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GrainGenes Sequence Report: AE043300

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Sequence
AE043300
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043300
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAACACAACAAAAGCAGAAGAAAAATCAAATCGTCCAGAAAAAGTAATA
AACACCAAATAAAAGGGCTAGACTACGATAGCCGGCATCGAGCCCGACGC
CGTGTCGGAGGAGGAAGGGCGACGAAGATGAGGAAGAAGCTGGGCACCCG
GTTCCCCGCGGTTCGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATC
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GGATCAAAAAGATAATGCAGGCAGATGAGGACGTTGGCAAGATTGCACTG
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TGTATGTTTGACCCACATCTTCTGTTGTTTCTTAAAGATATTTTGGCATA
ATTGTTTCCTCTCTATGCATTATAACGCTTGTTAATACCACTATGAAGCA
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GCGCTTGAATTGTTTCTGCAAGATTTGATTGATCGCTCATACCAAATTAC
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ACCGCCTACCGGGGCCGCCGTCCCGGCATCTGCATCCTGCTTGAGGCTGC
TGCCTCGACATCCACCATCCCGCTGGCGACATAGCCAACCTGCCTAGCTG
TCACGAAGCCATTGCACCGCGAGGACCAAGAAACCCTAAGGCGACGCCTC
CAACCAATTCCATCACTGTCGCCCGCTCTGATGGAGCTTAGATTTTCACC
TGGGGGTTTTTGGAACCACTCGTGTCAGTTGGAATCGAAACTCCATGAAT
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AAAGTCAATGCAAGGCTTTCGCCTCGGAGATCAACCCAACCACGAAGCTT
AGGGAGCGGCAAAAAAGTAGGCCCACACCATCGTCTCCCACCGAGCTCCA
CCACATGCTACAGCCGTCATGGCACCTCATGGCACGACGATTGCCATGCC
GGCCGCAACCGCTGCTCCGGGGCCGCCGCCTCGGCTTCCTCACTCCCACG
GGCACACCAAGCCGAAGGAGGAGGAGCAAAAGGCCCCTGACCTCCTCCAG
CACCTGTGCAGCTCCTAGAACCTCCGCCCGCCCAGAACCTCCACTCGCCA
GCGCCGCACTCTTCTTCGTGCCAGCTTGACCGCTCCCACAGCCGGCCCAT
CCTCGCCGGCGCAGCACACTCCTCCTACGTGCTAGCCGGACCGCGCCCAG
AGCTGGCCCTCGTGGCCCAACGTGCTCGCGCTGGCCCGCACCTTCCAACA
GAGCCGTTGTGACCCCTGCACCTAGCCGCCGCTCGCAGCCGCTGCGGCCT
GTCAGGCCTAGATCGGCCCTCGCTGCCCCGCCATCGTTCACTGTTCAGTT
GCTATGTTCTGGCTTCTTACCTATTTTGACACGACTATATACCATTAAAA
TTGGAGATTCTCACAAGCATAAAATGGTAGGCCTAATCGTGCTTGGTCTT
TTGGAGCTTAAATGGTTAAACCTCTTGAAATGTCATCCATATATATGGAT
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TTTTCACATATATTGCCATTTCTTGGTAGGTCCCATTTCATGTGATATTG
CCCACTGACCTACCTTCGAAATTTCTGGTTCTACATCTAGGTTGATAGGT
GCCTTCAAGATATTAGTTCCCATGTTCTTTTTGAGAATTTTACAAATGAA
AAAAGCTATTTCGGAGAGCATTTATTTTCTTGTGCTGAAAAATGGATATA
GTTGAAGGCAACTTTTCTAATAAGAAGTATCTAATGGTACTGGATCTATC
TTTTGCCTGTTGGTTGGTACATAATCGCTCCTAAAATAATTCTGTCTTTG
CAATAACACATATTTTACTGGTCAAAGACTTCATAATCCTATTGACAGTG
TTTGAATTGCATTACTTTTATTCACGCCTTTGAGCTTTTCAAAGGTAGCC
TGTTTGTGAGTACCATGAGTATATTGTCTATGTGATTCAATGCACTGCAA
TTATGTTGCTGGAGAAATTTTCCTGGATTGATTATCTTGAATAACTATCC
CAAGTATTATGTCATTCATTACTAGTTGAATGCTCGTGCGTTGCTACGAC
TACTTACTTTATGCCTAGTGTCACAAATGTTACACATGTAAGCAATGCAC
ATAAATATTTAAGCATATTGAAAAATAACTACTTAGTATTTCACAAACAT
TCAAATCTTACTTCACATAATTCGATATGTATAAATGCAGGGTGGAGAAA
TCATCTCTTTATTTACTAATCCATCTATCCTTAACTTTATTTGCTTGGTG
CTTGAGCACGTGTATCAAAACTTCTTCCTCGGCTCGTAGTCATCCTGCAC
AAGCAATCTATATTGTTAAAATGAATTTTCCCCATAAAAATTGAAGAAAG
TTAACAAAGAATCACACCGTCCAATTTGGATGAACAAATGTTTTACCATT
CCCTGAGAGCATAAAACTAAATACTAAGTAACCAGACAACTTAATGCAAA
TGTATGGATTATAATTTGCTTGGGCTCCTCACTTTAAGATTGTTCCAGAC
TTATAGACGATTAGCTATAATTCTATAGTTTTGATTAGCATATATTCTCT
CTATTTCTTAAAATAAGGTGTATTTATTTTTGAAAAAAATGTGAATTATA
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TCAATTTGACAAACTTAATATGGGAAATATATTACAAAAAACATATATTA
TTAGAAATTTTAGATGTTATGCTTTCTAATGGTATAATTTTTGTGTTATA
TAAACTATATTATGTAGATCAAATTGACGACATAGGGATACGTGGGGATG
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TGAATCACATGCAATCCCAGCAATTGAGGAGTTGATGCGATTGTTTGGCC
TGTCATGTCTACTGCCTCACGTCAACAGAAAAAAACAGATGAGGGAGGGA
CAAGAATGGGATCAAGCCGCTGTTCTTGTTCCCATGGTGTGTGAATATTC
GAGTAAAATATATACATCTTATATCAAGGAATGATGGATGTGCCTCTTTT
CCCCTTGTAAGATAGGTGTCATGTTCTCATGACATATTTGGTCAAATTAT
ACCATGCAAATAGTTAAAGATGTTTCAATACTTTTTCTAGCATAAACGAC
ATTTAGAAAATAGCGTTTCAATCTTAAATGCTAAGGTTCCTAAACAAACA
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GTGATAATTCCGTTGCGTGGGGTTAATTCTATCAGTTCATTTTATAATAA
AATTAGCAAAAGATGACATGCATAATTGTCTGGTTGTCACAAAGGTAACA
CATTTTCCCATTCCATCTCCTCACAAGATTATCACTCTGTCACAATGATA
AATTGGGCTCGATTAACTCCGTAGTAGGAACTAAAAATAATGACCAAATA
ATTGAAAAATAAGCACACCGGCCATATTTTGTTAGAAAACGTGAGAACTA
TTATTGAAAACAGGGCTGTGATTCTCTTCTTCAAAATTCCCTAGCCATTC
TGGAAGCCAATTCAAAGATTCAAACCAGCTCTTATTACTGGTTGGCCCTA
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ACACGAGACCGTTCAAAATCTGAGATGCGTAAATAGCAAACAAAGACCGA
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ATCTTATATCAAGGAACGATGGAAGTACCTCTTTTCCCCTTATAAGATAG
GTGTCATGTGCTCATGACATATTTGGTCAAATTATCACATGCAAATAGTT
AAATATGTTTCAATCCTTTTTCTGGCATAAATGTTGTTTAAAAAATAATG
TTTCAATCTTAAATGCTAAGGTTCTTAAACAAACACCAAGGGAGGACATG
GAAAATTGGAATCACATTGGTAGTGAGATAATTCCTTGCGTTGGGTAAAT
TCATATCAGTTCATTTTAGAATAAAATTAGCAACAAATGACATGCAAAAT
TGTCTGGTTGTCACAAAGTTAACACATTTTTTCATTCCATCTCCTAACAA
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AAACTGGGCTCGATTAACTCCGGTAGTAGGACCTGAAAATGATCAAATAA
TTGAAAAATAAGCACACCGGACATATTTTGTTAGAAACGTGAGAACTATT
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GAAGCCAATTCAAAGACTCAAACCAACACTTATTAATGGTTGGCCCTAAG
CCATGAGCAATTAGCACCATAGACATACTCTCAGGCTGTCGAAGGTAAGA
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CAAACCAAGACTGACATTGTTCAGTTTATATGAAAAGGAATGAATAATTT
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ATATGGATACTGAAGGACAATATGATGCGGTGACAACGGTCTGCACTATG
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GGCGACCTCATATTATTTCATCTAAATACAGGCAAATACAGTTAGAGTTA
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ATAATACACCCAAAACCAATATCCAAAAGTCCATGTTTCATCGACAGAGG
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TGATGTAAATTGGGAATTGAGGCCTAGGACTCATAGGCTGAAGAGCTTGG
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GATGACGCGCGGGAAGTGGCCCTGGTCGCCAGGAATCACCCTCAGACACC
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GTTACACATGTGCGGATATGTATTAGTTAGTTTGTTAACTTTGAGATGTG
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TTGTTGTGGTGGTGGCATTTTCTCAGTAATTATGTTGAAGTGTGACACCA
CACACCGCCACATCTTTGGATCTAATAGTAAAGATAGGTCATCCTTGTTC
TCTTTAACAAAAGATGTTCCACAAAAACCAAAGGTTGTGAACAGTACTGG
TCCAGTTTGTAAATTCCTTCATATTAAAAGGCATGCTATTGATATAAATA
CTGGGCTCTTTCAGCAACTATATTTTACGTAAACTGTGGCAGAGGCCTTG
GCACTACGATTTTGTTAATATATAGGTATATACACAAGCTATTTACATGT
CTCTGTACAAGGATATAGCTAAGGCTCTGTTCGGAACATGGGAAGGAAAA
CAAAGGAACTGAAAACCGTATAGGATTGGGAAAGCATTGCTAGTGCAAAA
CTACAGGGTTTAAAACCAGAGGAATAGTCCATGTATGGGCGTTTGGACAA
GCAACAAAAAACGCAGAAAACTATACATATGAATAGTGACGTGCAGATTG
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ATGTATCTAGGCACTTTTTAGTCTATATACATCCAAATTTGGACAAATTT
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TACTGAACACGGGACAGGAAATCAACAAAACATACTTTACATGAATTAAA
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AAGAGGCTTTCATGACTGCTGCAGTCACACTCTGCACCTTGTTCGGTTTC
AACAGCTCTCTGGACACTGCAACATGAGAGCAGGTCTGGTAATAAACTGA
ATACCCTGTTTCTGATCGCCCACTATAGCCACCAAACACAAATACTAGCA
ATTGTTGGAGTTAGATACACTAACAGTCCCTGTACTTGTCAGGCTGACTC
GATTTAGTCCTCGTATTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGGGAAGGACT
CGACGGAGGCGGAGGCAACGGGCAGGTGACGGAGGTGGTGATCGCTGGAC
CAGAAGTTGGAGTGACATATTTACAATGGAAGTTTAACTAAGTGTAACAG
AGTAACGTGGTAGGGGATAATTACAAATTTTCGGTCCATCTTCACTCCTG
CAAGTGGGACACGCCTCCACGTGGCATCTGAGTCAGCGGAATTTCGATGA
CAAACATGGATTAGGACTAAATCGAGCTCAATTTACAAATACACGAGCAA
AATTCAGCAAATTCCGAGTAGGAGGATTAAATCAAGCCAGCCCGACAAGT
ACAAGGACCGTCAATGTATTAAACTCCAATTGTTGCTCCTTTGGAAGGCT
CTAAAGAGAAACCAGAATATCGAAAGCCGAAGAGCACAAGAGAAACATGG
AAGGCTCAGGATGTGTCAGCAGGTCAGTTTCAGACTGGTTCATTTTGGCT
ACCAATTGGAAACTGAGATTGCTCTTATGCCTGGCACGAGATACTCAGAC
TGGCTCACTTTGGTAACCAAATGAAAACTGACATGAGCCGGCTCTTATGC
AGAACATGTGTTTGACCAACATCATAATTTGCAACATTCATCTGTAATTT
AGCTATCGCACTGATGTTTATCTAGATGAATGATTAAGTTTTTTCTTTTG
GTACTTTTTGTAAGTTTTTATAGATGGTGTCTTCTTTTGACATAAATATA
GTTATACAAGTTAGCCATGGCATGCTATCATTCTTCTTGCCTGCACAATT
AGTTTATGCTGTGTGTTTCAACTTTTTGCAGAAAGCAATGTGTGAAGAGG
TACAGCTCTTTTGACTTCCTAAAAGAGATTGCGAACAAGGTGCCAGACCT
TGGTGGCGCTGACTCTTGTGGAGATGAAAGAGGATTACCCAGACGAAGGT
AAATCTCACTTCCCTTGGCATAGTCAATTTCTCACGAATCATTGTGACAA
GTAACAAGCACCTGATTAATGTTTGAAATTTGCTTTCTAGAAAATTATCA
AATGGAAGCGATCCAGAGAACGAGGAACCTCCCCGGTCCAGCAAAATGGT
ACACTTGCCTAACATATCACCGGAGTTAAATTTCTTAGAAGCGAAGTTGA
TAACATGATTGTTGCCTTTGCAGCCAATAAGAAGCTTGAACACTAGTCCC
AGAGGACGAGGCAGAGGTCGAGGAAGAGGACGAGGGCGACCTCCAACCAA
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CGTGGTAATGAGAGTATTCCCCAAGGCGCACATCCAGTAGAGGCTCCATC
AGGCGATATGCCAGCTGTGATTTCAAAGGTTGAAGAAGCCAGCGCTGACC
ACCAGCCAGATTGGCCTATGCCAGATGCAATTGGAGGCATTGGTGTTGGA
CCATCCAGTTTCGGACACCTGACGGTGCAGGTTGATGAGGACGAGGACTA
CGACAATGAGGATTAGGCATGGTCATCTTCTCATCAACATGCACTAACAG
ATAATTCTCCTGGTTGTTGTACAATGTAAATAGAGTTTCTAGTAGTGACC
GCAGCTATGATGTGCTGATGATGTTACGTAGTGTGCCTTGTAACTTATAT
TTATTTTTCCCAATAATTGCTTGTTAGTTGCCTCACATCGTTGACATAAT
TGACTAGTATGTGATCTGTCAGGTTAATTTAACCCTGTATTTGATGGTTG
AAGCAGTAATATTACGCCTTGTTACATTGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.