Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005214

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005214
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005214
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGAGGCCCGCAGCCCACAACCAGTTATCACCACCCTAGCGGCCCACAGT CGTCGTTGGAACAGGATGGGGCGGGGCTGCGCGGTTGCTCTCACGGCGGC GGCGGCGGCGGCGGCGCTGCTGGTGTCGCTGCCTATGCTGCTGGTGTTGC CGCCGGACGCGGACACGTACGAGCAGGAGAGCCGCCGGATGTTCGTGGAG TGGAAGGCCAGGTACAAGAAGACCTATAAATACGCCGGCGAAGAGGAGTG CCGGTACGCGGTGTTCAAGGAGAGCCGCTACCGTGTCGCCTGGGCCAGGG CCGACGGAGTGACCACATCTGGCCTCAACGGTCTCAGCGCCCTCGCCATT GAGGAGATCCAGCGCGGGTACAGGGTCCGGAAGGGGGAGGAAGCATACAA GCAGGAGACCCGCCGGATGTTCGTGGGGTGGAAGGCCAAGTACGGCAAGA CCTACAGAGACGTCGGTGAGGAGGAATGCCGGTACAGGTTGTTCATGGGC AACCGCCGCGTCGTCGTCCGGCTCAACGCCGCCGCCGCCGCCGGGCAAAA CGTGTACGACATCAACCAATTCGGTGACCTCACCAACGAGGAGGTCCGGG AACGCTGCTACCAGGAGATGGTGGGCGAGGAGCTGAGCGCTAGGTGCCAA GCCGTCGCCCCCGACCCGGACCCCGGCCATGGGAGGCGGATTTGGTACCA GGTAATCATCTTTTTTTATGACACTGTTGCTAGCGGTTTTTAGTTTCTCT ATTAACATTGTTGTTTCTTTACATGTGGTTGATTACCATTTGCATGAAAT GGGGATTATGGATTTTGTTTCCCTCTCCCACGTACTAGTCCTCTAATTAT TTATTTTGTTTGGTCAAGCGCACTAGTTTCTTTCGGTATCCATATGAACA CAAGTATGGAATGCCTTCTGCCTGCAGATCATGAGATCAAACGCCTATTT CAACGGTGTACCAGTTTGTAATGGCCTCATATGTGCAAAGAACTCATGAG ATTTTGAGTAGTGTCTTGGTTGGTAGACATGTGAAGATTTTTATTAATCT CTCTTTGGATATGATTTGATTAACTTAGCAGTTCAATCTGTATTATTACT ACTAGTATATGGTAACTGGGAATTCCTACATGGTTTTATCCAAAGTTGTA TAATTGTGTGATTCTGTTACCGACTGGAGTACATCATGGAAGAGAATCGA GGGTTTGGTTTTATGATCAATGAGTGTTATAGAAAAACATATTCCTTTGA TCAAACATGGACATTAAAGTTTCTCGACATTTGGACTGATATAAGCTTAC CTGAAAAGAGAGAGGGGGGGGGGGGGGGGATTATGGGCCCCTTCTTTTCA GCTTCTCGGCCAGCTTCTCCCAGAAGCTACCCTCGACCAGCTTCTTCCAG AATCTCATCTGCCAAAATCGTTTATACTTTTAAATTGACATTGAAACTAC TAGTTAAGAAGTTTGAACGAATTTTGAAGATGAGATTCTGGGAGAAGCTG GTCGAGGTTAGCTTCTGGGAGAAGCTGCCCAAGAAGCTGAAAAGAAGGGG CCCATGTAGTGTGCTAATGCTTGATAAGCTGGTGTTGTGGATCCATAAGT CATTTTTCTCTAATAGTTGATGATCTCACCATCTGCTATCATTTGACATG ATGCTAAATAGCCTGTTGGTCTTGGAAACATCTTAAGTCTGAATCTCGTG TGGACCAGTATTTAATCATAATATAATTCTCAATTCGCTAGTATTTACTT TTTTATATAGGTTTGCCGGTGCATTGCTACGGAAGCGGAGTCTGGAGGTA GCACTGTTCCTGGAGATGAAGCACACATGTGGATCTGAACGTCACTTGTG TGTGTTGCTGGAGAATTTTAGAATAAAGATGTTGCTAATGTAAATGGTTA ATTTGAGATGAAAATGTATGTACGCATTTCCAAGCTATGATTAAGATTCT CGTTTCTCATGGGTGGGATGTTTTCAGCTATTTGCTATGTCAGACTGGCG GGCCTCCTAGGACAACCGTTCCATCATAATGACTCTTGAAAAGGCCTCTC TCTCCTGCAATTGTAGAAACAAGATCTTAACAGTGGGAGCCTTGAGTGTC ATGTTAAACCAATCTTTGATCATCGGGCAAACAAGGGAATGCATTTACAC TCAGCTACTTTTCATCTTTATCTTTGAATTGACTACATTGGTTGGAAGCA CCGAGTTCTATGGAATTGCTTCTTTTCCTGTTGTCGTTCCTAAACTTCTT CGAATTTTGTCTTGGTTATAGAATGTTAATTTTTACAGGATGTTCAATTG TGAATTGTTGTGAACCCATGATAAATAGATTCTGTAGTTTAATAGCAGTA GCGATTAATAGTCATTATCCACATACGAATTTTTGTTCCTCTCGATTAAA TAGGGGATTGTATCCTTTTGGGGAGTACATTTCTTATACCAACCAGTCAC TCACTATTCATGAAATCAAACATTTGTGGAGGAAACATCGCTGTGCTAGG ACATATGGTAGAGATCTAAATATCATAGTGGACATTTTTGAAAATCCAGC TGAGACCAATGTTCTGTGTAGTGACTGGAATGGCTGGAAAGATCCAATTA TCTGGTTAGTACTAAAGTTACAGCCTAGAATAAGTTTTATGTTTTACAGT ATTTCTCTTGGCATGACCTGCATATATTGAAGTGCAGAAAATAGCAACGG TGATAAGTTTCCTAATTTACCCCAGAGGCACACTAGATGATGAAGATATT TGTCACATCTTGCACTTACACATGGCTTAGGGTTTAGAGAACAAGTTCTA TAATGTTAATTTTTTTCTTAAGCCTTGGGTGACCACTAACCAGCCATTTC CGTTAGTGTGCATTTCTTATGTAACTAATCATTTGCTGCAGTGCATTTAT TCTTACTTGTCTGTTCAGGTTTTTACACACTAGTGCAGTTGGTTTACTTT CTTTTCTTGAGTCATTAGTTTTCATACAAAAGCTAGGTGTAAAAAGCATG CTGAATGGTGCTACTTTTTCCCAATTATTGGTTTGATGGCGCAACAGATG CAGTTGGGATTCAGTTTTTTCTGGAGAATGTTCATCCTAGAATGAATCTG CTGCATCGGCTCTTTTTGGATTGCCAGACTCATTGTATGCCAAGCCTAAT ACATTTGGTGAACTTATGCGGGCTATCATATCTCCATCCAGCAAAGTCCA AGAAGCAGTTTACTGGGCTTTGAAGGGTGCGAATCCAGATATTGTTTTGC ACACGCGCATGATGGCGAATAGGTATGGCACACTATTTGTGGATGCTTGT GTAAATTGAAGTAACTATATAGATTGTCCCATCAGTTCAAGAAGGAAAAG TGCAGTATAGTAGAATATTGACATCATGCAATTTCACATGCCTACTTATC TCATTCATCAGTAGTCACTGAAAATGCTTCTTTGTAGCCGAAATTGTTAA TGCAAGCTAAGATAGCTTCGCATATTTCTTTTATTTATGTAATATAATCT TCAAACTTAAAGTTTGAATCGGTAAGTCAATTACAATATAAACTAAATAT CTTCCAGTTTCAGAATGTCCACCACATTTATCATGCAGATAATTTGTTAG CAGCACTTAGTGTTGTACAACATATCAGGCAAGCTAAAGAGCTAATCAGT AATGAGGTGCGATAGTTGGCTATACGCCTATGTTTTAGAACACTGATATC ATATGTTTTGAACAGTTGAAGATTAACTCCTATCATTACTCTAGGCCAGT CCGAGCAAGAAAAGCTGCAGTTCTTTGTATTAAGAGAGCCCTACAGATTA GGAATATCAAGGGTGCACCTCTGGTGGCATTGGTCTCAGACACACCAGCA TTTGTGAAGGAGATAAAGTCAGACATCAGCGAGTGTGCAGAGGTTAGCTG CTAGATTGAATTGAATATTACAGGGTGAACTTAGCACCATATCTCAAGCA CCATGGAGATTGATTATGTATTTCTGAAAATATCGGAAAGTTGGATGCTG ATTCTGCAATTGTTTTCAGGTACTTTATTTTGATTACAAGTTGTTTGCCA AGACTTCTGGTCGGGAGATAGTTGGAAATGATAAGGTATTATTCACTCTC ATCATGTCATGTCCCCATAACTGTTACTGTTTCCCCTACAGATTTCTGAG TTCTGAACCTTATTGGAATCTTTAGGAGTAATTGTTTATGCTAGATTTGT GTCAAGGATGTTACAGTTTATATCAGGAAATGGAAAAACAAACAAATGTA GATATTTCCTAAAGTTGATAATGCACAACTCTATTTTGCTAGTGTGGAGC TACAATTTTGGCAAAATTTTCAATTAAAATGCTTCCGGATTTCTTGCCAT CTTGTGCATATTTTATCCTGTGCTGCTTTCTCGAGGATCTTCTTTCTCTG TTTTGCTCTCTTGTCTATATGTTGTGTTTTCTATTTTGAAGCATTCTTTC CATACGCATGTGGAATTAAGACAATCCATATGTGTACAGTTCTTACAACA TCCTAGCAATTCTAGGACAAATTATGAGGTAAAACAAATGACACATCTAG CCCTCTTTTAACTATATAGAGATCTGCTTATCATATTTTTTAGCCTGCTG GTAGACATTAATGGCACGTAGGTATGTGATTGGTGCTTTGGGGGAGTTAA TTCACCTAGAATACCTTATAATTTGGGACAAATTTTGAATGCTTTAGTAC GGCTCCACCGTCCGCCCTCAGTGCCGCCGTTCCTGGATGGTGCAGCGGCC TCTAGCCTCGCACGCTCCGCCGCCGCTACGGTGCTTGCCTCCGTCGGATG CGAGGACTGCCTTCGATGTCTCCGCTTGCCTTCCTCTGCTACCTCATTTC TTGCTGCGGAACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.