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GrainGenes Sequence Report: AE043672

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Sequence
AE043672
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043672
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAGCTTTCCTTCCAGTCGAAATCCTCAAGGCGGTCGTGGCGGCGCATC
GGTGACGGCGCGGCGGGGAGGTGGAAGGCGCCAGCGGCGAGAGCGAAGCG
GAAGTGGGGAGGGAGCTGGGGACGCGGAAGTGACTGCAGGACGAGCGCGG
CGGCGCATCGGCGTCTGTCACCGACGGCGAGGCATACGCCTTGTCACCAT
ACTCGCGGCCCTCCGCGTGGCACAGGTGACGCATGCAGCGGCCTCGCCTC
CTCCTCCCCGTGTTTGTTGCTATTATCCACTCGGAACTCAGATCGGCGCC
TACGAGATGAGCTGGGTTACCTCTAAACAGTGCCGGATTAAACATGCGAA
CGAATTTCTCGAGGATGGCATACAATACTGTCACTATAGTTAGTTACTAT
ACGCTTCTTGTAGTCAACTTCAGTATATCCTGCTAACAATAATATGTTGG
ATTGAAGAAGTGGAATCTCATCTTGAATTATGCAATGTTTCTTTTCATGA
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ATGGTCGTTTATGTATCCGATGTGATCTTTTTATGTGACAAATGCCAAAA
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ATCCCAGGGACACTGAAATGGCTGATGCGCCTAGAAATCCAGCACATAAT
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AACTGTCTTAATTAATGACGAGGATGCAAAGCAAGCTGGCATAGGGACAA
TATCAACACCCAGAAGACCGTCTCGTGGTGCTGGTGAAGGAGCTGCAGAA
GCACAAAACCAGGTGGTCATTAGGGATCAGAGGCAAGCTGAAAGGATGGG
GTCAGAACGAAGTAATTCTGCTGCTCCAGATGACCAAAATACTGTATCCA
ATGGTGATTTTGAGTTGGTATCTCAGGGCTGGTCAAATAAAATGAATGCT
GAAGAACCCCCCTCAGATGGGTGTGGACAATCTGTGCCAAGGCAGGCTTC
TTTGAGGCAAACTATGGATTCCAAGCAGTTCAAGGGCCGACCAGTCTCTT
CTCACAGAGCAGTTGTAACAGGACAGAACACTGCAGATCAGAAACCTGCC
AACAAGAGGTCTCTTGTTTCCAAGAAACAGGCTTCAGCAAATAATACGCA
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AGTTCTGGCACAATCCAGGTTAGTTCTCCTATATTTTCCCTCTTTTCTTT
TGGATTTTTTGAATTCAAGTAACATGGTAACACCATTGCTTAATCTGGAA
AATTATGTGCTCTGCCATTAGAATATGCATTACTTTTGATGTGCTTGCTT
AATCTGAAATTGTTGGACACTGGGTTAGCATAGCAGTGGTGTCCTAGGAG
AGTCTGGAATATTCCAGTGAGTGTTGGAGTCTGAGTTAGTGTAGTACTAC
TCTGGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTACGTATAGTAGTAGTGTC
CTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGTGTATGAGTGAAGATGTAAGGCTAAG
TCGTGCTATATATATAAGAGGGTGTGGAGGTCCAAGGGATCAAGCACATC
CAGAAATTTCCCCCCAAAACCTACATGGTATCAGAGCTAGGTTCCTCCTC
CTTACCCTAGCCACCACCGTTCCACCACTGCAGCACCCACCCCGGCTCTT
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TGTGTGAGGCTTGGTTGCTGCTCTGCGCGAGGGTTGTTCAGAAAGCTAGT
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TGGATTTGGGGACCAAGAGAAACTGAGGATGGAGGAGGACCTATGATCTG
GTCGGAGATGAGCAGATGCAGAGGCGATGCAAGCAGTTGTGTAGGAGCTG
GTGGAAGCCTGCAGCATCAAGTGAAGGTATAGGGGAGTGCTCCATGCAGG
TGGCTCCTAAGGTGTTGCTGGGCAAGATTTGGTTTCAGGAGGAGGTAGGT
GCTATTGTTGTGTTGCAACAGAGAAGAAGAGTCCAGGAGGGAGCGGCTGC
TGCTGTGAGGAGCAAAGGGAACAGAGCTTGCTGCTAGGAGAATAGGAAAT
AATGTAAAGGATCTAAGAGAGAGATGGTAGAGGCCGGGCGTGGTGACCGG
GGTGAAGATAGTTGAGGCAAGATGGCCGGAGGGTTGATGGAGAGGAGGTA
GAGGTCAAGGTTGTGACAGTGTTGAAGAGGTGGAAGTCATGTGGAGGTCA
GGAGAGTGGAACTGTGGATAGCTGACCAGTTAGGTGAGGCGGCTGTGGCT
CTGTAGGAGCTGTTGTTGAGGTGAGGCAGCCGTGGTTCTGCAGGAACCGG
AGTTGATGAAGAGGCAATGGCGATGCTCAAGCTGATGATGGAACGCGTGT
GGTGCCGCCGTTGTAGGCGCCGGTGTGAGAAGGCGCACGGTTGGAGAGGC
AACAGTGAACCAACGCAAGAAGGATTAGAGGTGGCTAGCTTGATGCAAAG
TTGTGCATGGTGATGTGATATTGAGGCGGCATGTGGCGGAGTTTGAATGG
TCAGTGTCGAATGGGTGCTTGATGGCAGATGGTGAAAGACCAATGGAGCA
AGAGCTAGAGTAAAATGCTCTCATGCATTTTGTTCTTGTAAACTAGATTT
GTAATGGTCGTAGCAAGTGTTGTGAAGTTGTAGCAAGATGGCCATGGTGG
TTACCCATGCCCATCTTGAGGGGGAGTGTTGGACACTGGGTTAGCATAGC
AGTGGTGTCCTAGGAGAGTCTGGAATATTCCAGTGAGTGTTGGAGTCTGA
GTTAGTGTAGTACTACTCTGGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTAC
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AAGATGTAAGGCTAAGTCGTGCTATATATATAAGAGGGTGTGGAGGTCCA
AGGGATCAAGCACATCCAGAAATTTCCCCCCAAAACCTACAGAAATATTT
ATTGCTTTGTGTTCCATATTCTAGGCTGTTCTATTTTGCTCAAGGTCGAG
TTCTTTGTTTTTCTTCTCATGTTCAATACCGTGGCACTTTTTCCCCTTAA
TGCGTACCTTGTACCTGATGATTGCATCTTCACAGTTCCAGCATTGATGT
AAAAATCCCTGTTTACTCACATGCCCTTCATTTGACAAAGAGCATTTTAT
ATTTTCATCTAAACAGACGAATCACAACTTCAGTCTGTTCCTGGAAGCTT
TGAATCTGCTGAGGAGTACATTAGCGTTTTTGAGCCTTTGCTTTTTGAGG
AATGCAGAGCTCAGCTATACAGTTCATATGAGGAGTCTCTTGAGGCTGTA
TCAAGGGATGCACATGTAATGGTGCGCGTGAAAACCGTTGAAAGGCGTGA
AAGAGGCATGTTCTACTTCTTTTTGTATTGATGGCATGTCTCGTAACAAT
TATAATAATTGCTGCACTCTTATTTCTCACTGCAATTGCCTGACTATTAT
GATGGTTGATGTGCACAGGATGGTATGATGTTGTTGTTCTACCAGCACAT
GAATGTAAATGGACTTTTAAAGAAGGCGAAGTCGCAGTTTTGTCATTTCC
TCGGCCTGGTCCAGGTAGCTCTACTGTATTCCTTTTCTAGTTATGTATTA
AGTGTGCAGATTTTTTACTCTCAAGGAACTGTTTGGCGAACTGGGCTCAT
GTATCCATTTCTTTGTTATTTAGCTTCCCAGTCAAGTAAGTCTAATACGA
AGACTATTGGTTCAAACCAAGATACCGAGTCAGAGTGTGGACGGCTTGTT
GGTAGAGTTCGGCGCCATATGCCTTATGATACACGTGATCCCATTGGAGC
AATTATCCGTTTTTATGTTGGGAATTCATCTGATTCTAGCTGGTAATTCG
CGATATCATTGTTGTTTAGCTTGTCCTATACTGATAAAACCATATATTCA
ATGTTTTTGAACTAGCTTTTGTTTAACTTGGTTTTATCGAACCTTGCTGC
TAGTTCCTTACACCTAACTGTCGTTCTTGAAGATTATGTTACTGCAAAAG
TTAATACCTCTGATGTAGTTTGCTGATTAAGACTTCCACTTTGCTCACAT
TGTCTGTAAATGAGATTTCCTGTAAGATAGATTTATTAAATTGATCACAG
GAACATTTTTTTCTTACTAAGGGTTACTTGTGACAAACAGTGGTCTTTTT
TCCACTAGCAAGCAATTAAATCGAACAGTTGGAATGCATACCTGCTCTGC
AACTTATTGCAGCTTCCTACTCCCTCCGTTGCATAATATAAGATGTTTTA
GCTTTGTGAAGATAATGTAGCTAGACGCCTTTTAGTGTGTAGGTTCGGAG
AGGTTCACTCCGAATCTACACACTAAAAGATGTCTAGATACATTACCTTC
ACAAACCTAAAACATGTTATATTTTGAAACGAAGGGAGTAGTTCTTAATG
CTGACAACCATATCAGCCCGTTGCCCTATTGGATGAATTTAAGCTACACC
CCAGACTAAACCTTGCTCATCCGAACAGGCTTTGCCGTAAGGTTCATGGG
TCAATCAATTTTCTTAGGTTTTGGCTGCTAGGATGATAGGTTCAAGTTAA
ACTCATATTTCTTTGCTAATCTTGCTTGATTTTATGAACACTATTCTTGA
CCCTTTATCTACTGTTTATACATATGTTAACTGAATCCTGCACTTACTGT
CATCATCTTATTATTCCTTCTTTTGTGTTGTAATTGCAGCAGTGGGACTA
ATGTTCTGGGGAAACTCCAACCTCAAAGCACATGGTATCTAACTGCTCTT
GGTTCTCTTGCAACAACACAAAGGGAATATGTTGCGTTGCATGCATTCCG
TCGTCTTAATGTGCAGGTGATGTATACTATATTTAGTTAAGTTCTATCTG
CCTTCTTGGTTATTATTTTGCAGTTGTTTTGATCAAAATCTTTCCATCAG
ATGCAAAATGCAATTCTTCAGCCAAGCCCAGAGTACTTCCCCAAGTATCA
GGAGCAGCCACCTTCTATGCCGGACTGTTTCACTCCAAACTTTTCTTGTC
ATCTCCATCATTCATTCAATGGGCCTCAGCTATCAGCAATCCATTGGGCT
GCAATGCATACAGCTGCTGGCACAAGCAATGGAGCAGTGAAGAAACAAGA
ACCATGGCCTTTCACATTGGTACAAGGTCCTCCAGGGACAGGGAAAACCC
ATACTGTTTGGGGAATGCTAAATGTTATTCATCTTGTTCAGTATCAACGT
TACTATGCTGCTCTGCTAAAGAAACTTGCTCCTGAAAGTTACGAGGAAAT
TAGTGATAGTTCTAGCAATGTTTCAGAGGATGTTGCTGCAGGCTCAATGG
ATGAGGTTTTGCAGAGCATGAATCAGAACCTGTTTCGCACTCTTCCCAAG
CTTTGCCCCAAACCACGGATGCTTGTTTGTGCCCCATCAAATGCTGCAAC
AGATGAGTTGCTTGCTCGAGTTCTTGACCGTGGCTTCATAGATGGTGAGA
TGAGGGTCTACCGCCCTGATGTCGCCCGTGTTGGAGTTGATTCACAATCC
CGTGCTGCACAAGCTGTTTCAGTTGAGCGACGCACGGAACAGCTTTTAAT
GAAGGGACGTGATGAGGTAATTGGTTGGCTACATCAGCTAAAATGCCGTG
AGCACCAGTTATCGCAGGAGATAGCTATTCTGCAGAGGGAACTTAATATG
GTTGCACAGGCTGGTAGATCCCAGGGTTCATTCGGAGTAGATCCAGATAT
GCTTGCTCAAAGGGATCGTAACCGTGATATTCTGCTTCAGAAACTTGCCG
CTTCAGTGGAAAGCAGGGATAAAATACTGGTTGAGATGTCACGCCTGCTG
ATATTAGAAAGCAGGTTCCGCGTTGGCAGAAACTTCAATCTAGAAGATGC
TAGGGCTAGTCTGGAAGCCAGTTTCGCCAGTGAAGCGGAAATTGTTTTTA
CTACAGTATCAAGCAGTGGCCGCAAGTTATTTTCTGACCTTAGTCATGGA
TTTGATATGGTTGTTATTGATGAGGCTGCTCAGGCGAGTGAAGTAGGAGT
CCTCCCCGCACTTTCACTTGGTGCAGCTAGATGTGTCTTGGTTGGTGATC
CACAACAGCTTCCTGCCACTGTTATTAGCAAAGCAGCTGGAACTTTACTC
TACAGCAGGAGTCTTTTTGAGAGGTTTCAGCAAGCTGGTTGCCCTACAAT
TTTGTTGTCAGTGCAATATAGGATGCATCCCCAGATCCGTGAATTTCCAT
CAAGATACTTCTACCAAGGGCGCCTTACAGATAGTGAAAGTGTTGCCAAC
TTGCCCGATGAGGCTTACTATAGAGATGCACTAATGGCACCATATGTTTT
CTATGACATCTCACATGGCCGTGAGTCCCACAGGGGCGGGTCATCTTCGT
ACCAGAATGTTCATGAAGCGCAGTTTGCATTGCGTTTGTATGGTCATCTT
CAGAAGTTCCTGAAAGCTAATGGTGGCAAGAGAGCATCTGTTGGTATAAT
CACTCCATATAAGTTGCAACTGAAGTGTCTTCAGCGGGAATTTGCGGAGG
TTATGAAGACTGAGGAAGGGAAAGATATCTACATAAACACAGTTGATGCT
TTTCAAGGCCAGGAGCGTGATGTGATTATTATGTCATGCGTCCGTGCCTC
TAACCATGGTGTGGGTTTTGTTGCAGATATACGCCGTATGAATGTTGCTC
TCACTCGAGCTAGGAGAGCTCTATGGGTATGCTTTGTGTCCTCCTTCCAG
AAATATGCCTCAATTTATTCCTAGACTTATGCTATCAGGCTAATAGTCTT
TGTTGTTTTTTCAGGTTATTGGTAATGCAAATGCCCTGATGCAGTCAGAG
GACTGGGCAGCACTGGTAGCAGATGCGAAGGCGAGGAAATGTTTCATGGA
CTTGAGTAGCATTCCTAGTGACTTCCTACCCATGAACAATTCTTCTAACA
CCCGAGGCACGAATTCTTCAAACAACACGAGGAACATGAGAGCTAGTGGA
CCAAGACCGATGCATTTCAACATGCTTTCTGAACCCAGGATTGGCATGAG
AGCCGGTGACGATGATCATTCCAACTCTTTCCCGAGAAACGGTAGTTACC
GGAACCAAGATGTTCGCCCTGGTGATCGGTCTGGGGATAATTTGCAGTTT
GGGACGAGCTGGAGGCCGAATTCGTCCAATGATCCAAGGAGACAAGTATA
GGGAGAAGATACTGCCGGTTGCAACTTTTTGTGTGGGATGATGCAGCAAG
GTGTTGCCTGTTGGGAAGATGTGCACCACGGGTAGTGGTCATGTGCAGGA
CCAGACAACCAATTCCCCATGATATGGCTAGACCTCTCGGTGGGGGGTTG
CAGTCATAGCTGCCACGACTAGCTAACTTGATGCTGTCGGCTGGGCGATG
GCTCTTGATTTTTGTCAGGCCACGGAACAAAGAAAGTCTGCCTCAGGCCC
TTGGTGTTCTGGAACCACGCAGGACGTGTTATGCCCATTTACATCGACTG
GGCTTGAGCGAGGCTGTCAGCTGGACAGACATTTGTCTGGCATTTTGCCA
CCTGCTTATTGCTCATTTTTGCATAGATATATATGTTATACGCGAGCAGG
CATTTTCATTTGGAAAGCCGCCCTATGGCTGCTGGTGAATATGGGGATTT
TCGTTTGGGGAGACTGCAATGGCTGGTAAGCCTTCAAGCTTTGCTGTTAG
AGCTGCTAGCTGCGAACTTTCGTGCTTGACATGCACTGTATAATCAGTTT
GCTCGCGTACACAGCGACACATCGCTTCTTCTGTGGCATCGATACGCCGT
AGGCCCTGTCTGTATGTGCAAAGTCGACATCTTGAGAAGCTGCGTTATTT
GATTCAGCTGCCCTGTTTGTCACCTACGGTATGTTCTGTTGCGTTTGACA
TGATCGTTGGTTGGTTCCTGAGTGCTGTGGTGTACATGGAAGGTGCTTCT
GTCTTTGCAGTTGATTCCCTATTCTTTCAGTCCTGACTTCACTTTGTCTA
GATACGCTTGTATGTAGACATGTTTTAGTGTTAGATACACGTGTATCTAT
ACAAAATGAAGTCATTTATTTTGAGATGGAGGGAGTGGTAAGTTTTCGTC
AGTATGAGGGAGGCCCCACAGTGCCGTGTGATGGCCCCGAATGTTCTTCT
CGTCTGGCATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTCGCTAGCAACAGC
TAGATCGTTAGACACCAGCTCTCGATCAGACAGACTAGTGCCAGCCGTGA
GGGCAACAAATTTACCCAGCAAAACAACATCATTAGTCTTGACTCCAGCA
ACCTTCTTCACTTTGCCTTTCTGTGCAAAAGCTGTCCCTCTTCTCGTTCT
GAATGATCCACATGAACCTCGATAGCCACCACCTCCGCTTCGGTATGGCG
AGTTCCAGTGAGAACGCAGAGATCATTCAGAATGCTGGAGTCATGTGCAT
ACGAACGCAGGGATTTCTAGGTCAATAAGAAATGGTCAATTTAGTCATCC
AAGATCAGTTCTCTTATAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.