTGA
TGCATAGGTAAATGTACCGATTTTATTCTTGTGCCAATGAAAACTTTGTT
CATACACGCAGCCCTCCTGCATGGTCTTGAAAAGGGAACATTTATTTTTC
CTCTTGCAGTCCATCTGTATGTTAATGAAACAGTACTCTTTACTTCTTCT
CACTCTGTTTGAATTTCTCTTTGATTGAAAATAGTATAATTTCTAATTCT
TACTTTATGAGTGTGGAACTTATTTTGGTATGGAACTTATCTTAATTTGT
GTATCATCAGCAACACACTATTCAGAGAGTTTTCCCTGATATCAATGAGG
AGAGTCTCCGAACTACCAATAGGACCACATAAATTGCTTGCCATCCTTGC
TGAACCATTGAAACAAAAGGAAAACTTTTCGCTGGAAGATCAAGAGATAT
CTGATAACTTACAAGAATTTGAAGATTGGGTAAGATCTCTGCTTTTGCCC
TAATGTGATGTGCATCTTCTCTTGATGCTGTTAGTGCTTTCATTCCCACT
AGAATTTAGTTAGTCGTTGGTTTCTTGACAAAGTATTGCTGTCTTATGGA
AAAACAGCACGAATATTACTCCCTGGATGCAACTTACCGGGGTTGGCTTA
GATGTGAGATGGAGAATTCTTCTGTTCCTCCTGAGATGCTTTCGGCAGAA
GAAAAGGATCAAGCTGTTGCTGCAGCGACACAAACACTGGAGCTGGCTTT
CTTGTTATTACACAGTAATTAAAACTTTCGTTGCTCCATCAAGACACAAA
GCCTCTGTTCTTTTCTGAAGAAGAATTAAATATTTATATCAACATGGAGC
ATTAGTCTACAAATATTTTTCTTCGACTGCAAAACTTGTGATTGTACATG
AAAGTTTTTGCCATCATCTAATATATATCATGGTTTTCTGTAATCAGGGG
AGGAAAGACCATGGTTAAATGCTGTCGAGACTAGTCCATTTGAGTCATCA
GAGCTTGTTTTCCTTGAGTTGCATGCAACTGCAATACTCTGTCTACCTTC
TGGAGAATGCATGCCACCAGATGCAACATCATGCACGGCTCTTACAAGCG
CACTTTATTCAACTGTTAGTGAAGAGGAGGTGTTGCATCGCCAGCTGAAG
GTTGAGTTCATCCCACTTCTCCCAATCTCCGCCTGCATGTTACACTTGAA
CATATGGAAGTGAAGCATTGGCCCGTTGCTCATTATTCATTACGGACTAT
GTCATGGATTTTGATAAGGACTATTTGAAGTTACATTTTAATTTATAATA
ATTGCTTATCATGGCTATTTCTGCAACTTCTGACTGTACAATTGATGGAC
AGGTGGATGTTAAGGTCTCGTCTAAAGATCCTTGTTGTATTGAAGTCGCG
CTTCGCTGCGTAGCAACAGAAGGTGATGGGTTTGGACTTCATGAAGCCAA
TGATGGAGGTCTTCTTGCTGCAATTATGGCCGCTGGGTTTAAAGGTATCT
ACAATTTAGAGTGACAGTATGATTCAGCTCTTTTTCGAATGCAAAGAATA
TTTTATGTGAATGATTTTCCGTGACAGGGGAACTCAATCGGTTTCAACCT
GGTGTTTCAATGGAAATTTCACGACTTGATGCTTGGTATTCTGATGGTCA
TGGTTCGGTTGAAAATACTGCTGCTTATATCATTCGAGGGCTCTGTCGGA
GATGCTGCCTGCCAGAAACAATTCTACGATCCATGCAGGTGATCTTGTAA
ATAGATTCTACAAGTATCCGCTTACTGCATTGAGCTATAGACAAACTGAT
AAGGGACAGTAGAGAAGATGAAAATAAAACAAAAATAGAAGTCAAATCTG
TTATGGCTTCTACACACTTCTACTCCCTCCGTTTAGAAATATAAGACGTT
TTAGCTTTATGAATCAAATGTATCTAGACGTCTTTAGTATGTAGGTTCGT
AGAGTTTCGGAGTGAACCTATACACTAAAAAGTGTCTAGATACATTCGAT
TCACAAAACTAAAATGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTACTATTCTA
GGTAACTTGGTCATTTGGTCATGTATGTTGTAGTAGTTTCTAGAGTGTTC
TAGTTATGTGCTGTTGTTATGTTGCTTGTATCTGTTTACTAGCTTAGTAG
TGTTCTCTAGAACCTTCTAGCTACGAGTAGAACTAAGTAGTGAAGGCTTA
TGCAGCCTATAAATAGAGGTCCTCACTTGTATCTATGTAACCAGACTATG
TACCCACTACCTATCGATAAAGAGAAATTTTGGTTTAGATCTTGTGTGTT
GAGAGTTTTGGACTAAACTCTTGACCGCCCTTGCCTCTAGAGTGAGATCT
AGCGCAGCATGTTTTGAGGGGTTTCTCCAACATTTGTGCTGTCCATATTG
TGGCAACAAGGTGGAGTTGTTCCCCCACAACCTTGTGCTGCTTCACAAAC
GGTCACTATTTTGCTGCTTCAATATACATTGTATATTGATATCTGACATT
AATATTTTGCAGGCATCTATCTCCCTTTCTGAAGCAGGCGATTCTCTAGA
TCATTGTGATAAACTCATTGAGTTGGTTGCTTCATCAGATTCTGGAATGA
TCCATTTGTTCAGCCAGCAGCAATTACAGGTCACTTTACGTTCTTTGGTT
TGTTCATCTGGTAGCTGCCGCGTTTCCTGATATCAGCAAATGTTTTCAAC
GTTTTACTCAGGAATTTCTGATTTTTGAGAGGGAGTGCTTCATATGTAAA
ATGGAGCTTGAGGAGGAGCAGATACCTACCGATGGCTAATCCATCCGAGT
TTAAATTATCAGGTGTGACACCTAAAATGTTATTCACCAGTTCCTAGAAG
AATGGATATGCTGAAGAACATTCTTTATTTGTGCTTGCAAATTGCATTAG
CAGCATATATTTGTTATTTATGTAGAATGATGTTGACCGCTTAATGCTTA
TGTTACACTTGACTTCAAAACATATGCACTGTGAGACACAGTTTTTTTAT
CCGATTCGTAAAAAAGGGCATACTGAGTACTGAAAGCTCCCACGCACCTG
ATTCGTACCAACTAGCAAGTTCAAAATACCTGATTGCATATGCAACTTTT
CATCAACTTATCTGACACTTGCTATGCTGCTTTACTGCTTTCTAATTGCT
GGAAAAAAACTGACATTTTTCGTTCATTTTCTTGTACATGCAGAATCAGA
CATGTTCTACCTACTGACTGAACCTGAAGTCAGGACTTGGTAGTCCGGAC
ACGTCATACCATCTGTTGTGTTGCCAATAACTAGTTGTATTGTATTGTGA
CCCTTCCAAAAAGGATTCTGTATAGGTTTTATTTCTGAGTGCAAGTCTGT
TACTCTCAGCTGATAACAGCAGCAGATGAGAGTGCACTCACTCTATTCGT
TTGTATCAACACTGATCTATAAGTACCAAGAGTAGGCAATTGCAAATCTA
TATGAAGTTCATGGGGACCTGCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.