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GrainGenes Sequence Report: AE042604

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Sequence
AE042604
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042604
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TAGCACCCCGGCTTCCTTTATTAGCCAGCGTCGCCTCCGCATTTCCGTGC
CACCACCTCCACGCCCCCTCCGCCGATCGATCCTTCGCCCCCGCTCGCCC
GCCCCACCGGGATCCTTTCAAGGTATCGCCCGCCTTTCGACGTTCCAATG
TTCTCCCCCTCTCTCGTCGATTTCGGCGGTTCTATGGTTTCAATGCCTTT
TTTATAGTTTGATTTGATCCGAGTAGTGACGCGATTGTGCTGTGGCGGAT
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GGTAAATTTTACTGCGGAGATTCGTATATAGTTCTGCAGGTGATGCTTTA
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GTCGTGCAGTCCAGCACAGGGAACCGCAGGGCTATGAATCCGATATGTTT
ATATCATACTTCAAGCCATGCATTATACCAATGGAGGGCGGTTTTGCATC
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GCAAAGGAAAGAGAGCTATCAGAGTTAAAGAGGTGCATTACATTTCACCT
CCTTTCTATGCTTAGAAACGAAAAATAATTTAAAAACCAATTCTTCAGTG
TTATATCAATTATGTGTCTTGTTTATTCAGGTTCCCTTTGCCCGTTCAGC
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GTTATAATGAAGAGTCAGAATGGGGTTTGTGAGATGTACAGATCTGGTAG
ACTGCGAATATGGGAGACTTCGGATCTGTCTTAGAATCTGTTTAGATTTA
GATCTACTGGGGTTCCATGGAATGTGCATGGCAGACCGGTTCGATCCACC
TGTGATGAGCAGAGTTACTGCTGCTGAAAATTAACTAAATTTTATACTTA
GATTATGTTTAGATTTAGAGGTACTGATACATATGATTGCTGCATGATTT
AATGGGATCATTTTGAATTCAGTTTGGAATTAGTCAAAATTAAAACTTCC
AATTTATATGTTCAATACTAGACCACATGAGATCTCTTTGTTTTGATCAG
ATCAAAATTTAACAAAATTTCTGTTGGGGTGAACACAAATTAATATCTTG
CAAATCAAGTTAATCTGTGTCTTTTCTAGATGAAGCAAGGATAAAGAAAA
TTTCAAATTCTGTAATATTTTTACTTAAAGGTACAACATCCGTTTCACTG
TATCTGCCCATGCCCTTGGGAGTATCTTTTCAATATATTTTGTCCATTGA
AGGGATCAAGTGTGTTAGATTTATCGACCCTATGCCCCAATTTAAATCCC
TTGGAAGATGTTTAGTGGTTGTAAGGGGTATTTGGGGAAAAGTCTAGTTA
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AAAGCCTATTACTATATCTTTAGGTCTGTCTTCCCCCATGTATTCTAGAT
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CACACAGTGAATTGTTATGTTTGCAGTATCAATAATGGTAAATTGAATTT
AGAAGACATTGTTCTGACAAAATCAATTCTTGAGAACACTAAATGCTTTT
TACTTGACTGCGGATCTGAGTTATTTGTATGGATTGGTCGAGTAACACAA
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ATATTTTTCAGTTTGTTATCTTGTTCACGTATGTCATTCTATTTAAATTT
TGGATTTGTAGGAATTCATTGTTAAACAAAATAGGCCAAAGACAATGAGA
GTAACCCAAGTAATTCAAGGTTATGAAAACCATACATTCAAGTCCAAGTT
TGAGTCGTGGCCATTAAGTGCAACAGGAAATGCTGGCGCGGAAGAAGGCC
GAGGAAAAGTTGCAGGTACATTATTTGGTATTGTTCTTTGGGATAAGGAA
AATTCCCCTTTGGATCTTGTTGCTGATAACATTTTCTTTTCCTCTAGCAC
TGTTGAAGAAAAAAGGTGATGTCAAGGGGGGCTCAAAGAACAGTACCCCA
GTGAATGAGGAAGTTCCTCCTTTGCTAGAAGGCGGCGGAAAACTTGAGGT
TTTGCTCATCGCACATCGTACTTTATATATATTTTTATAATCACAGCCAC
AAATCTGAAAGTGCAATAAGAAAATTATGCACACACAGGTCTGGTGTGTT
GATGGCAGTGCTAAGACTGCTCTTCAGAAGGAGGATCTTGGAAAATTTCA
CAGCGGAGATTGTTATATTGTCCTGTATACATATCATTCTGGTGAAAAGA
GAGAAGAATTCTATCTAACTTACTGGATTGGGAAGGATAGTGTACCGGTA
ATTATCTTTTCATTGTTTCCAAGCGTTATATATAGTGCACCTTACTATCT
TTCAGTTTGCTTTCTTGACTTTTTCTCAACATTCTCCCATATTAAATGTA
TTTTCGTCCTTGTGTGTGATCACCACACCATCTATTGGATGCCTTGATGG
TGTGTTTTCATTTAAACCTTTTGACCTTTTGTCATTTGTATGTATTGTCG
GCCACAATTAAATATTATTCTTGTGCCAATTTTGTTTCATTGTTACTGTA
ATGGGATTTCTGAATTTTCTCTTTGTTTATTTCACACAGGAAGATCAACA
TATGGCTCTTCAAATAGCTAATACAATGTGGAATTCAATGAAAGGAAGAC
CTGTTCTGGTACTGTATTTCTGCTGTGAAAATTTGTACAGTAATATCCAG
GAAGGAGTTTAATTTCTTGTATTTGGTATTGTAGGGTCGTATTTATCAAG
GGAAAGAGCCTCCACAATTTATTGCTCTTTTCCAGCCCATGGTTATTCTT
AAGGTATGTTTCTATGGTACTCAAGTATTCTACAATTAAATGAGGACCAA
TAATTGCTATTCTCTGAGGAACAAACTATTCATTAATTTATATAGTTGGA
AGATATTTAGAACATCAATGAGAAAAGTAACAGCTAAATTTTATTTGGAA
AATCATGCAGGGTGGAATCAGCTCTGGATACAAGAAATCGATAGAAGAAA
AGGGCTTGAAAGATGAAACATATTCTAGCACTGGCATTGCCCTTGTTCAC
ATTCAGGGAACATCAGTTCATAACAACAAAACACTTCAAGTTGATGCGGT
ATTGTTTAGATCTATATGTGCTTATTTAGATTCAAAGTGATAGTATTTTT
TGATGCATGAACCTGCATTGTTATGTTGTCAAGATGGTATATCAAAATAA
CAACTGAGAATTCAGCTAGCTACTGAGATTCTTGCTCAAATAAACTGCCA
CGACTTAGCATCAACAGATTGTCTTAGTGTAAGATCGTAGTGTATGGTAA
TGGTGAGCACGGAAGACACAAAATATGGTAGTTATGGTTCAGTTCAGATG
CAATAATGTGAAGTATGAGCTAGGATCACTAAACTAAAAGAAGTGTAGAC
TTACATGAGATGATGAGAGGCAAGTGCAAAGTGAGTTCTACATTTTCACT
GAATTTTTTAGCTACCGCGTTTGTAATATTGATATATGTAGAAGATTTAG
GTTGGCATGAACATGTTGAATGGATTTAGTCGACTAGCTGCTTTCAAAAT
ATTGAGCGCTAATTTTCCTTCGGTAGTAAAATTTAATGTTATTCATATAC
TTATTTTTCTTCGCAATGTCCTTTTTGATAACTTGACTCTTATTAAAACT
CAAAAAAGGCCAGCATCATTCTTTTTAATAATATAGCTTACATTAACCTA
ATCTATACACTATAAGGGTCTGCAAGACTCAAATTATTTCTACCTTTAAC
TTTTGAGTAACAATTTTAGGTTTCAACATCCTTGAGTTCCACGGATTGCT
TTGTCCTGCAAACCGGAAATTCAATGTTTACATGGATTGGTACCACAAGT
TCTTATGAACAGCAACAGTGGGCTACAAAAGTAGCTGAGTTTTTGAAGGT
ATATGAGAAAAAGATACTACCTTTTTCCCCTTCTGTCTTTCTCTAGTTAG
TTCATAATTCTCTATTCAACAAAGCAAACTGTGAGAACACGCGAGTCTTT
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TTTATCATTGATACTTATGATGCAATATCTATCTAGAACTTGGAGAAAAT
GAGTTGACATCTGTTGCTGGAAACTTTTACTGAAATTATAGATGAACCTG
TAGGGAACAAAATCAGCCTGCATTTAGATTACTATAACCTGATAAATTTA
GTATCACTAAGATACGAGTTAACCTGGCAATGTAGAAATTTATCTAATGT
TAGTTCATTTCAACTTTACCGTATTCCAACTGTAGCCAGCCAAATATGTT
TTAGCAAATGTGTATGCAAAACACTCTTAGTTACATCTTTGTTCATTTAT
GTAAAGTGCCTTCTCATGCAATTCGCTAATAGTAATCTGAAACCACCATG
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ACGATATCCATGGAGGCAATGTTCTATTTCAATTCAAAAGGGTTGTTTAC
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TCCATTGGATAAAATATTGGAGAATATGAAGCAATATGAACATGATTGCT
GCCACAGAAAATTCCTGTTCGGAATGCAGAAATTTCATAGAATCAGTTCA
ATGCCTGCTGGAGGAATCAGGGTTGATCCCTGCTTCCAAACGCAGACCAA
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CCAAATTCACAGCCTGGTGCTTCTGTCAAACATTGCAAGGAGGGAACTGA
GAGCTCTACTTTCTGGAATCCTCTTGGTGGAAAGCAGAATTACACAAGTA
AAAATGCCACACAGGATGTTGTTAGAGAACCTCATCTGTATACTTTCTCA
TTTAGGAATGGTCAGTTGTAGTCAAATCTTAATTCCAGAATTTCATCTTA
TTGTTACTCTGTGAATTTATATTCTACAAGTACCCTAATCATTTTCCATT
GTTTCGTTTTCATTTGTCATAACATGATCACGACTTATCAGGAAAGCTGG
AGGTTTGTTGTCTTATTTTTTGTACCTTAAAGTTTATGTTCCAGGGCCTC
AAAATTTCAAATTCTAAAATGCCTCTTTACCTGCAGGTTACTGAAGTTTT
CAATTTTTCACAAGATGATTTGTTGACCGAAGATGTGATGATACTTGACA
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AGCACTTCCATCTTACTTTTTTTTGCACTTCTAATTCTGTTCTATTTATC
ATCCATTTATATGGTGTAGCAGATATAAAGAGTTTACTTCAGGGTAACAC
TGCCTTTGTATATAGAAACCAACAGGAGCCTAATTCTGTCCCTTCTCACT
TCACTGTCTCACTGAGAGAGAGTAAGAGTTTCTTGAGGGATGGGGTGATG
GATGTTCTGCTTGTTGACACCCAACCTAGAACTGAATCCTCGTGAACTTA
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TGATTCTTTTTTTCTCTCGAACACACATCTAAATGCGTGCCATTTGTATT
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GCTTGCAGAGTGGATCTAAGGGTTCAGGTGATGGTGGACCAACTCAAAGG
GCATCAGCATTGGCTGCACTTTCATCCGCGTTTAATCCATCTTCCCAAGA
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TGAAAAATCAATTAATGCCGTGATCTTCTTTAGTCTAATGACAGGCCTAG
AAGTTCTGGTGATGGTGGACCTACCCAGCGTGCGTCAGCATTGGCTGCAT
TATCATCTTCACTTAATACATCATCAAAACCCAGAAGCCCACAATTTCGT
CCAGGTCAAGGTTCTCAGAGAGCAGCTGCTATTGCAGCATTATCTAATGT
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AACTGCAGATGAAACTAGTTGACATATATTTTTCTTTGCCCTCACATATA
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ATATTTAGACTCACTGCATCATTTTTTTATACAGAAATAGTTGACCGACA
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TTATGGAGGTTGTAGTATGAATTGAATGATCGAAAGAATAAATAATGAAG
ATGACTCCTGTTGAGATTTGTTTTTATGTTCTTGTTTCCTTATCTTCGTA
CTATATCTTGACAAATTCAGTTGATGTGCAGATGCTGAGAGGACAGAATT
TGATACGGATAAGGGTGCTCCTGGAGATGAAGTGCCATCCGAGGGGGAGC
GAACAGAGCCTGATGTATCACAGGAAGAAACTGCTAATGAAAATGGAGGT
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TTAAGAACAAAGTCTGTGCTATCACTATCTCTTATCTTGTGAAATAGCTA
AATTCCTCGCAATCGTAGAAAATACTGAGGAATTTACTTGAAAAAAACCT
TCTAGCAGATGATGTTTCTTCAGCCCAGAAGATAAAAATTCTTTGCCTTT
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GATTCACATATAATAAGCAAACATGGTTAAGTTCGATAATATCTCATTGA
TCTTTGAAGAGCAGTCCTGGATTTTGTGGTCACTGTAACATGTTATTCAA
TACCATCCTGACGAATTATCAAGAACTAATTACTCACTGTGTCTACTTCT
ATTTTATAATCATTGTGTCTACTATGGCTGCTAACTACTCTTCAGTCTAA
ATGAACCACCTCGAGTATGAGCGGAGATGTGTGTGCTAATCAGGCGGGTT
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ATTCCAGACTGTATTCGGTGTTACCAAGGAGGAATTCTACCAGCAGCCAA
GGTGGAAGCAAGACCAGCAGAAGAAAAAGGCCGATCTTTTCTGAAGCATA
GCCTTCTCCTGGATACAGAGGTTGCACAAATTCTAGTTTTCTCTTCCATG
ATTGGTGTCATGGAACATCAGAAGCCCATGTGAAGCAATCTTGCCATGTT
CCAGATGCGAGATTACCTGCTGATTTCCCCAAGTTTTCTAGGGTATTATT
TGTACATGATCTGCGTTACGCAGCTCCAAGGGCAGCCCCTACATCAGTCA
CTCTGAGCTTGTTCTGGTTATTGTCCGTCGATGCATGTGTACACTTTTTC
CTTGCTCAATTTGGTACGAAGGGGCATTCTTGGCGATGTTTTCAAAGGTC
ATGCTATATTGGAACTAAGATGTATATGATACAATTTGATGTTCATACTT
TTATTTTTATTTTTATTATTTTGGCAAACACCTCTGTGTTTGCCGGTCTT
ATACTATTAACTACTCTCTTCTAAGCAGTTTCAGTTCTTATGCTAAGTTC
TGCTAGCCTGATGATTTTCAGCCATGCTACCTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.