Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA027412

[Submit comment/correction]

Sequence
AA027412
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027412
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTGGCAATGGTAGTCTCGTGGGCGTGGCTGCTGGGCGCCGTCCCGCT
GCTGTGCCTGGCCTTCTGGCACGCCACCGACGGATGGTACCGTGCCGCAT
TCTTCCTCAAGCACGGCTACAAGAGGGGCAGCGATGGCGTCCGCCGCCGC
CTCCCGCCGGGCCACATGGGCTTGCCGTTCCTCGGCGAGACGCTGTCCCT
GCTCTGGTACTTCAAGCACGCGGGCCGCCCCGACGAATTCATCGGCGTCA
GGAGGCGCGCGTACGGCGGCGAGAAGGCGGGTATGTACCGGACACACCTG
TTCGGGTCCCCCACCATCGTGGTATGCGCGCCGATGGCCAACAAGTTCGT
GTTCCAGGCCGCCGACGATACCTTCGGCATCCACTGGCCAGTGCCGGAGC
TGGTGGGGTTGAACGCCATCGGGAACGTCGAGGGCGGCAACCACACCAGG
ATGAGGGGAGTCTTACTCAGCGCAATCAACCGGCCAAGCTCGCTCCGAAC
CATCGCCGCTGTAGTGCAACCGGGTGTTGTGGCGGCGCTCAACTCCTGGG
CTGACATGGGGACCATCGTCGCCTCCGACGAGGCCAAGAAAGTAAGCATT
AATACTCCCTCCATCCCAGTTTATAAGACTTACGCGTATACCTAGTTCAT
CCGCATGAGCTATATAAAATAAATTATATTATATAAAAATTATATTATTA
TAAAATACTAAGTTGGTTAATTTGTTAACCTAAAAATACGTGTAAGTCTT
ATAAACCGAGACGGAGTGAGTAGTATACTTTGTACTTACATAAATGTTCT
CATGAGGCTCTTTCCTACATCGCCCTCAAACAATTGGAAATGAATCAATG
ATGCATTCGTCTATCTATTAGATGGGTTTTGGGCCTCTCCCAATATAATA
CCTCCATTCCTAAAAAAGGCTTATAATATTTAAAAAATTCAAACTATGTA
AGATTTAACCTACTTATTTGAAGAAAAAAAATACAACACAATATCAATAT
TATTAGATACATTACGGAATAAATTTTCATATAATATATGTAGTATTGCA
AAATAGTGGTCTACCTTGGTGGCTAGCTGCAAACCCTATCCAGCCATTTT
TTGAATTTCTTATACCCGTTTCAAACTATGGTTAAAACGACGGACACAGT
TATCCTTGTATTGGATCTCTAAAAAAACATCATATTGTGAGGCTAAAATG
ATTTTTGCAGAAAATTATGAGCATTAGATCATGTACATATAGTTTAAACC
GGACCTACTTCCTACCGATTTGGCGGATATTTGTCTTTTCCATTAGGGAT
GGACGGAAACGTTTGAGATACCCGTTTGGGACATAGTCCATGTAAGATGA
TCTAGTATTTTTAAAAAATAGGGTGGCAGCATTTTGAATTATGCCTTTCT
AGTTGCTTCATAAAACGTCCCATTTTTGGCAAACGGAAAATGGAAAATAG
ATTTTCCGTGCGACAGAAAAAAAATTTTCTCCTGCAACATTGTTCGTCAT
CACAAGATGTGCGTGCATAATATAGACACTGTATCACAAACTATATCGAT
GATTCTGGTCATAATATTGGTCATTTGGTCCGAAAGTCATAAACCTCGAA
CATGATAGCTTATTTTGAGAAGGTTTTTTTTGAGATGCAATCAATAAACC
ACGTTTGGTATTTTTTCCTTGCAAGTATATCACATAATATGAAACCACGT
GAATGTTTCACATTGTTTGGGCCACTTTTTAATTTTTTATGTCCGTTTTA
AACTATGATCAAAACGGTGGGCATGAAGATTATTACCTAGGGTGTGAGGC
TCGCTGAACTTGCATTGGATCTATGAAGAAACATCATATTATGAGGCTCA
AAATTATTTTTACAAAAAAATCATGGACATAAAATCATGTACCTATAGTT
CAAATCGGACCCACTTCCTATCGATTCGGCAAATATTTGTCTTTCTCACC
AGGATGGACAGAAAGGTTTGAGATATCCCGGTTGGGATATTGTACATCTA
AGGTGGTCTAGTATTTTTTTTAAATGACGCGGTAGCATTTTGAATTATGT
TTTTGGCGATTGCTTCAAAAAAATGCCGCGTTTTTGGCACTCAAAAAATA
AAAATGTGTTATAAGAAAGTATATATAATGTTTTTATATTTTATTCAACA
AAAATATGTAATATTTGAGTTAAGTTCGATAGATCTTATTTTTCTGAAAT
TTTTGATATATCATATGTATTTTTCTAAATTAGAATGATTTAATTATGAT
TTTTTTAGTATTAATATGGTAAAAAGGGAAAATAGCTATGCTGATGGGAA
AGTATGAAACCTAGGCCGACGGCTTTTCCGTCGGCGTAGCCTTGACGCCG
TCGCATCGCCGTCACGGCATATCCACTACGTCGACGGCCCTGTCTACACC
GACGGCTGCTGTCAGCTCATCCCATTCTACTACGACGGCCAAACTAGGCC
GACGACCGGTTTGCTCGGATGCCCGCCTCGAGGCCTACACCGATGGCCCA
GGCATATAGCCGTCGGCGTAGAGTTTGGCCATCGACGTCTTGATTTATTC
CTGTAGTGCGCACCTGCCTACCGCATGTCAATGTATTATTACAGTTATTG
TAAGTTCTTTTAAAAACTTTTTTATCAAACTTTACATATTTTAACTTCAA
AAAAGATTATAGGCCTTCAATTGAGGGAAGAATTGTCTTTTACCTCTCTA
TCGTATGAGATACAAGAATTTAGAGAGAACTACCCAATGTATTGTTTTTC
AAGTGTTGTATCTAAGAGAGGTTGTATTTAATTCATTTAGAGTTCATGCT
TGCACTTGGGCAATAATTTTTCTCCCTATGAACAAGTCCAAGAGCCTTTT
GTTAGACCATCCACACCATATACTCATCACAGTGCGTGAAACAGATGCAT
GCGGTCCGACAATTGAAGCGGTTTAACTAATTGGTTCAGGTTAAAGAATA
GTGTGCCAGGAGCAAACATTGTACTCCCTTGGTCTAGAAATAACCGATTT
GAGTTTGTCTAGATTTAAATGTATCTAAACGCATTTAGTGTAGAGGTATA
TTTGAATTTAGACAAACTAAAATCTGTTATTTCTGAACGAAGGAAGTAAT
AAACACACAAGGAGAAATAAGAGAGAAATGACTTTGAAGAGAGAGACTGA
TATGATAGATAAAATATTGCCTCTCACATGACAAGCGATTCTAACACTAG
AGTGAAAATAGAGTGGTTCTAAGCAGTGTGTTTTTTCTTCAAAAGAATCG
ACAATGTGGATGGTCTTAGCTAAGATACAATATTACTTTTTTTACTCAAT
AACTATGGTTCCACCTCAATAAATTTTGGCTATGATACCGTGTTATGAGC
CAAGTATTGAGATAGTCCTTAGCCGGTTCATTAGGTATATAATTCTGTAC
ACGAAAGACTCTTATTAACAAAATCCATTGAGTACTATTGGGACCTTCTG
CCGGCGGAGCCCTAATTAGTGATCATAGTTGCTGCTCCGTCTCGGAAGAT
GTTTGGCATGCAATTTTTCTCTGGTTGGAATATTTCGTCACCGGCCGGCA
ATCCCCACCTTACATGTTTTCACATGATTTGGTCAAATTCAACGAACCTT
GATCAAGATTTGACATATCTGAAAATTTGTTTGAACAATCTCAAGTGATA
TTTTATAATTTCAACCAGTGTTACCGGTAACTGATCCTACCGATGTCACT
ACGGGAATCGATCGATGTGCCGACAGCCAGCCTCTACGCTGTGGCCAGGG
CCGTCAGTGTAGCTCCAGGAGGCCCATGGCCAGGCGAAAGCCGTCGGCTT
AAAACGGCCGTTGGCGCACCATCCACTAGCCCTGCCGCCGTCACATGGGT
TAGAAATAGACACGTGTGTGGAGTTTGGGGAACGTAATTGAGTTTTTTCC
GACAAACAAATGCATGACCTTTTTTTATGGTCAAATGCATGAGCTTTGGC
CATTCAGAATTTGATTCGAAGGCACCAAAAGCGACTTTGCGTCATTCCAT
CCTTGGCTTCCTACGCATATGGTAGCTCAATTCAAAAGAAAAACACTTTG
TGGCTAGCTACTTAAGTCTCGAATCAGATTACTGAGGTTGTGCAATGATG
AAGCCGAGAGGACGCTGTCTGATCAAGGTCAAGGTCATGCGCCCGCAGGA
CAGACGTCCACCACGCGGAGGCATGGGCTTCCTCCATGACTAGGCGGGGT
TAGCAAGAACGCCAAGGGCGTGTATGGTGGATTGAGCTTATAACGGCGGA
ACGTTCTTTGGCGAATTACACAAAGCTATTACCAAACACGCCCACTACAG
GAAACCTAGGCTAGGCCCATGGACAAATGCTATGTCGCTGGCGATTTATT
GGGGCCGTCGGCACCGTTGGCACAACATGACCGTCGCATAGACCACATTT
CCTACGGCGGCATAGCGAATTCGGCTGAACCTGCTGCCTTCGAGCAATCG
ACAAGACAGGATCATGCGAACGAATGCTATATATGGGGAAGAAACGCTTT
GAGATTTCTTTGTTGCTTTAGAAATATAAAAAATATAATCAAATGCTAAT
CGTTGCTTACTAAAAATAAATGGTTCGTGCTTGCAGGTGACTTTCATGAA
TATATGCAAGATGTTTATAAGCATGGATTCGTCACCTCTAATGGTGAAGA
TGGACCAATGGTTCACCGGCTTGGCCGCAGGCCTTAGGGCATTGCCGTTG
GATTTCCCAGGGACGGCGATCCATGGTGCTCGCAAGTGTCGTCAGAAGCT
GAACGTGGTGTTCCGGGAGGAGTTGGAGGGGAGAAAAAATACGGCCAAAG
AGTATGACGATGTGATGAGTGGGTTTATGGAAATGGAGGACGAGCAAGGA
AATAAGTTGAACAATGATGAGGTGGTGGACAACATCGTGTCCTCTGTTTT
TGCTGGCTACGAGTCCACCGCCACAGCCATCATGTGGGCCATGTACCACC
TCGCCAAATCCCCCGATGCCCTTGCCAAGCTCCGGGTAAGACACATAATC
ATATCATATTATCATGTTAATTATCCCATATAGTAGTGGTCTGACTAATA
TAGGCCAAACAAGCTCGTGTGCATCTACTAATAATGTTCACAAAGCAACT
CAGACTGCACCACTTTTCTAGAAACATGTAAAACATATGTAGACGCGCAC
ACACATCACACCACACATATTCATCGATCGACTACTGAAGGCTAGAGTCG
CGGAGTCTCGAGATTGACGAAATCACCATAACGAAATCACCACGTACAAC
TTGGAATCCATGGGAATGTCTTTCATACTAAAGAATATATCCTTATGAGA
CATAAACACATAAAATCTGGAGTTTGATATCTTAAAATGTGGATGGAACC
ACTCTTCTAACCACCCAACAAATGGTTGGTTTTTCCCGTGGCAGTTTTTC
AATAATAGCATGATATCAAAAATAATATGGAGCTCAACTCTTTAACCATT
TCATATACTTCGTTTGGTCCATATTAATGTAGATAAAGTTGATGCCATTA
ATATGGACCCGAGGGAGTATAGTTATTTGATATTCATTGATGTGAATCTA
TCCCTAACCGGACACTTCCTTTGCGTCCACTCCCGGTTTGCTTCCCCTCT
GCCACTCTTCTATCCCATCTAGACCCGATCTCTTCTCCTCTCATCTCCCT
ATAGTTTTCCCTCCACCGCCCATCTCCCTGTCCAACATATAGGAGCTTTG
TTTCCCTCTTAGACCCACGTCAATGTCAAAACCAGTGAGACAGTATCGGC
ATCCCATATCAAACAGCACTTACTACTTCCTCCGTTTAGAAATATAAGAC
ATTTTAGTTTTATAAAATGGATGTATCTAGATGCCTTTTAGTATATAGGT
TCACTCTGAACCTCAACAAATATATACACTAAAATACATCTAGATACATT
CGATTCACAAAGCTAAAACGTCTTATATTTCTGAATGGAGGGAGTACGTA
ATTGCGCAAAGAAGAACCCACTTAATTTTGGTCATCCTTTCGCAACTTAT
TCTCTAGAAAAGCTATTCTCTTAACACCTTCATTTGAGATGGACATCATC
ATACATAAACAAACATTACTAAGGCATGATTTAATCAAGATTAGATTAAT
ATCATAATATTAAGTATCCTACAAGGTACCAACCATTTTCTATACTTTAA
TTATTTCAACTTTTTCGGTCACTGATGTTGTTAAGATATTGTAAAACAAG
GAGTCACCCCAAGCAAAGTAATTTCTCATGTTGCTAGGAGGAGAATGTGG
CAATGAATGAAACCAAAGGTGGCTCGTATTTTATCTCGCACGATGACATC
CTGAAGATGAAGTACACGTCGAAGGTCGTGGAGGAGACGATCCGTATGGC
CAACATCGCGTCCATGGCGCACCGCGTGGCGAAGAGGGACGTGGAGTATG
GTGGGTACATCATACCAGAGGGGTGGCACGTGATGGTGATGGTGAGGTCA
CTCCACACCGACCCGAACTACTACCAGGATCCACTTACTTTCAACCCCGA
CAGATGGAGTGTAAGTAGAATATATATTGTTTTTTTGGTACTATCTTATA
CTCTATCTGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTATCTAGATTTCT
TTTAATGTGTAGATTCACTCTAAACCTGAGTGTACCTATATACTAAAAGT
AGTCTACATACATTTGATTCACAAAGATAAAACATCTTATATTTAAAATG
GAGGAAGTATAGAATTATTGGAGTTTTACATGAATCAGCTAATGAAGATT
GATGAAGAATTATTAATGGACGCTGCAGGAACCGACCAAGCCAGGGACGT
ACCAGGTGTTTGGTGGAGGGTGCAGGATATGCCCCGGCAATATGCTCGCT
AGGCTGCAGATCGCCATCATGCTCCATCACCTCTCTATCGGCTACGAGTG
AGTACTAGCTAGAAGTTTTAATTCAAATAAGTGATTATAAGAGTCGGCCC
AGTTGCCAATGCGATTGGAGTATATAGGTAGTAGATTATTTATTTGCTCG
ATAGTGTTGTCTCTTTGCAATTAATTAATTTTTCCTTCATGTATTATGAA
CTCTAGATGGGAATTGCTGAATCCTGATGCAAAGATCAATTACCTTCCGC
ACCCAAAGCCAATGGATGGCGCAACCATGATCTTCCGTAAGCTTGCTAGG
AAATGAAAAGAAAGATTATATCTGCTTAATTATCATGGGCAATCTATAGC
TACATATATGTGGCTAAATCATATGCGTACATGTATGTTAACTTGGCTAT
CATGCATGATCGTATAACAGATCAGCAGTTAGTGGCTAAATCATATGCGT
ACATGTATGTTTACATAGCCTGGTTTCCACTCTCAAGTCAATTATTGCGC
AGACTTTCCTAGCAAGCATTCATATTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.