Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE042281

[Submit comment/correction]

Sequence	AE042281
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE042281
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAGCTGGCTTCCTTTCCCTTTCTTCCCGCTAGGTCGCCGAGTCAACATCC GTCACCGGCGGCAGTAGCACGCCCTGCGCACCTTCTCAGGCAGACCCATC CCCTCTCCGCGTCCCCCGAACCCTAAGCTTCCACCAGCCCCCATGGGGAT CGCGGATGCCGTGCAGGCCTACACGGGCCTCTCGCCGGCCGCCGCCATCA CCGTCCTGGCCCTCATGCTCGCCACCTACCTCATCGTCTCCACCCTCTTC GTCGCCCCTGACGCCGCCGCACCGGCGGCACCTCCCAAGCCTGCTCAACA GAAGGAGCAGGGGACGGAGGCCGAGGCCGAGGCAGAGGCGGAGGCGGAGG CGGAGCCGTTCGTGCCGCCGTTCCCGGACCCTGTGCAGGTGGGCGAGATC ACGCTCGAGCAGCTCAGGGTCTACGACGGAAAGGACCCCGCCAAGTCGAT CCTCATCGCCATCCGCGGCAAGGTCTACGACGTCTCGCGCGGGAGGTGAG GATTTGGTTGTATTATATAGATTATGCTCTGATTTGGTCAGGGTTTAGTG CCGACCTATATGCGCATTGAGCTGAGCTTACAAATGCGGAAATATGTTAG CAGCAGCAGCAGTGTTAGTGCAAACAAAGAAAGTTAATGTGGAGTGGAAA GTAGGGGTGTTCAAAGTCGCGAAGGAATTAAGACAGTCAAAACTCAAAAC CAGTCATCAGTCAGCTAGTTCATTTGCCTTCACCGGTTGCAACTTGACCC ACAGGTCTAGTACAAAAAATATTAAGTCACGGTTTTGGTGGGTTGAGCTC AAACCGTACTGCAAGGCTTCTAGTGGTAATTGCTGATCCAACTCCAAGTT GGATGATATCTCAGTACTAGACTGTTAGTAACTTCAATTGTGCATAGAAC TGTGGATAATTGATTTGGGTCTATTTAATTGGGACATGAGGATTGAATCT TATTAGGTTGAGGGGGTTATACGAAGATAGATTTCCCTCAATTTGGAGTG CGAAATGGTGAACTTTAGACAATCAATTAGGAAACTAGAATGTTCTTGTG CAAGTATGAGCAACCTGACATGATTTTGCCAGTTCTCACTAGATTTTATT GTTAGATTTTTCTGGACGTTTGATTATGCTTGGATACTTCAACCAGGAGG TCAAGTGTATAAGTACATTGTGTATTGGTTTTTGAGTCGCGACTCAAAAG TGAGTCGCCTGACCTGCGACTCAGTGAATAGTCGACAAAAGTCGCTGTAT AGTCGCCATAAGTCGCCTTTATTTTTGGAAAACGACTCAGCGACTATACA GCGACTATTCAGCGACTATACAACGACTCAAAAACCACTATTGAGCACTT GACCAAATGGACTGTAGTCAATAGACATGATAGGCAACACTGGATGGTCT GTACTTTCAGCTGTTACTCACTTTTCGACATGACATATGATGTTAGGTTG TGCAAATATTTGTTGTTTGATGCAAATGATATGGGATTCTTACACCCATT TTAGCTATAACGAAATGTTAGCTTACTTGAGTGCAGTCCTCAAGGTCTTC ATTAAATATTGTAAATTCAATATCTCAAACAATTTATGTCATTCATGATT CATCAGGTAGAACTTAACTAAAAATATAACAAGTGGCAAGACAACTTTGT TGCCCTTGGCCTCACACTACTCTTAAATGAAATAGAAAAAACAAATAGGG ATCTTTCAAATTAAAGAACATATTGAGCATACAGTTTTCTCTATTAACCA CTCATGGGAGTTCTGAAGCTAAACTCCACTTCTAAGGAAGAGCTATCAAC TGCCGTAATGATTTGACGAACTGCAATTTTCATTTGGACTGTGGCCTGAT GCTCAAGAACAGTATGCCACTATTAGGAAAACCACTACAGCAATCGTTGC GAACTGTTATGTTGAAACAGTATCATATCTATTGTCAAGTTCACATCACT TTTTTGTGTTATCTTATTAGACTCCTAGTGCGTCTAAGGTGATGCAATGT TCCTTTTATATTGATTCCACTCTGATTTGGTCAGGCCTTAGTGTGGACCG TTATGCGCATTGAGTTGGGTTTACGATTGTAAACTGCGCCAAGCTTGAAC AATTGGATTACTTGAGGGAAGTAATAGCAGCAGTGTTAGTGCAAGCAAAG CAAGTTAACAGGTAGTGGTAAGAGCTGATCCAAGTTGGACGGCCTACTGC TCTAGGCAAGATATATGCTGTCTACTAGTAACTGCAAGTATGTTATCAAA CTTGCGGTGTGGATAATCCATTTGATCTAGACATGAGGCCTGAGTCTTAA TAGGTGGAGGGGGTTATACCAGGACATGAAGCTCTTGTTGCCCTTAAGTT GGTGGATTATAAAATGGTAAACTTAATGAGGAAGCTACAATGTTCCGCTG CAAGTTTGAGCAGCCTGACATTGTTTGGCTAGTTCTTCTTAGATTATGAT GTCAGGGTGTTACTGGACATTTGATTATTCATGATAGACCGCGAGCACTT ACAACTATTTGTTTCATTCGTCACATGGAACTTCTAGAATGTAACAAAAA ATACAATGAGTGGTAGGACAGCTTGTTTGCCTTTATATTACCCTTGAATG CAAAAGAGAAACAAAGAGGAGTCGATTGGATTGTCAACTTAAAGAACATG TTGACATGTTGTGCTTACTCGTGTCTCCTTGAACCGCTTATAGGAGCTCT GAAGCTAAACTCTATTTTAGTTAAGAGCTACACATTGCTGTAATGTTTTG ATGAAGTGAAATTTTATTTGGACTCCGGCCAGATGCTCAATTACAGCATG CTGCTATTGGGAAAAGCAACTACAACAATTGTTGCCAACTGTTCAGTTGA AACAGTATCATATTTATTGACTGTATTTCAACACCCCATCAATTTTATGC TATCTTAGACTCTTAGTGCACCTAATGTGATGTACTGTTTCTGTGTTTTT TCCCTTCTTTTTGGTGGAGGCCAGTGTTTAATGTTCAGTTGTTTGTATTC ACGGTATTCTTCAGCAGTGGCGAAGGACGAAAAAAATTGAGGTCGGGTGA ACTCTAAAACATATAATAGGTTTTAAAGAATCCCCTATATCTTCTTCCGG TTGTTCGGCGGCCCTAGATTTTTACATATCTTTTTCCACTTCTTACTCTT GCTCTTACTCTTCGTTTACCATAAGACCCATAACATTTCCAGTATCATGT ATGATTGGTTTAGTGTTGCTTCCACTAGAAAGTGGCATAAAATATCTTGT CAAACTTCAATTCACAATTCACAGTTCATAAATTCACCAAATAAGACAAG AGTCTTCTACCTAAGTGCAAAAATTCAGAAGAAATATACCTTTTCCCATT TCCTCCTTTGCTGCCCCTTCTCTTTCCTGCTCATCTTCAATTTCAATCTA CATGAGGATGCCTTCAGCAGTGCCGTCCCAGTTGGTCCGCCGCCCCTCTG CGCCCGCTACCGGCTGACAGCCACCCCGCTGGGCCCGCTGCCAGATAGCC TGCCGTTCGCCAGTCCCCTGCCTGGTCCAGTTTTGTCTTCCACTCTCCCT TCTTCGATTTTGAGTCTGGAGATGAGGCCGCCTCCAGCAATTTTTCCCGC CTCTTCTCTGGAGTCTGGACAGACCTCTGTTTCTCTTGTTCGTATGCAGT TGGACGATGCGAAGCGAGCAGCTGGAGGCTGGACTGGTTCTCTCGTTCGG CAGTTGGCCCAAGAAGACTACACGGCCCAATAGCCATAGAGCCTGGAGGT CACGTACGCTAATTATTTCCTTTCCTAATTTTCCCTAGCTGATCGATACG TACGTTTCCTGCGTAGGTGTGAAAACTTTTTCGTCGCGAGCCATGGTAGG GCAGTCGCCCAACCTCGCCCTACCGAGAGCCTCACCGCTGTTCTTCAGTA ACATATATTCTTCTTGTCTTAGTACTTATAAATTATCATGTGCCATCTCT TCCTGTTTAGCTCCACGTTTTTCTGTAAATTCGTTCTAGTTGGTGGAACC ATTTCATGTAGTGTAGTGTGTATACAGGTATCATTATCCTGTTGTCTGCA AATATTAGGCTCTGATTTGTTCAGACTTAGTGTTGACTGAGATGTGCATT GAGCCGAATTTAACTGTAAAGAAGCTACATTAGTACAAGTGAAGCAAGAT AATATGGATTGGTAAGAGCTGATCCAAGTTAGATGGCCTGTTGCTCCCAA CAACATATATTATGTGTGCTTCTAGCTTTAAGTATGCTATTAATATGGTG GTGTGGATTATCCATGTGGGTTCATTTGATTGAGACATGAGGGCTGTGTC TTCCTTGGTTGAAGGGATTTTACTAATTACTAGCATGGGAAGCTTTTGTT TCACATAAATTAGTGGAGTGCATGCAAAACGGTGAACTACAAGGAACTAT GAAGCTACAATGTCCTGGTGCGCATTTCAGCAATCCAACATGGTTTCACT TGTTCTCACTAGATTTTATCGTTAGGGTATTCCTGGACATTTGGCAATTC TTTGGATACTTCAGCTGGGAGTTAAAGTCTGTAAACACCTTGTGCATCTG AGCACTTGATCAAATGGGCCGTAGGCATTTAATGGTCTTCACTGTCAACT GTCGCTCACTTTTCGACTGGCAGATTGTGCAAATATTGGTCTTCACTGTC AACTGCCGCTCACGTTTCGACTGGCAGATTGTGCAAATATTAGTTGTTTG ATCGGTCCATTTTTACTTGAGTGCATTATTTAACGCTATAATTCATTAAT ACTGTAAATGTGATATCTCAAACTATTTATATATTCATCACAGAGCACTC TCAGAACGTAATTAGAAATACAACAAGAGGCAATACAGATCCTTGTTTGC CCTTATAAGTGGGATTGGGTGGGTTGTCAAATTAAAGAACATATTGTGCT TACAATTGTCTCTTTGAACCACTCATGGGATCTGAAGCTAAACAATGTTT CTTGTTAAGAGCTATCAACTGCTGTAATGATTTGATGAAGCGAAGTATTC GTTCAGACTTTTGCCAGATGCTCAATTACATTAGCTATCAACTGCTGTAA TGATTCGATGAAGCGAAGTATTTGTTCAGACTTTTGCCAGATGCTCAATT ACATTATGCTACTGCTAGGAAAAATGACTACAAGAATGGTCGAGAACTCT TATAACTTGAAACATTATTATATTTTATTATTTTGGCTTGCTGTATTTCA ACCGTGAACCGCTTTTTATGCCATCTTAGATTCTTGTCTCGGTGCACCTA ATGTGATGTACTGCCCCATTATTTCCGGGTTTCTTCATGTCTTGTAGCGC CAACATGTCTCCGTGTTTGGTTGCTAGTATCCATCTTATTTCTTCTGTAG AGTATATTGTTGTTATTTTAGTGACCATTATTATCATGTGCCGCCTCTCC TTGTTTAGCTCCACGTTTGTCTGTAAATAGTATATTCTAGTTGGTGAAGT CATTTGGTTTAGTGTGGCATTGTTTATCCTTCTGTCTGCAATTAGTAGTA CACGAGTACATAGCATTAACGGCCTTGCTTTGCTACACTATTATTCGTCT TATTAGTAATTTGGTATGTTGTTTCAACAGACAGCAAGCATATTCTTCTT ACTGATTGCTGACACTATCTTGACTTTTTAGCTCTGTAGTTCTTAGTGTG GCTCTCTACCTGGTATTCGCTTGGTCCAAATACTGCCAAGGAATTAGGTA CATAGGTCTGAATCGTTGATACAATCTTCCGCAAGGGGGTCCTTGTGGAT CTGAGTTTCAGATTTGAACTGGGTACTTGTGCACTGGACCGTGACTAGTG CCGGTGCTTTGGCTGCTTGCATCAGATGTTTTATTAGGCTGAGCATGCTT CTCGCGTCCACATGAGTCTGAAGTGAGATCCATTTTTTATTTTTGTCTTT TGTCAGACTTATAGTTCCCTTGCATGACCATCATACTTGTTAGACTCAGA TGCAGTAAGATCTTAGTTCTGTGATGACTGGTCTATCTTACTCTTTTTTC TTCTCTTATACTCAGGCTGTTCTATGGACCTCAAGGACCGTACTCCTTGT TTGCTGGGCGGGATGCATCCCGGGCCCTGGCATTGATGTCATTTGACCTT AATGACCTGACTGGGGACCTGGAAGGCCTCAGTCCAGATGAACTGGAGGT TTTACAGGACTGGGAAGAGAAATTTAAGGAGAGGTACCCTGTGGTGGGTC ACCTTCCTTCCGAGGACGCAATAGCTAGCGATCAGAAGGGTGCCGAGCTT GATCACGAGGAAGAGGACTCCTAACTCTGTCTGTGGGTACCTGTCTCAGT TGCCTGGGTTCTCTGTCTTTTACTACTGGAGTAGTAGATCTGATCCGCTG ACAGGTGGTGTTGCTTGCTTGCTGCATGAGCGTGCTCGCGTGACTAATGT ACTACTGCTACTACTACCTGCTTTCTCCATCTGCTTTACTTTGGTTGGTG TGTAGGGAGAAATTTTGATTTTGAGTGACGGAGTTAACTCTGAGAGCCGG CTTTGCGCCCGCTTGATGTGTATGTGCTTTGATTGGCGGCTTAATTATCG TTCCCAGACGATAATTCTGCTGGCGATTTAAGGGGCAATAATTTTGCCCA ACCACACTGCTGCATCGCTCCGTTTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.