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GrainGenes Sequence Report: AA037083

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Sequence
AA037083
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037083
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GATGTTCAGCCGCGCCCTCTCCACCGCGCGCTTTCCCACGGCGACCACCG
CAGTCGCGTCCTCCTCGGCCGTGAACTCCATCATCCTCCGCTCCCTCAAG
GAGCACTACCTCGAGGTCTCCAAAATGACGCCCCACCCAAGATCAGCCCG
CGCAGGCCCTACACCATCGTCAAGGCCGCCCTGGACCAGTCCATGGGCCC
CGTGCTCCGCCGCGTCTACGGCGAGGCCGGCGAGGAGATCTCCATCTCCG
TCGCTAGGCTCGCCAACATCATGCCCCCCGGCGCCCACTCTGACTCCGAC
TCTGACGGCGGAGGCGGGGCGAGCGAGTCGATTAGCCAGCTCTTCCTCCA
CGTAGACATCTCCAGGCCGGTGAGCAGTAAGTCGATGCAATTCCTCTGTG
GACTGTACCCCGACGCCGTGGGGATCCATTCGGTCTGCCTTCGGTCGAAG
ACTGCGCCGTCTGGGGCAGCGGCTGTGGCGATGGCGGCGAAGGGAGGTGG
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TAGTTCGTCTCACGCCCTTGGTTTCTGTAATTCGCTCCAATAGTCAATTC
AGTGAGAAATATGATATATAATATCACAAGGATCACCAGACATAATATGT
TCAAAACAGGCTTTATTTCTAGTGTCCAGGAGCAGGGTTTCACGTAATTT
TGATAAGGGCATTAAGATCTAAGAACATCGTGCAAGTGGTGTTTGGAGAT
ATTCTGGCTGCACATTGCATGTTGGTTTGTCTGAAATAAATTCTTTACCG
TAGTTTTGCACTCCTGCTAGCAGAGCTCTGTAGTAGTTTCCAACGAGAGC
TCTGTAGTAGTTACCAATGGGGTGTAGAAACAGGGATATTTGTGACAAAG
GATAAGTTTCAGGTATACCAATGTGTTCAGAACTCAAAACTCATTGCAAG
TCTACGTTTCAGTCAGTGGCCATATGTCTAGACAACTTACATGCTGAGAT
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TTATTAATTGCCAACATCAGCTAGAAGAAAAGAAAACCTCTCTCTTATCA
GAAAATAGACCTACAGTTCTATGTTATGCAGATCAACCAGGCTACATCAG
AGCAATCTTCTATTCATTGTCTCCTACTCTGGAACGATTAAACACCTTTG
CAGCTACCTCCTCGAGCCTTCTGGATCCTTGTTGGAGCCTTTTGTCTATT
TTCCTTCTGCAGATTTGATCAGAGATCAATCCAGTAACAAGCTTGGTGAG
TTGGTGTACAATGGTCATAGGGTTGCTAGGAATTTGTCCACAAGAGCAGG
CATTGTTCCTGATCTTCCACAAAGCCCATACAATTGCAGCACACCCAGCT
GCAACCATCTTTCTCTGATTGAAAGGAAATCTGAAACCAACTATCACACA
TATGAGACAAACCAGTAGGCATATTAGCAAGAACCATGGCAGATTGAGCT
TGTTAAGTACTTCCATCAAGAATCTCTGGCCTGTAGCCATGTAGTAGTGA
CTTGCTGACTGCTTACTAGGTTGGTGTCAATGATAATGTTACATGATATA
GGCTTGGTTTAGTTACTGCTATCAGATCTTAAAGGAAATAATTATGTAGA
TGAATGTATGTGTCTACTTAGTTCTGTGCAGTGTCCGGCAATACTGAAAA
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GTTCTTTACAACTTTGCGTAGCTCTTTGGATCATGGTTGTTTTTTATACC
TGGTATGTATAAGCCGTGTGATGTTTAATTGCTTATTGCCTGTCGATAGA
CCACAATTCTGTTTTATATTGGTCTGTACATTACAAATATGATAACACTA
ACATGGGAAGGTGCGTGATGCATTCCATCTTTGATTGACAGAGAGTTGGA
TGAGAAGGTGCGTGATGCATTCCATCTTTACATTGAGGCCCGTGGCATAA
ATGAGAAGCTCTTCCCTTTTCTACAAGCTTGGCTTTATGTGAAGGATCAC
CGCAACTTGGTACGCTGGTTCAAGAGTGTGGGTACAGTCATCAGTGAGCC
AAAGCTTGAGCCAAAGTCTGAGTAAGCTGCTTCCTTTGTGAACTGTCTCT
TGTTATATTTGATACCATGCATCTTTCTTATTGGAAGGTAACATTTAGAA
GATGTTTGATTCCCCAACGTAAATGCAAACGTAATCAAGTGACACTGTTA
ATGTAAACGGTATCGACCAAAAAGATTACTGTTTGGCTGCCATCGAGGTA
ACGGTAATAAATACCTAGAGCTGGTATGTGCAGTTCACGAACGGAACACA
AAATCTGGCCGAAATAAATTTCTCAGATCATTAATCGCCTTCCCTCCTTG
ACTGCTACGAGGCATGACTTGTTCTGCGCATCAGAGCTGCCGTTGGATTG
AGATCCATGCGATTTGTATTCAATTGGTTCTTGTTCTGTATGCCTTCTCG
CGATTTGAGATCTCCCGAGATTTTTTTTTTCTTTGATGCATTGTAAAATT
GCAGCCAAATTTGAACTCTTGAGTCAGGTCTCGCGTCCCCGTGCTCCTCT
CAGCCTCACCCCTCCTGGAGACCTCCACTTCTGCCTGCCACGCCGCCGCT
GTCGCGACGAAGCTGTCTGGTGGATCGCCGTGGGCGCCGCTCTTCTCCTC
TAGGGCCTTCTCCTCGAGGCATCTGGCAGAAGCCCGCCGGAGATGCGCCC
GTCCCATCCGTGGTGGACCACAAGTTTGTTTCTCGTCCTTATGAGCTCCT
TGTTGCGTTTGTATCTTCAGTATTTGCTTTCTGTATAGTTTCTGCTTAAT
TTGTTCATTTTTTGCGTGGAAAGATGGGGATAATCATAAATCTCAGGGAA
AATTTATGTCACAGTTTGTCTTGCGATTTTGTGGCCATTGCCGTCCTGCT
CTGCTGCGAACCCCAAAACCGAATCTCGAAGGCTCAGACACCAGGGCCTA
GTTTGGCAACAAAGTATTTCTAAAACTGAAGTATTTACAAAACCATAGTA
TCTAACTGCCTGGGCAGGCAATACTTCAGTTTCAGAAAAGAGTTGTTTTT
TCAATACTTCAAAATTAGCACCTTTTGAGGGATACTGAAGTATTAATACC
ACAGATTTTAGTCACTGCCAAACACATCAAAGTATTCAAAACTTTAGTTT
TTTGAGAAACTTTAGTATTGCTGAAATACTATAAAAATACTTTGCTACCA
AACACAGCCTAGTTATTTCGTCATTACAGTTGCAAGAGATTAGCAATAGT
GGGTACTGTATTTTAGAAGCGACTGCCGTGACTGCAGTGAATAAATGTGC
ATGAAGTAGTATAATGTGAAAAGTTTTGCTAGACAAATGATTGCCAATTT
TAGAGCAGCAAAATCTGTTTTCCTTGGTAATCCATTTTTATGCCACATTG
GATAATTGGCTATTGCTTCTGTGTACATGGAACAGGTCGATAATGCCAGA
GGATAAGTTCCATAAATTAGCAGATGATACGATACATGATTTACTTGAAA
AACTTGAGGTAATAGATTCGTCGATAAACTCTTGGTACCTTAGTACTTCA
TGAGAAGCTTCACTAAAAATATATCGGTCCAGCCTCTATCTTTGGCTAAC
ATTGTTCTATCGGCCTGTTTCAGGAATATGGTGATTCTCAGCAGATGGAT
GGCTTCGACATAGATTACGGGGTTAGTTATAGTGAAATGTCCTGAAATAA
TGTCCGTTTCACTATTTTGCATTTTTTTGGTGTGCATTGGATCTAATATG
GTTTTGCTCATTTCCCTGAAATTTAAGAATCAAGTTCTAACATTGAGGCT
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TCTGGCTATCTTCACCTGTGAGGTAAGGTTGTGTTATCTTATTTGCTGGT
CAGTTGATTGTGTGTACTAAGTACCCAAATGTGAGCATATTATCATGATG
TACCTTCCTTATGTGTAAGTTAGGCTTGCTATTATGTGACACCGGTAACT
GTCAAGGATAGTTCATTGGCATGAGTACCTTTTAAAATTTAAGAAGAGTA
TGTTTACATCCCATTATTTTGATACTTATCCTACTATATGGATTTGTGCT
TTTTAATACGGCTATAAGTTTTCTTCAAGAGATCCCACTCGTAAAAGATT
CTGCTTAGATATATCAACGCGTCCATTACCCATAAGCTCTTCAATCTTGG
TCTGGTACTTGTTGATTCTTATCTGAAAGGGCTGTCAATATCATGTCTGC
AGTGGGCCTGCTAGGTTTGACTGGGATGCAGCAACACACAGTTGGGTTTA
TAGGCGGACTGGAGTAAATCTCATGGGACTTCTAGAGAATGAGATTGGTG
AGCTCTGCGGCACTCCAGTAGATCTTTCATAGAAGGAAAGAAGCATGCCA
CATATCTGAGTTCGATGAGTCAGCACAACATTTCAGCGATATGTGGATGA
GATGATACCTTTTAATATGTTGATCATGTGGAGTAAACCAAGAGAATTGT
TGTACTGCAAATTTTTGCACTGTGTATTTATAGTACGTGTTTCTGATAAG
TCTCTGCCCTTTTGTCTGTAGCGACATAAGCATCTGATACATCATGTTTT
AATCAACTGTTTGCTTGAAGTGATATGTGCTTTATAAGTGTGATGTCCAG
AAATTGTATGTGGGTATTTCCGTAATTTGTATGATCAGCCAGACTCTTAC
GACCTTCACGGAGGAGCCCGTGTCGGCGCCCATACAGCACCTGATTTGTG
GAGATATCTGCTGGAAAAAAGTCCATACCATCTTGCAGGGATTACAAGTA
TCTGCTTAAGATGCTTCCCCCATGATTCACAATTTCGACAAACTCACAGA
GGTACGAAGATACTCTCAACCTCCCAACTATTTTTTTTGTACCCGCAAAA
AAAAAGCTACTTGAAGAAGTGCACAGTTGTTGTTCTGCTGATTCTACCTG
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TCGGTTGCTGATAGGCAGAACCTGGTTTCTGTTAATAACCACTTTGTGCT
CGGATTCTTTAGCCCTGGAGCTTCAAGCAACCGATATATCGGTATATGGT
ACAACACTATTCCAAATGGAACCGCTGTGTGGGTTGCTAACAGGAATAAT
CCAGTACAGGATAAGTCGGGCATACTTAAGTTTGATAATGGCGGTAATCT
GATACTTCTAGATGGCAAAGGTAGTTCGTTCACAGTTGCTTCTGGGGTGG
GAGTGGCAGATGTTGAGGCTGTAATTCTGGATTCTGTCAACTTTGTGCTG
AGGAGCATGACCAACCATTCAAATATCGTATGGCAGAGCTTTGCCTCTCC
TACTGATACATGGCTACCTGGAATGGATATTACAGTTGGAAATTTGTTGA
CGTCATGGAGGAGCAATGATGACCCAGCAATGGGGGATTACACATTTGGA
CCGGGCATAGCTAATCACAGTTAATTATTTGGTGGAATGGGAATAGATTT
TGGACCGGCGCACGCTGGACTGGTGATACGAATTCTCTCATTCCAGATCT
GAAATCTATTGGCATCATCCCTGTTTCATTTCAATGTGACAACCTTACGT
GCATGTACACTCCCAACCCTAGTGACAGAATGACTAAGATTGTTTTGGAT
CGAACTGGGTTGTTGAATTTAACACAGTTTGATCCAGATGCCAAATCCTG
GACATTGTTATGGAGACAGCCAGAAAGTTGCGATGTGTCTAATTTATGTG
GAGTTTATGGTGTATGCAATAACAATAGGTTATCAGCATCAGCATCAGGA
TCTCTATCCCTTTGTCAATGTCCAAAAGGCTTTGCACAACGAGACATATC
AAATGATAGGAAAGGGTGCACTAGAAACTCAAGATGCGATGGGTCTGGTT
CGGCCCACCGACCCGCTGAACCGGACCTTGTTTTTGTTACCATAAGGGAA
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ACCTAGGTTCTAACCGGACCTCTCTCCCCTCGGCGACCAGACGGACGCCG
CCGCCGCGCCGCAGCAGGAGTTGGCAGGCCGGCGGCACCGGAGTAAAAAA
CTCACCCCTGACGGCTCCACCTATTTTCCCCACCACCGGAGCAGGGCAAC
TCGCCAGCCGTGGGAACGCTGTGGGAGGCTCTCGTAGACGCGGAGCAGGG
CAACTCGCCGGTAGACAGGGAGCGCCCCAAGCATCGTAGGTAAATACTCC
TTGCAATCCCTCATCTCCCTCCCCGCGTAGAATTTTGGTACTAGTATTAG
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CCCGAACGGTAGTTTGGAGATCTAGGATCTTGCCTATCATGCAAAATTAG
TTCTAAACATACATGTGCATTGGGAACAACACTGATGAGTCCAGGTCGTG
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TTTAGATTGCCTAATTTTCTTGCTCCGTTGGTTATCATATTTCTTCCTAG
TAGCAGTGCTTGTTTTCATATCTGTATGTATGATCCTGACCCTTGTCCCT
TGAATCCTCGTGAAGAATGGAGATAGAGTAGGCACCTTGCAATTCTCATA
TTTGTGTCTAGTAGTTCAAGCTGTTTCTGAAGATAGAAAAAATGAGCTGA
CCAAATTTGAATGTGTCTAGGCTGTTGTTATGCAAGAATTCATAGACAAG
CATTCTCTCCCGTCGATGCAGCAGCCTAGCAGCCTCACGAGGTTCCGGTG
CTGAAGCAATTCTTGTTGATAATCAAGTTGGGATAGTGTTTCGTGGAGAT
GCTCGGTTGCAGCGATTGAGCAGCAATTGTATAGAGACAGTGAGAGGGAC
TGAGAGGGAGAGTAATGTGCCAGCGTTGATTTTCTTTCAAAAAACAAAAA
GCAAGTGTTGATTTGCATTAACTTTCTTTCATATTTTGAAGCTTGTTTAT
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TTGCAATCTGGTTGCTAAATTGATCTTGAATATTAAATCTACAGATGCCA
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AGAAGAAGAAAAAGATGTGGTCTCCTGTTTCGAGACATCATGTGGTGGCT
TCTTTGGTGTCAAGGTCCCAGGCTGCAAGGCGAGCTTCTCCGGCTGCAAG
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CTCCTGCAGGAACGCCACAAGCTGTTGTAGTTCTCGAGTCACTCCGAACA
CCGACGTTTATCCACAACGACTATGTCCCATATTCTGGTGAGCACGGTTA
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AGGACGACTCTGACCGCAATGCCGAGGACAACTTTGACCTTGATGCCAAA
GACGATGTTGAGGGTGACGAGCAACATGTTGAGGATGTTGAGTTTCTTAC
TGCGAGTGCATCGATTCGAGCTTTGACAAGCAAATTTAGATCCGAAGCAT
GGAAGGAATATGTTCCGGTCATTGTGGATGGACAAATTTCAGAAGCGAGA
TGCAAGCATTGCGACAATACGATCAGTGCAAAACGTGGTCAAGGGACCAG
CACCTTGTTGAAGCACTTGGACAGATGCAAGAAACGAGATGTTGCACTAA
GGATCGTGCAAGGTCTGAATTCAACACTTCGCTCTCCTGATGGTCGTCAT
TTGAAGAATTGGAACTTTGATCCAGTTATTGCAAGAAAGGAGCTTGCTCG
GATGATCGCATTACATGGACTTCCATTTATCCTTGTGGAATATGATGGAT
TTAGAAGATTTGTGGCAAGTCTAAACCCATTGTTCAAGACAATAAGTCGG
ACAACCATCAGAAATGACTGCATAAAAGCATTTCAAGAGCAAAAGGTGGC
ACTACAGGAGATGTTTAAGGATGCCCAATCCAGGTTTTCGTTGACAGCAG
ATATGTGGACATCGAACCAGACTCTTGGTTATATGTGCATCACTTGCCAC
TATATCACTACAGATTGGGAAATTAAGAAGAAAGTGATCAAGTTTTTCGT
TGTGGAGACACCTCACACTGGAATTGAGATGTTCAATCAGGTTCTTGAAT
GTATCCAAGAATGGAACATTGAGTATAAGCTATTTGGGATTACATTGGAT
AATGCTGCAGCAAATGATTCAATGGTATTTGAGTTAAAGCGCAATCTGGT
GGACAAGATGGCTCTTCCAGTGAGTGGAGTGTTGCTGCACAACCGCTGTT
CAGCGCATGCAATAAATCTCATTGCTCATGATGGTCTACACGAAGAGGAA
GTGAAAAATATTGTCAGCAACATACGGGAGAGTGTAAAATATATCAGATC
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GGGAAAAGGCGACAGTTCTTTGCAAGGTGTTGAAGGTATTTTACGATACA
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TGAGATGTGGAAAATAAAGATCACCCTGCACAATGAATCCTCTAATGCTG
ATCTTGGAGCGATGATTGCTGTCATGAAAACAAAGTTCAATAAGTATTGG
TACGACATCTACATGAACCTTGCAATTCCGGTAATACTTGACCCACGTTT
CAAGTTTAAGTATGTAGAGTTTCGCCTCAAACAGGCCTTCGTAAATGATC
CTCAACCACGTATAGACAGAGTGAGAAAAACTTTCAGGAGTCTCTTCAAT
GAATATTTTTTCTCAACTCAACAATGACAACAACAACTTCTCACAAGAAT
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GACTGGGATGACCACCTTAATGAGCATAGGCAAGATCCAGTAACCACAGA
ACTTGATCGATACTTGAATGAGAGCCCGATTTCGAGATCTGGAGAATTTG
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GCAATCGCGCGTGATGTGCTAGCAATGCCTGCATCTACGGTTGCATCTGA
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TGAGCGTCAAGAGTGTTGAGGCCCTTATCTGTTCGCAGGATTGGTATCGA
GGATCTGGTAATACTAACACACTCAGCTTTATTGTCTGATGTAATTTCAT
TTTGTTGAAACTAATGTACTTGTATTTCAGATTCTCACCGGCGGCGAATG
GGCGCAATCACTGACCTGGTTGACCTAAGAGATACTGAGATTGAATCACC
CTTAGCATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.