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GrainGenes Sequence Report: AE043624

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Sequence
AE043624
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043624
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAATAATCAGAAAGCTTCCATTATATCAGGAAAAGGGAGAAGAAAGAG
GGACTCAAGCAATCATGAGGACTTTGCTTTGGCAAATTATGATGGACCAC
TTTATAGTGTAAAGGAGTTGACCAAGGACCATCATCCGGATAGAGAAGAT
GAGAGAAGGCGCGTAGAAGCTGCTGGTGGTTATGTTCTTGAGTGGGCTGG
TGTATACCGTGTTAATGGTGAGCTAGCACTATCTCGAGCTATTGGTGACG
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AAACTTTTCACTCAGATCATTATAATTTGGTTGGTAGATTTAGAAAACTA
TTTACAAAGATGTCTAGTGACCAAGACCCAAGAACTTCACTTCGCCATAC
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GGGTTGGTTGACCCCAATTACTTGGCCAATCCTATTGTAAACCACTGTTC
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GGCCCATCTGTCGCATCGCATAGGATGGATATTAAGAGACCAATCTGAGA
CAGACTGGAGATTGGACTTTTATAATAGAAATTTCGAATCTATTCAAACT
CGAATTATTTGATATGCTGCTCTTTGTACGTAGTCCATGCTATGGTGAAA
GTTCTGAAGTACTATGAGAATTTGTGTTTGTGGCATGTTGCATGTGATGT
GCCATTGTGATGTACAAAACTCTCTCTATTCCTTGATATGTTAGTTGCAC
GGACACGCTGAATCGTTCTGGCTCATTTTCCTTGTAGGTATGGTGTAATA
TCGACACCTGAACTGACAGGGTGGCAGCTTCTGTCAGCAAATGATAGCTT
TCTTATTGCTTCATCTGATGGGGTCTTTGAGAAAATGACTATGCAAGATG
TGTGTGACATGATGTTGCATGCGAAGCTTGGTGTTAACCGAGACTTTGAA
TCCTTTACTGTTGCACAACAGAATTTGGCGGATTATGTAGTTCATCTTGC
TTTACAGAAAGGCACAACAGATAATGTAGCCGCTGTGGTTGTTCCTTTGG
GATCTCCTATTAGCTCTGGAGCTACAATAGAAGATTGGCACCATCTTGAA
GAAAATTCCGGGACATCTCTTTTGCCTCTACAGTCCATTCCGTACCAACA
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AGTTCAAGGTCTCCTGCGAAGTCGTTCTCAGTCCTTAGTTTTGCTAACAT
CTATTTCCATGTGCTTCAGATGATGGAGTTAGTTCAGCTGTTATTGAAAT
GGAGTATTTCAAGCGCTCATCGACAAAGTTCCAGAGGTTCTTGGTACGTG
GGTAATTTATTGGTTCAATGTTTGTCCTGAAAGTTTGATGTACCAATTAA
ACCAAAGGAGTTGTACAGTACGTGTTCTGTTTGAATGTGAAATATGTTTC
ACTTAGTATGTTAATGTTCTGCTTTAAGTCTTTGACAAAAGGCCCTACTG
CCCTTTATTAAGCTGCATGTTCAGTGTCTGTTGGAGTGTATTGGAGAATC
ATTGGCTCTATTATAATATTAATAGTATTTTTGCTTGATCTGAATTAGGT
TGATGCAAAACTTAAGAGACTGGGCTGCTTCTACTTGTCTGAAAGTCTTG
ATGAAGATATGGACTATATATTTAGGGTACCACAGGACTATCAGCATGAA
GGAGTCCGCGATTTCAATCACATGCCAAATGAAAACGTGTTACCTTCTGA
TGGTGAGGTTAACTGTTTTAGAATGCTCGCGTGTGGGGTCCTTTTCAGGA
ACAAGGTCCTTTGTTTTCCTTTTCTTGGAGGGGGTTAGCTTGTGGAGGGT
GTAATCTTATTTCAATGTCTTACCATCAAATCTCACTGTGTTGGTATAAG
ACTTAATAGTTTATACATATCGATCCTCATATGTTTGAGGAAAACTACAT
ATAAATTCATTTCTATACATTTGTTTTTTACCCATATTTTAGTGTGTGGG
TATCTGAGAGAGATGTGGACTTCTAATGTAATGCTTGCTAGTGTTTTCCA
TGCCCTCGGTTGTCATTTCACTCCTATATTTGGGTACAGGAAATCTTGAA
AAATACAAGGACAGAAACTTTTGCTGGTACCTTAGCCATCAAGATGATGA
AATGGGCCGGTGTAGTAGTCCTGAAGGGTTTGCAAATTATTTTGGCTTGC
TTGACTCTGTTTTGCATAATCAAAGCAAATGGAACAGTTCGCATTCATTT
GGCTACAAGATAGCTGACATCAGGTACCACTTCCATTGTTGAGCAACTTC
CTGAGTACCCTTTTAGCATGTCTGGACAATAGCCTGTAGATGTTTGCTGA
AGTTTAGATTCTTTGATGTAATTACTTTATATCGTCATGCTTCACATCAC
TTCAGGGGTCATCTGAATGTACCATCCAGTCCATTTATATTTCTTTATCT
ATAATTCTGATTATGGCTGTATTTCGTCCATAAACGTACCATAGGGTGAA
ATGAAGAATTAGGAAAAATAAATAGAAGAGTTACTTGCAACAGTGACTTC
TTATGGCATAATTTATTGGTCAGGTGATTTGTGAGAATATAATTTGAGAA
GGGCTGCTGGAGATTGATTTTTTTCTTTGAAATAAAATTCCTTACATCAA
GTAGCATATATAATTTCACTCTTTCTTTATCAACTACAGTGGTTACCATA
TTCTCATTTTCATTGTAATATTTCAAGTCATGTATTCGTAAGTGTGAGTT
TTTCTTTTGTTCAACAATTTCAGGTACAAGCTGAAGAGAAGATATGATCG
TGGTTCATATGGTGAAGTCTGGTTGGCATTTCGCTGGAATTGCTCTGATG
ATGTAGATGTACATAAAGACTCTTCTCACTTTAGCACTATACTTACACCA
GACTCATATAATTGCACAAGTTCAAACACAACTTCGTCATCTGATGAAAA
TCACGTCTCAGACATAATAGATGGTGATTTATTCATACTGAAGCGCATAA
TGGTAAGCCAAGTATTCTTCTAGCAAACTTCTGCCATTCTATCATCTGTT
CCCGTTATCCAGTATTAGATGTGAAGTTTTTGATTCTACTAGATGTGTTT
AATATTCTGGTTTTTGACATGCTTGCTGTGGTCAAATGCTCATATAGTCA
TATTGGGCATCTCTAGTACTTTGGAGTTTTCTACGTTATATGTGATACCT
TTAAGAGCAACTTAGATTTCCCAAAATAAGGAACATTAGATGCTAGAAAG
CCTTATTATCCTATCTGTTCTTGACTCTGGAGCATGGAAACTGCAGGTTG
AAAGAGGAAATGCTGCCTACCTGAGTGGATTGCGTGAGAAGTATTTTGGA
CAATTATTTTCAAATGCTTCGAGAACTCTTGAAGGTCTGTCAAGGATGGA
ATCATCATCTACAACGTTTTCGGTGGACATGCATTTCATTGAGTATACCT
TTCCAGAACAGAACATCTCAGCTATTGAGGAATCACTGAAGCATGTGGCT
AGGTTTATAGAATCTTTTGAATCAGAATCGAACGAAATATGGCTTGTGTA
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CAAAGTTAGTTACTGGTAATGATAATGAGAGGGTCAGACATATTCAAGTT
TTGCAACCATCAAAGTGGTGGTATTGGTTAAGGACAACTAAAGCTGGACA
AAGGCAAATGCAGAACCTCTTATGGCAGCTGGTATGCTTATGCTTATGCT
ATGTTTATGTGTATGGTTTTACAAATCATACTTCTCAGTCGTTTTTCACA
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TTCAAACATAGTTTATTGTATCTTTTTCTCTTGTTAAATACAAAATTAGG
AGAAATATTTTATAAGGCAGCTGGCTTGTTTTTTGTATAATAGTTAATAC
ATTGATATTTGTTTCTTTTATTGCTTCTTCTTTCAGCTTATGGGTCTAAA
GGCTTGTCATGATCGTAATATCACTCACAGGGATATTAAACCTGGTACAA
ATGCTGTTGACTTCTACTCTCTAGTTATTTACCACACTAAAGTCTCTAGT
TATTTATTACCTTTGTTTCAAAATATAAGACATTTTGGTAGGCTATTTTA
GCCAACCAAAACATCTTATATTTAGGAACGGAGGTAGTACCACACTAATT
GAACCACACATTGTTCCCATCTTCCCATAATTTTTTCCTAGTCATTTTCT
ATCAACTAGCTGTGTTAACATGATTTTTGTTTTGCCTTCGAAGAGAATAT
GATCATCTGCTTTGAGGATTTGGAGACTGGAAAATGTTCAAGAGAGATTC
CATCTGAAGCAAAGGAAAATAAGCTGAACATGTAAGAAAAAAGTTTACTC
TATGAGGTGTACCTTTTACAGTAAGGCAGGGCTTACTAATCTCTTACTTG
GATATTTGATATTTCTTGATAGTTGGATGAAAAAATTGTATGAACATTCG
GATAGCTGAGATCGTTGTAGAGACACGCATATATGTCTGACATAATTTTT
GCAAAGCACCGTACTTTTGTAGGAAGTTCCCAAGAAGTCAAAGTTTCTAA
TAGTAGTACAGTGTTTATAAGAAATTTACCTCACATGTATTTCAGTCTAG
CTCCACCTGTCCTAGAAAAATACGCTGGTACAGTATTCTTTCTCGAATAA
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AAGTCGCCGCATTCTTCTGGCATCACTTACTGACTTCTTCTGTGCAGGCG
TCTTATTGACTTTGGCAGTGCCATTGATGATTTCACTTTGAAGCATCTTT
ATGGTTCAGGGCCTACTCGGTGTGTGATAATTTTCCTTAATAGTGTTCCC
TTTAGCATTTGGTAGATCATACATTTGTTAGTTTTTCTCGACTTTAATCA
GTAAACATGTGACCTATTTTTATTTCTAGATGTTGCAGTTTGAAATCTTC
ATAACTTCTCTTATTAAGTTGCTCTGCAATGTATCTTTCTTTATCTCCTA
GAGGATCAATTTTTAACTCAACATTAACTTTCACACAGTCATATTACTTG
AAGTCTTGAATGTTAGGGGTGTTTTATATTTAGGTTTGAACATTGCAGCC
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TAATTCCTTGGATTTCAGTCTGGACACAGATATTTGGATCCAACATTTCT
GGAATAAAAATGTGAAGATTGCCTTTTTTGTCTTTAAAGGTTTTTTTGGT
ACTGAATTTATCTTTACGACTTCAATGAACCAAGCAGTGATAATTATTGC
TAAGGGCCAATAAGGGTTGGGTTCAAAGCTGAAGCACGTAAAGTGTAACA
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TTAACAAAAACTTTTATTAAGAAAATGAATATGAATGCATGTGTGTTTGC
ATTAGTATAGATTTGAGTGTATATGCCATGCTTGATTGTTCTAAATGATG
TGAAATGGTTTAAAGGTGAATGCAACATCATCTAGACCATTTACAAACAA
AATCCAAAGAGAAAGAAATCAAATAAAAATAAATAAAGCAAATGGTCATT
TGGACCAAAATCAACCACTAGGCCACTTTGTGTGTTCCTAGAAGAAGATT
TCCAACAGAAACATTTCTACTTCTTTTCACCCCTTGCTAGACCAAGTAAA
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TTTAATGGACAGTTGAAAATGGAATCTATTTCATATGTTAAGATCACACT
TTTTCAAAAACCTACCAAATCAATTCCCCTTGACCTCTCCAAGCAAACAT
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AATCCCCCCTTCGCCGTGGAGCACAGTGGAGCGCCGCCCGAATGTGGTCA
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GGATGTCTAGGAGCTATGCCGCACCCTACCGCCACCCCCTGTCCAGGCCA
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CTGCATCGTGTCCAAAGCGCGCCAGTGCGCTGTGCCCGACCAGCTCGCCC
AGCTCGCCCAGCTCGCGCCTTGCCCTCACCGCGCACGCGCAGCCCCGCCA
TGATCACGCCAACCTGGCAGACACCCCCGTTCGCCGCCGCGCGACCCGTA
GCTGCCGCACGCCGCCGCAAACACTTCTACCGCCGCTCAGAACACCGCAC
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GCCTGTAGCGATGCCACCGTCGAGCTCGCGTAGCACCGCTCGGTCCCCTC
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CTTAACTATGCAAGCTATTATTGGCAAGATCTATGCAAGCTTTAACCTAA
GCAAGATGCATTAGGCATGCTTTGGTTATATACCTTTGATTTATACCCAT
CCCAAGTTTTACTTGCAAGCTTTACTCTTTTACTTTACCAAAGTTCTTAC
TTTTAGTTAGTGCTTTGTGAGGATTTTGGAAAGTAGTATAGATAGCATAA
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CCCTTTATAAAAACTGATGGCTGGGTTCAGATGCGATACCATTCCAATTT
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TCTTGATGATGTCCACCTATGCAGTGCCCAGGATGGCAGATAGCCATGGC
TGGGAGGCCAAGCTCATAGGGGAGGTGCCTATACTAGAGTGTGTAAAGGA
AAGGTTATGATTGATTATCCGCATACTAAGTATGATGATTCAGGGTTATC
CCTGACGGATGTATCGAATTTTGTGGTGAAAATGTACCATCTCTGTAGAG
TGTCAAACTATTCGAATAGCCGTGTCCGCGGTCATGGACAGTTGGAGTGG
CCATACTGTTCCTTCGTCAGCTGTTTTCAAAATGACTTGTGAAGTGACCT
ATGATTTTGACTTAACCACAACAGGGTTGTGAATATGAAAACTAGGTTCC
CAACTTAAAGTGATTTAGAACATTTACTTAGTTTTCTTTACTTCTGAACT
CAGTTTAGATAAATCTGGCTTTTTGCAAATAAACTTAGAGCTTAGGATTC
CTACTAATAGTTTGCGAGTACTTAAAGAGTACTCATGGCTTTGTCCCTGG
CTATTCCCGTGGCCAGACTATGAGGACTATCAGGAAGATAGACAGCAGGA
CGGCTACGACAACTAGGATCATCTCCCATCGTCAGCATTGCCTGTGACCC
TGAAGATGGAGCCCACTGCTACGCTTATTATTCCGCTGCTTGTTTGTATT
AAGACTGGATCATGAGATCCTTTAATTGTGTAAGACCTTATTATGGTTTG
TAATGGATGATGTACTGTGATATCCAATCTGTTATGTCTCGCAAAAATGG
TAATCCTGGGATTGCGATGTATGGCATAACAGGCATCTGGGATTAAAAAT
CCGGGTGTTGACATAAAGTGTAGGATGTGCAGGATTTCTGAATTCCGTAA
CAAGTTGGGTTTTTTACTTTTTCTTAAAGTTATTTCTTTATTATTTACCT
ATCATGTTTAGGTCAATGGTTCATTTGAAGAGTAGGTTTTTTTTTCTGCC
AACTTGCATAATTTTCCTCTTAATGGACATGTTTGATGCTAAACTGCGAC
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AAGCACCTCTGGCCAATATTTGGCTATCTGTTTACTGTCAAGCATTATTT
TGGCAATTTGTTTACACGGTGCAACATGCTTGTTCTTGAACAAGATATTT
GCCGCATGGTCCTACTTTTGTTGTTCCAGTCCATTCTAATCCAATTTTGG
AACTCAATTCCAGGTCTGAGCAGACTTTTGAGTACACTCCTCCAGAGGCA
CTCCTTAATTCAAGCTGGTATCAGGGATCAAAAAGTGCAAGACTGAAGTA
TGTCTCTATCTATTTGTTTTACTTCTTCTGCAAATGCTTCCTTGTGCCAG
TATTATCTGTGCATAGCTACACTGAAGGTCGTTGATATCAATTTTCTGTT
TACAGGTATGATATCTGGAGTGTTGGAGTTGTCATGCTAGAGTTGATAGT
TGGTTCTCCACATGTTTTCCAGATAAGTGATCATGCACGTATATTAATGG
ATCAGCGCCTTGAAGGGTGGAGTGAGCAAACAAAGGAGCTTGCATACAAG
TGAGACAGTTCTGGTTTTTTTTTTTGTGTGTGCGAGTTATGCAGTACATT
TTGTATTCCTGGATTAGCAAACATTGATTCTGGTGACAACGCTAAGAAAT
CAAAGATGCTCATTGTAAATGAATTAATATGAATATATGTTTCTCTCCTG
GTTCTTGAGATATCCCTAAAGATAAAAAATCATTTCTTCTCTCTTAAGCC
GACATAAGAAATCAACGCTCTAAGCTGAATTGTGTGATTAAAGTAGAATT
CAGATTTGCTGGAAATTTATTCCGCCACCCTGAAAACCACAAGCTTAAAT
TTTCTAACTATATATGTAGCATCTTAGCAAAAATATTATTTTGGTATTAA
CATGTCAGGGGGCCATGATGCAGTTTGTCTGTTTTAGGGCTCTGCTTAAC
CATTACTGCCAAGTTACCTGATTAACTGTAATTATGAATTACAGTGTTTC
CATATTATCTGTGTAGTATGAGTAGTTATATTTTTCAAGAGTAAATTGTT
TGGCATATCATTTGTTCTGTCTTATTTTTATAGGTTGAGATCTTACATGG
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AACTCAGAACGGGTGAGTATAGCGATTGCATCATCTATTGATTAACTTAT
AATGTTACTGTGCGAGATATATGCAGATCTGCTTATATATCCTTTATTGC
TTGCATTTATCTATCCTGTTATTATTAGTTATTACTATAGTGTAAGTTCG
TAGGCCATCTTATTCTTTATTCCTTTTTTGTTTAAGGTCCACGCCGGGTT
AGCTTCTTGGAAATGCTCTGAAGAATCATTTGCCCGTCAAGTGAAGATCC
GAGATCCTCTGAAAATGGGGTTGGCATTTTTTCCTTATCATCATTTTCTG
CAAAATCAGATTATTCATATCATCGTATATAATTGTTCCACATTACAAAT
GTATTCCAGCTTTCCAAATTTGCGGGCATTGCGACTAGCACGCCAGCTAC
TAGTGTGGCATCCTGTAAGTGACTTGAACCCAGTCCTGCAAAACGGAGGT
GTTCTTGTATCCTTATTTTCGATATAATCTACCCTGTCCCACAATATAAG
TCATTATCAGGAAAAAGGAGGAGTATCTATTATGAATTGGTGATGTGGAA
TATTGGCTACATGATGTAGGAAACAGTAACAGTTTTGAAATGTCTCTGTC
AATAAAGTTCAATTATTAGGCCTGTCAAAAACCTCGTTGGGGGTGGTCAG
GCTATGCATGACCCACTTTCTGACCCGTGCGTCCTATTATCTTGAAAAGA
GCCATGTTAAACCATAATTTGCTTGTCCATGTCTTGTTATTTAATTTTTT
TGATTTATTCATTCTCCTTGATGCAGTTTTCAGTTTTACTTTTTACCATA
TGTATTCATTTCCCTTGATGCAGTTCCATCCATACCTCTTTCTTGCAGGA
GGACCGCCTAAGCGTTGATGAAGCATTGAACCATCCTTACTTCCAAGAGC
CGCCATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.