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GrainGenes Sequence Report: AE042155

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Sequence
AE042155
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042155
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGCTTCCTCCTCCTTTGTTCGGACCGATACAACAGCCTGAACCCCAGC
TTCCAACCCCTTCCCGTGCTCCGCCGCCACCGACCTCGCCTTTCACTCCC
CGCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCTGTCCCCGTCGCATCCGGCTGAGC
CCTAACGCTCTCGAATACCCCGTAAGGGATCTCAGCATCTCAACGCATAG
TCTCCTCGCCCTCCCTCCGCAGAGGTAAGCCCTAGCATCCATCGGTTTCA
CTCTTTTCTGCCTTCGCCAGCAACCAAATCGCTTGGCCAGGTCATGCTCG
TTCGGCCATGTCTACTTTGGATTGATCGCTGGTATGTTTTCTGTTGCTGA
TGTATTATATGGGATTATTTACCCCGCAGAAGCGCGCGCGTGTAGCTGCG
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TTCCGAAGAAAGGGCCCAATCCGTACGGCCAGCCGCCGCCCTACGGGGCG
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GGCTATGCAACCTCTACTGCAGCGGCTGGAGGCGCTGATGGTGCTCGGTT
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GATGCCATCTTCCAACATAAGCTGTTTATCCACACTAGGACCTCAGTCTG
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ATATAAGTTCTAAAGCAGCCATGTCTTCAAACTATCCCTTTCTTATCTTT
CCCAACATATGCATCATTCCATAGCCACGATCCCATGCCTTTTGGGGAGG
CATCAATCTTTAGCTGAAAAACATGAGCACCTTAAACCATCCCAAACTGG
TAGCTTGGGTACCTTGTGGACTCACTGAGAGCTCCCCAACAATTCGGAAG
CTGAAGCTGAAAGAAATTCTGACATCCTGAGCTTTATGTGGGTTGGTGTG
GGTAGAATGACATTATGGTGCCATTATTTGCATAAGATTTACTAGGTACA
AATAGGAAGTCATCTCTCCTACAAGGCCACAACCACATTACTGCAGCTTC
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TGCCGACTTCCTTCTCTATCAACTACAATAACCAATCTGTCCAAATGAAG
ACCATAGAGCATGACAAGTTTATCTGAGTTCTTTTGGGTAGTGAACATGA
CTCAGGAGATTGGGGTCTGCAACCCTGAAAACATTTGCGACTTTCCTCAC
TAAGTCACTCCACATATAATAAATGATGAACCAAAAATCTAGTTCGCATT
TTTTGGGTGTTTAGTCCATCTTAACTACATCCTTTGTTCCCTGATATAAG
ATGTTTTGGCAAACTAAATTGTTCCCTAATATGAGACGTTTTGGCAAACT
AATTGCGTTGTTTGTTCTACATCACAAAATTACCAAATCTTCTGGAGAAG
ATTTTTTCCCCTTTTAATTCGCCTGCTATCATTGCATGATCTTGTTGCAG
AAAATGTCAATTAATAATATAATACCCCACTAACATATTTTGCAGGCTGG
TGGACTTGCTACCAACGGCCCAGGTTCTTCGGATCTTAGCCTGCAAGCTC
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ACCAAAGCTAGACCAGTATGGTGCGAATTATGAATTGGAGAGAAGGGTGT
ACGGAGAACACTCAGCTAATATTAGCAGAAGAGATGGCCTCAATGATTTG
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TCTCTCTCACACACACACACACACACACACACGCACACGCACACACACAC
ACATGAACACAAGCGCGGGGGTACTTTTTTTTTGCTCCTTACCACTTTGA
TTTTACAATTTATAATATAACTTATTGTCATTCATGTGATCTCAGATTCA
TGACCGTGTAGATCAGGTAATTTTTGTTTCTCCCTTACAAAACATCATTT
TGTTCTCATTTATTGCCTACTTTGATAATTCATGAATTCTCATTATCGAA
ATGCTACTAATATTTTAGGTTTCATCAACACGCCATCCTCAGCTCGTGAA
AACTCAGCTGCAGCCTGGTTCTGATATACGGTGTGTGTTTTTACAGTCTG
GTTTACAGTATTTTAGCTTGCAGTAAGGTTCCAATGACCGGCAGGTTTTG
CTTCATATTATTGTTACTTCTGCTATTTACCTATCGATACTACTGTTGCT
ATTATTGTATTATCGCTTTAAGGTTCAAGTTAAAAGTTGCCTGCATCTCA
GTATGTTTGGTTAGCTGTACAAAATCCCTCGATAGCCCTCGAAAACAAAT
CTATAGCTAACTAGCGACCTTTGTGTCTGTCACCACAACAAAACATAGCA
TATGCACTGAGAAAAGTATGCATTTCTGGCAGACAAGCTGATTACTTTGC
AGGAAGAACCGGCCCAATCCATCAAGGATCCCAGGAAATTGGTGCATATG
GAAGAGCCGAAGCAGATCATCACAGTATGTCCCTTCTTGGATCTGTTACA
TATGGAGGCCAACAACAAGCTTCAGTGTTGGGGAGAACTCAGAGGTCAAA
CATGGACAGCCTTGTCTATGGACAAGGATCATCGAGCAGTGGTTTTGGGA
TGGCTCTCCCCCCTGGACGCGACTATGCTTCAGGGAAAAGCTTGCTGCAG
CCAGCTTCAGAATCTGATTACCGAGATAGCATCCTACCACGTGTACATCC
AGGCATCTCCATGGTCGATGAGCGAACAGGAGACCGTGTTGGTTATCGCC
GTGAACTGGATCTAAGAGATGATGAGCGTCGAATGGACCTTTTGTGGGAA
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AATTGAAAGAGAGCGGGACAGGGAGCGGGAGCGGGAGCGCGAAAGGAGGG
AACGTGAACGAGAAAGAGAACATCTTCGCGTACGCCGGGAGAAGGAGAGG
GAGCGGGATAGGAAGCACGTGGCTGTTGCAAGGCGGGAGCGCACTCCTCC
GAGAAGACCTGTTGAACGGCGACAATCTTCTTCTGTTAGATCTGAGAAGC
CTTTGCGGAGACTTTCACCTCGTCGTGATGCTGTGCATAGGTGGACCTCC
ATGTTTACTTGTAGCTTTGTGGATCCAACATGTGCTGCTTCGTCTTCAGT
GAAGCCTTTATAACTAACTCTTTTGTTTGCTGTCCTGAAGGCCTCGTACA
CCTGTTAAACAAATAAAGAGAGAATATATTTGCAAGGTAAACGGATAGTT
GTGTTTGTCACATTGTTGTTACTCAAATCATTAATAATGATGTTAGGGGC
TTACCAATCTCCTTGATGTACTCCTGGTCGTACAGCCCCCTGATTCTTGT
CCTTCTGAAACCAGTTCCTTTTTGCACCTCTGTTTCTGCACACATGTGGA
ACTATTTTGTTCTATTTTCTTCTGGAGTTCCATTTATTCATCCATCTTCG
CTGATCCTTGTTTCAGCATCTCTAGTAGTAGTAGTAGCTATTTCTCTATC
TGGTGCCAAGATATCGCTTTCCTCATTGTGATATGAAAAATCTTGAGATC
CTTTCTTTCTCCAATTCGAAGACCATCCCCACCTTAATTGCGCCCCATTA
TGCATTATGGTGAATCATGGACAAATTTGCCTCCTTCTCTGTTGCCTCTC
CTTTGTGCAACTGATTATGGCTTTGTATGCATTTATTTAGTTGTTTGTGT
TGCTTCTATTATGAATTTAATGCTAGTTAGGTTCTTACGTGCAGGTGTTT
CCATTTCGCTTGGTGGATGCTGAGAGGGACTATATATCTTTGACGAAACG
ATATCCTAGATTAGTCATTTCTCCAGATTTTTGTAAGGTTCGGTGTTGTA
TCAATGACTTTGATTTTGTTCCATTGTGGATCAAAGGATTCTTTTTTCAT
CTGCGATTAATTTATCTTATAGGTTGTCTTGAACTGGCCCAAAGGAAATC
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ATAATATGGTTGGCTGCCCAAAGTGATCATTCTTTGTTTTAGGAGCAATA
TTTAACCTATTTTTTGCTATTGCCGTGAAATAGTTTGGAGCATGACATCC
ATGAAGTGGATGATAAGTTTGACGAAAGAACAGTTTTATCTTCAGAGAAA
TCGAACTGCACCAACACCGCAGATACTGTTTGGAATGTAAAGGTTTGTGT
CTACAATTTTGTGTATTCTAAGTAAGGACTAGATTGAGCTACTTATTTTC
AGAAGTAGCTATATTTAAACGATTTGCTTATTATAAGTGCCCCATATTAC
TGTACAAATCTATATTGTACCAATATGTATAGGAATCTTGTGGCACACTG
TCTGTTGGGATTATACTCATGTTTGTAGAATGTTCAGACAAGCCCTTGTA
GCTTGTAAAACTCATGTAGCCATGTACTACAAGTTATGGTACCCCATTAT
CTGACGTCATTGGCTTTCCTATTTTTTGGACAGTACTTGAGTACTTGATG
AAATAATTTGGTTATTATGCATTGTAAAAAAAAAGCACAAGATTCTTATG
TGGGTTGTATGCTTAGGATGTACTATCTGTATTTTTGAAGCTTTTTAAAT
TTTGAAGTATTGCCAAATTGGTCTTTTGTCATATTCTTGTTCTAATGATG
GTGCACAGGTTCTCTTGATGAGTGGCATGAGCAACGGTGCTTTTGCTGAT
ATATGTTCATTGAGAAGTGCTGAGGACCGAATAGCGCACTGGAACAATGT
CTTAAAATTTGCTGTATTTAAGAAGGATCATGCACTCGTTGCAATTGGAG
GTCCTTGGAATGCAGCAATGGATGGTGGAGATCCGTCGACTGACTGTTCT
TGCTTGATTCAAACTGCTACCAGGTATATAATCATATATTGGCAAGATGG
GTGATCTGCAGTTGTATTGAAGTTCATTTTATTTCTTGAACTGGAAGTTG
TGCTAAAATTCGCCTTACCTGTACAGATATACTAAGGAACTGGTTCAGGT
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CTTTAGTATCTCGCACTTCTGGTGAACTTGCTTGCATTCGTAATTTAAGG
AAACGGTATGCTTTCATCAGATTGGAATAATAGTACTCCCTCTATTTAAC
GATAGGATTTGGTTAACCATTTATCTTTCGGATAGAAACCTATTGAACTA
TTTTCTGTAGAAGGGAAATTAGGTTAACCATTAGGTTATTAGGGGCATAA
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CTATGGTGAATACTCGCAAACTCGGCTTGCCAACTCGAACGCTAGCTGCA
ATTTTTTTTTGCCATGATCTCTGCTAAAATACTAACAATTCACAAGCATA
TTCAAAATTTCACAATTCACAAGCATATTTTATGAGTATACACAGGAAAC
AGATGACTATGACTCTATGAGTAGTTTACACAGACGTTGATGCAGAGGTT
GATGGGGCTGTAACGAACTAGTAATATTAAAGGCTAGCAACAGTGTTTAA
CAATAAACAGTGTACACTGGAACTGCTAATTTAGCTACAAGTCGATTTGA
ACAGCATAAACAATGCAAGTACGCAACATGGGAAAAACCGCAGTATTGTC
CTGATTTCAAGTATCTGCTCTCGAAATCGCAAAACAATTGAAAGGAATTA
ATCTGCTCGGTCTGCGGTGCAAGAGGTAGTCACTCGTGGATTTTTGGAGT
TGTTGGGGACGAGCTCCCGTCGGTTGCAGCATCAGTCCAGAAATCCCCAA
GAATTCCACCTCTACTAGCAGTACTAGGAGTACTACATCCATTGATTGTT
TAAAGAAAATCAGGCACTTCATCAGAGCTAGTCAGAAAGGACCGCTGGAG
AACCACCTGCAACTTCACCGGTGTAGGCCGTAGCGACCGGTGCGGTCGAT
GGTCTGGTAGGAGGGTCGCAGGAGGGATGAAGGAGCACCGCGCCGCCAGG
ATGAGGGATGATGAGGGACGCCATGCCGGCGTCCGTCAGTGAAGTCGCTG
TTGGGAAGGCCATCAGCGAGTCATCCTAGGGAGGAGATGGAGTTGGTAGA
TTAGGGAGATGGACTGAGGCACAGAGCCGCTGAGGAGATGGAAGGGATGG
TGGGCGGCACGTCATTCGGCCGGAGGTAGGCGGCGCTGGGTGTTAGAGAC
GTCTACACGCGAGATAACCATCGGTTGATTTGGGTCGAACCTAAAGGACC
TAATCCGATTTTGTGTTAACCACTTGGCCCATTGGGCTGTTCCTTAGGTC
TATGGTTAAACGGGAACCAAATCCCATCGTTACCCTCTATTCCAAAACAT
AAGGCTTATAAATTTAGTCAAAAGTCAACATCTTCTAAGTTTGACCACAT
TTATAGACAAAAATTATGAACGTCTACTAGACTAAAAATCAATATCAATA
GATTCACCATAAGTTATATTTTTATAATGTATATCTGTTAAATGTTGTAG
AGGTTGATATTACTCTCTCCTTGCCAAATTGTAGTGCATATACGATTTTT
TAGAAGTCAAATGATGTGAAGTTTGACCAAGTATGTATGAAAAACTATCA
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TCATATGGTATATATTTGGTACTGTAGATATACGTACATAATTTACTCAA
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GTAAGATTTGAATTTTGAGTAAACTTATATGCCTTATATTTTGGAATGGA
GGTAGCAAGATATTATTAGTGGTCATCAAGGACTGAAAGATATAGGTATA
TGTTGTAGACCTTTCAGTTTCTCAGAATGGAAGATGATTCCTAATATATT
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AAATATTTTTATTACGTGCAAGTTTTAACCTCACCTATAAAGCCTTAGTG
GAATATATCTTGGACCAGTACGACTCCTACCTGGCAGATTGTAGCACACA
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CATTTGTCGTCATATGAAGTCCATTTTAAATTTAATTTAGCACATCTGTG
CGACACCATTGCTAAAATCGTCATCATTTTTATAACATGTCTAACTATTT
GCAGGTCCATTACAACAGAATTGGCAAAGACGGGCTCTTTAGTCATAAAG
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GGATAAACTGACTATAAAGAATGAAAAGGTCAGTTTGTTCTATCATGGTT
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ATACAGAAGAACAGACGAAAGGAACAGGTGATGACCATTTAAGGACGGTT
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GGAAATACCTCTGGTGGTGTCCCTGTTGACAATGCTGTCGAGGATAAAAA
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AAAAGCCAACTGCTGAAGCTTCAGCTGACAAGTCATCTCAGGTGGACAAG
GCTGTCGTGGTAGAAACCGTGAGCCAAACTTCGGAAGAGGTAGTTCAGCA
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CCGAGACTAAGAAATCTGGGAAGAAGAAAGTAATTCGAAGGATCGTTAAA
AGAAAAGTTGTTGCTTCAGGATCCAAGTTGAATGCGTCTACTGTTCCAGC
TGAAACAAGTAAACAAGGAGGGGAAATTCAACTGGAAAATAATGATGTAA
GCTTAACTGATGCTGAGAATTTGCAGATTAAGCTTTCAGAAGGGTCAGAT
GTTGCTGCTGAAGTGATTTCAAATCAGAAGAAAGAAGAGAAGGCAGATGA
AGGGACCATATATACGGAGAATCAACAATCAAATGGAGATAAGTTTAATG
AACAGGAAGTTGTGAAAGAAGATACAAATAAAGTAGGGGAAAATGGAACG
AAAGATAAGACAAAGGATGATAAAGAGAAAACTAGCAAAGACCTGAAGAA
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GTGTCGTGGCTCACAAACCTTATAAGGTTTACCATTTTTTACCGAACTAC
TTATTTGTAGCTTCGTTCAATATCCCTTTCATTGGATGGCTTACTAGACT
ATACAACCAATGACACCGAGGAGTCCGTATTTGAGGTATAGTTTCTATCT
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TGTTTGCCGAGTCATTCTGTGAAATGCTTCAATTCAGAATGGGCTGCACT
ATCCTGTCTTTTCTTGAGGTAATTTTTATAGCTCTGCTAAGACTTCGTTA
ATTTTAGGCAACTCTGACCACTAATTTATATATTATGTATTTACAAAATC
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AACCGGATGGAGTTGTAAGTTATGATAATCATATTTACTGGTAATTGTCC
AAACTGTGGCATTAAGGTTTGTAACTTGAGGTTGGTGCCTTGTTAGCAGT
CGAGATATCATGTTTGTATTCTCAGGCAGGCTTTTGATTTGTATTCCCTG
TTCCTAAACAACCCTGTTTGGCCTTTCTTTCTCTTGGTTTCTGTTCTGTC
TATGTAATAAAAGGGGTTGCAGTTATCATGTTTAATAGGAGGTTTCTACC
CATCGGTATCTGCCTACCTGGGTTTGATGTTCGTTTGTTTCACAGAAACT
GCACACGCACTATGTTACAAAGAAGAATCAACGTAAGCGCCCAAGGGAGG
AAGATCTAAAGAAGGAAGATGATAAATCATCAGAAAAGCGACCAAAGACA
GCCGATGATACTCCTACTGAAAACACCCCTAATAATATCAGTGCAGTAAA
GAACGATGAAATAGTCGAAGATGATGTGAAAAACATGATCATAGATCAGA
TACCAGCTGCTCCTGCTGAACCTGAAACAGAAGAGAAAATGGAGGATGAA
GATCCGGATAATGAAGAAGATCCGGAGGAAGTAGAAGTTTATGAAGAAGA
TGATGAGGACATGGATGGTCCTACTGCTGAGAAACAGGTAAATATTTTTT
GCACACATTTTTAATACAGTCCTATGTATCATATTTTCATCTTTAATTTT
TGCACAATGGTAGAGATGTCTGTTATATGCTGAGATGATTATGGGATTTG
CACTTTTTCTTAATTGCATATTTTTACAATAAGGAATTTGTAGCAATAGA
CATATGGAGCATATCTTAAGTGGATAGTTGCCATTAGCATGCATGTCCTG
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AAGGAGTGTATCTAGACCCCTTTTAGTGTATAGGTTCACTCCAAACATAG
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CTTCTATACTTGTTACATCTGTGTTCTATTGTTTTGAACTAGAGCTTAGA
AATGGTAGTTCAAGGTTCATGTAAAGAGAACGGTTTTGTAGTTTTTTTTT
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ACTATGTACCAGATTGTTTGGTCTGCCCAGGAGATTGTGTATCTGTATTA
ACATATTCACATGCTGCAGGATGGGGATAATTTGAACAGTACTGACTCCA
ATCCAGAAGAAGTTAAAGGAAACAAAGGAGGAAAGGAGATCGAATCAGAA
AAGCCTGTTTCAGGGGAAGACACGCCTACTAAGGCAGAGAAAGGAGGTTT
GGTAGAAGTCGGTAAGGAGGGGAAGACACCTGTATCACAGAAAGGAGATT
CAACAAAACATGAGGTGGTTGATAAGGACCTGTTGCAGGTAAATTTTCTG
TTATGTGTAAGAAATTAAAGAGTTTTCATAAAAGTTAAAATGTTGCTAAT
GTGTGTGGTTTCCCCCTTATCTTGTAGGCTTTTCGGTACTTTGACCAAAA
CCGAGTGGGTTATATCAAGGTAAACACACTAATGATGCCTTTCTTTGGAA
ACCATGATTGCCTCCAAGCAGTTCCCGTATTATTAATTGCACTGTTCTTT
TCTTGCAACTACTGTGCTTATGTTGTGTTTTCCATATTTAACAACTGCAG
GCTGAAGATCTAAGTCGGATTGTTGACAATTTGGGGAAGTTTTTGTCTAA
TAGAGATGTGAAGGTCAGATATTTGAATCTGTTATACCTTCCCTAGACAT
TAATTGTTGAAATTTTCTCGGAACTCTATTTTGTAATTTATTTTTGTGTC
TTTCCCACTCTAAATGTTTGAATTGCATGTGGACCAAAAACACAGCGAAG
TCCTAAATAAGCAATTCTCTTTTAGTTTGAGTACCGAGAAGTTTACAGCA
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GAGTTGGTGCAGGCTGCACTTGCTGAGAGCAATTCTGCAAAGGATAATCA
TGTTATCTATACAAATCTTGTGAAGATGGTTGATCTATGATGTATTCCTG
TTTGTAGTTGCGGGAGGTAGCTTTACCGTAGCAGTTCATAAGTGAAGTTG
CAACTTGTTCATCGAAGATCTATTTGAAGCCTTGAAGATGAAGCATGAAG
CTGACGGTGCAACTTATTCATCAAGGAGTTATCTTTTATGCTTCTTTCAG
CAATGATTTGTGCACATTTTAGTTTCTTTTTGGAATTGGTACTTTTGTGT
TTTATGGAAGGGTCTGAACGTTAGCTTGGAACTAGAAAGCAGTTGAGCAG
AACTTGTTTGCACCGAGAGAGAGATTTCTGAATCTGTATAATTGCCTCTC
GAGAACGTTTTGTGCACCTAGCAGACTTTCTCTACATTAGCCGTGTTAAC
CGTGTTAGGGTATACTCTACTTCATTAGCGCAGTACAATTTGTATGGTAC
GTGAAGAAGTCCAAAACAGATGTTGTAGTGGACAAGAGAGCATCTGCGGA
TGGCGTTAGTAGCAGGAAAAGAAAAAGAAACAGCTAGGAGTTGTATCTTC
AGCGTGCGTGAACCAGGAGCCACGTGGCAAGGAGAAGCGCGACAATGCTG
CGAGGAGCCGTAATCCTGGGGCTGCTGTTGTCACCGTAGATGTCCGGGTA
CTCGCCTAGTGGTGGCTCCAAATCGTTGAAATCCCCTCTTTTGATGGTGT
GGCTGCATCCCCTCCTGAGGGCGTAGCGCACGTCCTCGACGGAGGCGCCG
TTGTAGAACCTGAAGCCGTCCAGCGCGCTGGCCACGCAGTTGAGCACGTC
CTCCGTCTCCACCACGCACGCCCCGCCGCAGTAGTAGTCCACCGCACCCA
GTGGCACGCCGATGATCCCCGACGGGTTCAGCCGGTACGCGTCCTCGCAG
CACCCGTACACCTGGGACAGCCACCAGGACAGAAACGATTCCTCAAGGTA
AGACAAGACGCTTAAAAAAATCAAAGACAGTGCGTGTACCTGGCCGCCCT
CGAAGCACTGCAGCGACCTCGCGGGCGTGTCCGGCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.